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Biol.' _citation.journal_id_ASTM JMOBAK _citation.journal_id_CSD 0070 _citation.journal_id_ISSN 1089-8638 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 430 _citation.language ? _citation.page_first 45 _citation.page_last 57 _citation.title 'Site-Specific Disulfide Crosslinked Nucleosomes with Enhanced Stability.' _citation.year 2018 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.jmb.2017.10.029 _citation.pdbx_database_id_PubMed 29113904 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Frouws, T.D.' 1 ? primary 'Barth, P.D.' 2 ? primary 'Richmond, T.J.' 3 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'DNA (147-MER)' 45368.051 1 ? ? ? ? 2 polymer man 'DNA (147-MER)' 45359.035 1 ? ? ? ? 3 polymer man 'Histone H3.2' 15271.863 2 ? 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;ATCAATATCCACCTGCAGATACTACCAAAAGTGTATTTGGAAACTGCTCCATCAAAAGGCATGTTCAGCTGGATTCCAGC TGAACATGCCTTTTGATGGAGCAGTTTCCAAATACACTTTTGGTAGTATCTGCAGGTGGATATTGAT ; J ? 3 'polypeptide(L)' no no ;ARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKT DLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLAAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; ;ARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKT DLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLAAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; A,E ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; B,F ? 5 'polypeptide(L)' no no ;SGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGCYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIP RHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK ; ;SGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGCYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIP RHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK ; C,G ? 6 'polypeptide(L)' no no ;AKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHY NKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; ;AKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHY NKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; D,H ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 7 'MANGANESE (II) ION' MN 8 'CHLORIDE ION' CL 9 water HOH # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 DA n 1 2 DT n 1 3 DC n 1 4 DA n 1 5 DA n 1 6 DT n 1 7 DA n 1 8 DT n 1 9 DC n 1 10 DC n 1 11 DA n 1 12 DC n 1 13 DC n 1 14 DT n 1 15 DG n 1 16 DC n 1 17 DA n 1 18 DG n 1 19 DA n 1 20 DT n 1 21 DA n 1 22 DC n 1 23 DT n 1 24 DA n 1 25 DC n 1 26 DC n 1 27 DA n 1 28 DA n 1 29 DA n 1 30 DA n 1 31 DG n 1 32 DT n 1 33 DG n 1 34 DT n 1 35 DA n 1 36 DT n 1 37 DT n 1 38 DT n 1 39 DG n 1 40 DG n 1 41 DA n 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_diffrn.ambient_temp_esd ? _diffrn.crystal_id 1 _diffrn.crystal_support ? _diffrn.crystal_treatment ? _diffrn.details ? _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_pressure ? _diffrn.ambient_pressure_esd ? _diffrn.ambient_pressure_gt ? _diffrn.ambient_pressure_lt ? _diffrn.ambient_temp_gt ? _diffrn.ambient_temp_lt ? # _diffrn_detector.details ? _diffrn_detector.detector PIXEL _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.type 'DECTRIS PILATUS 6M-F' _diffrn_detector.area_resol_mean ? _diffrn_detector.dtime ? _diffrn_detector.pdbx_frames_total ? _diffrn_detector.pdbx_collection_time_total ? _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2013-02-22 # _diffrn_radiation.collimation ? _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.filter_edge ? _diffrn_radiation.inhomogeneity ? _diffrn_radiation.monochromator ? _diffrn_radiation.polarisn_norm ? _diffrn_radiation.polarisn_ratio ? _diffrn_radiation.probe ? _diffrn_radiation.type ? _diffrn_radiation.xray_symbol ? _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.pdbx_wavelength_list ? _diffrn_radiation.pdbx_wavelength ? _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_analyzer ? _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 1.0 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.current ? _diffrn_source.details ? _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.power ? _diffrn_source.size ? _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.target ? _diffrn_source.type 'SLS BEAMLINE X06SA' _diffrn_source.voltage ? _diffrn_source.take-off_angle ? _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 1.0 _diffrn_source.pdbx_wavelength ? _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline X06SA _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site SLS # _reflns.B_iso_Wilson_estimate 49.2 _reflns.entry_id 5OMX _reflns.data_reduction_details ? _reflns.data_reduction_method ? _reflns.d_resolution_high 2.32 _reflns.d_resolution_low 47.14 _reflns.details ? _reflns.limit_h_max ? _reflns.limit_h_min ? _reflns.limit_k_max ? 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_reflns.pdbx_Rpim_I_all ? _reflns.pdbx_d_opt ? _reflns.pdbx_number_measured_all ? _reflns.pdbx_diffrn_id 1 _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.pdbx_CC_half ? _reflns.pdbx_R_split ? # _reflns_shell.d_res_high 2.32 _reflns_shell.d_res_low 2.45 _reflns_shell.meanI_over_sigI_all ? _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs 1.4 _reflns_shell.number_measured_all ? _reflns_shell.number_measured_obs ? _reflns_shell.number_possible ? _reflns_shell.number_unique_all ? _reflns_shell.number_unique_obs 3876 _reflns_shell.percent_possible_all 28.7 _reflns_shell.percent_possible_obs ? _reflns_shell.Rmerge_F_all ? _reflns_shell.Rmerge_F_obs ? _reflns_shell.Rmerge_I_all ? _reflns_shell.Rmerge_I_obs 0.212 _reflns_shell.meanI_over_sigI_gt ? _reflns_shell.meanI_over_uI_all ? _reflns_shell.meanI_over_uI_gt ? _reflns_shell.number_measured_gt ? _reflns_shell.number_unique_gt ? _reflns_shell.percent_possible_gt ? _reflns_shell.Rmerge_F_gt ? _reflns_shell.Rmerge_I_gt ? _reflns_shell.pdbx_redundancy 1.4 _reflns_shell.pdbx_Rsym_value ? 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Final energy minimization and water picking.' _refine.diff_density_max ? _refine.diff_density_max_esd ? _refine.diff_density_min ? _refine.diff_density_min_esd ? _refine.diff_density_rms ? _refine.diff_density_rms_esd ? _refine.entry_id 5OMX _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.ls_abs_structure_details ? _refine.ls_abs_structure_Flack ? _refine.ls_abs_structure_Flack_esd ? _refine.ls_abs_structure_Rogers ? _refine.ls_abs_structure_Rogers_esd ? _refine.ls_d_res_high 2.32 _refine.ls_d_res_low 47.14 _refine.ls_extinction_coef ? _refine.ls_extinction_coef_esd ? _refine.ls_extinction_expression ? _refine.ls_extinction_method ? _refine.ls_goodness_of_fit_all ? _refine.ls_goodness_of_fit_all_esd ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs_esd ? _refine.ls_hydrogen_treatment ? _refine.ls_matrix_type ? _refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs 80720 _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_work ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs 86.7 _refine.ls_percent_reflns_R_free 5 _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_free 0.259455 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.221903 _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? _refine.ls_restrained_S_obs ? _refine.ls_shift_over_esd_max ? _refine.ls_shift_over_esd_mean ? _refine.ls_structure_factor_coef ? _refine.ls_weighting_details ? _refine.ls_weighting_scheme ? _refine.ls_wR_factor_all ? _refine.ls_wR_factor_obs ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.ls_R_factor_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_ref ? _refine.ls_shift_over_su_max ? _refine.ls_shift_over_su_max_lt ? _refine.ls_shift_over_su_mean ? _refine.ls_shift_over_su_mean_lt ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_ls_sigma_Fsqd ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method 'FREE R-VALUE' _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_starting_model 1KX5 _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details random _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 6020 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 6021 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 37 _refine_hist.number_atoms_solvent 172 _refine_hist.number_atoms_total 12250 _refine_hist.d_res_high 2.32 _refine_hist.d_res_low 47.14 # _struct.entry_id 5OMX _struct.title 'X-ray Structure of the H2A-N38C Nucleosome Core Particle' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 5OMX _struct_keywords.text 'nucleosome core particle, histone, DNA, DNA binding protein' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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EB N N 9 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 5OMX 5OMX ? 1 ? 1 2 PDB 5OMX 5OMX ? 2 ? 1 3 UNP H32_XENLA P84233 ? 3 ;ARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKT DLRFQSSAVMALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; 2 4 UNP H4_XENLA P62799 ? 4 ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; 1 5 UNP Q6AZJ8_XENLA Q6AZJ8 ? 5 ;SGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIP RHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK ; 2 6 UNP H2B11_XENLA P02281 ? 6 ;AKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKSRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHY NKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; 5 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 5OMX I 1 ? 147 ? 5OMX -73 ? 73 ? -73 73 2 2 5OMX J 1 ? 147 ? 5OMX -73 ? 73 ? -73 73 3 3 5OMX A 1 ? 135 ? 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UNP P02281 SER 33 conflict 32 8 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details decameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 10 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 61380 ? 1 MORE -569 ? 1 'SSA (A^2)' 71850 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list ;A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB ; # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY C 44 ? SER C 57 ? GLY A 44 SER A 57 1 ? 14 HELX_P HELX_P2 AA2 ARG C 63 ? ASP C 77 ? ARG A 63 ASP A 77 1 ? 15 HELX_P HELX_P3 AA3 GLN C 85 ? ALA C 114 ? GLN A 85 ALA A 114 1 ? 30 HELX_P HELX_P4 AA4 MET C 120 ? GLY C 132 ? MET A 120 GLY A 132 1 ? 13 HELX_P HELX_P5 AA5 ASN D 26 ? ILE D 30 ? ASN B 25 ILE B 29 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 AA6 THR D 31 ? GLY D 42 ? THR B 30 GLY B 41 1 ? 12 HELX_P HELX_P7 AA7 LEU D 50 ? ALA D 77 ? LEU B 49 ALA B 76 1 ? 28 HELX_P HELX_P8 AA8 THR D 83 ? GLN D 94 ? THR B 82 GLN B 93 1 ? 12 HELX_P HELX_P9 AA9 THR E 16 ? GLY E 22 ? THR C 16 GLY C 22 1 ? 7 HELX_P HELX_P10 AB1 PRO E 26 ? GLY E 37 ? PRO C 26 GLY C 37 1 ? 12 HELX_P HELX_P11 AB2 ALA E 45 ? ASN E 73 ? ALA C 45 ASN C 73 1 ? 29 HELX_P HELX_P12 AB3 ILE E 79 ? ASN E 89 ? ILE C 79 ASN C 89 1 ? 11 HELX_P HELX_P13 AB4 ASP E 90 ? LEU E 97 ? ASP C 90 LEU C 97 1 ? 8 HELX_P HELX_P14 AB5 GLN E 112 ? LEU E 116 ? GLN C 112 LEU C 116 5 ? 5 HELX_P HELX_P15 AB6 TYR F 34 ? HIS F 46 ? TYR D 37 HIS D 49 1 ? 13 HELX_P HELX_P16 AB7 SER F 52 ? ASN F 81 ? SER D 55 ASN D 84 1 ? 30 HELX_P HELX_P17 AB8 THR F 87 ? LEU F 99 ? THR D 90 LEU D 102 1 ? 13 HELX_P HELX_P18 AB9 PRO F 100 ? SER F 120 ? PRO D 103 SER D 123 1 ? 21 HELX_P HELX_P19 AC1 GLY G 44 ? SER G 57 ? GLY E 44 SER E 57 1 ? 14 HELX_P HELX_P20 AC2 ARG G 63 ? LYS G 79 ? ARG E 63 LYS E 79 1 ? 17 HELX_P HELX_P21 AC3 GLN G 85 ? ALA G 114 ? GLN E 85 ALA E 114 1 ? 30 HELX_P HELX_P22 AC4 MET G 120 ? ARG G 131 ? MET E 120 ARG E 131 1 ? 12 HELX_P HELX_P23 AC5 ASP H 25 ? ILE H 30 ? ASP F 24 ILE F 29 5 ? 6 HELX_P HELX_P24 AC6 THR H 31 ? GLY H 42 ? THR F 30 GLY F 41 1 ? 12 HELX_P HELX_P25 AC7 LEU H 50 ? ALA H 77 ? LEU F 49 ALA F 76 1 ? 28 HELX_P HELX_P26 AC8 THR H 83 ? GLN H 94 ? THR F 82 GLN F 93 1 ? 12 HELX_P HELX_P27 AC9 ARG I 17 ? GLY I 22 ? ARG G 17 GLY G 22 1 ? 6 HELX_P HELX_P28 AD1 PRO I 26 ? GLY I 37 ? PRO G 26 GLY G 37 1 ? 12 HELX_P HELX_P29 AD2 ALA I 45 ? ASP I 72 ? ALA G 45 ASP G 72 1 ? 28 HELX_P HELX_P30 AD3 ILE I 79 ? ASN I 89 ? ILE G 79 ASN G 89 1 ? 11 HELX_P HELX_P31 AD4 ASP I 90 ? LEU I 97 ? ASP G 90 LEU G 97 1 ? 8 HELX_P HELX_P32 AD5 GLN I 112 ? LEU I 116 ? GLN G 112 LEU G 116 5 ? 5 HELX_P HELX_P33 AD6 TYR J 34 ? HIS J 46 ? TYR H 37 HIS H 49 1 ? 13 HELX_P HELX_P34 AD7 SER J 52 ? ASN J 81 ? SER H 55 ASN H 84 1 ? 30 HELX_P HELX_P35 AD8 THR J 87 ? LEU J 99 ? THR H 90 LEU H 102 1 ? 13 HELX_P HELX_P36 AD9 PRO J 100 ? SER J 120 ? PRO H 103 SER H 123 1 ? 21 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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I MN 115 I HOH 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? ? metalc10 metalc ? ? AA MN . MN ? ? ? 1_555 VA HOH . O ? ? I MN 117 I HOH 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? ? metalc11 metalc ? ? BA MN . MN ? ? ? 1_555 VA HOH . O ? ? I MN 118 I HOH 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.479 ? ? metalc12 metalc ? ? VA HOH . O ? ? ? 2_665 LA MN . MN ? ? I HOH 201 J MN 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.153 ? ? metalc13 metalc ? ? B DA 4 N7 ? ? ? 1_555 DA MN . MN ? ? J DA -70 J MN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.613 ? ? metalc14 metalc ? ? B DG 40 O6 ? ? ? 1_555 OA MN . MN ? ? J DG -34 J MN 112 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.467 ? ? metalc15 metalc ? ? B DG 71 N7 ? ? ? 1_555 MA MN . MN ? ? J DG -3 J MN 110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.470 ? ? metalc16 metalc ? ? B DG 79 O6 ? ? ? 1_555 PA MN . MN ? ? J DG 5 J MN 113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.728 ? ? metalc17 metalc ? ? B DC 85 OP1 ? ? ? 1_555 FA MN . MN ? ? J DC 11 J MN 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.624 ? ? metalc18 metalc ? ? B DG 101 N7 ? ? ? 1_555 LA MN . MN ? ? J DG 27 J MN 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.536 ? ? metalc19 metalc ? ? B DG 122 N7 ? ? ? 1_555 NA MN . MN ? ? J DG 48 J MN 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.471 ? ? metalc20 metalc ? ? B DG 135 N7 ? ? ? 1_555 KA MN . MN ? ? J DG 61 J MN 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.600 ? ? metalc21 metalc ? ? B DG 138 N7 ? ? ? 1_555 JA MN . MN ? ? J DG 64 J MN 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.585 ? ? metalc22 metalc ? ? KA MN . MN ? ? ? 1_555 WA HOH . O ? ? J MN 108 J HOH 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.222 ? ? metalc23 metalc ? ? NA MN . MN ? ? ? 1_555 WA HOH . O ? ? J MN 111 J HOH 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? ? metalc24 metalc ? ? NA MN . MN ? ? ? 1_555 WA HOH . O ? ? J MN 111 J HOH 211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.092 ? ? metalc25 metalc ? ? F VAL 45 O ? ? ? 1_555 SA MN . MN ? ? D VAL 48 E MN 201 2_565 ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? ? metalc26 metalc ? ? AB HOH . O ? ? ? 2_564 SA MN . MN ? ? D HOH 202 E MN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.150 ? ? metalc27 metalc ? ? AB HOH . O ? ? ? 2_564 SA MN . MN ? ? D HOH 211 E MN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.164 ? ? metalc28 metalc ? ? G ASP 77 OD1 ? ? ? 1_555 SA MN . MN ? ? E ASP 77 E MN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.147 ? ? metalc29 metalc ? ? SA MN . MN ? ? ? 1_555 BB HOH . O ? ? E MN 201 E HOH 307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.433 ? ? metalc30 metalc ? ? SA MN . MN ? ? ? 1_555 CB HOH . O ? ? E MN 201 F HOH 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? hydrog1 hydrog ? ? A DA 1 N1 ? ? ? 1_555 B DT 147 N3 ? ? I DA -73 J DT 73 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A DA 1 N6 ? ? ? 1_555 B DT 147 O4 ? ? I DA -73 J DT 73 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A DT 2 N3 ? ? ? 1_555 B DA 146 N1 ? ? I DT -72 J DA 72 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A DT 2 O4 ? ? ? 1_555 B DA 146 N6 ? ? I DT -72 J DA 72 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A DC 3 N3 ? ? ? 1_555 B DG 145 N1 ? ? I DC -71 J DG 71 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A DC 3 N4 ? ? ? 1_555 B DG 145 O6 ? ? I DC -71 J DG 71 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A DC 3 O2 ? ? ? 1_555 B DG 145 N2 ? ? I DC -71 J DG 71 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A DA 4 N1 ? ? ? 1_555 B DT 144 N3 ? ? I DA -70 J DT 70 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A DA 4 N6 ? ? ? 1_555 B DT 144 O4 ? ? I DA -70 J DT 70 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A DA 5 N1 ? ? ? 1_555 B DT 143 N3 ? ? I DA -69 J DT 69 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A DA 5 N6 ? ? ? 1_555 B DT 143 O4 ? ? I DA -69 J DT 69 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A DT 6 N3 ? ? ? 1_555 B DA 142 N1 ? ? I DT -68 J DA 68 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A DT 6 O4 ? ? ? 1_555 B DA 142 N6 ? ? I DT -68 J DA 68 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A DA 7 N1 ? ? ? 1_555 B DT 141 N3 ? ? I DA -67 J DT 67 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A DA 7 N6 ? ? ? 1_555 B DT 141 O4 ? ? I DA -67 J DT 67 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? A DT 8 N3 ? ? ? 1_555 B DA 140 N1 ? ? I DT -66 J DA 66 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? A DT 8 O4 ? ? ? 1_555 B DA 140 N6 ? ? I DT -66 J DA 66 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? A DC 9 N3 ? ? ? 1_555 B DG 139 N1 ? ? I DC -65 J DG 65 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? A DC 9 N4 ? ? ? 1_555 B DG 139 O6 ? ? I DC -65 J DG 65 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? A DC 9 O2 ? ? ? 1_555 B DG 139 N2 ? ? I DC -65 J DG 65 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? A DC 10 N3 ? ? ? 1_555 B DG 138 N1 ? ? I DC -64 J DG 64 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? A DC 10 N4 ? ? ? 1_555 B DG 138 O6 ? ? I DC -64 J DG 64 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? A DC 10 O2 ? ? ? 1_555 B DG 138 N2 ? ? I DC -64 J DG 64 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? A DA 11 N1 ? ? ? 1_555 B DT 137 N3 ? ? I DA -63 J DT 63 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? A DA 11 N6 ? ? ? 1_555 B DT 137 O4 ? ? I DA -63 J DT 63 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? A DC 12 N3 ? ? ? 1_555 B DG 136 N1 ? ? I DC -62 J DG 62 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? A DC 12 N4 ? ? ? 1_555 B DG 136 O6 ? ? I DC -62 J DG 62 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? A DC 12 O2 ? ? ? 1_555 B DG 136 N2 ? ? I DC -62 J DG 62 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? A DC 13 N3 ? ? ? 1_555 B DG 135 N1 ? ? I DC -61 J DG 61 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? A DC 13 N4 ? ? ? 1_555 B DG 135 O6 ? ? I DC -61 J DG 61 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? A DC 13 O2 ? ? ? 1_555 B DG 135 N2 ? ? I DC -61 J DG 61 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? A DT 14 N3 ? ? ? 1_555 B DA 134 N1 ? ? 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J 62 ? 1 A DC 12 1_555 B DG 136 1_555 A DC 13 1_555 B DG 135 1_555 0.279 -0.213 3.491 -0.578 11.177 33.033 -2.157 -0.559 3.245 18.991 0.981 34.828 12 II_DC-62DC-61:DG61DG62_JJ I -62 ? J 62 ? I -61 ? J 61 ? 1 A DC 13 1_555 B DG 135 1_555 A DT 14 1_555 B DA 134 1_555 -0.600 0.294 3.159 -0.681 5.627 30.477 -0.510 0.994 3.174 10.590 1.282 30.987 13 II_DC-61DT-60:DA60DG61_JJ I -61 ? J 61 ? I -60 ? J 60 ? 1 A DT 14 1_555 B DA 134 1_555 A DG 15 1_555 B DC 133 1_555 0.492 1.515 3.344 2.078 -2.524 44.248 2.243 -0.456 3.275 -3.345 -2.754 44.362 14 II_DT-60DG-59:DC59DA60_JJ I -60 ? J 60 ? I -59 ? J 59 ? 1 A DG 15 1_555 B DC 133 1_555 A DC 16 1_555 B DG 132 1_555 -0.180 0.036 3.074 -1.647 5.404 26.091 -1.250 -0.015 3.025 11.795 3.596 26.686 15 II_DG-59DC-58:DG58DC59_JJ I -59 ? J 59 ? I -58 ? J 58 ? 1 A DC 16 1_555 B DG 132 1_555 A DA 17 1_555 B DT 131 1_555 0.092 2.459 3.301 -1.855 -14.619 47.502 3.907 -0.233 2.484 -17.659 2.240 49.608 16 II_DC-58DA-57:DT57DG58_JJ I -58 ? J 58 ? I -57 ? J 57 ? 1 A DA 17 1_555 B DT 131 1_555 A DG 18 1_555 B DC 130 1_555 0.599 -0.543 3.381 1.582 -1.497 32.162 -0.701 -0.786 3.427 -2.699 -2.852 32.233 17 II_DA-57DG-56:DC56DT57_JJ I -57 ? J 57 ? I -56 ? J 56 ? 1 A DG 18 1_555 B DC 130 1_555 A DA 19 1_555 B DT 129 1_555 0.192 -0.259 3.625 3.328 -2.693 40.206 -0.039 0.138 3.638 -3.903 -4.825 40.424 18 II_DG-56DA-55:DT55DC56_JJ I -56 ? J 56 ? I -55 ? J 55 ? 1 A DA 19 1_555 B DT 129 1_555 A DT 20 1_555 B DA 128 1_555 0.139 -0.923 3.167 -0.324 -4.481 31.938 -0.875 -0.307 3.262 -8.094 0.585 32.244 19 II_DA-55DT-54:DA54DT55_JJ I -55 ? J 55 ? I -54 ? J 54 ? 1 A DT 20 1_555 B DA 128 1_555 A DA 21 1_555 B DT 127 1_555 -0.054 -1.082 3.389 -1.347 7.704 32.463 -3.162 -0.130 3.058 13.537 2.367 33.367 20 II_DT-54DA-53:DT53DA54_JJ I -54 ? J 54 ? I -53 ? J 53 ? 1 A DA 21 1_555 B DT 127 1_555 A DC 22 1_555 B DG 126 1_555 -0.454 -0.776 2.988 2.035 8.342 27.964 -3.125 1.287 2.613 16.768 -4.091 29.227 21 II_DA-53DC-52:DG52DT53_JJ I -53 ? J 53 ? I -52 ? 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