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'polypeptide(L)' no no ;MQVILLDKVANLGSLGDQVNVKAGYARNFLVPQGKAVPATKKNIEFFEARRAELEAKLAEVLAAANARAEKINALETVTI ASKAGDEGKLFGSIGTRDIADAVTAAGVEVAKSEVRLPNGVLRTTGEHEVSFQVHSEVFAKVIVNVVAE ; ;MQVILLDKVANLGSLGDQVNVKAGYARNFLVPQGKAVPATKKNIEFFEARRAELEAKLAEVLAAANARAEKINALETVTI ASKAGDEGKLFGSIGTRDIADAVTAAGVEVAKSEVRLPNGVLRTTGEHEVSFQVHSEVFAKVIVNVVAE ; H ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MKTFTAKPETVKRDWYVVDATGKTLGRLATELARRLRGKHKAEYTPHVDTGDYIIVLNADKVAVTGNKRTDKVYYHHTGH IGGIKQATFEEMIARRPERVIEIAVKGMLPKGPLGRAMFRKLKVYAGNEHNHAAQQPQVLDI ; ;MKTFTAKPETVKRDWYVVDATGKTLGRLATELARRLRGKHKAEYTPHVDTGDYIIVLNADKVAVTGNKRTDKVYYHHTGH IGGIKQATFEEMIARRPERVIEIAVKGMLPKGPLGRAMFRKLKVYAGNEHNHAAQQPQVLDI ; J ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MIQEQTMLNVADNSGARRVMCIKVLGGSHRRYAGVGDIIKITIKEAIPRGKVKKGDVLKAVVVRTKKGVRRPDGSVIRFD GNACVLLNNNSEQPIGTRIFGPVTRELRSEKFMKIISLAPEV ; ;MIQEQTMLNVADNSGARRVMCIKVLGGSHRRYAGVGDIIKITIKEAIPRGKVKKGDVLKAVVVRTKKGVRRPDGSVIRFD GNACVLLNNNSEQPIGTRIFGPVTRELRSEKFMKIISLAPEV ; K ? 11 'polypeptide(L)' no no ;RLNTLSPAEGSKKAGKRLGRGIGSGLGKTGGRGHKGQKSRSGGGVRRGFEGGQMPLYRRLPKFGFTSRKAAITAEIRLSD LAKVEGGVVDLNTLKAANIIGIQIEFAKVILAGEVTTPVTVRGLRVTKGARAAIEAAGGKIEE ; ;RLNTLSPAEGSKKAGKRLGRGIGSGLGKTGGRGHKGQKSRSGGGVRRGFEGGQMPLYRRLPKFGFTSRKAAITAEIRLSD LAKVEGGVVDLNTLKAANIIGIQIEFAKVILAGEVTTPVTVRGLRVTKGARAAIEAAGGKIEE ; L ? 12 'polypeptide(L)' no no ;MLQPKRTKFRKMHKGRNRGLAQGTDVSFGSFGLKAVGRGRLTARQIEAARRAMTRAVKRQGKIWIRVFPDKPITEKPLAV RMGKGKGNVEYWVALIQPGKVLYEMDGVPEELAREAFKLAAAKLPIKTTFVTKTVM ; ;MLQPKRTKFRKMHKGRNRGLAQGTDVSFGSFGLKAVGRGRLTARQIEAARRAMTRAVKRQGKIWIRVFPDKPITEKPLAV RMGKGKGNVEYWVALIQPGKVLYEMDGVPEELAREAFKLAAAKLPIKTTFVTKTVM ; M ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MRHRKSGRQLNRNSSHRQAMFRNMAGSLVRHEIIKTTLPKAKELRRVVEPLITLAKTDSVANRRLAFARTRDNEIVAKLF NELGPRFASRAGGYTRILKCGFRAGDNAPMAYIELVDRSE ; ;MRHRKSGRQLNRNSSHRQAMFRNMAGSLVRHEIIKTTLPKAKELRRVVEPLITLAKTDSVANRRLAFARTRDNEIVAKLF NELGPRFASRAGGYTRILKCGFRAGDNAPMAYIELVDRSE ; N ? 14 'polypeptide(L)' no no ;DKKSARIRRATRARRKLQELGATRLVVHRTPRHIYAQVIAPNGSEVLVAASTVEKAIAEQLKYTGNKDAAAAVGKAVAER ALEKGIKDVSFDRSGFQYHGRVQALADAAREAGLQF ; ;DKKSARIRRATRARRKLQELGATRLVVHRTPRHIYAQVIAPNGSEVLVAASTVEKAIAEQLKYTGNKDAAAAVGKAVAER ALEKGIKDVSFDRSGFQYHGRVQALADAAREAGLQF ; O ? 15 'polypeptide(L)' no no ;SNIIKQLEQEQMKQDVPSFRPGDTVEVKVWVVEGSKKRLQAFEGVVIAIRNRGLHSAFTVRKISNGEGVERVFQTHSPVV DSISVKRRGAVRKAKLYYLRERTGKAARIKERLN ; ;SNIIKQLEQEQMKQDVPSFRPGDTVEVKVWVVEGSKKRLQAFEGVVIAIRNRGLHSAFTVRKISNGEGVERVFQTHSPVV DSISVKRRGAVRKAKLYYLRERTGKAARIKERLN ; P ? 16 'polypeptide(L)' no no ;ARVKRGVIARARHKKILKQAKGYYGARSRVYRVAFQAVIKAGQYAYRDRRQRKRQFRQLWIARINAAARQNGISYSKFIN GLKKASVEIDRKILADIAVFDKVAFTALVEKAKAALA ; ;ARVKRGVIARARHKKILKQAKGYYGARSRVYRVAFQAVIKAGQYAYRDRRQRKRQFRQLWIARINAAARQNGISYSKFIN GLKKASVEIDRKILADIAVFDKVAFTALVEKAKAALA ; Q ? 17 'polypeptide(L)' no no ;MYAVFQSGGKQHRVSEGQTVRLEKLDIATGETVEFAEVLMIANGEEVKIGVPFVDGGVIKAEVVAHGRGEKVKIVKFRRR KHYRKQQGHRQWFTDVKITGISA ; ;MYAVFQSGGKQHRVSEGQTVRLEKLDIATGETVEFAEVLMIANGEEVKIGVPFVDGGVIKAEVVAHGRGEKVKIVKFRRR KHYRKQQGHRQWFTDVKITGISA ; R ? 18 'polypeptide(L)' no no ;METIAKHRHARSSAQKVRLVADLIRGKKVSQALDILTYTNKKAAVLVKKVLESAIANAEHNDGADIDDLKVTKIFVDEGP SMKRIMPRAKGRADRILKRTSHITVVVSDR ; ;METIAKHRHARSSAQKVRLVADLIRGKKVSQALDILTYTNKKAAVLVKKVLESAIANAEHNDGADIDDLKVTKIFVDEGP SMKRIMPRAKGRADRILKRTSHITVVVSDR ; S ? 19 'polypeptide(L)' no no ;MIREERLLKVLRAPHVSEKASTAMEKSNTIVLKVAKDATKAEIKAAVQKLFEVEVEVVNTLVVKGKVKRHGQRIGRRSDW KKAYVTLKEGQNL ; ;MIREERLLKVLRAPHVSEKASTAMEKSNTIVLKVAKDATKAEIKAAVQKLFEVEVEVVNTLVVKGKVKRHGQRIGRRSDW KKAYVTLKEGQNL ; T ? 20 'polypeptide(L)' no no ;AAKIRRDDEVIVLTGKDKGKRGKVKNVLSSGKVIVEGINLVKKHQKPVPALNQPGGIVEKEAAIQVSNVAIFNAATGKAD RVGFRFEDGKKVRFFKSNSETI ; ;AAKIRRDDEVIVLTGKDKGKRGKVKNVLSSGKVIVEGINLVKKHQKPVPALNQPGGIVEKEAAIQVSNVAIFNAATGKAD RVGFRFEDGKKVRFFKSNSETI ; U ? 21 'polypeptide(L)' no no ;MFTINAEVRKEQGKGASRRLRAANKFPAIIYGGKEAPLAIELDHDKVMNMQAKAEFYSEVLTIVVDGKEIKVKAQDVQRH PYKPKLQHIDFVRA ; ;MFTINAEVRKEQGKGASRRLRAANKFPAIIYGGKEAPLAIELDHDKVMNMQAKAEFYSEVLTIVVDGKEIKVKAQDVQRH PYKPKLQHIDFVRA ; V ? 22 'polypeptide(L)' no no RNGRDSEAKRLGVKRFGGESVLAGSIIVRQRGTKFHAGANVGCGRDHTLFAKADGKVKFEVKGPKNRKFISIEAE RNGRDSEAKRLGVKRFGGESVLAGSIIVRQRGTKFHAGANVGCGRDHTLFAKADGKVKFEVKGPKNRKFISIEAE W ? 23 'polypeptide(L)' no no SRVCQVTGKRPVTGNNRSHALNATKRRFLPNLHSHRFWVESEKRFVTLRVSAKGMRVIDKKGIDTVLAELRARGEKY SRVCQVTGKRPVTGNNRSHALNATKRRFLPNLHSHRFWVESEKRFVTLRVSAKGMRVIDKKGIDTVLAELRARGEKY X ? 24 'polypeptide(L)' no no MKAKELREKSVEELNTELLNLLREQFNLRMQAASGQLQQSHLLKQVRRDVARVKTLLNEKAGA MKAKELREKSVEELNTELLNLLREQFNLRMQAASGQLQQSHLLKQVRRDVARVKTLLNEKAGA Y ? 25 'polypeptide(L)' no no AKTIKITQTRSAIGRLPKHKATLLGLGLRRIGHTVEREDTPAIRGMINAVSFMVKVEE AKTIKITQTRSAIGRLPKHKATLLGLGLRRIGHTVEREDTPAIRGMINAVSFMVKVEE Z ? 26 'polypeptide(L)' no no AVQQNKPTRSKRGMRRSHDALTAVTSLSVDKTSGEKHLRHHITADGYYRGRKVIAK AVQQNKPTRSKRGMRRSHDALTAVTSLSVDKTSGEKHLRHHITADGYYRGRKVIAK 0 ? 27 'polypeptide(L)' no no GIREKIKLVSSAGTGHFYTTTKNKRTKPEKLELKKFDPVVRQHVIYKEAK GIREKIKLVSSAGTGHFYTTTKNKRTKPEKLELKKFDPVVRQHVIYKEAK 1 ? 28 'polypeptide(L)' no no MKRTFQPSVLKRNRSHGFRARMATKNGRQVLARRRAKGRARLTVSK MKRTFQPSVLKRNRSHGFRARMATKNGRQVLARRRAKGRARLTVSK 2 ? 29 'polypeptide(L)' no no PKIKTVRGAAKRFKKTGKGGFKHKHANLRHILTKKATKRKRHLRPKAMVSKGDLGLVIACLPYA PKIKTVRGAAKRFKKTGKGGFKHKHANLRHILTKKATKRKRHLRPKAMVSKGDLGLVIACLPYA 3 ? 30 'polypeptide(L)' no no MKVRASVKKLCRNCKIVKRDGVIRVICSAEPKHKQRQG MKVRASVKKLCRNCKIVKRDGVIRVICSAEPKHKQRQG 4 ? 31 'polypeptide(L)' no no MKKDIHPKYEEITASCSCGNVMKIRSTVGHDLNLDVCSKCHPFFTGKQRDVATGGRVDRFNKRFNI MKKDIHPKYEEITASCSCGNVMKIRSTVGHDLNLDVCSKCHPFFTGKQRDVATGGRVDRFNKRFNI 6 ? 32 polyribonucleotide no no ;AAUUGAAGAGUUUGAUCAUGGCUCAGAUUGAACGCUGGCGGCAGGCCUAACACAUGCAAGUCGAACGGUAACAGGAAGAA GCUUGCUUCUUUGCUGACGAGUGGCGGACGGGUGAGUAAUGUCUGGGAAACUGCCUGAUGGAGGGGGAUAACUACUGGAA ACGGUAGCUAAUACCGCAUAACGUCGCAAGACCAAAGAGGGGGACCUUCGGGCCUCUUGCCAUCGGAUGUGCCCAGAUGG GAUUAGCUAGUAGGUGGGGUAACGGCUCACCUAGGCGACGAUCCCUAGCUGGUCUGAGAGGAUGACCAGCCACACUGGAA CUGAGACACGGUCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUAUUGCACAAUGGGCGCAAGCCUGAUGCAGCCAUGCC GCGUGUAUGAAGAAGGCCUUCGGGUUGUAAAGUACUUUCAGCGGGGAGGAAGGGAGUAAAGUUAAUACCUUUGCUCAUUG 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CCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGUUAAAACUCAAAUGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUU CGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCUGGUCUUGACAUCCACGGAAGUUUUCAGAGAUGAGAAUGUGCCUUCGGGAACCGUG AGACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUUGUGAAAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUAUCCU UUGUUGCCAGCGGUCCGGCCGGGAACUCAAAGGAGACUGCCAGUGAUAAACUGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCA UCAUGGCCCUUACGACCAGGGCUACACACGUGCUACAAUGGCGCAUACAAAGAGAAGCGACCUCGCGAGAGCAAGCGGAC CUCAUAAAGUGCGUCGUAGUCCGGAUUGGAGUCUGCAACUCGACUCCAUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGUGGAUCAG AAUGCCACGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGUGGGUUGCAAAAGAAGUAGGUA GCUUAACCUUCGGGAGGGCGCUUACCACUUUGUGAUUCAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAACCGUAGGGGAACC UGCGGUUGGAUCACCUCCU ; a ? 33 'polypeptide(L)' no no ;MLKAGVHFGHQTRYWNPKMKPFIFGARNKVHIINLEKTVPMFNEALAELNKIASRKGKILFVGTKRAASEAVKDAALSCD QFFVNHRWLGGMLTNWKTVRQSIKRLKDLETQSQDGTFDKLTKKEALMRTRELEKLENSLGGIKDMGGLPDALFVIDADH EHIAIKEANNLGIPVFAIVDTNSDPDGVDFVIPGNDDAIRAVTLYLGAVAATVREGRS ; 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RSLKKGPFIDLHLLKKVEKAVESGDKKPLRTWSRRSTIFPNMIGLTIAVHNGRQHVPVFVTDEMVGHKLGEFAPTRTYR s ? 51 'polypeptide(L)' no no ;NIKSAKKRAIQSEKARKHNASRRSMMRTFIKKVYAAIEAGDKAAAQKAFNEMQPIVDRQAAKGLIHKNKAARHKANLTAQ INKLA ; ;NIKSAKKRAIQSEKARKHNASRRSMMRTFIKKVYAAIEAGDKAAAQKAFNEMQPIVDRQAAKGLIHKNKAARHKANLTAQ INKLA ; t ? 52 'polypeptide(L)' no no IKVRENEPFDVALRRFKRSCEKAGVLAEVRRREFYEKPTTERKRAKASAVKRHAKKLARENARRT IKVRENEPFDVALRRFKRSCEKAGVLAEVRRREFYEKPTTERKRAKASAVKRHAKKLARENARRT u ? 53 polyribonucleotide no no CCGCCG CCGCCG v ? 54 'polypeptide(L)' no no SRYQHTKGQIKDNAIEALLHDPLFRQRVEKNKKGKGSYMRKGKHG SRYQHTKGQIKDNAIEALLHDPLFRQRVEKNKKGKGSYMRKGKHG w ? 55 polyribonucleotide no no CGGUGAUUGGCGCAGCCUGGUAGCGCACUUCGUUCGGGACGAAGGGGUCGGAGGUUCGAAUCCUCUAUCACCGACCA CGGUGAUUGGCGCAGCCUGGUAGCGCACUUCGUUCGGGACGAAGGGGUCGGAGGUUCGAAUCCUCUAUCACCGACCA x ? 56 'polypeptide(L)' no no ;PVNNRIQDLTERSDVLRGYLDYDAKKERLEEVNAELEQPDVWNEPERAQALGKERSSLEAVVDTLDQMKQGLEDVSGLLE LAVEADDEETFNEAVAELDALEEKLAQLEFRRMFSGEYDSADCYLDIQAGSGGTEAQDWASMLERMYLRWAESRGFKTEI IEESEGEVAGIKSVTIKISGDYAYGWLRTETGVHRLVRKSPFDSGGRRHTSFSSAFVYPEVDDDIDIEINPADLRIDVYR TSGAGAQHVNRTESAVRITHIPTGIVTQCQNDRSQHKNKDQAMKQMKAKLYELEMQKKNAEKQAMEDNKSDIGWGSQIRS YVLDDSRIKDLRTGVETRNTQAVLDGSLDQFIEASLKAG ; ;PVNNRIQDLTERSDVLRGYLDYDAKKERLEEVNAELEQPDVWNEPERAQALGKERSSLEAVVDTLDQMKQGLEDVSGLLE LAVEADDEETFNEAVAELDALEEKLAQLEFRRMFSGEYDSADCYLDIQAGSGGTEAQDWASMLERMYLRWAESRGFKTEI IEESEGEVAGIKSVTIKISGDYAYGWLRTETGVHRLVRKSPFDSGGRRHTSFSSAFVYPEVDDDIDIEINPADLRIDVYR TSGAGAQHVNRTESAVRITHIPTGIVTQCQNDRSQHKNKDQAMKQMKAKLYELEMQKKNAEKQAMEDNKSDIGWGSQIRS YVLDDSRIKDLRTGVETRNTQAVLDGSLDQFIEASLKAG ; z ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 G n 1 2 G n 1 3 U n 1 4 U n 1 5 A n 1 6 A n 1 7 G n 1 8 C n 1 9 G n 1 10 A n 1 11 C n 1 12 U n 1 13 A n 1 14 A n 1 15 G n 1 16 C n 1 17 G n 1 18 U n 1 19 A n 1 20 C n 1 21 A n 1 22 C n 1 23 G n 1 24 G n 1 25 U n 1 26 G n 1 27 G n 1 28 A n 1 29 U n 1 30 G n 1 31 C n 1 32 C n 1 33 C n 1 34 U n 1 35 G n 1 36 G n 1 37 C 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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 30 1 sample 1 38 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 31 1 sample 1 66 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 32 1 sample 1 1539 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 33 1 sample 1 218 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 34 1 sample 1 206 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 35 1 sample 1 205 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 36 1 sample 1 157 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 37 1 sample 1 100 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 38 1 sample 1 151 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 39 1 sample 1 129 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 40 1 sample 1 127 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 41 1 sample 1 98 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 42 1 sample 1 116 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 43 1 sample 1 123 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 44 1 sample 1 114 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 45 1 sample 1 101 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 46 1 sample 1 88 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 47 1 sample 1 82 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 48 1 sample 1 80 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 49 1 sample 1 65 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 50 1 sample 1 79 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 51 1 sample 1 85 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 52 1 sample 1 65 ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 55 1 sample 1 77 ? 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'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 5MGP _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 5MGP _struct.title 'Structural basis for ArfA-RF2 mediated translation termination on stop-codon lacking mRNAs' _struct.pdbx_descriptor ;50S ribosomal protein L2, 50S ribosomal protein L3, 50S ribosomal protein L4, 50S ribosomal protein L5, 50S ribosomal protein L6, 50S ribosomal protein L9, 50S ribosomal protein L13, 50S ribosomal protein L14, 50S ribosomal protein L15, 50S ribosomal protein L16, 50S ribosomal protein L17, 50S ribosomal protein L18, 50S ribosomal protein L19, 50S ribosomal protein L20, 50S ribosomal protein L21, 50S ribosomal protein L22, 50S ribosomal protein L23, 50S ribosomal protein L24, 50S ribosomal protein L25, 50S ribosomal protein L27, 50S ribosomal protein L28, 50S ribosomal protein L29, 50S ribosomal protein L30, 50S ribosomal protein L32, 50S ribosomal protein L33, 50S ribosomal protein L34, 50S ribosomal protein L35, 50S ribosomal protein L36, 50S ribosomal protein L31, 30S ribosomal protein S2, 30S ribosomal protein S3, 30S ribosomal protein S4, 30S ribosomal protein S5, 30S ribosomal protein S6, 30S ribosomal protein S7, 30S ribosomal protein S8, 30S ribosomal protein S9, 30S ribosomal protein S10, 30S ribosomal protein S11, 30S ribosomal protein S12, 30S ribosomal protein S13, 30S ribosomal protein S14, 30S ribosomal protein S15, 30S ribosomal protein S16, 30S ribosomal protein S17, 30S ribosomal protein S18, 30S ribosomal protein S19, 30S ribosomal protein S20, 30S ribosomal protein S21, Alternative ribosome-rescue factor A, Peptide chain release factor 2/RNA Complex ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 5MGP _struct_keywords.text 'Cryo-Em, Ribosome, Termination, alternative rescue factor A' _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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'G-A MISPAIR' ? ? hydrog3184 hydrog ? ? FA G 141 N1 ? ? ? 1_555 FA C 220 N3 ? ? a G 142 a C 221 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3185 hydrog ? ? FA G 141 N2 ? ? ? 1_555 FA C 220 O2 ? ? a G 142 a C 221 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3186 hydrog ? ? FA G 141 O6 ? ? ? 1_555 FA C 220 N4 ? ? a G 142 a C 221 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3187 hydrog ? ? FA G 143 N1 ? ? ? 1_555 FA C 177 N3 ? ? a G 144 a C 178 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3188 hydrog ? ? FA G 143 N2 ? ? ? 1_555 FA C 177 O2 ? ? a G 144 a C 178 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3189 hydrog ? ? FA G 143 O6 ? ? ? 1_555 FA C 177 N4 ? ? a G 144 a C 178 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3190 hydrog ? ? FA G 144 N1 ? ? ? 1_555 FA G 176 O6 ? ? a G 145 a G 177 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog3191 hydrog ? ? FA G 144 N2 ? ? ? 1_555 FA G 176 N7 ? ? a G 145 a G 177 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog3192 hydrog ? ? FA G 145 N1 ? ? ? 1_555 FA C 175 N3 ? ? a G 146 a C 176 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3193 hydrog ? ? FA G 145 N2 ? ? ? 1_555 FA C 175 O2 ? ? a G 146 a C 176 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3194 hydrog ? ? FA G 145 O6 ? ? ? 1_555 FA C 175 N4 ? ? a G 146 a C 176 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3195 hydrog ? ? FA G 146 N1 ? ? ? 1_555 FA C 174 N3 ? ? a G 147 a C 175 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3196 hydrog ? ? FA G 146 N2 ? ? ? 1_555 FA C 174 O2 ? ? a G 147 a C 175 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3197 hydrog ? ? FA G 146 O6 ? ? ? 1_555 FA C 174 N4 ? ? a G 147 a C 175 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3198 hydrog ? ? FA G 147 N1 ? ? ? 1_555 FA A 173 N1 ? ? a G 148 a A 174 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? hydrog3199 hydrog ? ? FA G 147 O6 ? ? ? 1_555 FA A 173 N6 ? ? a G 148 a A 174 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? hydrog3200 hydrog ? ? FA A 148 N1 ? ? ? 1_555 FA A 171 N6 ? ? a A 149 a A 172 1_555 ? ? ? ? ? ? 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'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? hydrog ? ? # _struct_mon_prot_cis.pdbx_id 1 _struct_mon_prot_cis.label_comp_id LYS _struct_mon_prot_cis.label_seq_id 32 _struct_mon_prot_cis.label_asym_id BB _struct_mon_prot_cis.label_alt_id . _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code ? _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id LYS _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id 33 _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id w _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 LYS _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 33 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 BB _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 ? _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 LYS _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 34 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 w _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num 1 _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 0.07 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 6 ? 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P A G 1112 ? ? 127.23 119.70 7.53 1.20 Y 27 1 "C3'" A G 1236 ? ? "O3'" A G 1236 ? ? P A A 1237 ? ? 127.76 119.70 8.06 1.20 Y 28 1 N1 A U 1313 ? ? C2 A U 1313 ? ? O2 A U 1313 ? ? 129.01 122.80 6.21 0.70 N 29 1 N3 A U 1313 ? ? C2 A U 1313 ? ? O2 A U 1313 ? ? 116.50 122.20 -5.70 0.70 N 30 1 C6 A U 1313 ? ? N1 A U 1313 ? ? "C1'" A U 1313 ? ? 112.27 121.20 -8.93 1.40 N 31 1 C2 A U 1313 ? ? N1 A U 1313 ? ? "C1'" A U 1313 ? ? 128.99 117.70 11.29 1.20 N 32 1 "C3'" A A 1378 ? ? "O3'" A A 1378 ? ? P A U 1379 ? ? 128.07 119.70 8.37 1.20 Y 33 1 "O3'" A A 1378 ? ? P A U 1379 ? ? OP1 A U 1379 ? ? 118.27 110.50 7.77 1.10 Y 34 1 "C3'" A A 1626 ? ? "O3'" A A 1626 ? ? P A G 1627 ? ? 127.36 119.70 7.66 1.20 Y 35 1 "O3'" A A 1626 ? ? P A G 1627 ? ? OP2 A G 1627 ? ? 117.72 110.50 7.22 1.10 Y 36 1 C6 A C 1914 ? ? N1 A C 1914 ? ? C2 A C 1914 ? ? 116.45 120.30 -3.85 0.40 N 37 1 N1 A C 1914 ? ? C2 A C 1914 ? ? O2 A C 1914 ? ? 124.51 118.90 5.61 0.60 N 38 1 N3 A C 1914 ? ? C2 A C 1914 ? ? O2 A C 1914 ? ? 115.21 121.90 -6.69 0.70 N 39 1 C2 A C 1914 ? ? N1 A C 1914 ? ? "C1'" A C 1914 ? ? 127.78 118.80 8.98 1.10 N 40 1 N1 A U 1917 ? ? C2 A U 1917 ? ? O2 A U 1917 ? ? 127.70 122.80 4.90 0.70 N 41 1 N3 A U 1917 ? ? C2 A U 1917 ? ? O2 A U 1917 ? ? 116.32 122.20 -5.88 0.70 N 42 1 C2 A U 1917 ? ? N1 A U 1917 ? ? "C1'" A U 1917 ? ? 127.00 117.70 9.30 1.20 N 43 1 C6 A C 1920 ? ? N1 A C 1920 ? ? C2 A C 1920 ? ? 117.61 120.30 -2.69 0.40 N 44 1 "C3'" A G 1930 ? ? "O3'" A G 1930 ? ? P A U 1931 ? ? 127.84 119.70 8.14 1.20 Y 45 1 "C3'" A U 1940 ? ? "O3'" A U 1940 ? ? P A C 1941 ? ? 127.68 119.70 7.98 1.20 Y 46 1 C5 A C 2043 ? ? C6 A C 2043 ? ? N1 A C 2043 ? ? 124.47 121.00 3.47 0.50 N 47 1 C6 A C 2044 ? ? N1 A C 2044 ? ? C2 A C 2044 ? ? 117.76 120.30 -2.54 0.40 N 48 1 C5 A C 2072 ? ? C6 A C 2072 ? ? N1 A C 2072 ? ? 124.03 121.00 3.03 0.50 N 49 1 N3 A G 2162 ? ? C4 A G 2162 ? ? C5 A G 2162 ? ? 125.16 128.60 -3.44 0.50 N 50 1 N3 A G 2162 ? ? C4 A G 2162 ? ? N9 A G 2162 ? ? 129.95 126.00 3.95 0.60 N 51 1 C8 A G 2162 ? ? N9 A G 2162 ? ? "C1'" A G 2162 ? ? 118.61 127.00 -8.39 1.30 N 52 1 C4 A G 2162 ? ? N9 A G 2162 ? ? "C1'" A G 2162 ? ? 136.40 126.50 9.90 1.30 N 53 1 N1 A U 2457 ? ? C2 A U 2457 ? ? O2 A U 2457 ? ? 127.85 122.80 5.05 0.70 N 54 1 N3 A U 2457 ? ? C2 A U 2457 ? ? O2 A U 2457 ? ? 116.94 122.20 -5.26 0.70 N 55 1 C2 A U 2457 ? ? N1 A U 2457 ? ? "C1'" A U 2457 ? ? 126.51 117.70 8.81 1.20 N 56 1 N1 A U 2504 ? ? C2 A U 2504 ? ? O2 A U 2504 ? ? 128.04 122.80 5.24 0.70 N 57 1 N3 A U 2504 ? ? C2 A U 2504 ? ? O2 A U 2504 ? ? 116.48 122.20 -5.72 0.70 N 58 1 C2 A U 2504 ? ? N1 A U 2504 ? ? "C1'" A U 2504 ? ? 126.40 117.70 8.70 1.20 N 59 1 C6 A C 2579 ? ? N1 A C 2579 ? ? C2 A C 2579 ? ? 117.67 120.30 -2.63 0.40 N 60 1 N1 A U 2580 ? ? C2 A U 2580 ? ? O2 A U 2580 ? ? 129.10 122.80 6.30 0.70 N 61 1 N3 A U 2580 ? ? C2 A U 2580 ? ? O2 A U 2580 ? ? 115.26 122.20 -6.94 0.70 N 62 1 C2 A U 2580 ? ? N1 A U 2580 ? ? "C1'" A U 2580 ? ? 126.83 117.70 9.13 1.20 N 63 1 N3 A U 2604 ? ? C2 A U 2604 ? ? O2 A U 2604 ? ? 116.66 122.20 -5.54 0.70 N 64 1 C2 A U 2604 ? ? N1 A U 2604 ? ? "C1'" A U 2604 ? ? 128.02 117.70 10.32 1.20 N 65 1 N3 A U 2605 ? ? C2 A U 2605 ? ? O2 A U 2605 ? ? 117.11 122.20 -5.09 0.70 N 66 1 C2 A U 2605 ? ? N1 A U 2605 ? ? "C1'" A U 2605 ? ? 127.07 117.70 9.37 1.20 N 67 1 C6 A C 2646 ? ? N1 A C 2646 ? ? C2 A C 2646 ? ? 117.60 120.30 -2.70 0.40 N 68 1 C6 A C 2723 ? ? N1 A C 2723 ? ? C2 A C 2723 ? ? 117.89 120.30 -2.41 0.40 N 69 1 "C3'" A U 2798 ? ? "O3'" A U 2798 ? ? P A A 2799 ? ? 127.08 119.70 7.38 1.20 Y 70 1 "C3'" A G 2808 ? ? "O3'" A G 2808 ? ? P A A 2809 ? ? 127.07 119.70 7.37 1.20 Y 71 1 "O3'" A A 2820 ? ? P A A 2821 ? ? OP1 A A 2821 ? ? 118.75 110.50 8.25 1.10 Y 72 1 N1 A U 2884 ? ? C2 A U 2884 ? ? O2 A U 2884 ? ? 128.31 122.80 5.51 0.70 N 73 1 N3 A U 2884 ? ? C2 A U 2884 ? ? O2 A U 2884 ? ? 116.86 122.20 -5.34 0.70 N 74 1 C2 A U 2884 ? ? N1 A U 2884 ? ? "C1'" A U 2884 ? ? 125.85 117.70 8.15 1.20 N 75 1 "O3'" B C 3 ? ? P B C 4 ? ? OP1 B C 4 ? ? 117.15 110.50 6.65 1.10 Y 76 1 "O4'" B C 12 ? ? "C1'" B C 12 ? ? N1 B C 12 ? ? 113.18 108.50 4.68 0.70 N 77 1 N1 B C 12 ? ? C2 B C 12 ? ? O2 B C 12 ? ? 124.07 118.90 5.17 0.60 N 78 1 N3 B C 12 ? ? C2 B C 12 ? ? O2 B C 12 ? ? 117.05 121.90 -4.85 0.70 N 79 1 C6 B C 12 ? ? N1 B C 12 ? ? "C1'" B C 12 ? ? 112.58 120.80 -8.22 1.20 N 80 1 C2 B C 12 ? ? N1 B C 12 ? ? "C1'" B C 12 ? ? 128.60 118.80 9.80 1.10 N 81 1 "C3'" B G 44 ? ? "O3'" B G 44 ? ? P B A 45 ? ? 127.91 119.70 8.21 1.20 Y 82 1 "C3'" B A 52 ? ? "O3'" B A 52 ? ? P B A 53 ? ? 127.20 119.70 7.50 1.20 Y 83 1 N1 a U 4 ? ? C2 a U 4 ? ? O2 a U 4 ? ? 130.74 122.80 7.94 0.70 N 84 1 N3 a U 4 ? ? C2 a U 4 ? ? O2 a U 4 ? ? 115.04 122.20 -7.16 0.70 N 85 1 C6 a U 4 ? ? N1 a U 4 ? ? "C1'" a U 4 ? ? 111.44 121.20 -9.76 1.40 N 86 1 C2 a U 4 ? ? N1 a U 4 ? ? "C1'" a U 4 ? ? 130.49 117.70 12.79 1.20 N 87 1 C6 a C 58 ? ? N1 a C 58 ? ? C2 a C 58 ? ? 117.80 120.30 -2.50 0.40 N 88 1 C6 a C 311 ? ? N1 a C 311 ? ? C2 a C 311 ? ? 117.71 120.30 -2.59 0.40 N 89 1 N1 a C 436 ? ? C2 a C 436 ? ? O2 a C 436 ? ? 122.69 118.90 3.79 0.60 N 90 1 N3 a U 516 ? ? C2 a U 516 ? ? O2 a U 516 ? ? 117.20 122.20 -5.00 0.70 N 91 1 C2 a U 516 ? ? N1 a U 516 ? ? "C1'" a U 516 ? ? 126.54 117.70 8.84 1.20 N 92 1 C5 a G 529 ? ? C6 a G 529 ? ? O6 a G 529 ? ? 124.83 128.60 -3.77 0.60 N 93 1 C6 a C 545 ? ? N1 a C 545 ? ? C2 a C 545 ? ? 117.89 120.30 -2.41 0.40 N 94 1 N3 a C 545 ? ? C2 a C 545 ? ? O2 a C 545 ? ? 117.64 121.90 -4.26 0.70 N 95 1 C6 a C 556 ? ? N1 a C 556 ? ? C2 a C 556 ? ? 117.75 120.30 -2.55 0.40 N 96 1 N1 a C 754 ? ? C2 a C 754 ? ? O2 a C 754 ? ? 122.51 118.90 3.61 0.60 N 97 1 C2 a C 754 ? ? N1 a C 754 ? ? "C1'" a C 754 ? ? 126.53 118.80 7.73 1.10 N 98 1 "O4'" a A 792 ? ? "C1'" a A 792 ? ? N9 a A 792 ? ? 113.88 108.50 5.38 0.70 N 99 1 N1 a U 813 ? ? C2 a U 813 ? ? O2 a U 813 ? ? 127.38 122.80 4.58 0.70 N 100 1 N3 a U 813 ? ? C2 a U 813 ? ? O2 a U 813 ? ? 117.86 122.20 -4.34 0.70 N 101 1 "C3'" a G 890 ? ? "O3'" a G 890 ? ? P a U 891 ? ? 127.31 119.70 7.61 1.20 Y 102 1 C6 a C 924 ? ? N1 a C 924 ? ? C2 a C 924 ? ? 117.87 120.30 -2.43 0.40 N 103 1 "C3'" a U 960 ? ? "O3'" a U 960 ? ? P a U 961 ? ? 127.75 119.70 8.05 1.20 Y 104 1 C6 a C 1027 ? ? N1 a C 1027 ? ? C2 a C 1027 ? ? 117.78 120.30 -2.52 0.40 N 105 1 C5 a C 1027 ? ? C6 a C 1027 ? ? N1 a C 1027 ? ? 124.07 121.00 3.07 0.50 N 106 1 N3 a G 1138 ? ? C4 a G 1138 ? ? C5 a G 1138 ? ? 125.03 128.60 -3.57 0.50 N 107 1 N3 a G 1138 ? ? C4 a G 1138 ? ? N9 a G 1138 ? ? 130.06 126.00 4.06 0.60 N 108 1 C4 a G 1138 ? ? N9 a G 1138 ? ? "C1'" a G 1138 ? ? 135.24 126.50 8.74 1.30 N 109 1 N1 a C 1158 ? ? C2 a C 1158 ? ? O2 a C 1158 ? ? 124.48 118.90 5.58 0.60 N 110 1 N3 a C 1158 ? ? C2 a C 1158 ? ? O2 a C 1158 ? ? 117.13 121.90 -4.77 0.70 N 111 1 C6 a C 1158 ? ? N1 a C 1158 ? ? "C1'" a C 1158 ? ? 113.33 120.80 -7.47 1.20 N 112 1 C2 a C 1158 ? ? N1 a C 1158 ? ? "C1'" a C 1158 ? ? 128.15 118.80 9.35 1.10 N 113 1 "C3'" a G 1182 ? ? "O3'" a G 1182 ? ? P a U 1183 ? ? 126.99 119.70 7.29 1.20 Y 114 1 "C3'" a G 1297 ? ? "O3'" a G 1297 ? ? P a U 1298 ? ? 127.60 119.70 7.90 1.20 Y 115 1 "C3'" a G 1300 ? ? "O3'" a G 1300 ? ? P a U 1301 ? ? 127.45 119.70 7.75 1.20 Y 116 1 N1 a U 1301 ? ? C2 a U 1301 ? ? O2 a U 1301 ? ? 128.00 122.80 5.20 0.70 N 117 1 N3 a U 1301 ? ? C2 a U 1301 ? ? O2 a U 1301 ? ? 117.78 122.20 -4.42 0.70 N 118 1 C2 a U 1301 ? ? N1 a U 1301 ? ? "C1'" a U 1301 ? ? 127.28 117.70 9.58 1.20 N 119 1 "C3'" a G 1305 ? ? "O3'" a G 1305 ? ? P a A 1306 ? ? 127.70 119.70 8.00 1.20 Y 120 1 "O4'" a A 1346 ? ? "C1'" a A 1346 ? ? N9 a A 1346 ? ? 112.73 108.50 4.23 0.70 N 121 1 "C3'" a G 1432 ? ? "O3'" a G 1432 ? ? P a A 1433 ? ? 127.31 119.70 7.61 1.20 Y 122 1 "O4'" a A 1518 ? ? "C1'" a A 1518 ? ? N9 a A 1518 ? ? 113.56 108.50 5.06 0.70 N 123 1 CA c LEU 156 ? ? CB c LEU 156 ? ? CG c LEU 156 ? ? 132.49 115.30 17.19 2.30 N 124 1 CA d LEU 4 ? ? CB d LEU 4 ? ? CG d LEU 4 ? ? 129.41 115.30 14.11 2.30 N 125 1 CA f LEU 54 ? ? CB f LEU 54 ? ? CG f LEU 54 ? ? 134.00 115.30 18.70 2.30 N 126 1 CB w ASP 22 ? ? CG w ASP 22 ? ? OD1 w ASP 22 ? ? 123.95 118.30 5.65 0.90 N 127 1 "C3'" x G 3 ? ? "O3'" x G 3 ? ? P x U 4 ? ? 127.40 119.70 7.70 1.20 Y 128 1 "O3'" x G 3 ? ? P x U 4 ? ? OP1 x U 4 ? ? 117.16 110.50 6.66 1.10 Y 129 1 N3 x U 55 ? ? C2 x U 55 ? ? 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WA VAL 9 CG1 53 1 Y 1 r VAL 17 ? CG2 ? WA VAL 9 CG2 54 1 Y 1 r GLN 18 ? CG ? WA GLN 10 CG 55 1 Y 1 r GLN 18 ? CD ? WA GLN 10 CD 56 1 Y 1 r GLN 18 ? OE1 ? WA GLN 10 OE1 57 1 Y 1 r GLN 18 ? NE2 ? WA GLN 10 NE2 58 1 Y 1 u ARG 54 ? CG ? ZA ARG 52 CG 59 1 Y 1 u ARG 54 ? CD ? ZA ARG 52 CD 60 1 Y 1 u ARG 54 ? NE ? ZA ARG 52 NE 61 1 Y 1 u ARG 54 ? CZ ? ZA ARG 52 CZ 62 1 Y 1 u ARG 54 ? NH1 ? ZA ARG 52 NH1 63 1 Y 1 u ARG 54 ? NH2 ? ZA ARG 52 NH2 64 1 Y 1 u HIS 55 ? CG ? ZA HIS 53 CG 65 1 Y 1 u HIS 55 ? ND1 ? ZA HIS 53 ND1 66 1 Y 1 u HIS 55 ? CD2 ? ZA HIS 53 CD2 67 1 Y 1 u HIS 55 ? CE1 ? ZA HIS 53 CE1 68 1 Y 1 u HIS 55 ? NE2 ? ZA HIS 53 NE2 69 1 Y 1 u LYS 57 ? CG ? ZA LYS 55 CG 70 1 Y 1 u LYS 57 ? CD ? ZA LYS 55 CD 71 1 Y 1 u LYS 57 ? CE ? ZA LYS 55 CE 72 1 Y 1 u LYS 57 ? NZ ? ZA LYS 55 NZ 73 1 Y 1 u LYS 58 ? CG ? ZA LYS 56 CG 74 1 Y 1 u LYS 58 ? CD ? ZA LYS 56 CD 75 1 Y 1 u LYS 58 ? CE ? ZA LYS 56 CE 76 1 Y 1 u LYS 58 ? NZ ? ZA LYS 56 NZ 77 1 Y 1 u LEU 59 ? CG ? ZA LEU 57 CG 78 1 Y 1 u LEU 59 ? 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FREALIGN 9.11 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 5MGP 'double helix' 5MGP 'a-form double helix' 5MGP 'parallel strands' 5MGP 'hairpin loop' 5MGP tetraloop 5MGP 'bulge loop' 5MGP 'mismatched base pair' 5MGP 'internal loop' 5MGP 'triple helix' 5MGP 'quadruple helix' 5MGP 'three-way junction' 5MGP 'four-way junction' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A G 1 1_555 A C 2902 1_555 0.689 0.631 -0.931 -13.278 -16.287 -0.765 1 A_G1:C2902_A A 1 ? 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