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; ;MPPVPIYVKGGVWTNVEDQILKAAVQKYGTHQWSKVASLLQKKTARQSELRWNEYLNPKLNFTEFSKEEDAQLLDLAREL PNQWRTIADMMARPAQVCVERYNRLLESEDSGGAALSTGVTDLKAGDINPNAETQMARPDNGDLEDEEKEMLAEARARLL NTQGKKATRKIRERMLEESKRIAELQKRRELKQAGINVAIKKPKKKYGTDIDYNEDIVYEQAPMPGIYDTSTEDRQIKKK FEQFERKVNRKGLDGNKDKPSKKNKDKKRKHDENEHVEKAALGESTTLTDEYKKPKLILSAPGTKQGKVTYKKKLESKRQ KLIEAQATGTVLTPKELLPHDSGQEDNERSNIKSGKQLKSRIRKFLVQMFASLPSPKNDFEIVLSEDEKEEDAEIAEYEK EFENERAMNEEDNFIEPPSQNDAPRVSLVAVPLAYSTLPIPEFKNNPQSAIDNKYNLLVANAINKEPHMVPEDTVDFLKE VESRMQHITQGRTSMKIQFKTAMPPTEVLLESIQSKVESIEQLQRKLQHVQPLEQQNNEMCSTLCHHSLPALIEGQRKYY ADYYAYRQEIRSLEGRRKRLQAMLNSSSSI ; O ? 19 'polypeptide(L)' no no ;MTTSHRPQLEARSGAKAAAYTPTGIEHARLLPGHTTLKYRKFKEEENLKANCAQEDRNNDKSLEEVVVNEEKQDVVGSGN LQETRSEKDQKDSLQELLVTQKNKVEDKAELEGNEQLKGGNSSRRSWRKGTAFGRHKVTKETNIKEHATKKSASGYINDM TKSEYHQEFLHKHVR ; ;MTTSHRPQLEARSGAKAAAYTPTGIEHARLLPGHTTLKYRKFKEEENLKANCAQEDRNNDKSLEEVVVNEEKQDVVGSGN LQETRSEKDQKDSLQELLVTQKNKVEDKAELEGNEQLKGGNSSRRSWRKGTAFGRHKVTKETNIKEHATKKSASGYINDM TKSEYHQEFLHKHVR ; P ? 20 'polypeptide(L)' no no ;MSYNGIGLKSAKGSSTSGHVQRSLASNNRRRPQGSQQQRQQRQNAIKKASHDKASRPLAVQKQIETHMEKREIEVQVSEL RDRLEEEETLSEEQIDKKCEALRAKLTNEWQEQQRMSSLYTPRKARLTEEQHRHE ; ;MSYNGIGLKSAKGSSTSGHVQRSLASNNRRRPQGSQQQRQQRQNAIKKASHDKASRPLAVQKQIETHMEKREIEVQVSEL RDRLEEEETLSEEQIDKKCEALRAKLTNEWQEQQRMSSLYTPRKARLTEEQHRHE ; R ? 21 'polypeptide(L)' no no ;MDTLEPTAVDTHVSAEQILRDVYKKGQKARGSTNIDILDLEELREYQRRKRTEYEGYLKRNRLDMGQWIRYAQFEIEQHD MRRARSIFERALLVDSSFIPLWIRYIDAELKVKCINHARNLMNRAISTLPRVDKLWYKYLIVEESLNNVEIVRSLYTKWC SLEPGVNAWNSFVDFEIRQKNWNGVREIYSKYVMAHPQMQTWLKWVRFENRHGNTEFTRSVYSLAIDTVANLQNLQIWSD MEVAKLVNSFAHWEAAQQEYERSSALYQIAIEKWPSNQLLKAGLLDFEKQFGDINSIEETISYKRKMEYETILSNNAYDY DTWWLYLDLISESFPKQIMQTFEKAIVDSRPKELSKNVQWKRYIYLWMRYICYVELELENSLLEEELFQRLIDDIIPHKH FTFSKIWLMYAKFLIRHDDVPKARKILGKAIGLCPKAKTFKGYIELEVKLKEFDRVRKIYEKFIEFQPSDLQIWSQYGEL EENLGDWDRVRGIYTIALDENSDFLTKEAKIVLLQKYITFETESQEFEKARKLYRRYLELNQYSPQSWIEFAMYQTSTPT EQQLLDLAKLQSENVDEDIEFEITDENKLEARKVFEEAIVFFKEKDDKQGRLSILEALKDYEETYGTELDQETVKKRFPK VIKKVRLQNGVEEEFVDYIFPDDIDDDKPKPSKFLELAKKWKQEQAL ; ;MDTLEPTAVDTHVSAEQILRDVYKKGQKARGSTNIDILDLEELREYQRRKRTEYEGYLKRNRLDMGQWIRYAQFEIEQHD MRRARSIFERALLVDSSFIPLWIRYIDAELKVKCINHARNLMNRAISTLPRVDKLWYKYLIVEESLNNVEIVRSLYTKWC SLEPGVNAWNSFVDFEIRQKNWNGVREIYSKYVMAHPQMQTWLKWVRFENRHGNTEFTRSVYSLAIDTVANLQNLQIWSD MEVAKLVNSFAHWEAAQQEYERSSALYQIAIEKWPSNQLLKAGLLDFEKQFGDINSIEETISYKRKMEYETILSNNAYDY DTWWLYLDLISESFPKQIMQTFEKAIVDSRPKELSKNVQWKRYIYLWMRYICYVELELENSLLEEELFQRLIDDIIPHKH FTFSKIWLMYAKFLIRHDDVPKARKILGKAIGLCPKAKTFKGYIELEVKLKEFDRVRKIYEKFIEFQPSDLQIWSQYGEL EENLGDWDRVRGIYTIALDENSDFLTKEAKIVLLQKYITFETESQEFEKARKLYRRYLELNQYSPQSWIEFAMYQTSTPT EQQLLDLAKLQSENVDEDIEFEITDENKLEARKVFEEAIVFFKEKDDKQGRLSILEALKDYEETYGTELDQETVKKRFPK VIKKVRLQNGVEEEFVDYIFPDDIDDDKPKPSKFLELAKKWKQEQAL ; S ? 22 'polypeptide(L)' no no ;MSAYIAMKGVITNVDENIRNDEDVAFEYEIQKTPQNILTWKRYIEYWKEEGRTDKQIRWLYERFCSQFVTDTSIWEDYIR WESTKEVVETSRIFWLFQRCLKSCVRDCDRICLSYLELAIEQYDLAMIRHALASSLMKMEREMHRKVWDPVIKFVEEKVL PLTQLDSTQEDEEESTDEAELINVLLVKGFTKGGFISEEISENGSRGDIWSSHILERYLKVAPQQKRNESLATLALTRDN ITIKSVYEKYLPQDENSGKYLPSSELPFELNFNYLASLEKLGLDNQYEEFMRQMNGIYPDKWLFLILSLAKYYISRGRLD SCGDLLKKSLQQTLRYSDFDRIYNFYLLFEQECSQFILGKLKENDSKFFNQKDWTEKLQAHMATFESLINLYDIYLNDVA LRQDSNLVETWMKRVSLQKSAAEKCNVYSEAILKIDPRKVGTPGSFGRLWCSYGDLYWRSNAISTARELWTQSLKVPYPY IEDLEEIYLNWADRELDKEGVERAFSILEDALHVPTNPEILLEKYKNGHRKIPAQTVLFNSLRIWSKYIDYLEAYCPKDA NSSDKIFNKTKMAYNTVIDLRLITPAMAENFALFLQNHYEVMESFQVYEKTIPLFPPEIQYELWIEYLEVATSHQLSSLS PEHIRFLFEKALKNLCSNGIDCKTIFIAYSVFEERISGLISKSIEILRRGAVIGTVSVSTHLESRLQLWRMCISKAESTL GPSVTRELYQECIQILPNSKAVEFVIKFSDFESSIGETIRAREILAYGAKLLPPSRNTELWDSFEIFELKHGDKETYKDM LKMKKVLESNMLIDSASVSHEEGNINFVAAATSHAPNSHTLTQSTSSYSINPDEIELDI ; ;MSAYIAMKGVITNVDENIRNDEDVAFEYEIQKTPQNILTWKRYIEYWKEEGRTDKQIRWLYERFCSQFVTDTSIWEDYIR WESTKEVVETSRIFWLFQRCLKSCVRDCDRICLSYLELAIEQYDLAMIRHALASSLMKMEREMHRKVWDPVIKFVEEKVL PLTQLDSTQEDEEESTDEAELINVLLVKGFTKGGFISEEISENGSRGDIWSSHILERYLKVAPQQKRNESLATLALTRDN ITIKSVYEKYLPQDENSGKYLPSSELPFELNFNYLASLEKLGLDNQYEEFMRQMNGIYPDKWLFLILSLAKYYISRGRLD SCGDLLKKSLQQTLRYSDFDRIYNFYLLFEQECSQFILGKLKENDSKFFNQKDWTEKLQAHMATFESLINLYDIYLNDVA LRQDSNLVETWMKRVSLQKSAAEKCNVYSEAILKIDPRKVGTPGSFGRLWCSYGDLYWRSNAISTARELWTQSLKVPYPY IEDLEEIYLNWADRELDKEGVERAFSILEDALHVPTNPEILLEKYKNGHRKIPAQTVLFNSLRIWSKYIDYLEAYCPKDA NSSDKIFNKTKMAYNTVIDLRLITPAMAENFALFLQNHYEVMESFQVYEKTIPLFPPEIQYELWIEYLEVATSHQLSSLS PEHIRFLFEKALKNLCSNGIDCKTIFIAYSVFEERISGLISKSIEILRRGAVIGTVSVSTHLESRLQLWRMCISKAESTL GPSVTRELYQECIQILPNSKAVEFVIKFSDFESSIGETIRAREILAYGAKLLPPSRNTELWDSFEIFELKHGDKETYKDM LKMKKVLESNMLIDSASVSHEEGNINFVAAATSHAPNSHTLTQSTSSYSINPDEIELDI ; T ? 23 'polypeptide(L)' no no ;MSKIQVAHSSRLANLIDYKLRVLTQDGRVYIGQLMAFDKHMNLVLNECIEERVPKTQLDKLRPRKDSKDGTTLNIKVEKR VLGLTILRGEQILSTVVEDKPLLSKKERLVRDKKEKKQAQKQTKLRKEKEKKPGKIAKPNTANAKHTSSNSREIAQPSSS RYNGGNDNIGANRSRFNNEAPPQTRKFQPPPGFKRK ; ;MSKIQVAHSSRLANLIDYKLRVLTQDGRVYIGQLMAFDKHMNLVLNECIEERVPKTQLDKLRPRKDSKDGTTLNIKVEKR VLGLTILRGEQILSTVVEDKPLLSKKERLVRDKKEKKQAQKQTKLRKEKEKKPGKIAKPNTANAKHTSSNSREIAQPSSS RYNGGNDNIGANRSRFNNEAPPQTRKFQPPPGFKRK ; b,k ? 24 'polypeptide(L)' no no ;MTMNGIPVKLLNEAQGHIVSLELTTGATYRGKLVESEDSMNVQLRDVIATEPQGAVTHMDQIFVRGSQIKFIVVPDLLKN APLFKKNSSRPMPPIRGPKRR ; ;MTMNGIPVKLLNEAQGHIVSLELTTGATYRGKLVESEDSMNVQLRDVIATEPQGAVTHMDQIFVRGSQIKFIVVPDLLKN APLFKKNSSRPMPPIRGPKRR ; d,n ? 25 'polypeptide(L)' no no ;MSNKVKTKAMVPPINCIFNFLQQQTPVTIWLFEQIGIRIKGKIVGFDEFMNVVIDEAVEIPVNSADGKEDVEKGTPLGKI LLKGDNITLITSAD ; ;MSNKVKTKAMVPPINCIFNFLQQQTPVTIWLFEQIGIRIKGKIVGFDEFMNVVIDEAVEIPVNSADGKEDVEKGTPLGKI LLKGDNITLITSAD ; e,p ? 26 'polypeptide(L)' no no ;MSESSDISAMQPVNPKPFLKGLVNHRVGVKLKFNSTEYRGTLVSTDNYFNLQLNEAEEFVAGVSHGTLGEIFIRCNNVLY IRELPN ; ;MSESSDISAMQPVNPKPFLKGLVNHRVGVKLKFNSTEYRGTLVSTDNYFNLQLNEAEEFVAGVSHGTLGEIFIRCNNVLY IRELPN ; f,q ? 27 'polypeptide(L)' no no MVSTPELKKYMDKKILLNINGSRKVAGILRGYDIFLNVVLDDAMEINGEDPANNHQLGLQTVIRGNSIISLEALDAI MVSTPELKKYMDKKILLNINGSRKVAGILRGYDIFLNVVLDDAMEINGEDPANNHQLGLQTVIRGNSIISLEALDAI g,r ? 28 'polypeptide(L)' no no ;MKLVNFLKKLRNEQVTIELKNGTTVWGTLQSVSPQMNAILTDVKLTLPQPRLNKLNSNGIAMASLYLTGGQQPTASDNIA SLQYINIRGNTIRQIILPDSLNLDSLLVDQKQLNSLRRSGQIANDPSKKRRRDFGAPANKRPRRGL ; ;MKLVNFLKKLRNEQVTIELKNGTTVWGTLQSVSPQMNAILTDVKLTLPQPRLNKLNSNGIAMASLYLTGGQQPTASDNIA SLQYINIRGNTIRQIILPDSLNLDSLLVDQKQLNSLRRSGQIANDPSKKRRRDFGAPANKRPRRGL ; h,l ? 29 'polypeptide(L)' no no ;MSSQIIDRPKHELSRAELEELEEFEFKHGPMSLINDAMVTRTPVIISLRNNHKIIARVKAFDRHCNMVLENVKELWTEKK GKNVINRERFISKLFLRGDSVIVVLKTPVE ; ;MSSQIIDRPKHELSRAELEELEEFEFKHGPMSLINDAMVTRTPVIISLRNNHKIIARVKAFDRHCNMVLENVKELWTEKK GKNVINRERFISKLFLRGDSVIVVLKTPVE ; j,m ? 30 'polypeptide(L)' no no ;MKFTPSIVIDAPQYYVDHFNGKYNVDKCVILRDLQLETDSESMPSSLKHLTKPTHILDLTNNDLIMIPDLSRRDDIHTLL LGRNNIVEVDGRLLPMNVQNLTLSNNSIRRFEDLQRLRRAPRTLKNLTLIGNQVCHLANYREHVLRLVPHLETLDFQNVT AEERKSAMSFPRQADGDTLGPVNTAIRDNGSRDKTMEIMNLVVSKMTVERRNELKKQLAEATSLEEIARLEKLLSGGV ; ;MKFTPSIVIDAPQYYVDHFNGKYNVDKCVILRDLQLETDSESMPSSLKHLTKPTHILDLTNNDLIMIPDLSRRDDIHTLL LGRNNIVEVDGRLLPMNVQNLTLSNNSIRRFEDLQRLRRAPRTLKNLTLIGNQVCHLANYREHVLRLVPHLETLDFQNVT AEERKSAMSFPRQADGDTLGPVNTAIRDNGSRDKTMEIMNLVVSKMTVERRNELKKQLAEATSLEEIARLEKLLSGGV ; W ? 31 'polypeptide(L)' no no ;MVEPARKKQRIDRDTHHTVAEPVTEAKNTLYVSQLNEKINMQRLRVNLFLLFATFGEVLKVSMNFKKQRGQAFITMRTID QASLAQISLNGERFFGKPLKVEFSKSETKTL ; ;MVEPARKKQRIDRDTHHTVAEPVTEAKNTLYVSQLNEKINMQRLRVNLFLLFATFGEVLKVSMNFKKQRGQAFITMRTID QASLAQISLNGERFFGKPLKVEFSKSETKTL ; Y ? 32 'polypeptide(L)' no no ;MGHSGREERIKDIFKELTSKELTPGLLLTLQKLAQKPNTNLEQFIASCKALTKLSSNNPIIFNELLELLKNKSEEDSTGP KKIAPSINKRKKFKIQLDLDDNEDELDSPVQKKPAPTRTLFKRIDKLKAKQLRQYSPTVKDPSPNSEQQTQNGHAETKDY EPTRSEVVEEDREWYDNDDDYGNLVPEPLSELPEEAKLLPVIRNIDNDDALRNTVQLYPIPLKQRMEWIPPFLSKFALEN KVPTSIIIGSISETSSQVSALSMVNPFRNPDSEFSANAKRGSKLVALRRINMEHIQQSRDNTTVLNTAMGEVLGLENNNK AKDKSNQKICDDTALFTPSKDDIKHTKEQLPVFRCRSQLLSLIRENQVVVIIGETGSGKTTQLAQYLYEEGYANDRGKSI VVTQPRRVAAISVAKRVAMEMQVPLGKEVGYSIRFEDVTDSECTKLKFVTDGILLRETLLDDTLDKYSCVIIDEAHERSL NTDILLGFFKILLARRRDLKLIITSATMNAKKFSAFFGNAPQFTIPGRTFPVQTIYTSNPVQDYVEAAVSQAVKIHLAND CSSGDILIFMTGQEDIETTFDTLQEKFLQVYSKKFGTANFEEINDIEILPIYSALPADLQFKIFQDLHGTKRKIIIATNI AETSLTIKGIRYVIDCGYSKLKVYNPKIGLDSLVITPISKANADQRSGRAGRTAPGTAYRLYTEDTFKEDMYLQTIPEIQ RTNLSNTLLLLKSLDVTDELSKFPFIDKPPLQTFLSSLYELWFIGAIDTSGQLTPLGLQMAKFPLQPSLSKILLIAVRNG CSDEMLTIVSMLSVPQVFYRPKERQKEADIARNKFFIAKSDHLTLLNVFEQWRANNFSSHWCNKHFVQYKSLVRARDIRD QLLTILKSQKIPVISSGKDWDIIKKCICSGFAHQAAKITGLRNYVHLKTGVSVQLHPTSALHGLGDLPPYVVYHELLMTS KEYICCVTSVDPFWLMEYGGLLYDIKRIKNDQEATTTGLFGEHYEHTLDKVEDDIDINIRRCKDMRDSVIQELKMTDNSN KEDKKQKTKKQNILNGKENSMKPFKRRKPFF ; ;MGHSGREERIKDIFKELTSKELTPGLLLTLQKLAQKPNTNLEQFIASCKALTKLSSNNPIIFNELLELLKNKSEEDSTGP KKIAPSINKRKKFKIQLDLDDNEDELDSPVQKKPAPTRTLFKRIDKLKAKQLRQYSPTVKDPSPNSEQQTQNGHAETKDY EPTRSEVVEEDREWYDNDDDYGNLVPEPLSELPEEAKLLPVIRNIDNDDALRNTVQLYPIPLKQRMEWIPPFLSKFALEN KVPTSIIIGSISETSSQVSALSMVNPFRNPDSEFSANAKRGSKLVALRRINMEHIQQSRDNTTVLNTAMGEVLGLENNNK AKDKSNQKICDDTALFTPSKDDIKHTKEQLPVFRCRSQLLSLIRENQVVVIIGETGSGKTTQLAQYLYEEGYANDRGKSI VVTQPRRVAAISVAKRVAMEMQVPLGKEVGYSIRFEDVTDSECTKLKFVTDGILLRETLLDDTLDKYSCVIIDEAHERSL NTDILLGFFKILLARRRDLKLIITSATMNAKKFSAFFGNAPQFTIPGRTFPVQTIYTSNPVQDYVEAAVSQAVKIHLAND CSSGDILIFMTGQEDIETTFDTLQEKFLQVYSKKFGTANFEEINDIEILPIYSALPADLQFKIFQDLHGTKRKIIIATNI AETSLTIKGIRYVIDCGYSKLKVYNPKIGLDSLVITPISKANADQRSGRAGRTAPGTAYRLYTEDTFKEDMYLQTIPEIQ RTNLSNTLLLLKSLDVTDELSKFPFIDKPPLQTFLSSLYELWFIGAIDTSGQLTPLGLQMAKFPLQPSLSKILLIAVRNG CSDEMLTIVSMLSVPQVFYRPKERQKEADIARNKFFIAKSDHLTLLNVFEQWRANNFSSHWCNKHFVQYKSLVRARDIRD QLLTILKSQKIPVISSGKDWDIIKKCICSGFAHQAAKITGLRNYVHLKTGVSVQLHPTSALHGLGDLPPYVVYHELLMTS KEYICCVTSVDPFWLMEYGGLLYDIKRIKNDQEATTTGLFGEHYEHTLDKVEDDIDINIRRCKDMRDSVIQELKMTDNSN KEDKKQKTKKQNILNGKENSMKPFKRRKPFF ; Q ? 33 'polypeptide(L)' no no ;MLCAISGKVPRRPVLSPKSRTIFEKSLLEQYVKDTGNDPITNEPLSIEEIVEIVPSAQQASLTESTNSATLKANYSIPNL LTSLQNEWDAIMLENFKLRSTLDSLTKKLSTVMYERDAAKLVAAQLLMEKNEDSKDLPKSSQQAVAITREEFLQGLLQSS RDFVARGKLKAPKWPILKNLELLQAQNYSRNIKTFPYKELNKSMYYDKWVCMCRCEDGALHFTQLKDSKTITTITTPNPR TGGEHPAIISRGPCNRLLLLYPGNQITILDSKTNKVLREIEVDSANEIIYMYGHNEVNTEYFIWADNRGTIGFQSYEDDS QYIVHSAKSDVEYSSGVLHKDSLLLALYSPDGILDVYNLSSPDQASSRFPVDEEAKIKEVKFADNGYWMVVECDQTVVCF DLRKDVGTLAYPTYTIPEFKTGTVTYDIDDSGKNMIAYSNESNSLTIYKFDKKTKNWTKDEESALCLQSDTADFTDMDVV CGDGGIAAILKTNDSFNIVALTP ; ;MLCAISGKVPRRPVLSPKSRTIFEKSLLEQYVKDTGNDPITNEPLSIEEIVEIVPSAQQASLTESTNSATLKANYSIPNL LTSLQNEWDAIMLENFKLRSTLDSLTKKLSTVMYERDAAKLVAAQLLMEKNEDSKDLPKSSQQAVAITREEFLQGLLQSS RDFVARGKLKAPKWPILKNLELLQAQNYSRNIKTFPYKELNKSMYYDKWVCMCRCEDGALHFTQLKDSKTITTITTPNPR TGGEHPAIISRGPCNRLLLLYPGNQITILDSKTNKVLREIEVDSANEIIYMYGHNEVNTEYFIWADNRGTIGFQSYEDDS QYIVHSAKSDVEYSSGVLHKDSLLLALYSPDGILDVYNLSSPDQASSRFPVDEEAKIKEVKFADNGYWMVVECDQTVVCF DLRKDVGTLAYPTYTIPEFKTGTVTYDIDDSGKNMIAYSNESNSLTIYKFDKKTKNWTKDEESALCLQSDTADFTDMDVV CGDGGIAAILKTNDSFNIVALTP ; t,u,v,w ? 34 'polypeptide(L)' no no ;MDGLSFVDKGKIPDGYKNEIDQLVKKEFANIKREPVHPEIRGILAKRKGADNSVSTLTNALYTEYLKQRNNKKRRTPDFN DDDDTLFLEEYRRKYPRIDTSRYIPNESSEVSLLGIVDSYLKHQEIVLDTLLPQTVSNQWRINNDYIRQTCTIVEEMNIQ QRKQINDLEIYRKRL ; ;MDGLSFVDKGKIPDGYKNEIDQLVKKEFANIKREPVHPEIRGILAKRKGADNSVSTLTNALYTEYLKQRNNKKRRTPDFN DDDDTLFLEEYRRKYPRIDTSRYIPNESSEVSLLGIVDSYLKHQEIVLDTLLPQTVSNQWRINNDYIRQTCTIVEEMNIQ QRKQINDLEIYRKRL ; s ? 35 'polypeptide(L)' no no ;(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ; ;XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX ; x ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 A n 1 2 A n 1 3 G n 1 4 C n 1 5 A n 1 6 G n 1 7 C n 1 8 U n 1 9 U n 1 10 U n 1 11 A n 1 12 C n 1 13 A n 1 14 G n 1 15 A n 1 16 U n 1 17 C n 1 18 A n 1 19 A n 1 20 U n 1 21 G n 1 22 G n 1 23 C n 1 24 G n 1 25 G n 1 26 A n 1 27 G n 1 28 G n 1 29 G n 1 30 A n 1 31 G n 1 32 G n 1 33 U n 1 34 C n 1 35 A n 1 36 A n 1 37 C n 1 38 A n 1 39 U n 1 40 C n 1 41 A n 1 42 A n 1 43 G n 1 44 A n 1 45 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30 ;MKFTPSIVIDAPQYYVDHFNGKYNVDKCVILRDLQLETDSESMPSSLKHLTKPTHILDLTNNDLIMIPDLSRRDDIHTLL LGRNNIVEVDGRLLPMNVQNLTLSNNSIRRFEDLQRLRRAPRTLKNLTLIGNQVCHLANYREHVLRLVPHLETLDFQNVT AEERKSAMSFPRQADGDTLGPVNTAIRDNGSRDKTMEIMNLVVSKMTVERRNELKKQLAEATSLEEIARLEKLLSGGV ; 1 31 UNP MSL1_YEAST P40567 ? 31 ;MVEPARKKQRIDRDTHHTVAEPVTEAKNTLYVSQLNEKINMQRLRVNLFLLFATFGEVLKVSMNFKKQRGQAFITMRTID QASLAQISLNGERFFGKPLKVEFSKSETKTL ; 1 32 UNP PRP16_YEAST P15938 ? 32 ;MGHSGREERIKDIFKELTSKELTPGLLLTLQKLAQKPNTNLEQFIASCKALTKLSSNNPIIFNELLELLKNKSEEDSTGP KKIAPSINKRKKFKIQLDLDDNEDELDSPVQKKPAPTRTLFKRIDKLKAKQLRQYSPTVKDPSPNSEQQTQNGHAETKDY EPTRSEVVEEDREWYDNDDDYGNLVPEPLSELPEEAKLLPVIRNIDNDDALRNTVQLYPIPLKQRMEWIPPFLSKFALEN KVPTSIIIGSISETSSQVSALSMVNPFRNPDSEFSANAKRGSKLVALRRINMEHIQQSRDNTTVLNTAMGEVLGLENNNK AKDKSNQKICDDTALFTPSKDDIKHTKEQLPVFRCRSQLLSLIRENQVVVIIGETGSGKTTQLAQYLYEEGYANDRGKSI VVTQPRRVAAISVAKRVAMEMQVPLGKEVGYSIRFEDVTDSECTKLKFVTDGILLRETLLDDTLDKYSCVIIDEAHERSL NTDILLGFFKILLARRRDLKLIITSATMNAKKFSAFFGNAPQFTIPGRTFPVQTIYTSNPVQDYVEAAVSQAVKIHLAND CSSGDILIFMTGQEDIETTFDTLQEKFLQVYSKKFGTANFEEINDIEILPIYSALPADLQFKIFQDLHGTKRKIIIATNI AETSLTIKGIRYVIDCGYSKLKVYNPKIGLDSLVITPISKANADQRSGRAGRTAPGTAYRLYTEDTFKEDMYLQTIPEIQ RTNLSNTLLLLKSLDVTDELSKFPFIDKPPLQTFLSSLYELWFIGAIDTSGQLTPLGLQMAKFPLQPSLSKILLIAVRNG CSDEMLTIVSMLSVPQVFYRPKERQKEADIARNKFFIAKSDHLTLLNVFEQWRANNFSSHWCNKHFVQYKSLVRARDIRD QLLTILKSQKIPVISSGKDWDIIKKCICSGFAHQAAKITGLRNYVHLKTGVSVQLHPTSALHGLGDLPPYVVYHELLMTS KEYICCVTSVDPFWLMEYGGLLYDIKRIKNDQEATTTGLFGEHYEHTLDKVEDDIDINIRRCKDMRDSVIQELKMTDNSN KEDKKQKTKKQNILNGKENSMKPFKRRKPFF ; 1 33 UNP PRP19_YEAST P32523 ? 33 ;MLCAISGKVPRRPVLSPKSRTIFEKSLLEQYVKDTGNDPITNEPLSIEEIVEIVPSAQQASLTESTNSATLKANYSIPNL LTSLQNEWDAIMLENFKLRSTLDSLTKKLSTVMYERDAAKLVAAQLLMEKNEDSKDLPKSSQQAVAITREEFLQGLLQSS RDFVARGKLKAPKWPILKNLELLQAQNYSRNIKTFPYKELNKSMYYDKWVCMCRCEDGALHFTQLKDSKTITTITTPNPR TGGEHPAIISRGPCNRLLLLYPGNQITILDSKTNKVLREIEVDSANEIIYMYGHNEVNTEYFIWADNRGTIGFQSYEDDS QYIVHSAKSDVEYSSGVLHKDSLLLALYSPDGILDVYNLSSPDQASSRFPVDEEAKIKEVKFADNGYWMVVECDQTVVCF DLRKDVGTLAYPTYTIPEFKTGTVTYDIDDSGKNMIAYSNESNSLTIYKFDKKTKNWTKDEESALCLQSDTADFTDMDVV CGDGGIAAILKTNDSFNIVALTP ; 1 34 UNP SN309_YEAST Q06091 ? 34 ;MDGLSFVDKGKIPDGYKNEIDQLVKKEFANIKREPVHPEIRGILAKRKGADNSVSTLTNALYTEYLKQRNNKKRRTPDFN DDDDTLFLEEYRRKYPRIDTSRYIPNESSEVSLLGIVDSYLKHQEIVLDTLLPQTVSNQWRINNDYIRQTCTIVEEMNIQ QRKQINDLEIYRKRL ; 1 35 PDB 5LJ5 5LJ5 ? 35 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 5LJ5 U 1 ? 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P33334 1 ? 2413 ? 1 2413 7 7 5LJ5 B 1 ? 2163 ? P32639 1 ? 2163 ? 1 2163 8 8 5LJ5 D 1 ? 278 ? P28320 1 ? 278 ? 1 278 9 9 5LJ5 F 1 ? 179 ? P53854 1 ? 179 ? 1 179 10 10 5LJ5 C 1 ? 1008 ? P36048 1 ? 1008 ? 1 1008 11 11 5LJ5 G 1 ? 235 ? P21374 1 ? 235 ? 1 235 12 12 5LJ5 H 1 ? 591 ? A0A162ERE7 1 ? 591 ? 1 591 13 13 5LJ5 J 1 ? 451 ? Q12417 1 ? 451 ? 1 451 14 14 5LJ5 K 1 ? 379 ? P28004 1 ? 379 ? 1 379 15 15 5LJ5 L 1 ? 157 ? P25337 1 ? 157 ? 1 157 16 16 5LJ5 M 1 ? 339 ? Q12046 1 ? 339 ? 1 339 17 17 5LJ5 N 1 ? 364 ? P38241 1 ? 364 ? 1 364 18 18 5LJ5 O 1 ? 590 ? Q03654 1 ? 590 ? 1 590 19 19 5LJ5 P 1 ? 175 ? A0A162GIZ3 1 ? 175 ? 1 175 20 20 5LJ5 R 1 ? 135 ? Q03375 1 ? 135 ? 1 135 21 21 5LJ5 S 1 ? 687 ? Q12309 1 ? 687 ? 1 687 22 22 5LJ5 T 1 ? 859 ? Q04048 1 ? 859 ? 1 859 23 23 5LJ5 b 1 ? 196 ? P40018 1 ? 196 ? 1 196 24 24 5LJ5 d 1 ? 101 ? P43321 1 ? 101 ? 1 101 25 25 5LJ5 e 1 ? 94 ? Q12330 1 ? 94 ? 1 94 26 26 5LJ5 f 1 ? 86 ? P54999 1 ? 86 ? 1 86 27 27 5LJ5 g 1 ? 77 ? 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Q06091 1 ? 175 ? 1 175 45 35 5LJ5 x 1 ? 188 ? 5LJ5 1 ? 188 ? 1 188 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 GTP non-polymer n "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" ? 'C10 H16 N5 O14 P3' 523.180 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 UNK 'L-peptide linking' . UNKNOWN ? 'C4 H9 N O2' 103.120 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? r_mcbond_it 4.931 20.957 ? 29635 'ELECTRON MICROSCOPY' ? r_mcbond_other 4.930 20.957 ? 29634 'ELECTRON MICROSCOPY' ? r_mcangle_it 8.839 31.347 ? 36846 'ELECTRON MICROSCOPY' ? r_mcangle_other 8.839 31.348 ? 36847 'ELECTRON MICROSCOPY' ? r_scbond_it 5.329 20.042 ? 35793 'ELECTRON MICROSCOPY' ? r_scbond_other 5.329 20.042 ? 35794 'ELECTRON MICROSCOPY' ? r_scangle_it ? ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? r_scangle_other 9.208 30.547 ? 53786 'ELECTRON MICROSCOPY' ? r_long_range_B_refined 19.477 . ? 137799 'ELECTRON MICROSCOPY' ? r_long_range_B_other 19.477 . ? 137800 'ELECTRON MICROSCOPY' ? r_rigid_bond_restr ? ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? r_sphericity_free ? ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? r_sphericity_bonded ? ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? # _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.d_res_high 3.800 _refine_ls_shell.d_res_low 3.899 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 44142 _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.563 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 100.00 _refine_ls_shell.R_factor_R_free ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 0 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? # _struct.entry_id 5LJ5 _struct.title 'Overall structure of the yeast spliceosome immediately after branching.' _struct.pdbx_descriptor ;Pre-mRNA-splicing factor 8, Pre-mRNA-splicing helicase BRR2, Protein CWC16, Pre-mRNA-splicing factor CWC25, Pre-mRNA-splicing factor SNU114, ISY1, CWC22, PRP46, Pre-mRNA-processing protein 45, Pre-mRNA-splicing factor BUD31, CWC2, Pre-mRNA-splicing factor SLT11, CEF1, CWC15, Pre-mRNA-splicing factor CWC21, CLF1, SYF1, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, Small nuclear ribonucleoprotein E, Small nuclear ribonucleoprotein F, Small nuclear ribonucleoprotein G, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, Pre-mRNA-processing factor 19, Pre-mRNA-splicing factor SNT309, unknown/RNA Complex ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 5LJ5 _struct_keywords.text 'spliceosome, snRNP, pre-mRNA splicing, trans-esterification, lariat intermediate, complex C, splicing' _struct_keywords.pdbx_keywords SPLICING # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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UNK x 38 UNK x 54 1 ? 17 HELX_P HELX_P415 BU1 UNK SA 56 ? UNK SA 87 ? UNK x 56 UNK x 87 1 ? 32 HELX_P HELX_P416 BU2 UNK SA 89 ? UNK SA 110 ? UNK x 89 UNK x 110 1 ? 22 HELX_P HELX_P417 BU3 UNK SA 112 ? UNK SA 132 ? 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I G 56 Z U 45 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog20 hydrog ? ? C G 56 O6 ? ? ? 1_555 D U 45 N3 ? ? I G 56 Z U 45 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog21 hydrog ? ? C C 57 N3 ? ? ? 1_555 D U 44 N3 ? ? I C 57 Z U 44 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_18_PAIR ? ? hydrog22 hydrog ? ? C C 57 N4 ? ? ? 1_555 D U 44 O4 ? ? I C 57 Z U 44 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_18_PAIR ? ? hydrog23 hydrog ? ? C U 58 N3 ? ? ? 1_555 D G 43 O6 ? ? I U 58 Z G 43 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog24 hydrog ? ? C U 58 O2 ? ? ? 1_555 D G 43 N1 ? ? I U 58 Z G 43 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog25 hydrog ? ? C C 59 N3 ? ? ? 1_555 D U 42 N3 ? ? I C 59 Z U 42 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_18_PAIR ? ? hydrog26 hydrog ? ? C C 59 N4 ? ? ? 1_555 D U 42 O4 ? ? I C 59 Z U 42 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_18_PAIR ? ? hydrog27 hydrog ? ? C A 66 N1 ? ? ? 1_555 D U 38 N3 ? ? I A 66 Z U 38 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog28 hydrog ? ? C A 66 N6 ? ? ? 1_555 D U 38 O4 ? ? I A 66 Z U 38 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog29 hydrog ? ? C C 67 N3 ? ? ? 1_555 D G 37 N1 ? ? I C 67 Z G 37 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog30 hydrog ? ? C C 67 N4 ? ? ? 1_555 D G 37 O6 ? ? I C 67 Z G 37 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog31 hydrog ? ? C C 67 O2 ? ? ? 1_555 D G 37 N2 ? ? I C 67 Z G 37 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog32 hydrog ? ? C U 68 N3 ? ? ? 1_555 D A 36 N1 ? ? I U 68 Z A 36 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog33 hydrog ? ? C U 68 O4 ? ? ? 1_555 D A 36 N6 ? ? I U 68 Z A 36 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog34 hydrog ? ? C A 69 N1 ? ? ? 1_555 D U 35 N3 ? ? I A 69 Z U 35 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog35 hydrog ? ? C A 69 N6 ? ? ? 1_555 D U 35 O4 ? ? I A 69 Z U 35 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog36 hydrog ? ? C C 71 N3 ? ? ? 1_555 D G 34 N1 ? ? I C 71 Z G 34 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog37 hydrog ? ? C C 71 N4 ? ? ? 1_555 D G 34 O6 ? ? I C 71 Z G 34 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog38 hydrog ? ? C C 71 O2 ? ? ? 1_555 D G 34 N2 ? ? I C 71 Z G 34 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog39 hydrog ? ? C A 72 N1 ? ? ? 1_555 D U 33 N3 ? ? I A 72 Z U 33 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog40 hydrog ? ? C A 72 N6 ? ? ? 1_555 D U 33 O4 ? ? I A 72 Z U 33 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog41 hydrog ? ? A C 4 N3 ? ? ? 1_555 A G 144 N1 ? ? U C 4 U G 144 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog42 hydrog ? ? A C 4 N4 ? ? ? 1_555 A G 144 O6 ? ? U C 4 U G 144 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog43 hydrog ? ? A C 4 O2 ? ? ? 1_555 A G 144 N2 ? ? U C 4 U G 144 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog44 hydrog ? ? A A 5 N1 ? ? ? 1_555 A U 143 N3 ? ? U A 5 U U 143 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog45 hydrog ? ? A A 5 N6 ? ? ? 1_555 A U 143 O4 ? ? U A 5 U U 143 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog46 hydrog ? ? A G 6 N1 ? ? ? 1_555 A C 142 N3 ? ? U G 6 U C 142 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog47 hydrog ? ? A G 6 N2 ? ? ? 1_555 A C 142 O2 ? ? 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AL4 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? parallel AB2 4 5 ? anti-parallel AB2 5 6 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? parallel AB3 3 4 ? parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB6 1 2 ? parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? parallel AB6 4 5 ? anti-parallel AB6 5 6 ? anti-parallel AB6 6 7 ? parallel AB6 7 8 ? parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? 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An in vitro transcribed yeast UBC4 pre-mRNA substrate (with 2 x MS2 bacteriophage coat protein-binding stem loops at the 5' end and with the 3'-splice site sequence UAGAG mutated to UACAC) was pre-bound to an MS2-maltose binding protein fusion protein. This substrate-protein complex was added to the splicing extract. The splicing reaction proceeded through the first step but the second step was blocked by the 3' splice site mutation. Substrate-bound spliceosomes from the splicing extract were purified on amylose resin and eluted with maltose. Subsequently the spliceosomes were captured on anti-HA-agarose (for Prp18-HA-tagged) or streptactin resin (for Slu7-TAPS tagged) and eluted with HA peptide or desthiobiotin, respectively. Purified spliceosomes were then dialysed against 20 mM HEPES KOH pH 7.8, 75 mM KCl, 0.25 mM EDTA ; _em_entity_assembly.name 'Spliceosome immediately after branching' _em_entity_assembly.source NATURAL _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.entity_id_list '1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35' _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 5LJ5 _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.dimension_height ? _em_image_scans.dimension_width ? _em_image_scans.frames_per_image 20 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.used_frames_per_image 1-20 _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.details ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.citation_id ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 5LJ5 _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification 35714 _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_max 4000 _em_imaging.nominal_defocus_min 500 _em_imaging.nominal_magnification 81000 _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.detector_distance ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details ? _em_sample_support.grid_material COPPER _em_sample_support.grid_mesh_size 400 _em_sample_support.grid_type 'Quantifoil R2/2' _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature 277 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details '3 microlitres sample were applied to the grid, left for 30 seconds and then blotted for 2.5-3.0 seconds before plunging.' _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK III' _em_vitrification.entry_id 5LJ5 _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? # _em_experiment.entry_id 5LJ5 _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 CB Q PHE 435 ? ? 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? 35.93 53.14 297 1 PRO S 197 ? ? -63.69 88.47 298 1 TRP S 238 ? ? -32.88 146.19 299 1 PHE T 68 ? ? -114.45 -70.72 300 1 SER T 103 ? ? 67.70 86.07 301 1 CYS T 104 ? ? -165.35 99.46 302 1 HIS T 144 ? ? -98.87 42.59 303 1 LEU T 391 ? ? -72.00 24.52 304 1 ALA T 421 ? ? 2.61 143.32 305 1 GLU T 423 ? ? -149.08 -51.96 306 1 ALA T 462 ? ? -96.48 -68.15 307 1 VAL T 476 ? ? 80.60 169.69 308 1 PRO T 479 ? ? -102.24 56.13 309 1 ILE T 481 ? ? 67.87 157.66 310 1 GLU T 482 ? ? 61.25 -155.05 311 1 ASP T 483 ? ? 77.33 -55.84 312 1 PHE T 615 ? ? 58.68 108.38 313 1 PRO T 616 ? ? -174.37 -158.63 314 1 LEU T 655 ? ? -110.77 72.54 315 1 ASP T 661 ? ? 79.62 30.28 316 1 LEU b 15 ? ? -106.68 42.54 317 1 PRO b 101 ? ? -67.83 -174.41 318 1 GLN d 15 ? ? -28.89 124.39 319 1 ASP d 60 ? ? -78.12 -75.54 320 1 LYS d 70 ? ? -92.75 -60.51 321 1 PHE d 84 ? ? -68.49 -72.59 322 1 GLN e 34 ? ? -163.89 101.44 323 1 THR e 88 ? ? -124.24 -62.45 324 1 LYS f 32 ? ? -85.91 -79.46 325 1 SER f 64 ? ? -68.67 98.68 326 1 LEU g 59 ? ? -101.23 -60.53 327 1 GLN h 35 ? ? -108.96 41.37 328 1 LEU h 101 ? ? -161.06 118.65 329 1 ARG j 41 ? ? 49.42 74.18 330 1 ASN j 50 ? ? -95.86 31.29 331 1 ASN j 51 ? ? 60.05 71.61 332 1 LYS j 59 ? ? -125.04 -58.34 333 1 THR j 77 ? ? -150.35 89.13 334 1 PRO W 12 ? ? -68.43 96.93 335 1 GLN W 13 ? ? -108.94 44.32 336 1 TYR W 23 ? ? 63.73 79.99 337 1 CYS W 28 ? ? 68.77 -162.35 338 1 ASP W 33 ? ? 72.96 44.83 339 1 GLN W 35 ? ? 71.30 52.09 340 1 SER W 40 ? ? -67.79 82.35 341 1 ILE W 56 ? ? 70.81 59.67 342 1 LEU W 59 ? ? -100.12 53.79 343 1 LEU W 70 ? ? -162.58 80.41 344 1 ILE W 76 ? ? -164.63 64.81 345 1 THR W 78 ? ? -104.70 45.68 346 1 LEU W 81 ? ? -117.38 54.45 347 1 ASN W 85 ? ? -111.56 52.80 348 1 VAL W 98 ? ? -64.57 90.72 349 1 LEU W 103 ? ? -109.01 50.32 350 1 ARG W 122 ? ? 117.51 -34.97 351 1 LEU W 127 ? ? -172.48 142.35 352 1 THR W 128 ? ? -105.99 -78.80 353 1 LEU W 129 ? ? 68.39 123.78 354 1 LEU W 151 ? ? -65.10 97.31 355 1 PHE W 156 ? ? 82.77 -30.81 356 1 GLN Y 34 ? ? 63.08 71.59 357 1 GLN Y 68 ? ? 70.33 -173.48 358 1 GLN Y 71 ? ? -65.06 96.89 359 1 VAL k 6 ? ? -166.49 108.99 360 1 LEU k 15 ? ? -99.86 33.24 361 1 GLU k 47 ? ? -162.23 102.62 362 1 VAL k 81 ? ? -162.50 80.50 363 1 LEU k 84 ? ? -108.21 69.52 364 1 LEU k 93 ? ? -93.86 -61.22 365 1 VAL l 25 ? ? -160.13 89.46 366 1 GLN l 30 ? ? 67.25 -112.32 367 1 ALA l 80 ? ? -150.98 63.80 368 1 GLN l 83 ? ? -74.42 -81.24 369 1 PRO l 98 ? ? -131.27 -48.75 370 1 LEU l 103 ? ? -158.28 83.97 371 1 ARG m 41 ? ? -44.26 108.67 372 1 LYS m 59 ? ? -135.44 -63.24 373 1 GLU m 78 ? ? -140.12 58.04 374 1 ILE m 102 ? ? -91.69 -60.40 375 1 ARG n 30 ? ? -162.57 101.51 376 1 THR n 50 ? ? -119.40 76.23 377 1 ALA n 55 ? ? -63.39 92.27 378 1 ASN n 80 ? ? -91.99 -62.19 379 1 VAL p 44 ? ? -142.84 -63.37 380 1 GLU p 56 ? ? 61.51 62.67 381 1 ASN q 34 ? ? 60.28 82.64 382 1 SER r 22 ? ? 59.65 83.20 383 1 LEU r 57 ? ? -161.25 79.23 384 1 LEU r 59 ? ? -76.80 -76.62 385 1 THR r 61 ? ? -165.38 112.05 386 1 ILE r 68 ? ? -169.91 80.51 387 1 LEU r 71 ? ? -155.93 85.30 388 1 VAL Q 368 ? ? -123.13 -56.22 389 1 VAL Q 369 ? ? 53.65 -156.57 390 1 VAL Q 370 ? ? 157.58 74.31 391 1 GLU Q 374 ? ? -38.17 157.48 392 1 THR Q 380 ? ? -36.73 -107.63 393 1 THR Q 381 ? ? -28.92 -51.46 394 1 GLU Q 390 ? ? -79.14 37.36 395 1 ASP Q 395 ? ? 50.17 4.22 396 1 LYS Q 398 ? ? -149.97 -83.51 397 1 SER Q 399 ? ? 138.63 -139.89 398 1 ILE Q 400 ? ? -179.15 -80.18 399 1 VAL Q 401 ? ? 147.60 -99.99 400 1 LYS Q 427 ? ? -93.33 -91.96 401 1 ASP Q 440 ? ? -11.52 154.25 402 1 CYS Q 443 ? ? 140.88 -82.08 403 1 LYS Q 447 ? ? 79.15 32.83 404 1 ASP Q 451 ? ? -19.82 -58.62 405 1 ASP Q 462 ? ? -53.75 -6.81 406 1 LEU Q 464 ? ? 39.19 35.18 407 1 LYS Q 466 ? ? 49.12 -25.17 408 1 CYS Q 469 ? ? -159.01 27.46 409 1 VAL Q 470 ? ? 13.12 -81.56 410 1 ILE Q 471 ? ? 109.80 -171.73 411 1 GLU Q 477 ? ? -102.99 75.76 412 1 ARG Q 478 ? ? -31.94 28.93 413 1 LEU Q 501 ? ? -103.24 -130.51 414 1 ILE Q 502 ? ? 179.05 -44.30 415 1 ILE Q 503 ? ? 104.08 -80.83 416 1 THR Q 504 ? ? 65.65 112.11 417 1 VAL Q 541 ? ? -81.87 37.04 418 1 VAL Q 545 ? ? -110.55 56.92 419 1 GLU Q 546 ? ? -55.28 82.52 420 1 CYS Q 561 ? ? -78.86 22.93 421 1 ASN Q 604 ? ? -65.05 24.30 422 1 SER Q 644 ? ? 53.85 -44.61 423 1 LYS Q 648 ? ? -38.59 137.35 424 1 VAL Q 653 ? ? -60.19 -89.60 425 1 ILE Q 654 ? ? 113.39 -152.27 426 1 ASP Q 655 ? ? 151.81 99.57 427 1 ILE Q 678 ? ? -65.47 -178.78 428 1 THR Q 703 ? ? -136.93 -62.85 429 1 GLU Q 704 ? ? -57.51 -76.49 430 1 PHE Q 707 ? ? 18.03 40.11 431 1 LYS Q 708 ? ? -32.48 -39.26 432 1 THR Q 737 ? ? 20.98 46.59 433 1 ASP Q 738 ? ? -80.62 -107.12 434 1 ILE Q 746 ? ? 50.50 -107.40 435 1 LYS Q 748 ? ? 123.38 35.48 436 1 PRO Q 749 ? ? -79.28 -80.59 437 1 PRO Q 750 ? ? -32.30 114.30 438 1 ARG Q 798 ? ? -65.65 -173.68 439 1 ASN Q 799 ? ? 46.69 -38.72 440 1 CYS Q 801 ? ? -142.63 23.60 441 1 LEU Q 812 ? ? -91.44 31.90 442 1 SER Q 813 ? ? -143.13 39.18 443 1 PRO Q 815 ? ? -45.54 151.07 444 1 PRO Q 821 ? ? -51.41 101.51 445 1 LYS Q 822 ? ? 58.26 -101.75 446 1 ARG Q 824 ? ? -44.69 99.95 447 1 GLU Q 827 ? ? -49.29 153.21 448 1 ASN Q 833 ? ? -83.92 38.71 449 1 PHE Q 836 ? ? 31.40 108.61 450 1 ILE Q 837 ? ? 69.53 -69.44 451 1 LYS Q 839 ? ? -63.70 72.88 452 1 ASN Q 856 ? ? 53.36 -19.91 453 1 PHE Q 857 ? ? -62.20 43.71 454 1 LYS Q 890 ? ? 77.44 45.02 455 1 ILE Q 894 ? ? 172.86 177.81 456 1 SER Q 896 ? ? -174.95 42.24 457 1 GLN Q 914 ? ? -96.12 58.94 458 1 LYS Q 917 ? ? 43.09 179.15 459 1 ARG Q 922 ? ? 56.87 13.59 460 1 TYR Q 924 ? ? -126.27 -119.48 461 1 VAL Q 925 ? ? 135.95 78.83 462 1 HIS Q 926 ? ? -39.12 116.47 463 1 LEU Q 927 ? ? -70.10 24.72 464 1 THR Q 929 ? ? 103.21 -3.65 465 1 HIS Q 942 ? ? -59.43 28.13 466 1 LEU Q 944 ? ? 165.97 172.96 467 1 ASP Q 946 ? ? -132.00 -159.30 468 1 THR Q 959 ? ? -136.19 -78.61 469 1 CYS Q 965 ? ? -92.35 -110.77 470 1 THR Q 968 ? ? -166.75 116.44 471 1 ILE t 5 ? ? -126.71 -62.46 472 1 PRO t 17 ? ? -86.18 32.39 473 1 ARG t 20 ? ? -63.95 96.72 474 1 THR t 21 ? ? -161.11 118.72 475 1 ALA u 4 ? ? -87.14 46.54 476 1 ILE u 5 ? ? -135.42 -57.37 477 1 ARG u 20 ? ? -65.51 93.56 478 1 THR u 21 ? ? -161.27 113.21 479 1 ILE v 5 ? ? -136.23 -74.77 480 1 ARG v 20 ? ? -60.56 89.25 481 1 LEU v 81 ? ? -91.81 -75.76 482 1 LEU v 109 ? ? -30.63 -33.18 483 1 PRO w 17 ? ? -103.43 40.66 484 1 LYS w 18 ? ? -131.74 -48.92 485 1 ARG w 20 ? ? -58.73 97.82 486 1 PRO s 13 ? ? -76.38 22.18 487 1 ASP s 14 ? ? -154.06 -14.27 488 1 LYS s 94 ? ? 129.44 43.65 489 1 ARG s 102 ? ? -138.66 -49.70 490 1 PRO s 105 ? ? -72.00 -81.67 491 1 ASN s 106 ? ? 55.75 -171.13 492 1 VAL s 111 ? ? 7.32 -88.66 493 1 SER s 119 ? ? -163.48 -37.50 494 1 PRO s 133 ? ? -166.25 -24.21 495 1 VAL s 136 ? ? 74.53 -124.26 # loop_ _pdbx_validate_peptide_omega.id _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_model_num _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.omega 1 1 TYR A 403 ? 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SA UNK 142 5533 1 Y 1 x UNK 143 ? SA UNK 143 5534 1 Y 1 x UNK 144 ? SA UNK 144 5535 1 Y 1 x UNK 145 ? SA UNK 145 5536 1 Y 1 x UNK 146 ? SA UNK 146 5537 1 Y 1 x UNK 147 ? SA UNK 147 5538 1 Y 1 x UNK 148 ? SA UNK 148 5539 1 Y 1 x UNK 149 ? SA UNK 149 5540 1 Y 1 x UNK 150 ? SA UNK 150 5541 1 Y 1 x UNK 151 ? SA UNK 151 5542 1 Y 1 x UNK 152 ? SA UNK 152 5543 1 Y 1 x UNK 153 ? SA UNK 153 5544 1 Y 1 x UNK 154 ? SA UNK 154 5545 1 Y 1 x UNK 155 ? SA UNK 155 5546 1 Y 1 x UNK 156 ? SA UNK 156 5547 1 Y 1 x UNK 157 ? SA UNK 157 5548 1 Y 1 x UNK 158 ? SA UNK 158 5549 1 Y 1 x UNK 159 ? SA UNK 159 5550 1 Y 1 x UNK 160 ? SA UNK 160 5551 1 Y 1 x UNK 161 ? SA UNK 161 5552 1 Y 1 x UNK 162 ? SA UNK 162 5553 1 Y 1 x UNK 163 ? SA UNK 163 5554 1 Y 1 x UNK 164 ? SA UNK 164 5555 1 Y 1 x UNK 165 ? SA UNK 165 5556 1 Y 1 x UNK 166 ? SA UNK 166 5557 1 Y 1 x UNK 167 ? SA UNK 167 5558 1 Y 1 x UNK 168 ? SA UNK 168 5559 1 Y 1 x UNK 169 ? SA UNK 169 5560 1 Y 1 x UNK 170 ? SA UNK 170 5561 1 Y 1 x UNK 171 ? 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EDTA 1 4 ? ? ? ? 1 5 ? ? ? ? # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.units MEGADALTONS _em_entity_assembly_molwt.value 2 # _em_entity_assembly_naturalsource.id 2 _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 4932 _em_entity_assembly_naturalsource.organ . _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Saccharomyces cerevisiae' _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 2 _em_image_recording.average_exposure_time 0.8 _em_image_recording.details 'Total dose: 40 electrons/Angstrom^2 over 16 seconds. 20 movie frames collected at 1.25 frames per second.' _em_image_recording.detector_mode SUPER-RESOLUTION _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 QUANTUM (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images 2213 # _em_imaging_optics.id 1 _em_imaging_optics.imaging_id 1 _em_imaging_optics.chr_aberration_corrector ? _em_imaging_optics.energyfilter_lower ? _em_imaging_optics.energyfilter_name 'GIF Quantum' _em_imaging_optics.energyfilter_upper ? _em_imaging_optics.phase_plate ? _em_imaging_optics.sph_aberration_corrector ? # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details ? _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 15872 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'IMAGE ACQUISITION' ? ? ? ? ? 1 2 MASKING ? ? ? ? ? ? 3 'CTF CORRECTION' ? 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