data_5TMI # _entry.id 5TMI # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.286 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 5TMI WWPDB D_1000223107 BMRB 30191 # _pdbx_database_PDB_obs_spr.id OBSLTE _pdbx_database_PDB_obs_spr.date 2017-09-20 _pdbx_database_PDB_obs_spr.pdb_id 6ALT _pdbx_database_PDB_obs_spr.replace_pdb_id 5TMI _pdbx_database_PDB_obs_spr.details ? # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type PDB 'same sequence with a single 5-methylcytosine modification' 5L2G unspecified BMRB 'same sequence with a single 5-methylcytosine modification' 30151 unspecified PDB 'same sequence with a single 5-methylcytosine modification' 5L06 unspecified BMRB 'same sequence with a single 5-methylcytosine modification' 30148 unspecified BMRB 'same sequence with a single 8-oxoguanine modification' 30044 unspecified PDB 'same sequence with a single 8-oxoguanine modification' 5IZP unspecified PDB 'same sequence with a single 8-oxoguanine modification' 5IV1 unspecified BMRB . 30038 unspecified BMRB 'Solution Structure of a DNA Dodecamer with 5-methylcytosine at the 3rd Position and 9th position' 30191 unspecified # _pdbx_database_status.status_code OBS _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr OBS _pdbx_database_status.entry_id 5TMI _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2016-10-12 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs OBS _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Hoppins, J.J.' 1 'Miears, H.L.' 2 'Gruber, D.R.' 3 'Kasymov, R.D.' 4 'Zharkov, D.O.' 5 'Smirnov, S.L.' 6 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country ? _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'To Be Published' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD 0353 _citation.journal_id_ISSN ? _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Solution Structure of a DNA Dodecamer with 5-methylcytosine at the 3rd Position and 9th position' _citation.year ? _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI ? _citation.pdbx_database_id_PubMed ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Hoppins, J.J.' 1 primary 'Miears, H.L.' 2 primary 'Gruber, D.R.' 3 primary 'Kasymov, R.D.' 4 primary 'Zharkov, D.O.' 5 primary 'Smirnov, S.L.' 6 # _entity.id 1 _entity.type polymer _entity.src_method syn _entity.pdbx_description ;DNA (5'-D(*CP*GP*(5CM)P*GP*AP*AP*TP*TP*(5CM)P*GP*CP*G)-3') ; _entity.formula_weight 3691.446 _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_ec ? _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.details ? # _entity_poly.entity_id 1 _entity_poly.type polydeoxyribonucleotide _entity_poly.nstd_linkage no _entity_poly.nstd_monomer yes _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code '(DC)(DG)(5CM)(DG)(DA)(DA)(DT)(DT)(5CM)(DG)(DC)(DG)' _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can CGCGAATTCGCG _entity_poly.pdbx_strand_id A,B _entity_poly.pdbx_target_identifier ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 DC n 1 2 DG n 1 3 5CM n 1 4 DG n 1 5 DA n 1 6 DA n 1 7 DT n 1 8 DT n 1 9 5CM n 1 10 DG n 1 11 DC n 1 12 DG n # _pdbx_entity_src_syn.entity_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag sample _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num 12 _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific 'synthetic construct' _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name ? _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id 32630 _pdbx_entity_src_syn.details ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name PDB _struct_ref.db_code 5TMI _struct_ref.pdbx_db_accession 5TMI _struct_ref.pdbx_db_isoform ? _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ? _struct_ref.pdbx_align_begin 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 5TMI A 1 ? 12 ? 5TMI 1 ? 12 ? 1 12 2 1 5TMI B 1 ? 12 ? 5TMI 13 ? 24 ? 13 24 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight 5CM 'DNA linking' n "5-METHYL-2'-DEOXY-CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H16 N3 O7 P' 321.224 DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 # loop_ _pdbx_nmr_exptl.experiment_id _pdbx_nmr_exptl.conditions_id _pdbx_nmr_exptl.solution_id _pdbx_nmr_exptl.type _pdbx_nmr_exptl.spectrometer_id _pdbx_nmr_exptl.sample_state 1 1 1 '2D 1H-1H NOESY' 1 isotropic 2 2 1 '2D 1H-1H NOESY' 1 isotropic 3 1 1 '2D 1H-1H TOCSY' 1 isotropic 4 1 1 '2D DQF-COSY' 1 isotropic # loop_ _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.details _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_err _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_units _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.label _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_err _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_units _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_err _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_err _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_units 1 298 ? ambient 6.8 120 ? ? mM D2O ? pH ? ? K 2 278 ? ambient 6.8 120 ? ? mM H2O ? pH ? ? K # _pdbx_nmr_sample_details.solution_id 1 _pdbx_nmr_sample_details.contents ;50 mM sodium chloride, 10 mM potassium phosphate, 0.1 mM EDTA, 1 mM DNA (5'-D(*CP*GP*(DMC)P*GP*AP*AP*TP*TP*(DMC)P*GP*CP*G)-3'), 100% D2O ; _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system '100% D2O' _pdbx_nmr_sample_details.label 5metC3C9 _pdbx_nmr_sample_details.type solution _pdbx_nmr_sample_details.details ? # _pdbx_nmr_spectrometer.spectrometer_id 1 _pdbx_nmr_spectrometer.model INOVA _pdbx_nmr_spectrometer.type ? _pdbx_nmr_spectrometer.manufacturer Varian _pdbx_nmr_spectrometer.field_strength 500 _pdbx_nmr_spectrometer.details ? # _pdbx_nmr_refine.entry_id 5TMI _pdbx_nmr_refine.method 'simulated annealing' _pdbx_nmr_refine.details ? _pdbx_nmr_refine.software_ordinal 5 # _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 5TMI _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 18 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 11 _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'structures with the lowest energy' _pdbx_nmr_ensemble.representative_conformer ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # _pdbx_nmr_representative.entry_id 5TMI _pdbx_nmr_representative.conformer_id 1 _pdbx_nmr_representative.selection_criteria 'minimized average structure' # loop_ _pdbx_nmr_software.ordinal _pdbx_nmr_software.classification _pdbx_nmr_software.name _pdbx_nmr_software.version _pdbx_nmr_software.authors 1 'chemical shift assignment' NMRView 9.0 'Johnson, One Moon Scientific' 2 'peak picking' NMRView 9.0 'Johnson, One Moon Scientific' 3 processing NMRPipe ? 'Delaglio, Grzesiek, Vuister, Zhu, Pfeifer and Bax' 4 'data analysis' NMRView 9.0 'Johnson, One Moon Scientific' 5 refinement AMBER 12 'Case, Darden, Cheatham III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, and Kollman' 6 'structure calculation' AMBER 12 'Case, Darden, Cheatham III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, and Kollman' # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 5TMI _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'SOLUTION NMR' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 5TMI _struct.title 'Solution Structure of a DNA Dodecamer with 5-methylcytosine at the 3rd Position and 9th position' _struct.pdbx_descriptor ? _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 5TMI _struct_keywords.text 'Drew-Dickerson, DNA, non-canonical, modified DNA, methylated DNA, epigenetics, CpG site' _struct_keywords.pdbx_keywords DNA # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale1 covale both ? A DG 2 "O3'" ? ? ? 1_555 A 5CM 3 P ? ? A DG 2 A 5CM 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.615 ? covale2 covale both ? A 5CM 3 "O3'" ? ? ? 1_555 A DG 4 P ? ? A 5CM 3 A DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.617 ? covale3 covale both ? A DT 8 "O3'" ? ? ? 1_555 A 5CM 9 P ? ? A DT 8 A 5CM 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.615 ? covale4 covale both ? A 5CM 9 "O3'" ? ? ? 1_555 A DG 10 P ? ? A 5CM 9 A DG 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.614 ? covale5 covale both ? B DG 2 "O3'" ? ? ? 1_555 B 5CM 3 P ? ? B DG 14 B 5CM 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.614 ? covale6 covale both ? B 5CM 3 "O3'" ? ? ? 1_555 B DG 4 P ? ? B 5CM 15 B DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.616 ? covale7 covale both ? B DT 8 "O3'" ? ? ? 1_555 B 5CM 9 P ? ? B DT 20 B 5CM 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.616 ? covale8 covale both ? B 5CM 9 "O3'" ? ? ? 1_555 B DG 10 P ? ? B 5CM 21 B DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.614 ? hydrog1 hydrog ? ? A DC 1 N3 ? ? ? 1_555 B DG 12 N1 ? ? A DC 1 B DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog2 hydrog ? ? A DC 1 N4 ? ? ? 1_555 B DG 12 O6 ? ? A DC 1 B DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3 hydrog ? ? A DC 1 O2 ? ? ? 1_555 B DG 12 N2 ? ? A DC 1 B DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog4 hydrog ? ? A DG 2 N1 ? ? ? 1_555 B DC 11 N3 ? ? A DG 2 B DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog5 hydrog ? ? A DG 2 N2 ? ? ? 1_555 B DC 11 O2 ? ? A DG 2 B DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog6 hydrog ? ? A DG 2 O6 ? ? ? 1_555 B DC 11 N4 ? ? A DG 2 B DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog7 hydrog ? ? A 5CM 3 N3 ? ? ? 1_555 B DG 10 N1 ? ? A 5CM 3 B DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog8 hydrog ? ? A 5CM 3 N4 ? ? ? 1_555 B DG 10 O6 ? ? A 5CM 3 B DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog9 hydrog ? ? A 5CM 3 O2 ? ? ? 1_555 B DG 10 N2 ? ? A 5CM 3 B DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog10 hydrog ? ? A DG 4 N1 ? ? ? 1_555 B 5CM 9 N3 ? ? A DG 4 B 5CM 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog11 hydrog ? ? A DG 4 N2 ? ? ? 1_555 B 5CM 9 O2 ? ? A DG 4 B 5CM 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog12 hydrog ? ? A DG 4 O6 ? ? ? 1_555 B 5CM 9 N4 ? ? A DG 4 B 5CM 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog13 hydrog ? ? A DA 5 N1 ? ? ? 1_555 B DT 8 N3 ? ? A DA 5 B DT 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog14 hydrog ? ? A DA 5 N6 ? ? ? 1_555 B DT 8 O4 ? ? A DA 5 B DT 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog15 hydrog ? ? A DA 6 N1 ? ? ? 1_555 B DT 7 N3 ? ? A DA 6 B DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog16 hydrog ? ? A DA 6 N6 ? ? ? 1_555 B DT 7 O4 ? ? A DA 6 B DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog17 hydrog ? ? A DT 7 N3 ? ? ? 1_555 B DA 6 N1 ? ? A DT 7 B DA 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog18 hydrog ? ? A DT 7 O4 ? ? ? 1_555 B DA 6 N6 ? ? A DT 7 B DA 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog19 hydrog ? ? A DT 8 N3 ? ? ? 1_555 B DA 5 N1 ? ? A DT 8 B DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog20 hydrog ? ? A DT 8 O4 ? ? ? 1_555 B DA 5 N6 ? ? A DT 8 B DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog21 hydrog ? ? A 5CM 9 N3 ? ? ? 1_555 B DG 4 N1 ? ? A 5CM 9 B DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog22 hydrog ? ? A 5CM 9 N4 ? ? ? 1_555 B DG 4 O6 ? ? A 5CM 9 B DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog23 hydrog ? ? A 5CM 9 O2 ? ? ? 1_555 B DG 4 N2 ? ? A 5CM 9 B DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog24 hydrog ? ? A DG 10 N1 ? ? ? 1_555 B 5CM 3 N3 ? ? A DG 10 B 5CM 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog25 hydrog ? ? A DG 10 N2 ? ? ? 1_555 B 5CM 3 O2 ? ? A DG 10 B 5CM 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog26 hydrog ? ? A DG 10 O6 ? ? ? 1_555 B 5CM 3 N4 ? ? A DG 10 B 5CM 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog27 hydrog ? ? A DC 11 N3 ? ? ? 1_555 B DG 2 N1 ? ? A DC 11 B DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog28 hydrog ? ? A DC 11 N4 ? ? ? 1_555 B DG 2 O6 ? ? A DC 11 B DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog29 hydrog ? ? A DC 11 O2 ? ? ? 1_555 B DG 2 N2 ? ? A DC 11 B DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog30 hydrog ? ? A DG 12 N1 ? ? ? 1_555 B DC 1 N3 ? ? A DG 12 B DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog31 hydrog ? ? A DG 12 N2 ? ? ? 1_555 B DC 1 O2 ? ? A DG 12 B DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog32 hydrog ? ? A DG 12 O6 ? ? ? 1_555 B DC 1 N4 ? ? A DG 12 B DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference covale ? ? hydrog ? ? # _atom_sites.entry_id 5TMI _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C H N O P # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 DC 1 1 1 DC DC A . n A 1 2 DG 2 2 2 DG DG A . n A 1 3 5CM 3 3 3 5CM DMC A . n A 1 4 DG 4 4 4 DG DG A . n A 1 5 DA 5 5 5 DA DA A . n A 1 6 DA 6 6 6 DA DA A . n A 1 7 DT 7 7 7 DT DT A . n A 1 8 DT 8 8 8 DT DT A . n A 1 9 5CM 9 9 9 5CM DMC A . n A 1 10 DG 10 10 10 DG DG A . n A 1 11 DC 11 11 11 DC DC A . n A 1 12 DG 12 12 12 DG DG A . n B 1 1 DC 1 13 13 DC DC B . n B 1 2 DG 2 14 14 DG DG B . n B 1 3 5CM 3 15 15 5CM DMC B . n B 1 4 DG 4 16 16 DG DG B . n B 1 5 DA 5 17 17 DA DA B . n B 1 6 DA 6 18 18 DA DA B . n B 1 7 DT 7 19 19 DT DT B . n B 1 8 DT 8 20 20 DT DT B . n B 1 9 5CM 9 21 21 5CM DMC B . n B 1 10 DG 10 22 22 DG DG B . n B 1 11 DC 11 23 23 DC DC B . n B 1 12 DG 12 24 24 DG DG B . n # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 3610 ? 1 MORE 10 ? 1 'SSA (A^2)' 4140 ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2016-10-26 2 'Structure model' 1 1 2017-09-20 # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? 2 2 'Structure model' repository Obsolete ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' Advisory 2 2 'Structure model' Other 3 2 'Structure model' 'Structure summary' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' entity 2 2 'Structure model' pdbx_database_PDB_obs_spr 3 2 'Structure model' pdbx_database_status # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_entity.pdbx_number_of_molecules' 2 2 'Structure model' '_pdbx_database_status.status_code' 3 2 'Structure model' '_pdbx_database_status.status_code_cs' 4 2 'Structure model' '_pdbx_database_status.status_code_mr' # loop_ _pdbx_nmr_exptl_sample.solution_id _pdbx_nmr_exptl_sample.component _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_range _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_units _pdbx_nmr_exptl_sample.isotopic_labeling 1 'sodium chloride' 50 ? mM 'natural abundance' 1 'potassium phosphate' 10 ? mM 'natural abundance' 1 EDTA 0.1 ? mM 'natural abundance' 1 ;DNA (5'-D(*CP*GP*(DMC)P*GP*AP*AP*TP*TP*(DMC)P*GP*CP*G)-3') ; 1 ? mM 'natural abundance' # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 110.20 108.30 1.90 0.30 N 2 1 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.65 121.90 -5.25 0.70 N 3 1 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 110.32 108.30 2.02 0.30 N 4 1 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 112.74 108.30 4.44 0.30 N 5 1 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 110.15 108.30 1.85 0.30 N 6 1 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.83 117.00 -3.17 0.50 N 7 1 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.38 117.70 3.68 0.50 N 8 1 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.96 118.60 -4.64 0.60 N 9 1 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.77 117.00 -3.23 0.50 N 10 1 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 121.31 117.70 3.61 0.50 N 11 1 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 113.89 118.60 -4.71 0.60 N 12 1 "O4'" A DT 7 ? ? "C1'" A DT 7 ? ? N1 A DT 7 ? ? 110.28 108.30 1.98 0.30 N 13 1 C6 A DT 7 ? ? C5 A DT 7 ? ? C7 A DT 7 ? ? 119.19 122.90 -3.71 0.60 N 14 1 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 119.28 122.90 -3.62 0.60 N 15 1 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 110.64 108.30 2.34 0.30 N 16 1 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 116.70 121.90 -5.20 0.70 N 17 1 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 112.00 108.30 3.70 0.30 N 18 1 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.60 121.90 -5.30 0.70 N 19 1 "O4'" B DG 16 ? ? "C1'" B DG 16 ? ? N9 B DG 16 ? ? 112.46 108.30 4.16 0.30 N 20 1 "O4'" B DA 17 ? ? "C1'" B DA 17 ? ? N9 B DA 17 ? ? 110.16 108.30 1.86 0.30 N 21 1 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.85 117.00 -3.15 0.50 N 22 1 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.44 117.70 3.74 0.50 N 23 1 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 114.07 118.60 -4.53 0.60 N 24 1 C4 B DA 18 ? ? C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? 113.83 117.00 -3.17 0.50 N 25 1 C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N1 B DA 18 ? ? 121.22 117.70 3.52 0.50 N 26 1 N1 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N6 B DA 18 ? ? 113.97 118.60 -4.63 0.60 N 27 1 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 110.35 108.30 2.05 0.30 N 28 1 C6 B DT 19 ? ? C5 B DT 19 ? ? C7 B DT 19 ? ? 119.16 122.90 -3.74 0.60 N 29 1 C6 B DT 20 ? ? C5 B DT 20 ? ? C7 B DT 20 ? ? 119.28 122.90 -3.62 0.60 N 30 1 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 110.78 108.30 2.48 0.30 N 31 1 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 116.64 121.90 -5.26 0.70 N 32 1 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 112.15 108.30 3.85 0.30 N 33 2 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.60 121.90 -5.30 0.70 N 34 2 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 110.26 108.30 1.96 0.30 N 35 2 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 112.71 108.30 4.41 0.30 N 36 2 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 110.19 108.30 1.89 0.30 N 37 2 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.80 117.00 -3.20 0.50 N 38 2 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.43 117.70 3.73 0.50 N 39 2 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.97 118.60 -4.63 0.60 N 40 2 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.79 117.00 -3.21 0.50 N 41 2 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 121.31 117.70 3.61 0.50 N 42 2 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 113.88 118.60 -4.72 0.60 N 43 2 "O4'" A DT 7 ? ? "C1'" A DT 7 ? ? N1 A DT 7 ? ? 110.28 108.30 1.98 0.30 N 44 2 C6 A DT 7 ? ? C5 A DT 7 ? ? C7 A DT 7 ? ? 119.19 122.90 -3.71 0.60 N 45 2 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 110.54 108.30 2.24 0.30 N 46 2 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 116.74 121.90 -5.16 0.70 N 47 2 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.92 108.30 3.62 0.30 N 48 2 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.55 121.90 -5.35 0.70 N 49 2 "O4'" B DG 16 ? ? "C1'" B DG 16 ? ? N9 B DG 16 ? ? 112.71 108.30 4.41 0.30 N 50 2 "O4'" B DA 17 ? ? "C1'" B DA 17 ? ? N9 B DA 17 ? ? 110.21 108.30 1.91 0.30 N 51 2 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.80 117.00 -3.20 0.50 N 52 2 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.45 117.70 3.75 0.50 N 53 2 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 113.94 118.60 -4.66 0.60 N 54 2 C4 B DA 18 ? ? C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? 113.76 117.00 -3.24 0.50 N 55 2 C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N1 B DA 18 ? ? 121.31 117.70 3.61 0.50 N 56 2 N1 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N6 B DA 18 ? ? 113.93 118.60 -4.67 0.60 N 57 2 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 110.31 108.30 2.01 0.30 N 58 2 C6 B DT 19 ? ? C5 B DT 19 ? ? C7 B DT 19 ? ? 119.15 122.90 -3.75 0.60 N 59 2 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 110.63 108.30 2.33 0.30 N 60 2 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 116.75 121.90 -5.15 0.70 N 61 2 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 111.88 108.30 3.58 0.30 N 62 3 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.57 121.90 -5.33 0.70 N 63 3 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.70 108.30 3.40 0.30 N 64 3 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.81 117.00 -3.19 0.50 N 65 3 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.28 117.70 3.58 0.50 N 66 3 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 114.04 118.60 -4.56 0.60 N 67 3 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.78 117.00 -3.22 0.50 N 68 3 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 121.34 117.70 3.64 0.50 N 69 3 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 113.80 118.60 -4.80 0.60 N 70 3 "O4'" A DT 7 ? ? "C1'" A DT 7 ? ? N1 A DT 7 ? ? 110.28 108.30 1.98 0.30 N 71 3 C6 A DT 7 ? ? C5 A DT 7 ? ? C7 A DT 7 ? ? 119.20 122.90 -3.70 0.60 N 72 3 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 110.68 108.30 2.38 0.30 N 73 3 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 116.69 121.90 -5.21 0.70 N 74 3 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.98 108.30 3.68 0.30 N 75 3 "O4'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? N1 B DC 13 ? ? 110.26 108.30 1.96 0.30 N 76 3 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.63 121.90 -5.27 0.70 N 77 3 "O4'" B DG 14 ? ? "C1'" B DG 14 ? ? N9 B DG 14 ? ? 110.30 108.30 2.00 0.30 N 78 3 "O4'" B DG 16 ? ? "C1'" B DG 16 ? ? N9 B DG 16 ? ? 112.59 108.30 4.29 0.30 N 79 3 "O4'" B DA 17 ? ? "C1'" B DA 17 ? ? N9 B DA 17 ? ? 110.15 108.30 1.85 0.30 N 80 3 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.84 117.00 -3.16 0.50 N 81 3 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.38 117.70 3.68 0.50 N 82 3 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 114.02 118.60 -4.58 0.60 N 83 3 C4 B DA 18 ? ? C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? 113.77 117.00 -3.23 0.50 N 84 3 C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N1 B DA 18 ? ? 121.28 117.70 3.58 0.50 N 85 3 N1 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N6 B DA 18 ? ? 113.89 118.60 -4.71 0.60 N 86 3 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 110.28 108.30 1.98 0.30 N 87 3 C6 B DT 19 ? ? C5 B DT 19 ? ? C7 B DT 19 ? ? 119.23 122.90 -3.67 0.60 N 88 3 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 110.17 108.30 1.87 0.30 N 89 3 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 116.68 121.90 -5.22 0.70 N 90 3 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 111.91 108.30 3.61 0.30 N 91 4 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.60 121.90 -5.30 0.70 N 92 4 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 110.21 108.30 1.91 0.30 N 93 4 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 112.79 108.30 4.49 0.30 N 94 4 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 110.27 108.30 1.97 0.30 N 95 4 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.85 117.00 -3.15 0.50 N 96 4 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.36 117.70 3.66 0.50 N 97 4 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.92 118.60 -4.68 0.60 N 98 4 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.72 117.00 -3.28 0.50 N 99 4 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 121.34 117.70 3.64 0.50 N 100 4 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 113.89 118.60 -4.71 0.60 N 101 4 "O4'" A DT 7 ? ? "C1'" A DT 7 ? ? N1 A DT 7 ? ? 110.34 108.30 2.04 0.30 N 102 4 C6 A DT 7 ? ? C5 A DT 7 ? ? C7 A DT 7 ? ? 119.24 122.90 -3.66 0.60 N 103 4 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 119.28 122.90 -3.62 0.60 N 104 4 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 110.95 108.30 2.65 0.30 N 105 4 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 116.62 121.90 -5.28 0.70 N 106 4 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 112.24 108.30 3.94 0.30 N 107 4 "O4'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? N1 B DC 13 ? ? 110.28 108.30 1.98 0.30 N 108 4 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.63 121.90 -5.27 0.70 N 109 4 "O4'" B DG 14 ? ? "C1'" B DG 14 ? ? N9 B DG 14 ? ? 110.50 108.30 2.20 0.30 N 110 4 "O4'" B DG 16 ? ? "C1'" B DG 16 ? ? N9 B DG 16 ? ? 112.35 108.30 4.05 0.30 N 111 4 "O4'" B DA 17 ? ? "C1'" B DA 17 ? ? N9 B DA 17 ? ? 110.14 108.30 1.84 0.30 N 112 4 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.89 117.00 -3.11 0.50 N 113 4 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.37 117.70 3.67 0.50 N 114 4 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 113.99 118.60 -4.61 0.60 N 115 4 C4 B DA 18 ? ? C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? 113.77 117.00 -3.23 0.50 N 116 4 C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N1 B DA 18 ? ? 121.26 117.70 3.56 0.50 N 117 4 N1 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N6 B DA 18 ? ? 113.91 118.60 -4.69 0.60 N 118 4 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 110.36 108.30 2.06 0.30 N 119 4 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 110.29 108.30 1.99 0.30 N 120 4 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 116.68 121.90 -5.22 0.70 N 121 4 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 111.76 108.30 3.46 0.30 N 122 5 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 110.34 108.30 2.04 0.30 N 123 5 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.66 121.90 -5.24 0.70 N 124 5 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 110.38 108.30 2.08 0.30 N 125 5 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 112.57 108.30 4.27 0.30 N 126 5 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 110.21 108.30 1.91 0.30 N 127 5 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.81 117.00 -3.19 0.50 N 128 5 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.41 117.70 3.71 0.50 N 129 5 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.92 118.60 -4.68 0.60 N 130 5 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.73 117.00 -3.27 0.50 N 131 5 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 121.29 117.70 3.59 0.50 N 132 5 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 113.86 118.60 -4.74 0.60 N 133 5 "O4'" A DT 7 ? ? "C1'" A DT 7 ? ? N1 A DT 7 ? ? 110.36 108.30 2.06 0.30 N 134 5 C6 A DT 7 ? ? C5 A DT 7 ? ? C7 A DT 7 ? ? 119.11 122.90 -3.79 0.60 N 135 5 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 119.28 122.90 -3.62 0.60 N 136 5 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 110.62 108.30 2.32 0.30 N 137 5 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 116.71 121.90 -5.19 0.70 N 138 5 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.92 108.30 3.62 0.30 N 139 5 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.62 121.90 -5.28 0.70 N 140 5 "O4'" B DG 14 ? ? "C1'" B DG 14 ? ? N9 B DG 14 ? ? 110.27 108.30 1.97 0.30 N 141 5 "O4'" B DG 16 ? ? "C1'" B DG 16 ? ? N9 B DG 16 ? ? 112.81 108.30 4.51 0.30 N 142 5 "O4'" B DA 17 ? ? "C1'" B DA 17 ? ? N9 B DA 17 ? ? 110.25 108.30 1.95 0.30 N 143 5 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.89 117.00 -3.11 0.50 N 144 5 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.29 117.70 3.59 0.50 N 145 5 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 113.94 118.60 -4.66 0.60 N 146 5 C4 B DA 18 ? ? C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? 113.81 117.00 -3.19 0.50 N 147 5 C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N1 B DA 18 ? ? 121.25 117.70 3.55 0.50 N 148 5 N1 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N6 B DA 18 ? ? 113.90 118.60 -4.70 0.60 N 149 5 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 110.34 108.30 2.04 0.30 N 150 5 C6 B DT 19 ? ? C5 B DT 19 ? ? C7 B DT 19 ? ? 119.19 122.90 -3.71 0.60 N 151 5 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 110.94 108.30 2.64 0.30 N 152 5 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 116.64 121.90 -5.26 0.70 N 153 5 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 112.27 108.30 3.97 0.30 N 154 6 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 110.29 108.30 1.99 0.30 N 155 6 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.62 121.90 -5.28 0.70 N 156 6 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 110.56 108.30 2.26 0.30 N 157 6 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 112.75 108.30 4.45 0.30 N 158 6 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 110.23 108.30 1.93 0.30 N 159 6 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.81 117.00 -3.19 0.50 N 160 6 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.41 117.70 3.71 0.50 N 161 6 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.97 118.60 -4.63 0.60 N 162 6 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.82 117.00 -3.18 0.50 N 163 6 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 121.28 117.70 3.58 0.50 N 164 6 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 113.85 118.60 -4.75 0.60 N 165 6 "O4'" A DT 7 ? ? "C1'" A DT 7 ? ? N1 A DT 7 ? ? 110.22 108.30 1.92 0.30 N 166 6 C6 A DT 7 ? ? C5 A DT 7 ? ? C7 A DT 7 ? ? 119.23 122.90 -3.67 0.60 N 167 6 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 119.29 122.90 -3.61 0.60 N 168 6 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 110.34 108.30 2.04 0.30 N 169 6 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 116.81 121.90 -5.09 0.70 N 170 6 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.84 108.30 3.54 0.30 N 171 6 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.48 121.90 -5.42 0.70 N 172 6 "O4'" B DG 14 ? ? "C1'" B DG 14 ? ? N9 B DG 14 ? ? 110.23 108.30 1.93 0.30 N 173 6 "O4'" B DG 16 ? ? "C1'" B DG 16 ? ? N9 B DG 16 ? ? 112.78 108.30 4.48 0.30 N 174 6 "O4'" B DA 17 ? ? "C1'" B DA 17 ? ? N9 B DA 17 ? ? 110.15 108.30 1.85 0.30 N 175 6 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.85 117.00 -3.15 0.50 N 176 6 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.36 117.70 3.66 0.50 N 177 6 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 113.99 118.60 -4.61 0.60 N 178 6 C4 B DA 18 ? ? C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? 113.74 117.00 -3.26 0.50 N 179 6 C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N1 B DA 18 ? ? 121.34 117.70 3.64 0.50 N 180 6 N1 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N6 B DA 18 ? ? 113.87 118.60 -4.73 0.60 N 181 6 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 110.27 108.30 1.97 0.30 N 182 6 C6 B DT 19 ? ? C5 B DT 19 ? ? C7 B DT 19 ? ? 119.25 122.90 -3.65 0.60 N 183 6 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 110.87 108.30 2.57 0.30 N 184 6 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 116.66 121.90 -5.24 0.70 N 185 6 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 112.34 108.30 4.04 0.30 N 186 7 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.55 121.90 -5.35 0.70 N 187 7 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 110.21 108.30 1.91 0.30 N 188 7 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 112.75 108.30 4.45 0.30 N 189 7 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 110.13 108.30 1.83 0.30 N 190 7 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.81 117.00 -3.19 0.50 N 191 7 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.46 117.70 3.76 0.50 N 192 7 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.91 118.60 -4.69 0.60 N 193 7 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.77 117.00 -3.23 0.50 N 194 7 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 121.31 117.70 3.61 0.50 N 195 7 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 113.97 118.60 -4.63 0.60 N 196 7 "O4'" A DT 7 ? ? "C1'" A DT 7 ? ? N1 A DT 7 ? ? 110.28 108.30 1.98 0.30 N 197 7 C6 A DT 7 ? ? C5 A DT 7 ? ? C7 A DT 7 ? ? 119.23 122.90 -3.67 0.60 N 198 7 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 110.23 108.30 1.93 0.30 N 199 7 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 116.70 121.90 -5.20 0.70 N 200 7 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.72 108.30 3.42 0.30 N 201 7 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.63 121.90 -5.27 0.70 N 202 7 "O4'" B DG 14 ? ? "C1'" B DG 14 ? ? N9 B DG 14 ? ? 110.13 108.30 1.83 0.30 N 203 7 "O4'" B DG 16 ? ? "C1'" B DG 16 ? ? N9 B DG 16 ? ? 112.67 108.30 4.37 0.30 N 204 7 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.90 117.00 -3.10 0.50 N 205 7 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.38 117.70 3.68 0.50 N 206 7 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 113.91 118.60 -4.69 0.60 N 207 7 C4 B DA 18 ? ? C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? 113.70 117.00 -3.30 0.50 N 208 7 C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N1 B DA 18 ? ? 121.34 117.70 3.64 0.50 N 209 7 N1 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N6 B DA 18 ? ? 113.90 118.60 -4.70 0.60 N 210 7 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 110.19 108.30 1.89 0.30 N 211 7 C6 B DT 19 ? ? C5 B DT 19 ? ? C7 B DT 19 ? ? 119.23 122.90 -3.67 0.60 N 212 7 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 110.24 108.30 1.94 0.30 N 213 7 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 116.73 121.90 -5.17 0.70 N 214 7 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 111.75 108.30 3.45 0.30 N 215 8 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 110.25 108.30 1.95 0.30 N 216 8 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.73 121.90 -5.17 0.70 N 217 8 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 110.45 108.30 2.15 0.30 N 218 8 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 112.63 108.30 4.33 0.30 N 219 8 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 110.17 108.30 1.87 0.30 N 220 8 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.82 117.00 -3.18 0.50 N 221 8 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.37 117.70 3.67 0.50 N 222 8 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.88 118.60 -4.72 0.60 N 223 8 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.80 117.00 -3.20 0.50 N 224 8 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 121.28 117.70 3.58 0.50 N 225 8 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 113.85 118.60 -4.75 0.60 N 226 8 "O4'" A DT 7 ? ? "C1'" A DT 7 ? ? N1 A DT 7 ? ? 110.32 108.30 2.02 0.30 N 227 8 C6 A DT 7 ? ? C5 A DT 7 ? ? C7 A DT 7 ? ? 119.14 122.90 -3.76 0.60 N 228 8 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 110.81 108.30 2.51 0.30 N 229 8 N1 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 122.51 118.90 3.61 0.60 N 230 8 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 116.62 121.90 -5.28 0.70 N 231 8 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 112.31 108.30 4.01 0.30 N 232 8 "O4'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? N1 B DC 13 ? ? 110.39 108.30 2.09 0.30 N 233 8 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.60 121.90 -5.30 0.70 N 234 8 "O4'" B DG 14 ? ? "C1'" B DG 14 ? ? N9 B DG 14 ? ? 110.21 108.30 1.91 0.30 N 235 8 "O4'" B DG 16 ? ? "C1'" B DG 16 ? ? N9 B DG 16 ? ? 112.63 108.30 4.33 0.30 N 236 8 "O4'" B DA 17 ? ? "C1'" B DA 17 ? ? N9 B DA 17 ? ? 110.28 108.30 1.98 0.30 N 237 8 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.83 117.00 -3.17 0.50 N 238 8 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.36 117.70 3.66 0.50 N 239 8 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 114.00 118.60 -4.60 0.60 N 240 8 C4 B DA 18 ? ? C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? 113.76 117.00 -3.24 0.50 N 241 8 C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N1 B DA 18 ? ? 121.23 117.70 3.53 0.50 N 242 8 N1 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N6 B DA 18 ? ? 113.86 118.60 -4.74 0.60 N 243 8 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 110.30 108.30 2.00 0.30 N 244 8 C6 B DT 19 ? ? C5 B DT 19 ? ? C7 B DT 19 ? ? 119.20 122.90 -3.70 0.60 N 245 8 C6 B DT 20 ? ? C5 B DT 20 ? ? C7 B DT 20 ? ? 119.24 122.90 -3.66 0.60 N 246 8 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 110.87 108.30 2.57 0.30 N 247 8 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 116.64 121.90 -5.26 0.70 N 248 8 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 112.29 108.30 3.99 0.30 N 249 9 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.67 121.90 -5.23 0.70 N 250 9 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 112.68 108.30 4.38 0.30 N 251 9 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 110.17 108.30 1.87 0.30 N 252 9 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.77 117.00 -3.23 0.50 N 253 9 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.42 117.70 3.72 0.50 N 254 9 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 114.00 118.60 -4.60 0.60 N 255 9 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.86 117.00 -3.14 0.50 N 256 9 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 121.23 117.70 3.53 0.50 N 257 9 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 113.92 118.60 -4.68 0.60 N 258 9 "O4'" A DT 7 ? ? "C1'" A DT 7 ? ? N1 A DT 7 ? ? 110.16 108.30 1.86 0.30 N 259 9 C6 A DT 7 ? ? C5 A DT 7 ? ? C7 A DT 7 ? ? 119.24 122.90 -3.66 0.60 N 260 9 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 119.26 122.90 -3.64 0.60 N 261 9 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 110.28 108.30 1.98 0.30 N 262 9 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 116.65 121.90 -5.25 0.70 N 263 9 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.71 108.30 3.41 0.30 N 264 9 "O4'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? N1 B DC 13 ? ? 111.72 108.30 3.42 0.30 N 265 9 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.61 121.90 -5.29 0.70 N 266 9 "O4'" B DG 16 ? ? "C1'" B DG 16 ? ? N9 B DG 16 ? ? 112.41 108.30 4.11 0.30 N 267 9 "O4'" B DA 17 ? ? "C1'" B DA 17 ? ? N9 B DA 17 ? ? 110.20 108.30 1.90 0.30 N 268 9 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.83 117.00 -3.17 0.50 N 269 9 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.40 117.70 3.70 0.50 N 270 9 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 113.94 118.60 -4.66 0.60 N 271 9 C4 B DA 18 ? ? C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? 113.75 117.00 -3.25 0.50 N 272 9 C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N1 B DA 18 ? ? 121.29 117.70 3.59 0.50 N 273 9 N1 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N6 B DA 18 ? ? 113.90 118.60 -4.70 0.60 N 274 9 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 110.30 108.30 2.00 0.30 N 275 9 C6 B DT 19 ? ? C5 B DT 19 ? ? C7 B DT 19 ? ? 119.17 122.90 -3.73 0.60 N 276 9 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 110.40 108.30 2.10 0.30 N 277 9 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 116.66 121.90 -5.24 0.70 N 278 9 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 111.85 108.30 3.55 0.30 N 279 10 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 110.38 108.30 2.08 0.30 N 280 10 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.58 121.90 -5.32 0.70 N 281 10 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 110.36 108.30 2.06 0.30 N 282 10 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 112.67 108.30 4.37 0.30 N 283 10 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 110.21 108.30 1.91 0.30 N 284 10 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.81 117.00 -3.19 0.50 N 285 10 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.41 117.70 3.71 0.50 N 286 10 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.92 118.60 -4.68 0.60 N 287 10 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.73 117.00 -3.27 0.50 N 288 10 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 121.31 117.70 3.61 0.50 N 289 10 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 113.88 118.60 -4.72 0.60 N 290 10 "O4'" A DT 7 ? ? "C1'" A DT 7 ? ? N1 A DT 7 ? ? 110.22 108.30 1.92 0.30 N 291 10 C6 A DT 7 ? ? C5 A DT 7 ? ? C7 A DT 7 ? ? 119.15 122.90 -3.75 0.60 N 292 10 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 119.30 122.90 -3.60 0.60 N 293 10 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 110.48 108.30 2.18 0.30 N 294 10 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 116.66 121.90 -5.24 0.70 N 295 10 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.91 108.30 3.61 0.30 N 296 10 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.60 121.90 -5.30 0.70 N 297 10 "O4'" B DG 14 ? ? "C1'" B DG 14 ? ? N9 B DG 14 ? ? 110.23 108.30 1.93 0.30 N 298 10 "O4'" B DG 16 ? ? "C1'" B DG 16 ? ? N9 B DG 16 ? ? 111.77 108.30 3.47 0.30 N 299 10 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.83 117.00 -3.17 0.50 N 300 10 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.23 117.70 3.53 0.50 N 301 10 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 114.18 118.60 -4.41 0.60 N 302 10 C4 B DA 18 ? ? C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? 113.77 117.00 -3.23 0.50 N 303 10 C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N1 B DA 18 ? ? 121.27 117.70 3.57 0.50 N 304 10 N1 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N6 B DA 18 ? ? 113.88 118.60 -4.72 0.60 N 305 10 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 110.34 108.30 2.04 0.30 N 306 10 C6 B DT 19 ? ? C5 B DT 19 ? ? C7 B DT 19 ? ? 119.17 122.90 -3.73 0.60 N 307 10 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 110.86 108.30 2.56 0.30 N 308 10 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 116.72 121.90 -5.18 0.70 N 309 10 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 112.25 108.30 3.95 0.30 N 310 11 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 110.38 108.30 2.08 0.30 N 311 11 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.71 121.90 -5.19 0.70 N 312 11 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 110.52 108.30 2.22 0.30 N 313 11 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 112.57 108.30 4.27 0.30 N 314 11 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 110.22 108.30 1.92 0.30 N 315 11 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.83 117.00 -3.17 0.50 N 316 11 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.40 117.70 3.70 0.50 N 317 11 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.96 118.60 -4.64 0.60 N 318 11 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.83 117.00 -3.17 0.50 N 319 11 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 121.26 117.70 3.56 0.50 N 320 11 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 113.90 118.60 -4.70 0.60 N 321 11 "O4'" A DT 7 ? ? "C1'" A DT 7 ? ? N1 A DT 7 ? ? 110.25 108.30 1.95 0.30 N 322 11 C6 A DT 7 ? ? C5 A DT 7 ? ? C7 A DT 7 ? ? 119.15 122.90 -3.75 0.60 N 323 11 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 110.80 108.30 2.50 0.30 N 324 11 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 116.66 121.90 -5.24 0.70 N 325 11 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 112.45 108.30 4.15 0.30 N 326 11 "O4'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? N1 B DC 13 ? ? 110.34 108.30 2.04 0.30 N 327 11 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.67 121.90 -5.23 0.70 N 328 11 "O4'" B DG 14 ? ? "C1'" B DG 14 ? ? N9 B DG 14 ? ? 110.49 108.30 2.19 0.30 N 329 11 "O4'" B DG 16 ? ? "C1'" B DG 16 ? ? N9 B DG 16 ? ? 112.59 108.30 4.29 0.30 N 330 11 "O4'" B DA 17 ? ? "C1'" B DA 17 ? ? N9 B DA 17 ? ? 110.15 108.30 1.85 0.30 N 331 11 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.85 117.00 -3.15 0.50 N 332 11 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.37 117.70 3.67 0.50 N 333 11 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 113.97 118.60 -4.63 0.60 N 334 11 C4 B DA 18 ? ? C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? 113.79 117.00 -3.21 0.50 N 335 11 C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N1 B DA 18 ? ? 121.24 117.70 3.54 0.50 N 336 11 N1 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N6 B DA 18 ? ? 113.90 118.60 -4.70 0.60 N 337 11 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 110.32 108.30 2.02 0.30 N 338 11 C6 B DT 19 ? ? C5 B DT 19 ? ? C7 B DT 19 ? ? 119.23 122.90 -3.67 0.60 N 339 11 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 110.79 108.30 2.49 0.30 N 340 11 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 116.64 121.90 -5.26 0.70 N 341 11 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 112.11 108.30 3.81 0.30 N # _ndb_struct_conf_na.entry_id 5TMI _ndb_struct_conf_na.feature 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A DC 1 1_555 B DG 12 1_555 0.275 -0.077 0.098 3.438 -12.892 -0.233 1 A_DC1:DG24_B A 1 ? B 24 ? 19 1 1 A DG 2 1_555 B DC 11 1_555 -0.521 -0.150 0.164 3.903 -5.098 -0.388 2 A_DG2:DC23_B A 2 ? B 23 ? 19 1 1 A 5CM 3 1_555 B DG 10 1_555 0.515 -0.108 0.062 0.899 -9.663 0.322 3 A_5CM3:DG22_B A 3 ? B 22 ? 19 1 1 A DG 4 1_555 B 5CM 9 1_555 -0.351 -0.096 -0.011 4.318 -15.728 1.888 4 A_DG4:5CM21_B A 4 ? B 21 ? 19 1 1 A DA 5 1_555 B DT 8 1_555 0.224 0.018 -0.240 3.763 -14.739 -2.199 5 A_DA5:DT20_B A 5 ? B 20 ? 20 1 1 A DA 6 1_555 B DT 7 1_555 0.155 -0.014 -0.143 1.249 -18.386 -0.271 6 A_DA6:DT19_B A 6 ? B 19 ? 20 1 1 A DT 7 1_555 B DA 6 1_555 -0.150 -0.016 -0.158 -0.415 -18.937 -0.447 7 A_DT7:DA18_B A 7 ? B 18 ? 20 1 1 A DT 8 1_555 B DA 5 1_555 -0.239 0.030 -0.248 -4.230 -15.512 -3.341 8 A_DT8:DA17_B A 8 ? B 17 ? 20 1 1 A 5CM 9 1_555 B DG 4 1_555 0.353 -0.098 -0.003 -5.484 -15.028 1.731 9 A_5CM9:DG16_B A 9 ? B 16 ? 19 1 1 A DG 10 1_555 B 5CM 3 1_555 -0.521 -0.106 0.080 -0.309 -9.204 0.146 10 A_DG10:5CM15_B A 10 ? B 15 ? 19 1 1 A DC 11 1_555 B DG 2 1_555 0.491 -0.143 0.152 -2.980 -5.146 -0.134 11 A_DC11:DG14_B A 11 ? B 14 ? 19 1 1 A DG 12 1_555 B DC 1 1_555 -0.206 -0.071 0.213 1.238 -6.839 -0.902 12 A_DG12:DC13_B A 12 ? B 13 ? 19 1 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 A DC 1 1_555 B DG 12 1_555 A DG 2 1_555 B DC 11 1_555 -0.333 -0.655 3.155 -1.888 9.554 26.066 -3.509 0.268 2.764 20.303 4.013 27.797 1 AA_DC1DG2:DC23DG24_BB A 1 ? B 24 ? A 2 ? B 23 ? 1 A DG 2 1_555 B DC 11 1_555 A 5CM 3 1_555 B DG 10 1_555 0.139 -0.736 3.391 1.838 1.895 40.837 -1.267 0.009 3.358 2.713 -2.630 40.918 2 AA_DG25CM3:DG22DC23_BB A 2 ? B 23 ? A 3 ? B 22 ? 1 A 5CM 3 1_555 B DG 10 1_555 A DG 4 1_555 B 5CM 9 1_555 0.589 -0.669 3.106 3.147 13.885 22.357 -4.807 -0.528 2.355 31.977 -7.247 26.457 3 AA_5CM3DG4:5CM21DG22_BB A 3 ? B 22 ? A 4 ? B 21 ? 1 A DG 4 1_555 B 5CM 9 1_555 A DA 5 1_555 B DT 8 1_555 -1.117 0.157 3.230 -1.462 4.095 40.125 -0.232 1.455 3.267 5.948 2.123 40.350 4 AA_DG4DA5:DT205CM21_BB A 4 ? B 21 ? A 5 ? B 20 ? 1 A DA 5 1_555 B DT 8 1_555 A DA 6 1_555 B DT 7 1_555 -0.395 -0.202 3.247 -2.007 2.840 40.110 -0.613 0.348 3.241 4.132 2.920 40.255 5 AA_DA5DA6:DT19DT20_BB A 5 ? B 20 ? A 6 ? B 19 ? 1 A DA 6 1_555 B DT 7 1_555 A DT 7 1_555 B DA 6 1_555 -0.028 -0.440 3.222 0.064 -1.245 29.862 -0.598 0.068 3.237 -2.415 -0.123 29.887 6 AA_DA6DT7:DA18DT19_BB A 6 ? B 19 ? A 7 ? B 18 ? 1 A DT 7 1_555 B DA 6 1_555 A DT 8 1_555 B DA 5 1_555 0.305 -0.182 3.262 1.927 3.320 40.293 -0.634 -0.226 3.248 4.806 -2.790 40.468 7 AA_DT7DT8:DA17DA18_BB A 7 ? B 18 ? A 8 ? B 17 ? 1 A DT 8 1_555 B DA 5 1_555 A 5CM 9 1_555 B DG 4 1_555 1.156 0.325 3.245 1.648 4.327 40.530 -0.012 -1.477 3.303 6.221 -2.370 40.782 8 AA_DT85CM9:DG16DA17_BB A 8 ? B 17 ? A 9 ? B 16 ? 1 A 5CM 9 1_555 B DG 4 1_555 A DG 10 1_555 B 5CM 3 1_555 -0.567 -0.526 3.073 -3.065 13.638 22.114 -4.545 0.495 2.402 31.793 7.145 26.115 9 AA_5CM9DG10:5CM15DG16_BB A 9 ? B 16 ? A 10 ? B 15 ? 1 A DG 10 1_555 B 5CM 3 1_555 A DC 11 1_555 B DG 2 1_555 -0.080 -0.640 3.380 -1.315 1.741 40.787 -1.114 -0.033 3.352 2.496 1.886 40.843 10 AA_DG10DC11:DG145CM15_BB A 10 ? B 15 ? A 11 ? B 14 ? 1 A DC 11 1_555 B DG 2 1_555 A DG 12 1_555 B DC 1 1_555 0.323 -0.711 3.087 0.490 6.088 26.626 -2.902 -0.572 2.861 13.002 -1.047 27.306 11 AA_DC11DG12:DC13DG14_BB A 11 ? B 14 ? A 12 ? B 13 ? # _pdbx_audit_support.country 'United States' _pdbx_audit_support.funding_organization 'National Science Foundation (MCB Division)' _pdbx_audit_support.grant_number 1244641 _pdbx_audit_support.ordinal 1 #