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'X-RAY DIFFRACTION' 8 1 'MEDIUM THERMAL' F 146 3.420 2.000 93 ? ? ? ? ? ? # _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.d_res_high 2.290 _refine_ls_shell.d_res_low 2.349 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 9265 _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.309 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 98.01 _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.318 _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 473 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? _refine_ls_shell.number_reflns_obs ? _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' # loop_ _struct_ncs_oper.id _struct_ncs_oper.code _struct_ncs_oper.details _struct_ncs_oper.matrix[1][1] _struct_ncs_oper.matrix[1][2] _struct_ncs_oper.matrix[1][3] _struct_ncs_oper.matrix[2][1] _struct_ncs_oper.matrix[2][2] _struct_ncs_oper.matrix[2][3] _struct_ncs_oper.matrix[3][1] _struct_ncs_oper.matrix[3][2] _struct_ncs_oper.matrix[3][3] _struct_ncs_oper.vector[1] _struct_ncs_oper.vector[2] _struct_ncs_oper.vector[3] 1 given ? 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 0.00000 0.00000 2 given ? 0.553822 0.832274 0.024518 0.832459 -0.554070 0.004288 0.017153 0.018036 -0.999690 -225.22955 321.24414 -101.26797 3 given ? -0.478496 0.877888 -0.018855 -0.878071 -0.478516 0.003688 -0.005785 0.018320 0.999815 -239.15379 218.81169 -78.39960 4 given ? -0.994528 0.103675 0.012860 0.103688 0.994610 0.000350 -0.012754 0.001682 -0.999917 -98.70463 -36.47165 -135.70724 5 given ? 0.422091 -0.905870 0.035199 -0.906388 -0.422437 -0.002677 0.017294 -0.030774 -0.999377 158.27574 253.55420 -165.21646 6 given ? -0.487039 -0.873325 -0.009849 0.873281 -0.487123 0.009609 -0.013189 -0.003921 0.999905 75.92924 316.78668 -37.44228 # loop_ _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details 1 1 A 1 2 B 1 3 C 1 4 D 1 5 E 1 6 F 2 1 A 2 2 B 2 3 C 2 4 D 2 5 E 2 6 F 3 1 A 3 2 B 3 3 C 4 1 D 4 2 E 4 3 F 5 1 A 5 2 E 6 1 B 6 2 C 7 1 D 7 2 F 8 1 A 8 2 B 8 3 C 8 4 D 8 5 E 8 6 F # loop_ _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.selection_details 1 1 1 A GLU 8 . A ILE 19 . A GLU 14 A ILE 25 3 ? 1 2 1 B GLU 8 . B ILE 19 . B GLU 14 B ILE 25 3 ? 1 3 1 C GLU 8 . C ILE 19 . C GLU 14 C ILE 25 3 ? 1 4 1 D GLU 8 . D ILE 19 . D GLU 14 D ILE 25 3 ? 1 5 1 E GLU 8 . E ILE 19 . E GLU 14 E ILE 25 3 ? 1 6 1 F GLU 8 . F ILE 19 . F GLU 14 F ILE 25 3 ? 1 1 2 A LEU 20 . A ALA 22 . A LEU 26 A ALA 28 6 ? 1 2 2 B LEU 20 . B ALA 22 . B LEU 26 B ALA 28 6 ? 1 3 2 C LEU 20 . C ALA 22 . C LEU 26 C ALA 28 6 ? 1 4 2 D LEU 20 . D ALA 22 . D LEU 26 D ALA 28 6 ? 1 5 2 E LEU 20 . E ALA 22 . E LEU 26 E ALA 28 6 ? 1 6 2 F LEU 20 . F ALA 22 . F LEU 26 F ALA 28 6 ? 1 1 3 A ILE 23 . A MET 45 . A ILE 29 A MET 51 3 ? 1 2 3 B ILE 23 . B MET 45 . B ILE 29 B MET 51 3 ? 1 3 3 C ILE 23 . C MET 45 . C ILE 29 C MET 51 3 ? 1 4 3 D ILE 23 . D MET 45 . D ILE 29 D MET 51 3 ? 1 5 3 E ILE 23 . E MET 45 . E ILE 29 E MET 51 3 ? 1 6 3 F ILE 23 . F MET 45 . F ILE 29 F MET 51 3 ? 1 1 4 A ASN 49 . A VAL 59 . A ASN 55 A VAL 65 3 ? 1 2 4 B ASN 49 . B VAL 59 . B ASN 55 B VAL 65 3 ? 1 3 4 C ASN 49 . C VAL 59 . C ASN 55 C VAL 65 3 ? 1 4 4 D ASN 49 . D VAL 59 . D ASN 55 D VAL 65 3 ? 1 5 4 E ASN 49 . E VAL 59 . E ASN 55 E VAL 65 3 ? 1 6 4 F ASN 49 . F VAL 59 . F ASN 55 F VAL 65 3 ? 1 1 5 A ASN 61 . A MET 69 . A ASN 67 A MET 75 3 ? 1 2 5 B ASN 61 . B MET 69 . B ASN 67 B MET 75 3 ? 1 3 5 C ASN 61 . C MET 69 . C ASN 67 C MET 75 3 ? 1 4 5 D ASN 61 . D MET 69 . D ASN 67 D MET 75 3 ? 1 5 5 E ASN 61 . E MET 69 . E ASN 67 E MET 75 3 ? 1 6 5 F ASN 61 . F MET 69 . F ASN 67 F MET 75 3 ? 1 1 6 A GLY 71 . A PHE 159 . A GLY 77 A PHE 165 2 ? 1 2 6 B GLY 71 . B PHE 159 . B GLY 77 B PHE 165 2 ? 1 3 6 C GLY 71 . C PHE 159 . C GLY 77 C PHE 165 2 ? 1 4 6 D GLY 71 . D PHE 159 . D GLY 77 D PHE 165 2 ? 1 5 6 E GLY 71 . E PHE 159 . E GLY 77 E PHE 165 2 ? 1 6 6 F GLY 71 . F PHE 159 . F GLY 77 F PHE 165 2 ? 2 1 1 A ILE 161 . A TRP 200 . A ILE 167 A TRP 206 2 ? 2 2 1 B ILE 161 . B TRP 200 . B ILE 167 B TRP 206 2 ? 2 3 1 C ILE 161 . C TRP 200 . C ILE 167 C TRP 206 2 ? 2 4 1 D ILE 161 . D TRP 200 . D ILE 167 D TRP 206 2 ? 2 5 1 E ILE 161 . E TRP 200 . E ILE 167 E TRP 206 2 ? 2 6 1 F ILE 161 . F TRP 200 . F ILE 167 F TRP 206 2 ? 3 1 1 A TRP 201 . A LEU 299 . A TRP 207 A LEU 305 2 ? 3 2 1 B TRP 201 . B LEU 299 . B TRP 207 B LEU 305 2 ? 3 3 1 C TRP 201 . C LEU 299 . C TRP 207 C LEU 305 2 ? 3 1 2 A CYS 301 . A LYS 315 . A CYS 307 A LYS 321 4 ? 3 2 2 B CYS 301 . B LYS 315 . B CYS 307 B LYS 321 4 ? 3 3 2 C CYS 301 . C LYS 315 . C CYS 307 C LYS 321 4 ? 4 1 1 D TRP 201 . D LYS 315 . D TRP 207 D LYS 321 2 ? 4 2 1 E TRP 201 . E LYS 315 . E TRP 207 E LYS 321 2 ? 4 3 1 F TRP 201 . F LYS 315 . F TRP 207 F LYS 321 2 ? 5 1 1 A LYS 333 . A VAL 349 . A LYS 339 A VAL 355 2 ? 5 2 1 E LYS 333 . E VAL 349 . E LYS 339 E VAL 355 2 ? 6 1 1 B LYS 333 . B VAL 349 . B LYS 339 B VAL 355 2 ? 6 2 1 C LYS 333 . C VAL 349 . C LYS 339 C VAL 355 2 ? 7 1 1 D ASP 330 . D VAL 349 . D ASP 336 D VAL 355 2 ? 7 2 1 F ASP 330 . F VAL 349 . F ASP 336 F VAL 355 2 ? 8 1 1 A GLN 350 . A PHE 365 . A GLN 356 A PHE 371 2 ? 8 2 1 B GLN 350 . B PHE 365 . B GLN 356 B PHE 371 2 ? 8 3 1 C GLN 350 . C PHE 365 . C GLN 356 C PHE 371 2 ? 8 4 1 D GLN 350 . D PHE 365 . D GLN 356 D PHE 371 2 ? 8 5 1 E GLN 350 . E PHE 365 . E GLN 356 E PHE 371 2 ? 8 6 1 F GLN 350 . F PHE 365 . F GLN 356 F PHE 371 2 ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 ? 2 ? 3 ? 4 ? 5 ? 6 ? 7 ? 8 ? # _database_PDB_matrix.entry_id 4FR4 _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _struct.entry_id 4FR4 _struct.title 'Crystal structure of human serine/threonine-protein kinase 32A (YANK1)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 4FR4 _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSFERASE _struct_keywords.text 'Structural Genomics, Structural Genomics Consortium, SGC, TRANSFERASE' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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'expression tag' 0 12 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 software_defined_assembly PISA monomeric 1 2 author_and_software_defined_assembly PISA monomeric 1 3 author_and_software_defined_assembly PISA monomeric 1 4 author_and_software_defined_assembly PISA monomeric 1 5 author_and_software_defined_assembly PISA monomeric 1 6 author_and_software_defined_assembly PISA monomeric 1 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,G,H,U 2 1 B,I,J,K,V 3 1 C,L,M,N,O,W 4 1 D,P,X 5 1 E,Q,R,Y 6 1 F,S,T,Z # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details 'THE AUTHOR STATES THAT THE BIOLOGICAL UNIT OF THIS PROTEIN IS UNKNOWN.' # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ASN A 13 ? 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F CYS 340 F CYS 346 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 CYS A 334 ? 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S ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? anti-parallel A 3 4 ? anti-parallel A 4 5 ? anti-parallel A 5 6 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel B 2 3 ? anti-parallel C 1 2 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel D 2 3 ? anti-parallel D 3 4 ? anti-parallel D 4 5 ? anti-parallel D 5 6 ? anti-parallel E 1 2 ? anti-parallel E 2 3 ? anti-parallel F 1 2 ? anti-parallel G 1 2 ? anti-parallel H 1 2 ? anti-parallel H 2 3 ? anti-parallel H 3 4 ? anti-parallel H 4 5 ? anti-parallel H 5 6 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel I 2 3 ? anti-parallel J 1 2 ? anti-parallel K 1 2 ? anti-parallel K 2 3 ? anti-parallel K 3 4 ? anti-parallel K 4 5 ? anti-parallel K 5 6 ? anti-parallel L 1 2 ? anti-parallel L 2 3 ? anti-parallel M 1 2 ? anti-parallel N 1 2 ? anti-parallel N 2 3 ? anti-parallel N 3 4 ? anti-parallel N 4 5 ? anti-parallel N 5 6 ? anti-parallel O 1 2 ? anti-parallel O 2 3 ? anti-parallel P 1 2 ? anti-parallel Q 1 2 ? anti-parallel Q 2 3 ? anti-parallel Q 3 4 ? anti-parallel Q 4 5 ? anti-parallel Q 5 6 ? anti-parallel R 1 2 ? anti-parallel R 2 3 ? anti-parallel S 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 PHE A 17 ? 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ALA B 169 MET B 170 G 1 SER B 314 ? LYS B 315 ? SER B 320 LYS B 321 G 2 GLN C 170 ? ILE C 171 ? GLN C 176 ILE C 177 H 1 PHE C 17 ? GLY C 24 ? PHE C 23 GLY C 30 H 2 VAL C 31 ? LYS C 36 ? VAL C 37 LYS C 42 H 3 MET C 42 ? ASN C 49 ? MET C 48 ASN C 55 H 4 ASP C 89 ? VAL C 94 ? ASP C 95 VAL C 100 H 5 LEU C 80 ? GLN C 85 ? LEU C 86 GLN C 91 H 6 PHE C 356 ? ASN C 357 ? PHE C 362 ASN C 363 I 1 GLY C 100 ? ASP C 101 ? GLY C 106 ASP C 107 I 2 ILE C 146 ? LEU C 148 ? ILE C 152 LEU C 154 I 3 VAL C 154 ? ILE C 156 ? VAL C 160 ILE C 162 J 1 ILE C 136 ? ILE C 137 ? ILE C 142 ILE C 143 J 2 ALA C 163 ? MET C 164 ? ALA C 169 MET C 170 K 1 PHE D 17 ? GLY D 24 ? PHE D 23 GLY D 30 K 2 VAL D 31 ? LYS D 36 ? VAL D 37 LYS D 42 K 3 MET D 42 ? ASN D 49 ? MET D 48 ASN D 55 K 4 ASP D 89 ? VAL D 94 ? ASP D 95 VAL D 100 K 5 LEU D 80 ? GLN D 85 ? LEU D 86 GLN D 91 K 6 PHE D 356 ? ASN D 357 ? PHE D 362 ASN D 363 L 1 GLY D 100 ? ASP D 101 ? GLY D 106 ASP D 107 L 2 ILE D 146 ? LEU D 148 ? 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O ILE C 39 H 2 3 N CYS C 32 ? N CYS C 38 O MET C 45 ? O MET C 51 H 3 4 N ALA C 44 ? N ALA C 50 O VAL C 94 ? O VAL C 100 H 4 5 O VAL C 93 ? O VAL C 99 N TYR C 82 ? N TYR C 88 H 5 6 N SER C 83 ? N SER C 89 O PHE C 356 ? O PHE C 362 I 1 2 N GLY C 100 ? N GLY C 106 O LEU C 148 ? O LEU C 154 I 2 3 N LEU C 147 ? N LEU C 153 O HIS C 155 ? O HIS C 161 J 1 2 N ILE C 137 ? N ILE C 143 O ALA C 163 ? O ALA C 169 K 1 2 N LEU D 20 ? N LEU D 26 O ILE D 33 ? O ILE D 39 K 2 3 N CYS D 32 ? N CYS D 38 O MET D 45 ? O MET D 51 K 3 4 N LYS D 46 ? N LYS D 52 O MET D 92 ? O MET D 98 K 4 5 O PHE D 91 ? O PHE D 97 N PHE D 84 ? N PHE D 90 K 5 6 N SER D 83 ? N SER D 89 O PHE D 356 ? O PHE D 362 L 1 2 N GLY D 100 ? N GLY D 106 O LEU D 148 ? O LEU D 154 L 2 3 N LEU D 147 ? N LEU D 153 O HIS D 155 ? O HIS D 161 M 1 2 N ILE D 137 ? N ILE D 143 O ALA D 163 ? O ALA D 169 N 1 2 N LEU E 20 ? N LEU E 26 O ILE E 33 ? O ILE E 39 N 2 3 N CYS E 32 ? N CYS E 38 O MET E 45 ? O MET E 51 N 3 4 N ALA E 44 ? N ALA E 50 O VAL E 94 ? O VAL E 100 N 4 5 O VAL E 93 ? O VAL E 99 N TRP E 81 ? N TRP E 87 N 5 6 N SER E 83 ? N SER E 89 O PHE E 356 ? O PHE E 362 O 1 2 N GLY E 100 ? N GLY E 106 O LEU E 148 ? O LEU E 154 O 2 3 N LEU E 147 ? N LEU E 153 O HIS E 155 ? O HIS E 161 P 1 2 N ILE E 137 ? N ILE E 143 O ALA E 163 ? O ALA E 169 Q 1 2 N LEU F 20 ? N LEU F 26 O ILE F 33 ? O ILE F 39 Q 2 3 N CYS F 32 ? N CYS F 38 O MET F 45 ? O MET F 51 Q 3 4 N ALA F 44 ? N ALA F 50 O VAL F 94 ? O VAL F 100 Q 4 5 O VAL F 93 ? O VAL F 99 N TYR F 82 ? N TYR F 88 Q 5 6 N SER F 83 ? N SER F 89 O PHE F 356 ? O PHE F 362 R 1 2 N GLY F 100 ? N GLY F 106 O LEU F 148 ? O LEU F 154 R 2 3 N LEU F 147 ? N LEU F 153 O HIS F 155 ? O HIS F 161 S 1 2 N ILE F 137 ? N ILE F 143 O ALA F 163 ? 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