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US ? ? primary Immunity IUNIEH 2048 1097-4180 ? ? 48 ? 45 58.e6 ;Structural Activation of Pro-inflammatory Human Cytokine IL-23 by Cognate IL-23 Receptor Enables Recruitment of the Shared Receptor IL-12R beta 1. ; 2018 ? 10.1016/j.immuni.2017.12.008 29287995 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1 'To Be Published' ? 0353 ? ? ? ? ? ? ? 'Human antibodies that bind human IL-12 and methods for producing' ? ? ? ? ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Bloch, Y.' 1 ? primary 'Bouchareychas, L.' 2 ? primary 'Merceron, R.' 3 ? primary 'Skladanowska, K.' 4 ? primary 'Van den Bossche, L.' 5 ? primary 'Detry, S.' 6 ? primary 'Govindarajan, S.' 7 ? primary 'Elewaut, D.' 8 ? primary 'Haerynck, F.' 9 ? primary 'Dullaers, M.' 10 ? primary 'Adamopoulos, I.E.' 11 ? primary 'Savvides, S.N.' 12 ? 1 'Salfeld, J.' 13 ? 1 'Smith, S.' 14 ? # _cell.entry_id 5N2K _cell.length_a 85.250 _cell.length_b 172.540 _cell.length_c 138.159 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 106.16 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 14 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5N2K _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Briakinumab FAb light chain' 25925.178 7 ? ? ? 'the secretion signal is cleaved off likely between residues 29 and 30' 2 polymer man 'Briakinumab FAb heavy chain' 30719.658 7 ? ? ? ;The secretion signal is cleaved off likely between residues 29 and 30. The purification tag was removed by thrombin digest cleaving between residues 256 and 257. ; 3 polymer man 'Briakinumab FAb light chain' 25908.148 1 ? ? ? 'The secretion signal is cleaved off between residues29 and 30.' 4 polymer man 'Briakinumab FAb heavy chain' 30702.627 1 ? ? ? ;The secretion signal is cleaved off between residues 29 and 30. The purification tag was removed by thrombin digest cleaving between residues 256 and 257. ; 5 non-polymer syn 1,2-ETHANEDIOL 62.068 1 ? ? ? ? 6 water nat water 18.015 1005 ? ? ? ? # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MGILPSPGMPALLSLVSLLSVLLMGCVAQSVLTQPPSVSGAPGQRVTISCSGSRSNIGSNTVKWYQQLPGTAPKLLIYYN DQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAITGLQAEDEADYYCQSYDRYTHPALLFGTGTKVTVLGQPKAAPSVTLFPPSSEELQA NKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVA PTECS ; ;MGILPSPGMPALLSLVSLLSVLLMGCVAQSVLTQPPSVSGAPGQRVTISCSGSRSNIGSNTVKWYQQLPGTAPKLLIYYN DQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAITGLQAEDEADYYCQSYDRYTHPALLFGTGTKVTVLGQPKAAPSVTLFPPSSEELQA NKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVA PTECS ; A,C,E,I,K,M,O ? 2 'polypeptide(L)' no no 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LYS H 203 ASN H 206 5 ? 4 HELX_P HELX_P33 AD6 ASN I 56 ? ASN I 60 ? ASN I 28 ASN I 32 5 ? 5 HELX_P HELX_P34 AD7 GLN I 108 ? GLU I 112 ? GLN I 80 GLU I 84 5 ? 5 HELX_P HELX_P35 AD8 SER I 154 ? ALA I 160 ? SER I 126 ALA I 132 1 ? 7 HELX_P HELX_P36 AD9 THR I 214 ? LYS I 219 ? THR I 186 LYS I 191 1 ? 6 HELX_P HELX_P37 AE1 THR J 56 ? TYR J 60 ? THR J 28 TYR J 32 5 ? 5 HELX_P HELX_P38 AE2 ARG J 115 ? THR J 119 ? ARG J 87 THR J 91 5 ? 5 HELX_P HELX_P39 AE3 SER J 186 ? ALA J 188 ? SER J 158 ALA J 160 5 ? 3 HELX_P HELX_P40 AE4 SER J 217 ? LEU J 219 ? SER J 189 LEU J 191 5 ? 3 HELX_P HELX_P41 AE5 LYS J 231 ? ASN J 234 ? LYS J 203 ASN J 206 5 ? 4 HELX_P HELX_P42 AE6 ASN K 56 ? ASN K 60 ? ASN K 28 ASN K 32 5 ? 5 HELX_P HELX_P43 AE7 GLN K 108 ? GLU K 112 ? GLN K 80 GLU K 84 5 ? 5 HELX_P HELX_P44 AE8 SER K 154 ? ALA K 160 ? SER K 126 ALA K 132 1 ? 7 HELX_P HELX_P45 AE9 THR K 214 ? LYS K 219 ? THR K 186 LYS K 191 1 ? 6 HELX_P HELX_P46 AF1 THR L 56 ? TYR L 60 ? 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ARG P 87 THR P 91 5 ? 5 HELX_P HELX_P61 AG7 SER O 186 ? ALA O 188 ? SER P 158 ALA P 160 5 ? 3 HELX_P HELX_P62 AG8 LYS O 231 ? ASN O 234 ? LYS P 203 ASN P 206 5 ? 4 HELX_P HELX_P63 AG9 GLN P 108 ? GLU P 112 ? GLN O 80 GLU O 84 5 ? 5 HELX_P HELX_P64 AH1 SER P 154 ? ALA P 160 ? SER O 126 ALA O 132 1 ? 7 HELX_P HELX_P65 AH2 THR P 214 ? LYS P 219 ? 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C CYS 244 SG ? ? ? 1_555 D CYS 246 SG ? ? C CYS 216 D CYS 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf11 disulf ? ? D CYS 50 SG ? ? ? 1_555 D CYS 124 SG A ? D CYS 22 D CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf12 disulf ? ? D CYS 50 SG ? ? ? 1_555 D CYS 124 SG B ? D CYS 22 D CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? disulf13 disulf ? ? D CYS 170 SG ? ? ? 1_555 D CYS 226 SG A ? D CYS 142 D CYS 198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf14 disulf ? ? E CYS 50 SG ? ? ? 1_555 E CYS 117 SG ? ? E CYS 22 E CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf15 disulf ? ? E CYS 167 SG ? ? ? 1_555 E CYS 226 SG ? ? E CYS 139 E CYS 198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? disulf16 disulf ? ? F CYS 50 SG ? ? ? 1_555 F CYS 124 SG A ? F CYS 22 F CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf17 disulf ? ? F CYS 50 SG ? ? ? 1_555 F CYS 124 SG B ? F CYS 22 F CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf18 disulf ? ? F CYS 170 SG A ? ? 1_555 F CYS 226 SG ? ? F CYS 142 F CYS 198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf19 disulf ? ? 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J CYS 50 SG ? ? ? 1_555 J CYS 124 SG A ? J CYS 22 J CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf29 disulf ? ? J CYS 50 SG ? ? ? 1_555 J CYS 124 SG B ? J CYS 22 J CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf30 disulf ? ? J CYS 170 SG ? ? ? 1_555 J CYS 226 SG ? ? J CYS 142 J CYS 198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf31 disulf ? ? K CYS 50 SG ? ? ? 1_555 K CYS 117 SG ? ? K CYS 22 K CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf32 disulf ? ? K CYS 167 SG ? ? ? 1_555 K CYS 226 SG ? ? K CYS 139 K CYS 198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf33 disulf ? ? L CYS 50 SG ? ? ? 1_555 L CYS 124 SG A ? L CYS 22 L CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf34 disulf ? ? L CYS 50 SG ? ? ? 1_555 L CYS 124 SG B ? L CYS 22 L CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf35 disulf ? ? L CYS 170 SG ? ? ? 1_555 L CYS 226 SG ? ? L CYS 142 L CYS 198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf36 disulf ? ? M CYS 50 SG ? ? ? 1_555 M CYS 117 SG ? ? M CYS 22 M CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf37 disulf ? ? M CYS 167 SG ? ? ? 1_555 M CYS 226 SG ? ? M CYS 139 M CYS 198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf38 disulf ? ? N CYS 50 SG ? ? ? 1_555 N CYS 124 SG B ? N CYS 22 N CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf39 disulf ? ? N CYS 50 SG ? ? ? 1_555 N CYS 124 SG A ? N CYS 22 N CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf40 disulf ? ? N CYS 170 SG ? ? ? 1_555 N CYS 226 SG ? ? N CYS 142 N CYS 198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf41 disulf ? ? O CYS 50 SG ? ? ? 1_555 O CYS 124 SG A ? P CYS 22 P CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf42 disulf ? ? O CYS 50 SG ? ? ? 1_555 O CYS 124 SG B ? P CYS 22 P CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf43 disulf ? ? O CYS 170 SG ? ? ? 1_555 O CYS 226 SG ? ? P CYS 142 P CYS 198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf44 disulf ? ? P CYS 50 SG ? ? ? 1_555 P CYS 117 SG ? ? O CYS 22 O CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf45 disulf ? ? P CYS 167 SG ? ? ? 1_555 P CYS 226 SG ? ? O CYS 139 O CYS 198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? covale1 covale both ? 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OE2 P GLU 150 ? ? 2.17 # loop_ _pdbx_validate_symm_contact.id _pdbx_validate_symm_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_symm_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_symm_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_symm_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_symm_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_symm_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_symm_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_symm_contact.site_symmetry_1 _pdbx_validate_symm_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_symm_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_symm_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_symm_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_symm_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_symm_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_symm_contact.site_symmetry_2 _pdbx_validate_symm_contact.dist 1 1 OH D TYR 59 ? ? 1_555 OH P TYR 59 ? ? 2_445 1.91 2 1 OH B TYR 59 ? ? 1_555 OH F TYR 59 ? ? 2_454 1.92 3 1 OH H TYR 59 ? ? 1_555 OH L TYR 59 ? ? 2_445 1.95 4 1 O H HOH 329 ? ? 1_555 O L HOH 330 ? ? 2_445 2.12 # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 ASN A 28 ? ? -95.81 -87.93 2 1 ASN A 52 ? ? 75.70 -44.18 3 1 ASP A 53 ? ? -148.15 14.24 4 1 ARG A 94 ? A -115.24 -164.60 5 1 HIS A 97 ? B -61.64 -78.79 6 1 ASP A 156 ? ? 57.83 -100.69 7 1 SER B 115 ? ? -100.34 40.97 8 1 ASP B 146 ? ? 56.17 77.63 9 1 ASN C 28 ? ? -94.74 -87.80 10 1 ASN C 52 ? ? 77.19 -45.54 11 1 ASP C 53 ? ? -150.41 12.50 12 1 ASP C 156 ? ? 58.85 -101.15 13 1 SER D 115 ? ? -102.39 43.87 14 1 ASP D 146 ? ? 56.95 79.00 15 1 THR D 222 ? ? -166.64 -31.82 16 1 ASN E 28 ? ? -95.51 -87.74 17 1 ASN E 52 ? ? 76.71 -44.57 18 1 ASP E 53 ? ? -151.04 13.07 19 1 ALA E 85 ? ? -175.61 -179.60 20 1 ASP E 93 ? ? -106.45 -75.85 21 1 ASP E 156 ? ? 58.23 -99.97 22 1 SER F 115 ? ? -102.16 42.95 23 1 ASP F 146 ? ? 56.34 78.27 24 1 ASN G 28 ? ? -93.76 -88.27 25 1 ASN G 52 ? ? 75.73 -45.03 26 1 ASP G 53 ? ? -148.63 14.95 27 1 ASP G 156 ? ? 57.91 -100.52 28 1 SER H 115 ? ? -100.33 40.89 29 1 ALA H 138 ? ? -173.59 147.29 30 1 ASP H 146 ? ? 57.92 79.35 31 1 ASN I 28 ? ? -95.41 -89.39 32 1 ASN I 52 ? ? 71.87 -45.50 33 1 ASN I 52 ? ? 72.88 -45.50 34 1 ASP I 53 ? ? -149.48 14.74 35 1 HIS I 97 ? A 14.88 -89.01 36 1 ASP I 156 ? ? 58.26 -101.29 37 1 SER J 115 ? ? -98.68 39.17 38 1 ASP J 146 ? ? 57.64 78.17 39 1 ASN K 28 ? ? -93.43 -88.20 40 1 ASN K 52 ? ? 75.49 -44.73 41 1 ASP K 53 ? ? -150.31 11.95 42 1 LEU K 111 ? ? -65.13 98.45 43 1 ASP K 156 ? ? 58.97 -100.23 44 1 SER L 115 ? ? -95.28 39.80 45 1 ASP L 146 ? ? 58.18 79.21 46 1 ASN M 28 ? ? -96.07 -88.13 47 1 ASN M 52 ? ? 75.49 -45.52 48 1 ASP M 53 ? ? -150.98 12.89 49 1 ASP M 93 ? ? -117.33 -74.15 50 1 LEU M 111 ? ? -65.86 99.31 51 1 ASP M 156 ? ? 58.50 -100.79 52 1 SER N 115 ? ? -93.15 39.77 53 1 ASP N 146 ? ? 57.96 79.39 54 1 SER P 115 ? ? -101.34 42.12 55 1 ASP P 146 ? ? 56.38 79.28 56 1 ASN O 28 ? ? -95.23 -88.33 57 1 ASN O 52 ? ? 75.07 -44.73 58 1 ASP O 53 ? ? -149.01 14.43 59 1 ASP O 156 ? ? 58.15 -99.80 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_atom_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_alt_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_atom_id 1 1 Y 1 A GLN 1 ? 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C GLU 243 CG 53 1 Y 1 C GLU 215 ? CD ? C GLU 243 CD 54 1 Y 1 C GLU 215 ? OE1 ? C GLU 243 OE1 55 1 Y 1 C GLU 215 ? OE2 ? C GLU 243 OE2 56 1 Y 1 D GLN 1 ? CD ? D GLN 29 CD 57 1 Y 1 D GLN 1 ? OE1 ? D GLN 29 OE1 58 1 Y 1 D GLN 1 ? NE2 ? D GLN 29 NE2 59 1 Y 1 D ARG 16 ? NE ? D ARG 44 NE 60 1 Y 1 D ARG 16 ? CZ ? D ARG 44 CZ 61 1 Y 1 D ARG 16 ? NH1 ? D ARG 44 NH1 62 1 Y 1 D ARG 16 ? NH2 ? D ARG 44 NH2 63 1 Y 1 D LYS 76 ? CE ? D LYS 104 CE 64 1 Y 1 D LYS 76 ? NZ ? D LYS 104 NZ 65 1 Y 1 D SER 130 ? OG ? D SER 158 OG 66 1 Y 1 D LYS 216 ? CG ? D LYS 244 CG 67 1 Y 1 D LYS 216 ? CD ? D LYS 244 CD 68 1 Y 1 D LYS 216 ? CE ? D LYS 244 CE 69 1 Y 1 D LYS 216 ? NZ ? D LYS 244 NZ 70 1 Y 1 D LYS 220 ? CG ? D LYS 248 CG 71 1 Y 1 D LYS 220 ? CD ? D LYS 248 CD 72 1 Y 1 D LYS 220 ? CE ? D LYS 248 CE 73 1 Y 1 D LYS 220 ? NZ ? D LYS 248 NZ 74 1 Y 1 D THR 222 ? OG1 ? D THR 250 OG1 75 1 Y 1 D THR 222 ? CG2 ? D THR 250 CG2 76 1 Y 1 D ARG 228 ? CG ? D ARG 256 CG 77 1 Y 1 D ARG 228 ? CD ? D ARG 256 CD 78 1 Y 1 D ARG 228 ? NE ? D ARG 256 NE 79 1 Y 1 D ARG 228 ? CZ ? D ARG 256 CZ 80 1 Y 1 D ARG 228 ? NH1 ? D ARG 256 NH1 81 1 Y 1 D ARG 228 ? NH2 ? D ARG 256 NH2 82 1 Y 1 E GLN 1 ? CG ? E GLN 29 CG 83 1 Y 1 E GLN 1 ? CD ? E GLN 29 CD 84 1 Y 1 E GLN 1 ? OE1 ? E GLN 29 OE1 85 1 Y 1 E GLN 1 ? NE2 ? E GLN 29 NE2 86 1 Y 1 E LYS 161 ? CG ? E LYS 189 CG 87 1 Y 1 E LYS 161 ? CD ? E LYS 189 CD 88 1 Y 1 E LYS 161 ? CE ? E LYS 189 CE 89 1 Y 1 E LYS 161 ? NZ ? E LYS 189 NZ 90 1 Y 1 F GLN 1 ? CG ? F GLN 29 CG 91 1 Y 1 F GLN 1 ? CD ? F GLN 29 CD 92 1 Y 1 F GLN 1 ? OE1 ? F GLN 29 OE1 93 1 Y 1 F GLN 1 ? NE2 ? F GLN 29 NE2 94 1 Y 1 F GLU 89 ? CD ? F GLU 117 CD 95 1 Y 1 F GLU 89 ? OE1 ? F GLU 117 OE1 96 1 Y 1 F GLU 89 ? OE2 ? F GLU 117 OE2 97 1 Y 1 F GLN 107 ? CG ? F GLN 135 CG 98 1 Y 1 F GLN 107 ? CD ? F GLN 135 CD 99 1 Y 1 F GLN 107 ? OE1 ? F GLN 135 OE1 100 1 Y 1 F GLN 107 ? NE2 ? F GLN 135 NE2 101 1 Y 1 F LYS 203 ? CE ? F LYS 231 CE 102 1 Y 1 F LYS 203 ? NZ ? 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