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A ILE 10 A THR 375 4 ? # _struct_ncs_ens.id 1 _struct_ncs_ens.details ? # _struct.entry_id 4RB4 _struct.title ;Crystal structure of dodecameric iron-containing heptosyltransferase TibC in complex with ADP-D-beta-D-heptose at 3.9 angstrom resolution ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 4RB4 _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSFERASE _struct_keywords.text 'GT-B fold, Heptose transfer, TibA, ADP-D-beta-D-heptose, TRANSFERASE' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 1 ? K N N 1 ? L N N 1 ? M N N 2 ? N N N 3 ? O N N 2 ? P N N 3 ? Q N N 2 ? R N N 4 ? S N N 3 ? T N N 2 ? U N N 3 ? V N N 2 ? W N N 3 ? X N N 2 ? Y N N 3 ? Z N N 2 ? AA N N 3 ? BA N N 2 ? CA N N 3 ? DA N N 2 ? EA N N 3 ? FA N N 2 ? GA N N 4 ? HA N N 3 ? 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ALA A 110 LYS A 126 1 ? 17 HELX_P HELX_P132 132 SER L 134 ? ALA L 142 ? SER A 134 ALA A 142 1 ? 9 HELX_P HELX_P133 133 PRO L 143 ? TYR L 145 ? PRO A 143 TYR A 145 5 ? 3 HELX_P HELX_P134 134 ASP L 181 ? GLY L 186 ? ASP A 181 GLY A 186 1 ? 6 HELX_P HELX_P135 135 HIS L 188 ? GLY L 196 ? HIS A 188 GLY A 196 1 ? 9 HELX_P HELX_P136 136 THR L 236 ? LEU L 248 ? THR A 236 LEU A 248 1 ? 13 HELX_P HELX_P137 137 PRO L 282 ? HIS L 292 ? PRO A 282 HIS A 292 1 ? 11 HELX_P HELX_P138 138 GLY L 302 ? THR L 310 ? GLY A 302 THR A 310 1 ? 9 HELX_P HELX_P139 139 PHE L 368 ? LEU L 373 ? PHE A 368 LEU A 373 1 ? 6 HELX_P HELX_P140 140 THR L 375 ? THR L 391 ? THR A 375 THR A 391 1 ? 17 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? A CYS 342 SG ? ? ? 1_555 M FE . FE ? ? K CYS 342 K FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? ? metalc2 metalc ? ? B CYS 339 SG ? ? ? 1_555 O FE . FE ? ? L CYS 339 L FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.562 ? ? metalc3 metalc ? ? B CYS 358 SG ? ? ? 1_555 O FE . FE ? ? L CYS 358 L FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.987 ? ? metalc4 metalc ? ? B CYS 370 SG ? ? ? 1_555 O FE . FE ? ? L CYS 370 L FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.942 ? ? metalc5 metalc ? ? C CYS 339 SG ? ? ? 1_555 Q FE . FE ? ? C CYS 339 C FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.562 ? ? metalc6 metalc ? ? C CYS 342 SG ? ? ? 1_555 Q FE . FE ? ? C CYS 342 C FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.925 ? ? metalc7 metalc ? ? D CYS 339 SG ? ? ? 1_555 T FE . FE ? ? D CYS 339 D FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.661 ? ? metalc8 metalc ? ? D CYS 358 SG ? ? ? 1_555 T FE . FE ? ? D CYS 358 D FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? ? metalc9 metalc ? ? E CYS 358 SG ? ? ? 1_555 V FE . FE ? ? E CYS 358 E FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.975 ? ? metalc10 metalc ? ? F CYS 339 SG ? ? ? 1_555 X FE . FE ? ? H CYS 339 H FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? ? metalc11 metalc ? ? F CYS 342 SG ? ? ? 1_555 X FE . FE ? ? H CYS 342 H FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.913 ? ? metalc12 metalc ? ? F CYS 358 SG ? ? ? 1_555 X FE . FE ? ? H CYS 358 H FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.996 ? ? metalc13 metalc ? ? G CYS 339 SG ? ? ? 1_555 Z FE . FE ? ? B CYS 339 B FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.555 ? ? metalc14 metalc ? ? G CYS 342 SG ? ? ? 1_555 Z FE . FE ? ? B CYS 342 B FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? ? metalc15 metalc ? ? G CYS 358 SG ? ? ? 1_555 Z FE . FE ? ? B CYS 358 B FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.977 ? ? metalc16 metalc ? ? H CYS 339 SG ? ? ? 1_555 BA FE . FE ? ? F CYS 339 F FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.560 ? ? metalc17 metalc ? ? H CYS 342 SG ? ? ? 1_555 BA FE . FE ? ? F CYS 342 F FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.941 ? ? metalc18 metalc ? ? H CYS 358 SG ? ? ? 1_555 BA FE . FE ? ? F CYS 358 F FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? ? metalc19 metalc ? ? I CYS 342 SG ? ? ? 1_555 DA FE . FE ? ? G CYS 342 G FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.604 ? ? metalc20 metalc ? ? J CYS 358 SG ? ? ? 1_555 FA FE . FE ? ? I CYS 358 I FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? ? metalc21 metalc ? ? J CYS 370 SG ? ? ? 1_555 FA FE . FE ? ? I CYS 370 I FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.460 ? ? metalc22 metalc ? ? K CYS 339 SG ? ? ? 1_555 IA FE . FE ? ? J CYS 339 J FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.546 ? ? metalc23 metalc ? ? L CYS 339 SG ? ? ? 1_555 LA FE . FE ? ? A CYS 339 A FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.641 ? ? metalc24 metalc ? ? L CYS 358 SG ? ? ? 1_555 LA FE . FE ? ? A CYS 358 A FE 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.198 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 THR 107 B . ? THR 107 L LEU 108 B ? LEU 108 L 1 -2.92 2 LYS 230 B . ? LYS 230 L TYR 231 B ? TYR 231 L 1 -8.85 3 THR 105 D . ? THR 105 D GLY 106 D ? GLY 106 D 1 -0.68 4 LEU 108 D . ? LEU 108 D GLY 109 D ? GLY 109 D 1 -6.30 5 GLY 109 D . ? GLY 109 D ALA 110 D ? ALA 110 D 1 1.64 6 GLY 106 F . ? GLY 106 H THR 107 F ? THR 107 H 1 -1.54 7 PHE 9 G . ? PHE 9 B ILE 10 G ? ILE 10 B 1 -27.40 8 THR 105 L . ? THR 105 A GLY 106 L ? GLY 106 A 1 -3.99 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 4 ? B ? 6 ? C ? 4 ? D ? 6 ? E ? 2 ? F ? 2 ? G ? 5 ? H ? 4 ? I ? 4 ? J ? 4 ? K ? 4 ? L ? 4 ? M ? 6 ? N ? 2 ? O ? 4 ? P ? 4 ? Q ? 4 ? R ? 6 ? S ? 2 ? T ? 3 ? U ? 4 ? V ? 4 ? W ? 5 ? X ? 2 ? Y ? 4 ? Z ? 4 ? AA ? 4 ? AB ? 5 ? AC ? 2 ? AD ? 3 ? AE ? 4 ? AF ? 4 ? AG ? 5 ? AH ? 2 ? AI ? 2 ? AJ ? 4 ? AK ? 4 ? AL ? 6 ? AM ? 2 ? AN ? 4 ? AO ? 4 ? AP ? 4 ? AQ ? 6 ? AR ? 2 ? AS ? 4 ? AT ? 4 ? AU ? 4 ? AV ? 6 ? AW ? 2 ? AX ? 4 ? AY ? 6 ? AZ ? 4 ? BA ? 6 ? BB ? 2 ? BC ? 4 ? BD ? 4 ? BE ? 4 ? BF ? 6 ? BG ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? anti-parallel A 3 4 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel B 2 3 ? parallel B 3 4 ? parallel B 4 5 ? parallel B 5 6 ? parallel C 1 2 ? anti-parallel C 2 3 ? anti-parallel C 3 4 ? anti-parallel D 1 2 ? parallel D 2 3 ? parallel D 3 4 ? parallel D 4 5 ? parallel D 5 6 ? parallel E 1 2 ? anti-parallel F 1 2 ? anti-parallel G 1 2 ? parallel G 2 3 ? parallel G 3 4 ? parallel G 4 5 ? parallel H 1 2 ? anti-parallel H 2 3 ? anti-parallel H 3 4 ? anti-parallel I 1 2 ? parallel I 2 3 ? parallel I 3 4 ? parallel J 1 2 ? anti-parallel J 2 3 ? anti-parallel J 3 4 ? anti-parallel K 1 2 ? anti-parallel K 2 3 ? anti-parallel K 3 4 ? anti-parallel L 1 2 ? parallel L 2 3 ? parallel L 3 4 ? parallel M 1 2 ? parallel M 2 3 ? parallel M 3 4 ? parallel M 4 5 ? parallel M 5 6 ? parallel N 1 2 ? anti-parallel O 1 2 ? anti-parallel O 2 3 ? anti-parallel O 3 4 ? anti-parallel P 1 2 ? anti-parallel P 2 3 ? anti-parallel P 3 4 ? anti-parallel Q 1 2 ? parallel Q 2 3 ? parallel Q 3 4 ? parallel R 1 2 ? parallel R 2 3 ? parallel R 3 4 ? parallel R 4 5 ? parallel R 5 6 ? parallel S 1 2 ? anti-parallel T 1 2 ? anti-parallel T 2 3 ? anti-parallel U 1 2 ? anti-parallel U 2 3 ? anti-parallel U 3 4 ? anti-parallel V 1 2 ? parallel V 2 3 ? parallel V 3 4 ? parallel W 1 2 ? parallel W 2 3 ? parallel W 3 4 ? parallel W 4 5 ? parallel X 1 2 ? anti-parallel Y 1 2 ? anti-parallel Y 2 3 ? anti-parallel Y 3 4 ? anti-parallel Z 1 2 ? anti-parallel Z 2 3 ? anti-parallel Z 3 4 ? anti-parallel AA 1 2 ? parallel AA 2 3 ? parallel AA 3 4 ? parallel AB 1 2 ? parallel AB 2 3 ? parallel AB 3 4 ? parallel AB 4 5 ? parallel AC 1 2 ? anti-parallel AD 1 2 ? anti-parallel AD 2 3 ? anti-parallel AE 1 2 ? anti-parallel AE 2 3 ? anti-parallel AE 3 4 ? anti-parallel AF 1 2 ? parallel AF 2 3 ? parallel AF 3 4 ? parallel AG 1 2 ? parallel AG 2 3 ? parallel AG 3 4 ? parallel AG 4 5 ? parallel AH 1 2 ? anti-parallel AI 1 2 ? anti-parallel AJ 1 2 ? anti-parallel AJ 2 3 ? anti-parallel AJ 3 4 ? anti-parallel AK 1 2 ? parallel AK 2 3 ? parallel AK 3 4 ? parallel AL 1 2 ? parallel AL 2 3 ? parallel AL 3 4 ? parallel AL 4 5 ? parallel AL 5 6 ? parallel AM 1 2 ? anti-parallel AN 1 2 ? anti-parallel AN 2 3 ? anti-parallel AN 3 4 ? anti-parallel AO 1 2 ? anti-parallel AO 2 3 ? anti-parallel AO 3 4 ? anti-parallel AP 1 2 ? parallel AP 2 3 ? parallel AP 3 4 ? parallel AQ 1 2 ? parallel AQ 2 3 ? parallel AQ 3 4 ? parallel AQ 4 5 ? parallel AQ 5 6 ? parallel AR 1 2 ? anti-parallel AS 1 2 ? anti-parallel AS 2 3 ? anti-parallel AS 3 4 ? anti-parallel AT 1 2 ? anti-parallel AT 2 3 ? anti-parallel AT 3 4 ? anti-parallel AU 1 2 ? parallel AU 2 3 ? parallel AU 3 4 ? parallel AV 1 2 ? parallel AV 2 3 ? parallel AV 3 4 ? parallel AV 4 5 ? parallel AV 5 6 ? parallel AW 1 2 ? anti-parallel AX 1 2 ? anti-parallel AX 2 3 ? anti-parallel AX 3 4 ? anti-parallel AY 1 2 ? anti-parallel AY 2 3 ? parallel AY 3 4 ? parallel AY 4 5 ? parallel AY 5 6 ? parallel AZ 1 2 ? anti-parallel AZ 2 3 ? anti-parallel AZ 3 4 ? anti-parallel BA 1 2 ? parallel BA 2 3 ? parallel BA 3 4 ? parallel BA 4 5 ? parallel BA 5 6 ? parallel BB 1 2 ? anti-parallel BC 1 2 ? anti-parallel BC 2 3 ? anti-parallel BC 3 4 ? anti-parallel BD 1 2 ? anti-parallel BD 2 3 ? anti-parallel BD 3 4 ? anti-parallel BE 1 2 ? parallel BE 2 3 ? parallel BE 3 4 ? parallel BF 1 2 ? parallel BF 2 3 ? parallel BF 3 4 ? parallel BF 4 5 ? parallel BF 5 6 ? parallel BG 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 GLN A 18 ? GLY A 20 ? GLN K 18 GLY K 20 A 2 ILE A 24 ? ASN A 29 ? ILE K 24 ASN K 29 A 3 ARG A 33 ? LEU A 36 ? ARG K 33 LEU K 36 A 4 GLY A 62 ? THR A 65 ? GLY K 62 THR K 65 B 1 GLN A 18 ? GLY A 20 ? GLN K 18 GLY K 20 B 2 ILE A 24 ? ASN A 29 ? ILE K 24 ASN K 29 B 3 ALA A 163 ? ARG A 166 ? ALA K 163 ARG K 166 B 4 PRO A 98 ? SER A 102 ? PRO K 98 SER K 102 B 5 ARG A 128 ? THR A 132 ? ARG K 128 THR K 132 B 6 GLN A 149 ? SER A 151 ? GLN K 149 SER K 151 C 1 ASN A 52 ? VAL A 59 ? ASN K 52 VAL K 59 C 2 TRP A 41 ? ASP A 47 ? TRP K 41 ASP K 47 C 3 PHE A 74 ? ARG A 80 ? PHE K 74 ARG K 80 C 4 LEU A 88 ? THR A 91 ? LEU K 88 THR K 91 D 1 GLU A 275 ? ASP A 276 ? GLU K 275 ASP K 276 D 2 ARG A 251 ? CYS A 254 ? ARG K 251 CYS K 254 D 3 TYR A 218 ? ILE A 221 ? TYR K 218 ILE K 221 D 4 PHE A 295 ? GLY A 298 ? PHE K 295 GLY K 298 D 5 VAL A 314 ? ILE A 317 ? VAL K 314 ILE K 317 D 6 ARG A 332 ? VAL A 333 ? ARG K 332 VAL K 333 E 1 HIS A 260 ? GLN A 263 ? HIS K 260 GLN K 263 E 2 VAL A 266 ? HIS A 269 ? VAL K 266 HIS K 269 F 1 GLN B 18 ? GLY B 20 ? GLN L 18 GLY L 20 F 2 ILE B 24 ? TYR B 26 ? ILE L 24 TYR L 26 G 1 PHE B 28 ? ASN B 29 ? PHE L 28 ASN L 29 G 2 ALA B 163 ? ARG B 166 ? ALA L 163 ARG L 166 G 3 PRO B 98 ? SER B 102 ? PRO L 98 SER L 102 G 4 ARG B 128 ? THR B 132 ? ARG L 128 THR L 132 G 5 GLN B 149 ? SER B 151 ? GLN L 149 SER L 151 H 1 ILE B 53 ? CYS B 57 ? ILE L 53 CYS L 57 H 2 HIS B 42 ? ASP B 47 ? HIS L 42 ASP L 47 H 3 PHE B 74 ? PHE B 79 ? PHE L 74 PHE L 79 H 4 LEU B 88 ? THR B 91 ? LEU L 88 THR L 91 I 1 GLU B 275 ? ASP B 276 ? GLU L 275 ASP L 276 I 2 ARG B 251 ? CYS B 254 ? ARG L 251 CYS L 254 I 3 TYR B 218 ? ALA B 222 ? TYR L 218 ALA L 222 I 4 PHE B 295 ? GLY B 298 ? PHE L 295 GLY L 298 J 1 GLN C 18 ? GLY C 20 ? GLN C 18 GLY C 20 J 2 ILE C 24 ? ASP C 27 ? ILE C 24 ASP C 27 J 3 ARG C 33 ? LEU C 36 ? ARG C 33 LEU C 36 J 4 GLY C 62 ? THR C 65 ? GLY C 62 THR C 65 K 1 ASN C 52 ? VAL C 59 ? ASN C 52 VAL C 59 K 2 TRP C 41 ? ASP C 47 ? TRP C 41 ASP C 47 K 3 PHE C 74 ? ARG C 80 ? 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