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C . n # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 5MG3 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 5MG3 _struct.title 'EM fitted model of bacterial holo-translocon' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 5MG3 _struct_keywords.text 'holotranslocon, membrane protein insertion machinery, chaperone, protein secretion' _struct_keywords.pdbx_keywords CHAPERONE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? 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'expression tag' 554 82 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 25910 ? 1 MORE -179 ? 1 'SSA (A^2)' 75270 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LEU A 38 ? 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CZ Y ARG 256 ? ? NH1 Y ARG 256 ? ? 126.34 120.30 6.04 0.50 N 38 1 N Y TYR 258 ? ? CA Y TYR 258 ? ? CB Y TYR 258 ? ? 121.84 110.60 11.24 1.80 N 39 1 CB Y TRP 300 ? ? CG Y TRP 300 ? ? CD2 Y TRP 300 ? ? 116.73 126.60 -9.87 1.30 N 40 1 CB Y TYR 309 ? ? CG Y TYR 309 ? ? CD1 Y TYR 309 ? ? 117.36 121.00 -3.64 0.60 N 41 1 CB Y PHE 327 ? ? CG Y PHE 327 ? ? CD2 Y PHE 327 ? ? 127.29 120.80 6.49 0.70 N 42 1 CB Y PHE 330 ? ? CG Y PHE 330 ? ? CD2 Y PHE 330 ? ? 126.24 120.80 5.44 0.70 N 43 1 CB Y PHE 330 ? ? CG Y PHE 330 ? ? CD1 Y PHE 330 ? ? 114.36 120.80 -6.44 0.70 N 44 1 C Y ASN 338 ? ? N Y PRO 339 ? ? CA Y PRO 339 ? ? 129.34 119.30 10.04 1.50 Y 45 1 NE Y ARG 340 ? ? CZ Y ARG 340 ? ? NH1 Y ARG 340 ? ? 124.25 120.30 3.95 0.50 N 46 1 NE Y ARG 357 ? ? CZ Y ARG 357 ? ? NH1 Y ARG 357 ? ? 124.10 120.30 3.80 0.50 N 47 1 NE Y ARG 357 ? ? CZ Y ARG 357 ? ? NH2 Y ARG 357 ? ? 115.24 120.30 -5.06 0.50 N 48 1 CB Y TYR 365 ? ? CG Y TYR 365 ? ? CD2 Y TYR 365 ? ? 126.41 121.00 5.41 0.60 N 49 1 CB Y TYR 365 ? ? CG Y TYR 365 ? ? CD1 Y TYR 365 ? ? 115.35 121.00 -5.65 0.60 N 50 1 NE Y ARG 372 ? ? CZ Y ARG 372 ? ? NH1 Y ARG 372 ? ? 126.85 120.30 6.55 0.50 N 51 1 NE Y ARG 372 ? ? CZ Y ARG 372 ? ? NH2 Y ARG 372 ? ? 115.23 120.30 -5.07 0.50 N 52 1 CB Y TYR 380 ? ? CG Y TYR 380 ? ? CD1 Y TYR 380 ? ? 126.81 121.00 5.81 0.60 N 53 1 CB Y PHE 383 ? ? CG Y PHE 383 ? ? CD2 Y PHE 383 ? ? 115.04 120.80 -5.76 0.70 N 54 1 CB Y PHE 383 ? ? CG Y PHE 383 ? ? CD1 Y PHE 383 ? ? 127.87 120.80 7.07 0.70 N 55 1 CB Y PHE 390 ? ? CG Y PHE 390 ? ? CD1 Y PHE 390 ? ? 113.62 120.80 -7.18 0.70 N 56 1 NE Y ARG 392 ? ? CZ Y ARG 392 ? ? NH1 Y ARG 392 ? ? 129.32 120.30 9.02 0.50 N 57 1 NE Y ARG 392 ? ? CZ Y ARG 392 ? ? NH2 Y ARG 392 ? ? 115.15 120.30 -5.15 0.50 N 58 1 CB Y TYR 400 ? ? CG Y TYR 400 ? ? CD2 Y TYR 400 ? ? 126.46 121.00 5.46 0.60 N 59 1 CB Y TYR 400 ? ? CG Y TYR 400 ? ? CD1 Y TYR 400 ? ? 114.25 121.00 -6.75 0.60 N 60 1 NE E ARG 454 ? ? CZ E ARG 454 ? ? NH1 E ARG 454 ? ? 124.24 120.30 3.94 0.50 N 61 1 NE E ARG 454 ? ? CZ E ARG 454 ? ? NH2 E ARG 454 ? ? 115.00 120.30 -5.30 0.50 N 62 1 NE E ARG 457 ? ? CZ E ARG 457 ? ? NH2 E ARG 457 ? ? 114.27 120.30 -6.03 0.50 N 63 1 NE E ARG 461 ? ? CZ E ARG 461 ? ? NH1 E ARG 461 ? ? 126.43 120.30 6.13 0.50 N 64 1 NE E ARG 461 ? ? CZ E ARG 461 ? ? NH2 E ARG 461 ? ? 116.97 120.30 -3.33 0.50 N 65 1 CB E TRP 465 ? ? CG E TRP 465 ? ? CD1 E TRP 465 ? ? 119.00 127.00 -8.00 1.30 N 66 1 CD E ARG 468 ? ? NE E ARG 468 ? ? CZ E ARG 468 ? ? 132.21 123.60 8.61 1.40 N 67 1 CG E MET 485 ? ? SD E MET 485 ? ? CE E MET 485 ? ? 85.08 100.20 -15.12 1.60 N 68 1 NE E ARG 498 ? ? CZ E ARG 498 ? ? NH2 E ARG 498 ? ? 123.67 120.30 3.37 0.50 N 69 1 CB E PHE 502 ? ? CG E PHE 502 ? ? CD2 E PHE 502 ? ? 130.16 120.80 9.36 0.70 N 70 1 CB E PHE 502 ? ? CG E PHE 502 ? ? CD1 E PHE 502 ? ? 111.94 120.80 -8.86 0.70 N 71 1 NE E ARG 507 ? ? CZ E ARG 507 ? ? NH2 E ARG 507 ? ? 115.98 120.30 -4.32 0.50 N 72 1 CB G PHE 515 ? ? CG G PHE 515 ? ? CD2 G PHE 515 ? ? 114.46 120.80 -6.34 0.70 N 73 1 CD G ARG 518 ? ? NE G ARG 518 ? ? CZ G ARG 518 ? ? 132.39 123.60 8.79 1.40 N 74 1 NE G ARG 518 ? ? CZ G ARG 518 ? ? NH2 G ARG 518 ? ? 117.16 120.30 -3.14 0.50 N 75 1 NE D ARG 4 ? ? CZ D ARG 4 ? ? NH1 D ARG 4 ? ? 123.55 120.30 3.25 0.50 N 76 1 CB D TYR 23 ? ? CG D TYR 23 ? ? CD2 D TYR 23 ? ? 114.94 121.00 -6.06 0.60 N 77 1 CB D TYR 23 ? ? CG D TYR 23 ? ? CD1 D TYR 23 ? ? 125.77 121.00 4.77 0.60 N 78 1 NE D ARG 235 ? ? CZ D ARG 235 ? ? NH1 D ARG 235 ? ? 126.32 120.30 6.02 0.50 N 79 1 NE D ARG 235 ? ? CZ D ARG 235 ? ? NH2 D ARG 235 ? ? 117.28 120.30 -3.02 0.50 N 80 1 NE D ARG 237 ? ? CZ D ARG 237 ? ? NH1 D ARG 237 ? ? 126.54 120.30 6.24 0.50 N 81 1 NE D ARG 237 ? ? CZ D ARG 237 ? ? NH2 D ARG 237 ? ? 116.97 120.30 -3.33 0.50 N 82 1 NH1 D ARG 250 ? ? CZ D ARG 250 ? ? NH2 D ARG 250 ? ? 111.02 119.40 -8.38 1.10 N 83 1 NE D ARG 250 ? ? CZ D ARG 250 ? ? NH1 D ARG 250 ? ? 125.18 120.30 4.88 0.50 N 84 1 NE D ARG 250 ? ? CZ D ARG 250 ? ? NH2 D ARG 250 ? ? 123.79 120.30 3.49 0.50 N 85 1 NH1 D ARG 255 ? ? CZ D ARG 255 ? ? NH2 D ARG 255 ? ? 111.77 119.40 -7.63 1.10 N 86 1 NE D ARG 255 ? ? CZ D ARG 255 ? ? NH1 D ARG 255 ? ? 124.18 120.30 3.88 0.50 N 87 1 NE D ARG 255 ? ? CZ D ARG 255 ? ? NH2 D ARG 255 ? ? 123.64 120.30 3.34 0.50 N 88 1 CB D ASP 265 ? ? CG D ASP 265 ? ? OD1 D ASP 265 ? ? 124.20 118.30 5.90 0.90 N 89 1 NE D ARG 268 ? ? CZ D ARG 268 ? ? NH1 D ARG 268 ? ? 128.93 120.30 8.63 0.50 N 90 1 NE D ARG 268 ? ? CZ D ARG 268 ? ? NH2 D ARG 268 ? ? 111.91 120.30 -8.39 0.50 N 91 1 CB D PHE 281 ? ? CG D PHE 281 ? ? CD2 D PHE 281 ? ? 114.52 120.80 -6.28 0.70 N 92 1 NE D ARG 282 ? ? CZ D ARG 282 ? ? NH1 D ARG 282 ? ? 128.34 120.30 8.04 0.50 N 93 1 NE D ARG 297 ? ? CZ D ARG 297 ? ? NH1 D ARG 297 ? ? 131.61 120.30 11.31 0.50 N 94 1 NE D ARG 297 ? ? CZ D ARG 297 ? ? NH2 D ARG 297 ? ? 112.50 120.30 -7.80 0.50 N 95 1 CB D ASP 301 ? ? CG D ASP 301 ? ? OD1 D ASP 301 ? ? 123.76 118.30 5.46 0.90 N 96 1 NE D ARG 318 ? ? CZ D ARG 318 ? ? NH2 D ARG 318 ? ? 124.11 120.30 3.81 0.50 N 97 1 N D ASP 328 ? ? CA D ASP 328 ? ? CB D ASP 328 ? ? 121.78 110.60 11.18 1.80 N 98 1 CB D ASP 328 ? ? CG D ASP 328 ? ? OD1 D ASP 328 ? ? 124.71 118.30 6.41 0.90 N 99 1 CB D ASP 328 ? ? CG D ASP 328 ? ? OD2 D ASP 328 ? ? 109.60 118.30 -8.70 0.90 N 100 1 CB D TYR 336 ? ? CG D TYR 336 ? ? CD2 D TYR 336 ? ? 113.47 121.00 -7.53 0.60 N 101 1 CB D TYR 336 ? ? CG D TYR 336 ? ? CD1 D TYR 336 ? ? 125.35 121.00 4.35 0.60 N 102 1 CG D MET 353 ? ? SD D MET 353 ? ? CE D MET 353 ? ? 86.24 100.20 -13.96 1.60 N 103 1 CB D TYR 372 ? ? CG D TYR 372 ? ? CD2 D TYR 372 ? ? 115.66 121.00 -5.34 0.60 N 104 1 N D ALA 380 ? ? CA D ALA 380 ? ? CB D ALA 380 ? ? 100.27 110.10 -9.83 1.40 N 105 1 NE D ARG 383 ? ? CZ D ARG 383 ? ? NH1 D ARG 383 ? ? 123.96 120.30 3.66 0.50 N 106 1 NE D ARG 383 ? ? CZ D ARG 383 ? ? NH2 D ARG 383 ? ? 116.05 120.30 -4.25 0.50 N 107 1 CB D PHE 406 ? ? CG D PHE 406 ? ? CD2 D PHE 406 ? ? 112.67 120.80 -8.13 0.70 N 108 1 CB D PHE 406 ? ? CG D PHE 406 ? ? CD1 D PHE 406 ? ? 127.93 120.80 7.13 0.70 N 109 1 NH1 D ARG 407 ? ? CZ D ARG 407 ? ? NH2 D ARG 407 ? ? 112.36 119.40 -7.04 1.10 N 110 1 NE D ARG 407 ? ? CZ D ARG 407 ? ? NH1 D ARG 407 ? ? 127.83 120.30 7.53 0.50 N 111 1 NE D ARG 418 ? ? CZ D ARG 418 ? ? NH1 D ARG 418 ? ? 126.95 120.30 6.65 0.50 N 112 1 NE D ARG 418 ? ? CZ D ARG 418 ? ? NH2 D ARG 418 ? ? 115.81 120.30 -4.49 0.50 N 113 1 NE D ARG 439 ? ? CZ D ARG 439 ? ? NH2 D ARG 439 ? ? 116.41 120.30 -3.89 0.50 N 114 1 CB D TYR 472 ? ? CG D TYR 472 ? ? CD1 D TYR 472 ? ? 125.64 121.00 4.64 0.60 N 115 1 CB D PHE 475 ? ? CG D PHE 475 ? ? CD1 D PHE 475 ? ? 116.02 120.80 -4.78 0.70 N 116 1 N D ALA 541 ? ? CA D ALA 541 ? ? CB D ALA 541 ? ? 100.91 110.10 -9.19 1.40 N 117 1 CB D ASP 543 ? ? CG D ASP 543 ? ? OD2 D ASP 543 ? ? 112.56 118.30 -5.74 0.90 N 118 1 CB D TYR 546 ? ? CG D TYR 546 ? ? 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RELION ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'Baden-Wurttemberg Stiftung' Germany Meth-P-LS-4 1 'French National Research Agency' France 'ANR- 09-JCJC-0044' 2 'Biotechnology and Biological Sciences Research Council' 'United Kingdom' BB/P000940/1 3 # _atom_sites.entry_id 5MG3 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C H N O S # loop_