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'ATCC 204508 / S288c' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP MED11_YEAST Q99278 1 ;MQPPYIQERLKSLNDIETQLCSMLQEASQVTFIFGELKRGNESVKPQFENHVKQFYERLDKSTTQLRKEIQLLDENVGTR LLPINVNKKALGQDTEKMEEQLDLLSAILDPSKSK ; 1 ? 2 UNP MED17_YEAST P32569 2 ;MTTEDPDSNHLSSETGIKLALDPNLITLALSSNPNSSLHSPTSDEPVPESAGKADTSIRLEGDELENKTKKDNDKNLKFL KNKDSLVSNPHEIYGSMPLEQLIPIILRQRGPGFKFVDLNEKELQNEIKQLGSDSSDGHNSEKKDTDGADENVQIGEDFM EVDYEDKDNPVDSRNETDHKTNENGETDDNIETVMTQEQFVKRRRDMLEHINLAMNESSLALEFVSLLLSSVKESTGMSS MSPFLRKVVKPSSLNSDKIPYVAPTKKEYIELDILNKGWKLQSLNESKDLLRASFNKLSSILQNEHDYWNKIMQSISNKD VIFKIRDRTSGQKLLAIKYGYEDSGSTYKHDRGIANIRNNIESQNLDLIPHSSSVFKGTDFVHSVKKFLRVRIFTKIESE DDYILSGESVMDRDSESEEAETKDIRKQIQLLKKIIFEKELMYQIKKECALLISYGVSIENENKVIIELPNEKFEIELLS LDDDSIVNHEQDLPKINDKRANLMLVMLRLLLVVIFKKTLRSRISSPHGLINLNVDDDILIIRPILGKVRFANYKLLLKK IIKDYVLDIVPGSSITETEVEREQPQENKNIDDENITKLNKEIRAFDKLLNIPRRELKINLPLTEHKSPNLSLMLESPNY CNALIHIKFSAGTEANAVSFDTTFSDFKEVEDFLHFIVAEYIQQKKV ; 1 ? 3 UNP MED8_YEAST P38304 3 ;MSQSTASLVPEGNQGSLQEDVSFDFNGVPGQALDAVRMRLAQLTHSLRRIRDEMSKAELPQWYTLQSQLNVTLSQLVSVT STLQHFQETLDSTVVYPLPKFPTTSHESLVTTLLRKKNIPEVDEWMKYVRETSGVTTALLKDEEIEKLLQQDREITNWAR TTFRNEYGKHDFKNEESLSEEHASLLVRDSKPSKPFNVDDVLKFTFTGEKPIITGSTSTSSSN ; 1 ? 4 UNP MED22_YEAST P32570 4 ;MSNQALYEKLEQTRTILSVKLAELINMTTIADRNDDDEGSFAQENSELAVATTSVMMVNNQTMQLIKNVQDLLILTRSIK EKWLLNQIPVTEHSKVTRFDEKQIEELLDNCIETFVAEKTT ; 1 ? 5 UNP MED18_YEAST P32585 5 ;MVQQLSLFGSIGDDGYDLLISTLTTISGNPPLLYNSLCTVWKPNPSYDVENVNSRNQLVEPNRIKLSKEVPFSYLIDETM MDKPLNFRILKSFTNDKIPLNYAMTRNILHNTVPQVTNFNSTNEDQNNSKHTEDTVNESRNSDDIIDVDMDASPAPSNES CSPWSLQISDIPAAGNNRSVSMQTIAETIILSSAGKNSSVSSLMNGLGYVFEFQYLTIGVKFFMKHGLILELQKIWQIEE AGNSQITSGGFLLKAYINVSRGTDIDRINYTETALMNLKKELQGYIELSVPDRQSMDSRVAHGNILI ; 1 ? 6 UNP MED20_YEAST P34162 6 ;MGKSAVIFVERATPATLTELKDALSNSILSVRDPWSIDFRTYRCSIKNLPADVSKLMYSITFHHHGRQTVLIKDNSAMVT TAAAADIPPALVFNGSSTGVPESIDTILSSKLSNIWMQRQLIKGDAGETLILDGLTVRLVNLFSSTGFKGLLIELQADEA GEFETKIAGIEGHLAEIRAKEYKTSSDSLGPDTSNEICDLAYQYVRALEL ; 1 ? 7 UNP MED6_YEAST P38782 7 ;MNVTPLDELQWKSPEWIQVFGLRTENVLDYFAESPFFDKTSNNQVIKMQRQFSQLNDPNAAVNMTQNIMTLPDGKNGNLE EEFAYVDPARRQILFKYPMYMQLEEELMKLDGTEYVLSSVREPDFWVIRKQRRTNNSGVGSAKGPEIIPLQDYYIIGANI YQSPTIFKIVQSRLMSTSYHLNSTLESLYDLIEFQPSQGVHYKVPTDTSTTATAATNGNNAGGGSNKSSVRPTGGANMAT VPSTTNVNMTVNTMGTGGQTIDNGTGRTGNGNMGITTEMLDKLMVTSIRSTPNYI ; 1 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 4GWP A 1 ? 115 ? 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'X-RAY DIFFRACTION' # _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.d_res_high 4.200 _refine_ls_shell.d_res_low 4.308 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 1656 _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.371 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 97.05 _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.449 _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 86 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? _refine_ls_shell.number_reflns_obs ? _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' # _struct.entry_id 4GWP _struct.title 'Structure of the Mediator Head Module from S. cerevisiae' _struct.pdbx_descriptor ;Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 6 ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 4GWP _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSCRIPTION _struct_keywords.text ;Binding Sites, Mediator Complex, Models, Molecular, Phosphorylation, Protein Structure, Tertiary, Protein Subunits, RNA Polymerase II, Saccharomyces cerevisiae, Structure-Activity Relationship, TRANSCRIPTION ; # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ILE A 6 ? LYS A 38 ? ILE A 6 LYS A 38 1 ? 33 HELX_P HELX_P2 2 ASN A 41 ? SER A 43 ? ASN A 41 SER A 43 5 ? 3 HELX_P HELX_P3 3 VAL A 44 ? THR A 79 ? VAL A 44 THR A 79 1 ? 36 HELX_P HELX_P4 4 GLY A 92 ? LYS A 113 ? GLY A 92 LYS A 113 1 ? 22 HELX_P HELX_P5 5 GLU B 183 ? 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LEU E 85 THR E 94 1 ? 10 HELX_P HELX_P34 34 TYR E 102 ? ASN E 107 ? TYR E 102 ASN E 107 1 ? 6 HELX_P HELX_P35 35 SER E 199 ? LEU E 207 ? SER E 199 LEU E 207 1 ? 9 HELX_P HELX_P36 36 LYS E 225 ? GLY E 227 ? LYS E 225 GLY E 227 5 ? 3 HELX_P HELX_P37 37 ASP E 264 ? LEU E 282 ? ASP E 264 LEU E 282 1 ? 19 HELX_P HELX_P38 38 ASP E 292 ? ASP E 297 ? ASP E 292 ASP E 297 5 ? 6 HELX_P HELX_P39 39 ALA F 15 ? ALA F 23 ? ALA F 15 ALA F 23 1 ? 9 HELX_P HELX_P40 40 ALA F 83 ? ILE F 87 ? ALA F 83 ILE F 87 5 ? 5 HELX_P HELX_P41 41 PRO F 88 ? ASN F 94 ? PRO F 88 ASN F 94 1 ? 7 HELX_P HELX_P42 42 SER F 103 ? LEU F 112 ? SER F 103 LEU F 112 1 ? 10 HELX_P HELX_P43 43 GLU F 162 ? ILE F 177 ? GLU F 162 ILE F 177 1 ? 16 HELX_P HELX_P44 44 ASN F 195 ? LEU F 208 ? ASN F 195 LEU F 208 1 ? 14 HELX_P HELX_P45 45 ARG G 23 ? SER G 34 ? ARG G 23 SER G 34 1 ? 12 HELX_P HELX_P46 46 ASP G 38 ? ARG G 50 ? ASP G 38 ARG G 50 1 ? 13 HELX_P HELX_P47 47 PRO G 88 ? PHE G 95 ? PRO G 88 PHE G 95 1 ? 8 HELX_P HELX_P48 48 MET G 99 ? ASP G 111 ? MET G 99 ASP G 111 1 ? 13 HELX_P HELX_P49 49 LYS G 168 ? TYR G 189 ? LYS G 168 TYR G 189 1 ? 22 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 2 ? B ? 2 ? C ? 2 ? D ? 5 ? E ? 5 ? F ? 16 ? G ? 14 ? H ? 5 ? I ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel C 1 2 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel D 2 3 ? anti-parallel D 3 4 ? anti-parallel D 4 5 ? anti-parallel E 1 2 ? anti-parallel E 2 3 ? anti-parallel E 3 4 ? anti-parallel E 4 5 ? anti-parallel F 1 2 ? anti-parallel F 2 3 ? anti-parallel F 3 4 ? anti-parallel F 4 5 ? anti-parallel F 5 6 ? anti-parallel F 6 7 ? anti-parallel F 7 8 ? anti-parallel F 8 9 ? anti-parallel F 9 10 ? anti-parallel F 10 11 ? anti-parallel F 11 12 ? anti-parallel F 12 13 ? anti-parallel F 13 14 ? anti-parallel F 14 15 ? anti-parallel F 15 16 ? anti-parallel G 1 2 ? anti-parallel G 2 3 ? anti-parallel G 3 4 ? anti-parallel G 4 5 ? anti-parallel G 5 6 ? anti-parallel G 6 7 ? anti-parallel G 7 8 ? anti-parallel G 8 9 ? anti-parallel G 9 10 ? anti-parallel G 10 11 ? anti-parallel G 11 12 ? anti-parallel G 12 13 ? anti-parallel G 13 14 ? anti-parallel H 1 2 ? anti-parallel H 2 3 ? anti-parallel H 3 4 ? anti-parallel H 4 5 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 ILE B 322 ? 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VAL C 94 LEU C 98 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id A 1 2 N ILE B 325 ? 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