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? -8.70 -113.36 264 1 THR G 471 ? ? -129.93 -160.31 265 1 ASP G 505 ? ? -94.44 -120.06 266 1 ALA H 3 ? ? -169.26 -46.88 267 1 ALA H 8 ? ? -17.85 -72.85 268 1 ALA H 68 ? ? -169.57 -13.60 269 1 ASP H 80 ? ? -160.02 -51.60 270 1 VAL H 82 ? ? -142.56 -72.91 271 1 SER H 88 ? ? -159.87 -20.17 272 1 ALA H 100 ? ? -39.18 -35.21 273 1 ILE H 108 ? ? -109.88 -80.05 274 1 HIS H 109 ? ? -170.01 124.42 275 1 GLN H 126 ? ? -90.03 -78.25 276 1 SER H 131 ? ? -100.01 -160.00 277 1 ALA H 132 ? ? -89.95 -79.09 278 1 VAL H 133 ? ? 49.99 -140.01 279 1 VAL H 140 ? ? 79.04 -85.21 280 1 LYS H 141 ? ? 65.79 116.89 281 1 LEU H 146 ? ? -149.92 -140.01 282 1 ASN H 148 ? ? -143.82 -135.90 283 1 THR H 160 ? ? -50.00 -2.92 284 1 ASN H 182 ? ? -5.27 -110.01 285 1 GLU H 184 ? ? 160.03 100.00 286 1 ALA H 185 ? ? 179.99 10.01 287 1 ASP H 198 ? ? 73.27 -3.50 288 1 ASP H 208 ? ? -110.04 53.92 289 1 GLN H 215 ? ? 119.96 149.71 290 1 ILE H 274 ? ? -19.98 111.44 291 1 GLN H 281 ? ? 156.59 -172.28 292 1 SER H 320 ? ? -125.01 -152.88 293 1 THR H 321 ? ? -69.94 -174.90 294 1 PRO H 325 ? ? -56.21 -151.02 295 1 GLU H 326 ? ? 30.01 -120.59 296 1 LYS H 334 ? ? -90.01 -80.02 297 1 MET H 340 ? ? -0.05 10.19 298 1 LEU H 362 ? ? 57.33 170.75 299 1 THR H 366 ? ? 109.79 77.30 300 1 GLN H 368 ? ? -21.71 -69.92 301 1 LEU H 370 ? ? 42.60 7.94 302 1 SER H 391 ? ? 48.74 19.99 303 1 ILE H 480 ? ? 10.40 108.21 304 1 ALA H 497 ? ? 66.34 -28.69 305 1 ASP H 505 ? ? -100.07 63.75 306 1 LYS H 509 ? ? 59.47 170.00 307 1 PRO H 512 ? ? 1.49 156.02 308 1 ASP I 4 ? ? 11.76 83.19 309 1 ALA I 8 ? ? 29.63 -100.04 310 1 ALA I 68 ? ? -170.76 -20.31 311 1 VAL I 82 ? ? -166.19 -59.59 312 1 SER I 88 ? ? -155.75 -22.51 313 1 ILE I 108 ? ? 179.57 143.02 314 1 HIS I 109 ? ? 18.59 97.00 315 1 LEU I 129 ? ? 48.75 -18.99 316 1 ASN I 130 ? ? -110.18 53.25 317 1 VAL I 133 ? ? 50.30 -147.01 318 1 ASP I 134 ? ? -90.03 -76.01 319 1 SER I 137 ? ? 179.95 50.00 320 1 GLU I 139 ? ? 149.98 109.98 321 1 VAL I 140 ? ? 86.44 -69.71 322 1 LYS I 141 ? ? 71.76 119.67 323 1 LEU I 146 ? ? -140.04 -129.96 324 1 ASN I 148 ? ? -121.63 -119.75 325 1 THR I 160 ? ? -59.98 29.59 326 1 LYS I 178 ? ? -31.62 137.96 327 1 ASN I 182 ? ? 21.16 88.47 328 1 GLU I 184 ? ? 139.94 -140.02 329 1 LEU I 192 ? ? -60.03 30.15 330 1 SER I 195 ? ? -0.25 -160.02 331 1 LEU I 196 ? ? 9.84 -60.75 332 1 ASP I 198 ? ? 59.42 13.33 333 1 SER I 199 ? ? 171.74 129.99 334 1 GLN I 215 ? ? 149.99 146.69 335 1 ILE I 274 ? ? -20.04 114.78 336 1 GLN I 281 ? ? 158.36 -171.26 337 1 SER I 320 ? ? -120.43 -150.04 338 1 PHE I 322 ? ? -39.99 -9.37 339 1 GLU I 326 ? ? 102.66 -137.72 340 1 GLU I 343 ? ? -170.00 -70.00 341 1 LEU I 362 ? ? 58.33 170.85 342 1 THR I 366 ? ? 0.08 96.93 343 1 THR I 393 ? ? -148.31 -153.35 344 1 THR I 471 ? ? -129.80 -138.40 345 1 ILE I 508 ? ? -110.28 -99.97 346 1 ALA I 510 ? ? -128.56 -98.65 347 1 ASP J 4 ? ? 10.92 14.10 348 1 ALA J 8 ? ? 29.53 -100.00 349 1 ALA J 46 ? ? 74.36 -37.81 350 1 SER J 47 ? ? 150.04 -119.98 351 1 ALA J 68 ? ? -165.18 -7.14 352 1 VAL J 82 ? ? -169.95 -62.15 353 1 ASP J 84 ? ? -47.20 -122.82 354 1 ILE J 108 ? ? -120.01 -90.01 355 1 SER J 131 ? ? -89.98 -79.91 356 1 ALA J 132 ? ? -171.30 89.91 357 1 ASP J 134 ? ? 132.52 168.88 358 1 GLU J 139 ? ? 171.54 130.08 359 1 VAL J 140 ? ? 66.02 -60.07 360 1 LYS J 141 ? ? 50.34 130.00 361 1 PHE J 142 ? ? -65.72 -96.41 362 1 LEU J 146 ? ? -145.69 -150.90 363 1 ASN J 148 ? ? -140.04 -110.52 364 1 LEU J 159 ? ? -40.01 -9.99 365 1 THR J 160 ? ? -69.99 69.98 366 1 HIS J 161 ? ? -124.56 -73.69 367 1 SER J 180 ? ? 60.00 10.01 368 1 GLU J 184 ? ? -149.42 -85.09 369 1 ALA J 185 ? ? -50.03 39.97 370 1 ASP J 198 ? ? 66.35 -8.14 371 1 GLN J 215 ? ? 96.07 145.00 372 1 ILE J 274 ? ? -19.97 109.62 373 1 GLN J 281 ? ? 160.01 -159.99 374 1 SER J 320 ? ? -150.03 -156.72 375 1 PHE J 322 ? ? -29.95 0.01 376 1 PRO J 325 ? ? -45.37 -168.84 377 1 GLU J 326 ? ? 49.93 -139.95 378 1 LYS J 334 ? ? -90.01 -80.04 379 1 ARG J 363 ? ? -117.51 -89.99 380 1 THR J 366 ? ? 92.98 106.33 381 1 GLN J 367 ? ? -179.97 -159.69 382 1 ASP J 379 ? ? -160.01 -50.05 383 1 CYS J 382 ? ? 149.96 -54.53 384 1 PRO J 416 ? ? -31.16 -70.02 385 1 THR J 471 ? ? -126.14 -134.30 386 1 ALA K 3 ? ? 50.09 159.94 387 1 GLU K 5 ? ? -0.18 95.99 388 1 ALA K 8 ? ? 39.33 -90.00 389 1 LYS K 33 ? ? -106.22 69.47 390 1 ALA K 46 ? ? -90.00 -79.99 391 1 LEU K 48 ? ? 30.01 50.76 392 1 ALA K 68 ? ? -172.40 -19.95 393 1 VAL K 82 ? ? -169.99 -41.95 394 1 ASP K 84 ? ? -113.79 -117.32 395 1 SER K 88 ? ? -144.07 -18.12 396 1 LYS K 107 ? ? 43.16 29.04 397 1 ILE K 108 ? ? -109.98 -99.94 398 1 LEU K 129 ? ? 60.04 -35.57 399 1 SER K 131 ? ? 120.05 -127.47 400 1 ASP K 134 ? ? -156.67 -147.00 401 1 HIS K 135 ? ? -160.47 -146.63 402 1 ASP K 138 ? ? -73.06 -70.01 403 1 GLU K 139 ? ? -179.98 140.03 404 1 VAL K 140 ? ? 65.66 -63.50 405 1 LYS K 141 ? ? 54.30 113.29 406 1 PHE K 142 ? ? -60.31 -86.80 407 1 LEU K 146 ? ? -150.50 -140.36 408 1 ASN K 148 ? ? -135.09 -120.04 409 1 THR K 160 ? ? -64.67 84.76 410 1 HIS K 161 ? ? -150.11 -80.21 411 1 ASN K 182 ? ? 139.96 -175.02 412 1 LEU K 192 ? ? -40.33 29.93 413 1 PHE K 205 ? ? 87.17 126.44 414 1 GLN K 215 ? ? 119.94 155.12 415 1 ILE K 274 ? ? -19.98 119.59 416 1 GLN K 281 ? ? 169.99 -169.96 417 1 SER K 320 ? ? -132.29 -144.80 418 1 PHE K 322 ? ? -40.12 -10.07 419 1 PRO K 325 ? ? -46.09 -165.40 420 1 GLU K 326 ? ? 50.04 -139.88 421 1 LYS K 334 ? ? -150.35 -71.97 422 1 GLU K 343 ? ? -110.01 -90.02 423 1 SER K 350 ? ? 30.12 171.35 424 1 ALA K 365 ? ? 30.00 139.97 425 1 THR K 366 ? ? 40.00 22.60 426 1 GLN K 368 ? ? 159.68 -48.45 427 1 SER K 391 ? ? 70.00 -0.85 428 1 THR K 471 ? ? -138.49 -150.49 429 1 ILE K 508 ? ? -140.05 -110.05 430 1 LYS K 509 ? ? 129.95 -109.99 431 1 ALA K 510 ? ? -157.34 -108.07 432 1 PRO K 512 ? ? -95.01 -89.82 433 1 ASP L 4 ? ? 106.62 79.96 434 1 ALA L 8 ? ? 22.83 -81.76 435 1 ALA L 68 ? ? -170.03 -14.72 436 1 VAL L 82 ? ? -179.81 -12.41 437 1 ASP L 84 ? ? -110.01 -94.26 438 1 LEU L 129 ? ? 59.99 19.35 439 1 SER L 131 ? ? 26.64 130.03 440 1 ALA L 132 ? ? 29.95 139.86 441 1 ASP L 138 ? ? -70.06 -71.76 442 1 GLU L 139 ? ? 169.97 130.05 443 1 VAL L 140 ? ? 74.59 -74.28 444 1 LYS L 141 ? ? 57.21 112.98 445 1 LEU L 146 ? ? -146.19 -150.00 446 1 ASN L 148 ? ? -130.06 -99.96 447 1 ASN L 182 ? ? -69.96 -174.95 448 1 SER L 199 ? ? -174.66 136.91 449 1 GLN L 215 ? ? 124.20 150.60 450 1 ILE L 274 ? ? -20.32 123.52 451 1 SER L 320 ? ? -130.21 -160.00 452 1 PHE L 322 ? ? -39.99 -10.04 453 1 HIS L 324 ? ? -32.28 -33.71 454 1 PRO L 325 ? ? -49.95 -169.36 455 1 GLU L 326 ? ? 49.98 -149.11 456 1 LYS L 334 ? ? -110.02 -88.11 457 1 THR L 366 ? ? 69.79 69.88 458 1 ASP L 371 ? ? 142.00 -37.20 459 1 SER L 391 ? ? 51.93 19.85 460 1 THR L 471 ? ? -125.53 -131.10 461 1 ALA L 511 ? ? 20.16 -169.45 462 1 ALA M 8 ? ? 54.60 -120.79 463 1 SER M 47 ? ? -172.51 -159.97 464 1 ALA M 68 ? ? 178.49 -33.50 465 1 VAL M 82 ? ? -160.28 -50.28 466 1 LYS M 107 ? ? 39.94 40.01 467 1 ILE M 108 ? ? -139.95 -131.18 468 1 ALA M 115 ? ? -50.03 -3.14 469 1 HIS M 135 ? ? 50.08 -35.73 470 1 SER M 137 ? ? 90.06 64.67 471 1 GLU M 139 ? ? 179.99 139.96 472 1 VAL M 140 ? ? 59.86 -66.13 473 1 LYS M 141 ? ? 56.03 119.87 474 1 PHE M 142 ? ? -61.78 -71.75 475 1 LEU M 146 ? ? -140.49 -149.96 476 1 ASN M 148 ? ? -130.01 -100.03 477 1 LEU M 159 ? ? -44.81 -9.97 478 1 ASN M 182 ? ? 59.90 157.15 479 1 GLU M 184 ? ? 139.97 -140.00 480 1 ASP M 198 ? ? 70.07 -0.04 481 1 LEU M 335 ? ? 170.03 129.54 482 1 VAL M 339 ? ? -100.04 -89.13 483 1 MET M 340 ? ? 150.65 109.95 484 1 GLU M 343 ? ? -101.54 -79.96 485 1 THR M 366 ? ? 145.89 101.52 486 1 GLN M 367 ? ? 170.59 -170.30 487 1 SER M 391 ? ? 56.47 15.22 488 1 PRO M 416 ? ? -55.34 -76.19 489 1 THR M 471 ? ? -129.42 -131.61 490 1 ASP M 505 ? ? -98.50 -81.01 491 1 ILE M 507 ? ? 60.01 80.05 492 1 ALA M 511 ? ? 97.91 -31.69 493 1 PRO M 512 ? ? -10.53 -169.98 494 1 ALA N 8 ? ? 77.46 -118.13 495 1 LYS N 33 ? ? -102.98 73.09 496 1 ARG N 44 ? ? 81.45 19.94 497 1 SER N 47 ? ? -157.28 -149.12 498 1 ALA N 68 ? ? -179.75 -20.55 499 1 SER N 75 ? ? -140.01 -39.33 500 1 GLU N 81 ? ? -90.03 -79.98 501 1 ASP N 84 ? ? -59.97 -130.32 502 1 ILE N 108 ? ? -150.02 -70.06 503 1 ILE N 114 ? ? -54.23 8.94 504 1 LEU N 128 ? ? -92.03 50.62 505 1 LEU N 129 ? ? 139.97 0.04 506 1 ALA N 132 ? ? 60.00 64.12 507 1 VAL N 133 ? ? -35.38 -95.64 508 1 GLU N 139 ? ? 120.34 120.01 509 1 VAL N 140 ? ? 97.78 -64.86 510 1 LYS N 141 ? ? 45.87 120.26 511 1 LEU N 146 ? ? -149.89 -140.35 512 1 ASN N 148 ? ? -140.03 -107.74 513 1 LEU N 159 ? ? -41.40 -9.99 514 1 HIS N 161 ? ? -160.01 -57.53 515 1 ALA N 185 ? ? 113.42 17.96 516 1 SER N 195 ? ? 152.05 140.83 517 1 GLN N 215 ? ? 120.00 155.95 518 1 ILE N 274 ? ? -20.02 122.50 519 1 GLN N 281 ? ? 159.15 -170.47 520 1 SER N 320 ? ? -148.47 -135.80 521 1 PHE N 322 ? ? -43.65 -10.00 522 1 PRO N 325 ? ? -40.02 -163.42 523 1 GLU N 326 ? ? 40.00 -130.38 524 1 LEU N 335 ? ? 170.39 128.82 525 1 ASP N 344 ? ? 40.84 99.59 526 1 ARG N 363 ? ? -99.39 -70.02 527 1 THR N 366 ? ? -37.07 127.01 528 1 GLN N 367 ? ? 171.31 -170.96 529 1 ALA N 420 ? ? -179.99 -60.17 530 1 THR N 471 ? ? -129.46 -131.06 531 1 ALA N 497 ? ? -90.09 58.60 532 1 ALA N 498 ? ? -162.83 -49.71 533 1 ILE N 508 ? ? 37.52 121.33 534 1 LYS N 509 ? 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WE FITTED THE MODEL WITH THE OCCUPANCY REFINEMENT FEATURE IN DIREX. THIS BASICALLY DETERMINES WHETHER THERE IS SUFFICIENT DENSITY FOR EACH RESIDUE OR IF THERE IS REDUCED OR MISSING DENSITY. THE OCCUPANCY IS VALUE BETWEEN 0 AND 1. WE WROTE THIS VALUE INTO THE B-FACTOR COLUMN AS 100X(1-OCCUPANCY). THIS RESEMBLES A B-FACTOR BUT IS NOT EXACTLY THE SAME. SUBMISSION BASED ON EXPERIMENTAL DATA FROM EMDB EMD-1960. (DEPOSITION ID: 10235). ; _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.resolution_method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.name 'BOVINE TRIC IN THE NUCLEOTIDE FREE STATE' _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 4A0O _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.number_digital_images 700 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.entry_id 4A0O _em_imaging.id 1 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.date 2008-10-20 _em_imaging.temperature 101 _em_imaging.microscope_model 'JEOL 3200FSC' _em_imaging.nominal_defocus_min 1200 _em_imaging.nominal_defocus_max 3000 _em_imaging.tilt_angle_min 0 _em_imaging.tilt_angle_max 0 _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_magnification 50000 _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.details NONE _em_imaging.specimen_holder_type . _em_imaging.specimen_holder_model . _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details 'HOLEY CARBON' _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type ? # _em_vitrification.entry_id 4A0O _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK I' _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.details 'LIQUID ETHEN' _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 4A0O _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' # _em_single_particle_entity.entry_id 4A0O _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A GLU 184 ? A GLU 184 2 1 Y 1 A ALA 185 ? A ALA 185 3 1 Y 1 A ILE 186 ? A ILE 186 4 1 Y 1 A HIS 187 ? A HIS 187 5 1 Y 1 A VAL 188 ? A VAL 188 6 1 Y 1 A ILE 189 ? A ILE 189 7 1 Y 1 A LYS 190 ? A LYS 190 8 1 Y 1 A LYS 191 ? A LYS 191 9 1 Y 1 A LEU 192 ? A LEU 192 10 1 Y 1 A GLY 193 ? A GLY 193 11 1 Y 1 A GLY 194 ? A GLY 194 12 1 Y 1 A SER 195 ? A SER 195 13 1 Y 1 A LEU 196 ? A LEU 196 14 1 Y 1 A ALA 197 ? A ALA 197 15 1 Y 1 A ASP 198 ? A ASP 198 16 1 Y 1 A SER 199 ? A SER 199 17 1 Y 1 A TYR 200 ? A TYR 200 18 1 Y 1 A LEU 201 ? A LEU 201 19 1 Y 1 A ASP 202 ? A ASP 202 20 1 Y 1 A GLU 203 ? A GLU 203 21 1 Y 1 A GLY 204 ? A GLY 204 22 1 Y 1 A PHE 205 ? A PHE 205 23 1 Y 1 A LEU 206 ? A LEU 206 24 1 Y 1 A LEU 207 ? A LEU 207 25 1 Y 1 A ASP 208 ? A ASP 208 26 1 Y 1 A LYS 209 ? A LYS 209 27 1 Y 1 A LYS 210 ? A LYS 210 28 1 Y 1 A ILE 211 ? A ILE 211 29 1 Y 1 A GLY 212 ? A GLY 212 30 1 Y 1 A VAL 213 ? A VAL 213 31 1 Y 1 A ASN 214 ? A ASN 214 32 1 Y 1 A GLN 215 ? A GLN 215 33 1 Y 1 A PRO 216 ? 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