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Q7Z7C8 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 5FUR A 1 ? 339 ? P20226 1 ? 339 ? 1 339 2 2 5FUR B 1 ? 43 ? P52655 9 ? 51 ? 9 51 3 3 5FUR C 1 ? 47 ? P52655 330 ? 376 ? 330 376 4 4 5FUR D 1 ? 97 ? P52657 3 ? 99 ? 3 99 5 5 5FUR E 1 ? 89 ? 5FUR -1 ? 87 ? -1 87 6 6 5FUR F 1 ? 93 ? 5FUR 70 ? 162 ? 70 162 7 7 5FUR G 1 ? 1893 ? P21675 1 ? 1872 ? 1 1893 8 8 5FUR H 1 ? 349 ? Q15545 1 ? 349 ? 1 349 9 9 5FUR I 1 ? 1199 ? Q6P1X5 1 ? 1199 ? 1 1199 10 10 5FUR J 1 ? 677 ? P49848 1 ? 677 ? 1 677 11 10 5FUR K 1 ? 677 ? 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THR PHOSPHOTHREONINE # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2016-04-06 2 'Structure model' 1 1 2016-04-13 3 'Structure model' 1 2 2017-08-02 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Database references' 2 3 'Structure model' 'Data collection' # _pdbx_audit_revision_category.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal 3 _pdbx_audit_revision_category.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_category.category em_software # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 3 'Structure model' '_em_software.fitting_id' 2 3 'Structure model' '_em_software.image_processing_id' 3 3 'Structure model' '_em_software.name' # _pdbx_database_remark.id 700 _pdbx_database_remark.text ; SHEET DETERMINATION METHOD: DSSP THE SHEETS PRESENTED AS "AA" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN **-STRANDED BARREL THIS IS REPRESENTED BY A **-STRANDED SHEET IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL. ; # _pdbx_entry_details.entry_id 5FUR _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ;THE SUPER CORE PROMOTER SEQUENCE IS DESCRIBED IN JUVEN- GERSHON. ET AL. (2006) NATURE METHODS, 3, P.917-922. ; # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 5FUR _em_3d_fitting.ref_protocol ? _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 5FUR _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.num_particles 22050 _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size 1.32 _em_3d_reconstruction.resolution 8.5 _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.details 'SUBMISSION BASED ON EXPERIMENTAL DATA FROM EMDB EMD-3305. (DEPOSITION ID: 14001).' _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.resolution_method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name '10 MM HEPES, 10 MM MGCL2, 50 MM KCL, 3% TREHALOSE 1 MM DTT, 0.0125% NP-40' _em_buffer.pH 7.9 _em_buffer.details '10 MM HEPES, 10 MM MGCL2, 50 MM KCL, 3% TREHALOSE 1 MM DTT, 0.0125% NP-40' # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.name 'HUMAN TFIID-TFIIA COMPLEX BOUND TO SUPER CORE PROMOTER DNA' _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 5FUR _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.number_digital_images 1253 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.entry_id 5FUR _em_imaging.id 1 _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.date 2014-08-11 _em_imaging.temperature ? _em_imaging.nominal_defocus_min 2000 _em_imaging.nominal_defocus_max 4000 _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_magnification ? _em_imaging.calibrated_magnification 37879 _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.details ;THE CAMERA WAS OPERATED IN COUNTING MODE WITH A DOSE RATE OF 8 ELECTRONS PER PIXEL PER SECOND, WITH A TOTAL EXPOSURE TIME OF 10 SECONDS FRACTIONATED OVER 20 FRAMES. ; _em_imaging.specimen_holder_type . _em_imaging.specimen_holder_model . _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details CARBON _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type ? # _em_vitrification.entry_id 5FUR _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.details 'LIQUID ETHANE' _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 5FUR _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' # _em_single_particle_entity.entry_id 5FUR _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 N G GLY 679 ? ? 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