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ALA n 3 32 GLU n 3 33 GLY n 3 34 ILE n 3 35 TYR n 3 36 THR n 3 37 GLU n 3 38 GLY n 3 39 LEU n 3 40 MET n 3 41 HIS n 3 42 ASN n 3 43 GLN n 3 44 ASP n 3 45 GLY n 3 46 LEU n 3 47 ILE n 3 48 CYS n 3 49 GLY n 3 50 LEU n 3 51 ARG n 3 52 GLN n 3 53 LEU n 3 54 ALA n 3 55 ASN n 3 56 GLU n 3 57 THR n 3 58 THR n 3 59 GLN n 3 60 ALA n 3 61 LEU n 3 62 GLN n 3 63 LEU n 3 64 PHE n 3 65 LEU n 3 66 ARG n 3 67 ALA n 3 68 THR n 3 69 THR n 3 70 GLU n 3 71 LEU n 3 72 ARG n 3 73 THR n 3 74 PHE n 3 75 SER n 3 76 ILE n 3 77 LEU n 3 78 ASN n 3 79 ARG n 3 80 LYS n 3 81 ALA n 3 82 ILE n 3 83 ASP n 3 84 PHE n 3 85 LEU n 3 86 LEU n 3 87 GLN n 3 88 ARG n 3 89 TRP n 3 90 GLY n 3 91 GLY n 3 92 THR n 3 93 CYS n 3 94 HIS n 3 95 ILE n 3 96 LEU n 3 97 GLY n 3 98 PRO n 3 99 ASP n 3 100 CYS n 3 101 CYS n 3 102 ILE n 3 103 GLU n 3 104 PRO n 3 105 HIS n 3 106 ASP n 3 107 TRP n 3 108 THR n 3 109 LYS n 3 110 ASN n 3 111 ILE n 3 112 THR n 3 113 ASP n 3 114 LYS n 3 115 ILE n 3 116 ASP n 3 117 GLN n 3 118 ILE n 3 119 ILE n 3 120 HIS n 3 121 ASP n 3 122 PHE n 3 123 VAL n 3 124 ASP n 3 125 HIS n 3 126 HIS n 3 127 HIS n 3 128 HIS n 3 129 HIS n 3 130 HIS n # loop_ _entity_src_gen.entity_id _entity_src_gen.pdbx_src_id _entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag _entity_src_gen.pdbx_seq_type _entity_src_gen.pdbx_beg_seq_num _entity_src_gen.pdbx_end_seq_num _entity_src_gen.gene_src_common_name _entity_src_gen.gene_src_genus _entity_src_gen.pdbx_gene_src_gene _entity_src_gen.gene_src_species _entity_src_gen.gene_src_strain _entity_src_gen.gene_src_tissue _entity_src_gen.gene_src_tissue_fraction _entity_src_gen.gene_src_details _entity_src_gen.pdbx_gene_src_fragment _entity_src_gen.pdbx_gene_src_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_gene_src_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.pdbx_gene_src_variant _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell_line _entity_src_gen.pdbx_gene_src_atcc _entity_src_gen.pdbx_gene_src_organ _entity_src_gen.pdbx_gene_src_organelle _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cellular_location _entity_src_gen.host_org_common_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.host_org_genus _entity_src_gen.pdbx_host_org_gene _entity_src_gen.pdbx_host_org_organ _entity_src_gen.host_org_species _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 1278 Human ? 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Hi-5 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP NPC1_HUMAN O15118 ? 1 ;MTARGLALGLLLLLLCPAQVFSQSCVWYGECGIAYGDKRYNCEYSGPPKPLPKDGYDLVQELCPGFFFGNVSLCCDVRQL QTLKDNLQLPLQFLSRCPSCFYNLLNLFCELTCSPRQSQFLNVTATEDYVDPVTNQTKTNVKELQYYVGQSFANAMYNAC RDVEAPSSNDKALGLLCGKDADACNATNWIEYMFNKDNGQAPFTITPVFSDFPVHGMEPMNNATKGCDESVDEVTAPCSC QDCSIVCGPKPQPPPPPAPWTILGLDAMYVIMWITYMAFLLVFFGAFFAVWCYRKRYFVSEYTPIDSNIAFSVNASDKGE ASCCDPVSAAFEGCLRRLFTRWGSFCVRNPGCVIFFSLVFITACSSGLVFVRVTTNPVDLWSAPSSQARLEKEYFDQHFG PFFRTEQLIIRAPLTDKHIYQPYPSGADVPFGPPLDIQILHQVLDLQIAIENITASYDNETVTLQDICLAPLSPYNTNCT ILSVLNYFQNSHSVLDHKKGDDFFVYADYHTHFLYCVRAPASLNDTSLLHDPCLGTFGGPVFPWLVLGGYDDQNYNNATA LVITFPVNNYYNDTEKLQRAQAWEKEFINFVKNYKNPNLTISFTAERSIEDELNRESDSDVFTVVISYAIMFLYISLALG HMKSCRRLLVDSKVSLGIAGILIVLSSVACSLGVFSYIGLPLTLIVIEVIPFLVLAVGVDNIFILVQAYQRDERLQGETL DQQLGRVLGEVAPSMFLSSFSETVAFFLGALSVMPAVHTFSLFAGLAVFIDFLLQITCFVSLLGLDIKRQEKNRLDIFCC VRGAEDGTSVQASESCLFRFFKNSYSPLLLKDWMRPIVIAIFVGVLSFSIAVLNKVDIGLDQSLSMPDDSYMVDYFKSIS QYLHAGPPVYFVLEEGHDYTSSKGQNMVCGGMGCNNDSLVQQIFNAAQLDNYTRIGFAPSSWIDDYFDWVKPQSSCCRVD NITDQFCNASVVDPACVRCRPLTPEGKQRPQGGDFMRFLPMFLSDNPNPKCGKGGHAAYSSAVNILLGHGTRVGATYFMT YHTVLQTSADFIDALKKARLIASNVTETMGINGSAYRVFPYSVFYVFYEQYLTIIDDTIFNLGVSLGAIFLVTMVLLGCE LWSAVIMCATIAMVLVNMFGVMWLWGISLNAVSLVNLVMSCGISVEFCSHITRAFTVSMKGSRVERAEEALAHMGSSVFS GITLTKFGGIVVLAFAKSQIFQIFYFRMYLAMVLLGATHGLIFLPVLLSYIGPSVNKAKSCATEERYKGTERERLLNF ; 1 2 UNP VGP_EBOZ5 P87666 ? 2 ;SIPLGVIHNSTLQVSDVDKLVCRDKLSSTNQLRSVGLNLEGNGVATDVPSATKRWGFRSGVPPKVVNYEAGEWAENCYNL EIKKPDGSECLPAAPDGIRGFPRCRYVHKVSGTGPCAGDFAFHKEGAFFLYDRLASTVIYRGTTFAEGVVAFLILPQ ; 32 3 UNP VGP_EBOZ5 P87666 ? 3 ;PKCNPNLHYWTTQDEGAAIGLAWIPYFGPAAEGIYTEGLMHNQDGLICGLRQLANETTQALQLFLRATTELRTFSILNRK AIDFLLQRWGGTCHILGPDCCIEPHDWTKNITDKIDQIIHDFVD ; 509 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 5JNX A 1 ? 1278 ? O15118 1 ? 1278 ? 1 1278 2 2 5JNX C 2 ? 158 ? P87666 32 ? 188 ? 32 188 3 3 5JNX D 1 ? 124 ? P87666 509 ? 632 ? 509 632 4 2 5JNX E 2 ? 158 ? P87666 32 ? 188 ? 32 188 5 3 5JNX F 1 ? 124 ? P87666 509 ? 632 ? 509 632 6 2 5JNX G 2 ? 158 ? P87666 32 ? 188 ? 32 188 7 3 5JNX H 1 ? 124 ? P87666 509 ? 632 ? 509 632 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 2 5JNX ARG C 1 ? UNP P87666 ? ? 'expression tag' 31 1 2 5JNX VAL C 12 ? UNP P87666 THR 42 'engineered mutation' 42 2 3 5JNX HIS D 125 ? UNP P87666 ? ? 'expression tag' 633 3 3 5JNX HIS D 126 ? UNP P87666 ? ? 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'expression tag' 635 21 7 5JNX HIS H 128 ? UNP P87666 ? ? 'expression tag' 636 22 7 5JNX HIS H 129 ? UNP P87666 ? ? 'expression tag' 637 23 7 5JNX HIS H 130 ? UNP P87666 ? ? 'expression tag' 638 24 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BMA 'D-saccharide, beta linking' . beta-D-mannopyranose 'beta-D-mannose; D-mannose; mannose' 'C6 H12 O6' 180.156 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MAN 'D-saccharide, alpha linking' . alpha-D-mannopyranose 'alpha-D-mannose; D-mannose; mannose' 'C6 H12 O6' 180.156 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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L NAG 2 L BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale25 covale both ? L BMA . O6 ? ? ? 1_555 L MAN . C1 ? ? L BMA 3 L MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale26 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? M NAG 1 M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.624 ? ? covale27 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? N NAG 1 N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale28 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? ? covale29 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? P NAG 1 P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLY 248 A . ? GLY 248 A PRO 249 A ? PRO 249 A 1 0.02 2 PRO 377 A . ? PRO 377 A VAL 378 A ? VAL 378 A 1 0.03 3 TYR 423 A . ? TYR 423 A PRO 424 A ? PRO 424 A 1 0.03 4 SER 473 A . ? SER 473 A PRO 474 A ? PRO 474 A 1 -3.73 5 PHE 924 A . ? PHE 924 A ASN 925 A ? ASN 925 A 1 0.91 6 ASP 948 A . ? ASP 948 A TRP 949 A ? TRP 949 A 1 -2.92 7 GLU 985 A . ? GLU 985 A GLY 986 A ? GLY 986 A 1 -0.12 8 GLY 1034 A . ? GLY 1034 A ALA 1035 A ? ALA 1035 A 1 -0.75 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 7 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 3 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 7 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 3 ? AC1 ? 2 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 7 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 3 ? AC6 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? anti-parallel AB2 5 6 ? anti-parallel AB2 6 7 ? parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB7 4 5 ? anti-parallel AB7 5 6 ? anti-parallel AB7 6 7 ? parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC3 4 5 ? anti-parallel AC3 5 6 ? anti-parallel AC3 6 7 ? parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC6 1 2 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 TRP A 27 ? TYR A 35 ? TRP A 27 TYR A 35 AA1 2 LYS A 38 ? GLU A 43 ? LYS A 38 GLU A 43 AA2 1 LYS A 49 ? PRO A 50 ? LYS A 49 PRO A 50 AA2 2 SER A 72 ? LEU A 73 ? SER A 72 LEU A 73 AA3 1 LEU A 121 ? VAL A 130 ? LEU A 121 VAL A 130 AA3 2 THR A 137 ? VAL A 148 ? THR A 137 VAL A 148 AA3 3 THR A 204 ? PHE A 209 ? THR A 204 PHE A 209 AA4 1 LEU A 547 ? GLY A 548 ? LEU A 547 GLY A 548 AA4 2 ALA A 560 ? VAL A 567 ? ALA A 560 VAL A 567 AA4 3 ARG A 404 ? ARG A 411 ? ARG A 404 ARG A 411 AA4 4 THR A 600 ? SER A 602 ? THR A 600 SER A 602 AA5 1 HIS A 418 ? ILE A 419 ? HIS A 418 ILE A 419 AA5 2 PRO A 430 ? PHE A 431 ? PRO A 430 PHE A 431 AA6 1 THR A 454 ? TYR A 457 ? THR A 454 TYR A 457 AA6 2 GLU A 460 ? THR A 463 ? GLU A 460 THR A 463 AA7 1 LYS A 499 ? GLY A 500 ? LYS A 499 GLY A 500 AA7 2 VAL A 505 ? ALA A 507 ? VAL A 505 ALA A 507 AA8 1 ASN A 915 ? ASN A 916 ? ASN A 915 ASN A 916 AA8 2 LEU A 919 ? VAL A 920 ? LEU A 919 VAL A 920 AA9 1 ASP A 944 ? ASP A 945 ? ASP A 944 ASP A 945 AA9 2 SER A 954 ? SER A 955 ? SER A 954 SER A 955 AB1 1 LEU B 13 ? SER B 16 ? LEU C 43 SER C 46 AB1 2 LEU B 5 ? ILE B 8 ? LEU C 35 ILE C 38 AB1 3 ALA B 147 ? ILE B 155 ? ALA C 177 ILE C 185 AB1 4 LEU B 33 ? ASN B 39 ? LEU C 63 ASN C 69 AB2 1 LEU B 13 ? SER B 16 ? LEU C 43 SER C 46 AB2 2 LEU B 5 ? ILE B 8 ? LEU C 35 ILE C 38 AB2 3 ALA B 147 ? ILE B 155 ? ALA C 177 ILE C 185 AB2 4 PHE B 129 ? LEU B 131 ? PHE C 159 LEU C 161 AB2 5 LEU B 135 ? SER B 137 ? LEU C 165 SER C 167 AB2 6 VAL B 66 ? ASN B 68 ? VAL C 96 ASN C 98 AB2 7 ARG C 72 ? THR C 73 ? ARG D 580 THR D 581 AB3 1 TRP B 56 ? ARG B 59 ? TRP C 86 ARG C 89 AB3 2 PHE B 121 ? HIS B 124 ? PHE C 151 HIS C 154 AB4 1 ALA B 71 ? GLU B 73 ? ALA C 101 GLU C 103 AB4 2 LEU C 7 ? THR C 12 ? LEU D 515 THR D 520 AB4 3 TYR C 35 ? MET C 40 ? TYR D 543 MET D 548 AB5 1 ALA B 75 ? LYS B 84 ? ALA C 105 LYS C 114 AB5 2 CYS B 105 ? THR B 114 ? CYS C 135 THR C 144 AB6 1 LEU D 13 ? SER D 16 ? LEU E 43 SER E 46 AB6 2 LEU D 5 ? ILE D 8 ? LEU E 35 ILE E 38 AB6 3 ALA D 147 ? ILE D 155 ? ALA E 177 ILE E 185 AB6 4 LEU D 33 ? ASN D 39 ? LEU E 63 ASN E 69 AB7 1 LEU D 13 ? SER D 16 ? LEU E 43 SER E 46 AB7 2 LEU D 5 ? ILE D 8 ? LEU E 35 ILE E 38 AB7 3 ALA D 147 ? ILE D 155 ? ALA E 177 ILE E 185 AB7 4 PHE D 129 ? LEU D 131 ? PHE E 159 LEU E 161 AB7 5 LEU D 135 ? SER D 137 ? LEU E 165 SER E 167 AB7 6 VAL D 66 ? ASN D 68 ? VAL E 96 ASN E 98 AB7 7 ARG E 72 ? THR E 73 ? ARG F 580 THR F 581 AB8 1 TRP D 56 ? ARG D 59 ? TRP E 86 ARG E 89 AB8 2 PHE D 121 ? HIS D 124 ? PHE E 151 HIS E 154 AB9 1 ALA D 71 ? GLU D 73 ? ALA E 101 GLU E 103 AB9 2 LEU E 7 ? THR E 12 ? LEU F 515 THR F 520 AB9 3 TYR E 35 ? MET E 40 ? TYR F 543 MET F 548 AC1 1 ALA D 75 ? LYS D 84 ? ALA E 105 LYS E 114 AC1 2 CYS D 105 ? THR D 114 ? CYS E 135 THR E 144 AC2 1 LEU F 13 ? SER F 16 ? LEU G 43 SER G 46 AC2 2 LEU F 5 ? ILE F 8 ? LEU G 35 ILE G 38 AC2 3 ALA F 147 ? ILE F 155 ? ALA G 177 ILE G 185 AC2 4 LEU F 33 ? ASN F 39 ? LEU G 63 ASN G 69 AC3 1 LEU F 13 ? SER F 16 ? LEU G 43 SER G 46 AC3 2 LEU F 5 ? ILE F 8 ? 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N ALA A 34 O LYS A 38 ? O LYS A 38 AA2 1 2 N LYS A 49 ? N LYS A 49 O LEU A 73 ? O LEU A 73 AA3 1 2 N TYR A 129 ? N TYR A 129 O LYS A 138 ? O LYS A 138 AA3 2 3 N VAL A 148 ? N VAL A 148 O VAL A 208 ? O VAL A 208 AA4 1 2 N GLY A 548 ? N GLY A 548 O ALA A 560 ? O ALA A 560 AA4 2 3 O LEU A 561 ? O LEU A 561 N ILE A 410 ? N ILE A 410 AA4 3 4 N ARG A 411 ? N ARG A 411 O THR A 600 ? O THR A 600 AA5 1 2 N HIS A 418 ? N HIS A 418 O PHE A 431 ? O PHE A 431 AA6 1 2 N ALA A 455 ? N ALA A 455 O VAL A 462 ? O VAL A 462 AA7 1 2 N LYS A 499 ? N LYS A 499 O TYR A 506 ? O TYR A 506 AA8 1 2 N ASN A 916 ? N ASN A 916 O LEU A 919 ? O LEU A 919 AA9 1 2 N ASP A 945 ? N ASP A 945 O SER A 954 ? O SER A 954 AB1 1 2 O GLN B 14 ? O GLN C 44 N VAL B 7 ? N VAL C 37 AB1 2 3 N GLY B 6 ? N GLY C 36 O PHE B 153 ? O PHE C 183 AB1 3 4 O LEU B 154 ? O LEU C 184 N ARG B 34 ? N ARG C 64 AB2 1 2 O GLN B 14 ? O GLN C 44 N VAL B 7 ? N VAL C 37 AB2 2 3 N GLY B 6 ? N GLY C 36 O PHE B 153 ? O PHE C 183 AB2 3 4 O ALA B 147 ? O ALA C 177 N LEU B 131 ? N LEU C 161 AB2 4 5 N PHE B 130 ? N PHE C 160 O SER B 137 ? O SER C 167 AB2 5 6 O ALA B 136 ? O ALA C 166 N VAL B 67 ? N VAL C 97 AB2 6 7 N VAL B 66 ? N VAL C 96 O THR C 73 ? O THR D 581 AB3 1 2 N GLY B 57 ? N GLY C 87 O PHE B 123 ? O PHE C 153 AB4 1 2 N GLY B 72 ? N GLY C 102 O TRP C 10 ? O TRP D 518 AB4 2 3 N THR C 11 ? N THR D 519 O THR C 36 ? O THR D 544 AB5 1 2 N ALA B 75 ? N ALA C 105 O ARG B 106 ? O ARG C 136 AB6 1 2 O GLN D 14 ? O GLN E 44 N VAL D 7 ? N VAL E 37 AB6 2 3 N GLY D 6 ? N GLY E 36 O PHE D 153 ? O PHE E 183 AB6 3 4 O LEU D 154 ? O LEU E 184 N ARG D 34 ? N ARG E 64 AB7 1 2 O GLN D 14 ? O GLN E 44 N VAL D 7 ? N VAL E 37 AB7 2 3 N GLY D 6 ? N GLY E 36 O PHE D 153 ? O PHE E 183 AB7 3 4 O ALA D 147 ? O ALA E 177 N LEU D 131 ? N LEU E 161 AB7 4 5 N PHE D 130 ? N PHE E 160 O SER D 137 ? O SER E 167 AB7 5 6 O ALA D 136 ? O ALA E 166 N VAL D 67 ? N VAL E 97 AB7 6 7 N VAL D 66 ? N VAL E 96 O THR E 73 ? O THR F 581 AB8 1 2 N GLY D 57 ? N GLY E 87 O PHE D 123 ? O PHE E 153 AB9 1 2 N GLY D 72 ? N GLY E 102 O TRP E 10 ? O TRP F 518 AB9 2 3 N THR E 11 ? N THR F 519 O THR E 36 ? O THR F 544 AC1 1 2 N ALA D 75 ? N ALA E 105 O ARG D 106 ? O ARG E 136 AC2 1 2 O GLN F 14 ? O GLN G 44 N VAL F 7 ? N VAL G 37 AC2 2 3 N GLY F 6 ? N GLY G 36 O PHE F 153 ? O PHE G 183 AC2 3 4 O LEU F 154 ? O LEU G 184 N ARG F 34 ? N ARG G 64 AC3 1 2 O GLN F 14 ? O GLN G 44 N VAL F 7 ? N VAL G 37 AC3 2 3 N GLY F 6 ? N GLY G 36 O PHE F 153 ? O PHE G 183 AC3 3 4 O ALA F 147 ? O ALA G 177 N LEU F 131 ? N LEU G 161 AC3 4 5 N PHE F 130 ? N PHE G 160 O SER F 137 ? O SER G 167 AC3 5 6 O ALA F 136 ? O ALA G 166 N VAL F 67 ? N VAL G 97 AC3 6 7 N VAL F 66 ? N VAL G 96 O THR G 73 ? O THR H 581 AC4 1 2 N GLY F 57 ? N GLY G 87 O PHE F 123 ? O PHE G 153 AC5 1 2 N GLY F 72 ? N GLY G 102 O TRP G 10 ? O TRP H 518 AC5 2 3 N THR G 11 ? N THR H 519 O THR G 36 ? O THR H 544 AC6 1 2 N ALA F 75 ? N ALA G 105 O ARG F 106 ? 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G GLY 16 235 1 Y 1 H GLY 599 ? G GLY 91 236 1 Y 1 H THR 600 ? G THR 92 237 1 Y 1 H CYS 601 ? G CYS 93 238 1 Y 1 H HIS 602 ? G HIS 94 239 1 Y 1 H ILE 603 ? G ILE 95 240 1 Y 1 H LEU 604 ? G LEU 96 241 1 Y 1 H GLY 605 ? G GLY 97 242 1 Y 1 H PRO 606 ? G PRO 98 243 1 Y 1 H ASP 607 ? G ASP 99 244 1 Y 1 H CYS 608 ? G CYS 100 245 1 Y 1 H CYS 609 ? G CYS 101 246 1 Y 1 H ILE 610 ? G ILE 102 247 1 Y 1 H GLU 611 ? G GLU 103 248 1 Y 1 H PRO 612 ? G PRO 104 249 1 Y 1 H HIS 613 ? G HIS 105 250 1 Y 1 H ASP 614 ? G ASP 106 251 1 Y 1 H TRP 615 ? G TRP 107 252 1 Y 1 H THR 616 ? G THR 108 253 1 Y 1 H LYS 617 ? G LYS 109 254 1 Y 1 H ASN 618 ? G ASN 110 255 1 Y 1 H ILE 619 ? G ILE 111 256 1 Y 1 H THR 620 ? G THR 112 257 1 Y 1 H ASP 621 ? G ASP 113 258 1 Y 1 H LYS 622 ? G LYS 114 259 1 Y 1 H ILE 623 ? G ILE 115 260 1 Y 1 H ASP 624 ? G ASP 116 261 1 Y 1 H GLN 625 ? G GLN 117 262 1 Y 1 H ILE 626 ? G ILE 118 263 1 Y 1 H ILE 627 ? G ILE 119 264 1 Y 1 H HIS 628 ? G HIS 120 265 1 Y 1 H ASP 629 ? 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'Ebola virus - Zaire (1995)' ? ? # loop_ _em_entity_assembly_recombinant.id _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id _em_entity_assembly_recombinant.cell _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_recombinant.organism _em_entity_assembly_recombinant.plasmid _em_entity_assembly_recombinant.strain 2 2 ? 9606 'Homo sapiens' pCAG ? 3 3 ? 266783 'Insect cell expression vector pTIE1' ? ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 50 _em_image_recording.average_exposure_time 8 _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode SUPER-RESOLUTION _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images 1379 # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details ? _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 703336 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? 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RELION 1.4 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 15 _em_specimen.details '25 mM Tris pH 8.0, 150 mM NaCl and 0.1% digitonin' _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'Ministry of Science and Technology of China' China '2015CB9101012014, ZX09507003006' 1 'National Natural Science Foundation of China' China 'project 31321062 and 81590761' 2 'President Foundation of Chinese Academy of Sciences and Strategic Priority Research Program of the Chinese Academy of Sciences' China XDB08020100 3 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero H 4 NAG 1 B NAG 1 A NAG 1301 n H 4 NAG 2 B NAG 2 A NAG 1302 n I 4 NAG 1 I NAG 1 A NAG 1304 n I 4 NAG 2 I NAG 2 A NAG 1305 n J 5 NAG 1 J NAG 1 A NAG 1306 n J 5 NAG 2 J NAG 2 A NAG 1307 n J 5 BMA 3 J BMA 3 A BMA 1308 n K 4 NAG 1 K NAG 1 A NAG 1310 n K 4 NAG 2 K NAG 2 A NAG 1311 n L 6 NAG 1 L NAG 1 A NAG 1312 n L 6 NAG 2 L NAG 2 A NAG 1313 n L 6 BMA 3 L BMA 3 A BMA 1314 n L 6 MAN 4 L MAN 4 A MAN 1315 n M 4 NAG 1 M NAG 1 A NAG 1319 n M 4 NAG 2 M NAG 2 A NAG 1318 n N 4 NAG 1 N NAG 1 D NAG 701 n N 4 NAG 2 N NAG 2 D NAG 702 n O 4 NAG 1 O NAG 1 F NAG 701 n O 4 NAG 2 O NAG 2 F NAG 702 n P 4 NAG 1 P NAG 1 H NAG 701 n P 4 NAG 2 P NAG 2 H NAG 702 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier BMA 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpb BMA 'COMMON NAME' GMML 1.0 b-D-mannopyranose BMA 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-Manp BMA 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man MAN 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpa MAN 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-D-mannopyranose MAN 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-Manp MAN 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 4 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 4 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 4 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? 4 5 DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 5 5 'WURCS=2.0/2,3,2/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5]/1-1-2/a4-b1_b4-c1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 6 5 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{}}}}' LINUCS PDB-CARE ? 7 6 DManpa1-6DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 8 6 'WURCS=2.0/3,4,3/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3/a4-b1_b4-c1_c6-d1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 9 6 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(6+1)][a-D-Manp]{}}}}}' LINUCS PDB-CARE ? # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 4 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 5 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 3 5 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 4 6 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 5 6 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 6 6 4 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 4 NAG 1 n 4 NAG 2 n 5 NAG 1 n 5 NAG 2 n 5 BMA 3 n 6 NAG 1 n 6 NAG 2 n 6 BMA 3 n 6 MAN 4 n # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 7 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG #