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n C 2 471 ALA 471 423 423 ALA ALA C . n C 2 472 VAL 472 424 424 VAL VAL C . n C 2 473 TYR 473 425 425 TYR TYR C . n C 2 474 VAL 474 426 426 VAL VAL C . n C 2 475 THR 475 427 427 THR THR C . n C 2 476 ARG 476 428 428 ARG ARG C . n C 2 477 PRO 477 429 429 PRO PRO C . n C 2 478 VAL 478 430 430 VAL VAL C . n C 2 479 ASP 479 431 431 ASP ASP C . n C 2 480 VAL 480 432 432 VAL VAL C . n C 2 481 PRO 481 433 433 PRO PRO C . n C 2 482 PHE 482 434 434 PHE PHE C . n C 2 483 PRO 483 435 435 PRO PRO C . n C 2 484 GLU 484 436 436 GLU GLU C . n C 2 485 ASP 485 437 437 ASP ASP C . n C 2 486 GLU 486 438 438 GLU GLU C . n C 2 487 CYS 487 439 439 CYS CYS C . n C 2 488 PHE 488 440 440 PHE PHE C . n C 2 489 ASP 489 441 441 ASP ASP C . n C 2 490 LEU 490 442 442 LEU LEU C . n C 2 491 LYS 491 443 443 LYS LYS C . n C 2 492 SER 492 444 444 SER SER C . n C 2 493 LEU 493 445 445 LEU LEU C . n C 2 494 VAL 494 446 446 VAL VAL C . n C 2 495 ARG 495 447 447 ARG ARG C . n C 2 496 VAL 496 448 448 VAL VAL C . n C 2 497 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475 LYS LYS C . n # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 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_pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' em_3d_fitting 2 2 'Structure model' em_software # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_em_3d_fitting.target_criteria' 2 2 'Structure model' '_em_software.fitting_id' 3 2 'Structure model' '_em_software.image_processing_id' 4 2 'Structure model' '_em_software.name' # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 4V3M _em_3d_fitting.ref_protocol 'RIGID BODY FIT' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.target_criteria 'Cross-correlation coefficient' _em_3d_fitting.details 'METHOD--RIGID BODY' _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id 1 _em_3d_fitting_list.id 1 _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id 4OEB _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id ? 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(DEPOSITION ID: 12858).' _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.resolution_method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name '50 MM NACL, 20 MM HEPES' _em_buffer.pH 7.4 _em_buffer.details '50 MM NACL, 20 MM HEPES' # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.name 'PLEUROTOLYSIN PREPORE ON LIPOSOMES (TMH2 HELIX LOCK) TRAPPED WITH ENGINEERED DISULPHIDE' _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 4V3M _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.number_digital_images 154 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.entry_id 4V3M _em_imaging.id 1 _em_imaging.microscope_model 'FEI POLARA 300' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.date 2013-01-30 _em_imaging.temperature 94 _em_imaging.nominal_defocus_min 700 _em_imaging.nominal_defocus_max 3700 _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_cs 2.3 _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.nominal_magnification 59000 _em_imaging.calibrated_magnification 76148 _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.details ? _em_imaging.specimen_holder_type . _em_imaging.specimen_holder_model . _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details 'HOLEY CARBON' _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type ? # _em_vitrification.entry_id 4V3M _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK III' _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.details ;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 80,INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- PLEUROTOLYSIN A WAS FIRST ADDED TO SPHINGOMYELIN-CHOLESTEROL LIPOSOMES AT A MOLAR RATIO OF 1 TO 2000 ROTEIN TO LIPID IN THE ABOVE BUFFER. AFTER 5 MIN INCUBATION AT ROOM TEMPERATURE,PLEUROTOLYSIN B WAS ADDED TO THE MIXTURE AT A MOLAR RATIO OF 1 TO 2 TO PLEUROTOLYSIN A. THE MIXTURE WAS INCUBATED AT 40 C OR ROOM TEMPERATURE FOR 30 MIN AFTER WHICH 3.5 UL WERE PLACED ON NEGATIVELY GLOW DISCHARGED LACEY GRIDS AND VITRIFIED IN LIQUID ETHANE USING A VITROBOT. 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