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_pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.entry_id 4LD9 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2013-06-24 _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_sf REL _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.SG_entry ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Arnaudo, N.' 1 'Fernandez, I.S.' 2 'McLaughlin, S.H.' 3 'Peak-Chew, S.Y.' 4 'Rhodes, D.' 5 'Martino, F.' 6 # _citation.id primary _citation.title 'The N-terminal acetylation of Sir3 stabilizes its binding to the nucleosome core particle.' _citation.journal_abbrev Nat.Struct.Mol.Biol. _citation.journal_volume 20 _citation.page_first 1119 _citation.page_last 1121 _citation.year 2013 _citation.journal_id_ASTM ? _citation.country US _citation.journal_id_ISSN 1545-9993 _citation.journal_id_CSD ? _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 23934150 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/nsmb.2641 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Arnaudo, N.' 1 ? primary 'Fernandez, I.S.' 2 ? primary 'McLaughlin, S.H.' 3 ? primary 'Peak-Chew, S.Y.' 4 ? primary 'Rhodes, D.' 5 ? primary 'Martino, F.' 6 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Histone H3.2' 15421.101 2 ? ? ? ? 2 polymer man 'Histone H4' 11394.426 2 ? ? ? ? 3 polymer man 'Histone H2A' 14109.436 2 ? ? ? ? 4 polymer man 'Histone H2B 1.1' 13965.265 2 ? ? ? ? 5 polymer syn 'Widom 601 sequence reverse' 51808.992 1 ? ? ? ? 6 polymer syn 'Widom 601 sequence forward' 51341.676 1 ? ? ? ? 7 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;MSGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK ; ;MSGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK ; C,G ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKSRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKSRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; D,H ? 5 polydeoxyribonucleotide no no ;(DC)(DA)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DG)(DC)(DA)(DA)(DT)(DC)(DG)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA) (DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT)(DG)(DA)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG) (DA)(DG)(DA)(DC)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DA)(DG)(DT)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DT) (DT)(DG)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG) (DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DA) (DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DT)(DA)(DG)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DA) (DC)(DG)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DC)(DG) (DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DC)(DT)(DG)(DC)(DA)(DG)(DG)(DG)(DC) (DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DG) ; ;CAATACATGCAATCGATGTATATATCTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGG ACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTGCAGGGC GGCCGCG ; I ? 6 polydeoxyribonucleotide no no ;(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC) (DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DG)(DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DA) (DT)(DT)(DG)(DG)(DT)(DC)(DG)(DT)(DA)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA)(DG) (DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC) (DG)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA) (DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DA)(DA)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DA)(DC)(DT)(DC)(DC) (DC)(DT)(DA)(DG)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DT)(DC) (DA)(DG)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DC)(DG)(DA)(DT)(DT)(DG)(DC)(DA) (DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DT)(DG) ; ;CGCGGCCGCCCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTAC GCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCAGATATATACATCGATTGCA TGTATTG ; J ? 7 'polypeptide(L)' no yes ;(ACE)AKTLKDLDGWQVIITDDQGRVIDDNNRRRSRKRGGENVFLKRISDGLSFGKGESVIFNDNVTETYSVYLIHEIRL NTLNNVVEIWVFSYLRWFELKPKLYYEQFRPDLIKEDHPLEFYKDKFFNEVNKSELYLTAELSEIWLKDFIAVGQILPES QWNDSSIDKIEDRDFLVRYACEPTAEKFVPIDIFQIIRRVKEMEPKQSDEYLKRVSVPVSGQKTNRQVMHKMGKHHHHHH ; ;XAKTLKDLDGWQVIITDDQGRVIDDNNRRRSRKRGGENVFLKRISDGLSFGKGESVIFNDNVTETYSVYLIHEIRLNTLN NVVEIWVFSYLRWFELKPKLYYEQFRPDLIKEDHPLEFYKDKFFNEVNKSELYLTAELSEIWLKDFIAVGQILPESQWND SSIDKIEDRDFLVRYACEPTAEKFVPIDIFQIIRRVKEMEPKQSDEYLKRVSVPVSGQKTNRQVMHKMGKHHHHHH ; K,L ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ALA n 1 3 ARG n 1 4 THR n 1 5 LYS n 1 6 GLN n 1 7 THR n 1 8 ALA n 1 9 ARG n 1 10 LYS n 1 11 SER n 1 12 THR n 1 13 GLY n 1 14 GLY n 1 15 LYS n 1 16 ALA n 1 17 PRO n 1 18 ARG n 1 19 LYS n 1 20 GLN n 1 21 LEU n 1 22 ALA n 1 23 THR n 1 24 LYS n 1 25 ALA n 1 26 ALA n 1 27 ARG n 1 28 LYS n 1 29 SER n 1 30 ALA n 1 31 PRO n 1 32 ALA n 1 33 THR n 1 34 GLY n 1 35 GLY n 1 36 VAL n 1 37 LYS n 1 38 LYS n 1 39 PRO n 1 40 HIS n 1 41 ARG n 1 42 TYR n 1 43 ARG n 1 44 PRO n 1 45 GLY n 1 46 THR n 1 47 VAL n 1 48 ALA n 1 49 LEU n 1 50 ARG n 1 51 GLU n 1 52 ILE n 1 53 ARG n 1 54 ARG n 1 55 TYR n 1 56 GLN n 1 57 LYS n 1 58 SER n 1 59 THR n 1 60 GLU n 1 61 LEU n 1 62 LEU n 1 63 ILE n 1 64 ARG n 1 65 LYS n 1 66 LEU n 1 67 PRO n 1 68 PHE n 1 69 GLN n 1 70 ARG n 1 71 LEU n 1 72 VAL n 1 73 ARG n 1 74 GLU n 1 75 ILE n 1 76 ALA n 1 77 GLN n 1 78 ASP n 1 79 PHE n 1 80 LYS n 1 81 THR n 1 82 ASP n 1 83 LEU n 1 84 ARG n 1 85 PHE n 1 86 GLN n 1 87 SER n 1 88 SER n 1 89 ALA n 1 90 VAL n 1 91 MET n 1 92 ALA n 1 93 LEU n 1 94 GLN n 1 95 GLU n 1 96 ALA n 1 97 SER n 1 98 GLU n 1 99 ALA n 1 100 TYR n 1 101 LEU n 1 102 VAL n 1 103 GLY n 1 104 LEU n 1 105 PHE n 1 106 GLU n 1 107 ASP n 1 108 THR n 1 109 ASN n 1 110 LEU n 1 111 CYS n 1 112 ALA n 1 113 ILE n 1 114 HIS n 1 115 ALA n 1 116 LYS n 1 117 ARG n 1 118 VAL n 1 119 THR n 1 120 ILE n 1 121 MET n 1 122 PRO n 1 123 LYS n 1 124 ASP n 1 125 ILE n 1 126 GLN n 1 127 LEU n 1 128 ALA n 1 129 ARG n 1 130 ARG n 1 131 ILE n 1 132 ARG n 1 133 GLY n 1 134 GLU n 1 135 ARG n 1 136 ALA n 2 1 MET n 2 2 SER n 2 3 GLY n 2 4 ARG n 2 5 GLY n 2 6 LYS n 2 7 GLY n 2 8 GLY n 2 9 LYS n 2 10 GLY n 2 11 LEU n 2 12 GLY n 2 13 LYS n 2 14 GLY n 2 15 GLY n 2 16 ALA n 2 17 LYS n 2 18 ARG n 2 19 HIS n 2 20 ARG n 2 21 LYS n 2 22 VAL n 2 23 LEU n 2 24 ARG n 2 25 ASP n 2 26 ASN n 2 27 ILE n 2 28 GLN n 2 29 GLY n 2 30 ILE n 2 31 THR n 2 32 LYS n 2 33 PRO n 2 34 ALA n 2 35 ILE n 2 36 ARG n 2 37 ARG n 2 38 LEU n 2 39 ALA n 2 40 ARG n 2 41 ARG n 2 42 GLY n 2 43 GLY n 2 44 VAL n 2 45 LYS n 2 46 ARG n 2 47 ILE n 2 48 SER n 2 49 GLY n 2 50 LEU n 2 51 ILE n 2 52 TYR n 2 53 GLU n 2 54 GLU n 2 55 THR n 2 56 ARG n 2 57 GLY n 2 58 VAL n 2 59 LEU n 2 60 LYS n 2 61 VAL n 2 62 PHE n 2 63 LEU n 2 64 GLU n 2 65 ASN n 2 66 VAL n 2 67 ILE n 2 68 ARG n 2 69 ASP n 2 70 ALA n 2 71 VAL n 2 72 THR n 2 73 TYR n 2 74 THR n 2 75 GLU n 2 76 HIS n 2 77 ALA n 2 78 LYS n 2 79 ARG n 2 80 LYS n 2 81 THR n 2 82 VAL n 2 83 THR n 2 84 ALA n 2 85 MET n 2 86 ASP n 2 87 VAL n 2 88 VAL n 2 89 TYR n 2 90 ALA n 2 91 LEU n 2 92 LYS n 2 93 ARG n 2 94 GLN n 2 95 GLY n 2 96 ARG n 2 97 THR n 2 98 LEU n 2 99 TYR n 2 100 GLY n 2 101 PHE n 2 102 GLY n 2 103 GLY n 3 1 MET n 3 2 SER n 3 3 GLY n 3 4 ARG n 3 5 GLY n 3 6 LYS n 3 7 GLN n 3 8 GLY n 3 9 GLY n 3 10 LYS n 3 11 THR n 3 12 ARG n 3 13 ALA n 3 14 LYS n 3 15 ALA n 3 16 LYS n 3 17 THR n 3 18 ARG n 3 19 SER n 3 20 SER n 3 21 ARG n 3 22 ALA n 3 23 GLY n 3 24 LEU 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? 16181 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_angle_d 1.597 ? ? 23100 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_dihedral_angle_d 28.492 ? ? 6531 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_chiral_restr 0.093 ? ? 2607 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_plane_restr 0.006 ? ? 1926 'X-RAY DIFFRACTION' ? # loop_ _refine_ls_shell.pdbx_refine_id _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used _refine_ls_shell.d_res_high _refine_ls_shell.d_res_low _refine_ls_shell.number_reflns_R_work _refine_ls_shell.R_factor_R_work _refine_ls_shell.percent_reflns_obs _refine_ls_shell.R_factor_R_free _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free _refine_ls_shell.number_reflns_R_free _refine_ls_shell.number_reflns_all _refine_ls_shell.R_factor_all _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs _refine_ls_shell.number_reflns_obs 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.3062 3.3777 2371 0.4072 89.00 0.4257 . . 123 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.3777 3.4559 2661 0.3667 99.00 0.4161 . . 140 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.4559 3.5419 2616 0.3592 97.00 0.3957 . . 138 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.5419 3.6371 2667 0.3292 98.00 0.3606 . . 140 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.6371 3.7434 2659 0.3282 98.00 0.3624 . . 143 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.7434 3.8634 2636 0.3209 99.00 0.3769 . . 140 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.8634 4.0004 2669 0.2984 99.00 0.3905 . . 139 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 4.0004 4.1592 2677 0.2824 99.00 0.3239 . . 139 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 4.1592 4.3467 2663 0.2702 99.00 0.3352 . . 144 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 4.3467 4.5733 2704 0.2438 99.00 0.3458 . . 139 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 4.5733 4.8560 2630 0.2310 99.00 0.2792 . . 140 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 4.8560 5.2247 2682 0.2421 99.00 0.3229 . . 140 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 5.2247 5.7392 2653 0.2370 98.00 0.3176 . . 137 . . . . 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'X-RAY DIFFRACTION' . 8.1508 19.9969 2547 0.1419 94.00 0.1914 . . 134 . . . . # _database_PDB_matrix.entry_id 4LD9 _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _struct.entry_id 4LD9 _struct.title 'Crystal structure of the N-terminally acetylated BAH domain of Sir3 bound to the nucleosome core particle' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 4LD9 _struct_keywords.pdbx_keywords 'NUCLEAR PROTEIN/TRANSCRIPTION/DNA' _struct_keywords.text ;BETA BARREL, PROTEIN-DNA COMPLEX, DOUBLE HELIX, alpha-helix, beta-sheet, double stranded DNA, chromatin binding, chromatin, N-terminal acetylation, nucleus, NUCLEAR PROTEIN-TRANSCRIPTION-DNA complex ; # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? K N N 7 ? 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'expression tag' 236 16 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 GLY A 45 ? SER A 58 ? GLY A 44 SER A 57 1 ? 14 HELX_P HELX_P2 2 ARG A 64 ? ASP A 78 ? ARG A 63 ASP A 77 1 ? 15 HELX_P HELX_P3 3 GLN A 86 ? HIS A 114 ? GLN A 85 HIS A 113 1 ? 29 HELX_P HELX_P4 4 MET A 121 ? GLY A 133 ? MET A 120 GLY A 132 1 ? 13 HELX_P HELX_P5 5 ASP B 25 ? ILE B 30 ? ASP B 24 ILE B 29 5 ? 6 HELX_P HELX_P6 6 THR B 31 ? GLY B 42 ? THR B 30 GLY B 41 1 ? 12 HELX_P HELX_P7 7 LEU B 50 ? ALA B 77 ? LEU B 49 ALA B 76 1 ? 28 HELX_P HELX_P8 8 THR B 83 ? GLN B 94 ? THR B 82 GLN B 93 1 ? 12 HELX_P HELX_P9 9 PRO C 27 ? GLY C 38 ? PRO C 26 GLY C 37 1 ? 12 HELX_P HELX_P10 10 GLY C 47 ? ASN C 74 ? GLY C 46 ASN C 73 1 ? 28 HELX_P HELX_P11 11 ILE C 80 ? ARG C 89 ? ILE C 79 ARG C 88 1 ? 10 HELX_P HELX_P12 12 ASP C 91 ? LEU C 98 ? ASP C 90 LEU C 97 1 ? 8 HELX_P HELX_P13 13 GLN C 113 ? LEU C 117 ? GLN C 112 LEU C 116 5 ? 5 HELX_P HELX_P14 14 ALA D 39 ? HIS D 50 ? ALA D 39 HIS D 50 1 ? 12 HELX_P HELX_P15 15 SER D 56 ? ASN D 85 ? SER D 56 ASN D 85 1 ? 30 HELX_P HELX_P16 16 THR D 91 ? LEU D 103 ? THR D 91 LEU D 103 1 ? 13 HELX_P HELX_P17 17 PRO D 104 ? LYS D 121 ? PRO D 104 LYS D 121 1 ? 18 HELX_P HELX_P18 18 THR E 46 ? SER E 58 ? THR E 45 SER E 57 1 ? 13 HELX_P HELX_P19 19 LYS E 65 ? ASP E 78 ? LYS E 64 ASP E 77 1 ? 14 HELX_P HELX_P20 20 SER E 87 ? ALA E 115 ? SER E 86 ALA E 114 1 ? 29 HELX_P HELX_P21 21 MET E 121 ? ARG E 132 ? MET E 120 ARG E 131 1 ? 12 HELX_P HELX_P22 22 ASP F 25 ? ILE F 30 ? ASP F 24 ILE F 29 5 ? 6 HELX_P HELX_P23 23 THR F 31 ? ALA F 39 ? THR F 30 ALA F 38 1 ? 9 HELX_P HELX_P24 24 LEU F 50 ? LYS F 78 ? LEU F 49 LYS F 77 1 ? 29 HELX_P HELX_P25 25 THR F 83 ? GLN F 94 ? THR F 82 GLN F 93 1 ? 12 HELX_P HELX_P26 26 PRO G 27 ? LYS G 37 ? PRO G 26 LYS G 36 1 ? 11 HELX_P HELX_P27 27 GLY G 47 ? ASN G 74 ? GLY G 46 ASN G 73 1 ? 28 HELX_P HELX_P28 28 ILE G 80 ? ASN G 90 ? ILE G 79 ASN G 89 1 ? 11 HELX_P HELX_P29 29 GLU G 93 ? LEU G 98 ? GLU G 92 LEU G 97 1 ? 6 HELX_P HELX_P30 30 GLN G 113 ? LEU G 117 ? GLN G 112 LEU G 116 5 ? 5 HELX_P HELX_P31 31 TYR H 38 ? 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PRO L 115 VAL L 127 1 ? 13 HELX_P HELX_P46 46 TRP L 142 ? LYS L 144 ? TRP L 142 LYS L 144 5 ? 3 HELX_P HELX_P47 47 GLU L 155 ? ASP L 160 ? GLU L 155 ASP L 160 1 ? 6 HELX_P HELX_P48 48 ASP L 188 ? MET L 199 ? ASP L 188 MET L 199 1 ? 12 HELX_P HELX_P49 49 GLU L 200 ? SER L 212 ? 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HB3 H N N 512 TYR HD1 H N N 513 TYR HD2 H N N 514 TYR HE1 H N N 515 TYR HE2 H N N 516 TYR HH H N N 517 TYR HXT H N N 518 VAL N N N N 519 VAL CA C N S 520 VAL C C N N 521 VAL O O N N 522 VAL CB C N N 523 VAL CG1 C N N 524 VAL CG2 C N N 525 VAL OXT O N N 526 VAL H H N N 527 VAL H2 H N N 528 VAL HA H N N 529 VAL HB H N N 530 VAL HG11 H N N 531 VAL HG12 H N N 532 VAL HG13 H N N 533 VAL HG21 H N N 534 VAL HG22 H N N 535 VAL HG23 H N N 536 VAL HXT H N N 537 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal ACE C O doub N N 1 ACE C CH3 sing N N 2 ACE C H sing N N 3 ACE CH3 H1 sing N N 4 ACE CH3 H2 sing N N 5 ACE CH3 H3 sing N N 6 ALA N CA sing N N 7 ALA N H sing N N 8 ALA N H2 sing N N 9 ALA CA C sing N N 10 ALA CA CB sing N N 11 ALA CA HA sing N N 12 ALA C O doub N N 13 ALA C OXT sing N N 14 ALA CB HB1 sing N N 15 ALA CB HB2 sing N N 16 ALA CB HB3 sing N N 17 ALA OXT HXT sing N N 18 ARG N CA sing N N 19 ARG N H sing N N 20 ARG N H2 sing N N 21 ARG CA C sing N N 22 ARG CA CB sing N N 23 ARG CA HA sing N N 24 ARG C O doub N N 25 ARG C OXT sing N N 26 ARG CB CG sing N N 27 ARG CB HB2 sing N N 28 ARG CB HB3 sing N N 29 ARG CG CD sing N N 30 ARG CG HG2 sing N N 31 ARG CG HG3 sing N N 32 ARG CD NE sing N N 33 ARG CD HD2 sing N N 34 ARG CD HD3 sing N N 35 ARG NE CZ sing N N 36 ARG NE HE sing N N 37 ARG CZ NH1 sing N N 38 ARG CZ NH2 doub N N 39 ARG NH1 HH11 sing N N 40 ARG NH1 HH12 sing N N 41 ARG NH2 HH21 sing N N 42 ARG NH2 HH22 sing N N 43 ARG OXT HXT sing N N 44 ASN N CA sing N N 45 ASN N H sing N N 46 ASN N H2 sing N N 47 ASN CA C sing N N 48 ASN CA CB sing N N 49 ASN CA HA sing N N 50 ASN C O doub N N 51 ASN C OXT sing N N 52 ASN CB CG sing N N 53 ASN CB HB2 sing N N 54 ASN CB HB3 sing N N 55 ASN CG OD1 doub N N 56 ASN CG ND2 sing N N 57 ASN ND2 HD21 sing N N 58 ASN ND2 HD22 sing N N 59 ASN OXT HXT sing N N 60 ASP N CA sing N N 61 ASP N H sing N N 62 ASP N H2 sing N N 63 ASP CA C sing N N 64 ASP CA CB sing N N 65 ASP CA HA sing N N 66 ASP C O doub N N 67 ASP C OXT sing N N 68 ASP CB CG sing N N 69 ASP CB HB2 sing N N 70 ASP CB HB3 sing N N 71 ASP CG OD1 doub N N 72 ASP CG OD2 sing N N 73 ASP OD2 HD2 sing N N 74 ASP OXT HXT sing N N 75 CYS N CA sing N N 76 CYS N H sing N N 77 CYS N H2 sing N N 78 CYS CA C sing N N 79 CYS CA CB sing N N 80 CYS CA HA sing N N 81 CYS C O doub N N 82 CYS C OXT sing N N 83 CYS CB SG sing N N 84 CYS CB HB2 sing N N 85 CYS CB HB3 sing N N 86 CYS SG HG sing N N 87 CYS OXT HXT sing N N 88 DA OP3 P sing N N 89 DA OP3 HOP3 sing N N 90 DA P OP1 doub N N 91 DA P OP2 sing N N 92 DA P "O5'" sing N N 93 DA OP2 HOP2 sing N N 94 DA "O5'" "C5'" sing N N 95 DA "C5'" "C4'" sing N N 96 DA "C5'" "H5'" sing N N 97 DA "C5'" "H5''" sing N N 98 DA "C4'" "O4'" sing N N 99 DA "C4'" "C3'" sing N N 100 DA "C4'" "H4'" sing N N 101 DA "O4'" "C1'" sing N N 102 DA "C3'" "O3'" sing N N 103 DA "C3'" 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J 34 ? 1 I DA 50 1_555 J DT 118 1_555 I DG 51 1_555 J DC 117 1_555 0.165 0.408 3.284 -5.952 1.785 36.705 0.402 -1.053 3.235 2.810 9.369 37.209 32 II_DA-34DG-33:DC33DT34_JJ I -34 ? J 34 ? I -33 ? J 33 ? 1 I DG 51 1_555 J DC 117 1_555 I DT 52 1_555 J DA 116 1_555 0.261 -0.415 3.162 3.613 4.343 33.331 -1.390 0.114 3.096 7.505 -6.243 33.793 33 II_DG-33DT-32:DA32DC33_JJ I -33 ? J 33 ? I -32 ? J 32 ? 1 I DT 52 1_555 J DA 116 1_555 I DA 53 1_555 J DT 115 1_555 -0.111 0.434 3.469 4.018 17.074 34.185 -1.686 0.721 3.284 26.959 -6.344 38.303 34 II_DT-32DA-31:DT31DA32_JJ I -32 ? J 32 ? I -31 ? J 31 ? 1 I DA 53 1_555 J DT 115 1_555 I DA 54 1_555 J DT 114 1_555 -1.239 -0.423 3.654 -3.876 7.769 31.385 -2.283 1.449 3.574 14.028 6.999 32.535 35 II_DA-31DA-30:DT30DT31_JJ I -31 ? J 31 ? I -30 ? J 30 ? 1 I DA 54 1_555 J DT 114 1_555 I DT 55 1_555 J DA 113 1_555 -0.440 -0.735 3.170 -8.185 8.178 31.538 -2.564 -0.529 2.916 14.452 14.464 33.543 36 II_DA-30DT-29:DA29DT30_JJ I -30 ? J 30 ? I -29 ? J 29 ? 1 I DT 55 1_555 J DA 113 1_555 I DC 56 1_555 J DG 112 1_555 0.091 0.552 2.516 5.528 1.447 34.891 0.743 0.483 2.521 2.393 -9.143 35.341 37 II_DT-29DC-28:DG28DA29_JJ I -29 ? J 29 ? I -28 ? J 28 ? 1 I DC 56 1_555 J DG 112 1_555 I DC 57 1_555 J DG 111 1_555 0.084 2.038 3.456 4.669 -11.955 40.726 3.979 0.343 2.771 -16.684 -6.516 42.618 38 II_DC-28DC-27:DG27DG28_JJ I -28 ? J 28 ? I -27 ? J 27 ? 1 I DC 57 1_555 J DG 111 1_555 I DC 58 1_555 J DG 110 1_555 -0.807 0.631 4.245 -18.661 11.709 25.477 -1.652 -2.975 3.900 22.025 35.100 33.561 39 II_DC-27DC-26:DG26DG27_JJ I -27 ? J 27 ? I -26 ? J 26 ? 1 I DC 58 1_555 J DG 110 1_555 I DC 59 1_555 J DG 109 1_555 1.302 1.152 3.462 7.255 -18.722 48.393 2.595 -0.983 3.009 -21.782 -8.441 52.161 40 II_DC-26DC-25:DG25DG26_JJ I -26 ? J 26 ? I -25 ? J 25 ? 1 I DC 59 1_555 J DG 109 1_555 I DT 60 1_555 J DA 108 1_555 -0.580 0.526 3.197 1.513 -5.916 32.930 1.849 1.247 3.031 -10.326 -2.641 33.476 41 II_DC-25DT-24:DA24DG25_JJ I -25 ? J 25 ? I -24 ? J 24 ? 1 I DT 60 1_555 J DA 108 1_555 I DT 61 1_555 J DA 107 1_555 0.152 -0.166 3.372 3.012 7.981 37.824 -1.256 0.151 3.274 12.124 -4.575 38.739 42 II_DT-24DT-23:DA23DA24_JJ I -24 ? J 24 ? I -23 ? J 23 ? 1 I DT 61 1_555 J DA 107 1_555 I DG 62 1_555 J DC 106 1_555 0.779 -0.586 3.022 -2.986 13.688 25.505 -3.789 -2.125 2.310 28.433 6.202 29.043 43 II_DT-23DG-22:DC22DA23_JJ I -23 ? J 23 ? I -22 ? J 22 ? 1 I DG 62 1_555 J DC 106 1_555 I DG 63 1_555 J DC 105 1_555 -0.532 -0.855 3.417 -15.034 15.463 24.529 -4.301 -1.750 2.432 30.026 29.193 32.552 44 II_DG-22DG-21:DC21DC22_JJ I -22 ? J 22 ? I -21 ? J 21 ? 1 I DG 63 1_555 J DC 105 1_555 I DC 64 1_555 J DG 104 1_555 -0.461 -0.482 3.470 0.856 -0.541 36.849 -0.685 0.852 3.465 -0.855 -1.354 36.862 45 II_DG-21DC-20:DG20DC21_JJ I -21 ? J 21 ? I -20 ? J 20 ? 1 I DC 64 1_555 J DG 104 1_555 I DG 65 1_555 J DC 103 1_555 -0.744 0.827 2.911 4.681 9.913 24.705 -0.552 2.691 2.840 21.847 -10.315 26.993 46 II_DC-20DG-19:DC19DG20_JJ I -20 ? J 20 ? I -19 ? J 19 ? 1 I DG 65 1_555 J DC 103 1_555 I DG 66 1_555 J DC 102 1_555 -0.233 0.411 3.247 -14.813 4.666 39.311 0.082 -1.230 3.159 6.630 21.049 42.154 47 II_DG-19DG-18:DC18DC19_JJ I -19 ? J 19 ? I -18 ? J 18 ? 1 I DG 66 1_555 J DC 102 1_555 I DT 67 1_555 J DA 101 1_555 -0.588 -0.482 3.589 -4.229 1.434 35.853 -1.001 0.288 3.611 2.319 6.836 36.121 48 II_DG-18DT-17:DA17DC18_JJ I -18 ? J 18 ? I -17 ? J 17 ? 1 I DT 67 1_555 J DA 101 1_555 I DT 68 1_555 J DA 100 1_555 1.233 0.188 3.730 3.286 -17.202 39.437 2.215 -1.308 3.451 -24.102 -4.604 43.009 49 II_DT-17DT-16:DA16DA17_JJ I -17 ? J 17 ? I -16 ? J 16 ? 1 I DT 68 1_555 J DA 100 1_555 I DA 69 1_555 J DT 99 1_555 -1.117 0.876 2.846 3.020 -22.790 36.290 3.011 1.772 1.904 -32.857 -4.355 42.751 50 II_DT-16DA-15:DT15DA16_JJ I -16 ? J 16 ? I -15 ? J 15 ? 1 I DA 69 1_555 J DT 99 1_555 I DA 70 1_555 J DT 98 1_555 1.029 -0.684 3.165 3.695 -2.396 30.797 -0.820 -1.216 3.306 -4.483 -6.913 31.102 51 II_DA-15DA-14:DT14DT15_JJ I -15 ? J 15 ? I -14 ? 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