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_citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Science _citation.journal_id_ASTM SCIEAS _citation.journal_id_CSD 0038 _citation.journal_id_ISSN 1095-9203 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 352 _citation.language ? _citation.page_first 1330 _citation.page_last 1333 _citation.title 'Structural basis of transcription activation.' _citation.year 2016 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1126/science.aaf4417 _citation.pdbx_database_id_PubMed 27284196 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Feng, Y.' 1 ? primary 'Zhang, Y.' 2 ? primary 'Ebright, R.H.' 3 ? # 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_entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'DNA-directed RNA polymerase subunit alpha' 35056.164 4 2.7.7.6 ? ? ? 2 polymer nat 'DNA-directed RNA polymerase subunit beta' 125436.539 2 2.7.7.6 ? ? ? 3 polymer nat ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; 170997.391 2 2.7.7.6 ? ? ? 4 polymer nat 'DNA-directed RNA polymerase subunit omega' 11533.316 2 2.7.7.6 ? ? ? 5 polymer man 'RNA polymerase sigma factor SigA' 50769.398 2 ? ? ? ? 6 polymer man 'Transcriptional regulator, Crp family' 24344.762 4 ? ? ? ? 7 polymer syn 'DNA (72-MER)' 22234.168 2 ? ? ? ? 8 polymer syn 'DNA (72-MER)' 22341.262 2 ? ? ? ? 9 polymer syn ;RNA (5'-R(*UP*CP*GP*A)-3') ; 1240.802 2 ? ? ? ? 10 non-polymer syn 'ZINC ION' 65.409 4 ? ? ? ? 11 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 2 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'RNAP subunit alpha,RNA polymerase subunit alpha,Transcriptase subunit alpha' 2 'RNAP subunit beta,RNA polymerase subunit beta,Transcriptase subunit beta' 3 ;RNAP subunit beta',RNA polymerase subunit beta',Transcriptase subunit beta' ; 4 'RNAP omega subunit,RNA polymerase omega subunit,Transcriptase subunit omega' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MLDSKLKAPVFTVRTQGREYGEFVLEPLERGFGVTLGNPLRRILLSSIPGTAVTSVYIEDVLHEFSTIPGVKEDVVEIIL NLKELVVRFLNPSLQTVTLLLKAEGPKEVKARDFLPVADVEIMNPDLHIATLEEGGRLNMEVRVDRGVGYVPAEKHGIKD RINAIPVDAVFSPVRRVAFQVEDTRLGQRTDLDKLTLRIWTDGSVTPLEALNQAVEILREHLTYFSNPQAAAVAAPEEAK EPEAPPEQEEELDLPLEELGLSTRVLHSLKEEGIESVRALLALNLKDLKNIPGIGERSLEEIKEALEKKGFTLKE ; ;MLDSKLKAPVFTVRTQGREYGEFVLEPLERGFGVTLGNPLRRILLSSIPGTAVTSVYIEDVLHEFSTIPGVKEDVVEIIL 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;MAEPGIDKLFGMVDSKYRLTVVVAKRAQQLLRHGFKNTVLEPEERPKMQTLEGLFDDPNAVTWAMKELLTGRLVFGENLV PEDRLQKEMERLYPVEREE ; ;MAEPGIDKLFGMVDSKYRLTVVVAKRAQQLLRHGFKNTVLEPEERPKMQTLEGLFDDPNAVTWAMKELLTGRLVFGENLV PEDRLQKEMERLYPVEREE ; E,P ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMKKSKRKNAQAQEAQETEVLVQEEAEELPEFPEGEPDPDLEDPDLTLEDDLLDLPEEGEG LDLEEEEEDLPIPKISTSDPVRQYLHEIGQVPLLTLEEEVELARKVEEGMEAIKKLSEITGLDPDLIREVVRAKILGSAR VRHIPGLKETLDPKTVEEIDQKLKSLPKEHKRYLHIAREGEAARQHLIEANLRLVVSIAKKYTGRGLSFLDLIQEGNQGL IRAVEKFEYKRRFKFSTYATWWIRQAINRAIADQARTIRIPVHMVETINKLSRTARQLQQELGREPTYEEIAEAMGPGWD AKRVEETLKIAQEPVSLETPIGDEKDSFYGDFIPDEHLPSPVDAATQSLLSEELEKALSKLSEREAMVLKLRKGLIDGRE HTLEEVGAFFGVTRERIRQIENKALRKLKYHESRTRKLRDFLD ; ;MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMKKSKRKNAQAQEAQETEVLVQEEAEELPEFPEGEPDPDLEDPDLTLEDDLLDLPEEGEG LDLEEEEEDLPIPKISTSDPVRQYLHEIGQVPLLTLEEEVELARKVEEGMEAIKKLSEITGLDPDLIREVVRAKILGSAR VRHIPGLKETLDPKTVEEIDQKLKSLPKEHKRYLHIAREGEAARQHLIEANLRLVVSIAKKYTGRGLSFLDLIQEGNQGL IRAVEKFEYKRRFKFSTYATWWIRQAINRAIADQARTIRIPVHMVETINKLSRTARQLQQELGREPTYEEIAEAMGPGWD AKRVEETLKIAQEPVSLETPIGDEKDSFYGDFIPDEHLPSPVDAATQSLLSEELEKALSKLSEREAMVLKLRKGLIDGRE HTLEEVGAFFGVTRERIRQIENKALRKLKYHESRTRKLRDFLD ; F,Q ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMKRFARKETIYLRGEEARTLYRLEEGLVRVVELLPDGRLITLRHVLPGDYFGEEALEGKA YRYTAEAMTEAVVQGLEPRAMDHEALHRVARNLARQMRRVQAYEAHLQTGELRARIARYLLFLADTPLSARDRQGIYVTV SHEEIADATASIRESVSKVLADLRREGLIATAYRRVYLLDLAALEREAGSALEAA ; ;MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMKRFARKETIYLRGEEARTLYRLEEGLVRVVELLPDGRLITLRHVLPGDYFGEEALEGKA YRYTAEAMTEAVVQGLEPRAMDHEALHRVARNLARQMRRVQAYEAHLQTGELRARIARYLLFLADTPLSARDRQGIYVTV SHEEIADATASIRESVSKVLADLRREGLIATAYRRVYLLDLAALEREAGSALEAA ; G,H,R,S ? 7 polydeoxyribonucleotide no no ;(DT)(DG)(DG)(DG)(DC)(DC)(DC)(DT)(DT)(DG)(DT)(DG)(DA)(DG)(DC)(DC)(DA)(DC)(DC)(DT) (DC)(DA)(DC)(DA)(DG)(DT)(DC)(DA)(DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DC)(DG)(DT)(DC)(DC)(DG)(DT) (DT)(DG)(DC)(DC)(DG)(DT)(DA)(DT)(DA)(DA)(DT)(DG)(DG)(DG)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT) (DC)(DA)(DC)(DG)(DG)(DA)(DT)(DG)(DC)(DA)(DG)(DG) ; TGGGCCCTTGTGAGCCACCTCACAGTCAAGGCCCGTCCGTTGCCGTATAATGGGAGCTGTCACGGATGCAGG I,T ? 8 polydeoxyribonucleotide no no ;(DC)(DC)(DT)(DG)(DC)(DA)(DT)(DC)(DC)(DG)(DT)(DG)(DA)(DG)(DT)(DC)(DG)(DA)(DG)(DG) (DG)(DT)(DA)(DA)(DT)(DA)(DA)(DC)(DG)(DG)(DC)(DA)(DA)(DC)(DG)(DG)(DA)(DC)(DG)(DG) (DG)(DC)(DC)(DT)(DT)(DG)(DA)(DC)(DT)(DG)(DT)(DG)(DA)(DG)(DG)(DT)(DG)(DG)(DC)(DT) (DC)(DA)(DC)(DA)(DA)(DG)(DG)(DG)(DC)(DC)(DC)(DA) ; CCTGCATCCGTGAGTCGAGGGTAATAACGGCAACGGACGGGCCTTGACTGTGAGGTGGCTCACAAGGGCCCA J,U ? 9 polyribonucleotide no no UCGA UCGA K,V ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 LEU n 1 3 ASP n 1 4 SER n 1 5 LYS n 1 6 LEU n 1 7 LYS n 1 8 ALA n 1 9 PRO n 1 10 VAL n 1 11 PHE n 1 12 THR n 1 13 VAL n 1 14 ARG n 1 15 THR n 1 16 GLN n 1 17 GLY n 1 18 ARG n 1 19 GLU n 1 20 TYR n 1 21 GLY n 1 22 GLU n 1 23 PHE n 1 24 VAL n 1 25 LEU n 1 26 GLU n 1 27 PRO n 1 28 LEU n 1 29 GLU n 1 30 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'Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579)' 300852 ? ? 'HB8 / ATCC 27634 / DSM 579' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 1 1524 ? 'Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579)' 300852 ? ? 'HB8 / ATCC 27634 / DSM 579' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 1 sample 1 99 ? 'Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579)' 300852 ? ? 'HB8 / ATCC 27634 / DSM 579' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _pdbx_entity_src_syn.entity_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id _pdbx_entity_src_syn.details 7 1 sample 1 72 'Thermus thermophilus' ? 274 ? 8 1 sample 1 72 'Thermus thermophilus' ? 274 ? 9 1 sample 1 4 'Thermus thermophilus' ? 274 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP RPOA_THET8 Q5SHR6 ? 1 ;MLDSKLKAPVFTVRTQGREYGEFVLEPLERGFGVTLGNPLRRILLSSIPGTAVTSVYIEDVLHEFSTIPGVKEDVVEIIL NLKELVVRFLNPSLQTVTLLLKAEGPKEVKARDFLPVADVEIMNPDLHIATLEEGGRLNMEVRVDRGVGYVPAEKHGIKD RINAIPVDAVFSPVRRVAFQVEDTRLGQRTDLDKLTLRIWTDGSVTPLEALNQAVEILREHLTYFSNPQAAAVAAPEEAK EPEAPPEQEEELDLPLEELGLSTRVLHSLKEEGIESVRALLALNLKDLKNIPGIGERSLEEIKEALEKKGFTLKE ; 1 2 UNP RPOB_THET8 Q8RQE9 ? 2 ;MEIKRFGRIREVIPLPPLTEIQVESYRRALQADVPPEKRENVGIQAAFRETFPIEEEDKGKGGLVLDFLEYRLGEPPFPQ DECREKDLTYQAPLYARLQLIHKDTGLIKEDEVFLGHIPLMTEDGSFIINGADRVIVSQIHRSPGVYFTPDPARPGRYIA SIIPLPKRGPWIDLEVEPNGVVSMKVNKRKFPLVLLLRVLGYDQETLARELGAYGELVQGLMDESVFAMRPEEALIRLFT LLRPGDPPKRDKAVAYVYGLIADPRRYDLGEAGRYKAEEKLGIRLSGRTLARFEDGEFKDEVFLPTLRYLFALTAGVPGH EVDDIDHLGNRRIRTVGELMTDQFRVGLARLARGVRERMLMGSEDSLTPAKLVNSRPLEAAIREFFSRSQLSQFKDETNP LSSLRHKRRISALGPGGLTRERAGFDVRDVHRTHYGRICPVETPEGANIGLITSLAAYARVDELGFIRTPYRRVVGGVVT DEVVYMTATEEDRYTIAQANTPLEGNRIAAERVVARRKGEPVIVSPEEVEFMDVSPKQVFSVNTNLIPFLEHDDANRALM GSNMQTQAVPLIRAQAPVVMTGLEERVVRDSLAALYAEEDGEVAKVDGNRIVVRYEDGRLVEYPLRRFYRSNQGTALDQR PRVVVGQRVRKGDLLADGPASENGFLALGQNVLVAIMPFDGYNFEDAIVISEELLKRDFYTSIHIERYEIEARDTKLGPE RITRDIPHLSEAALRDLDEEGVVRIGAEVKPGDILVGRTSFKGESEPTPEERLLRSIFGEKARDVKDTSLRVPPGEGGIV VRTVRLRRGDPGVELKPGVREVVRVYVAQKRKLQVGDKLANRHGNKGVVAKILPVEDMPHLPDGTPVDVILNPLGVPSRM NLGQILETHLGLAGYFLGQRYISPIFDGAKEPEIKELLAQAFEVYFGKRKGEGFGVDKREVEVLRRAEKLGLVTPGKTPE EQLKELFLQGKVVLYDGRTGEPIEGPIVVGQMFIMKLYHMVEDKMHARSTGPYSLITQQPLGGKAQFGGQRFGEMEVWAL EAYGAAHTLQEMLTLKSDDIEGRNAAYEAIIKGEDVPEPSVPESFRVLVKELQALALDVQTLDEKDNPVDIFEGLASKR ; 1 3 UNP RPOC_THET8 Q8RQE8 ? 3 ;MKKEVRKVRIALASPEKIRSWSYGEVEKPETINYRTLKPERDGLFDERIFGPIKDYECACGKYKRQRFEGKVCERCGVEV TKSIVRRYRMGHIELATPAAHIWFVKDVPSKIGTLLDLSATELEQVLYFSKYIVLDPKGAILNGVPVEKRQLLTDEEYRE LRYGKQETYPLPPGVDALVKDGEEVVKGQELAPGVVSRLDGVALYRFPRRVRVEYVKKERAGLRLPLAAWVEKEAYKPGE ILAELPEPYLFRAEEEGVVELKELEEGAFLVLRREDEPVATYFLPVGMTPLVVHGEIVEKGQPLAEAKGLLRMPRQVRAA QVEAEEEGETVYLTLFLEWTEPKDYRVQPHMNVVVPEGARVEAGDKIVAAIDPEEEVIAEAEGVVHLHEPASILVVKARV YPFEDDVEVSTGDRVAPGDVLADGGKVKSDVYGRVEVDLVRNVVRVVESYDIDARMGAEAIQQLLKELDLEALEKELLEE MKHPSRARRAKARKRLEVVRAFLDSGNRPEWMILEAVPVLPPDLRPMVQVDGGRFATSDLNDLYRRLINRNNRLKKLLAQ GAPEIIIRNEKRMLQEAVDALLDNGRRGAPVTNPGSDRPLRSLTDILSGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPQLKLH QCGLPKRMALELFKPFLLKKMEEKGIAPNVKAARRMLERQRDIKDEVWDALEEVIHGKVVLLNRAPTLHRLGIQAFQPVL VEGQSIQLHPLVCEAFNADFDGDQMAVHVPLSSFAQAEARIQMLSAHNLLSPASGEPLAKPSRDIILGLYYITQVRKEKK GAGLEFATPEEALAAHERGEVALNAPIKVAGRETSVGRLKYVFANPDEALLAVAHGIVDLQDVVTVRYMGKRLETSPGRI LFARIVAEAVEDEKVAWELIQLDVPQEKNSLKDLVYQAFLRLGMEKTARLLDALKYYGFTFSTTSGITIGIDDAVIPEEK KQYLEEADRKLLQIEQAYEMGFLTDRERYDQILQLWTETTEKVTQAVFKNFEENYPFNPLYVMAQSGARGNPQQIRQLCG LRGLMQKPSGETFEVPVRSSFREGLTVLEYFISSHGARKGGADTALRTADSGYLTRKLVDVTHEIVVREADCGTTNYISV PLFQPDEVTRSLRLRKRADIEAGLYGRVLAREVEVLGVRLEEGRYLSMDDVHLLIKAAEAGEIQEVPVRSPLTCQTRYGV CQKCYGYDLSMARPVSIGEAVGIVAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGAADITQGLPRVIELFEARRPKAKAVISEIDGV VRIEETEEKLSVFVESEGFSKEYKLPKEARLLVKDGDYVEAGQPLTRGAIDPHQLLEAKGPEAVERYLVEEIQKVYRAQG VKLHDKHIEIVVRQMMKYVEVTDPGDSRLLEGQVLEKWDVEALNERLIAEGKTPVAWKPLLMGVTKSALSTKSWLSAASF QNTTHVLTEAAIAGKKDELIGLKENVILGRLIPAGTGSDFVRFTQVVDQKTLKAIEEARKEAVEAKERPAARRGVKREQP GKQA ; 1 4 UNP RPOZ_THET8 Q8RQE7 ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog245 hydrog ? ? T DC 43 N4 ? ? ? 1_555 U DG 30 O6 ? ? T DC -15 U DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog246 hydrog ? ? T DC 43 O2 ? ? ? 1_555 U DG 30 N2 ? ? T DC -15 U DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog247 hydrog ? ? T DC 44 N3 ? ? ? 1_555 U DG 29 N1 ? ? T DC -14 U DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog248 hydrog ? ? T DC 44 N4 ? ? ? 1_555 U DG 29 O6 ? ? T DC -14 U DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog249 hydrog ? ? T DC 44 O2 ? ? ? 1_555 U DG 29 N2 ? ? T DC -14 U DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog250 hydrog ? ? T DG 45 N1 ? ? ? 1_555 U DC 28 N3 ? ? T DG -13 U DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog251 hydrog ? ? T DG 45 N2 ? ? ? 1_555 U DC 28 O2 ? ? T DG -13 U DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog252 hydrog ? ? T DG 45 O6 ? ? ? 1_555 U DC 28 N4 ? ? T DG -13 U DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog253 hydrog ? ? T DT 46 N3 ? ? ? 1_555 U DA 27 N1 ? ? T DT -12 U DA 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog254 hydrog ? ? T DT 46 O4 ? ? ? 1_555 U DA 27 N6 ? ? T DT -12 U DA 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog255 hydrog ? ? T DT 60 N3 ? ? ? 1_555 U DA 13 N1 ? ? T DT 2 U DA -2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog256 hydrog ? ? T DT 60 O4 ? ? ? 1_555 U DA 13 N6 ? ? T DT 2 U DA -2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog257 hydrog ? ? T DC 61 N3 ? ? ? 1_555 U DG 12 N1 ? ? T DC 3 U DG -3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog258 hydrog ? ? T DC 61 N4 ? ? ? 1_555 U DG 12 O6 ? ? T DC 3 U DG -3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog259 hydrog ? ? T DC 61 O2 ? ? ? 1_555 U DG 12 N2 ? ? T DC 3 U DG -3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog260 hydrog ? ? T DA 62 N1 ? ? ? 1_555 U DT 11 N3 ? ? T DA 4 U DT -4 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DA-DT PAIR' ? ? ? hydrog261 hydrog ? ? T DC 63 N3 ? ? ? 1_555 U DG 10 N1 ? ? T DC 5 U DG -5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog262 hydrog ? ? T DC 63 N4 ? ? ? 1_555 U DG 10 O6 ? ? T DC 5 U DG -5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog263 hydrog ? ? T DC 63 O2 ? ? ? 1_555 U DG 10 N2 ? ? T DC 5 U DG -5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog264 hydrog ? ? T DG 64 N1 ? ? ? 1_555 U DC 9 N3 ? ? T DG 6 U DC -6 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog265 hydrog ? ? T DG 65 N1 ? ? ? 1_555 U DC 8 N3 ? ? T DG 7 U DC -7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog266 hydrog ? ? T DG 65 N2 ? ? ? 1_555 U DC 8 O2 ? ? T DG 7 U DC -7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog267 hydrog ? ? T DG 65 O6 ? ? ? 1_555 U DC 8 N4 ? ? T DG 7 U DC -7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog268 hydrog ? ? T DA 66 N1 ? ? ? 1_555 U DT 7 N3 ? ? T DA 8 U DT -8 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DA-DT PAIR' ? ? ? hydrog269 hydrog ? ? T DT 67 N3 ? ? ? 1_555 U DA 6 N1 ? ? T DT 9 U DA -9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog270 hydrog ? ? T DT 67 O4 ? ? ? 1_555 U DA 6 N6 ? ? T DT 9 U DA -9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog271 hydrog ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLU 26 A . ? GLU 26 A PRO 27 A ? PRO 27 A 1 -4.51 2 GLU 26 B . ? GLU 26 B PRO 27 B ? PRO 27 B 1 -5.93 3 PHE 52 C . ? PHE 52 C PRO 53 C ? PRO 53 C 1 0.60 4 VAL 108 D . ? VAL 108 D PRO 109 D ? 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parallel AB9 4 5 ? anti-parallel AB9 5 6 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC6 4 5 ? parallel AC6 5 6 ? anti-parallel AC6 6 7 ? parallel AC6 7 8 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD1 4 5 ? anti-parallel AD1 5 6 ? parallel AD1 6 7 ? anti-parallel AD1 7 8 ? parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD4 1 2 ? parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD7 3 4 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AD9 3 4 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE2 3 4 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? parallel AE5 1 2 ? parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE6 1 2 ? parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE7 1 2 ? parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF2 2 3 ? anti-parallel AF2 3 4 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF6 2 3 ? anti-parallel AF6 3 4 ? anti-parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF7 2 3 ? anti-parallel AF7 3 4 ? anti-parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF8 2 3 ? anti-parallel AF8 3 4 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AF9 2 3 ? anti-parallel AF9 3 4 ? anti-parallel AG1 1 2 ? anti-parallel AG1 2 3 ? anti-parallel AG1 3 4 ? anti-parallel AG2 1 2 ? anti-parallel AG2 2 3 ? anti-parallel AG2 3 4 ? anti-parallel AG3 1 2 ? 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U . n U 8 71 DC 71 56 ? ? ? U . n U 8 72 DA 72 57 ? ? ? U . n V 9 1 U 1 1 1 U U V . n V 9 2 C 2 2 2 C C V . n V 9 3 G 3 3 3 G G V . n V 9 4 A 4 4 4 A A V . n # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code W 10 ZN 1 2001 2001 ZN ZN D . X 10 ZN 1 2002 2002 ZN ZN D . Y 11 MG 1 2003 2003 MG MG D . Z 10 ZN 1 2001 2001 ZN ZN O . AA 10 ZN 1 2002 2002 ZN ZN O . BA 11 MG 1 2003 2003 MG MG O . # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA undecameric 11 2 author_and_software_defined_assembly PISA undecameric 11 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,W,X,Y 2 1 L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,Z,AA,BA # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 72170 ? 1 MORE -297 ? 1 'SSA (A^2)' 169120 ? 2 'ABSA (A^2)' 71970 ? 2 MORE -300 ? 2 'SSA (A^2)' 169120 ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 SG ? 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D ZN 2001 ? 1_555 SG ? D CYS 1204 ? D CYS 1204 ? 1_555 93.3 ? 28 SG ? O CYS 58 ? O CYS 58 ? 1_555 ZN ? AA ZN . ? O ZN 2002 ? 1_555 SG ? O CYS 60 ? O CYS 60 ? 1_555 111.1 ? 29 SG ? O CYS 58 ? O CYS 58 ? 1_555 ZN ? AA ZN . ? O ZN 2002 ? 1_555 SG ? O CYS 73 ? O CYS 73 ? 1_555 119.8 ? 30 SG ? O CYS 60 ? O CYS 60 ? 1_555 ZN ? AA ZN . ? O ZN 2002 ? 1_555 SG ? O CYS 73 ? O CYS 73 ? 1_555 100.0 ? 31 SG ? O CYS 58 ? O CYS 58 ? 1_555 ZN ? AA ZN . ? O ZN 2002 ? 1_555 SG ? O CYS 76 ? O CYS 76 ? 1_555 107.9 ? 32 SG ? O CYS 60 ? O CYS 60 ? 1_555 ZN ? AA ZN . ? O ZN 2002 ? 1_555 SG ? O CYS 76 ? O CYS 76 ? 1_555 116.6 ? 33 SG ? O CYS 73 ? O CYS 73 ? 1_555 ZN ? AA ZN . ? O ZN 2002 ? 1_555 SG ? O CYS 76 ? O CYS 76 ? 1_555 101.5 ? 34 OD1 ? O ASP 739 ? O ASP 739 ? 1_555 MG ? BA MG . ? O MG 2003 ? 1_555 OD1 ? O ASP 741 ? O ASP 741 ? 1_555 83.0 ? 35 OD1 ? O ASP 739 ? O ASP 739 ? 1_555 MG ? BA MG . ? O MG 2003 ? 1_555 OD2 ? O ASP 741 ? O ASP 741 ? 1_555 88.8 ? 36 OD1 ? O ASP 741 ? O ASP 741 ? 1_555 MG ? 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