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E ARG 510 NH2 # loop_ _software.name _software.classification _software.version _software.citation_id _software.pdbx_ordinal HKL-2000 'data collection' . ? 1 PHENIX 'model building' '(phenix.refine: 1.7.3_928)' ? 2 PHENIX refinement '(phenix.refine: 1.7.3_928)' ? 3 HKL-2000 'data reduction' . ? 4 HKL-2000 'data scaling' . ? 5 PHENIX phasing 1.7.3_928 ? 6 # _cell.entry_id 4DUG _cell.length_a 131.714 _cell.length_b 135.058 _cell.length_c 204.249 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 20 _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.length_a_esd ? _cell.length_b_esd ? _cell.length_c_esd ? _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma_esd ? # _symmetry.entry_id 4DUG _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? # _exptl.entry_id 4DUG _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews 2.61 _exptl_crystal.density_percent_sol 52.80 _exptl_crystal.description ? _exptl_crystal.F_000 ? _exptl_crystal.preparation ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method 'VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP' _exptl_crystal_grow.temp 291 _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 4.8 _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range ? _exptl_crystal_grow.pdbx_details 'sodium formate, glycerol, pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K' # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 113 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.type 'MARMOSAIC 225 mm CCD' _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2010-02-01 _diffrn_detector.details ? # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator 'Diamond(111)' _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 0.97872 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'APS BEAMLINE 21-ID-F' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site APS _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline 21-ID-F _diffrn_source.pdbx_wavelength ? 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'X-RAY DIFFRACTION' # _database_PDB_matrix.entry_id 4DUG _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _struct.entry_id 4DUG _struct.title 'Crystal Structure of Circadian Clock Protein KaiC E318A Mutant' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 4DUG _struct_keywords.pdbx_keywords 'CIRCADIAN CLOCK PROTEIN, TRANSFERASE' _struct_keywords.text ;KaiA, KaiB, ATP-binding, biological rhythms, DNA-binding, metal-binding, nucleotide-binding, phosphoprotein, repressor, Serine/threonine-protein kinase, transcription regulation, auto-kinase, phosphorylation, CIRCADIAN CLOCK PROTEIN, TRANSFERASE ; # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 4 ? J N N 3 ? K N N 3 ? L N N 4 ? M N N 4 ? N N N 3 ? O N N 3 ? P N N 4 ? Q N N 4 ? R N N 3 ? S N N 5 ? T N N 3 ? U N N 4 ? V N N 4 ? W N N 3 ? X N N 3 ? Y N N 4 ? Z N N 4 ? AA N N 3 ? BA N N 3 ? CA N N 4 ? DA N N 4 ? EA N N 3 ? FA N N 6 ? GA N N 6 ? HA N N 6 ? IA N N 6 ? JA N N 6 ? KA N N 6 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP KAIC_SYNE7 Q79PF4 1 ;MTSAEMTSPNNNSEHQAIAKMRTMIEGFDDISHGGLPIGRSTLVSGTSGTGKTLFSIQFLYNGIIEFDEPGVFVTFEETP QDIIKNARSFGWDLAKLVDEGKLFILDASPDPEGQEVVGGFDLSALIERINYAIQKYRARRVSIDSVTSVFQQYDASSVV RRELFRLVARLKQIGATTVMTTERIEEYGPIARYGVEEFVSDNVVILRNVLEGERRRRTLEILKLRGTSHMKGEYPFTIT DHGINIFPLGAMRLTQRSSNVRVSSGVVRLDEMCGGGFFKDSIILATGATGTGKTLLVSRFVENACANKERAILFAYEES RAQLLRNAYSWGMDFEEMERQNLLKIVCAYPESAGLEDHLQIIKSEINDFKPARIAIDSLSALARGVSNNAFRQFVIGVT GYAKQEEITGLFTNTSDQFMGAHSITDSHISTITDTIILLQYVEIRGEMSRAINVFKMRGSWHDKAIREFMISDKGPDIK DSFRNFERIISGSPTRITVDEKSELSRIVRGVQEKGPES ; 1 ? 2 UNP KAIC_SYNE7 Q79PF4 2 ;MTSAEMTSPNNNSEHQAIAKMRTMIEGFDDISHGGLPIGRSTLVSGTSGTGKTLFSIQFLYNGIIEFDEPGVFVTFEETP QDIIKNARSFGWDLAKLVDEGKLFILDASPDPEGQEVVGGFDLSALIERINYAIQKYRARRVSIDSVTSVFQQYDASSVV RRELFRLVARLKQIGATTVMTTERIEEYGPIARYGVEEFVSDNVVILRNVLEGERRRRTLEILKLRGTSHMKGEYPFTIT DHGINIFPLGAMRLTQRSSNVRVSSGVVRLDEMCGGGFFKDSIILATGATGTGKTLLVSRFVENACANKERAILFAYEES RAQLLRNAYSWGMDFEEMERQNLLKIVCAYPESAGLEDHLQIIKSEINDFKPARIAIDSLSALARGVSNNAFRQFVIGVT GYAKQEEITGLFTNTSDQFMGAHSITDSHISTITDTIILLQYVEIRGEMSRAINVFKMRGSWHDKAIREFMISDKGPDIK DSFRNFERIISGSPTRITVDEKSELSRIVRGVQEKGPES ; 1 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 4DUG A 1 ? 519 ? Q79PF4 1 ? 519 ? 1 519 2 1 4DUG B 1 ? 519 ? Q79PF4 1 ? 519 ? 1 519 3 1 4DUG C 1 ? 519 ? Q79PF4 1 ? 519 ? 1 519 4 2 4DUG D 1 ? 519 ? Q79PF4 1 ? 519 ? 1 519 5 1 4DUG E 1 ? 519 ? Q79PF4 1 ? 519 ? 1 519 6 1 4DUG F 1 ? 519 ? Q79PF4 1 ? 519 ? 1 519 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 4DUG ALA A 318 ? UNP Q79PF4 GLU 318 'engineered mutation' 318 1 2 4DUG ALA B 318 ? UNP Q79PF4 GLU 318 'engineered mutation' 318 2 3 4DUG ALA C 318 ? UNP Q79PF4 GLU 318 'engineered mutation' 318 3 4 4DUG ALA D 318 ? UNP Q79PF4 GLU 318 'engineered mutation' 318 4 5 4DUG ALA E 318 ? UNP Q79PF4 GLU 318 'engineered mutation' 318 5 6 4DUG ALA F 318 ? UNP Q79PF4 GLU 318 'engineered mutation' 318 6 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 56950 ? 1 MORE -261 ? 1 'SSA (A^2)' 101370 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 GLY A 27 ? 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GLY B 355 ASN B 368 1 ? 14 HELX_P HELX_P30 30 SER B 388 ? GLU B 406 ? SER B 388 GLU B 406 1 ? 19 HELX_P HELX_P31 31 GLY C 27 ? SER C 32 ? GLY C 27 SER C 32 1 ? 6 HELX_P HELX_P32 32 GLY C 51 ? PHE C 67 ? GLY C 51 PHE C 67 1 ? 17 HELX_P HELX_P33 33 THR C 79 ? ASN C 86 ? THR C 79 ASN C 86 1 ? 8 HELX_P HELX_P34 34 LEU C 94 ? ASP C 99 ? LEU C 94 ASP C 99 1 ? 6 HELX_P HELX_P35 35 LEU C 126 ? ARG C 138 ? LEU C 126 ARG C 138 1 ? 13 HELX_P HELX_P36 36 ALA C 156 ? GLY C 175 ? ALA C 156 GLY C 175 1 ? 20 HELX_P HELX_P37 37 VAL C 196 ? SER C 201 ? VAL C 196 SER C 201 1 ? 6 HELX_P HELX_P38 38 VAL C 267 ? GLY C 275 ? VAL C 267 GLY C 275 1 ? 9 HELX_P HELX_P39 39 GLY C 293 ? ALA C 307 ? GLY C 293 ALA C 307 1 ? 15 HELX_P HELX_P40 40 SER C 320 ? SER C 330 ? SER C 320 SER C 330 1 ? 11 HELX_P HELX_P41 41 ASP C 334 ? GLN C 341 ? ASP C 334 GLN C 341 1 ? 8 HELX_P HELX_P42 42 GLY C 355 ? ASP C 369 ? GLY C 355 ASP C 369 1 ? 15 HELX_P HELX_P43 43 LEU C 380 ? ARG C 385 ? LEU C 380 ARG C 385 5 ? 6 HELX_P HELX_P44 44 SER C 388 ? GLN C 405 ? SER C 388 GLN C 405 1 ? 18 HELX_P HELX_P45 45 GLY D 27 ? SER D 32 ? GLY D 27 SER D 32 1 ? 6 HELX_P HELX_P46 46 GLY D 51 ? GLU D 66 ? GLY D 51 GLU D 66 1 ? 16 HELX_P HELX_P47 47 THR D 79 ? ARG D 88 ? THR D 79 ARG D 88 1 ? 10 HELX_P HELX_P48 48 SER D 89 ? GLY D 91 ? SER D 89 GLY D 91 5 ? 3 HELX_P HELX_P49 49 ASP D 93 ? GLU D 100 ? ASP D 93 GLU D 100 1 ? 8 HELX_P HELX_P50 50 PHE D 121 ? ARG D 138 ? PHE D 121 ARG D 138 1 ? 18 HELX_P HELX_P51 51 VAL D 147 ? GLN D 152 ? VAL D 147 GLN D 152 1 ? 6 HELX_P HELX_P52 52 SER D 157 ? GLY D 175 ? SER D 157 GLY D 175 1 ? 19 HELX_P HELX_P53 53 VAL D 196 ? SER D 201 ? VAL D 196 SER D 201 1 ? 6 HELX_P HELX_P54 54 VAL D 267 ? CYS D 274 ? VAL D 267 CYS D 274 1 ? 8 HELX_P HELX_P55 55 LYS D 294 ? ASN D 308 ? LYS D 294 ASN D 308 1 ? 15 HELX_P HELX_P56 56 SER D 320 ? TYR D 329 ? SER D 320 TYR D 329 1 ? 10 HELX_P HELX_P57 57 SER D 330 ? GLY D 332 ? SER D 330 GLY D 332 5 ? 3 HELX_P HELX_P58 58 ASP D 334 ? GLN D 341 ? ASP D 334 GLN D 341 1 ? 8 HELX_P HELX_P59 59 TYR D 350 ? ALA D 354 ? TYR D 350 ALA D 354 5 ? 5 HELX_P HELX_P60 60 GLY D 355 ? LYS D 371 ? GLY D 355 LYS D 371 1 ? 17 HELX_P HELX_P61 61 SER D 388 ? GLU D 406 ? SER D 388 GLU D 406 1 ? 19 HELX_P HELX_P62 62 GLY E 27 ? SER E 32 ? GLY E 27 SER E 32 1 ? 6 HELX_P HELX_P63 63 GLY E 51 ? GLU E 66 ? GLY E 51 GLU E 66 1 ? 16 HELX_P HELX_P64 64 THR E 79 ? ALA E 87 ? THR E 79 ALA E 87 1 ? 9 HELX_P HELX_P65 65 ARG E 88 ? PHE E 90 ? ARG E 88 PHE E 90 5 ? 3 HELX_P HELX_P66 66 ASP E 93 ? GLU E 100 ? ASP E 93 GLU E 100 1 ? 8 HELX_P HELX_P67 67 GLY E 120 ? ARG E 138 ? GLY E 120 ARG E 138 1 ? 19 HELX_P HELX_P68 68 VAL E 147 ? GLN E 152 ? VAL E 147 GLN E 152 1 ? 6 HELX_P HELX_P69 69 SER E 157 ? GLY E 175 ? SER E 157 GLY E 175 1 ? 19 HELX_P HELX_P70 70 VAL E 196 ? SER E 201 ? VAL E 196 SER E 201 1 ? 6 HELX_P HELX_P71 71 VAL E 267 ? CYS E 274 ? VAL E 267 CYS E 274 1 ? 8 HELX_P HELX_P72 72 GLY E 293 ? ASN E 308 ? GLY E 293 ASN E 308 1 ? 16 HELX_P HELX_P73 73 ALA E 322 ? SER E 330 ? ALA E 322 SER E 330 1 ? 9 HELX_P HELX_P74 74 PHE E 335 ? GLN E 341 ? PHE E 335 GLN E 341 1 ? 7 HELX_P HELX_P75 75 TYR E 350 ? ALA E 354 ? TYR E 350 ALA E 354 5 ? 5 HELX_P HELX_P76 76 GLY E 355 ? PHE E 370 ? GLY E 355 PHE E 370 1 ? 16 HELX_P HELX_P77 77 LEU E 380 ? ARG E 385 ? LEU E 380 ARG E 385 5 ? 6 HELX_P HELX_P78 78 SER E 388 ? GLU E 406 ? SER E 388 GLU E 406 1 ? 19 HELX_P HELX_P79 79 GLY F 27 ? SER F 32 ? GLY F 27 SER F 32 1 ? 6 HELX_P HELX_P80 80 GLY F 51 ? ASP F 68 ? GLY F 51 ASP F 68 1 ? 18 HELX_P HELX_P81 81 THR F 79 ? ALA F 87 ? THR F 79 ALA F 87 1 ? 9 HELX_P HELX_P82 82 ARG F 88 ? GLY F 91 ? ARG F 88 GLY F 91 5 ? 4 HELX_P HELX_P83 83 ASP F 93 ? GLU F 100 ? ASP F 93 GLU F 100 1 ? 8 HELX_P HELX_P84 84 GLY F 120 ? ARG F 138 ? GLY F 120 ARG F 138 1 ? 19 HELX_P HELX_P85 85 SER F 146 ? PHE F 151 ? 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ILE F 430 THR F 434 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale both ? 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F SER 431 F TPO 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? ? covale10 covale both ? F TPO 432 C ? ? ? 1_555 F ILE 433 N ? ? F TPO 432 F ILE 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? ? metalc1 metalc ? ? A THR 53 OG1 ? ? ? 1_555 J MG . MG ? ? A THR 53 A MG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? ? metalc2 metalc ? ? A THR 295 OG1 ? ? ? 1_555 G MG . MG ? ? A THR 295 A MG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.227 ? ? metalc3 metalc ? ? A GLU 319 OE2 ? ? ? 1_555 G MG . MG ? ? A GLU 319 A MG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.165 ? ? metalc4 metalc ? ? G MG . MG ? ? ? 1_555 H ATP . O3G ? ? A MG 801 A ATP 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.452 ? ? metalc5 metalc ? ? G MG . MG ? ? ? 1_555 H ATP . O3B ? ? A MG 801 A ATP 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.505 ? ? metalc6 metalc ? ? G MG . MG ? ? ? 1_555 H ATP . O2G ? ? A MG 801 A ATP 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.986 ? ? metalc7 metalc ? ? G MG . MG ? ? ? 1_555 FA HOH . O ? ? A MG 801 A HOH 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.243 ? ? metalc8 metalc ? ? I ATP . O2G ? ? ? 1_555 J MG . MG ? ? A ATP 803 A MG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? ? metalc9 metalc ? ? B THR 53 OG1 ? ? ? 1_555 N MG . MG ? ? B THR 53 B MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? ? metalc10 metalc ? ? K MG . MG ? ? ? 1_555 L ATP . O3B ? ? B MG 601 B ATP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.110 ? ? metalc11 metalc ? ? K MG . MG ? ? ? 1_555 L ATP . O2G ? ? B MG 601 B ATP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? ? metalc12 metalc ? ? K MG . MG ? ? ? 1_555 L ATP . O3G ? ? B MG 601 B ATP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.413 ? ? metalc13 metalc ? ? K MG . MG ? ? ? 1_555 GA HOH . O ? ? B MG 601 B HOH 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.104 ? ? metalc14 metalc ? ? K MG . MG ? ? ? 1_555 GA HOH . O ? ? B MG 601 B HOH 711 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.104 ? ? metalc15 metalc ? ? M ATP . O3B ? ? ? 1_555 N MG . MG ? ? B ATP 603 B MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? ? metalc16 metalc ? ? M ATP . O3G ? ? ? 1_555 N MG . MG ? ? B ATP 603 B MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.277 ? ? metalc17 metalc ? ? M ATP . O2G ? ? ? 1_555 N MG . MG ? ? B ATP 603 B MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.559 ? ? metalc18 metalc ? ? N MG . MG ? ? ? 1_555 GA HOH . O ? ? B MG 604 B HOH 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.071 ? ? metalc19 metalc ? ? C THR 53 OG1 ? ? ? 1_555 R MG . MG ? ? C THR 53 C MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.090 ? ? metalc20 metalc ? ? C GLU 78 OE2 ? ? ? 1_555 R MG . MG ? ? C GLU 78 C MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.111 ? ? metalc21 metalc ? ? C THR 295 OG1 ? ? ? 1_555 O MG . MG ? ? C THR 295 C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.149 ? ? metalc22 metalc ? ? O MG . MG ? ? ? 1_555 P ATP . O2B ? ? C MG 601 C ATP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.129 ? ? metalc23 metalc ? ? O MG . MG ? ? ? 1_555 P ATP . O2G ? ? C MG 601 C ATP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.352 ? ? metalc24 metalc ? ? O MG . MG ? ? ? 1_555 P ATP . O3G ? ? C MG 601 C ATP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? ? metalc25 metalc ? ? O MG . MG ? ? ? 1_555 P ATP . O3B ? ? C MG 601 C ATP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.506 ? ? metalc26 metalc ? ? O MG . MG ? ? ? 1_555 HA HOH . O ? ? C MG 601 C HOH 706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.092 ? ? metalc27 metalc ? ? Q ATP . O1G ? ? ? 1_555 R MG . MG ? ? C ATP 603 C MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.359 ? ? metalc28 metalc ? ? D THR 53 OG1 ? ? ? 1_555 W MG . MG ? ? D THR 53 D MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? metalc29 metalc ? ? D THR 295 OG1 ? ? ? 1_555 T MG . MG ? ? D THR 295 D MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? metalc30 metalc ? ? T MG . MG ? ? ? 1_555 U ATP . O3B ? ? D MG 601 D ATP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.197 ? ? metalc31 metalc ? ? T MG . MG ? ? ? 1_555 U ATP . O2G ? ? D MG 601 D ATP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? ? metalc32 metalc ? ? T MG . MG ? ? ? 1_555 IA HOH . O ? ? D MG 601 D HOH 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? metalc33 metalc ? ? V ATP . O2G ? ? ? 1_555 W MG . MG ? ? D ATP 603 D MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.455 ? ? metalc34 metalc ? ? V ATP . O3B ? ? ? 1_555 W MG . MG ? ? D ATP 603 D MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? ? metalc35 metalc ? ? W MG . MG ? ? ? 1_555 IA HOH . O ? ? D MG 604 D HOH 711 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? ? metalc36 metalc ? ? W MG . MG ? ? ? 1_555 IA HOH . O ? ? D MG 604 D HOH 714 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? ? metalc37 metalc ? ? E THR 53 OG1 ? ? ? 1_555 AA MG . MG ? ? E THR 53 E MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? ? metalc38 metalc ? ? E ASP 145 OD2 ? ? ? 1_555 AA MG . MG ? ? E ASP 145 E MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? ? metalc39 metalc ? ? E THR 295 OG1 ? ? ? 1_555 X MG . MG ? ? E THR 295 E MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? ? metalc40 metalc ? ? X MG . MG ? ? ? 1_555 Y ATP . O2G ? ? E MG 601 E ATP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.348 ? ? metalc41 metalc ? ? X MG . MG ? ? ? 1_555 Y ATP . O3B ? ? E MG 601 E ATP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.867 ? ? metalc42 metalc ? ? X MG . MG ? ? ? 1_555 JA HOH . O ? ? E MG 601 E HOH 715 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.113 ? ? metalc43 metalc ? ? Z ATP . O3G ? ? ? 1_555 AA MG . MG ? ? E ATP 603 E MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? ? metalc44 metalc ? ? Z ATP . O2G ? ? ? 1_555 AA MG . MG ? ? E ATP 603 E MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.665 ? ? metalc45 metalc ? ? F THR 53 OG1 ? ? ? 1_555 EA MG . MG ? ? F THR 53 F MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? ? metalc46 metalc ? ? F THR 295 OG1 ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? F THR 295 F MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.116 ? ? metalc47 metalc ? ? BA MG . MG ? ? ? 1_555 CA ATP . O2G ? ? F MG 601 F ATP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? ? metalc48 metalc ? ? DA ATP . O2G ? ? ? 1_555 EA MG . MG ? ? F ATP 603 F MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.204 ? ? metalc49 metalc ? ? EA MG . MG ? ? ? 1_555 KA HOH . O ? ? F MG 604 F HOH 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference covale ? ? metalc ? ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 OG1 ? 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B ATP 602 ? 1_555 MG ? K MG . ? B MG 601 ? 1_555 O3G ? L ATP . ? B ATP 602 ? 1_555 65.2 ? 29 O2G ? L ATP . ? B ATP 602 ? 1_555 MG ? K MG . ? B MG 601 ? 1_555 O3G ? L ATP . ? B ATP 602 ? 1_555 63.6 ? 30 O3B ? L ATP . ? B ATP 602 ? 1_555 MG ? K MG . ? B MG 601 ? 1_555 O ? GA HOH . ? B HOH 710 ? 1_555 150.9 ? 31 O2G ? L ATP . ? B ATP 602 ? 1_555 MG ? K MG . ? B MG 601 ? 1_555 O ? GA HOH . ? B HOH 710 ? 1_555 86.6 ? 32 O3G ? L ATP . ? B ATP 602 ? 1_555 MG ? K MG . ? B MG 601 ? 1_555 O ? GA HOH . ? B HOH 710 ? 1_555 94.1 ? 33 O3B ? L ATP . ? B ATP 602 ? 1_555 MG ? K MG . ? B MG 601 ? 1_555 O ? GA HOH . ? B HOH 711 ? 1_555 131.6 ? 34 O2G ? L ATP . ? B ATP 602 ? 1_555 MG ? K MG . ? B MG 601 ? 1_555 O ? GA HOH . ? B HOH 711 ? 1_555 157.2 ? 35 O3G ? L ATP . ? B ATP 602 ? 1_555 MG ? K MG . ? B MG 601 ? 1_555 O ? GA HOH . ? B HOH 711 ? 1_555 133.0 ? 36 O ? GA HOH . ? B HOH 710 ? 1_555 MG ? K MG . ? B MG 601 ? 1_555 O ? GA HOH . ? B HOH 711 ? 1_555 77.4 ? 37 OG1 ? C THR 53 ? C THR 53 ? 1_555 MG ? 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O THR F 495 # loop_ _struct_site.id _struct_site.pdbx_evidence_code _struct_site.pdbx_auth_asym_id _struct_site.pdbx_auth_comp_id _struct_site.pdbx_auth_seq_id _struct_site.pdbx_auth_ins_code _struct_site.pdbx_num_residues _struct_site.details AC1 Software A MG 801 ? 4 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 801' AC2 Software A ATP 802 ? 23 'BINDING SITE FOR RESIDUE ATP A 802' AC3 Software A ATP 803 ? 22 'BINDING SITE FOR RESIDUE ATP A 803' AC4 Software A MG 804 ? 3 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 804' AC5 Software B MG 601 ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG B 601' AC6 Software B ATP 602 ? 20 'BINDING SITE FOR RESIDUE ATP B 602' AC7 Software B ATP 603 ? 23 'BINDING SITE FOR RESIDUE ATP B 603' AC8 Software B MG 604 ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG B 604' AC9 Software C MG 601 ? 3 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG C 601' BC1 Software C ATP 602 ? 19 'BINDING SITE FOR RESIDUE ATP C 602' BC2 Software C ATP 603 ? 22 'BINDING SITE FOR RESIDUE ATP C 603' BC3 Software C MG 604 ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG C 604' BC4 Software C PO4 605 ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE PO4 C 605' BC5 Software D MG 601 ? 4 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG D 601' BC6 Software D ATP 602 ? 19 'BINDING SITE FOR RESIDUE ATP D 602' BC7 Software D ATP 603 ? 20 'BINDING SITE FOR RESIDUE ATP D 603' BC8 Software D MG 604 ? 6 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG D 604' BC9 Software E MG 601 ? 3 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG E 601' CC1 Software E ATP 602 ? 19 'BINDING SITE FOR RESIDUE ATP E 602' CC2 Software E ATP 603 ? 21 'BINDING SITE FOR RESIDUE ATP E 603' CC3 Software E MG 604 ? 3 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG E 604' CC4 Software F MG 601 ? 4 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG F 601' CC5 Software F ATP 602 ? 21 'BINDING SITE FOR RESIDUE ATP F 602' CC6 Software F ATP 603 ? 22 'BINDING SITE FOR RESIDUE ATP F 603' CC7 Software F MG 604 ? 4 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG F 604' # loop_ _struct_site_gen.id _struct_site_gen.site_id _struct_site_gen.pdbx_num_res _struct_site_gen.label_comp_id _struct_site_gen.label_asym_id _struct_site_gen.label_seq_id _struct_site_gen.pdbx_auth_ins_code _struct_site_gen.auth_comp_id _struct_site_gen.auth_asym_id _struct_site_gen.auth_seq_id _struct_site_gen.label_atom_id _struct_site_gen.label_alt_id _struct_site_gen.symmetry _struct_site_gen.details 1 AC1 4 THR A 295 ? 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? -131.43 -44.00 107 1 ASN C 86 ? ? -85.79 35.12 108 1 ALA C 87 ? ? -147.80 -24.96 109 1 LYS C 102 ? ? -142.80 -27.27 110 1 LEU C 106 ? ? -65.70 88.39 111 1 ASP C 107 ? ? -65.45 82.96 112 1 PRO C 112 ? ? -64.77 33.25 113 1 GLN C 115 ? ? 65.23 123.55 114 1 GLU C 116 ? ? -82.51 -128.32 115 1 VAL C 117 ? ? 61.34 -42.26 116 1 VAL C 118 ? ? -75.19 28.53 117 1 LEU C 123 ? ? 56.13 -167.00 118 1 SER C 124 ? ? 43.92 -71.50 119 1 SER C 146 ? ? 55.04 77.54 120 1 GLN C 153 ? ? -106.44 -66.19 121 1 TYR C 154 ? ? -167.02 69.42 122 1 THR C 182 ? ? -123.39 -168.47 123 1 ARG C 193 ? ? 43.25 -84.63 124 1 LEU C 211 ? ? -73.39 -72.19 125 1 GLU C 212 ? ? 40.01 112.77 126 1 THR C 240 ? ? -120.89 -152.04 127 1 LEU C 249 ? ? -67.39 59.12 128 1 MET C 252 ? ? -59.84 103.24 129 1 ASP C 281 ? ? -99.54 59.25 130 1 VAL C 347 ? ? -97.55 -69.55 131 1 CYS C 348 ? ? 63.17 117.38 132 1 PHE C 370 ? ? -157.59 -42.29 133 1 LYS C 371 ? ? 61.49 92.81 134 1 PRO C 372 ? ? -104.54 -167.19 135 1 ALA C 373 ? ? -134.38 -33.44 136 1 SER C 379 ? ? 68.33 90.23 137 1 MET C 420 ? ? 58.97 107.65 138 1 TPO C 432 ? ? -78.96 -129.59 139 1 ILE C 433 ? ? 42.08 -75.48 140 1 MET C 458 ? ? -162.50 118.48 141 1 HIS C 463 ? ? 57.98 141.60 142 1 LYS C 480 ? ? -129.18 -118.82 143 1 PHE C 483 ? ? -107.92 60.18 144 1 ASN C 485 ? ? -100.39 40.67 145 1 ARG C 488 ? ? 57.87 73.73 146 1 ILE C 497 ? ? -109.97 -88.49 147 1 THR C 498 ? ? 49.95 78.12 148 1 ASP C 500 ? ? -169.91 80.44 149 1 LYS C 502 ? ? -129.36 -133.56 150 1 GLU C 504 ? ? -144.22 -112.04 151 1 SER C 506 ? ? -148.54 -55.10 152 1 ARG C 507 ? ? 179.60 -18.68 153 1 ILE C 508 ? ? 75.31 -20.42 154 1 PRO D 112 ? ? -74.82 28.16 155 1 GLU D 113 ? ? -111.63 -116.59 156 1 GLU D 116 ? ? -130.71 -35.70 157 1 PHE D 121 ? ? -153.41 29.89 158 1 SER D 146 ? ? 55.49 70.63 159 1 GLN D 152 ? ? -76.17 40.93 160 1 TYR D 154 ? ? -171.53 5.61 161 1 ALA D 156 ? ? -93.19 -153.02 162 1 ILE D 185 ? ? -101.72 -66.58 163 1 VAL D 196 ? ? -137.23 -38.04 164 1 LEU D 211 ? ? -86.84 -72.16 165 1 GLU D 212 ? ? 42.05 79.68 166 1 GLU D 214 ? 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