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_entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 1263 HCoV-HKU1 ? 'S, 3' ? 'isolate N5' ? ? ? ? 'Human coronavirus HKU1 (isolate N5)' 443241 ? ? ? ? ? ? ? Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? 'FreeStyle 293F' ? ? ? ? ? plasmid ? ? ? pVRC-8400 ? ? 1 2 sample 'Biological sequence' 1264 1299 ? ? wac ? ? ? ? ? ? 'Enterobacteria phage T4' 10665 ? ? ? ? ? ? ? Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? 'FreeStyle 293F' ? ? ? ? ? plasmid ? ? ? pVRC-8400 ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP SPIKE_CVHN5 Q0ZME7 ? 1 ;VIGDFNCTNSFINDYNKTIPRISEDVVDVSLGLGTYYVLNRVYLNTTLLFTGYFPKSGANFRDLALKGSIYLSTLWYKPP FLSDFNNGIFSKVKNTKLYVNNTLYSEFSTIVIGSVFVNTSYTIVVQPHNGILEITACQYTMCEYPHTVCKSKGSIRNES WHIDSSEPLCLFKKNFTYNVSADWLYFHFYQERGVFYAYYADVGMPTTFLFSLYLGTILSHYYVMPLTCNAISSNTDNET LEYWVTPLSRRQYLLNFDEHGVITNAVDCSSSFLSEIQCKTQSFAPNTGVYDLSGFTVKPVATVYRRIPNLPDCDIDNWL NNVSVPSPLNWERRIFSNCNFNLSTLLRLVHVDSFSCNNLDKSKIFGSCFNSITVDKFAIPNRRRDDLQLGSSGFLQSSN YKIDISSSSCQLYYSLPLVNVTINNFNPSSWNRRYGFGSFNLSSYDVVYSDHCFSVNSDFCPCADPSVVNSCAKSKPPSA ICPAGTKYRHCDLDTTLYVKNWCRCSCLPDPISTYSPNTCPQKKVVVGIGEHCPGLGINEEKCGTQLNHSSCFCSPDAFL GWSFDSCISNNRCNIFSNFIFNGINSGTTCSNDLLYSNTEISTGVCVNYDLYGITGQGIFKEVSAAYYNNWQNLLYDSNG NIIGFKDFLTNKTYTILPCYSGRVSAAFYQNSSSPALLYRNLKCSYVLNNISFISQPFYFDSYLGCVLNAVNLTSYSVSS CDLRMGSGFCIDYALPSSRRKRRGISSPYRFVTFEPFNVSFVNDSVETVGGLFEIQIPTNFTIAGHEEFIQTSSPKVTID CSAFVCSNYAACHDLLSEYGTFCDNINSILNEVNDLLDITQLQVANALMQGVTLSSNLNTNLHSDVDNIDFKSLLGCLGS QCGSSSRSLLEDLLFNKVKLSDVGFVEAYNNCTGGSEIRDLLCVQSFNGIKVLPPILSETQISGYTTAATVAAMFPPWSA AAGVPFSLNVQYRINGLGVTMDVLNKNQKLIANAFNKALLSIQNGFTATNSALAKIQSVVNANAQALNSLLQQLFNKFGA ISSSLQEILSRLDNLEAQVQIDRLINGRLTALNAYVSQQLSDITLIKAGASRAIEKVNECVKSQSPRINFCGNGNHILSL VQNAPYGLLFIHFSYKPTSFKTVLVSPGLCLSGDRGIAPKQGYFIKQNDSWMFTGSSYYYPEPISDKNVVFMNSCSVNFT KAPFIYLNNSIPNLSDFEAELSLWFKNHTSIAPNLTFNSHINATFLDLYYEMNVIQESIKSLN ; 14 2 UNP WAC_BPT4 P10104 ? 1 GYIPEAPRDGQAYVRKDGEWVFLSTFL 458 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 5I08 A 1 ? 1263 ? 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UNP Q0ZME7 ARG 755 'engineered mutation' 755 4 1 5I08 SER A 743 ? UNP Q0ZME7 ARG 756 'engineered mutation' 756 5 1 5I08 GLY A 1264 ? UNP Q0ZME7 ? ? linker 1277 6 1 5I08 SER A 1265 ? UNP Q0ZME7 ? ? linker 1278 7 2 5I08 LEU A 1287 ? UNP P10104 PHE 479 conflict 1300 8 2 5I08 GLY A 1293 ? UNP P10104 ? ? 'expression tag' 1306 9 2 5I08 LEU A 1294 ? UNP P10104 ? ? 'expression tag' 1307 10 2 5I08 GLU A 1295 ? UNP P10104 ? ? 'expression tag' 1308 11 2 5I08 VAL A 1296 ? UNP P10104 ? ? 'expression tag' 1309 12 2 5I08 LEU A 1297 ? UNP P10104 ? ? 'expression tag' 1310 13 2 5I08 PHE A 1298 ? UNP P10104 ? ? 'expression tag' 1311 14 2 5I08 GLN A 1299 ? UNP P10104 ? ? 'expression tag' 1312 15 3 5I08 GLY B 739 ? UNP Q0ZME7 ARG 752 'engineered mutation' 752 16 3 5I08 GLY B 740 ? UNP Q0ZME7 ARG 753 'engineered mutation' 753 17 3 5I08 SER B 741 ? UNP Q0ZME7 LYS 754 'engineered mutation' 754 18 3 5I08 GLY B 742 ? UNP Q0ZME7 ARG 755 'engineered mutation' 755 19 3 5I08 SER B 743 ? UNP Q0ZME7 ARG 756 'engineered mutation' 756 20 3 5I08 GLY B 1264 ? UNP Q0ZME7 ? ? linker 1277 21 3 5I08 SER B 1265 ? UNP Q0ZME7 ? ? linker 1278 22 4 5I08 LEU B 1287 ? UNP P10104 PHE 479 conflict 1300 23 4 5I08 GLY B 1293 ? UNP P10104 ? ? 'expression tag' 1306 24 4 5I08 LEU B 1294 ? UNP P10104 ? ? 'expression tag' 1307 25 4 5I08 GLU B 1295 ? UNP P10104 ? ? 'expression tag' 1308 26 4 5I08 VAL B 1296 ? UNP P10104 ? ? 'expression tag' 1309 27 4 5I08 LEU B 1297 ? UNP P10104 ? ? 'expression tag' 1310 28 4 5I08 PHE B 1298 ? UNP P10104 ? ? 'expression tag' 1311 29 4 5I08 GLN B 1299 ? UNP P10104 ? ? 'expression tag' 1312 30 5 5I08 GLY C 739 ? UNP Q0ZME7 ARG 752 'engineered mutation' 752 31 5 5I08 GLY C 740 ? UNP Q0ZME7 ARG 753 'engineered mutation' 753 32 5 5I08 SER C 741 ? UNP Q0ZME7 LYS 754 'engineered mutation' 754 33 5 5I08 GLY C 742 ? UNP Q0ZME7 ARG 755 'engineered mutation' 755 34 5 5I08 SER C 743 ? UNP Q0ZME7 ARG 756 'engineered mutation' 756 35 5 5I08 GLY C 1264 ? UNP Q0ZME7 ? ? linker 1277 36 5 5I08 SER C 1265 ? UNP Q0ZME7 ? ? linker 1278 37 6 5I08 LEU C 1287 ? UNP P10104 PHE 479 conflict 1300 38 6 5I08 GLY C 1293 ? UNP P10104 ? ? 'expression tag' 1306 39 6 5I08 LEU C 1294 ? UNP P10104 ? ? 'expression tag' 1307 40 6 5I08 GLU C 1295 ? UNP P10104 ? ? 'expression tag' 1308 41 6 5I08 VAL C 1296 ? UNP P10104 ? ? 'expression tag' 1309 42 6 5I08 LEU C 1297 ? UNP P10104 ? ? 'expression tag' 1310 43 6 5I08 PHE C 1298 ? UNP P10104 ? ? 'expression tag' 1311 44 6 5I08 GLN C 1299 ? UNP P10104 ? ? 'expression tag' 1312 45 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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C N N 1 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LEU A 75 ? LYS A 78 ? LEU A 88 LYS A 91 5 ? 4 HELX_P HELX_P2 AA2 ASN A 235 ? GLU A 239 ? ASN A 248 GLU A 252 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 AA3 ASP A 268 ? SER A 271 ? ASP A 281 SER A 284 5 ? 4 HELX_P HELX_P4 AA4 SER A 272 ? GLN A 282 ? SER A 285 GLN A 295 1 ? 11 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP A 315 ? ASN A 321 ? ASP A 328 ASN A 334 1 ? 7 HELX_P HELX_P6 AA6 PRO A 328 ? TRP A 331 ? 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ASN C 1067 ASN C 1111 1 ? 45 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf1 disulf ? ? 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C CYS 1113 C CYS 1124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.102 ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 7 ? AA3 ? 7 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 6 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 5 ? AA8 ? 7 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 5 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 3 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 7 ? AB9 ? 3 ? AC1 ? 6 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 5 ? AC4 ? 7 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 5 ? AC7 ? 2 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 2 ? AD1 ? 3 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 2 ? AD4 ? 7 ? AD5 ? 3 ? AD6 ? 6 ? AD7 ? 2 ? AD8 ? 5 ? AD9 ? 2 ? AE1 ? 5 ? AE2 ? 2 ? AE3 ? 2 ? AE4 ? 2 ? AE5 ? 3 ? 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C . n # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 22100 ? 1 MORE -56 ? 1 'SSA (A^2)' 133900 ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2016-03-02 2 'Structure model' 1 1 2016-03-09 3 'Structure model' 1 2 2016-04-13 4 'Structure model' 1 3 2019-12-18 5 'Structure model' 1 4 2020-04-22 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? 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# _em_3d_reconstruction.entry_id 5I08 _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm 'BACK PROJECTION' _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 31435 _em_3d_reconstruction.resolution 4.04 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 8.0 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.name 'HKU1 spike with attached foldon domain and mutated furin-cleavage site' _em_entity_assembly.source RECOMBINANT _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.entity_id_list 1 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 5I08 _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.dimension_height ? _em_image_scans.dimension_width ? _em_image_scans.frames_per_image 50 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.used_frames_per_image ? _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.details ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.citation_id ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 5I08 _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification 22500 _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? 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C GLN 1299 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 200 mM NaCl 'sodium chloride' 1 2 2 mM C4H11NO3 Tris # _em_crystal_formation.id 1 _em_crystal_formation.specimen_id 1 _em_crystal_formation.atmosphere ? _em_crystal_formation.details ? _em_crystal_formation.instrument ? _em_crystal_formation.lipid_mixture ? _em_crystal_formation.lipid_protein_ratio ? _em_crystal_formation.temperature ? _em_crystal_formation.time ? _em_crystal_formation.time_unit ? # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.units MEGADALTONS _em_entity_assembly_molwt.value 0.42 # _em_entity_assembly_naturalsource.id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 443241 _em_entity_assembly_naturalsource.organ . _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Human coronavirus HKU1 (isolate N5)' _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_entity_assembly_recombinant.id 1 _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_recombinant.cell 'FreeStyle 293F' _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 9606 _em_entity_assembly_recombinant.organism 'Homo sapiens' _em_entity_assembly_recombinant.plasmid pVRC8400 _em_entity_assembly_recombinant.strain ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 57 _em_image_recording.average_exposure_time 10 _em_image_recording.details 'Images were collected using Legionon and processed using Appion.' _em_image_recording.detector_mode COUNTING _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 1 _em_image_recording.num_real_images 1049 # _em_imaging_optics.id 1 _em_imaging_optics.imaging_id 1 _em_imaging_optics.chr_aberration_corrector ? _em_imaging_optics.energyfilter_lower ? _em_imaging_optics.energyfilter_name ? _em_imaging_optics.energyfilter_upper ? _em_imaging_optics.phase_plate ? _em_imaging_optics.sph_aberration_corrector ? # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details ;2188 particles were selected from a subset of the data using DoG Picker. These particles were used to generate a 3D model from which back projections were derived. Back projection images were used as templates for picking particles from the entire dataset using FindEM. ; _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 39164 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? 'DoG Picker' ? 1 ? ? 2 'PARTICLE SELECTION' ? FindEM ? 1 ? ? 3 'IMAGE ACQUISITION' ? Leginon ? ? ? 1 4 MASKING ? ? ? ? ? ? 5 'CTF CORRECTION' ? CTFFIND3 ? 1 ? ? 6 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL FITTING' ? MODELLER ? ? 1 ? 9 'MODEL FITTING' ? Rosetta 2015.19 ? 1 ? 10 'MODEL FITTING' ? Coot 0.8.2 ? 1 ? 11 OTHER ? ? ? ? ? ? 12 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 1.3 1 ? ? 13 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? 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