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10.1038/nature20576 _citation.pdbx_database_id_PubMed 27974800 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Worrall, L.J.' 1 ? primary 'Hong, C.' 2 ? primary 'Vuckovic, M.' 3 ? primary 'Deng, W.' 4 ? primary 'Bergeron, J.R.' 5 ? primary 'Majewski, D.D.' 6 ? primary 'Huang, R.K.' 7 ? primary 'Spreter, T.' 8 ? primary 'Finlay, B.B.' 9 ? primary 'Yu, Z.' 10 ? primary 'Strynadka, N.C.' 11 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Lipoprotein PrgK' 26199.723 24 ? ? ? ? 2 polymer nat 'Protein PrgH' 30360.537 24 ? ? ? ? # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;CKDKDLLKGLDQEQANEVIAVLQMHNIEANKIDSGKLGYSITVAEPDFTAAVYWIKTYQLPPRPRVEIAQMFPADSLVSS PRAEKARLYSAIEQRLEQSLQTMEGVLSARVHISYDIDAGENGRPPKPVHLSALAVYERGSPLAHQISDIKRFLKNSFAD VDYDNISVVLSERSDAQLQAPGTPVKRNSFATSWIVLIILLSVMSAGFGVWYYKNHYARNKKGITADDKAKSSNE ; ;CKDKDLLKGLDQEQANEVIAVLQMHNIEANKIDSGKLGYSITVAEPDFTAAVYWIKTYQLPPRPRVEIAQMFPADSLVSS PRAEKARLYSAIEQRLEQSLQTMEGVLSARVHISYDIDAGENGRPPKPVHLSALAVYERGSPLAHQISDIKRFLKNSFAD VDYDNISVVLSERSDAQLQAPGTPVKRNSFATSWIVLIILLSVMSAGFGVWYYKNHYARNKKGITADDKAKSSNE ; 0,2,4,6,8,B,D,F,H,J,L,N,P,R,T,V,X,Z,a,c,e,g,i,k ? 2 'polypeptide(L)' no no ;SAKKNEPRFKNGIVAALAGFFILGIGTVGTLWILNSPQRQAAELDSLLGQEKERFQVLPGRDKMLYVAAQNERDTLWARQ VLARGDYDKNARVINENEENKRISIWLDTYYPQLAYYRIHFDEPRKPVFWLSRQRNTMSKKELEVLSQKLRALMPYADSV NITLMDDVTAAGQAEAGLKQQALPYSRRNHKGGVTFVIQGALDDVEILRARQFVDSYYRTWGGRYVQFAIELKDDWLKGR SFQYGAEGYIKMSPGHWYFPSPL ; ;SAKKNEPRFKNGIVAALAGFFILGIGTVGTLWILNSPQRQAAELDSLLGQEKERFQVLPGRDKMLYVAAQNERDTLWARQ 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'Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium' 90371 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 1 263 ? 'Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium' 90371 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 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P41783 130 ? 392 ? 130 392 22 1 5TCP L 1 ? 235 ? P41786 18 ? 252 ? 18 252 23 2 5TCP M 1 ? 263 ? P41783 130 ? 392 ? 130 392 24 1 5TCP N 1 ? 235 ? P41786 18 ? 252 ? 18 252 25 2 5TCP O 1 ? 263 ? P41783 130 ? 392 ? 130 392 26 1 5TCP P 1 ? 235 ? P41786 18 ? 252 ? 18 252 27 2 5TCP Q 1 ? 263 ? P41783 130 ? 392 ? 130 392 28 1 5TCP R 1 ? 235 ? P41786 18 ? 252 ? 18 252 29 2 5TCP S 1 ? 263 ? P41783 130 ? 392 ? 130 392 30 1 5TCP T 1 ? 235 ? P41786 18 ? 252 ? 18 252 31 2 5TCP U 1 ? 263 ? P41783 130 ? 392 ? 130 392 32 1 5TCP V 1 ? 235 ? P41786 18 ? 252 ? 18 252 33 2 5TCP W 1 ? 263 ? P41783 130 ? 392 ? 130 392 34 1 5TCP X 1 ? 235 ? P41786 18 ? 252 ? 18 252 35 2 5TCP Y 1 ? 263 ? P41783 130 ? 392 ? 130 392 36 1 5TCP Z 1 ? 235 ? P41786 18 ? 252 ? 18 252 37 1 5TCP a 1 ? 235 ? P41786 18 ? 252 ? 18 252 38 2 5TCP b 1 ? 263 ? P41783 130 ? 392 ? 130 392 39 1 5TCP c 1 ? 235 ? P41786 18 ? 252 ? 18 252 40 2 5TCP d 1 ? 263 ? P41783 130 ? 392 ? 130 392 41 1 5TCP e 1 ? 235 ? P41786 18 ? 252 ? 18 252 42 2 5TCP f 1 ? 263 ? P41783 130 ? 392 ? 130 392 43 1 5TCP g 1 ? 235 ? P41786 18 ? 252 ? 18 252 44 2 5TCP h 1 ? 263 ? P41783 130 ? 392 ? 130 392 45 1 5TCP i 1 ? 235 ? P41786 18 ? 252 ? 18 252 46 2 5TCP j 1 ? 263 ? P41783 130 ? 392 ? 130 392 47 1 5TCP k 1 ? 235 ? P41786 18 ? 252 ? 18 252 48 2 5TCP l 1 ? 263 ? P41783 130 ? 392 ? 130 392 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 48-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 48 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 222330 ? 1 MORE -427 ? 1 'SSA (A^2)' 381240 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASP A 11 ? 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ASP 4 28 HIS 4 42 1 ? 15 HELX_P HELX_P30 AD3 GLY E 35 ? LEU E 37 ? GLY 4 52 LEU 4 54 5 ? 3 HELX_P HELX_P31 AD4 ALA E 44 ? TYR E 58 ? ALA 4 61 TYR 4 75 1 ? 15 HELX_P HELX_P32 AD5 GLU E 67 ? PHE E 72 ? GLU 4 84 PHE 4 89 5 ? 6 HELX_P HELX_P33 AD6 SER E 80 ? GLN E 101 ? SER 4 97 GLN 4 118 1 ? 22 HELX_P HELX_P34 AD7 ALA E 119 ? GLY E 123 ? ALA 4 136 GLY 4 140 5 ? 5 HELX_P HELX_P35 AD8 PRO E 142 ? ASN E 156 ? PRO 4 159 ASN 4 173 1 ? 15 HELX_P HELX_P36 AD9 GLU F 43 ? LEU F 48 ? GLU 5 172 LEU 5 177 1 ? 6 HELX_P HELX_P37 AE1 GLU F 51 ? GLU F 53 ? GLU 5 180 GLU 5 182 5 ? 3 HELX_P HELX_P38 AE2 ASN F 71 ? GLY F 85 ? ASN 5 200 GLY 5 214 1 ? 15 HELX_P HELX_P39 AE3 GLU F 96 ? TYR F 111 ? GLU 5 225 TYR 5 240 1 ? 16 HELX_P HELX_P40 AE4 SER F 139 ? MET F 154 ? SER 5 268 MET 5 283 1 ? 16 HELX_P HELX_P41 AE5 ASP F 166 ? GLN F 181 ? ASP 5 295 GLN 5 310 1 ? 16 HELX_P HELX_P42 AE6 ASP F 203 ? GLY F 222 ? ASP 5 332 GLY 5 351 1 ? 20 HELX_P HELX_P43 AE7 ASP G 11 ? HIS G 25 ? ASP 6 28 HIS 6 42 1 ? 15 HELX_P HELX_P44 AE8 GLY G 35 ? LEU G 37 ? GLY 6 52 LEU 6 54 5 ? 3 HELX_P HELX_P45 AE9 ALA G 44 ? TYR G 58 ? ALA 6 61 TYR 6 75 1 ? 15 HELX_P HELX_P46 AF1 GLU G 67 ? PHE G 72 ? GLU 6 84 PHE 6 89 5 ? 6 HELX_P HELX_P47 AF2 SER G 80 ? GLN G 101 ? SER 6 97 GLN 6 118 1 ? 22 HELX_P HELX_P48 AF3 ALA G 119 ? GLY G 123 ? ALA 6 136 GLY 6 140 5 ? 5 HELX_P HELX_P49 AF4 PRO G 142 ? ASN G 156 ? PRO 6 159 ASN 6 173 1 ? 15 HELX_P HELX_P50 AF5 GLU H 43 ? LEU H 48 ? GLU 7 172 LEU 7 177 1 ? 6 HELX_P HELX_P51 AF6 GLU H 51 ? GLU H 53 ? GLU 7 180 GLU 7 182 5 ? 3 HELX_P HELX_P52 AF7 ASN H 71 ? GLY H 85 ? ASN 7 200 GLY 7 214 1 ? 15 HELX_P HELX_P53 AF8 GLU H 96 ? TYR H 111 ? GLU 7 225 TYR 7 240 1 ? 16 HELX_P HELX_P54 AF9 SER H 139 ? MET H 154 ? SER 7 268 MET 7 283 1 ? 16 HELX_P HELX_P55 AG1 ASP H 166 ? GLN H 181 ? ASP 7 295 GLN 7 310 1 ? 16 HELX_P HELX_P56 AG2 ASP H 203 ? GLY H 222 ? ASP 7 332 GLY 7 351 1 ? 20 HELX_P HELX_P57 AG3 ASP I 11 ? HIS I 25 ? 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