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De-ubiquination enzyme. Hydrolase., HYDROLASE' _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? 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ALA B 9 SER B 13 5 ? 5 HELX_P HELX_P17 AB8 ASN B 19 ? ASP B 33 ? ASN B 14 ASP B 28 1 ? 15 HELX_P HELX_P18 AB9 THR B 47 ? TYR B 51 ? THR B 42 TYR B 46 5 ? 5 HELX_P HELX_P19 AC1 ILE B 68 ? ILE B 74 ? ILE B 63 ILE B 69 1 ? 7 HELX_P HELX_P20 AC2 ASP B 75 ? GLN B 85 ? ASP B 70 GLN B 80 1 ? 11 HELX_P HELX_P21 AC3 ASN B 107 ? GLY B 119 ? ASN B 102 GLY B 114 1 ? 13 HELX_P HELX_P22 AC4 LEU B 125 ? THR B 138 ? LEU B 120 THR B 133 1 ? 14 HELX_P HELX_P23 AC5 THR B 140 ? GLN B 155 ? THR B 135 GLN B 150 1 ? 16 HELX_P HELX_P24 AC6 ASN B 168 ? SER B 181 ? ASN B 163 SER B 176 1 ? 14 HELX_P HELX_P25 AC7 GLU B 197 ? ARG B 209 ? GLU B 192 ARG B 204 1 ? 13 HELX_P HELX_P26 AC8 PRO B 244 ? CYS B 248 ? PRO B 239 CYS B 243 5 ? 5 HELX_P HELX_P27 AC9 THR B 297 ? MET B 303 ? THR B 292 MET B 298 1 ? 7 HELX_P HELX_P28 AD1 MET B 303 ? LEU B 312 ? MET B 298 LEU B 307 1 ? 10 HELX_P HELX_P29 AD2 PRO B 341 ? ILE B 344 ? PRO B 336 ILE B 339 5 ? 4 HELX_P HELX_P30 AD3 ASN B 345 ? LYS B 360 ? 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ASN F 340 GLU F 358 1 ? 19 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale1 covale both ? A ASN 107 C ? ? ? 1_555 A YCM 108 N ? ? A ASN 102 A YCM 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale2 covale both ? A YCM 108 C ? ? ? 1_555 A LEU 109 N ? ? A YCM 103 A LEU 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale3 covale both ? B ASN 107 C ? ? ? 1_555 B YCM 108 N ? ? B ASN 102 B YCM 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale4 covale both ? B YCM 108 C ? ? ? 1_555 B LEU 109 N ? ? B YCM 103 B LEU 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale5 covale both ? C ASN 107 C ? ? ? 1_555 C YCM 108 N ? ? C ASN 102 C YCM 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? covale6 covale both ? C YCM 108 C ? ? ? 1_555 C LEU 109 N ? ? C YCM 103 C LEU 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale7 covale both ? D ASN 107 C ? ? ? 1_555 D YCM 108 N ? ? D ASN 102 D YCM 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale8 covale both ? D YCM 108 C ? ? ? 1_555 D LEU 109 N ? ? D YCM 103 D LEU 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale9 covale both ? E ASN 107 C ? ? ? 1_555 E YCM 108 N ? ? E ASN 102 E YCM 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale10 covale both ? E YCM 108 C ? ? ? 1_555 E LEU 109 N ? ? E YCM 103 E LEU 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale11 covale both ? F ASN 107 C ? ? ? 1_555 F YCM 108 N ? ? F ASN 102 F YCM 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale12 covale both ? F YCM 108 C ? ? ? 1_555 F LEU 109 N ? ? F YCM 103 F LEU 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? # _struct_conn_type.id covale _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # _struct_mon_prot_cis.pdbx_id 1 _struct_mon_prot_cis.label_comp_id PHE _struct_mon_prot_cis.label_seq_id 157 _struct_mon_prot_cis.label_asym_id E _struct_mon_prot_cis.label_alt_id . _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code ? _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id PHE _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id 152 _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id E _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 VAL _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 158 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 E _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 ? _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 VAL _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 153 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 E _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num 1 _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 2.86 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 2 ? 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VAL F 309 ILE F 310 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N VAL A 98 ? 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N ILE C 210 AA7 4 5 N ILE C 212 ? N ILE C 207 O TYR C 238 ? O TYR C 233 AA8 1 2 N VAL C 278 ? N VAL C 273 O ALA C 333 ? O ALA C 328 AA8 2 3 O ALA C 332 ? O ALA C 327 N ILE C 315 ? N ILE C 310 AA9 1 2 N VAL D 98 ? N VAL D 93 O VAL D 266 ? O VAL D 261 AA9 2 3 O VAL D 263 ? O VAL D 258 N GLY D 256 ? N GLY D 251 AA9 3 4 O TYR D 257 ? O TYR D 252 N ILE D 215 ? N ILE D 210 AA9 4 5 N ILE D 212 ? N ILE D 207 O TYR D 238 ? O TYR D 233 AB1 1 2 N VAL D 278 ? N VAL D 273 O ALA D 333 ? O ALA D 328 AB1 2 3 O ALA D 332 ? O ALA D 327 N ILE D 315 ? N ILE D 310 AB2 1 2 N ASN D 282 ? N ASN D 277 O GLU D 289 ? O GLU D 284 AB3 1 2 N VAL E 98 ? N VAL E 93 O VAL E 266 ? O VAL E 261 AB3 2 3 O VAL E 263 ? O VAL E 258 N GLY E 256 ? N GLY E 251 AB3 3 4 O TYR E 257 ? O TYR E 252 N ILE E 215 ? N ILE E 210 AB3 4 5 N ILE E 212 ? N ILE E 207 O TYR E 238 ? O TYR E 233 AB4 1 2 N VAL E 278 ? N VAL E 273 O ALA E 333 ? O ALA E 328 AB4 2 3 O ALA E 332 ? O ALA E 327 N ILE E 315 ? N ILE E 310 AB5 1 2 N VAL F 98 ? 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