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GLY B 3594 TYR B 3604 1 ? 11 HELX_P HELX_P187 AU7 PHE B 3619 ? GLY B 3630 ? PHE B 3619 GLY B 3630 1 ? 12 HELX_P HELX_P188 AU8 ASP B 3637 ? TYR B 3641 ? ASP B 3637 TYR B 3641 5 ? 5 HELX_P HELX_P189 AU9 ASP B 3642 ? VAL B 3644 ? ASP B 3642 VAL B 3644 5 ? 3 HELX_P HELX_P190 AV1 LEU B 3645 ? ARG B 3651 ? LEU B 3645 ARG B 3651 1 ? 7 HELX_P HELX_P191 AV2 PRO B 3689 ? VAL B 3696 ? PRO B 3689 VAL B 3696 1 ? 8 HELX_P HELX_P192 AV3 THR B 3704 ? ARG B 3721 ? THR B 3704 ARG B 3721 1 ? 18 HELX_P HELX_P193 AV4 ARG B 3721 ? VAL B 3756 ? ARG B 3721 VAL B 3756 1 ? 36 HELX_P HELX_P194 AV5 ASP B 3763 ? PRO B 3803 ? ASP B 3763 PRO B 3803 1 ? 41 HELX_P HELX_P195 AV6 SER B 3805 ? HIS B 3822 ? SER B 3805 HIS B 3822 1 ? 18 HELX_P HELX_P196 AV7 SER B 3828 ? LEU B 3840 ? SER B 3828 LEU B 3840 1 ? 13 HELX_P HELX_P197 AV8 ASP B 3851 ? GLY B 3874 ? ASP B 3851 GLY B 3874 1 ? 24 HELX_P HELX_P198 AV9 LEU B 3876 ? THR B 3895 ? LEU B 3876 THR B 3895 1 ? 20 HELX_P HELX_P199 AW1 TYR B 3901 ? ARG B 3910 ? TYR B 3901 ARG B 3910 1 ? 10 HELX_P HELX_P200 AW2 GLY B 3911 ? ILE B 3914 ? GLY B 3911 ILE B 3914 5 ? 4 HELX_P HELX_P201 AW3 THR B 3928 ? SER B 3939 ? THR B 3928 SER B 3939 1 ? 12 HELX_P HELX_P202 AW4 LEU B 3947 ? ASP B 3954 ? LEU B 3947 ASP B 3954 1 ? 8 HELX_P HELX_P203 AW5 THR B 3981 ? ARG B 3997 ? THR B 3981 ARG B 3997 1 ? 17 HELX_P HELX_P204 AW6 ARG B 4000 ? LEU B 4013 ? ARG B 4000 LEU B 4013 1 ? 14 HELX_P HELX_P205 AW7 ASP B 4026 ? GLU B 4034 ? ASP B 4026 GLU B 4034 1 ? 9 HELX_P HELX_P206 AW8 ALA B 4051 ? ASN B 4063 ? ALA B 4051 ASN B 4063 1 ? 13 HELX_P HELX_P207 AW9 SER B 4073 ? SER B 4090 ? SER B 4073 SER B 4090 1 ? 18 HELX_P HELX_P208 AX1 ASN B 4098 ? LEU B 4101 ? ASN B 4098 LEU B 4101 5 ? 4 HELX_P HELX_P209 AX2 ALA B 4102 ? LEU B 4116 ? ALA B 4102 LEU B 4116 1 ? 15 HELX_P HELX_P210 AX3 PRO B 4135 ? GLY B 4142 ? PRO B 4135 GLY B 4142 1 ? 8 HELX_P HELX_P211 AX4 GLY B 4152 ? ILE B 4164 ? GLY B 4152 ILE B 4164 1 ? 13 HELX_P HELX_P212 AX5 PRO B 4165 ? CYS B 4170 ? PRO B 4165 CYS B 4170 1 ? 6 HELX_P HELX_P213 AX6 ASN B 4174 ? TYR B 4196 ? ASN B 4174 TYR B 4196 1 ? 23 HELX_P HELX_P214 AX7 GLY B 4208 ? ALA B 4227 ? GLY B 4208 ALA B 4227 1 ? 20 HELX_P HELX_P215 AX8 PRO B 4239 ? SER B 4250 ? PRO B 4239 SER B 4250 1 ? 12 HELX_P HELX_P216 AX9 ILE B 4251 ? VAL B 4256 ? ILE B 4251 VAL B 4256 1 ? 6 HELX_P HELX_P217 AY1 ASN B 4258 ? PHE B 4273 ? ASN B 4258 PHE B 4273 1 ? 16 HELX_P HELX_P218 AY2 THR B 4274 ? ASP B 4279 ? THR B 4274 ASP B 4279 1 ? 6 HELX_P HELX_P219 AY3 ARG B 4301 ? LEU B 4312 ? ARG B 4301 LEU B 4312 1 ? 12 HELX_P HELX_P220 AY4 THR B 4317 ? GLY B 4322 ? THR B 4317 GLY B 4322 5 ? 6 HELX_P HELX_P221 AY5 PRO B 4324 ? GLU B 4350 ? PRO B 4324 GLU B 4350 1 ? 27 HELX_P HELX_P222 AY6 LEU B 4380 ? ILE B 4391 ? LEU B 4380 ILE B 4391 1 ? 12 HELX_P HELX_P223 AY7 PRO B 4392 ? LEU B 4395 ? PRO B 4392 LEU B 4395 5 ? 4 HELX_P HELX_P224 AY8 ASP B 4407 ? GLU B 4439 ? ASP B 4407 GLU B 4439 1 ? 33 HELX_P HELX_P225 AY9 THR B 4445 ? GLY B 4458 ? THR B 4445 GLY B 4458 1 ? 14 HELX_P HELX_P226 AZ1 THR B 4474 ? SER B 4498 ? THR B 4474 SER B 4498 1 ? 25 HELX_P HELX_P227 AZ2 PRO B 4517 ? SER B 4533 ? PRO B 4517 SER B 4533 1 ? 17 HELX_P HELX_P228 AZ3 ASP B 4631 ? GLY B 4639 ? ASP B 4631 GLY B 4639 1 ? 9 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc1 metalc ? ? 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MG ? ? B ATP 4802 B MG 4803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.818 ? metalc11 metalc ? ? I ATP . O2B ? ? ? 1_555 J MG . MG ? ? B ATP 4802 B MG 4803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.729 ? metalc12 metalc ? ? I ATP . O3B ? ? ? 1_555 J MG . MG ? ? B ATP 4802 B MG 4803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.726 ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 1510 A . ? SER 1510 A PRO 1511 A ? PRO 1511 A 1 -0.58 2 GLN 3135 A . ? GLN 3135 A PRO 3136 A ? PRO 3136 A 1 0.75 3 SER 4172 A . ? SER 4172 A PRO 4173 A ? PRO 4173 A 1 4.37 4 ALA 4197 A . ? ALA 4197 A PRO 4198 A ? PRO 4198 A 1 -7.76 5 SER 1510 B . ? SER 1510 B PRO 1511 B ? PRO 1511 B 1 -0.52 6 GLN 3135 B . ? GLN 3135 B PRO 3136 B ? PRO 3136 B 1 0.77 7 SER 4172 B . ? SER 4172 B PRO 4173 B ? PRO 4173 B 1 4.30 8 ALA 4197 B . ? ALA 4197 B PRO 4198 B ? PRO 4198 B 1 -7.80 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 5 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 5 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 5 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 3 ? AC1 ? 5 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 5 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 3 ? AC6 ? 3 ? AC7 ? 2 ? AC8 ? 3 ? AC9 ? 2 ? AD1 ? 5 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 2 ? AD4 ? 2 ? AD5 ? 5 ? AD6 ? 3 ? AD7 ? 2 ? AD8 ? 2 ? AD9 ? 5 ? AE1 ? 2 ? AE2 ? 3 ? AE3 ? 3 ? AE4 ? 5 ? AE5 ? 4 ? AE6 ? 5 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? parallel AA7 3 4 ? parallel AA7 4 5 ? parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? parallel AB2 2 3 ? parallel AB2 3 4 ? parallel AB2 4 5 ? parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? parallel AB6 2 3 ? parallel AB6 3 4 ? parallel AB6 4 5 ? parallel AB7 1 2 ? parallel AB8 1 2 ? parallel AB8 2 3 ? parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? parallel AC1 2 3 ? parallel AC1 3 4 ? parallel AC1 4 5 ? parallel AC2 1 2 ? parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? parallel AC3 4 5 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC7 1 2 ? parallel AC8 1 2 ? parallel AC8 2 3 ? parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? parallel AD1 2 3 ? parallel AD1 3 4 ? parallel AD1 4 5 ? parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD5 1 2 ? parallel AD5 2 3 ? parallel AD5 3 4 ? parallel AD5 4 5 ? parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD9 1 2 ? parallel AD9 2 3 ? parallel AD9 3 4 ? parallel AD9 4 5 ? parallel AE1 1 2 ? parallel AE2 1 2 ? parallel AE2 2 3 ? parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE4 1 2 ? parallel AE4 2 3 ? parallel AE4 3 4 ? parallel AE4 4 5 ? parallel AE5 1 2 ? parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE5 3 4 ? anti-parallel AE6 1 2 ? parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE6 3 4 ? parallel AE6 4 5 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ASP A 1476 ? 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B VAL 4402 3432 1 Y 1 B GLY 4499 ? B GLY 4499 3433 1 Y 1 B GLY 4500 ? B GLY 4500 3434 1 Y 1 B ALA 4501 ? B ALA 4501 3435 1 Y 1 B THR 4546 ? B THR 4546 3436 1 Y 1 B THR 4547 ? B THR 4547 3437 1 Y 1 B SER 4548 ? B SER 4548 3438 1 Y 1 B GLN 4549 ? B GLN 4549 3439 1 Y 1 B GLY 4550 ? B GLY 4550 3440 1 Y 1 B ALA 4551 ? B ALA 4551 3441 1 Y 1 B THR 4552 ? B THR 4552 3442 1 Y 1 B LEU 4553 ? B LEU 4553 3443 1 Y 1 B ASP 4554 ? B ASP 4554 3444 1 Y 1 B ALA 4555 ? B ALA 4555 3445 1 Y 1 B CYS 4556 ? B CYS 4556 3446 1 Y 1 B THR 4596 ? B THR 4596 3447 1 Y 1 B ASN 4597 ? B ASN 4597 3448 1 Y 1 B THR 4598 ? B THR 4598 3449 1 Y 1 B GLU 4599 ? B GLU 4599 3450 1 Y 1 B LYS 4600 ? B LYS 4600 3451 1 Y 1 B LYS 4601 ? B LYS 4601 3452 1 Y 1 B ALA 4602 ? B ALA 4602 # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # _em_entity_assembly_naturalsource.id 2 _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 9606 _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Homo sapiens' _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_entity_assembly_recombinant.id 2 _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_recombinant.cell ? _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 7108 _em_entity_assembly_recombinant.organism 'Spodoptera frugiperda' _em_entity_assembly_recombinant.plasmid ? _em_entity_assembly_recombinant.strain ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details 'Negative stain dataset was processed as' # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 1.6 _em_image_recording.average_exposure_time 2 _em_image_recording.details 'Images were also collected using K2 summit detetor in counting mode' _em_image_recording.detector_mode INTEGRATING _em_image_recording.film_or_detector_model 'FEI FALCON II (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 6746 _em_image_recording.num_real_images 312198 # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details 'Negative stain dataset was processed to generate templates.' _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 1 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? Gautomatch 0.53 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' 'Manually & automatically collection' EPU ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' 'local CTF and equiphase averaging(EPA) was performed; phase flip was applied for picking but not for particle extraction' Gctf 1.06 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? Coot 0.83 ? 1 ? 8 OTHER ? ? ? ? ? ? 9 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 1.4 1 ? ? 10 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 1.4 1 ? ? 11 CLASSIFICATION ? RELION 1.4 1 ? ? 12 RECONSTRUCTION ? RELION 1.4 1 ? ? 13 'MODEL REFINEMENT' ? REFMAC 5.8.0166 ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 0.15 _em_specimen.details 'vitrification was performed immediately after gel filtration.' _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'Wellcome Trust' 'United Kingdom' WT100387 1 'Medical Research Council (United Kingdom)' 'United Kingdom' MC_UP_A025_1011 2 # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 2 "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ADP 3 "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" ATP 4 'MAGNESIUM ION' MG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #