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KVGIKTIKVYCQRMQEENITRALIVVQQGMTPSAKQSLVDMAPKYILEQFLQQELLINITEHELVPEHVVMTKEEVTELL ARYKLRENQLPRIQAGDPVARYFGIKRGQVVKIIRPSETAGRYITYRLVQ ; E ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MSDNEDNFDGDDFDDVEEDEGLDDLENAEEEGQENVEILPSGERPQANQKRITTPYMTKYERARVLGTRALQIAMCAPVM VELEGETDPLLIAMKELKARKIPIIIRRYLPDGSYEDWGVDELIITD ; ;MSDNEDNFDGDDFDDVEEDEGLDDLENAEEEGQENVEILPSGERPQANQKRITTPYMTKYERARVLGTRALQIAMCAPVM VELEGETDPLLIAMKELKARKIPIIIRRYLPDGSYEDWGVDELIITD ; F ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MFYHISLEHEILLHPRYFGPNLLNTVKQKLFTEVEGTCTGKYGFVIAVTTIDNIGAGVIQPGRGFVLYPVKYKAIVFRPF KGEVVDAVVTQVNKVGLFTEIGPMSCFISRHSIPSEMEFDPNSNPPCYKTMDEDIVIQQDDEIRLKIVGTRVDKNDIFAI GSLMDDYLGLVS ; ;MFYHISLEHEILLHPRYFGPNLLNTVKQKLFTEVEGTCTGKYGFVIAVTTIDNIGAGVIQPGRGFVLYPVKYKAIVFRPF KGEVVDAVVTQVNKVGLFTEIGPMSCFISRHSIPSEMEFDPNSNPPCYKTMDEDIVIQQDDEIRLKIVGTRVDKNDIFAI GSLMDDYLGLVS ; G ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MAGILFEDIFDVKDIDPEGKKFDRVSRLHCESESFKMDLILDVNIQIYPVDLGDKFRLVIASTLYEDGTLDDGEYNPTDD RPSRADQFEYVMYGKVYRIEGDETSTEAATRLSAYVSYGGLLMRLQGDANNLHGFEVDSRVYLLMKKLAF ; ;MAGILFEDIFDVKDIDPEGKKFDRVSRLHCESESFKMDLILDVNIQIYPVDLGDKFRLVIASTLYEDGTLDDGEYNPTDD RPSRADQFEYVMYGKVYRIEGDETSTEAATRLSAYVSYGGLLMRLQGDANNLHGFEVDSRVYLLMKKLAF ; H ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MEPDGTYEPGFVGIRFCQECNNMLYPKEDKENRILLYACRNCDYQQEADNSCIYVNKITHEVDELTQIIADVSQDPTLPR TEDHPCQKCGHKEAVFFQSHSARAEDAMRLYYVCTAPHCGHRWTE ; ;MEPDGTYEPGFVGIRFCQECNNMLYPKEDKENRILLYACRNCDYQQEADNSCIYVNKITHEVDELTQIIADVSQDPTLPR TEDHPCQKCGHKEAVFFQSHSARAEDAMRLYYVCTAPHCGHRWTE ; I ? 10 'polypeptide(L)' no no MIIPVRCFTCGKIVGNKWEAYLGLLQAEYTEGDALDALGLKRYCCRRMLLAHVDLIEKLLNYAPLEK MIIPVRCFTCGKIVGNKWEAYLGLLQAEYTEGDALDALGLKRYCCRRMLLAHVDLIEKLLNYAPLEK J ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MNAPPAFESFLLFEGEKKITINKDTKVPNACLFTINKEDHTLGNIIKSQLLKDPQVLFAGYKVPHPLEHKIIIRVQTTPD YSPQEAFTNAITDLISELSLLEERFRVAIKDKQEGIE ; ;MNAPPAFESFLLFEGEKKITINKDTKVPNACLFTINKEDHTLGNIIKSQLLKDPQVLFAGYKVPHPLEHKIIIRVQTTPD YSPQEAFTNAITDLISELSLLEERFRVAIKDKQEGIE ; K ? 12 'polypeptide(L)' no no MDTQKDVQPPKQQPMIYICGECHTENEIKSRDPIRCRECGYRIMYKKRTKRLVVFDAR MDTQKDVQPPKQQPMIYICGECHTENEIKSRDPIRCRECGYRIMYKKRTKRLVVFDAR L ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MASTSRLDALPRVTCPNHPDAILVEDYRAGDMICPECGLVVGDRVIDVGSEWRTFSNDKATKDPSRVGDSQNPLLSDGDL STMIGKGTGAASFDEFGNSKYQNRRTMSSSDRAMMNAFKEITTMADRINLPRNIVDRTNNLFKQVYEQKSLKGRANDAIA SACLYIACRQEGVPRTFKEICAVSRISKKEIGRCFKLILKALETSVDLITTGDFMSRFCSNLCLPKQVQMAATHIARKAV ELDLVPGRSPISVAAAAIYMASQASAEKRTQKEIGDIAGVADVTIRQSYRLIYPRAPDLFPTDFKFDTPVDKLPQL ; ;MASTSRLDALPRVTCPNHPDAILVEDYRAGDMICPECGLVVGDRVIDVGSEWRTFSNDKATKDPSRVGDSQNPLLSDGDL STMIGKGTGAASFDEFGNSKYQNRRTMSSSDRAMMNAFKEITTMADRINLPRNIVDRTNNLFKQVYEQKSLKGRANDAIA SACLYIACRQEGVPRTFKEICAVSRISKKEIGRCFKLILKALETSVDLITTGDFMSRFCSNLCLPKQVQMAATHIARKAV ELDLVPGRSPISVAAAAIYMASQASAEKRTQKEIGDIAGVADVTIRQSYRLIYPRAPDLFPTDFKFDTPVDKLPQL ; M ? 14 'polypeptide(L)' no no ;MANSANTNTVPKLYRSVIEDVINDVRDIFLDDGVDEQVLMELKTLWENKLMQSRAVDGFHSEEQQLLLQVQQQHQPQQQQ HHHHHHHQQAQPQQTVPQQAQTQQVLIPASQQATAPQVIVPDSKLIQHMNASNMSAAATAATLALPAGVTPVQQILTNSG 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EEEWERRNKVLNHFSIMQQRRLKDQDQDEDEEEKEKRGRRKASELRIHDLEDDLEMSSDASDASGEEGGRVPKAKKKAPL AKGGRKKKKKKGSDDEAFEDSDDGDFEGQEVDYMSDGSSSSQEEPESKAKAPQQEEGPKGVDEQSDSSEESEEEKPPEED KEEEEEKKAPTPQEKKRRKDSSEESDSSEESDIDSEASSALFMAKKKTPPKRERKPSGGSSRGNSRPGTPSAEGGSTSST LRAAASKLEQGKRVSEMPAAKRLRLDTGPQSLSGKSTPQPPSGKTTPNSGDVQVTEDAVRRYLTRKPMTTKDLLKKFQTK KTGLSSEQTVNVLAQILKRLNPERKMINDKMHFSLKE ; S ? 20 'polypeptide(L)' no no ;MAERGELDLTGAKQNTGVWLVKVPKYLSQQWAKASGRGEVGKLRIAKTQGRTEVSFTLNEDLANIHDIGGKPASVSAPRE HPFVLQSVGGQTLTVFTESSSDKLSLEGIVVQRAECRPAASENYMRLKRLQIEESSKPVRLSQQLDKVVTTNYKPVANHQ YNIEYERKKKEDGKRARADKQHVLDMLFSAFEKHQYYNLKDLVDITKQPVVYLKEILKEIGVQNVKGIHKNTWELKPEYR HYQGEEKSD ; ;MAERGELDLTGAKQNTGVWLVKVPKYLSQQWAKASGRGEVGKLRIAKTQGRTEVSFTLNEDLANIHDIGGKPASVSAPRE HPFVLQSVGGQTLTVFTESSSDKLSLEGIVVQRAECRPAASENYMRLKRLQIEESSKPVRLSQQLDKVVTTNYKPVANHQ YNIEYERKKKEDGKRARADKQHVLDMLFSAFEKHQYYNLKDLVDITKQPVVYLKEILKEIGVQNVKGIHKNTWELKPEYR HYQGEEKSD ; T ? 21 'polypeptide(L)' no no ;MEDEVVRFAKKMDKMVQKKNAAGALDLLKELKNIPMTLELLQSTRIGMSVNAIRKQSTDEEVTSLAKSLIKSWKKLLDGP STEKDLDEKKKEPAITSQNSPEAREESTSSGNVSNRKDETNARDTYVSSFPRAPSTSDSVRLKCREMLAAALRTGDDYIA IGADEEELGSQIEEAIYQEIRNTDMKYKNRVRSRISNLKDAKNPNLRKNVLCGNIPPDLFARMTAEEMASDELKEMRKNL TKEAIREHQMAKTGGTQTDLFTCGKCKKKNCTYTQVQTRSADEPMTTFVVCNECGNRWKFC ; ;MEDEVVRFAKKMDKMVQKKNAAGALDLLKELKNIPMTLELLQSTRIGMSVNAIRKQSTDEEVTSLAKSLIKSWKKLLDGP STEKDLDEKKKEPAITSQNSPEAREESTSSGNVSNRKDETNARDTYVSSFPRAPSTSDSVRLKCREMLAAALRTGDDYIA IGADEEELGSQIEEAIYQEIRNTDMKYKNRVRSRISNLKDAKNPNLRKNVLCGNIPPDLFARMTAEEMASDELKEMRKNL TKEAIREHQMAKTGGTQTDLFTCGKCKKKNCTYTQVQTRSADEPMTTFVVCNECGNRWKFC ; U ? 22 polydeoxyribonucleotide no no ;(DG)(DA)(DA)(DG)(DG)(DG)(DC)(DG)(DC)(DC)(DT)(DA)(DT)(DA)(DA)(DA)(DA)(DG)(DG)(DG) (DG)(DG)(DT)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG)(DC)(DG)(DC)(DG)(DA)(DA)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT) (DT)(DT)(DT)(DT)(DC)(DG)(DC)(DG)(DA)(DT)(DC)(DG)(DA)(DA)(DC)(DA)(DC)(DT)(DC)(DG) (DA)(DG)(DC)(DC)(DG)(DA)(DG)(DC)(DA)(DG)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG) ; GAAGGGCGCCTATAAAAGGGGGTGGGGGCGCGAATTTTTTTTTTCGCGATCGAACACTCGAGCCGAGCAGACGTG X ? 23 polydeoxyribonucleotide no no ;(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DC)(DT)(DG)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(DC)(DT)(DC)(DG)(DA)(DG)(DT) (DG)(DT)(DT)(DC)(DG)(DA)(DT)(DC)(DG)(DC)(DG)(DA)(DC)(DT)(DG)(DA)(DG)(DG)(DA)(DC) (DG)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC)(DC)(DC)(DC)(DC)(DA)(DC)(DC)(DC)(DC)(DC)(DT)(DT) (DT)(DT)(DA)(DT)(DA)(DG)(DG)(DC)(DG)(DC)(DC)(DC)(DT)(DT)(DC) ; CACGTCTGCTCGGCTCGAGTGTTCGATCGCGACTGAGGACGAACGCGCCCCCACCCCCTTTTATAGGCGCCCTTC Y ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 24 'MAGNESIUM ION' MG 25 'ZINC ION' ZN # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 HIS n 1 3 GLY n 1 4 GLY n 1 5 GLY n 1 6 PRO n 1 7 PRO n 1 8 SER n 1 9 GLY n 1 10 ASP n 1 11 SER n 1 12 ALA n 1 13 CYS n 1 14 PRO n 1 15 LEU n 1 16 ARG n 1 17 THR n 1 18 ILE n 1 19 LYS n 1 20 ARG n 1 21 VAL n 1 22 GLN n 1 23 PHE n 1 24 GLY n 1 25 VAL n 1 26 LEU n 1 27 SER n 1 28 PRO n 1 29 ASP n 1 30 GLU n 1 31 LEU n 1 32 LYS n 1 33 ARG n 1 34 MET n 1 35 SER n 1 36 VAL n 1 37 THR n 1 38 GLU n 1 39 GLY n 1 40 GLY n 1 41 ILE n 1 42 LYS n 1 43 TYR n 1 44 PRO n 1 45 GLU n 1 46 THR n 1 47 THR n 1 48 GLU n 1 49 GLY n 1 50 GLY n 1 51 ARG n 1 52 PRO n 1 53 LYS n 1 54 LEU n 1 55 GLY n 1 56 GLY n 1 57 LEU n 1 58 MET n 1 59 ASP n 1 60 PRO n 1 61 ARG n 1 62 GLN n 1 63 GLY n 1 64 VAL n 1 65 ILE n 1 66 GLU n 1 67 ARG n 1 68 THR n 1 69 GLY n 1 70 ARG n 1 71 CYS n 1 72 GLN n 1 73 THR n 1 74 CYS n 1 75 ALA n 1 76 GLY n 1 77 ASN n 1 78 MET n 1 79 THR n 1 80 GLU n 1 81 CYS n 1 82 PRO n 1 83 GLY n 1 84 HIS n 1 85 PHE n 1 86 GLY n 1 87 HIS n 1 88 ILE n 1 89 GLU n 1 90 LEU n 1 91 ALA n 1 92 LYS n 1 93 PRO n 1 94 VAL n 1 95 PHE n 1 96 HIS n 1 97 VAL n 1 98 GLY n 1 99 PHE n 1 100 LEU n 1 101 VAL n 1 102 LYS n 1 103 THR n 1 104 MET n 1 105 LYS n 1 106 VAL n 1 107 LEU n 1 108 ARG n 1 109 CYS n 1 110 VAL n 1 111 CYS n 1 112 PHE n 1 113 PHE n 1 114 CYS n 1 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W 23 64 DT 64 82 82 DT DT Y . n W 23 65 DA 65 83 83 DA DA Y . n W 23 66 DG 66 84 84 DG DG Y . n W 23 67 DG 67 85 85 DG DG Y . n W 23 68 DC 68 86 86 DC DC Y . n W 23 69 DG 69 87 87 DG DG Y . n W 23 70 DC 70 88 88 DC DC Y . n W 23 71 DC 71 89 89 DC DC Y . n W 23 72 DC 72 90 90 DC DC Y . n W 23 73 DT 73 91 91 DT DT Y . n W 23 74 DT 74 92 92 DT DT Y . n W 23 75 DC 75 93 93 DC DC Y . n # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code X 24 MG 1 2001 1486 MG MG A . 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JA 25 ZN 1 402 302 ZN ZN U . # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 5IYB _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 5IYB _struct.title 'Human core-PIC in the open state' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? # _struct_keywords.entry_id 5IYB _struct_keywords.text 'initiation, RNA polymerase II, human, TRANSCRIPTION, TRANSFERASE-DNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'TRANSCRIPTION, TRANSFERASE/DNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? R N N 18 ? S N N 19 ? T N N 20 ? U N N 21 ? V N N 22 ? W N N 23 ? X N N 24 ? Y N N 25 ? Z N N 25 ? AA N N 25 ? BA N N 25 ? CA N N 25 ? DA N N 25 ? EA N N 25 ? FA N N 25 ? GA N N 25 ? HA N N 25 ? IA N N 24 ? JA N N 25 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP RPB1_HUMAN P24928 ? 1 ;MHGGGPPSGDSACPLRTIKRVQFGVLSPDELKRMSVTEGGIKYPETTEGGRPKLGGLMDPRQGVIERTGRCQTCAGNMTE CPGHFGHIELAKPVFHVGFLVKTMKVLRCVCFFCSKLLVDSNNPKIKDILAKSKGQPKKRLTHVYDLCKGKNICEGGEEM DNKFGVEQPEGDEDLTKEKGHGGCGRYQPRIRRSGLELYAEWKHVNEDSQEKKILLSPERVHEIFKRISDEECFVLGMEP RYARPEWMIVTVLPVPPLSVRPAVVMQGSARNQDDLTHKLADIVKINNQLRRNEQNGAAAHVIAEDVKLLQFHVATMVDN ELPGLPRAMQKSGRPLKSLKQRLKGKEGRVRGNLMGKRVDFSARTVITPDPNLSIDQVGVPRSIAANMTFAEIVTPFNID RLQELVRRGNSQYPGAKYIIRDNGDRIDLRFHPKPSDLHLQTGYKVERHMCDGDIVIFNRQPTLHKMSMMGHRVRILPWS TFRLNLSVTTPYNADFDGDEMNLHLPQSLETRAEIQELAMVPRMIVTPQSNRPVMGIVQDTLTAVRKFTKRDVFLERGEV MNLLMFLSTWDGKVPQPAILKPRPLWTGKQIFSLIIPGHINCIRTHSTHPDDEDSGPYKHISPGDTKVVVENGELIMGIL CKKSLGTSAGSLVHISYLEMGHDITRLFYSNIQTVINNWLLIEGHTIGIGDSIADSKTYQDIQNTIKKAKQDVIEVIEKA HNNELEPTPGNTLRQTFENQVNRILNDARDKTGSSAQKSLSEYNNFKSMVVSGAKGSKINISQVIAVVGQQNVEGKRIPF GFKHRTLPHFIKDDYGPESRGFVENSYLAGLTPTEFFFHAMGGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLIKSMESVMVKYDATVR NSINQVVQLRYGEDGLAGESVEFQNLATLKPSNKAFEKKFRFDYTNERALRRTLQEDLVKDVLSNAHIQNELEREFERMR EDREVLRVIFPTGDSKVVLPCNLLRMIWNAQKIFHINPRLPSDLHPIKVVEGVKELSKKLVIVNGDDPLSRQAQENATLL FNIHLRSTLCSRRMAEEFRLSGEAFDWLLGEIESKFNQAIAHPGEMVGALAAQSLGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTLG VPRLKELINISKKPKTPSLTVFLLGQSARDAERAKDILCRLEHTTLRKVTANTAIYYDPNPQSTVVAEDQEWVNVYYEMP DFDVARISPWLLRVELDRKHMTDRKLTMEQIAEKINAGFGDDLNCIFNDDNAEKLVLRIRIMNSDENKMQEEEEVVDKMD DDVFLRCIESNMLTDMTLQGIEQISKVYMHLPQTDNKKKIIITEDGEFKALQEWILETDGVSLMRVLSEKDVDPVRTTSN DIVEIFTVLGIEAVRKALERELYHVISFDGSYVNYRHLALLCDTMTCRGHLMAITRHGVNRQDTGPLMKCSFEETVDVLM EAAAHGESDPMKGVSENIMLGQLAPAGTGCFDLLLDAEKCKYGMEIPTNIPGLGAAGPTGMFFGSAPSPMGGISPAMTPW NQGATPAYGAWSPSVGSGMTPGAAGFSPSAASDASGFSPGYSPAWSPTPGSPGSPGPSSPYIPSPGGAMSPSYSPTSPAY EPRSPGGYTPQSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSP TSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPNYTPTSP SYSPTSPSYSPTSPNYTPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPSSPRYTPQSPTYTPSSPSYSPSSPSYSPASPKYT PTSPSYSPSSPEYTPTSPKYSPTSPKYSPTSPKYSPTSPTYSPTTPKYSPTSPTYSPTSPVYTPTSPKYSPTSPTYSPTS PKYSPTSPTYSPTSPKGSTYSPTSPGYSPTSPTYSLTSPAISPDDSDEEN ; 1 2 UNP RPB2_HUMAN P30876 ? 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3 ;MPYANQPTVRITELTDENVKFIIENTDLAVANSIRRVFIAEVPIIAIDWVQIDANSSVLHDEFIAHRLGLIPLISDDIVD KLQYSRDCTCEEFCPECSVEFTLDVRCNEDQTRHVTSRDLISNSPRVIPVTSRNRDNDPNDYVEQDDILIVKLRKGQELR LRAYAKKGFGKEHAKWNPTAGVAFEYDPDNALRHTVYPKPEEWPKSEYSELDEDESQAPYDPNGKPERFYYNVESCGSLR PETIVLSALSGLKKKLSDLQTQLSHEIQSDVLTIN ; 1 4 UNP RPB4_HUMAN O15514 ? 4 ;MAAGGSDPRAGDVEEDASQLIFPKEFETAETLLNSEVHMLLEHRKQQNESAEDEQELSEVFMKTLNYTARFSRFKNRETI ASVRSLLLQKKLHKFELACLANLCPETAEESKALIPSLEGRFEDEELQQILDDIQTKRSFQY ; 1 5 UNP RPAB1_HUMAN P19388 ? 5 ;MDDEEETYRLWKIRKTIMQLCHDRGYLVTQDELDQTLEEFKAQSGDKPSEGRPRRTDLTVLVAHNDDPTDQMFVFFPEEP KVGIKTIKVYCQRMQEENITRALIVVQQGMTPSAKQSLVDMAPKYILEQFLQQELLINITEHELVPEHVVMTKEEVTELL ARYKLRENQLPRIQAGDPVARYFGIKRGQVVKIIRPSETAGRYITYRLVQ ; 1 6 UNP RPAB2_HUMAN P61218 ? 6 ;MSDNEDNFDGDDFDDVEEDEGLDDLENAEEEGQENVEILPSGERPQANQKRITTPYMTKYERARVLGTRALQIAMCAPVM VELEGETDPLLIAMKELKARKIPIIIRRYLPDGSYEDWGVDELIITD ; 1 7 UNP RPB7_HUMAN P62487 ? 7 ;MFYHISLEHEILLHPRYFGPNLLNTVKQKLFTEVEGTCTGKYGFVIAVTTIDNIGAGVIQPGRGFVLYPVKYKAIVFRPF KGEVVDAVVTQVNKVGLFTEIGPMSCFISRHSIPSEMEFDPNSNPPCYKTMDEDIVIQQDDEIRLKIVGTRVDKNDIFAI GSLMDDYLGLVS ; 1 8 UNP RPAB3_HUMAN P52434 ? 8 ;MAGILFEDIFDVKDIDPEGKKFDRVSRLHCESESFKMDLILDVNIQIYPVDLGDKFRLVIASTLYEDGTLDDGEYNPTDD RPSRADQFEYVMYGKVYRIEGDETSTEAATRLSAYVSYGGLLMRLQGDANNLHGFEVDSRVYLLMKKLAF ; 1 9 UNP RPB9_HUMAN P36954 ? 9 ;MEPDGTYEPGFVGIRFCQECNNMLYPKEDKENRILLYACRNCDYQQEADNSCIYVNKITHEVDELTQIIADVSQDPTLPR TEDHPCQKCGHKEAVFFQSHSARAEDAMRLYYVCTAPHCGHRWTE ; 1 10 UNP RPAB5_HUMAN P62875 ? 10 MIIPVRCFTCGKIVGNKWEAYLGLLQAEYTEGDALDALGLKRYCCRRMLLAHVDLIEKLLNYAPLEK 1 11 UNP RPB11_HUMAN P52435 ? 11 ;MNAPPAFESFLLFEGEKKITINKDTKVPNACLFTINKEDHTLGNIIKSQLLKDPQVLFAGYKVPHPLEHKIIIRVQTTPD YSPQEAFTNAITDLISELSLLEERFRVAIKDKQEGIE ; 1 12 UNP RPAB4_HUMAN P53803 ? 12 MDTQKDVQPPKQQPMIYICGECHTENEIKSRDPIRCRECGYRIMYKKRTKRLVVFDAR 1 13 UNP TF2B_HUMAN Q00403 ? 13 ;MASTSRLDALPRVTCPNHPDAILVEDYRAGDMICPECGLVVGDRVIDVGSEWRTFSNDKATKDPSRVGDSQNPLLSDGDL STMIGKGTGAASFDEFGNSKYQNRRTMSSSDRAMMNAFKEITTMADRINLPRNIVDRTNNLFKQVYEQKSLKGRANDAIA SACLYIACRQEGVPRTFKEICAVSRISKKEIGRCFKLILKALETSVDLITTGDFMSRFCSNLCLPKQVQMAATHIARKAV ELDLVPGRSPISVAAAAIYMASQASAEKRTQKEIGDIAGVADVTIRQSYRLIYPRAPDLFPTDFKFDTPVDKLPQL ; 1 14 UNP TF2AA_HUMAN P52655 ? 14 ;MANSANTNTVPKLYRSVIEDVINDVRDIFLDDGVDEQVLMELKTLWENKLMQSRAVDGFHSEEQQLLLQVQQQHQPQQQQ HHHHHHHQQAQPQQTVPQQAQTQQVLIPASQQATAPQVIVPDSKLIQHMNASNMSAAATAATLALPAGVTPVQQILTNSG QLLQVVRAANGAQYIFQPQQSVVLQQQVIPQMQPGGVQAPVIQQVLAPLPGGISPQTGVIIQPQQILFTGNKTQVIPTTV AAPTPAQAQITATGQQQPQAQPAQTQAPLVLQVDGTGDTSSEEDEDEEEDYDDDEEEDKEKDGAEDGQVEEEPLNSEDDV SDEEGQELFDTENVVVCQYDKIHRSKNKWKFHLKDGIMNLNGRDYIFSKAIGDAEW ; 1 15 UNP T2AG_HUMAN P52657 ? 15 ;MAYQLYRNTTLGNSLQESLDELIQSQQITPQLALQVLLQFDKAINAALAQRVRNRVNFRGSLNTYRFCDNVWTFVLNDVE FREVTELIKVDKVKIVACDGKNTGSNTTE ; 1 16 UNP TBP_HUMAN P20226 ? 16 ;MDQNNSLPPYAQGLASPQGAMTPGIPIFSPMMPYGTGLTPQPIQNTNSLSILEEQQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ QQQQQQQQQQQQQQQAVAAAAVQQSTSQQATQGTSGQAPQLFHSQTLTTAPLPGTTPLYPSPMTPMTPITPATPASESSG IVPQLQNIVSTVNLGCKLDLKTIALRARNAEYNPKRFAAVIMRIREPRTTALIFSSGKMVCTGAKSEEQSRLAARKYARV VQKLGFPAKFLDFKIQNMVGSCDVKFPIRLEGLVLTHQQFSSYEPELFPGLIYRMIKPRIVLLIFVSGKVVLTGAKVRAE IYEAFENIYPILKGFRKTT ; 1 17 UNP T2EA_HUMAN P29083 ? 17 ;MADPDVLTEVPAALKRLAKYVIRGFYGIEHALALDILIRNSCVKEEDMLELLKFDRKQLRSVLNNLKGDKFIKCRMRVET AADGKTTRHNYYFINYRTLVNVVKYKLDHMRRRIETDERDSTNRASFKCPVCSSTFTDLEANQLFDPMTGTFRCTFCHTE VEEDESAMPKKDARTLLARFNEQIEPIYALLRETEDVNLAYEILEPEPTEIPALKQSKDHAATTAGAASLAGGHHREAWA TKGPSYEDLYTQNVVINMDDQEDLHRASLEGKSAKERPIWLRESTVQGAYGSEDMKEGGIDMDAFQEREEGHAGPDDNEE VMRALLIHEKKTSSAMAGSVGAAAPVTAANGSDSESETSESDDDSPPRPAAVAVHKREEDEEEDDEFEEVADDPIVMVAG RPFSYSEVSQRPELVAQMTPEEKEAYIAMGQRMFEDLFE ; 1 18 UNP T2EB_HUMAN P29084 ? 18 ;MDPSLLRERELFKKRALSTPVVEKRSASSESSSSSSKKKKTKVEHGGSSGSKQNSDHSNGSFNLKALSGSSGYKFGVLAK IVNYMKTRHQRGDTHPLTLDEILDETQHLDIGLKQKQWLMTEALVNNPKIEVIDGKYAFKPKYNVRDKKALLRLLDQHDQ RGLGGILLEDIEEALPNSQKAVKALGDQILFVNRPDKKKILFFNDKSCQFSVDEEFQKLWRSVTVDSMDEEKIEEYLKRQ GISSMQESGPKKVAPIQRRKKPASQKKRRFKTHNEHLAGVLKDYSDITSSK ; 1 19 UNP T2FA_HUMAN P35269 ? 19 ;MAALGPSSQNVTEYVVRVPKNTTKKYNIMAFNAADKVNFATWNQARLERDLSNKKIYQEEEMPESGAGSEFNRKLREEAR RKKYGIVLKEFRPEDQPWLLRVNGKSGRKFKGIKKGGVTENTSYYIFTQCPDGAFEAFPVHNWYNFTPLARHRTLTAEEA EEEWERRNKVLNHFSIMQQRRLKDQDQDEDEEEKEKRGRRKASELRIHDLEDDLEMSSDASDASGEEGGRVPKAKKKAPL AKGGRKKKKKKGSDDEAFEDSDDGDFEGQEVDYMSDGSSSSQEEPESKAKAPQQEEGPKGVDEQSDSSEESEEEKPPEED KEEEEEKKAPTPQEKKRRKDSSEESDSSEESDIDSEASSALFMAKKKTPPKRERKPSGGSSRGNSRPGTPSAEGGSTSST LRAAASKLEQGKRVSEMPAAKRLRLDTGPQSLSGKSTPQPPSGKTTPNSGDVQVTEDAVRRYLTRKPMTTKDLLKKFQTK KTGLSSEQTVNVLAQILKRLNPERKMINDKMHFSLKE ; 1 20 UNP T2FB_HUMAN P13984 ? 20 ;MAERGELDLTGAKQNTGVWLVKVPKYLSQQWAKASGRGEVGKLRIAKTQGRTEVSFTLNEDLANIHDIGGKPASVSAPRE HPFVLQSVGGQTLTVFTESSSDKLSLEGIVVQRAECRPAASENYMRLKRLQIEESSKPVRLSQQLDKVVTTNYKPVANHQ YNIEYERKKKEDGKRARADKQHVLDMLFSAFEKHQYYNLKDLVDITKQPVVYLKEILKEIGVQNVKGIHKNTWELKPEYR HYQGEEKSD ; 1 21 UNP TCEA1_HUMAN P23193 ? 21 ;MEDEVVRFAKKMDKMVQKKNAAGALDLLKELKNIPMTLELLQSTRIGMSVNAIRKQSTDEEVTSLAKSLIKSWKKLLDGP STEKDLDEKKKEPAITSQNSPEAREESTSSGNVSNRKDETNARDTYVSSFPRAPSTSDSVRLKCREMLAAALRTGDDYIA IGADEEELGSQIEEAIYQEIRNTDMKYKNRVRSRISNLKDAKNPNLRKNVLCGNIPPDLFARMTAEEMASDELKEMRKNL TKEAIREHQMAKTGGTQTDLFTCGKCKKKNCTYTQVQTRSADEPMTTFVVCNECGNRWKFC ; 1 22 PDB 5IYB 5IYB ? 22 ? 1 23 PDB 5IYB 5IYB ? 23 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 5IYB A 1 ? 1970 ? 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THR A 832 GLU A 869 1 ? 38 HELX_P HELX_P30 AD3 ARG A 890 ? ASP A 894 ? ARG A 890 ASP A 894 5 ? 5 HELX_P HELX_P31 AD4 ALA A 907 ? LYS A 910 ? ALA A 907 LYS A 910 5 ? 4 HELX_P HELX_P32 AD5 SER A 912 ? ARG A 921 ? SER A 912 ARG A 921 1 ? 10 HELX_P HELX_P33 AD6 LEU A 938 ? LEU A 943 ? LEU A 938 LEU A 943 1 ? 6 HELX_P HELX_P34 AD7 ASN A 945 ? PHE A 970 ? ASN A 945 PHE A 970 1 ? 26 HELX_P HELX_P35 AD8 ASN A 982 ? HIS A 995 ? ASN A 982 HIS A 995 1 ? 14 HELX_P HELX_P36 AD9 HIS A 1005 ? LEU A 1020 ? HIS A 1005 LEU A 1020 1 ? 16 HELX_P HELX_P37 AE1 ASP A 1027 ? ALA A 1037 ? ASP A 1027 ALA A 1037 1 ? 11 HELX_P HELX_P38 AE2 THR A 1038 ? LEU A 1049 ? THR A 1038 LEU A 1049 1 ? 12 HELX_P HELX_P39 AE3 CYS A 1050 ? GLU A 1057 ? CYS A 1050 GLU A 1057 1 ? 8 HELX_P HELX_P40 AE4 SER A 1061 ? ILE A 1080 ? SER A 1061 ILE A 1080 1 ? 20 HELX_P HELX_P41 AE5 MET A 1086 ? THR A 1100 ? MET A 1086 THR A 1100 1 ? 15 HELX_P HELX_P42 AE6 GLY A 1120 ? ASN A 1129 ? 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V DG 70 O6 ? ? ? 1_555 W DC 6 N4 ? ? X DG 69 Y DC 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog144 hydrog ? ? V DA 71 N1 ? ? ? 1_555 W DT 5 N3 ? ? X DA 70 Y DT 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog145 hydrog ? ? V DA 71 N6 ? ? ? 1_555 W DT 5 O4 ? ? X DA 70 Y DT 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog146 hydrog ? ? V DC 72 N3 ? ? ? 1_555 W DG 4 N1 ? ? X DC 71 Y DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog147 hydrog ? ? V DC 72 N4 ? ? ? 1_555 W DG 4 O6 ? ? X DC 71 Y DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog148 hydrog ? ? V DC 72 O2 ? ? ? 1_555 W DG 4 N2 ? ? X DC 71 Y DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog149 hydrog ? ? V DG 73 N1 ? ? ? 1_555 W DC 3 N3 ? ? X DG 72 Y DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog150 hydrog ? ? V DG 73 N2 ? ? ? 1_555 W DC 3 O2 ? ? X DG 72 Y DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog151 hydrog ? ? V DG 73 O6 ? ? ? 1_555 W DC 3 N4 ? ? X DG 72 Y DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog152 hydrog ? ? V DT 74 N3 ? ? ? 1_555 W DA 2 N1 ? ? X DT 73 Y DA 20 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DA PAIR' ? ? ? hydrog153 hydrog ? ? V DG 75 N1 ? ? ? 1_555 W DC 1 N3 ? ? X DG 74 Y DC 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog154 hydrog ? ? V DG 75 N2 ? ? ? 1_555 W DC 1 O2 ? ? X DG 74 Y DC 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog155 hydrog ? ? V DG 75 O6 ? ? ? 1_555 W DC 1 N4 ? ? X DG 74 Y DC 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLN 461 A . ? GLN 461 A PRO 462 A ? PRO 462 A 1 -2.72 2 LYS 581 A . ? LYS 581 A PRO 582 A ? 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AF3 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA4 5 6 ? parallel AA4 6 7 ? anti-parallel AA4 7 8 ? parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA7 5 6 ? anti-parallel AA7 6 7 ? anti-parallel AA7 7 8 ? anti-parallel AA7 8 9 ? anti-parallel AA7 9 10 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB3 4 5 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AB9 4 5 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? parallel AC3 4 5 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? parallel AC5 5 6 ? anti-parallel AC5 6 7 ? parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD1 4 5 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD3 4 5 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? parallel AD5 3 4 ? parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD6 3 4 ? parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD7 3 4 ? parallel AD7 4 5 ? anti-parallel AD7 5 6 ? anti-parallel AD7 6 7 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE1 3 4 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE2 3 4 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE4 3 4 ? parallel AE4 4 5 ? anti-parallel AE4 5 6 ? anti-parallel AE4 6 7 ? parallel AE4 7 8 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE5 3 4 ? anti-parallel AE5 4 5 ? anti-parallel AE5 5 6 ? anti-parallel AE5 6 7 ? anti-parallel AE5 7 8 ? anti-parallel AE5 8 9 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF1 3 4 ? anti-parallel AF1 4 5 ? parallel AF1 5 6 ? anti-parallel AF1 6 7 ? anti-parallel AF1 7 8 ? anti-parallel AF1 8 9 ? anti-parallel AF1 9 10 ? anti-parallel AF1 10 11 ? anti-parallel AF1 11 12 ? parallel AF1 12 13 ? anti-parallel AF1 13 14 ? anti-parallel AF1 14 15 ? parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF2 2 3 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF3 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 SER A 1448 ? 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ARG A 426 ASP A 428 AA6 1 PHE A 554 ? LEU A 555 ? PHE A 554 LEU A 555 AA6 2 TRP A 586 ? THR A 587 ? TRP A 586 THR A 587 AA7 1 ILE A 579 ? LYS A 581 ? ILE A 579 LYS A 581 AA7 2 TYR H 90 ? ARG H 98 ? TYR H 90 ARG H 98 AA7 3 VAL H 141 ? LYS H 146 ? VAL H 141 LYS H 146 AA7 4 LYS H 55 ? ALA H 61 ? LYS H 55 ALA H 61 AA7 5 ILE H 4 ? ASP H 14 ? ILE H 4 ASP H 14 AA7 6 VAL H 25 ? SER H 32 ? VAL H 25 SER H 32 AA7 7 ASP H 38 ? ASN H 44 ? ASP H 38 ASN H 44 AA7 8 LEU H 121 ? GLN H 126 ? LEU H 121 GLN H 126 AA7 9 SER H 113 ? TYR H 118 ? SER H 113 TYR H 118 AA7 10 TYR H 90 ? ARG H 98 ? TYR H 90 ARG H 98 AA8 1 VAL A 629 ? GLU A 631 ? VAL A 629 GLU A 631 AA8 2 GLU A 634 ? MET A 637 ? GLU A 634 MET A 637 AA9 1 GLY A 789 ? GLN A 790 ? GLY A 789 GLN A 790 AA9 2 PHE A 822 ? VAL A 823 ? PHE A 822 VAL A 823 AB1 1 GLU A 902 ? ASN A 905 ? GLU A 902 ASN A 905 AB1 2 LYS A 976 ? LEU A 979 ? LYS A 976 LEU A 979 AB2 1 TYR A 1308 ? PRO A 1312 ? TYR A 1308 PRO A 1312 AB2 2 TRP A 1334 ? ASP A 1339 ? TRP A 1334 ASP A 1339 AB2 3 SER A 1138 ? PHE A 1142 ? SER A 1138 PHE A 1142 AB2 4 THR A 1358 ? SER A 1359 ? THR A 1358 SER A 1359 AB3 1 CYS A 1245 ? PHE A 1247 ? CYS A 1245 PHE A 1247 AB3 2 LEU A 1255 ? ILE A 1259 ? LEU A 1255 ILE A 1259 AB3 3 TRP A 1210 ? LEU A 1216 ? TRP A 1210 LEU A 1216 AB3 4 THR A 1170 ? TYR A 1177 ? THR A 1170 TYR A 1177 AB3 5 CYS I 52 ? ASN I 56 ? CYS I 52 ASN I 56 AB4 1 ASP A 1472 ? LEU A 1475 ? ASP A 1472 LEU A 1475 AB4 2 ILE F 104 ? ARG F 108 ? ILE F 104 ARG F 108 AB4 3 GLU F 116 ? GLY F 119 ? GLU F 116 GLY F 119 AB5 1 ILE B 65 ? GLN B 68 ? ILE B 65 GLN B 68 AB5 2 ARG B 83 ? LEU B 93 ? ARG B 83 LEU B 93 AB5 3 SER B 121 ? THR B 131 ? SER B 121 THR B 131 AB5 4 THR B 142 ? PRO B 153 ? THR B 142 PRO B 153 AB6 1 THR B 97 ? TRP B 99 ? THR B 97 TRP B 99 AB6 2 PRO B 105 ? PRO B 107 ? PRO B 105 PRO B 107 AB7 1 PHE B 185 ? ILE B 187 ? PHE B 185 ILE B 187 AB7 2 SER B 190 ? LEU B 194 ? SER B 190 LEU B 194 AB7 3 SER B 467 ? VAL B 469 ? 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? 124.46 49.92 23 1 CYS A 154 ? ? -15.68 123.56 24 1 GLU A 155 ? ? -117.52 -132.86 25 1 HIS A 181 ? ? -92.93 46.83 26 1 CYS A 184 ? ? 51.42 90.73 27 1 HIS A 204 ? ? 109.05 -91.26 28 1 ASN A 206 ? ? 108.73 -27.96 29 1 GLU A 207 ? ? 72.73 -32.99 30 1 ASP A 208 ? ? 22.61 -58.42 31 1 GLN A 210 ? ? 50.58 -173.63 32 1 GLU A 211 ? ? -132.56 -47.43 33 1 LYS A 212 ? ? 74.97 145.64 34 1 LYS A 213 ? ? -179.20 74.82 35 1 TYR A 242 ? ? -122.91 -108.31 36 1 PRO A 262 ? ? 42.37 -22.16 37 1 ALA A 263 ? ? 89.03 9.09 38 1 VAL A 264 ? ? 58.75 -61.12 39 1 MET A 266 ? ? 34.73 69.82 40 1 GLN A 267 ? ? 62.64 -137.66 41 1 ALA A 270 ? ? 84.76 5.76 42 1 ASN A 272 ? ? 157.77 47.15 43 1 GLN A 273 ? ? -46.87 159.78 44 1 GLU A 294 ? ? -69.06 -71.72 45 1 GLN A 295 ? ? -15.25 -50.56 46 1 ASN A 296 ? ? -86.62 -129.97 47 1 ALA A 299 ? ? -68.76 -97.05 48 1 ALA A 300 ? ? -166.45 -63.74 49 1 LEU A 322 ? ? 22.86 77.01 50 1 LYS A 344 ? ? -47.10 -95.26 51 1 VAL A 350 ? ? -78.91 -71.16 52 1 ASN A 353 ? ? -158.03 -54.17 53 1 PHE A 361 ? ? 67.58 69.53 54 1 SER A 374 ? ? -59.79 -173.36 55 1 ASP A 452 ? ? -50.32 93.11 56 1 TRP A 479 ? ? 70.01 158.91 57 1 SER A 480 ? ? -108.03 48.51 58 1 ASN A 485 ? ? -33.28 141.54 59 1 PHE A 496 ? ? -30.76 39.80 60 1 SER A 530 ? ? -145.31 39.64 61 1 ASN A 531 ? ? 26.30 44.44 62 1 GLN A 539 ? ? 53.67 -134.09 63 1 HIS A 599 ? ? -170.45 -34.75 64 1 ARG A 604 ? ? 58.58 -143.87 65 1 THR A 605 ? ? 40.79 101.87 66 1 HIS A 606 ? ? -158.48 -25.20 67 1 SER A 607 ? ? -49.43 71.14 68 1 PRO A 610 ? ? -29.73 -163.60 69 1 ASP A 611 ? ? 51.91 -81.40 70 1 ASP A 612 ? ? 168.84 163.70 71 1 ASP A 614 ? ? 74.46 -14.83 72 1 SER A 615 ? ? -164.24 -4.50 73 1 HIS A 620 ? ? 79.02 -9.99 74 1 ILE A 621 ? ? 64.40 73.23 75 1 PRO A 623 ? ? 13.84 -92.25 76 1 ASP A 625 ? ? 41.47 -4.27 77 1 THR A 626 ? ? -145.52 -3.28 78 1 CYS A 641 ? ? -152.32 -147.12 79 1 THR A 647 ? ? -67.61 9.81 80 1 ILE A 687 ? ? -162.02 108.41 81 1 ALA A 694 ? ? -126.91 -159.48 82 1 GLU A 726 ? ? 60.14 95.14 83 1 PRO A 729 ? ? -44.53 -12.86 84 1 ASN A 764 ? ? -57.13 103.25 85 1 ALA A 786 ? ? -79.51 -78.83 86 1 ILE A 798 ? ? -37.05 131.39 87 1 LYS A 803 ? ? -54.58 105.79 88 1 TYR A 827 ? ? -57.06 -4.95 89 1 ALA A 877 ? ? 87.85 0.75 90 1 ASN A 881 ? ? -87.54 -154.24 91 1 ASP A 894 ? ? -168.39 -6.91 92 1 ALA A 907 ? ? -38.73 -38.05 93 1 LEU A 909 ? ? -73.22 22.20 94 1 PRO A 911 ? ? -40.16 -91.24 95 1 THR A 925 ? ? -70.89 48.95 96 1 ALA A 929 ? ? -63.71 -163.81 97 1 LEU A 930 ? ? -65.07 2.44 98 1 ARG A 931 ? ? -31.97 95.54 99 1 ARG A 932 ? ? 116.39 -25.67 100 1 GLN A 935 ? ? 57.42 -44.14 101 1 PHE A 970 ? ? -119.18 74.71 102 1 CYS A 981 ? ? 58.41 83.70 103 1 ASN A 982 ? ? -59.00 101.67 104 1 LEU A 1020 ? ? -82.80 32.32 105 1 LEU A 1049 ? ? -84.69 44.20 106 1 GLU A 1057 ? ? -125.35 -58.06 107 1 ARG A 1059 ? ? 52.66 18.96 108 1 MET A 1086 ? ? -86.71 49.12 109 1 MET A 1102 ? ? 64.00 142.56 110 1 THR A 1103 ? ? 59.26 99.71 111 1 ASN A 1105 ? ? -167.43 54.77 112 1 ALA A 1110 ? ? -135.33 -118.55 113 1 SER A 1113 ? ? -74.74 -151.75 114 1 ALA A 1114 ? ? 86.90 28.66 115 1 VAL A 1117 ? ? 30.24 105.03 116 1 THR A 1136 ? ? -151.22 79.83 117 1 ARG A 1149 ? ? -144.85 -8.78 118 1 HIS A 1163 ? ? -69.98 82.92 119 1 SER A 1183 ? ? -148.90 30.62 120 1 THR A 1184 ? ? -37.25 134.01 121 1 PRO A 1200 ? ? 2.44 86.32 122 1 ASN A 1263 ? ? -127.51 -167.45 123 1 ASP A 1265 ? ? 61.19 -84.77 124 1 GLU A 1273 ? ? -164.31 15.69 125 1 GLU A 1274 ? ? 63.26 98.40 126 1 VAL A 1275 ? ? -58.65 70.99 127 1 VAL A 1276 ? ? -144.50 -19.33 128 1 THR A 1297 ? ? -100.50 64.44 129 1 GLN A 1299 ? ? 31.84 -55.93 130 1 ILE A 1301 ? ? -91.48 -78.19 131 1 GLN A 1303 ? ? -63.50 92.16 132 1 SER A 1305 ? ? 67.09 175.70 133 1 ASP A 1315 ? ? -71.88 -99.82 134 1 ASN A 1316 ? ? -84.01 -148.12 135 1 PHE A 1328 ? ? -92.53 55.13 136 1 VAL A 1341 ? ? -133.94 -32.12 137 1 SER A 1342 ? ? -57.84 57.45 138 1 ASP A 1351 ? ? 70.65 -5.72 139 1 ASP A 1389 ? ? -54.21 -7.05 140 1 ASP A 1423 ? ? -73.32 22.82 141 1 GLU A 1433 ? ? -153.71 -50.45 142 1 THR A 1435 ? ? 37.90 -95.47 143 1 MET A 1451 ? ? 49.01 23.56 144 1 PRO A 1465 ? ? -66.25 58.52 145 1 GLU B 12 ? ? -145.12 -18.14 146 1 ASP B 14 ? ? -148.65 -51.44 147 1 GLN B 23 ? ? -44.88 -7.13 148 1 VAL B 40 ? ? -144.48 37.48 149 1 MET B 53 ? ? -123.34 -57.76 150 1 ASP B 61 ? ? -61.34 -99.65 151 1 ALA B 74 ? ? 50.47 -18.20 152 1 SER B 75 ? ? -151.89 -105.60 153 1 GLU B 77 ? ? 77.80 -134.60 154 1 VAL B 78 ? ? 10.61 58.44 155 1 GLU B 79 ? ? 110.93 -62.69 156 1 GLU B 89 ? ? -126.56 -119.02 157 1 LEU B 118 ? ? -73.01 -153.71 158 1 TYR B 120 ? ? -67.04 98.44 159 1 GLN B 141 ? ? 174.18 74.40 160 1 THR B 159 ? ? -59.72 -9.98 161 1 ASN B 203 ? ? 12.52 43.67 162 1 LYS B 210 ? ? -141.88 58.77 163 1 GLU B 226 ? ? -47.06 -14.35 164 1 SER B 228 ? ? -148.72 -114.41 165 1 PRO B 231 ? ? -87.52 -90.76 166 1 THR B 232 ? ? -143.03 -157.55 167 1 THR B 234 ? ? -153.22 -68.99 168 1 ILE B 235 ? ? -37.91 127.55 169 1 ARG B 242 ? ? 46.99 78.96 170 1 LYS B 249 ? ? 160.82 -25.97 171 1 SER B 250 ? ? 82.76 -119.65 172 1 ALA B 251 ? ? 21.90 99.20 173 1 TYR B 262 ? ? 67.39 -20.22 174 1 TYR B 290 ? ? 60.20 -67.41 175 1 PHE B 292 ? ? 62.97 -18.31 176 1 GLU B 293 ? ? -108.73 43.89 177 1 CYS B 357 ? ? -140.40 30.64 178 1 LYS B 427 ? ? 45.90 72.77 179 1 ASP B 428 ? ? -176.98 53.27 180 1 GLN B 456 ? ? 85.72 -27.03 181 1 ALA B 459 ? ? 57.74 -172.07 182 1 HIS B 460 ? ? -162.76 -19.89 183 1 ARG B 491 ? ? 95.07 69.56 184 1 ASP B 492 ? ? 133.93 34.86 185 1 ALA B 496 ? ? -172.77 -163.74 186 1 ARG B 499 ? ? -154.41 -30.46 187 1 MET B 508 ? ? -92.57 -73.06 188 1 GLU B 513 ? ? -177.31 85.73 189 1 HIS B 518 ? ? 54.89 -83.42 190 1 ALA B 527 ? ? -70.70 -147.74 191 1 ALA B 530 ? ? -48.79 152.32 192 1 SER B 549 ? ? -173.17 -14.56 193 1 ILE B 561 ? ? -158.16 8.21 194 1 LYS B 685 ? ? -37.88 -27.73 195 1 HIS B 699 ? ? 173.50 140.33 196 1 ALA B 708 ? ? -68.38 0.65 197 1 ASN B 739 ? ? -88.94 32.35 198 1 TYR B 753 ? ? -117.02 69.60 199 1 TYR B 785 ? ? 44.23 -129.86 200 1 GLU B 791 ? ? 66.84 71.03 201 1 PHE B 806 ? ? 55.50 14.10 202 1 LYS B 821 ? ? 46.26 22.46 203 1 THR B 836 ? ? -131.45 -43.08 204 1 MET B 840 ? ? 51.70 14.69 205 1 ASP B 863 ? ? -156.23 -17.24 206 1 LEU B 873 ? ? -124.60 -67.05 207 1 GLU B 875 ? ? 84.38 -55.26 208 1 ASN B 876 ? ? -151.72 -7.23 209 1 ASP B 878 ? ? -148.08 17.89 210 1 GLU B 879 ? ? -2.97 102.43 211 1 LEU B 880 ? ? 127.88 31.19 212 1 GLU B 881 ? ? 107.33 25.04 213 1 SER B 882 ? ? -92.86 43.49 214 1 THR B 883 ? ? -105.33 -72.20 215 1 ASN B 884 ? ? 36.11 -98.62 216 1 ARG B 886 ? ? 37.36 42.34 217 1 CYS B 892 ? ? -152.54 18.72 218 1 PHE B 895 ? ? -117.37 -151.92 219 1 THR B 898 ? ? 8.13 -86.96 220 1 THR B 901 ? ? 36.48 -169.67 221 1 ARG B 938 ? ? -65.62 1.39 222 1 GLN B 941 ? ? -90.97 48.98 223 1 ASP B 998 ? ? -162.60 105.69 224 1 ALA B 999 ? ? -97.98 39.82 225 1 VAL B 1006 ? ? 19.61 48.06 226 1 ASN B 1007 ? ? -35.65 -37.95 227 1 ASN B 1025 ? ? -39.85 151.10 228 1 HIS B 1053 ? ? -69.59 58.83 229 1 HIS B 1060 ? ? -170.91 149.72 230 1 ARG B 1064 ? ? 47.09 -120.43 231 1 ASN B 1071 ? ? -153.97 -17.08 232 1 ALA B 1099 ? ? -92.50 58.52 233 1 PHE B 1108 ? ? -146.12 -78.79 234 1 SER B 1111 ? ? -154.94 -55.12 235 1 MET B 1125 ? ? -81.42 34.26 236 1 ASN B 1129 ? ? 57.44 91.80 237 1 HIS B 1133 ? ? -139.13 -103.22 238 1 GLU B 1136 ? ? 41.00 101.39 239 1 THR B 1144 ? ? -132.60 -40.86 240 1 SER B 1164 ? ? -57.70 -6.02 241 1 MET B 1165 ? ? -148.90 44.56 242 1 SER B 1166 ? ? 52.80 133.96 243 1 ASN C 5 ? ? -66.26 -147.43 244 1 PRO C 7 ? ? -41.48 100.87 245 1 VAL C 58 ? ? -94.21 35.55 246 1 ILE C 74 ? ? -63.06 87.78 247 1 SER C 75 ? ? -91.01 40.59 248 1 ILE C 78 ? ? -59.42 104.24 249 1 GLU C 92 ? ? 54.27 -98.40 250 1 PRO C 125 ? ? -44.32 150.01 251 1 ARG C 126 ? ? -67.81 86.13 252 1 VAL C 127 ? ? -145.92 -13.09 253 1 ARG C 133 ? ? 55.28 72.49 254 1 ASN C 134 ? ? -129.86 -80.42 255 1 ASP C 138 ? ? 70.52 119.02 256 1 VAL C 143 ? ? 25.12 -67.17 257 1 ASP C 147 ? ? 59.09 -61.53 258 1 ASP C 187 ? ? 57.43 71.17 259 1 LEU C 211 ? ? -161.23 -24.49 260 1 ASP C 212 ? ? -116.52 60.52 261 1 GLU C 213 ? ? -44.45 -10.48 262 1 GLN C 217 ? ? 72.06 93.29 263 1 ALA C 218 ? 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? -62.27 -146.27 295 1 ASP H 67 ? ? 153.85 -27.37 296 1 LEU H 70 ? ? -147.92 44.86 297 1 ASN H 76 ? ? 53.46 78.91 298 1 PRO H 82 ? ? -71.08 22.37 299 1 SER H 83 ? ? -91.58 42.35 300 1 ALA H 85 ? ? -68.63 58.46 301 1 ILE H 99 ? ? -141.31 -19.55 302 1 GLU H 100 ? ? 58.39 -156.59 303 1 GLU H 103 ? ? -147.73 17.80 304 1 GLU H 107 ? ? 66.24 -66.08 305 1 ALA H 108 ? ? 46.54 -128.50 306 1 ALA H 109 ? ? 33.93 34.08 307 1 ARG H 111 ? ? 69.67 168.98 308 1 ASP H 128 ? ? -133.11 -45.18 309 1 HIS H 133 ? ? -140.59 -45.07 310 1 SER H 139 ? ? -165.93 28.01 311 1 LYS H 147 ? ? 62.45 -43.75 312 1 ALA H 149 ? ? 36.11 -145.16 313 1 TYR I 7 ? ? -105.15 79.59 314 1 VAL I 12 ? ? 64.93 109.74 315 1 ARG I 15 ? ? 174.13 26.97 316 1 PHE I 16 ? ? -34.42 -166.88 317 1 GLU I 19 ? ? -97.76 -65.23 318 1 ASP I 49 ? ? -91.96 -71.16 319 1 TYR I 54 ? ? -174.11 134.53 320 1 LYS I 57 ? ? 70.19 64.46 321 1 THR I 59 ? ? 59.86 -2.11 322 1 HIS I 60 ? ? -157.37 56.16 323 1 VAL I 62 ? ? -47.62 -19.53 324 1 GLN I 67 ? ? 59.09 -33.13 325 1 ILE I 68 ? 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RELION 1.4beta 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 0.3 _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 5IYB 'double helix' 5IYB 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 V DG 1 1_555 W DC 75 1_555 -0.522 -0.569 -1.515 -40.252 -37.347 10.026 1 X_DG0:DC93_Y X 0 ? 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