data_5DN6 # _entry.id 5DN6 # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.318 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 5DN6 WWPDB D_1000213341 # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type PDB 'ATP synthase alpha/beta dimer from P. denitrificans' 5CDF unspecified PDB 'ATP synthase F1-c8 sub complex from Bos taurus' 2XND unspecified PDB 'ATP synthase F1-c10 sub complex from S. cerevisiae' 2XOK unspecified # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf REL _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 5DN6 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2015-09-09 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Morales-Rios, E.' 1 'Montgomery, M.G.' 2 'Leslie, A.G.W.' 3 'Walker, J.E.' 4 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Proc.Natl.Acad.Sci.USA _citation.journal_id_ASTM PNASA6 _citation.journal_id_CSD 0040 _citation.journal_id_ISSN 1091-6490 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 112 _citation.language ? _citation.page_first 13231 _citation.page_last 13236 _citation.title 'Structure of ATP synthase from Paracoccus denitrificans determined by X-ray crystallography at 4.0 angstrom resolution.' _citation.year 2015 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1073/pnas.1517542112 _citation.pdbx_database_id_PubMed 26460036 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Morales-Rios, E.' 1 ? primary 'Montgomery, M.G.' 2 ? primary 'Leslie, A.G.' 3 ? primary 'Walker, J.E.' 4 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 97.44 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 5DN6 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 112.001 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 187.943 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 164.724 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB 24 _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5DN6 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Chain A' 1720.111 1 ? ? ? ? 2 polymer nat 'Chain B' 1294.587 1 ? ? ? ? 3 polymer nat 'Chain C' 1635.006 1 ? ? ? ? 4 polymer nat 'ATP synthase subunit alpha' 55099.793 3 7.1.2.2 ? ? ? 5 polymer nat 'ATP synthase subunit beta' 50385.977 3 7.1.2.2 ? ? ? 6 polymer nat 'ATP synthase gamma chain' 31639.014 1 ? ? ? ? 7 polymer nat 'ATP synthase subunit delta' 20047.754 1 ? ? ? ? 8 polymer nat 'ATP synthase epsilon chain' 15840.824 1 ? ? ? ? 9 polymer nat 'ATP synthase F0 subcomplex C subunit' 7610.894 12 ? ? ? ? 10 polymer nat 'Chain V' 6656.196 1 ? ? ? ? 11 polymer nat 'Chain W' 10571.022 1 ? ? ? ? 12 polymer nat 'ATP synthase subunit a,ATP synthase subunit a,ATP synthase subunit a,ATP synthase subunit a' 29724.506 1 ? ? ? ;The UNK residues actually appear earlier than the proper residues listed. We used higher numbers so people would not mis-assign them.,The UNK residues actually appear earlier than the proper residues listed. We used higher numbers so people would not mis-assign them.,The UNK residues actually appear earlier than the proper residues listed. We used higher numbers so people would not mis-assign them.,The UNK residues actually appear earlier than the proper residues listed. We used higher numbers so people would not mis-assign them. ; 13 polymer nat 'Chain Y' 4613.678 1 ? ? ? ? 14 polymer nat 'Zeta inhibitor protein' 11686.950 1 ? ? ? ? 15 non-polymer syn "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 507.181 4 ? ? ? ? 16 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 5 ? ? ? ? 17 non-polymer syn "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 427.201 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 4 'ATP synthase F1 sector subunit alpha,F-ATPase subunit alpha' 5 'ATP synthase F1 sector subunit beta,F-ATPase subunit beta' 6 'ATP synthase F1 sector gamma subunit,F-ATPase gamma subunit' 7 'ATP synthase F(1) sector subunit delta,F-type ATPase subunit delta,F-ATPase subunit delta' 8 'ATP synthase F1 sector epsilon subunit,F-ATPase epsilon subunit' 12 'ATP synthase F0 sector subunit a,F-ATPase subunit 6' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ; XXXXXXXXXXXXXXXXXXXX 1 ? 2 'polypeptide(L)' no no '(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)' XXXXXXXXXXXXXXX 2 ? 3 'polypeptide(L)' no no ;(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) ; XXXXXXXXXXXXXXXXXXX 3 ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MGIQAAEISAILKDQIKNFGQDAEVAEVGQVLSVGDGIARVYGLDKVQAGEMVEFPGGIRGMVLNLETDNVGVVIFGDDR DIKEGDTVKRTGAIVEVPAGKELLGRVVDALGNPIDGKGPLNASERRIADVKAPGIMPRKSVHEPMATGLKSVDAMIPVG RGQRELIIGDRQTGKTAIALDTILNQANYNGREADGMKTLHCIYVAVGQKRSTVAQLVKKLEETGAMAYTTVVAATASDP APMQYLAPYSATAMGEYFRDNGMDALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERSAKLNEANGAG SLTALPIIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFFQGIRPAVNTGLSVSRVGSAAQTKAMKSVAGPVKLELAQYRE MAAFAQFGSDLDAATQKLLNRGARLTELMKQPQYSPLTNAEIVIVIYAGTKGYLDGIPVRDVTKWEHGLLQYLRNQKADL LEDMTKNDRKVAGELEDAIKAALDGYAKTYA ; ;MGIQAAEISAILKDQIKNFGQDAEVAEVGQVLSVGDGIARVYGLDKVQAGEMVEFPGGIRGMVLNLETDNVGVVIFGDDR DIKEGDTVKRTGAIVEVPAGKELLGRVVDALGNPIDGKGPLNASERRIADVKAPGIMPRKSVHEPMATGLKSVDAMIPVG RGQRELIIGDRQTGKTAIALDTILNQANYNGREADGMKTLHCIYVAVGQKRSTVAQLVKKLEETGAMAYTTVVAATASDP APMQYLAPYSATAMGEYFRDNGMDALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERSAKLNEANGAG SLTALPIIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFFQGIRPAVNTGLSVSRVGSAAQTKAMKSVAGPVKLELAQYRE MAAFAQFGSDLDAATQKLLNRGARLTELMKQPQYSPLTNAEIVIVIYAGTKGYLDGIPVRDVTKWEHGLLQYLRNQKADL LEDMTKNDRKVAGELEDAIKAALDGYAKTYA ; A,B,C ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MAEANGKITQVIGAVVDVQFDGQLPAILNALETENNGKRLVLEVAQHLGENTVRTIAMDATEGLVRGLPVKDTGGPIMVP VGDATLGRILNVVGEPVDEGGPVEATQTRAIHQQAPDFAAQATASEILVTGIKVIDLLAPYSKGGKIGLFGGAGVGKTVL IMELINNIAKVHSGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMVESGVIKPDDLSKSQVALVYGQMNEPPGARMRVALTGLTVAEQFR DATGTDVLFFVDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGAMQERITSTKNGSITSIQAVYVPADDLTDPAPAT TFAHLDATTVLSRAISELGIYPAVDPLDSNSRILDPAVVGEEHYQVARDVQGILQKYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTV ARARKIQRFLSQPFDVAKVFTGSDGVQVPLEDTIKSFKAVVAGEYDHLPEAAFYMVGGIEDVKAKAQRLAADAA ; ;MAEANGKITQVIGAVVDVQFDGQLPAILNALETENNGKRLVLEVAQHLGENTVRTIAMDATEGLVRGLPVKDTGGPIMVP VGDATLGRILNVVGEPVDEGGPVEATQTRAIHQQAPDFAAQATASEILVTGIKVIDLLAPYSKGGKIGLFGGAGVGKTVL IMELINNIAKVHSGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMVESGVIKPDDLSKSQVALVYGQMNEPPGARMRVALTGLTVAEQFR DATGTDVLFFVDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGAMQERITSTKNGSITSIQAVYVPADDLTDPAPAT TFAHLDATTVLSRAISELGIYPAVDPLDSNSRILDPAVVGEEHYQVARDVQGILQKYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTV ARARKIQRFLSQPFDVAKVFTGSDGVQVPLEDTIKSFKAVVAGEYDHLPEAAFYMVGGIEDVKAKAQRLAADAA ; D,E,F ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MPSLKDLKNRIGSVKNTRKITKAMQMVAAAKLRRAQEAAEAARPYADRMAAVMAGLTAAAAGSDMAPRLLAGTGEDRRHL LVVMTSERGLAGGFNSSIVKLARLRLQELQAQGKQVSILTVGKKGREQLKREYGDLFVNHVDLSEVKRIGYDNARAIADE ILDRFDNGEFDVATLFYNRFESVISQVPTARQVIPAVIEEGEAGASSLYDYEPDENAILNDLLPRSVATQVFAALLENAA SEQGARMTAMDNATRNAGDMIDRLTTVYNRSRQAAITKELIEIISGAEAL ; ;MPSLKDLKNRIGSVKNTRKITKAMQMVAAAKLRRAQEAAEAARPYADRMAAVMAGLTAAAAGSDMAPRLLAGTGEDRRHL LVVMTSERGLAGGFNSSIVKLARLRLQELQAQGKQVSILTVGKKGREQLKREYGDLFVNHVDLSEVKRIGYDNARAIADE ILDRFDNGEFDVATLFYNRFESVISQVPTARQVIPAVIEEGEAGASSLYDYEPDENAILNDLLPRSVATQVFAALLENAA SEQGARMTAMDNATRNAGDMIDRLTTVYNRSRQAAITKELIEIISGAEAL ; G ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MTVANSASISADIAGRYAQALFDLVRDSGGIDALSSQIDDLASAYDASQDLRDLTLSPLYDRQQQEAAVGALSERMGLSA ELANTLRLLARNRRLFTLPQFVAKLRNLIADAKGEVTADVVSAQALTDEQKARLADTLAAKSGKTVKLNARVDESLIGGM IVKLGSQMIDSSIRSKLASLQNAMKEVG ; ;MTVANSASISADIAGRYAQALFDLVRDSGGIDALSSQIDDLASAYDASQDLRDLTLSPLYDRQQQEAAVGALSERMGLSA ELANTLRLLARNRRLFTLPQFVAKLRNLIADAKGEVTADVVSAQALTDEQKARLADTLAAKSGKTVKLNARVDESLIGGM IVKLGSQMIDSSIRSKLASLQNAMKEVG ; H ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MADTMQFDLVSPERNLVSVPVREVRLPGADGDLTAMPGHAPAIVNLRPGLVTVVAGDGSETEFAVTGGFAEINNESVTLL AERGHPRAEMTQEVFNEMMAQARRRVEAAKERESAGEELVAAAVKLLADMEALGTHIGLDPNHANFPH ; ;MADTMQFDLVSPERNLVSVPVREVRLPGADGDLTAMPGHAPAIVNLRPGLVTVVAGDGSETEFAVTGGFAEINNESVTLL AERGHPRAEMTQEVFNEMMAQARRRVEAAKERESAGEELVAAAVKLLADMEALGTHIGLDPNHANFPH ; I ? 9 'polypeptide(L)' no no MENLGQLGQYLGAGLACVGMAGAAMGVGNVAGNYLAGALRNPSAAASQTATLFIGMAFAEALGIFSFLVALLLLFAV MENLGQLGQYLGAGLACVGMAGAAMGVGNVAGNYLAGALRNPSAAASQTATLFIGMAFAEALGIFSFLVALLLLFAV J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U ? 10 'polypeptide(L)' no no ;(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ; XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX V ? 11 'polypeptide(L)' no no ;(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ; ;XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX ; W ? 12 'polypeptide(L)' no no ;(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)MAEEEAGGLVFHPMDQFVIKPLFGEGPVNWYTPTNATLWMALAALAITALLVFGTRGRAIVPNRV QSIAELLYGMVHKMVEDVTGKDGLKYFPYVMTLFCFILFANFLGLLPKSFSPTSHIAVTAVLAVLVFAGVTVLGFVKNGA HFLGLFWVSSAPLALRPVLAVIELISYFVRPVSHSIRLAGNIMAGHAVIKVFAAFAAVAAIAPVSVVAITAMYGLEVLVC LIQAYVFTILTCVYLKDALHPAH ; ;XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXMAEEEAGGLVFHPMDQFVIKPLFGEGPVNWYTPTNATLWMALAAL AITALLVFGTRGRAIVPNRVQSIAELLYGMVHKMVEDVTGKDGLKYFPYVMTLFCFILFANFLGLLPKSFSPTSHIAVTA VLAVLVFAGVTVLGFVKNGAHFLGLFWVSSAPLALRPVLAVIELISYFVRPVSHSIRLAGNIMAGHAVIKVFAAFAAVAA IAPVSVVAITAMYGLEVLVCLIQAYVFTILTCVYLKDALHPAH ; X ? 13 'polypeptide(L)' no no ;(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ; XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX Y ? 14 'polypeptide(L)' no no ;MTTFDDRERAHEAKFAHDAELNFKAEARRNRLLGEWAAGLLGKTGDDARAYALTVVTSDFDEPGDEDVFRKLAADLEGKA DEETIRAKMVELRATAREQIISEI ; ;MTTFDDRERAHEAKFAHDAELNFKAEARRNRLLGEWAAGLLGKTGDDARAYALTVVTSDFDEPGDEDVFRKLAADLEGKA DEETIRAKMVELRATAREQIISEI ; Z ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 UNK n 1 2 UNK n 1 3 UNK n 1 4 UNK n 1 5 UNK n 1 6 UNK n 1 7 UNK n 1 8 UNK n 1 9 UNK n 1 10 UNK n 1 11 UNK n 1 12 UNK n 1 13 UNK n 1 14 UNK n 1 15 UNK n 1 16 UNK n 1 17 UNK n 1 18 UNK n 1 19 UNK n 1 20 UNK n 2 1 UNK n 2 2 UNK n 2 3 UNK n 2 4 UNK n 2 5 UNK n 2 6 UNK n 2 7 UNK n 2 8 UNK n 2 9 UNK n 2 10 UNK n 2 11 UNK n 2 12 UNK n 2 13 UNK n 2 14 UNK n 2 15 UNK n 3 1 UNK n 3 2 UNK n 3 3 UNK n 3 4 UNK n 3 5 UNK n 3 6 UNK n 3 7 UNK n 3 8 UNK n 3 9 UNK n 3 10 UNK n 3 11 UNK n 3 12 UNK n 3 13 UNK n 3 14 UNK n 3 15 UNK n 3 16 UNK n 3 17 UNK n 3 18 UNK n 3 19 UNK n 4 1 MET n 4 2 GLY n 4 3 ILE n 4 4 GLN n 4 5 ALA n 4 6 ALA n 4 7 GLU n 4 8 ILE n 4 9 SER n 4 10 ALA n 4 11 ILE n 4 12 LEU n 4 13 LYS n 4 14 ASP n 4 15 GLN n 4 16 ILE n 4 17 LYS n 4 18 ASN n 4 19 PHE n 4 20 GLY n 4 21 GLN n 4 22 ASP n 4 23 ALA n 4 24 GLU n 4 25 VAL n 4 26 ALA n 4 27 GLU n 4 28 VAL n 4 29 GLY n 4 30 GLN n 4 31 VAL n 4 32 LEU n 4 33 SER n 4 34 VAL n 4 35 GLY n 4 36 ASP n 4 37 GLY n 4 38 ILE n 4 39 ALA n 4 40 ARG n 4 41 VAL n 4 42 TYR n 4 43 GLY n 4 44 LEU n 4 45 ASP n 4 46 LYS n 4 47 VAL n 4 48 GLN n 4 49 ALA n 4 50 GLY n 4 51 GLU n 4 52 MET n 4 53 VAL n 4 54 GLU n 4 55 PHE n 4 56 PRO n 4 57 GLY n 4 58 GLY n 4 59 ILE n 4 60 ARG n 4 61 GLY n 4 62 MET n 4 63 VAL n 4 64 LEU n 4 65 ASN n 4 66 LEU n 4 67 GLU n 4 68 THR n 4 69 ASP n 4 70 ASN n 4 71 VAL n 4 72 GLY n 4 73 VAL n 4 74 VAL n 4 75 ILE n 4 76 PHE n 4 77 GLY n 4 78 ASP n 4 79 ASP n 4 80 ARG n 4 81 ASP n 4 82 ILE n 4 83 LYS n 4 84 GLU n 4 85 GLY n 4 86 ASP n 4 87 THR n 4 88 VAL n 4 89 LYS n 4 90 ARG n 4 91 THR n 4 92 GLY n 4 93 ALA n 4 94 ILE n 4 95 VAL n 4 96 GLU n 4 97 VAL n 4 98 PRO n 4 99 ALA n 4 100 GLY n 4 101 LYS n 4 102 GLU n 4 103 LEU n 4 104 LEU n 4 105 GLY n 4 106 ARG n 4 107 VAL n 4 108 VAL n 4 109 ASP n 4 110 ALA n 4 111 LEU n 4 112 GLY n 4 113 ASN n 4 114 PRO n 4 115 ILE n 4 116 ASP n 4 117 GLY n 4 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'Paracoccus denitrificans' 266 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 5DN6 5DN6 ? 1 ? 1 2 PDB 5DN6 5DN6 ? 2 ? 1 3 PDB 5DN6 5DN6 ? 3 ? 1 4 UNP ATPA_PARDP A1B8N8 ? 4 ;MGIQAAEISAILKDQIKNFGQDAEVAEVGQVLSVGDGIARVYGLDKVQAGEMVEFPGGIRGMVLNLETDNVGVVIFGDDR DIKEGDTVKRTGAIVEVPAGKELLGRVVDALGNPIDGKGPLNASERRIADVKAPGIMPRKSVHEPMATGLKSVDAMIPVG RGQRELIIGDRQTGKTAIALDTILNQANYNGREADGMKTLHCIYVAVGQKRSTVAQLVKKLEETGAMAYTTVVAATASDP APMQYLAPYSATAMGEYFRDNGMDALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERSAKLNEANGAG SLTALPIIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFFQGIRPAVNTGLSVSRVGSAAQTKAMKSVAGPVKLELAQYRE MAAFAQFGSDLDAATQKLLNRGARLTELMKQPQYSPLTNAEIVIVIYAGTKGYLDGIPVRDVTKWEHGLLQYLRNQKADL LEDMTKNDRKVAGELEDAIKAALDGYAKTYA ; 1 5 UNP ATPB_PARDP A1B8P0 ? 5 ;MAEANGKITQVIGAVVDVQFDGQLPAILNALETENNGKRLVLEVAQHLGENTVRTIAMDATEGLVRGLPVKDTGGPIMVP VGDATLGRILNVVGEPVDEGGPVEATQTRAIHQQAPDFAAQATASEILVTGIKVIDLLAPYSKGGKIGLFGGAGVGKTVL IMELINNIAKVHSGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMVESGVIKPDDLSKSQVALVYGQMNEPPGARMRVALTGLTVAEQFR DATGTDVLFFVDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGAMQERITSTKNGSITSIQAVYVPADDLTDPAPAT TFAHLDATTVLSRAISELGIYPAVDPLDSNSRILDPAVVGEEHYQVARDVQGILQKYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTV ARARKIQRFLSQPFDVAKVFTGSDGVQVPLEDTIKSFKAVVAGEYDHLPEAAFYMVGGIEDVKAKAQRLAADAA ; 1 6 UNP ATPG_PARDP A1B8N9 ? 6 ;MPSLKDLKNRIGSVKNTRKITKAMQMVAAAKLRRAQEAAEAARPYADRMAAVMAGLTAAAAGSDMAPRLLAGTGEDRRHL LVVMTSERGLAGGFNSSIVKLARLRLQELQAQGKQVSILTVGKKGREQLKREYGDLFVNHVDLSEVKRIGYDNARAIADE ILDRFDNGEFDVATLFYNRFESVISQVPTARQVIPAVIEEGEAGASSLYDYEPDENAILNDLLPRSVATQVFAALLENAA SEQGARMTAMDNATRNAGDMIDRLTTVYNRSRQAAITKELIEIISGAEAL ; 1 7 UNP ATPD_PARDP A1B8N7 ? 7 ;MTVANSASISADIAGRYAQALFDLVRDSGGIDALSSQIDDLASAYDASQDLRDLTLSPLYDRQQQEAAVGALSERMGLSA ELANTLRLLARNRRLFTLPQFVAKLRNLIADAKGEVTADVVSAQALTDEQKARLADTLAAKSGKTVKLNARVDESLIGGM IVKLGSQMIDSSIRSKLASLQNAMKEVG ; 1 8 UNP ATPE_PARDP A1B8P1 ? 8 ;MADTMQFDLVSPERNLVSVPVREVRLPGADGDLTAMPGHAPAIVNLRPGLVTVVAGDGSETEFAVTGGFAEINNESVTLL AERGHPRAEMTQEVFNEMMAQARRRVEAAKERESAGEELVAAAVKLLADMEALGTHIGLDPNHANFPH ; 1 9 UNP A1B618_PARDP A1B618 ? 9 MENLGQLGQYLGAGLACVGMAGAAMGVGNVAGNYLAGALRNPSAAASQTATLFIGMAFAEALGIFSFLVALLLLFAV 1 10 PDB 5DN6 5DN6 ? 10 ? 1 11 PDB 5DN6 5DN6 ? 11 ? 1 12 PDB 5DN6 5DN6 ? 12 ? 1 13 UNP ATP6_PARDP A1B619 ? 12 ;MAEEEAGGLVFHPMDQFVIKPLFGEGPVNWYTPTNATLWMALAALAITALLVFGTRGRAIVPNRVQSIAELLYGMVHKMV EDVTGKDGLKYFPYVMTLFCFILFANFLGLLPKSFSPTSHIAVTAVLAVLVFAGVTVLGFVKNGAHFLGLFWVSSAPLAL RPVLAVIELISYFVRPVSHSIRLAGNIMAGHAVIKVFAAFAAVAAIAPVSVVAITAMYGLEVLVCLIQAYVFTILTCVYL KDALHPAH ; 1 14 PDB 5DN6 5DN6 ? 13 ? 1 15 UNP A1B602_PARDP A1B602 ? 14 ;MTTFDDRERAHEAKFAHDAELNFKAEARRNRLLGEWAAGLLGKTGDDARAYALTVVTSDFDEPGDEDVFRKLAADLEGKA DEETIRAKMVELRATAREQIISEI ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 5DN6 1 1 ? 20 ? 5DN6 1001 ? 1020 ? 1001 1020 2 2 5DN6 2 1 ? 15 ? 5DN6 1001 ? 1015 ? 1001 1015 3 3 5DN6 3 1 ? 19 ? 5DN6 1001 ? 1019 ? 1001 1019 4 4 5DN6 A 1 ? 511 ? 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PHE V 75 ? ALA S 44 PHE S 75 1 ? 32 HELX_P HELX_P162 AR9 LEU W 4 ? ASN W 41 ? LEU T 4 ASN T 41 1 ? 38 HELX_P HELX_P163 AS1 ALA W 44 ? PHE W 75 ? ALA T 44 PHE T 75 1 ? 32 HELX_P HELX_P164 AS2 LEU X 4 ? ASN X 41 ? LEU U 4 ASN U 41 1 ? 38 HELX_P HELX_P165 AS3 ALA X 44 ? PHE X 75 ? ALA U 44 PHE U 75 1 ? 32 HELX_P HELX_P166 AS4 UNK Y 2 ? UNK Y 78 ? UNK V 1002 UNK V 1078 1 ? 77 HELX_P HELX_P167 AS5 UNK Z 2 ? UNK Z 102 ? UNK W 1002 UNK W 1102 1 ? 101 HELX_P HELX_P168 AS6 UNK Z 105 ? UNK Z 123 ? UNK W 1105 UNK W 1123 1 ? 19 HELX_P HELX_P169 AS7 UNK AA 2 ? UNK AA 18 ? UNK X 1002 UNK X 1018 1 ? 17 HELX_P HELX_P170 AS8 UNK AA 22 ? UNK AA 35 ? UNK X 1022 UNK X 1035 1 ? 14 HELX_P HELX_P171 AS9 GLU AA 203 ? ALA AA 233 ? GLU X 1203 ALA X 1233 1 ? 31 HELX_P HELX_P172 AT1 TYR AA 253 ? HIS AA 280 ? TYR X 1253 HIS X 1280 1 ? 28 HELX_P HELX_P173 AT2 UNK BA 2 ? UNK BA 25 ? UNK Y 1002 UNK Y 1025 1 ? 24 HELX_P HELX_P174 AT3 UNK BA 27 ? UNK BA 53 ? UNK Y 1027 UNK Y 1053 1 ? 27 HELX_P HELX_P175 AT4 PHE CA 4 ? 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MG ? ? C ATP 600 C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.487 ? metalc11 metalc ? ? HA ATP . O2B ? ? ? 1_555 IA MG . MG ? ? C ATP 600 C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.188 ? metalc12 metalc ? ? JA ATP . O2G ? ? ? 1_555 KA MG . MG ? ? D ATP 600 D MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.960 ? metalc13 metalc ? ? LA ATP . O2G ? ? ? 1_555 MA MG . MG ? ? F ATP 600 F MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.220 ? metalc14 metalc ? ? LA ATP . O3G ? ? ? 1_555 MA MG . MG ? ? F ATP 600 F MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ASP 270 D . ? ASP 270 A ASP 271 D ? ASP 271 A 1 -5.16 2 ARG 363 D . ? ARG 363 A PRO 364 D ? PRO 364 A 1 2.33 3 ASP 270 E . ? ASP 270 B ASP 271 E ? ASP 271 B 1 -0.96 4 ARG 363 E . ? 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CA ASP 75 514 1 Y 1 Z LEU 75 ? CA LEU 76 515 1 Y 1 Z GLU 76 ? CA GLU 77 516 1 Y 1 Z GLY 77 ? CA GLY 78 517 1 Y 1 Z LYS 78 ? CA LYS 79 518 1 Y 1 Z ALA 79 ? CA ALA 80 519 1 Y 1 Z ASP 80 ? CA ASP 81 520 1 Y 1 Z GLU 81 ? CA GLU 82 # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'Medical Research Council (United Kingdom)' 'United Kingdom' MR/M009858/1 1 'Medical Research Council (United Kingdom)' 'United Kingdom' U105663150 2 'Medical Research Council (United Kingdom)' 'United Kingdom' U105184325 3 # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 15 "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" ATP 16 'MAGNESIUM ION' MG 17 "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ADP #