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'X-RAY DIFFRACTION' 8.3766 49.6654 . . 215 4178 100.00 . . . 0.1732 . 0.1844 . . . . . . . . # _struct.entry_id 4WRT _struct.title 'Crystal structure of Influenza B polymerase with bound vRNA promoter (form FluB2)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? # _struct_keywords.entry_id 4WRT _struct_keywords.text 'TRANSFERASE-RNA COMPLEX' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSFERASE/RNA # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 6 ? H N N 6 ? I N N 6 ? J N N 6 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 4WRT 4WRT ? 1 ? 1 2 PDB 4WRT 4WRT ? 2 ? 1 3 UNP Q5V8Z9_9INFB Q5V8Z9 ? 3 ;MDTFITRNFQTTIIQKAKNTMAEFSEDPELQPAMLFNICVHLEVCYVISDMNFLDEEGKAYTALEGQGKEQNLRPQYEVI EGMPRTIAWMVQRSLAQEHGIETPKYLADLFDYKTKRFIEVGITKGLADDYFWKKKEKLGNSMELMIFSYNQDYSLSNES SLDEEGKGRVLSRLTELQAELSLKNLWQVLIGEEDVEKGIDFKLGQTISRLRDISVPAGFSNFEGMRSYIDNIDPKGAIE RNLARMSPLVSVTPKKLTWEDLRPIGPHIYNHELPEVPYNAFLLMSDELGLANMTEGKSKKPKTLAKECLEKYSTLRDQT DPILIMKSEKANENFLWKLWRDCVNTISNEEMSNELQKTNYAKWATGDGLTYQKIMKEVAIDDETMCQEEPKIPNKCRVA AWVQTEMNLLSTLTSKRALDLPEIGPDVAPVEHVGSERRKYFVNEINYCKASTVMMKYVLFHTSLLNESNASMGKYKVIP ITNRVVNEKGESFDMLYGLAVKGQSHLRGDTDVVTVVTFEFSSTDPRVDSGKWPKYTVFRIGSLFVSGREKSVYLYCRVN GTNKIQMKWGMEARRCLLQSMQQMEAIVEQESSIQGYDMTKACFKGDRVNSPKTFSIGTQEGKLVKGSFGKALRVIFTKC LMHYVFGNAQLEGFSAESRRLLLLIQALKDRKGPWVFDLEGMYSGIEECISNNPWVIQSAYWFNEWLGFEKEGSKVLESV DEIMDE ; 1 4 UNP Q5V8Y6_9INFB Q5V8Y6 ? 4 ;MNINPYFLFIDVPIQAAISTTFPYTGVPPYSHGTGTGYTIDTVIRTHEYSNKGKQYISDVTGCTMVDPTNGPLPEDNEPS AYAQLDCVLEALDRMDEEHPGLFQAASQNAMETLMVTTVDKLTQGRQTFDWTVCRNQPAATALNTTITSFRLNDLNGADK GGLIPFCQDIIDSLDRPEMTFFSVKNIKKKLPAKNRKGFLIKRIPMKVKDKITKVEYIKRALSLNTMTKDAERGKLKRRA IATAGIQIRGFVLVVENLAKNICENLEQSGLPVGGNEKKAKLSNAVAKMLSNCPPGGISMTVTGDNTKWNECLNPRIFLA MTERITRDSPIWFRDFCSIAPVLFSNKIARLGKGFMITSKTKRLKAQIPCPDLFSIPLERYNEETRAKLKKLKPFFNEEG TASLSPGMMMGMFNMLSTVLGVAALGIKNIGNKEYLWDGLQSSDDFALFVNAKDEETCMEGINDFYRTCKLLGINMSKKK SYCNETGMFEFTSMFYRDGFVSNFAMELPSFGVAGVNESADMAIGMTIIKNNMINNGMGPATAQTAIQLFIADYRYTYKC HRGDSKVEGKRMKIIKELWENTKGRDGLLVADGGPNIYNLRNLHIPEIVLKYNLMDPEYKGRLLHPQNPFVGHLSIEGIK EADITPAHGPVKKMDYDAVSGTHSWRTKRNRSILNTDQRNMILEEQCYAKCCNLFEACFNSASYRKPVGQHSMLEAMAHR LRMDARLDYESGRMSKDDFEKAMAHLGEIGYI ; 1 5 UNP Q5V8X3_9INFB Q5V8X3 ? 5 ;MTLAKIELLKQLLRDNEAKTVLKQTTVDQYNIIRKFNTSRIEKNPSLRMKWAMCSNFPLALTKGDMANRIPLEYKGIQLK TNAEDIGTKGQMCSIAAVTWWNTYGPIGDTEGFERVYESFFLRKMRLDNATWGRITFGPVERVRKRVLLNPLTKEMPPDE ASNVIMEILFPKEAGIPRESTWIHRELIKEKREKLKGTMITPIVLAYMLERELVARRRFLPVAGATSAEFIEMLHCLQGE NWRQIYHPGGNKLTESRSQSMIVACRKIIRRSIVASNPLELAVEIANKTVIDTEPLKSCLAAIDGGDVACDIIRAALGLK IRQRQRFGRLELKRISGRGFKNDEEILIGNGTIQKIGIWDGEEEFHVRCGECRGILKKSKMKLEKLLINSAKKEDMRDLI ILCMVFSQDTRMFQGVRGEINFLNRAGQLLSPMYQLQRYFLNRSNDLFDQWGYEESPKASELHGINESMNASDYTLKGVV VTRNVIDDFSSTETEKVSITKNLSLIKRTGEVIMGANDVSELESQAQLMITYDTPKMWEMGTTKELVQNTYQWVLKNLVT LKAQFLLGKEDMFQWDAFEAFESIIPQKMAGQYSGFARAVLKQMRDQEVMKTDQFIKLLPFCFSPPKLRSNGEPYQFLKL VLKGGGENFIEVRKGSPLFSYNPQTEVLTICGRMMSLKGKIEDEERNRSMGNAVLAGFLVSGKYDPDLGDFKTIEELEKL KPGEKANILLYQGKPVKVVKRKRYSALSNDISQGIKRQRMTVESMGWALS ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 4WRT R 1 ? 18 ? 4WRT 1 ? 18 ? 1 18 2 2 4WRT V 1 ? 14 ? 4WRT 1 ? 14 ? 1 14 3 3 4WRT A 15 ? 740 ? 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'expression tag' 789 73 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 39100 ? 1 MORE -250 ? 1 'SSA (A^2)' 67500 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER C 14 ? 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PRO B 606 TYR B 612 1 ? 7 HELX_P HELX_P58 AG4 ASN D 622 ? MET D 624 ? ASN B 613 MET B 615 5 ? 3 HELX_P HELX_P59 AG5 ASP D 625 ? LEU D 633 ? ASP B 616 LEU B 624 1 ? 9 HELX_P HELX_P60 AG6 SER D 644 ? LYS D 649 ? SER B 635 LYS B 640 1 ? 6 HELX_P HELX_P61 AG7 ARG D 680 ? THR D 685 ? ARG B 671 THR B 676 5 ? 6 HELX_P HELX_P62 AG8 ARG D 688 ? PHE D 708 ? ARG B 679 PHE B 699 1 ? 21 HELX_P HELX_P63 AG9 SER D 721 ? SER D 740 ? SER B 712 SER B 731 1 ? 20 HELX_P HELX_P64 AH1 SER D 744 ? ILE D 758 ? SER B 735 ILE B 749 1 ? 15 HELX_P HELX_P65 AH2 MET E 10 ? ASP E 24 ? MET C 1 ASP C 15 1 ? 15 HELX_P HELX_P66 AH3 ASP E 24 ? THR E 34 ? ASP C 15 THR C 25 1 ? 11 HELX_P HELX_P67 AH4 THR E 35 ? ARG E 43 ? THR C 26 ARG C 34 1 ? 9 HELX_P HELX_P68 AH5 ASN E 53 ? MET E 62 ? ASN C 44 MET C 53 1 ? 10 HELX_P HELX_P69 AH6 GLY E 73 ? ARG E 78 ? GLY C 64 ARG C 69 1 ? 6 HELX_P HELX_P70 AH7 SER E 103 ? GLY E 114 ? SER C 94 GLY C 105 1 ? 12 HELX_P HELX_P71 AH8 GLY E 121 ? TYR E 126 ? GLY C 112 TYR C 117 1 ? 6 HELX_P HELX_P72 AH9 TYR E 126 ? ASN E 138 ? TYR C 117 ASN C 129 1 ? 13 HELX_P HELX_P73 AI1 PRO E 166 ? PHE E 179 ? PRO C 157 PHE C 170 1 ? 14 HELX_P HELX_P74 AI2 PRO E 180 ? ALA E 183 ? PRO C 171 ALA C 174 5 ? 4 HELX_P HELX_P75 AI3 ARG E 187 ? HIS E 193 ? ARG C 178 HIS C 184 1 ? 7 HELX_P HELX_P76 AI4 HIS E 193 ? LEU E 204 ? HIS C 184 LEU C 195 1 ? 12 HELX_P HELX_P77 AI5 THR E 210 ? GLU E 221 ? THR C 201 GLU C 212 1 ? 12 HELX_P HELX_P78 AI6 SER E 236 ? GLU E 241 ? SER C 227 GLU C 232 1 ? 6 HELX_P HELX_P79 AI7 MET E 242 ? GLN E 247 ? MET C 233 GLN C 238 1 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role hydrog1 hydrog ? ? 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R U 9 V A 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? B A 1 N6 ? ? ? 1_555 B A 10 N3 ? ? V A 1 V A 10 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-A MISPAIR' ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? B G 2 N1 ? ? ? 1_555 B C 9 N3 ? ? V G 2 V C 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? B G 2 N2 ? ? ? 1_555 B C 9 O2 ? ? V G 2 V C 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? B G 2 O6 ? ? ? 1_555 B C 9 N4 ? ? V G 2 V C 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? B U 3 N3 ? ? ? 1_555 B A 8 N1 ? ? V U 3 V A 8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? B U 3 O4 ? ? ? 1_555 B A 8 N6 ? ? V U 3 V A 8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? B A 4 N3 ? ? ? 1_555 B A 7 N6 ? ? V A 4 V A 7 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-A MISPAIR' ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # _struct_mon_prot_cis.pdbx_id 1 _struct_mon_prot_cis.label_comp_id LEU _struct_mon_prot_cis.label_seq_id 280 _struct_mon_prot_cis.label_asym_id D _struct_mon_prot_cis.label_alt_id . _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code ? _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id LEU _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id 271 _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id B _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 281 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 D _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 ? _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 272 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 B _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num 1 _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 2.51 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 5 ? AA3 ? 6 ? AA4 ? 6 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 5 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 3 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 2 ? 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MET B 488 PHE B 491 AB3 2 MET D 503 ? ARG D 506 ? MET B 494 ARG B 497 AB4 1 GLU D 650 ? ALA D 651 ? GLU B 641 ALA B 642 AB4 2 MET D 663 ? ASP D 664 ? MET B 654 ASP B 655 AB5 1 LEU E 68 ? THR E 71 ? LEU C 59 THR C 62 AB5 2 LYS E 98 ? CYS E 102 ? LYS C 89 CYS C 93 AB5 3 LYS E 89 ? GLU E 93 ? LYS C 80 GLU C 84 AB6 1 GLU E 82 ? TYR E 83 ? GLU C 73 TYR C 74 AB6 2 ILE E 86 ? GLN E 87 ? ILE C 77 GLN C 78 AB7 1 THR E 140 ? PHE E 146 ? THR C 131 PHE C 137 AB7 2 TRP E 251 ? HIS E 256 ? TRP C 242 HIS C 247 AB8 1 VAL E 152 ? LEU E 157 ? VAL C 143 LEU C 148 AB8 2 ARG E 226 ? VAL E 231 ? 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