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(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ; ;SSVAKSTANKLDWTKIVSKLGLSGQTAAALTSFKKRNDEAKRILFELKQQPSNVDFAFYKSTLKNTAIVDKIQSDVSKFT PSKANLSKQLNLIESFEAKALENAKETESVVLAELTDLEKTLENIESXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX ; W ? 15 'polypeptide(L)' no no ;(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ; XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX X ? 16 'polypeptide(L)' no no ;SPLDQFIINNLLEINSPFLNLSTLNFSTFSLYTLFVVLVISLTFILSIGGESNNLVKGSNWLIAIEAIFDTILNMVKGQI GGSVYGRYVPLVYTLFTFILVANLIGMVPYNFALSASLIYIIGISVSLWIGLTILGLFLNKAVFFSLFVPSGTPLPLVPV LVLIELLSYTARAISLGLRLAANTLSGHLLMSILGNLVKNLMSINYFTFIFGLIPLAGIFAIVILEFAIACIQAYVFAIL TSSYLKDSIYLH ; ;SPLDQFIINNLLEINSPFLNLSTLNFSTFSLYTLFVVLVISLTFILSIGGESNNLVKGSNWLIAIEAIFDTILNMVKGQI GGSVYGRYVPLVYTLFTFILVANLIGMVPYNFALSASLIYIIGISVSLWIGLTILGLFLNKAVFFSLFVPSGTPLPLVPV LVLIELLSYTARAISLGLRLAANTLSGHLLMSILGNLVKNLMSINYFTFIFGLIPLAGIFAIVILEFAIACIQAYVFAIL TSSYLKDSIYLH ; Y ? 17 'polypeptide(L)' no no ;(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ; XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX Z ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 18 "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" ATP 19 'MAGNESIUM ION' MG 20 "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ADP # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 UNK n 1 2 UNK n 1 3 UNK n 1 4 UNK n 1 5 UNK n 1 6 UNK n 1 7 UNK n 1 8 UNK n 1 9 UNK n 1 10 UNK n 1 11 UNK n 1 12 UNK n 1 13 UNK n 1 14 UNK n 1 15 UNK n 1 16 UNK n 1 17 UNK n 1 18 UNK n 1 19 UNK n 1 20 UNK n 1 21 UNK n 1 22 UNK n 1 23 UNK n 1 24 UNK n 1 25 UNK n 1 26 UNK n 1 27 UNK n 1 28 UNK n 1 29 UNK n 1 30 UNK n 2 1 UNK n 2 2 UNK n 2 3 UNK n 2 4 UNK n 2 5 UNK n 2 6 UNK n 2 7 UNK n 2 8 UNK n 2 9 UNK n 2 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CA PHE 237 CZ 12243 1 Y 1 Y ILE 239 ? CG1 ? CA ILE 239 CG1 12244 1 Y 1 Y ILE 239 ? CG2 ? CA ILE 239 CG2 12245 1 Y 1 Y ILE 239 ? CD1 ? CA ILE 239 CD1 12246 1 Y 1 Y LEU 240 ? CG ? CA LEU 240 CG 12247 1 Y 1 Y LEU 240 ? CD1 ? CA LEU 240 CD1 12248 1 Y 1 Y LEU 240 ? CD2 ? CA LEU 240 CD2 12249 1 Y 1 Y THR 241 ? OG1 ? CA THR 241 OG1 12250 1 Y 1 Y THR 241 ? CG2 ? CA THR 241 CG2 12251 1 Y 1 Y SER 242 ? OG ? CA SER 242 OG 12252 1 Y 1 Y SER 243 ? OG ? CA SER 243 OG 12253 1 Y 1 Y TYR 244 ? CG ? CA TYR 244 CG 12254 1 Y 1 Y TYR 244 ? CD1 ? CA TYR 244 CD1 12255 1 Y 1 Y TYR 244 ? CD2 ? CA TYR 244 CD2 12256 1 Y 1 Y TYR 244 ? CE1 ? CA TYR 244 CE1 12257 1 Y 1 Y TYR 244 ? CE2 ? CA TYR 244 CE2 12258 1 Y 1 Y TYR 244 ? CZ ? CA TYR 244 CZ 12259 1 Y 1 Y TYR 244 ? OH ? CA TYR 244 OH 12260 1 Y 1 Y LEU 245 ? CG ? CA LEU 245 CG 12261 1 Y 1 Y LEU 245 ? CD1 ? CA LEU 245 CD1 12262 1 Y 1 Y LEU 245 ? CD2 ? CA LEU 245 CD2 12263 1 Y 1 Y LYS 246 ? CG ? CA LYS 246 CG 12264 1 Y 1 Y LYS 246 ? CD ? CA LYS 246 CD 12265 1 Y 1 Y LYS 246 ? CE ? CA LYS 246 CE 12266 1 Y 1 Y LYS 246 ? NZ ? CA LYS 246 NZ 12267 1 Y 1 Y ASP 247 ? CG ? CA ASP 247 CG 12268 1 Y 1 Y ASP 247 ? OD1 ? CA ASP 247 OD1 12269 1 Y 1 Y ASP 247 ? OD2 ? CA ASP 247 OD2 12270 1 Y 1 Y SER 248 ? OG ? CA SER 248 OG 12271 1 Y 1 Y ILE 249 ? CG1 ? CA ILE 249 CG1 12272 1 Y 1 Y ILE 249 ? CG2 ? CA ILE 249 CG2 12273 1 Y 1 Y ILE 249 ? CD1 ? CA ILE 249 CD1 12274 1 Y 1 Y TYR 250 ? CG ? CA TYR 250 CG 12275 1 Y 1 Y TYR 250 ? CD1 ? CA TYR 250 CD1 12276 1 Y 1 Y TYR 250 ? CD2 ? CA TYR 250 CD2 12277 1 Y 1 Y TYR 250 ? CE1 ? CA TYR 250 CE1 12278 1 Y 1 Y TYR 250 ? CE2 ? CA TYR 250 CE2 12279 1 Y 1 Y TYR 250 ? CZ ? CA TYR 250 CZ 12280 1 Y 1 Y TYR 250 ? OH ? 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OA N N 19 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 5LQY 5LQY ? 1 ? 1 2 PDB 5LQY 5LQY ? 2 ? 1 3 PDB 5LQY 5LQY ? 3 ? 1 4 PDB 5LQY 5LQY ? 4 ? 1 5 PDB 5LQY 5LQY ? 5 ? 1 6 PDB 5LQY 5LQY ? 6 ? 1 7 PDB 5LQY 5LQY ? 7 ? 1 8 PDB 5LQY 5LQY ? 8 ? 1 9 PDB 5LQY 5LQY ? 9 ? 1 10 PDB 5LQY 5LQY ? 10 ? 1 11 PDB 5LQY 5LQY ? 11 ? 1 12 PDB 5LQY 5LQY ? 12 ? 1 13 PDB 5LQY 5LQY ? 13 ? 1 14 PDB 5LQY 5LQY ? 14 ? 1 15 PDB 5LQY 5LQY ? 15 ? 1 16 PDB 5LQY 5LQY ? 16 ? 1 17 PDB 5LQY 5LQY ? 17 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 5LQY 1 1 ? 30 ? 5LQY 1001 ? 1030 ? 1001 1030 2 2 5LQY 2 1 ? 25 ? 5LQY 1001 ? 1025 ? 1001 1025 3 3 5LQY 3 1 ? 17 ? 5LQY 1001 ? 1017 ? 1001 1017 4 4 5LQY 4 1 ? 27 ? 5LQY 1001 ? 1027 ? 1001 1027 5 5 5LQY A 1 ? 510 ? 5LQY 1 ? 510 ? 1 510 6 5 5LQY B 1 ? 510 ? 5LQY 1 ? 510 ? 1 510 7 5 5LQY C 1 ? 510 ? 5LQY 2 ? 510 ? 2 510 8 6 5LQY D 1 ? 476 ? 5LQY 4 ? 479 ? 4 479 9 6 5LQY E 1 ? 476 ? 5LQY 4 ? 479 ? 4 479 10 6 5LQY F 1 ? 476 ? 5LQY 4 ? 479 ? 4 479 11 7 5LQY G 1 ? 269 ? 5LQY 1 ? 269 ? 1 269 12 8 5LQY H 1 ? 138 ? 5LQY 2 ? 139 ? 2 139 13 9 5LQY I 1 ? 63 ? 5LQY 1 ? 63 ? 1 63 14 10 5LQY J 1 ? 66 ? 5LQY 1 ? 66 ? 1 66 15 11 5LQY K 1 ? 76 ? 5LQY 1 ? 76 ? 1 76 16 11 5LQY L 1 ? 76 ? 5LQY 1 ? 76 ? 1 76 17 11 5LQY M 1 ? 76 ? 5LQY 1 ? 76 ? 1 76 18 11 5LQY N 1 ? 76 ? 5LQY 1 ? 76 ? 1 76 19 11 5LQY O 1 ? 76 ? 5LQY 1 ? 76 ? 1 76 20 11 5LQY P 1 ? 76 ? 5LQY 1 ? 76 ? 1 76 21 11 5LQY Q 1 ? 76 ? 5LQY 1 ? 76 ? 1 76 22 11 5LQY R 1 ? 76 ? 5LQY 1 ? 76 ? 1 76 23 11 5LQY S 1 ? 76 ? 5LQY 1 ? 76 ? 1 76 24 11 5LQY T 1 ? 76 ? 5LQY 1 ? 76 ? 1 76 25 12 5LQY U 1 ? 194 ? 5LQY 1 ? 194 ? 1 194 26 13 5LQY V 1 ? 204 ? 5LQY 1 ? 204 ? 1 204 27 14 5LQY W 1 ? 155 ? 5LQY 1 ? 1028 ? 1 1028 28 15 5LQY X 1 ? 21 ? 5LQY 1001 ? 1021 ? 1001 1021 29 16 5LQY Y 1 ? 252 ? 5LQY 1 ? 252 ? 1 252 30 17 5LQY Z 1 ? 44 ? 5LQY 1001 ? 1044 ? 1001 1044 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 30-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 30 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 UNK A 1 ? UNK A 30 ? UNK 1 1001 UNK 1 1030 1 ? 30 HELX_P HELX_P2 AA2 UNK B 2 ? UNK B 25 ? UNK 2 1002 UNK 2 1025 1 ? 24 HELX_P HELX_P3 AA3 UNK C 2 ? UNK C 16 ? UNK 3 1002 UNK 3 1016 1 ? 15 HELX_P HELX_P4 AA4 UNK D 2 ? UNK D 26 ? UNK 4 1002 UNK 4 1026 1 ? 25 HELX_P HELX_P5 AA5 ILE E 13 ? GLY E 20 ? ILE A 13 GLY A 20 1 ? 8 HELX_P HELX_P6 AA6 GLY E 102 ? LEU E 106 ? GLY A 102 LEU A 106 5 ? 5 HELX_P HELX_P7 AA7 GLY E 176 ? ASN E 187 ? GLY A 176 ASN A 187 1 ? 12 HELX_P HELX_P8 AA8 GLN E 188 ? ASP E 193 ? GLN A 188 ASP A 193 1 ? 6 HELX_P HELX_P9 AA9 LYS E 211 ? ASN E 225 ? LYS A 211 ASN A 225 1 ? 15 HELX_P HELX_P10 AB1 ALA E 241 ? LEU E 247 ? ALA A 241 LEU A 247 1 ? 7 HELX_P HELX_P11 AB2 LEU E 247 ? ASP E 261 ? LEU A 247 ASP A 261 1 ? 15 HELX_P HELX_P12 AB3 ASP E 272 ? LEU E 286 ? ASP A 272 LEU A 286 1 ? 15 HELX_P HELX_P13 AB4 ASP E 299 ? GLU E 309 ? ASP A 299 GLU A 309 1 ? 11 HELX_P HELX_P14 AB5 ILE E 340 ? THR E 348 ? ILE A 340 THR A 348 1 ? 9 HELX_P HELX_P15 AB6 VAL E 382 ? VAL E 402 ? 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F ADP 600 F MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.648 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ASP 271 E . ? ASP 271 A ASP 272 E ? ASP 272 A 1 0.12 2 ARG 364 E . ? ARG 364 A PRO 365 E ? PRO 365 A 1 0.05 3 ASP 271 F . ? ASP 271 B ASP 272 F ? ASP 272 B 1 0.09 4 ARG 364 F . ? ARG 364 B PRO 365 F ? PRO 365 B 1 0.07 5 ASP 271 G . ? ASP 271 C ASP 272 G ? ASP 272 C 1 0.09 6 ARG 364 G . ? ARG 364 C PRO 365 G ? PRO 365 C 1 0.19 7 ASP 254 H . ? ASP 257 D ASN 255 H ? ASN 258 D 1 0.11 8 TYR 343 H . ? TYR 346 D PRO 344 H ? PRO 347 D 1 -0.02 9 ASP 254 I . ? ASP 257 E ASN 255 I ? ASN 258 E 1 0.05 10 TYR 343 I . ? TYR 346 E PRO 344 I ? PRO 347 E 1 0.05 11 ASP 254 J . ? ASP 257 F ASN 255 J ? ASN 258 F 1 0.02 12 TYR 343 J . ? TYR 346 F PRO 344 J ? PRO 347 F 1 -0.04 13 ASN 40 O . ? ASN 40 K PRO 41 O ? PRO 41 K 1 0.83 14 ASN 40 P . ? ASN 40 L PRO 41 P ? PRO 41 L 1 0.65 15 ASN 40 Q . ? ASN 40 M PRO 41 Q ? PRO 41 M 1 0.40 16 ASN 40 R . ? ASN 40 N PRO 41 R ? PRO 41 N 1 0.17 17 ASN 40 S . ? ASN 40 O PRO 41 S ? PRO 41 O 1 0.17 18 ASN 40 T . ? ASN 40 P PRO 41 T ? PRO 41 P 1 0.28 19 ASN 40 U . ? ASN 40 Q PRO 41 U ? PRO 41 Q 1 0.71 20 ASN 40 V . ? ASN 40 R PRO 41 V ? PRO 41 R 1 0.99 21 ASN 40 W . ? ASN 40 S PRO 41 W ? PRO 41 S 1 0.84 22 ASN 40 X . ? ASN 40 T PRO 41 X ? PRO 41 T 1 0.60 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 7 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 5 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 6 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 6 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 7 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 6 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 7 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 7 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 7 ? AC1 ? 2 ? AC2 ? 5 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 7 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 7 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 7 ? AD1 ? 3 ? AD2 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA1 6 7 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? parallel AA3 3 4 ? parallel AA3 4 5 ? parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA5 5 6 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? parallel AA7 3 4 ? parallel AA7 4 5 ? parallel AA7 5 6 ? parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? anti-parallel AB1 5 6 ? anti-parallel AB1 6 7 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? parallel AB3 2 3 ? parallel AB3 3 4 ? parallel AB3 4 5 ? parallel AB3 5 6 ? parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? anti-parallel AB5 5 6 ? anti-parallel AB5 6 7 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? parallel AB7 2 3 ? parallel AB7 3 4 ? parallel AB7 4 5 ? parallel AB7 5 6 ? parallel AB7 6 7 ? parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AB9 4 5 ? anti-parallel AB9 5 6 ? anti-parallel AB9 6 7 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? parallel AC2 2 3 ? parallel AC2 3 4 ? parallel AC2 4 5 ? parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC4 1 2 ? parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC5 5 6 ? anti-parallel AC5 6 7 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? parallel AC7 2 3 ? parallel AC7 3 4 ? parallel AC7 4 5 ? parallel AC7 5 6 ? parallel AC7 6 7 ? parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? parallel AC9 3 4 ? parallel AC9 4 5 ? parallel AC9 5 6 ? anti-parallel AC9 6 7 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 THR E 30 ? GLY E 37 ? THR A 30 GLY A 37 AA1 2 ILE E 40 ? GLY E 45 ? ILE A 40 GLY A 45 AA1 3 VAL E 73 ? LEU E 77 ? VAL A 73 LEU A 77 AA1 4 LYS E 62 ? LEU E 68 ? LYS A 62 LEU A 68 AA1 5 GLU E 53 ? PHE E 57 ? GLU A 53 PHE A 57 AA1 6 ILE E 89 ? ILE E 96 ? ILE A 89 ILE A 96 AA1 7 THR E 30 ? GLY E 37 ? THR A 30 GLY A 37 AA2 1 ASP E 98 ? ILE E 101 ? ASP A 98 ILE A 101 AA2 2 GLY E 127 ? ILE E 130 ? GLY A 127 ILE A 130 AA3 1 VAL E 109 ? VAL E 110 ? VAL A 109 VAL A 110 AA3 2 SER E 231 ? ALA E 236 ? SER A 231 ALA A 236 AA3 3 TYR E 202 ? VAL E 208 ? TYR A 202 VAL A 208 AA3 4 HIS E 265 ? ASP E 271 ? HIS A 265 ASP A 271 AA3 5 SER E 322 ? ALA E 325 ? SER A 322 ALA A 325 AA4 1 LEU E 168 ? ILE E 169 ? LEU A 168 ILE A 169 AA4 2 GLY E 350 ? ILE E 352 ? GLY A 350 ILE A 352 AA4 3 VAL E 373 ? SER E 374 ? VAL A 373 SER A 374 AA5 1 ARG F 32 ? GLY F 37 ? ARG B 32 GLY B 37 AA5 2 ILE F 40 ? PHE F 44 ? ILE B 40 PHE B 44 AA5 3 VAL F 73 ? LEU F 77 ? VAL B 73 LEU B 77 AA5 4 LYS F 62 ? LEU F 68 ? LYS B 62 LEU B 68 AA5 5 GLU F 53 ? GLU F 56 ? GLU B 53 GLU B 56 AA5 6 LYS F 91 ? ILE F 96 ? LYS B 91 ILE B 96 AA6 1 ASP F 98 ? ILE F 101 ? ASP B 98 ILE B 101 AA6 2 GLY F 127 ? ILE F 130 ? GLY B 127 ILE B 130 AA7 1 VAL F 109 ? VAL F 110 ? VAL B 109 VAL B 110 AA7 2 SER F 231 ? ALA F 236 ? SER B 231 ALA B 236 AA7 3 LEU F 201 ? VAL F 208 ? LEU B 201 VAL B 208 AA7 4 HIS F 265 ? ASP F 271 ? HIS B 265 ASP B 271 AA7 5 SER F 322 ? GLU F 330 ? SER B 322 GLU B 330 AA7 6 ILE F 169 ? GLY F 171 ? ILE B 169 GLY B 171 AA8 1 PRO F 147 ? MET F 148 ? PRO B 147 MET B 148 AA8 2 ILE F 161 ? GLY F 162 ? ILE B 161 GLY B 162 AA9 1 GLY F 350 ? GLN F 351 ? GLY B 350 GLN B 351 AA9 2 VAL F 373 ? SER F 374 ? VAL B 373 SER B 374 AB1 1 THR G 30 ? GLY G 37 ? THR C 30 GLY C 37 AB1 2 ILE G 40 ? GLY G 45 ? ILE C 40 GLY C 45 AB1 3 VAL G 73 ? LEU G 77 ? VAL C 73 LEU C 77 AB1 4 LYS G 62 ? LEU G 68 ? LYS C 62 LEU C 68 AB1 5 GLU G 53 ? PHE G 57 ? GLU C 53 PHE C 57 AB1 6 ILE G 89 ? ILE G 96 ? ILE C 89 ILE C 96 AB1 7 THR G 30 ? GLY G 37 ? THR C 30 GLY C 37 AB2 1 ASP G 98 ? ILE G 101 ? ASP C 98 ILE C 101 AB2 2 GLY G 127 ? ILE G 130 ? GLY C 127 ILE C 130 AB3 1 VAL G 109 ? VAL G 110 ? VAL C 109 VAL C 110 AB3 2 SER G 231 ? ALA G 236 ? SER C 231 ALA C 236 AB3 3 LEU G 201 ? VAL G 208 ? LEU C 201 VAL C 208 AB3 4 HIS G 265 ? ASP G 271 ? HIS C 265 ASP C 271 AB3 5 SER G 322 ? GLU G 330 ? SER C 322 GLU C 330 AB3 6 ILE G 169 ? GLY G 171 ? ILE C 169 GLY C 171 AB4 1 GLY G 350 ? GLN G 351 ? GLY C 350 GLN C 351 AB4 2 VAL G 373 ? SER G 374 ? VAL C 373 SER C 374 AB5 1 SER H 7 ? ILE H 14 ? SER D 10 ILE D 17 AB5 2 VAL H 17 ? GLN H 21 ? VAL D 20 GLN D 24 AB5 3 ALA H 56 ? ALA H 61 ? ALA D 59 ALA D 64 AB5 4 LEU H 46 ? GLN H 50 ? LEU D 49 GLN D 53 AB5 5 ALA H 33 ? THR H 35 ? ALA D 36 THR D 38 AB5 6 THR H 73 ? ASP H 76 ? THR D 76 ASP D 79 AB5 7 SER H 7 ? ILE H 14 ? SER D 10 ILE D 17 AB6 1 SER H 82 ? PRO H 84 ? SER D 85 PRO D 87 AB6 2 ARG H 112 ? PRO H 114 ? ARG D 115 PRO D 117 AB7 1 ILE H 93 ? ILE H 94 ? ILE D 96 ILE D 97 AB7 2 VAL H 213 ? VAL H 216 ? VAL D 216 VAL D 219 AB7 3 SER H 180 ? GLY H 184 ? SER D 183 GLY D 187 AB7 4 VAL H 249 ? ASP H 254 ? VAL D 252 ASP D 257 AB7 5 VAL H 302 ? GLN H 306 ? VAL D 305 GLN D 309 AB7 6 LYS H 150 ? GLY H 152 ? LYS D 153 GLY D 155 AB7 7 ALA H 329 ? THR H 330 ? ALA D 332 THR D 333 AB8 1 VAL H 131 ? LEU H 132 ? VAL D 134 LEU D 135 AB8 2 TYR H 145 ? ALA H 146 ? TYR D 148 ALA D 149 AB9 1 SER I 7 ? ILE I 14 ? SER E 10 ILE E 17 AB9 2 VAL I 17 ? GLN I 21 ? VAL E 20 GLN E 24 AB9 3 ALA I 56 ? ALA I 61 ? ALA E 59 ALA E 64 AB9 4 LEU I 46 ? HIS I 51 ? LEU E 49 HIS E 54 AB9 5 ALA I 33 ? THR I 35 ? ALA E 36 THR E 38 AB9 6 THR I 73 ? ASP I 76 ? THR E 76 ASP E 79 AB9 7 SER I 7 ? ILE I 14 ? SER E 10 ILE E 17 AC1 1 SER I 82 ? PRO I 84 ? SER E 85 PRO E 87 AC1 2 ARG I 112 ? PRO I 114 ? ARG E 115 PRO E 117 AC2 1 ILE I 93 ? ILE I 94 ? ILE E 96 ILE E 97 AC2 2 VAL I 213 ? VAL I 216 ? VAL E 216 VAL E 219 AC2 3 SER I 180 ? THR I 183 ? SER E 183 THR E 186 AC2 4 VAL I 249 ? VAL I 253 ? VAL E 252 VAL E 256 AC2 5 VAL I 302 ? SER I 304 ? VAL E 305 SER E 307 AC3 1 VAL I 131 ? LEU I 132 ? VAL E 134 LEU E 135 AC3 2 TYR I 145 ? ALA I 146 ? TYR E 148 ALA E 149 AC4 1 LYS I 150 ? GLY I 155 ? LYS E 153 GLY E 158 AC4 2 LEU I 327 ? LEU I 333 ? LEU E 330 LEU E 336 AC5 1 SER J 7 ? ILE J 14 ? SER F 10 ILE F 17 AC5 2 VAL J 17 ? PHE J 22 ? VAL F 20 PHE F 25 AC5 3 ALA J 56 ? ALA J 61 ? ALA F 59 ALA F 64 AC5 4 LEU J 46 ? HIS J 51 ? LEU F 49 HIS F 54 AC5 5 ALA J 33 ? ILE J 36 ? ALA F 36 ILE F 39 AC5 6 THR J 73 ? ASP J 76 ? THR F 76 ASP F 79 AC5 7 SER J 7 ? ILE J 14 ? SER F 10 ILE F 17 AC6 1 SER J 82 ? PRO J 84 ? SER F 85 PRO F 87 AC6 2 ARG J 112 ? PRO J 114 ? ARG F 115 PRO F 117 AC7 1 ILE J 93 ? ILE J 94 ? ILE F 96 ILE F 97 AC7 2 VAL J 213 ? VAL J 216 ? VAL F 216 VAL F 219 AC7 3 SER J 180 ? THR J 183 ? SER F 183 THR F 186 AC7 4 VAL J 249 ? VAL J 253 ? VAL F 252 VAL F 256 AC7 5 VAL J 302 ? GLN J 306 ? VAL F 305 GLN F 309 AC7 6 LYS J 150 ? GLY J 152 ? LYS F 153 GLY F 155 AC7 7 ALA J 329 ? THR J 330 ? ALA F 332 THR F 333 AC8 1 VAL J 131 ? LEU J 132 ? VAL F 134 LEU F 135 AC8 2 TYR J 145 ? ALA J 146 ? TYR F 148 ALA F 149 AC9 1 VAL K 170 ? SER K 173 ? VAL G 170 SER G 173 AC9 2 ILE K 153 ? MET K 156 ? ILE G 153 MET G 156 AC9 3 LEU K 67 ? VAL K 71 ? LEU G 67 VAL G 71 AC9 4 ASP K 100 ? ILE K 104 ? ASP G 100 ILE G 104 AC9 5 VAL K 120 ? ASN K 125 ? VAL G 120 ASN G 125 AC9 6 LYS M 42 ? GLU M 47 ? LYS I 42 GLU I 47 AC9 7 SER M 53 ? ALA M 58 ? SER I 53 ALA I 58 AD1 1 GLU L 49 ? LEU L 51 ? GLU H 50 LEU H 52 AD1 2 GLY L 73 ? LEU L 78 ? GLY H 74 LEU H 79 AD1 3 LYS L 82 ? THR L 87 ? LYS H 83 THR H 88 AD2 1 VAL L 55 ? VAL L 58 ? VAL H 56 VAL H 59 AD2 2 SER L 66 ? VAL L 70 ? SER H 67 VAL H 71 AD2 3 ALA L 90 ? PRO L 92 ? ALA H 91 PRO H 93 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N ARG E 32 ? N ARG A 32 O PHE E 44 ? O PHE A 44 AA1 2 3 N ALA E 41 ? N ALA A 41 O ILE E 75 ? O ILE A 75 AA1 3 4 O GLY E 74 ? O GLY A 74 N ASN E 67 ? N ASN A 67 AA1 4 5 O GLY E 63 ? O GLY A 63 N VAL E 55 ? N VAL A 55 AA1 5 6 N GLU E 56 ? N GLU A 56 O LYS E 91 ? O LYS A 91 AA1 6 7 O VAL E 90 ? O VAL A 90 N GLY E 31 ? N GLY A 31 AA2 1 2 N VAL E 99 ? N VAL A 99 O ALA E 129 ? O ALA A 129 AA3 1 2 N VAL E 110 ? N VAL A 110 O ALA E 235 ? O ALA A 235 AA3 2 3 O ILE E 232 ? O ILE A 232 N CYS E 203 ? N CYS A 203 AA3 3 4 N VAL E 208 ? N VAL A 208 O ASP E 271 ? O ASP A 271 AA3 4 5 N ILE E 268 ? N ILE A 268 O THR E 324 ? O THR A 324 AA4 1 2 N LEU E 168 ? N LEU A 168 O ILE E 352 ? O ILE A 352 AA4 2 3 N GLN E 351 ? N GLN A 351 O VAL E 373 ? O VAL A 373 AA5 1 2 N GLY F 37 ? N GLY B 37 O ILE F 40 ? O ILE B 40 AA5 2 3 N ALA F 41 ? N ALA B 41 O ILE F 75 ? O ILE B 75 AA5 3 4 O VAL F 76 ? O VAL B 76 N MET F 64 ? N MET B 64 AA5 4 5 O GLY F 63 ? O GLY B 63 N VAL F 55 ? N VAL B 55 AA5 5 6 N LEU F 54 ? N LEU B 54 O LYS F 95 ? O LYS B 95 AA6 1 2 N VAL F 99 ? N VAL B 99 O ALA F 129 ? O ALA B 129 AA7 1 2 N VAL F 110 ? N VAL B 110 O ALA F 235 ? O ALA B 235 AA7 2 3 O VAL F 234 ? O VAL B 234 N TYR F 205 ? N TYR B 205 AA7 3 4 N TYR F 202 ? N TYR B 202 O LEU F 267 ? O LEU B 267 AA7 4 5 N ILE F 268 ? N ILE B 268 O THR F 324 ? O THR B 324 AA7 5 6 O PRO F 327 ? O PRO B 327 N ILE F 169 ? N ILE B 169 AA8 1 2 N MET F 148 ? N MET B 148 O ILE F 161 ? O ILE B 161 AA9 1 2 N GLN F 351 ? N GLN B 351 O VAL F 373 ? O VAL B 373 AB1 1 2 N ARG G 32 ? N ARG C 32 O PHE G 44 ? O PHE C 44 AB1 2 3 N ALA G 41 ? N ALA C 41 O ILE G 75 ? O ILE C 75 AB1 3 4 O VAL G 76 ? O VAL C 76 N MET G 64 ? N MET C 64 AB1 4 5 O GLY G 63 ? O GLY C 63 N VAL G 55 ? N VAL C 55 AB1 5 6 N GLU G 56 ? N GLU C 56 O LYS G 91 ? O LYS C 91 AB1 6 7 O VAL G 90 ? O VAL C 90 N GLY G 31 ? N GLY C 31 AB2 1 2 N VAL G 99 ? N VAL C 99 O ALA G 129 ? O ALA C 129 AB3 1 2 N VAL G 110 ? N VAL C 110 O ALA G 235 ? O ALA C 235 AB3 2 3 O VAL G 234 ? O VAL C 234 N TYR G 205 ? N TYR C 205 AB3 3 4 N VAL G 208 ? N VAL C 208 O ASP G 271 ? O ASP C 271 AB3 4 5 N ILE G 268 ? N ILE C 268 O THR G 324 ? O THR C 324 AB3 5 6 O PRO G 327 ? O PRO C 327 N ILE G 169 ? N ILE C 169 AB4 1 2 N GLN G 351 ? N GLN C 351 O VAL G 373 ? O VAL C 373 AB5 1 2 N LYS H 9 ? N LYS D 12 O GLN H 21 ? O GLN D 24 AB5 2 3 N VAL H 18 ? N VAL D 21 O ALA H 59 ? O ALA D 62 AB5 3 4 O ILE H 60 ? O ILE D 63 N GLU H 47 ? N GLU D 50 AB5 4 5 O LEU H 46 ? O LEU D 49 N LEU H 34 ? N LEU D 37 AB5 5 6 N THR H 35 ? N THR D 38 O VAL H 75 ? O VAL D 78 AB5 6 7 O VAL H 74 ? O VAL D 77 N GLY H 8 ? N GLY D 11 AB6 1 2 N VAL H 83 ? N VAL D 86 O ASN H 113 ? O ASN D 116 AB7 1 2 N ILE H 94 ? N ILE D 97 O LEU H 215 ? O LEU D 218 AB7 2 3 O VAL H 216 ? O VAL D 219 N PHE H 182 ? N PHE D 185 AB7 3 4 N VAL H 181 ? N VAL D 184 O PHE H 252 ? O PHE D 255 AB7 4 5 N LEU H 251 ? N LEU D 254 O VAL H 305 ? O VAL D 308 AB7 5 6 O SER H 304 ? O SER D 307 N ILE H 151 ? N ILE D 154 AB7 6 7 N GLY H 152 ? 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O HIS H 92 # loop_ _struct_site.id _struct_site.pdbx_evidence_code _struct_site.pdbx_auth_asym_id _struct_site.pdbx_auth_comp_id _struct_site.pdbx_auth_seq_id _struct_site.pdbx_auth_ins_code _struct_site.pdbx_num_residues _struct_site.details AC1 Software A ATP 600 ? 7 'binding site for residue ATP A 600' AC2 Software A MG 601 ? 2 'binding site for residue MG A 601' AC3 Software B ADP 600 ? 13 'binding site for residue ADP B 600' AC4 Software B MG 601 ? 2 'binding site for residue MG B 601' AC5 Software C ADP 600 ? 14 'binding site for residue ADP C 600' AC6 Software C MG 601 ? 2 'binding site for residue MG C 601' AC7 Software D ADP 600 ? 10 'binding site for residue ADP D 600' AC8 Software D MG 601 ? 2 'binding site for residue MG D 601' AC9 Software E ADP 600 ? 10 'binding site for residue ADP E 600' AD1 Software F ADP 600 ? 10 'binding site for residue ADP F 600' AD2 Software F MG 601 ? 2 'binding site for residue MG F 601' # loop_ _struct_site_gen.id _struct_site_gen.site_id _struct_site_gen.pdbx_num_res _struct_site_gen.label_comp_id _struct_site_gen.label_asym_id _struct_site_gen.label_seq_id _struct_site_gen.pdbx_auth_ins_code _struct_site_gen.auth_comp_id _struct_site_gen.auth_asym_id _struct_site_gen.auth_seq_id _struct_site_gen.label_atom_id _struct_site_gen.label_alt_id _struct_site_gen.symmetry _struct_site_gen.details 1 AC1 7 ARG E 173 ? 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The map was scaled to 1.75 A after comparison with the model.' _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_protocol 'RIGID BODY FIT' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 5LQY _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages 2 _em_3d_reconstruction.num_particles 23065 _em_3d_reconstruction.resolution 7.8 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.5 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.source _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.entity_id_list _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.oligomeric_details 1 0 'The complex comprises of the catalytic domain, membrane domain and peripheral stalk of the yeast ATP synthase.' 'Yeast F1FO ATP Synthase' 'MULTIPLE SOURCES' COMPLEX '1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17' ? ? 2 1 'Yeast F1FO ATP Synthase' 'Yeast F1FO ATP Synthase' NATURAL COMPLEX '1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17' ? ? 3 1 'ATP synthase inhibitor protein IF1' 'ATP synthase inhibitor protein IF1' RECOMBINANT COMPLEX 10 ? ? # _em_image_scans.entry_id 5LQY _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.dimension_height 4096 _em_image_scans.dimension_width 4096 _em_image_scans.frames_per_image 69 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.sampling_size 14 _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.used_frames_per_image 1-32 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 5LQY _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure 'COMA FREE' _em_imaging.c2_aperture_diameter 70 _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification 81395 _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_max 5000 _em_imaging.nominal_defocus_min 1800 _em_imaging.nominal_magnification 47000 _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum 87.5 _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details ? _em_sample_support.grid_material GOLD _em_sample_support.grid_mesh_size 300 _em_sample_support.grid_type 'Quantifoil R0.6/1' _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature 277.15 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details 'Grids were blotted for 12-14 seconds before plunging.' _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.instrument 'HOMEMADE PLUNGER' _em_vitrification.entry_id 5LQY _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 5LQY _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 5LQY _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A ALA 1 ? 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54 ALA CB HB3 sing N N 55 ALA OXT HXT sing N N 56 ARG N CA sing N N 57 ARG N H sing N N 58 ARG N H2 sing N N 59 ARG CA C sing N N 60 ARG CA CB sing N N 61 ARG CA HA sing N N 62 ARG C O doub N N 63 ARG C OXT sing N N 64 ARG CB CG sing N N 65 ARG CB HB2 sing N N 66 ARG CB HB3 sing N N 67 ARG CG CD sing N N 68 ARG CG HG2 sing N N 69 ARG CG HG3 sing N N 70 ARG CD NE sing N N 71 ARG CD HD2 sing N N 72 ARG CD HD3 sing N N 73 ARG NE CZ sing N N 74 ARG NE HE sing N N 75 ARG CZ NH1 sing N N 76 ARG CZ NH2 doub N N 77 ARG NH1 HH11 sing N N 78 ARG NH1 HH12 sing N N 79 ARG NH2 HH21 sing N N 80 ARG NH2 HH22 sing N N 81 ARG OXT HXT sing N N 82 ASN N CA sing N N 83 ASN N H sing N N 84 ASN N H2 sing N N 85 ASN CA C sing N N 86 ASN CA CB sing N N 87 ASN CA HA sing N N 88 ASN C O doub N N 89 ASN C OXT sing N N 90 ASN CB CG sing N N 91 ASN CB HB2 sing N N 92 ASN CB HB3 sing N N 93 ASN CG OD1 doub N N 94 ASN CG ND2 sing N N 95 ASN ND2 HD21 sing N N 96 ASN ND2 HD22 sing N N 97 ASN OXT HXT sing N N 98 ASP N CA sing N N 99 ASP N H sing N N 100 ASP N H2 sing N N 101 ASP CA C sing N N 102 ASP CA CB sing N N 103 ASP CA HA sing N N 104 ASP C O doub N N 105 ASP C OXT sing N N 106 ASP CB CG sing N N 107 ASP CB HB2 sing N N 108 ASP CB HB3 sing N N 109 ASP CG OD1 doub N N 110 ASP CG OD2 sing N N 111 ASP OD2 HD2 sing N N 112 ASP OXT HXT sing N N 113 ATP PG O1G doub N N 114 ATP PG O2G sing N N 115 ATP PG O3G sing N N 116 ATP PG O3B sing N N 117 ATP O2G HOG2 sing N N 118 ATP O3G HOG3 sing N N 119 ATP PB O1B doub N N 120 ATP PB O2B sing N N 121 ATP PB O3B sing N N 122 ATP PB O3A sing N N 123 ATP O2B HOB2 sing N N 124 ATP PA O1A doub N N 125 ATP PA O2A sing N N 126 ATP PA O3A sing N N 127 ATP PA "O5'" sing N N 128 ATP O2A HOA2 sing N N 129 ATP "O5'" "C5'" sing N N 130 ATP "C5'" "C4'" sing N N 131 ATP "C5'" "H5'1" sing N N 132 ATP "C5'" "H5'2" sing N N 133 ATP "C4'" "O4'" sing N N 134 ATP "C4'" "C3'" sing N N 135 ATP "C4'" "H4'" sing N N 136 ATP "O4'" "C1'" sing N N 137 ATP "C3'" "O3'" sing N N 138 ATP "C3'" "C2'" sing N N 139 ATP "C3'" "H3'" sing N N 140 ATP "O3'" "HO3'" sing N N 141 ATP "C2'" "O2'" sing N N 142 ATP "C2'" "C1'" sing N N 143 ATP "C2'" "H2'" sing N N 144 ATP "O2'" "HO2'" sing N N 145 ATP "C1'" N9 sing N N 146 ATP "C1'" "H1'" sing N N 147 ATP N9 C8 sing Y N 148 ATP N9 C4 sing Y N 149 ATP C8 N7 doub Y N 150 ATP C8 H8 sing N N 151 ATP N7 C5 sing Y N 152 ATP C5 C6 sing Y N 153 ATP C5 C4 doub Y N 154 ATP C6 N6 sing N N 155 ATP C6 N1 doub Y N 156 ATP N6 HN61 sing N N 157 ATP N6 HN62 sing N N 158 ATP N1 C2 sing Y N 159 ATP C2 N3 doub Y N 160 ATP C2 H2 sing N N 161 ATP N3 C4 sing Y N 162 CYS N CA sing N N 163 CYS N H sing N N 164 CYS N H2 sing N N 165 CYS CA C sing N N 166 CYS CA CB sing N N 167 CYS CA HA sing N N 168 CYS C O doub N N 169 CYS C OXT sing N N 170 CYS CB SG sing N N 171 CYS CB HB2 sing N N 172 CYS CB HB3 sing N N 173 CYS SG HG sing N N 174 CYS OXT HXT sing N N 175 GLN N CA sing N N 176 GLN N H sing N N 177 GLN N H2 sing N N 178 GLN CA C sing N N 179 GLN CA CB sing N N 180 GLN CA HA sing N N 181 GLN C O doub N N 182 GLN C OXT sing N N 183 GLN CB CG sing N N 184 GLN CB HB2 sing N N 185 GLN CB HB3 sing N N 186 GLN CG CD sing N N 187 GLN CG HG2 sing N N 188 GLN CG HG3 sing N N 189 GLN CD OE1 doub N N 190 GLN CD NE2 sing N N 191 GLN NE2 HE21 sing N N 192 GLN NE2 HE22 sing N N 193 GLN OXT HXT sing N N 194 GLU N CA sing N N 195 GLU N H sing N N 196 GLU N H2 sing N N 197 GLU CA C sing N N 198 GLU CA CB sing N N 199 GLU CA HA sing N N 200 GLU C O doub N N 201 GLU C OXT sing N N 202 GLU CB CG sing N N 203 GLU CB HB2 sing N N 204 GLU CB HB3 sing N N 205 GLU CG CD sing N N 206 GLU CG HG2 sing N N 207 GLU CG HG3 sing N N 208 GLU CD OE1 doub N N 209 GLU CD OE2 sing N N 210 GLU OE2 HE2 sing N N 211 GLU OXT HXT sing N N 212 GLY N CA sing N N 213 GLY N H sing N N 214 GLY N H2 sing N N 215 GLY CA C sing N N 216 GLY CA HA2 sing N N 217 GLY CA HA3 sing N N 218 GLY C O doub N N 219 GLY C OXT sing N N 220 GLY OXT HXT sing N N 221 HIS N CA sing N N 222 HIS N H sing N N 223 HIS N H2 sing N N 224 HIS CA C sing N N 225 HIS CA CB sing N N 226 HIS CA HA sing N N 227 HIS C O doub N N 228 HIS C OXT sing N N 229 HIS CB CG sing N N 230 HIS CB HB2 sing N N 231 HIS CB HB3 sing N N 232 HIS CG ND1 sing Y N 233 HIS CG CD2 doub Y N 234 HIS ND1 CE1 doub Y N 235 HIS ND1 HD1 sing N N 236 HIS CD2 NE2 sing Y N 237 HIS CD2 HD2 sing N N 238 HIS CE1 NE2 sing Y N 239 HIS CE1 HE1 sing N N 240 HIS NE2 HE2 sing N N 241 HIS OXT HXT sing N N 242 ILE N CA sing N N 243 ILE N H sing N N 244 ILE N H2 sing N N 245 ILE CA C sing N N 246 ILE CA CB sing N N 247 ILE CA HA sing N N 248 ILE C O doub N N 249 ILE C OXT sing N N 250 ILE CB CG1 sing N N 251 ILE CB CG2 sing N N 252 ILE CB HB sing N N 253 ILE CG1 CD1 sing N N 254 ILE CG1 HG12 sing N N 255 ILE CG1 HG13 sing N N 256 ILE CG2 HG21 sing N N 257 ILE CG2 HG22 sing N N 258 ILE CG2 HG23 sing N N 259 ILE CD1 HD11 sing N N 260 ILE CD1 HD12 sing N N 261 ILE CD1 HD13 sing N N 262 ILE OXT HXT sing N N 263 LEU N CA sing N N 264 LEU N H sing N N 265 LEU N H2 sing N N 266 LEU CA C sing N N 267 LEU CA CB sing N N 268 LEU CA HA sing N N 269 LEU C O doub N N 270 LEU C OXT sing N N 271 LEU CB CG sing N N 272 LEU CB HB2 sing N N 273 LEU CB HB3 sing N N 274 LEU CG CD1 sing N N 275 LEU CG CD2 sing N N 276 LEU CG HG sing N N 277 LEU CD1 HD11 sing N N 278 LEU CD1 HD12 sing N N 279 LEU CD1 HD13 sing N N 280 LEU CD2 HD21 sing N N 281 LEU CD2 HD22 sing N N 282 LEU CD2 HD23 sing N N 283 LEU OXT HXT sing N N 284 LYS N CA sing N N 285 LYS N H sing N N 286 LYS N H2 sing N N 287 LYS CA C sing N N 288 LYS CA CB sing N N 289 LYS CA HA sing N N 290 LYS C O doub N N 291 LYS C OXT sing N N 292 LYS CB CG sing N N 293 LYS CB HB2 sing N N 294 LYS CB HB3 sing N N 295 LYS CG CD sing N N 296 LYS CG HG2 sing N N 297 LYS CG HG3 sing N N 298 LYS CD CE sing N N 299 LYS CD HD2 sing N N 300 LYS CD HD3 sing N N 301 LYS CE NZ sing N N 302 LYS CE HE2 sing N N 303 LYS CE HE3 sing N N 304 LYS NZ HZ1 sing N N 305 LYS NZ HZ2 sing N N 306 LYS NZ HZ3 sing N N 307 LYS OXT HXT sing N N 308 MET N CA sing N N 309 MET N H sing N N 310 MET N H2 sing N N 311 MET CA C sing N N 312 MET CA CB sing N N 313 MET CA HA sing N N 314 MET C O doub N N 315 MET C OXT sing N N 316 MET CB CG sing N N 317 MET CB HB2 sing N N 318 MET CB HB3 sing N N 319 MET CG SD sing N N 320 MET CG HG2 sing N N 321 MET CG HG3 sing N N 322 MET SD CE sing N N 323 MET CE HE1 sing N N 324 MET CE HE2 sing N N 325 MET CE HE3 sing N N 326 MET OXT HXT sing N N 327 PHE N CA sing N N 328 PHE N H sing N N 329 PHE N H2 sing N N 330 PHE CA C sing N N 331 PHE CA CB sing N N 332 PHE CA HA sing N N 333 PHE C O doub N N 334 PHE C OXT sing N N 335 PHE CB CG sing N N 336 PHE CB HB2 sing N N 337 PHE CB HB3 sing N N 338 PHE CG CD1 doub Y N 339 PHE CG CD2 sing Y N 340 PHE CD1 CE1 sing Y N 341 PHE CD1 HD1 sing N N 342 PHE CD2 CE2 doub Y N 343 PHE CD2 HD2 sing N N 344 PHE CE1 CZ doub Y N 345 PHE CE1 HE1 sing N N 346 PHE CE2 CZ sing Y N 347 PHE CE2 HE2 sing N N 348 PHE CZ HZ sing N N 349 PHE OXT HXT sing N N 350 PRO N CA sing N N 351 PRO N CD sing N N 352 PRO N H sing N N 353 PRO CA C sing N N 354 PRO CA CB sing N N 355 PRO CA HA sing N N 356 PRO C O doub N N 357 PRO C OXT sing N N 358 PRO CB CG sing N N 359 PRO CB HB2 sing N N 360 PRO CB HB3 sing N N 361 PRO CG CD sing N N 362 PRO CG HG2 sing N N 363 PRO CG HG3 sing N N 364 PRO CD HD2 sing N N 365 PRO CD HD3 sing N N 366 PRO OXT HXT sing N N 367 SER N CA sing N N 368 SER N H sing N N 369 SER N H2 sing N N 370 SER CA C sing N N 371 SER CA CB sing N N 372 SER CA HA sing N N 373 SER C O doub N N 374 SER C OXT sing N N 375 SER CB OG sing N N 376 SER CB HB2 sing N N 377 SER CB HB3 sing N N 378 SER OG HG sing N N 379 SER OXT HXT sing N N 380 THR N CA sing N N 381 THR N H sing N N 382 THR N H2 sing N N 383 THR CA C sing N N 384 THR CA CB sing N N 385 THR CA HA sing N N 386 THR C O doub N N 387 THR C OXT sing N N 388 THR CB OG1 sing N N 389 THR CB CG2 sing N N 390 THR CB HB sing N N 391 THR OG1 HG1 sing N N 392 THR CG2 HG21 sing N N 393 THR CG2 HG22 sing N N 394 THR CG2 HG23 sing N N 395 THR OXT HXT sing N N 396 TRP N CA sing N N 397 TRP N H sing N N 398 TRP N H2 sing N N 399 TRP CA C sing N N 400 TRP CA CB sing N N 401 TRP CA HA sing N N 402 TRP C O doub N N 403 TRP C OXT sing N N 404 TRP CB CG sing N N 405 TRP CB HB2 sing N N 406 TRP CB HB3 sing N N 407 TRP CG CD1 doub Y N 408 TRP CG CD2 sing Y N 409 TRP CD1 NE1 sing Y N 410 TRP CD1 HD1 sing N N 411 TRP CD2 CE2 doub Y N 412 TRP CD2 CE3 sing Y N 413 TRP NE1 CE2 sing Y N 414 TRP NE1 HE1 sing N N 415 TRP CE2 CZ2 sing Y N 416 TRP CE3 CZ3 doub Y N 417 TRP CE3 HE3 sing N N 418 TRP CZ2 CH2 doub Y N 419 TRP CZ2 HZ2 sing N N 420 TRP CZ3 CH2 sing Y N 421 TRP CZ3 HZ3 sing N N 422 TRP CH2 HH2 sing N N 423 TRP OXT HXT sing N N 424 TYR N CA sing N N 425 TYR N H sing N N 426 TYR N H2 sing N N 427 TYR CA C sing N N 428 TYR CA CB sing N N 429 TYR CA HA sing N N 430 TYR C O doub N N 431 TYR C OXT sing N N 432 TYR CB CG sing N N 433 TYR CB HB2 sing N N 434 TYR CB HB3 sing N N 435 TYR CG CD1 doub Y N 436 TYR CG CD2 sing Y N 437 TYR CD1 CE1 sing Y N 438 TYR CD1 HD1 sing N N 439 TYR CD2 CE2 doub Y N 440 TYR CD2 HD2 sing N N 441 TYR CE1 CZ doub Y N 442 TYR CE1 HE1 sing N N 443 TYR CE2 CZ sing Y N 444 TYR CE2 HE2 sing N N 445 TYR CZ OH sing N N 446 TYR OH HH sing N N 447 TYR OXT HXT sing N N 448 VAL N CA sing N N 449 VAL N H sing N N 450 VAL N H2 sing N N 451 VAL CA C sing N N 452 VAL CA CB sing N N 453 VAL CA HA sing N N 454 VAL C O doub N N 455 VAL C OXT sing N N 456 VAL CB CG1 sing N N 457 VAL CB CG2 sing N N 458 VAL CB HB sing N N 459 VAL CG1 HG11 sing N N 460 VAL CG1 HG12 sing N N 461 VAL CG1 HG13 sing N N 462 VAL CG2 HG21 sing N N 463 VAL CG2 HG22 sing N N 464 VAL CG2 HG23 sing N N 465 VAL OXT HXT sing N N 466 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 20 mM ? Tris-HCL 1 2 100 mM ? 'sodium chloride' 1 3 2 mM ? 'Magnesium sulphate' 1 4 2 mM ? ATP 1 5 0.05 % ? Cymal-7 # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type NONE _em_ctf_correction.details ? # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag ? _em_entity_assembly_molwt.units MEGADALTONS _em_entity_assembly_molwt.value 0.55 # loop_ _em_entity_assembly_naturalsource.id _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id _em_entity_assembly_naturalsource.cell _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_naturalsource.organ _em_entity_assembly_naturalsource.organelle _em_entity_assembly_naturalsource.organism _em_entity_assembly_naturalsource.strain _em_entity_assembly_naturalsource.tissue 2 2 ? ? 870730 ? ? 'Ogataea angusta' ? ? 3 3 ? ? 9913 ? ? 'Bos taurus' ? ? # _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 3 _em_entity_assembly_recombinant.id 1 _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 469008 _em_entity_assembly_recombinant.organism 'Escherichia coli BL21(DE3)' _em_entity_assembly_recombinant.plasmid ? _em_entity_assembly_recombinant.strain ? _em_entity_assembly_recombinant.cell ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ;The total exposure was 4 seconds resulting in 69 frames and a total dose of 64 e/A2. Frames were captured with an in-house protocol. For processing frames 1-32 were used. ; # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 64 _em_image_recording.average_exposure_time 4 _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode INTEGRATING _em_image_recording.film_or_detector_model 'FEI FALCON II (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images ? # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details ;After 2D classification, the number of particles used for orientation determination and reconstruction was 100724 particles followed by per-particle motion correction and B-factor weighting. ; _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 123683 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ;Using template generated with a subset of data, particles were automatically picked, followed by manual inspection and deletion of aggregates and non-particles. ; RELION 1.4 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' 'One image was collected for each hole' EPU ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' 'CTF correction was applied to each particle in RELION' CTFFIND 3 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? Coot 0.8.3 ? 1 ? 8 OTHER ? ? ? ? ? ? 9 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? 1 ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? RELION 1.4 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? RELION 1.4 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 3.5 _em_specimen.details 'The enzyme with bound inhibitor protein extracted in DDM and purified in Cymal-7.' _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # _atom_sites.entry_id 5LQY _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C MG N O P # loop_