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L . n O 2 323 GLN 323 254 ? ? ? L . n # loop_ _software.name _software.classification _software.version _software.citation_id _software.pdbx_ordinal HKL-2000 'data collection' . ? 1 PHENIX 'model building' . ? 2 PHENIX refinement . ? 3 HKL-2000 'data reduction' . ? 4 SCALEPACK 'data scaling' . ? 5 PHENIX phasing . ? 6 # _cell.entry_id 4RS5 _cell.length_a 350.155 _cell.length_b 350.155 _cell.length_c 350.155 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 120 _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.length_a_esd ? _cell.length_b_esd ? _cell.length_c_esd ? _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma_esd ? # _symmetry.entry_id 4RS5 _symmetry.space_group_name_H-M 'P 42 3 2' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 208 _symmetry.space_group_name_Hall ? # _exptl.entry_id 4RS5 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews 3.73 _exptl_crystal.density_percent_sol 66.99 _exptl_crystal.description ? 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F6KTB0 1 ? 323 ? -68 254 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 4RS5 GLN E 227 ? UNP F6KTB0 LYS 550 'engineered mutation' 227 1 3 4RS5 SER D 101 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 101 2 3 4RS5 VAL D 102 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 102 3 3 4RS5 LYS D 103 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 103 4 3 4RS5 ARG D 104 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 104 5 3 4RS5 GLY D 105 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 105 6 3 4RS5 THR D 106 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 106 7 3 4RS5 SER D 107 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 107 8 3 4RS5 VAL D 108 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 108 9 3 4RS5 GLY D 109 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 109 10 3 4RS5 MET D 110 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 110 11 3 4RS5 LYS D 111 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 111 12 3 4RS5 PRO D 112 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 112 13 3 4RS5 SER D 113 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 113 14 3 4RS5 PRO D 114 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 114 15 3 4RS5 ARG D 115 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 115 16 3 4RS5 PRO D 116 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 116 17 4 4RS5 SER M 101 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 101 18 4 4RS5 VAL M 102 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 102 19 4 4RS5 LYS M 103 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 103 20 4 4RS5 ARG M 104 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 104 21 4 4RS5 GLY M 105 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 105 22 4 4RS5 THR M 106 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 106 23 4 4RS5 SER M 107 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 107 24 4 4RS5 VAL M 108 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 108 25 4 4RS5 GLY M 109 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 109 26 4 4RS5 MET M 110 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 110 27 4 4RS5 LYS M 111 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 111 28 4 4RS5 PRO M 112 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 112 29 4 4RS5 SER M 113 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 113 30 4 4RS5 PRO M 114 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 114 31 4 4RS5 ARG M 115 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 115 32 4 4RS5 PRO M 116 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 116 33 5 4RS5 SER A 101 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 101 34 5 4RS5 VAL A 102 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 102 35 5 4RS5 LYS A 103 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 103 36 5 4RS5 ARG A 104 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 104 37 5 4RS5 GLY A 105 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 105 38 5 4RS5 THR A 106 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 106 39 5 4RS5 SER A 107 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 107 40 5 4RS5 VAL A 108 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 108 41 5 4RS5 GLY A 109 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 109 42 5 4RS5 MET A 110 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 110 43 5 4RS5 LYS A 111 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 111 44 5 4RS5 PRO A 112 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 112 45 5 4RS5 SER A 113 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 113 46 5 4RS5 PRO A 114 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 114 47 5 4RS5 ARG A 115 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 115 48 5 4RS5 PRO A 116 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 116 49 6 4RS5 SER G 101 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 101 50 6 4RS5 VAL G 102 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 102 51 6 4RS5 LYS G 103 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 103 52 6 4RS5 ARG G 104 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 104 53 6 4RS5 GLY G 105 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 105 54 6 4RS5 THR G 106 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 106 55 6 4RS5 SER G 107 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 107 56 6 4RS5 VAL G 108 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 108 57 6 4RS5 GLY G 109 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 109 58 6 4RS5 MET G 110 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 110 59 6 4RS5 LYS G 111 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 111 60 6 4RS5 PRO G 112 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 112 61 6 4RS5 SER G 113 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 113 62 6 4RS5 PRO G 114 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 114 63 6 4RS5 ARG G 115 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 115 64 6 4RS5 PRO G 116 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 116 65 7 4RS5 SER J 101 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 101 66 7 4RS5 VAL J 102 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 102 67 7 4RS5 LYS J 103 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 103 68 7 4RS5 ARG J 104 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 104 69 7 4RS5 GLY J 105 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 105 70 7 4RS5 THR J 106 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 106 71 7 4RS5 SER J 107 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 107 72 7 4RS5 VAL J 108 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 108 73 7 4RS5 GLY J 109 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 109 74 7 4RS5 MET J 110 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 110 75 7 4RS5 LYS J 111 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 111 76 7 4RS5 PRO J 112 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 112 77 7 4RS5 SER J 113 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 113 78 7 4RS5 PRO J 114 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 114 79 7 4RS5 ARG J 115 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 115 80 7 4RS5 PRO J 116 ? UNP F6KTB0 ? ? insertion 116 81 8 4RS5 GLN N 227 ? UNP F6KTB0 LYS 550 'engineered mutation' 227 82 9 4RS5 GLN B 227 ? UNP F6KTB0 LYS 550 'engineered mutation' 227 83 10 4RS5 GLN H 227 ? UNP F6KTB0 LYS 550 'engineered mutation' 227 84 11 4RS5 GLN K 227 ? UNP F6KTB0 LYS 550 'engineered mutation' 227 85 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 180-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 180 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 1252720 ? 1 MORE -6897 ? 1 'SSA (A^2)' 1295310 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 2 'crystal symmetry operation' 2_555 -x,-y,z -1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 3 'crystal symmetry operation' 3_555 -x,y,-z -1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 0.0000000000 4 'crystal symmetry operation' 4_555 x,-y,-z 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 0.0000000000 5 'crystal symmetry operation' 5_555 z,x,y 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 6 'crystal symmetry operation' 6_555 z,-x,-y 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 7 'crystal symmetry operation' 7_555 -z,-x,y 0.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 8 'crystal symmetry operation' 8_555 -z,x,-y 0.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 9 'crystal symmetry operation' 9_555 y,z,x 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 10 'crystal symmetry operation' 10_555 -y,z,-x 0.0000000000 -1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 11 'crystal symmetry operation' 11_555 y,-z,-x 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 12 'crystal symmetry operation' 12_555 -y,-z,x 0.0000000000 -1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ;The biological assembly is a 60mer generated from the pentamer in the asymmetric unit by the following 12 operations: (x,y,z),(-x,-y,z),(-x,y,-z),(x,-y,-z),(y,z,x),(-y,-z,x),(-y,z,-x),(y,-z,-x),(z,x,y),(-z,-x,y),(-z,x,-y) and (z,-x,-y). The pentamer in the asymmetric unit is generated from the deposited PDB by the following transformations(r11,r12,r13,r21,r22,r23,r31,r32,r33,tx,tx,tz):(1,0,0,0,1,0,0,0,1,0,0,0), (-0.8127, 0.5018, -0.2962, -0.4896, -0.3124, 0.8141, 0.316, 0.8066, 0.4996, 1.955, 0.5457, -0.138), (0.3088, 0.809, -0.5002, -0.8085, 0.5003, 0.3099, 0.501, 0.3087, 0.8086, -0.07626, 0.23, -0.006095), (-0.8092, -0.4849, 0.3318, 0.5077, -0.2928, 0.8103, -0.2957, 0.8241, 0.4831, 4.346, 1.46, -1.11) and (0.2998, -0.8038, 0.5138, 0.803, 0.5034, 0.319, -0.515, 0.3169, 0.7964, 2.491, 1.66, -0.7237). ; # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 LEU A 43 ? GLN A 48 ? LEU E 43 GLN E 48 1 ? 6 HELX_P HELX_P2 2 SER A 64 ? LEU A 69 ? SER E 64 LEU E 69 5 ? 6 HELX_P HELX_P3 3 GLY A 94 ? SER A 98 ? GLY E 94 SER E 98 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 4 THR A 99 ? GLY A 106 ? THR E 99 GLY E 106 1 ? 8 HELX_P HELX_P5 5 ASP A 145 ? GLY A 152 ? ASP E 145 GLY E 152 1 ? 8 HELX_P HELX_P6 6 PRO B 152 ? GLU B 157 ? PRO F 83 GLU F 88 1 ? 6 HELX_P HELX_P7 7 GLY B 159 ? PHE B 167 ? GLY F 90 PHE F 98 1 ? 9 HELX_P HELX_P8 8 PRO B 216 ? GLN B 221 ? PRO F 147 GLN F 152 1 ? 6 HELX_P HELX_P9 9 HIS B 231 ? LEU B 235 ? HIS F 162 LEU F 166 5 ? 5 HELX_P HELX_P10 10 PRO B 240 ? CYS B 247 ? PRO F 171 CYS F 178 5 ? 8 HELX_P HELX_P11 11 THR C 75 ? THR C 78 ? THR D 75 THR D 78 5 ? 4 HELX_P HELX_P12 12 THR C 79 ? PHE C 84 ? THR D 79 PHE D 84 1 ? 6 HELX_P HELX_P13 13 GLN C 134 ? GLU C 140 ? GLN D 134 GLU D 140 1 ? 7 HELX_P HELX_P14 14 SER C 184 ? GLN C 188 ? SER D 184 GLN D 188 5 ? 5 HELX_P HELX_P15 15 CYS C 241 ? MET C 245 ? CYS D 241 MET D 245 5 ? 5 HELX_P HELX_P16 16 THR D 79 ? PHE D 84 ? THR M 79 PHE M 84 1 ? 6 HELX_P HELX_P17 17 GLN D 134 ? GLU D 140 ? GLN M 134 GLU M 140 1 ? 7 HELX_P HELX_P18 18 SER D 184 ? GLN D 188 ? SER M 184 GLN M 188 5 ? 5 HELX_P HELX_P19 19 CYS D 241 ? MET D 245 ? CYS M 241 MET M 245 5 ? 5 HELX_P HELX_P20 20 THR E 79 ? PHE E 83 ? THR A 79 PHE A 83 5 ? 5 HELX_P HELX_P21 21 GLN E 134 ? GLU E 140 ? GLN A 134 GLU A 140 1 ? 7 HELX_P HELX_P22 22 SER E 184 ? GLN E 188 ? SER A 184 GLN A 188 5 ? 5 HELX_P HELX_P23 23 CYS E 241 ? MET E 245 ? CYS A 241 MET A 245 5 ? 5 HELX_P HELX_P24 24 THR F 79 ? PHE F 84 ? THR G 79 PHE G 84 1 ? 6 HELX_P HELX_P25 25 GLN F 134 ? GLU F 140 ? GLN G 134 GLU G 140 1 ? 7 HELX_P HELX_P26 26 SER F 184 ? GLN F 188 ? SER G 184 GLN G 188 5 ? 5 HELX_P HELX_P27 27 CYS F 241 ? MET F 245 ? CYS G 241 MET G 245 5 ? 5 HELX_P HELX_P28 28 THR G 75 ? THR G 78 ? THR J 75 THR J 78 5 ? 4 HELX_P HELX_P29 29 THR G 79 ? PHE G 84 ? THR J 79 PHE J 84 1 ? 6 HELX_P HELX_P30 30 GLN G 134 ? GLU G 140 ? GLN J 134 GLU J 140 1 ? 7 HELX_P HELX_P31 31 SER G 184 ? GLN G 188 ? SER J 184 GLN J 188 5 ? 5 HELX_P HELX_P32 32 CYS G 241 ? MET G 245 ? CYS J 241 MET J 245 5 ? 5 HELX_P HELX_P33 33 ALA G 296 ? ILE G 300 ? ALA J 296 ILE J 300 5 ? 5 HELX_P HELX_P34 34 LEU H 43 ? GLN H 48 ? LEU N 43 GLN N 48 1 ? 6 HELX_P HELX_P35 35 SER H 64 ? ARG H 68 ? SER N 64 ARG N 68 5 ? 5 HELX_P HELX_P36 36 GLY H 94 ? SER H 98 ? GLY N 94 SER N 98 5 ? 5 HELX_P HELX_P37 37 THR H 99 ? GLY H 106 ? THR N 99 GLY N 106 1 ? 8 HELX_P HELX_P38 38 ASP H 145 ? LEU H 151 ? ASP N 145 LEU N 151 1 ? 7 HELX_P HELX_P39 39 LEU I 43 ? GLN I 48 ? LEU B 43 GLN B 48 1 ? 6 HELX_P HELX_P40 40 THR I 63 ? ARG I 68 ? THR B 63 ARG B 68 5 ? 6 HELX_P HELX_P41 41 GLY I 94 ? SER I 98 ? GLY B 94 SER B 98 5 ? 5 HELX_P HELX_P42 42 THR I 99 ? GLY I 106 ? THR B 99 GLY B 106 1 ? 8 HELX_P HELX_P43 43 ASP I 145 ? GLY I 152 ? ASP B 145 GLY B 152 1 ? 8 HELX_P HELX_P44 44 LEU J 43 ? GLN J 48 ? LEU H 43 GLN H 48 1 ? 6 HELX_P HELX_P45 45 SER J 64 ? ARG J 68 ? SER H 64 ARG H 68 5 ? 5 HELX_P HELX_P46 46 GLY J 94 ? SER J 98 ? GLY H 94 SER H 98 5 ? 5 HELX_P HELX_P47 47 THR J 99 ? GLY J 106 ? THR H 99 GLY H 106 1 ? 8 HELX_P HELX_P48 48 ASP J 145 ? GLY J 152 ? ASP H 145 GLY H 152 1 ? 8 HELX_P HELX_P49 49 LEU K 43 ? GLN K 48 ? LEU K 43 GLN K 48 1 ? 6 HELX_P HELX_P50 50 THR K 63 ? ARG K 68 ? THR K 63 ARG K 68 5 ? 6 HELX_P HELX_P51 51 GLY K 94 ? SER K 98 ? GLY K 94 SER K 98 5 ? 5 HELX_P HELX_P52 52 THR K 99 ? CYS K 105 ? THR K 99 CYS K 105 1 ? 7 HELX_P HELX_P53 53 GLY K 106 ? TYR K 108 ? GLY K 106 TYR K 108 5 ? 3 HELX_P HELX_P54 54 ASP K 145 ? GLY K 152 ? ASP K 145 GLY K 152 1 ? 8 HELX_P HELX_P55 55 PRO L 152 ? GLU L 157 ? PRO O 83 GLU O 88 1 ? 6 HELX_P HELX_P56 56 GLY L 159 ? PHE L 167 ? GLY O 90 PHE O 98 1 ? 9 HELX_P HELX_P57 57 PRO L 216 ? GLN L 221 ? PRO O 147 GLN O 152 1 ? 6 HELX_P HELX_P58 58 HIS L 231 ? LEU L 235 ? HIS O 162 LEU O 166 5 ? 5 HELX_P HELX_P59 59 PRO L 240 ? CYS L 247 ? 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