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_citation.id primary _citation.title 'Crystal Structure of the Prothrombinase Complex from the Venom of Pseudonaja Textilis.' _citation.journal_abbrev Blood _citation.journal_volume 122 _citation.page_first 2777 _citation.page_last ? _citation.year 2013 _citation.journal_id_ASTM ? _citation.country US _citation.journal_id_ISSN 0006-4971 _citation.journal_id_CSD ? _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 23869089 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1182/BLOOD-2013-06-511733 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Lechtenberg, B.C.' 1 ? primary 'Murray-Rust, T.A.' 2 ? primary 'Johnson, D.J.' 3 ? primary 'Adams, T.E.' 4 ? primary 'Krishnaswamy, S.' 5 ? primary 'Camire, R.M.' 6 ? primary 'Huntington, J.A.' 7 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'FACTOR X-LIKE PROTEASE' 47041.273 1 ? ? 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DISORDERED SIDE CHAINS AND LOOPS WERE NOT MODELLED, WITH THE EXCEPTION OF A PORTION OF THE A2-REGION OF FV (656-670) ; _refine.pdbx_starting_model 'UNPUBLISHED FV STRUCTURE AND PDB ENTRY 1KIG' _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'MAXIMUM LIKELIHOOD' _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details RANDOM _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free 0.648 _refine.overall_SU_ML 0.605 _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B 38.223 _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 10995 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 188 _refine_hist.number_atoms_solvent 112 _refine_hist.number_atoms_total 11295 _refine_hist.d_res_high 3.32 _refine_hist.d_res_low 89.81 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function r_bond_refined_d 0.002 0.019 ? 11436 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_bond_other_d ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_angle_refined_deg 0.614 1.948 ? 15665 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_angle_other_deg ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_dihedral_angle_1_deg 3.872 5.000 ? 1478 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_dihedral_angle_2_deg 28.056 23.918 ? 462 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_dihedral_angle_3_deg 15.819 15.000 ? 1407 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_dihedral_angle_4_deg 15.057 15.000 ? 38 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_chiral_restr 0.042 0.200 ? 1752 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_gen_planes_refined 0.002 0.021 ? 8894 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_gen_planes_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_nbd_refined ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_nbd_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_nbtor_refined ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_nbtor_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_xyhbond_nbd_refined ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_xyhbond_nbd_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_metal_ion_refined ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_metal_ion_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_symmetry_vdw_refined ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_symmetry_vdw_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_symmetry_hbond_refined ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_symmetry_hbond_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_symmetry_metal_ion_refined ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_symmetry_metal_ion_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_mcbond_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_mcbond_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_mcangle_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_mcangle_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_scbond_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_scbond_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_scangle_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_scangle_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_long_range_B_refined ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_long_range_B_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_rigid_bond_restr ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_sphericity_free ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_sphericity_bonded ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? # _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.d_res_high 3.318 _refine_ls_shell.d_res_low 3.404 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 2905 _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.551 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 95.78 _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.557 _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 158 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? # _database_PDB_matrix.entry_id 4BXS _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _struct.entry_id 4BXS _struct.title 'Crystal Structure of the Prothrombinase Complex from the Venom of Pseudonaja Textilis' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 4BXS _struct_keywords.pdbx_keywords 'BLOOD CLOTTING' _struct_keywords.text 'BLOOD CLOTTING, BLOOD COAGULATION, PROTHROMBINASE, HYDROLASE' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 5 ? G N N 6 ? H N N 7 ? I N N 7 ? J N N 8 ? K N N 9 ? L N N 9 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP Q6IT10_PSETT 1 ? ? Q6IT10 ? 2 UNP FA5V_PSETE 2 ? ? Q7SZN0 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 4BXS A 1 ? 423 ? Q6IT10 41 ? 463 ? 1 423 2 2 4BXS V 1 ? 1430 ? Q7SZN0 31 ? 1460 ? 1 1430 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 2 4BXS LYS V 50 ? UNP Q7SZN0 GLU 80 conflict 50 1 2 4BXS LYS V 1287 ? UNP Q7SZN0 SER 1317 conflict 1287 2 2 4BXS PHE V 1305 ? UNP Q7SZN0 SER 1335 conflict 1305 3 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 6220 ? 1 MORE -5.0 ? 1 'SSA (A^2)' 59790 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ALA A 209 ? ILE A 213 ? ALA A 209 ILE A 213 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 2 PRO A 250 ? PHE A 257 ? PRO A 250 PHE A 257 1 ? 8 HELX_P HELX_P3 3 THR A 288 ? VAL A 295 ? THR A 288 VAL A 295 1 ? 8 HELX_P HELX_P4 4 ASP A 329 ? VAL A 335 ? ASP A 329 VAL A 335 1 ? 7 HELX_P HELX_P5 5 LEU A 398 ? LYS A 400 ? LEU A 398 LYS A 400 5 ? 3 HELX_P HELX_P6 6 PHE A 401 ? ARG A 410 ? PHE A 401 ARG A 410 1 ? 10 HELX_P HELX_P7 7 GLU B 43 ? LYS B 47 ? GLU V 43 LYS V 47 5 ? 5 HELX_P HELX_P8 8 ASN B 150 ? ASN B 156 ? ASN V 150 ASN V 156 1 ? 7 HELX_P HELX_P9 9 VAL B 285 ? ALA B 291 ? VAL V 285 ALA V 291 1 ? 7 HELX_P HELX_P10 10 ARG B 347 ? TYR B 352 ? ARG V 347 TYR V 352 1 ? 6 HELX_P HELX_P11 11 ASP B 483 ? SER B 490 ? ASP V 483 SER V 490 1 ? 8 HELX_P HELX_P12 12 GLU B 526 ? SER B 529 ? GLU V 526 SER V 529 5 ? 4 HELX_P HELX_P13 13 TYR B 531 ? CYS B 540 ? TYR V 531 CYS V 540 1 ? 10 HELX_P HELX_P14 14 ASN B 542 ? VAL B 546 ? ASN V 542 VAL V 546 5 ? 5 HELX_P HELX_P15 15 ASP B 550 ? VAL B 558 ? ASP V 550 VAL V 558 1 ? 9 HELX_P HELX_P16 16 GLU B 643 ? MET B 648 ? GLU V 643 MET V 648 1 ? 6 HELX_P HELX_P17 17 ASP B 661 ? GLU B 669 ? ASP V 661 GLU V 669 1 ? 9 HELX_P HELX_P18 18 GLU B 847 ? HIS B 851 ? GLU V 847 HIS V 851 5 ? 5 HELX_P HELX_P19 19 PRO B 902 ? LYS B 906 ? PRO V 902 LYS V 906 5 ? 5 HELX_P HELX_P20 20 PRO B 924 ? GLY B 928 ? PRO V 924 GLY V 928 5 ? 5 HELX_P HELX_P21 21 ASN B 946 ? HIS B 952 ? ASN V 946 HIS V 952 1 ? 7 HELX_P HELX_P22 22 VAL B 1098 ? GLU B 1103 ? VAL V 1098 GLU V 1103 1 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 89 SG ? ? ? 1_555 A CYS 100 SG ? ? A CYS 89 A CYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 96 SG ? ? ? 1_555 A CYS 109 SG ? ? A CYS 96 A CYS 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf3 disulf ? ? A CYS 111 SG ? ? ? 1_555 A CYS 124 SG ? ? A CYS 111 A CYS 124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf4 disulf ? ? A CYS 132 SG ? ? ? 1_555 A CYS 285 SG ? ? A CYS 132 A CYS 285 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf5 disulf ? ? A CYS 176 SG ? ? ? 1_555 A CYS 181 SG ? ? A CYS 176 A CYS 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf6 disulf ? ? A CYS 196 SG ? ? ? 1_555 A CYS 212 SG ? ? A CYS 196 A CYS 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf7 disulf ? ? A CYS 333 SG ? ? ? 1_555 A CYS 347 SG ? ? A CYS 333 A CYS 347 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf8 disulf ? ? B CYS 140 SG ? ? ? 1_555 B CYS 166 SG ? ? V CYS 140 V CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf9 disulf ? ? B CYS 221 SG ? ? ? 1_555 B CYS 302 SG ? ? V CYS 221 V CYS 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf10 disulf ? ? B CYS 473 SG ? ? ? 1_555 B CYS 499 SG ? ? V CYS 473 V CYS 499 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf11 disulf ? ? B CYS 642 SG ? ? ? 1_555 B CYS 1002 SG ? ? V CYS 642 V CYS 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf12 disulf ? ? B CYS 936 SG ? ? ? 1_555 B CYS 962 SG ? ? V CYS 936 V CYS 962 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf13 disulf ? ? B CYS 1117 SG ? ? ? 1_555 B CYS 1268 SG ? ? V CYS 1117 V CYS 1268 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf14 disulf ? ? B CYS 1273 SG ? ? ? 1_555 B CYS 1427 SG ? ? V CYS 1273 V CYS 1427 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? covale1 covale one ? B ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? V ASN 126 D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? B ASN 212 ND2 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? V ASN 212 C NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? B ASN 376 ND2 ? ? ? 1_555 C NAG . C1 ? ? V ASN 376 B NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? B ASN 914 ND2 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? V ASN 914 E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? B ASN 1150 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? V ASN 1150 V NAG 1521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale6 covale both ? C NAG . O6 ? ? ? 1_555 C FUC . C1 ? ? B NAG 1 B FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.599 ? ? covale7 covale both ? D NAG . O4 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? C NAG 1 C NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale8 covale both ? D NAG . O4 ? ? ? 1_555 D BMA . C1 ? ? C NAG 2 C BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale9 covale both ? D BMA . O3 ? ? ? 1_555 D MAN . C1 ? ? C BMA 3 C MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale10 covale both ? D BMA . O6 ? ? ? 1_555 D MAN . C1 ? ? C BMA 3 C MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale11 covale both ? D MAN . O2 ? ? ? 1_555 D MAN . C1 ? ? C MAN 4 C MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale12 covale both ? D MAN . O3 ? ? ? 1_555 D MAN . C1 ? ? C MAN 6 C MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale13 covale both ? D MAN . O6 ? ? ? 1_555 D MAN . C1 ? ? C MAN 6 C MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale14 covale both ? E NAG . O4 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? D NAG 1 D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale15 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? E NAG 1 E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? metalc1 metalc ? ? B LYS 94 O ? ? ? 1_555 H CA . CA ? ? V LYS 94 V CA 2430 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? ? metalc2 metalc ? ? B GLU 109 O ? ? ? 1_555 H CA . CA ? ? V GLU 109 V CA 2430 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.253 ? ? metalc3 metalc ? ? B ASP 112 OD1 ? ? ? 1_555 H CA . CA ? ? V ASP 112 V CA 2430 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.711 ? ? metalc4 metalc ? ? B ASP 113 OD1 ? ? ? 1_555 H CA . CA ? ? V ASP 113 V CA 2430 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.137 ? ? metalc5 metalc ? ? B LYS 890 O ? ? ? 1_555 I CA . CA ? ? V LYS 890 V CA 2431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.596 ? ? metalc6 metalc ? ? B PHE 905 O ? ? ? 1_555 I CA . CA ? ? V PHE 905 V CA 2431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.618 ? ? metalc7 metalc ? ? B ASP 908 OD1 ? ? ? 1_555 I CA . CA ? ? V ASP 908 V CA 2431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.631 ? ? metalc8 metalc ? ? B ASP 908 OD2 ? ? ? 1_555 I CA . CA ? ? V ASP 908 V CA 2431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.052 ? ? metalc9 metalc ? ? B ASP 909 OD1 ? ? ? 1_555 I CA . CA ? ? V ASP 909 V CA 2431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.529 ? ? metalc10 metalc ? ? B HIS 1055 NE2 ? ? ? 1_555 J CU . CU ? ? V HIS 1055 V CU 2432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.589 ? ? metalc11 metalc ? ? B GLU 1095 OE1 ? ? ? 1_555 J CU . CU ? ? V GLU 1095 V CU 2432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.101 ? ? metalc12 metalc ? ? L HOH . O ? ? ? 1_555 I CA . CA ? ? V HOH 2080 V CA 2431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.971 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? metalc ? ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 O ? 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B LYS 890 ? V LYS 890 ? 1_555 CA ? I CA . ? V CA 2431 ? 1_555 OD2 ? B ASP 908 ? V ASP 908 ? 1_555 57.5 ? 11 O ? B PHE 905 ? V PHE 905 ? 1_555 CA ? I CA . ? V CA 2431 ? 1_555 OD2 ? B ASP 908 ? V ASP 908 ? 1_555 86.1 ? 12 OD1 ? B ASP 908 ? V ASP 908 ? 1_555 CA ? I CA . ? V CA 2431 ? 1_555 OD2 ? B ASP 908 ? V ASP 908 ? 1_555 44.6 ? 13 O ? B LYS 890 ? V LYS 890 ? 1_555 CA ? I CA . ? V CA 2431 ? 1_555 OD1 ? B ASP 909 ? V ASP 909 ? 1_555 156.4 ? 14 O ? B PHE 905 ? V PHE 905 ? 1_555 CA ? I CA . ? V CA 2431 ? 1_555 OD1 ? B ASP 909 ? V ASP 909 ? 1_555 102.3 ? 15 OD1 ? B ASP 908 ? V ASP 908 ? 1_555 CA ? I CA . ? V CA 2431 ? 1_555 OD1 ? B ASP 909 ? V ASP 909 ? 1_555 79.1 ? 16 OD2 ? B ASP 908 ? V ASP 908 ? 1_555 CA ? I CA . ? V CA 2431 ? 1_555 OD1 ? B ASP 909 ? V ASP 909 ? 1_555 105.4 ? 17 O ? B LYS 890 ? V LYS 890 ? 1_555 CA ? I CA . ? V CA 2431 ? 1_555 O ? L HOH . ? V HOH 2080 ? 1_555 76.4 ? 18 O ? B PHE 905 ? V PHE 905 ? 1_555 CA ? I CA . ? V CA 2431 ? 1_555 O ? L HOH . ? 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V GLU 1095 ? 1_555 97.6 ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 NAG C . ? 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None 'Disulfide bridge' # _struct_mon_prot_cis.pdbx_id 1 _struct_mon_prot_cis.label_comp_id ASP _struct_mon_prot_cis.label_seq_id 659 _struct_mon_prot_cis.label_asym_id B _struct_mon_prot_cis.label_alt_id . _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code ? _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id ASP _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id 659 _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id V _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 GLU _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 660 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 B _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 ? _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 GLU _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 660 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 V _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num 1 _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle -9.74 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA ? 2 ? AB ? 6 ? AC ? 4 ? AD ? 2 ? VA ? 2 ? VB ? 4 ? VC ? 4 ? VD ? 2 ? VE ? 2 ? VF ? 4 ? VG ? 5 ? VH ? 4 ? VI ? 4 ? VJ ? 2 ? VK ? 3 ? VL ? 2 ? 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