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NH1 G ARG 303 ? ? 123.56 120.30 3.26 0.50 N # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 SER A 26 ? ? -58.87 -9.28 2 1 LEU A 28 ? ? -65.50 11.36 3 1 GLN A 30 ? ? -78.19 -84.68 4 1 GLU A 50 ? ? -65.36 -70.75 5 1 LYS A 57 ? ? -29.79 -45.46 6 1 GLU A 59 ? ? -59.33 -72.51 7 1 VAL A 82 ? ? 47.95 76.21 8 1 MET A 84 ? ? 54.79 -127.22 9 1 THR A 88 ? ? 44.63 -141.35 10 1 ALA A 89 ? ? -135.13 -40.64 11 1 ARG A 130 ? ? 79.37 -15.59 12 1 GLN A 145 ? ? -103.97 41.32 13 1 ALA A 224 ? ? -19.47 -74.81 14 1 TYR A 228 ? ? -49.83 -14.11 15 1 SER A 233 ? ? 55.78 -131.75 16 1 ARG A 235 ? ? -149.43 -14.65 17 1 TYR A 315 ? ? -105.37 -91.08 18 1 GLU A 322 ? ? -37.93 121.33 19 1 ALA A 337 ? ? -56.70 92.08 20 1 SER B 26 ? ? -59.26 -8.48 21 1 LEU B 28 ? ? -65.53 11.72 22 1 GLN B 30 ? ? -77.68 -85.44 23 1 GLU B 50 ? ? -63.35 -75.20 24 1 GLU B 59 ? ? -58.79 -72.76 25 1 VAL B 82 ? ? 48.15 76.71 26 1 MET B 84 ? ? 53.92 -129.25 27 1 THR B 88 ? ? 42.99 -145.90 28 1 ALA B 89 ? ? -136.19 -32.57 29 1 ARG B 130 ? ? 79.35 -14.92 30 1 GLN B 145 ? ? -103.87 41.93 31 1 ALA B 224 ? ? -19.73 -75.02 32 1 TYR B 228 ? ? -49.85 -13.74 33 1 SER B 233 ? ? 56.15 -130.78 34 1 ARG B 235 ? ? -147.81 -14.43 35 1 TYR B 315 ? ? -108.04 -90.13 36 1 ALA B 337 ? ? -56.40 92.36 37 1 SER C 26 ? ? -59.01 -8.95 38 1 LEU C 28 ? ? -65.37 11.66 39 1 GLN C 30 ? ? -77.65 -85.05 40 1 CYS C 31 ? ? -140.09 13.28 41 1 GLU C 50 ? ? -63.12 -75.11 42 1 GLU C 59 ? ? -59.19 -72.52 43 1 VAL C 82 ? ? 48.16 77.02 44 1 MET C 84 ? ? 53.94 -129.06 45 1 THR C 88 ? ? 42.10 -146.73 46 1 ALA C 89 ? ? -136.47 -33.38 47 1 ARG C 130 ? ? 78.94 -14.59 48 1 GLN C 145 ? ? -104.02 41.73 49 1 ALA C 224 ? ? -19.44 -75.01 50 1 SER C 233 ? ? 56.12 -130.90 51 1 ARG C 235 ? ? -148.82 -14.74 52 1 TYR C 315 ? ? -107.81 -90.06 53 1 ALA C 337 ? ? -56.59 92.38 54 1 SER D 26 ? ? -59.45 -8.53 55 1 LEU D 28 ? ? -65.24 10.97 56 1 GLN D 30 ? ? -78.21 -84.83 57 1 GLU D 50 ? ? -62.84 -75.25 58 1 GLU D 59 ? ? -59.08 -72.48 59 1 LEU D 81 ? ? -146.56 10.76 60 1 VAL D 82 ? ? 47.84 76.42 61 1 MET D 84 ? ? 53.80 -129.12 62 1 THR D 88 ? ? 42.81 -146.79 63 1 ALA D 89 ? ? -135.09 -33.93 64 1 ARG D 130 ? ? 79.18 -15.20 65 1 GLN D 145 ? ? -103.88 41.19 66 1 ALA D 224 ? ? -19.05 -75.35 67 1 TYR D 228 ? ? -49.79 -13.65 68 1 SER D 233 ? ? 56.15 -130.67 69 1 ARG D 235 ? ? -149.02 -13.46 70 1 TYR D 315 ? ? -108.65 -90.36 71 1 ALA D 337 ? ? -56.85 92.48 72 1 SER E 26 ? ? -59.54 -8.24 73 1 LEU E 28 ? ? -65.60 11.86 74 1 GLN E 30 ? ? -78.12 -85.44 75 1 GLU E 50 ? ? -62.69 -75.54 76 1 GLU E 59 ? ? -58.80 -72.65 77 1 VAL E 82 ? ? 48.19 76.85 78 1 MET E 84 ? ? 54.45 -129.02 79 1 THR E 88 ? ? 43.53 -146.10 80 1 ALA E 89 ? ? -135.73 -32.99 81 1 ARG E 130 ? ? 78.95 -15.28 82 1 GLN E 145 ? ? -103.92 41.42 83 1 ALA E 224 ? ? -19.41 -75.14 84 1 TYR E 228 ? ? -48.97 -14.78 85 1 SER E 233 ? ? 56.36 -131.14 86 1 ARG E 235 ? ? -149.38 -13.03 87 1 TYR E 315 ? ? -107.74 -89.80 88 1 ALA E 337 ? ? -56.58 92.51 89 1 SER F 26 ? ? -59.15 -9.00 90 1 LEU F 28 ? ? -65.54 11.70 91 1 GLN F 30 ? ? -77.38 -85.42 92 1 CYS F 31 ? ? -140.26 13.91 93 1 GLU F 50 ? ? -63.34 -75.20 94 1 GLU F 59 ? ? -59.02 -72.67 95 1 VAL F 82 ? ? 48.28 76.57 96 1 MET F 84 ? ? 54.12 -129.54 97 1 THR F 88 ? ? 42.51 -146.41 98 1 ALA F 89 ? ? -136.01 -33.55 99 1 ARG F 130 ? ? 79.44 -15.88 100 1 GLN F 145 ? ? -104.14 41.84 101 1 ALA F 224 ? ? -19.59 -75.36 102 1 TYR F 228 ? ? -49.88 -13.97 103 1 SER F 233 ? ? 56.04 -130.73 104 1 ARG F 235 ? ? -148.00 -14.13 105 1 TYR F 315 ? ? -108.40 -90.38 106 1 ALA F 337 ? ? -55.35 92.11 107 1 SER G 26 ? ? -59.82 -8.15 108 1 LEU G 28 ? ? -65.11 10.92 109 1 GLN G 30 ? ? -78.23 -84.77 110 1 GLU G 50 ? ? -63.08 -75.19 111 1 GLU G 59 ? ? -59.26 -72.38 112 1 VAL G 82 ? ? 47.65 76.54 113 1 MET G 84 ? ? 53.99 -129.23 114 1 THR G 88 ? ? 43.09 -146.99 115 1 ALA G 89 ? ? -135.14 -33.86 116 1 ARG G 130 ? ? 79.17 -14.77 117 1 GLN G 145 ? ? -104.19 40.55 118 1 ALA G 224 ? ? -19.29 -75.74 119 1 SER G 233 ? ? 57.14 -132.18 120 1 ARG G 235 ? ? -147.82 -12.61 121 1 TYR G 315 ? ? -108.12 -89.26 122 1 ALA G 337 ? ? -55.82 92.46 # _em_3d_fitting.entry_id 5NP7 _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details 'Backbone fitting is good but many of the sidechains cannot be relied on as the map resolution was insufficient.' _em_3d_fitting.overall_b_value 94.574 _em_3d_fitting.ref_protocol 'FLEXIBLE FIT' _em_3d_fitting.ref_space RECIPROCAL _em_3d_fitting.target_criteria 'Maximum likelihood' _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 5NP7 _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.details ;Helical segments were divided in half, not drawn randomly or odd/even as this would result in some segments from the same filament in both half models. Thus, it is strictly not gold-standard. ; _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 60000 _em_3d_reconstruction.resolution 4.2 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type HELICAL _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.0 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.name 'Helical filament of HRAD51 on single-stranded DNA with AMPPNP' _em_entity_assembly.source RECOMBINANT _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.entity_id_list 1 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 5NP7 _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.dimension_height 4096 _em_image_scans.dimension_width 4096 _em_image_scans.frames_per_image 34 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.sampling_size 14 _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.used_frames_per_image ? _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 5NP7 _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure 'COMA FREE' _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification 104477 _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_max ? _em_imaging.nominal_defocus_min 2000 _em_imaging.nominal_magnification 59000 _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details ? _em_sample_support.grid_material COPPER _em_sample_support.grid_mesh_size 400 _em_sample_support.grid_type Quantifoil _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature ? _em_vitrification.cryogen_name NITROGEN _em_vitrification.details ? _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.instrument ? _em_vitrification.entry_id 5NP7 _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 5NP7 _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state 'HELICAL ARRAY' _em_experiment.reconstruction_method HELICAL _em_experiment.entity_assembly_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET 1 ? A MET 1 2 1 Y 1 A ALA 2 ? A ALA 2 3 1 Y 1 A MET 3 ? A MET 3 4 1 Y 1 A GLN 4 ? A GLN 4 5 1 Y 1 A MET 5 ? A MET 5 6 1 Y 1 A GLN 6 ? A GLN 6 7 1 Y 1 A LEU 7 ? A LEU 7 8 1 Y 1 A GLU 8 ? A GLU 8 9 1 Y 1 A ALA 9 ? A ALA 9 10 1 Y 1 A ASN 10 ? A ASN 10 11 1 Y 1 A ALA 11 ? A ALA 11 12 1 Y 1 A ASP 12 ? A ASP 12 13 1 Y 1 A THR 13 ? A THR 13 14 1 Y 1 A SER 14 ? A SER 14 15 1 Y 1 A VAL 15 ? A VAL 15 16 1 Y 1 A GLU 16 ? A GLU 16 17 1 Y 1 A GLU 17 ? A GLU 17 18 1 Y 1 A GLU 18 ? A GLU 18 19 1 Y 1 A SER 19 ? A SER 19 20 1 Y 1 A GLY 275 ? A GLY 275 21 1 Y 1 A ALA 276 ? A ALA 276 22 1 Y 1 A ALA 277 ? A ALA 277 23 1 Y 1 A MET 278 ? A MET 278 24 1 Y 1 A PHE 279 ? A PHE 279 25 1 Y 1 A ALA 280 ? A ALA 280 26 1 Y 1 A ALA 281 ? A ALA 281 27 1 Y 1 A ASP 282 ? A ASP 282 28 1 Y 1 A PRO 283 ? A PRO 283 29 1 Y 1 B MET 1 ? B MET 1 30 1 Y 1 B ALA 2 ? B ALA 2 31 1 Y 1 B MET 3 ? B MET 3 32 1 Y 1 B GLN 4 ? B GLN 4 33 1 Y 1 B MET 5 ? B MET 5 34 1 Y 1 B GLN 6 ? B GLN 6 35 1 Y 1 B LEU 7 ? B LEU 7 36 1 Y 1 B GLU 8 ? 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