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'X-RAY DIFFRACTION' 5.7648 6.3438 4150 . 146 4004 81.0000 . . . 0.3097 . 0.2768 . . . . . . 14 . . . 'X-RAY DIFFRACTION' 6.3438 7.2590 4200 . 147 4053 81.0000 . . . 0.3197 . 0.2908 . . . . . . 14 . . . 'X-RAY DIFFRACTION' 7.2590 9.1353 4154 . 145 4009 79.0000 . . . 0.2930 . 0.2643 . . . . . . 14 . . . 'X-RAY DIFFRACTION' 9.1353 47.9634 4012 . 141 3871 73.0000 . . . 0.2539 . 0.2230 . . . . . . 14 . . . # loop_ _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details 1 1 'chain A' 1 2 'chain D' 1 3 'chain E' 1 4 'chain J' 1 5 'chain M' 2 1 'chain B' 2 2 'chain F' 2 3 'chain H' 2 4 'chain K' 2 5 'chain N' 3 1 'chain C' 3 2 'chain G' 3 3 'chain I' 3 4 'chain L' 3 5 'chain O' # loop_ _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.selection_details 1 1 1 D SER 72 . 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'chain O' # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 ? 2 ? 3 ? # _struct.entry_id 4YVW _struct.title 'crystal structure of an enterovirus 71/coxsackievirus A16 chimeric virus-like particle' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? # _struct_keywords.entry_id 4YVW _struct_keywords.text 'virus-like particle, neutralization epitope, VIRUS' _struct_keywords.pdbx_keywords VIRUS # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 2 ? I N N 2 ? J N N 2 ? K N N 2 ? L N N 3 ? M N N 3 ? N N N 3 ? O N N 3 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 75 ? THR A 78 ? THR E 75 THR E 78 5 ? 4 HELX_P HELX_P2 AA2 THR A 79 ? SER A 85 ? THR E 79 SER E 85 1 ? 7 HELX_P HELX_P3 AA3 GLN A 118 ? GLU A 124 ? GLN E 118 GLU E 124 1 ? 7 HELX_P HELX_P4 AA4 LEU A 169 ? THR A 173 ? LEU E 169 THR E 173 5 ? 5 HELX_P HELX_P5 AA5 CYS A 225 ? MET A 229 ? CYS E 225 MET E 229 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 AA6 LEU B 43 ? GLN B 48 ? 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LEU M 169 THR M 173 5 ? 5 HELX_P HELX_P35 AD8 CYS G 225 ? MET G 229 ? CYS M 225 MET M 229 5 ? 5 HELX_P HELX_P36 AD9 LEU H 43 ? GLN H 48 ? LEU B 43 GLN B 48 1 ? 6 HELX_P HELX_P37 AE1 SER H 64 ? ARG H 68 ? SER B 64 ARG B 68 5 ? 5 HELX_P HELX_P38 AE2 GLY H 94 ? SER H 98 ? GLY B 94 SER B 98 5 ? 5 HELX_P HELX_P39 AE3 THR H 99 ? CYS H 105 ? THR B 99 CYS B 105 1 ? 7 HELX_P HELX_P40 AE4 GLY H 106 ? TYR H 108 ? GLY B 106 TYR B 108 5 ? 3 HELX_P HELX_P41 AE5 ASP H 145 ? MET H 150 ? ASP B 145 MET B 150 1 ? 6 HELX_P HELX_P42 AE6 GLY H 160 ? GLN H 162 ? GLY B 160 GLN B 162 5 ? 3 HELX_P HELX_P43 AE7 LEU I 43 ? GLN I 48 ? LEU H 43 GLN H 48 1 ? 6 HELX_P HELX_P44 AE8 SER I 64 ? ARG I 68 ? SER H 64 ARG H 68 5 ? 5 HELX_P HELX_P45 AE9 GLY I 94 ? SER I 98 ? GLY H 94 SER H 98 5 ? 5 HELX_P HELX_P46 AF1 THR I 99 ? CYS I 105 ? THR H 99 CYS H 105 1 ? 7 HELX_P HELX_P47 AF2 ASP I 145 ? MET I 150 ? ASP H 145 MET H 150 1 ? 6 HELX_P HELX_P48 AF3 LEU J 43 ? GLN J 48 ? 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PRO O 171 CYS O 178 5 ? 8 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLY 202 C . ? GLY 133 G THR 203 C ? THR 134 G 1 -1.12 2 GLY 226 C . ? GLY 157 G PHE 227 C ? PHE 158 G 1 0.91 3 GLY 202 L . ? GLY 133 C THR 203 L ? THR 134 C 1 -2.45 4 GLY 226 L . ? 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AE5 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? parallel AA4 3 4 ? parallel AA4 4 5 ? parallel AA4 5 6 ? parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB3 4 5 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB6 4 5 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB8 4 5 ? parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC1 4 5 ? parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC2 4 5 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD5 3 4 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD6 3 4 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD7 3 4 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD8 3 4 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AD9 3 4 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE1 3 4 ? anti-parallel AE2 1 2 ? parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE2 3 4 ? anti-parallel AE2 4 5 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE3 3 4 ? anti-parallel AE4 1 2 ? parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE4 3 4 ? anti-parallel AE4 4 5 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE5 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 GLY A 88 ? LEU A 95 ? GLY E 88 LEU E 95 AA1 2 LEU A 247 ? MET A 255 ? LEU E 247 MET E 255 AA1 3 ALA A 133 ? CYS A 140 ? ALA E 133 CYS E 140 AA1 4 ALA A 188 ? VAL A 192 ? ALA E 188 VAL E 192 AA1 5 ALA B 22 ? PRO B 23 ? ALA F 22 PRO F 23 AA2 1 TYR A 106 ? ASP A 110 ? TYR E 106 ASP E 110 AA2 2 THR A 232 ? THR A 237 ? THR E 232 THR E 237 AA2 3 LEU A 150 ? VAL A 156 ? LEU E 150 VAL E 156 AA2 4 SER A 178 ? LYS A 182 ? SER E 178 LYS E 182 AA2 5 PHE K 13 ? LEU K 14 ? PHE N 13 LEU N 14 AA3 1 TYR A 201 ? GLN A 202 ? TYR E 201 GLN E 202 AA3 2 TYR A 128 ? ARG A 130 ? TYR E 128 ARG E 130 AA3 3 ARG A 259 ? ALA A 260 ? ARG E 259 ALA E 260 AA4 1 PHE B 2 ? LEU B 6 ? PHE F 2 LEU F 6 AA4 2 PHE J 2 ? LEU J 6 ? PHE K 2 LEU K 6 AA4 3 PHE I 2 ? LEU I 6 ? PHE H 2 LEU H 6 AA4 4 PHE H 2 ? LEU H 6 ? PHE B 2 LEU B 6 AA4 5 PHE K 2 ? LEU K 6 ? PHE N 2 LEU N 6 AA4 6 PHE B 2 ? LEU B 6 ? PHE F 2 LEU F 6 AA5 1 PHE B 13 ? LEU B 14 ? PHE F 13 LEU F 14 AA5 2 SER F 178 ? LYS F 182 ? SER J 178 LYS J 182 AA5 3 LEU F 150 ? VAL F 156 ? 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ILE G 234 MET G 241 AB2 1 GLY D 88 ? LEU D 95 ? GLY A 88 LEU A 95 AB2 2 LEU D 247 ? MET D 255 ? LEU A 247 MET A 255 AB2 3 ALA D 133 ? CYS D 140 ? ALA A 133 CYS A 140 AB2 4 ALA D 188 ? VAL D 192 ? ALA A 188 VAL A 192 AB2 5 ALA H 22 ? PRO H 23 ? ALA B 22 PRO B 23 AB3 1 TYR D 106 ? ASP D 110 ? TYR A 106 ASP A 110 AB3 2 THR D 232 ? THR D 237 ? THR A 232 THR A 237 AB3 3 LEU D 150 ? VAL D 156 ? LEU A 150 VAL A 156 AB3 4 SER D 178 ? LYS D 182 ? SER A 178 LYS A 182 AB3 5 PHE I 13 ? LEU I 14 ? PHE H 13 LEU H 14 AB4 1 TYR D 201 ? GLN D 202 ? TYR A 201 GLN A 202 AB4 2 TYR D 128 ? ARG D 130 ? TYR A 128 ARG A 130 AB4 3 ARG D 259 ? ALA D 260 ? ARG A 259 ALA A 260 AB5 1 GLY E 88 ? LEU E 95 ? GLY D 88 LEU D 95 AB5 2 LEU E 247 ? MET E 255 ? LEU D 247 MET D 255 AB5 3 ALA E 133 ? CYS E 140 ? ALA D 133 CYS D 140 AB5 4 ALA E 188 ? VAL E 192 ? ALA D 188 VAL D 192 AB5 5 ALA I 22 ? PRO I 23 ? ALA H 22 PRO H 23 AB6 1 TYR E 106 ? ASP E 110 ? TYR D 106 ASP D 110 AB6 2 THR E 232 ? THR E 237 ? THR D 232 THR D 237 AB6 3 LEU E 150 ? VAL E 156 ? LEU D 150 VAL D 156 AB6 4 SER E 178 ? LYS E 182 ? SER D 178 LYS D 182 AB6 5 PHE J 13 ? LEU J 14 ? PHE K 13 LEU K 14 AB7 1 TYR E 201 ? GLN E 202 ? TYR D 201 GLN D 202 AB7 2 TYR E 128 ? ARG E 130 ? TYR D 128 ARG D 130 AB7 3 ARG E 259 ? ALA E 260 ? ARG D 259 ALA D 260 AB8 1 GLY F 88 ? LEU F 95 ? GLY J 88 LEU J 95 AB8 2 LEU F 247 ? MET F 255 ? LEU J 247 MET J 255 AB8 3 ALA F 133 ? CYS F 140 ? ALA J 133 CYS J 140 AB8 4 ALA F 188 ? VAL F 192 ? ALA J 188 VAL J 192 AB8 5 ALA J 22 ? PRO J 23 ? ALA K 22 PRO K 23 AB9 1 TYR F 201 ? GLN F 202 ? TYR J 201 GLN J 202 AB9 2 TYR F 128 ? ARG F 130 ? TYR J 128 ARG J 130 AB9 3 ARG F 259 ? ALA F 260 ? ARG J 259 ALA J 260 AC1 1 GLY G 88 ? LEU G 95 ? GLY M 88 LEU M 95 AC1 2 LEU G 247 ? MET G 255 ? LEU M 247 MET M 255 AC1 3 ALA G 133 ? CYS G 140 ? ALA M 133 CYS M 140 AC1 4 ALA G 188 ? VAL G 192 ? ALA M 188 VAL M 192 AC1 5 ALA K 22 ? PRO K 23 ? ALA N 22 PRO N 23 AC2 1 TYR G 106 ? ASP G 110 ? TYR M 106 ASP M 110 AC2 2 THR G 232 ? THR G 237 ? THR M 232 THR M 237 AC2 3 LEU G 150 ? VAL G 156 ? LEU M 150 VAL M 156 AC2 4 SER G 178 ? LYS G 182 ? SER M 178 LYS M 182 AC2 5 PHE H 13 ? LEU H 14 ? PHE B 13 LEU B 14 AC3 1 MET G 129 ? ARG G 130 ? MET M 129 ARG M 130 AC3 2 ARG G 259 ? ALA G 260 ? ARG M 259 ALA M 260 AC4 1 THR H 51 ? LEU H 53 ? THR B 51 LEU B 53 AC4 2 THR H 211 ? ALA H 220 ? THR B 211 ALA B 220 AC4 3 ARG H 70 ? SER H 74 ? ARG B 70 SER B 74 AC5 1 THR H 51 ? LEU H 53 ? THR B 51 LEU B 53 AC5 2 THR H 211 ? ALA H 220 ? THR B 211 ALA B 220 AC5 3 SER H 112 ? PHE H 121 ? SER B 112 PHE B 121 AC5 4 SER H 164 ? SER H 173 ? SER B 164 SER B 173 AC6 1 GLU H 81 ? ARG H 87 ? GLU B 81 ARG B 87 AC6 2 LEU H 193 ? TYR H 198 ? LEU B 193 TYR B 198 AC6 3 LYS H 130 ? THR H 136 ? LYS B 130 THR B 136 AC6 4 HIS H 154 ? ASP H 158 ? HIS B 154 ASP B 158 AC7 1 THR I 51 ? ILE I 52 ? THR H 51 ILE H 52 AC7 2 THR I 211 ? ALA I 220 ? THR H 211 ALA H 220 AC7 3 ARG I 70 ? SER I 74 ? ARG H 70 SER H 74 AC8 1 THR I 51 ? ILE I 52 ? THR H 51 ILE H 52 AC8 2 THR I 211 ? ALA I 220 ? THR H 211 ALA H 220 AC8 3 SER I 112 ? PHE I 121 ? SER H 112 PHE H 121 AC8 4 SER I 164 ? SER I 173 ? SER H 164 SER H 173 AC9 1 GLU I 81 ? ARG I 87 ? GLU H 81 ARG H 87 AC9 2 LEU I 193 ? TYR I 198 ? LEU H 193 TYR H 198 AC9 3 LYS I 130 ? THR I 136 ? LYS H 130 THR H 136 AC9 4 THR I 153 ? ASP I 158 ? THR H 153 ASP H 158 AD1 1 THR J 51 ? ILE J 52 ? THR K 51 ILE K 52 AD1 2 THR J 211 ? ALA J 220 ? THR K 211 ALA K 220 AD1 3 TRP J 111 ? PHE J 121 ? TRP K 111 PHE K 121 AD1 4 SER J 164 ? SER J 173 ? SER K 164 SER K 173 AD2 1 ARG J 70 ? SER J 74 ? ARG K 70 SER K 74 AD2 2 THR J 211 ? ALA J 220 ? THR K 211 ALA K 220 AD2 3 TRP J 111 ? PHE J 121 ? TRP K 111 PHE K 121 AD2 4 THR J 225 ? MET J 226 ? THR K 225 MET K 226 AD3 1 CYS J 83 ? ARG J 87 ? CYS K 83 ARG K 87 AD3 2 LEU J 193 ? TYR J 198 ? LEU K 193 TYR K 198 AD3 3 LYS J 130 ? THR J 136 ? LYS K 130 THR K 136 AD3 4 HIS J 154 ? ASP J 158 ? 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