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F LYS 3 F VAL 510 0 ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 ? 2 ? 3 ? 4 ? 5 ? 6 ? # _struct.entry_id 5KS8 _struct.title 'Crystal structure of two-subunit pyruvate carboxylase from Methylobacillus flagellatus' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 5KS8 _struct_keywords.text 'Biotin, Ligase, TIM Barrel, Pyruvate' _struct_keywords.pdbx_keywords LIGASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 2 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 4 ? K N N 5 ? L N N 5 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP Q1H158_METFK Q1H158 ? 1 ;MIKKILIANRGEIAVRIVRACSEMGIKSVAIYSDADRHALHVKKADEAYNIGSDPVLGYLNAHNIVNLAVASGCDALHPG YGFLSENPELAEICARRGIKFIGPDAKVIRQMGDKIQARTAMIKAGIPCV ; 1 2 UNP Q1H158_METFK Q1H158 ? 1 ;VVNPRHIEVQVLADSHGNVIHLFERDCSIQRRNQKLIEIAPSPQLSKAQREYIGNLAVKAAKAVGYKNAGTVEFLLDSDN NFYFMEMNTRLQVEHTVTEQITGIDIVQEQIRVADGQRLQYKQSEVQYRGFAMEFRINAEDPKNDFLPSFGKITRYYAPG GPGIRMDAAMYSGYVIPPYYDSMCAKLTVWALNWESVVERGRRALNDTVVYGVKTTIPYYQEILKHPDFRNAIFNTSFVE SHPELANYATQFPRELVAAAISAAIAAHEGI ; 202 3 UNP Q1H157_METFK Q1H157 ? 2 ;MAKVHVTDVVLRDGHQSLIATRMRTDDMLPICSKLDAVGYWSLEAWGGATFDACVRYLREDPWERLKKLRKALPNSRLQM LLRGQNLLGYRHYSDDVVRAFVQKSADNGIDVFRIFDAMNDLRNLKVSIESVKAVGKHAEGTISYTTSPVHDIPYFVNLA KELESFGCDTIAIKDMASLLTPQVTGDLVKALREAVSLPIHLHAHATSGLASMSIQRAVDNGVAIVDGCISSFAEGASLP ATESIVAALKGTEYDTGLDIGLLQEISAYFREVRKKYWQFESEFTGVDTRVLVNQVPGGMISNLSNQLKEQGALDRMDAV LDEIPRVREDLGYPPLVTPTSQIVGTQAVLNVMTGARYKSVTNEVKNYLLGHYGKAPSTVNPDVRNLAVGNAQVIECRPA DLLTAEMEKLRNEVEGLAKSEEDVLTYAMFPDLAKTFLQERNAGSLKPEPLLDKEAVTSRESHSRFAPTEFNVTLHGETF HIKLTGSGHHGEEQRPFYVSVDGVTEEVVVEILNEIEVSGGGQSSGEAKRKASSAASSGRPRPTHAGCVTTAMPGTIVDV KVNVGDKVSAGDAVLVIEAMKMENEIQASKSGVVVAINVKKGDSVTPDEALLEIQPD ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 5KS8 A 1 ? 130 ? Q1H158 1 ? 130 ? 1 130 2 2 5KS8 A 135 ? 405 ? Q1H158 202 ? 472 ? 202 472 3 1 5KS8 B 1 ? 130 ? Q1H158 1 ? 130 ? 1 130 4 2 5KS8 B 135 ? 405 ? Q1H158 202 ? 472 ? 202 472 5 3 5KS8 C 1 ? 617 ? Q1H157 1 ? 617 ? 1 617 6 3 5KS8 D 1 ? 617 ? Q1H157 1 ? 617 ? 1 617 7 3 5KS8 E 1 ? 617 ? Q1H157 1 ? 617 ? 1 617 8 3 5KS8 F 1 ? 617 ? Q1H157 1 ? 617 ? 1 617 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 5KS8 GLY A 131 ? UNP Q1H158 ? ? linker 131 1 1 5KS8 SER A 132 ? UNP Q1H158 ? ? linker 132 2 1 5KS8 SER A 133 ? UNP Q1H158 ? ? linker 200 3 1 5KS8 GLY A 134 ? UNP Q1H158 ? ? linker 201 4 3 5KS8 GLY B 131 ? UNP Q1H158 ? ? linker 131 5 3 5KS8 SER B 132 ? UNP Q1H158 ? ? linker 132 6 3 5KS8 SER B 133 ? UNP Q1H158 ? ? linker 200 7 3 5KS8 GLY B 134 ? UNP Q1H158 ? ? linker 201 8 5 5KS8 ALA C 419 ? UNP Q1H157 LYS 419 conflict 419 9 5 5KS8 ALA C 421 ? UNP Q1H157 GLU 421 conflict 421 10 5 5KS8 ALA C 422 ? UNP Q1H157 GLU 422 conflict 422 11 6 5KS8 ALA D 419 ? UNP Q1H157 LYS 419 conflict 419 12 6 5KS8 ALA D 421 ? UNP Q1H157 GLU 421 conflict 421 13 6 5KS8 ALA D 422 ? UNP Q1H157 GLU 422 conflict 422 14 7 5KS8 ALA E 419 ? UNP Q1H157 LYS 419 conflict 419 15 7 5KS8 ALA E 421 ? UNP Q1H157 GLU 421 conflict 421 16 7 5KS8 ALA E 422 ? UNP Q1H157 GLU 422 conflict 422 17 8 5KS8 ALA F 419 ? UNP Q1H157 LYS 419 conflict 419 18 8 5KS8 ALA F 421 ? UNP Q1H157 GLU 421 conflict 421 19 8 5KS8 ALA F 422 ? UNP Q1H157 GLU 422 conflict 422 20 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 23880 ? 1 MORE -122 ? 1 'SSA (A^2)' 112480 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ARG A 10 ? GLY A 25 ? ARG A 10 GLY A 25 1 ? 16 HELX_P HELX_P2 AA2 ASP A 34 ? HIS A 38 ? ASP A 34 HIS A 38 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 AA3 ALA A 39 ? ALA A 45 ? ALA A 39 ALA A 45 1 ? 7 HELX_P HELX_P4 AA4 ASN A 61 ? GLY A 73 ? ASN A 61 GLY A 73 1 ? 13 HELX_P HELX_P5 AA5 ASN A 87 ? GLY A 98 ? ASN A 87 GLY A 98 1 ? 12 HELX_P HELX_P6 AA6 ASP A 105 ? ASP A 114 ? ASP A 105 ASP A 114 1 ? 10 HELX_P HELX_P7 AA7 ASP A 114 ? ALA A 125 ? ASP A 114 ALA A 125 1 ? 12 HELX_P HELX_P8 AA8 SER A 180 ? VAL A 198 ? SER A 247 VAL A 265 1 ? 19 HELX_P HELX_P9 AA9 GLU A 228 ? GLY A 237 ? GLU A 295 GLY A 304 1 ? 10 HELX_P HELX_P10 AB1 ASP A 239 ? ASP A 249 ? ASP A 306 ASP A 316 1 ? 11 HELX_P HELX_P11 AB2 LYS A 256 ? VAL A 260 ? LYS A 323 VAL A 327 5 ? 5 HELX_P HELX_P12 AB3 PRO A 276 ? ASP A 279 ? PRO A 343 ASP A 346 5 ? 4 HELX_P HELX_P13 AB4 ASN A 327 ? THR A 342 ? ASN A 394 THR A 409 1 ? 16 HELX_P HELX_P14 AB5 THR A 350 ? HIS A 360 ? THR A 417 HIS A 427 1 ? 11 HELX_P HELX_P15 AB6 HIS A 360 ? ALA A 366 ? 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PRO B 343 ASP B 346 5 ? 4 HELX_P HELX_P30 AD3 ASN B 327 ? THR B 342 ? ASN B 394 THR B 409 1 ? 16 HELX_P HELX_P31 AD4 THR B 350 ? HIS B 360 ? THR B 417 HIS B 427 1 ? 11 HELX_P HELX_P32 AD5 HIS B 360 ? ALA B 366 ? HIS B 427 ALA B 433 1 ? 7 HELX_P HELX_P33 AD6 HIS B 376 ? ASN B 381 ? HIS B 443 ASN B 448 5 ? 6 HELX_P HELX_P34 AD7 PRO B 387 ? GLU B 403 ? PRO B 454 GLU B 470 1 ? 17 HELX_P HELX_P35 AD8 ARG C 12 ? ILE C 19 ? ARG C 12 ILE C 19 1 ? 8 HELX_P HELX_P36 AD9 ILE C 31 ? VAL C 38 ? ILE C 31 VAL C 38 1 ? 8 HELX_P HELX_P37 AE1 ALA C 49 ? TYR C 57 ? ALA C 49 TYR C 57 1 ? 9 HELX_P HELX_P38 AE2 ASP C 61 ? LEU C 73 ? ASP C 61 LEU C 73 1 ? 13 HELX_P HELX_P39 AE3 ARG C 83 ? LEU C 87 ? ARG C 83 LEU C 87 5 ? 5 HELX_P HELX_P40 AE4 SER C 94 ? GLY C 109 ? SER C 94 GLY C 109 1 ? 16 HELX_P HELX_P41 AE5 ASP C 121 ? ASN C 124 ? ASP C 121 ASN C 124 5 ? 4 HELX_P HELX_P42 AE6 LEU C 125 ? VAL C 135 ? LEU C 125 VAL C 135 1 ? 11 HELX_P HELX_P43 AE7 ASP C 152 ? PHE C 166 ? ASP C 152 PHE C 166 1 ? 15 HELX_P HELX_P44 AE8 THR C 181 ? VAL C 196 ? THR C 181 VAL C 196 1 ? 16 HELX_P HELX_P45 AE9 LEU C 210 ? ASN C 221 ? LEU C 210 ASN C 221 1 ? 12 HELX_P HELX_P46 AF1 ILE C 230 ? ALA C 234 ? ILE C 230 ALA C 234 5 ? 5 HELX_P HELX_P47 AF2 ALA C 241 ? ALA C 248 ? ALA C 241 ALA C 248 1 ? 8 HELX_P HELX_P48 AF3 ASP C 259 ? TYR C 277 ? ASP C 259 TYR C 277 1 ? 19 HELX_P HELX_P49 AF4 TRP C 278 ? GLU C 281 ? TRP C 278 GLU C 281 5 ? 4 HELX_P HELX_P50 AF5 ASP C 288 ? VAL C 293 ? ASP C 288 VAL C 293 5 ? 6 HELX_P HELX_P51 AF6 GLY C 299 ? GLN C 311 ? GLY C 299 GLN C 311 1 ? 13 HELX_P HELX_P52 AF7 ALA C 313 ? ASP C 315 ? ALA C 313 ASP C 315 5 ? 3 HELX_P HELX_P53 AF8 ARG C 316 ? LEU C 331 ? ARG C 316 LEU C 331 1 ? 16 HELX_P HELX_P54 AF9 PRO C 339 ? GLY C 355 ? PRO C 339 GLY C 355 1 ? 17 HELX_P HELX_P55 AG1 THR C 362 ? LEU C 370 ? THR C 362 LEU C 370 1 ? 9 HELX_P HELX_P56 AG2 ASN C 381 ? GLY C 390 ? ASN C 381 GLY C 390 1 ? 10 HELX_P HELX_P57 AG3 ARG C 398 ? LEU C 403 ? ARG C 398 LEU C 403 5 ? 6 HELX_P HELX_P58 AG4 GLU C 406 ? VAL C 414 ? GLU C 406 VAL C 414 1 ? 9 HELX_P HELX_P59 AG5 SER C 420 ? PHE C 430 ? SER C 420 PHE C 430 1 ? 11 HELX_P HELX_P60 AG6 PHE C 430 ? ALA C 443 ? PHE C 430 ALA C 443 1 ? 14 HELX_P HELX_P61 AG7 ASP C 453 ? HIS C 463 ? ASP C 453 HIS C 463 1 ? 11 HELX_P HELX_P62 AG8 ARG D 12 ? ILE D 19 ? ARG D 12 ILE D 19 1 ? 8 HELX_P HELX_P63 AG9 ILE D 31 ? VAL D 38 ? ILE D 31 VAL D 38 1 ? 8 HELX_P HELX_P64 AH1 ALA D 49 ? TYR D 57 ? ALA D 49 TYR D 57 1 ? 9 HELX_P HELX_P65 AH2 ASP D 61 ? LEU D 73 ? ASP D 61 LEU D 73 1 ? 13 HELX_P HELX_P66 AH3 ARG D 83 ? LEU D 87 ? ARG D 83 LEU D 87 5 ? 5 HELX_P HELX_P67 AH4 SER D 94 ? ASN D 108 ? SER D 94 ASN D 108 1 ? 15 HELX_P HELX_P68 AH5 ASP D 121 ? ASN D 124 ? ASP D 121 ASN D 124 5 ? 4 HELX_P HELX_P69 AH6 LEU D 125 ? VAL D 135 ? LEU D 125 VAL D 135 1 ? 11 HELX_P HELX_P70 AH7 ASP D 152 ? PHE D 166 ? ASP D 152 PHE D 166 1 ? 15 HELX_P HELX_P71 AH8 THR D 181 ? VAL D 196 ? 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GLU D 406 VAL D 414 1 ? 9 HELX_P HELX_P86 AJ5 SER D 420 ? PHE D 430 ? SER D 420 PHE D 430 1 ? 11 HELX_P HELX_P87 AJ6 PHE D 430 ? ALA D 443 ? PHE D 430 ALA D 443 1 ? 14 HELX_P HELX_P88 AJ7 SER D 459 ? SER D 464 ? SER D 459 SER D 464 1 ? 6 HELX_P HELX_P89 AJ8 ARG E 12 ? ILE E 19 ? ARG E 12 ILE E 19 1 ? 8 HELX_P HELX_P90 AJ9 ILE E 31 ? VAL E 38 ? ILE E 31 VAL E 38 1 ? 8 HELX_P HELX_P91 AK1 ALA E 49 ? TYR E 57 ? ALA E 49 TYR E 57 1 ? 9 HELX_P HELX_P92 AK2 ASP E 61 ? LEU E 73 ? ASP E 61 LEU E 73 1 ? 13 HELX_P HELX_P93 AK3 ARG E 83 ? LEU E 87 ? ARG E 83 LEU E 87 5 ? 5 HELX_P HELX_P94 AK4 SER E 94 ? ASN E 108 ? SER E 94 ASN E 108 1 ? 15 HELX_P HELX_P95 AK5 ASP E 121 ? ASN E 124 ? ASP E 121 ASN E 124 5 ? 4 HELX_P HELX_P96 AK6 LEU E 125 ? VAL E 135 ? LEU E 125 VAL E 135 1 ? 11 HELX_P HELX_P97 AK7 ASP E 152 ? PHE E 166 ? ASP E 152 PHE E 166 1 ? 15 HELX_P HELX_P98 AK8 THR E 181 ? VAL E 196 ? THR E 181 VAL E 196 1 ? 16 HELX_P HELX_P99 AK9 LEU E 210 ? ASN E 221 ? 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PHE F 430 GLY F 444 1 ? 15 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale none ? 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