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'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_metal_ion_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_metal_ion_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_vdw_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_vdw_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_hbond_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_hbond_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_metal_ion_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_metal_ion_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 8.381 25.705 7700 ? r_mcbond_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 8.378 25.704 7699 ? r_mcbond_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 13.172 38.571 9604 ? r_mcangle_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 13.171 38.573 9605 ? r_mcangle_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 10.714 26.054 7140 ? r_scbond_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 10.713 26.053 7139 ? r_scbond_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_scangle_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 18.297 38.753 10580 ? r_scangle_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 22.399 ? 29774 ? r_long_range_B_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 22.398 ? 29775 ? r_long_range_B_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_rigid_bond_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_sphericity_free ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_sphericity_bonded ? ? # loop_ _refine_ls_restr_ncs.pdbx_refine_id _refine_ls_restr_ncs.dom_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ens_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ordinal _refine_ls_restr_ncs.ncs_model_details _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_position _refine_ls_restr_ncs.weight_position _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_B_iso _refine_ls_restr_ncs.weight_B_iso _refine_ls_restr_ncs.pdbx_auth_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_number _refine_ls_restr_ncs.pdbx_type _refine_ls_restr_ncs.pdbx_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_rms _refine_ls_restr_ncs.pdbx_weight 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 1 1 ? 1.05 0.50 ? ? A 6961 'tight thermal' ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 1 2 ? 0.93 0.50 ? ? B 6961 'tight thermal' ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 1 3 ? 0.99 0.50 ? ? C 6961 'tight thermal' ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 1 4 ? 1.65 0.50 ? ? D 6961 'tight thermal' ? ? ? # _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine_ls_shell.d_res_high 3.500 _refine_ls_shell.d_res_low 3.591 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.number_reflns_obs ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 0 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 6497 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 100.00 _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? _refine_ls_shell.R_factor_obs ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.486 _refine_ls_shell.redundancy_reflns_all ? _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_all ? _refine_ls_shell.wR_factor_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_free ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_work ? _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.pdbx_phase_error ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_work ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_free ? # loop_ _struct_ncs_oper.id _struct_ncs_oper.code _struct_ncs_oper.details _struct_ncs_oper.matrix[1][1] _struct_ncs_oper.matrix[1][2] _struct_ncs_oper.matrix[1][3] _struct_ncs_oper.matrix[2][1] _struct_ncs_oper.matrix[2][2] _struct_ncs_oper.matrix[2][3] _struct_ncs_oper.matrix[3][1] _struct_ncs_oper.matrix[3][2] _struct_ncs_oper.matrix[3][3] _struct_ncs_oper.vector[1] _struct_ncs_oper.vector[2] _struct_ncs_oper.vector[3] 1 given ? 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 0.00000 0.00000 2 given ? 0.001246 0.999999 0.000332 -0.999999 0.001246 0.000723 0.000723 -0.000332 1.000000 -0.09105 124.71944 -0.01601 3 given ? -0.999999 0.001310 0.000614 -0.001310 -0.999999 0.000725 0.000615 0.000724 1.000000 124.73636 124.87591 -0.07010 4 given ? 0.000198 -1.000000 0.000119 1.000000 0.000198 -0.000115 0.000115 0.000119 1.000000 124.81739 -0.01223 -0.01129 # loop_ _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id 1 A 1 2 B 1 3 C 1 4 D 1 # loop_ _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.selection_details 1 1 1 A MET 94 . A VAL 586 . A MET 94 A VAL 586 1 ? 1 2 1 B MET 94 . B VAL 586 . B MET 94 B VAL 586 1 ? 1 3 1 C MET 94 . C VAL 586 . C MET 94 C VAL 586 1 ? 1 4 1 D MET 94 . D VAL 586 . D MET 94 D VAL 586 1 ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 ? 2 ? 3 ? 4 ? # _struct.entry_id 5U6O _struct.title 'Structure of the human HCN1 hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated ion channel' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 5U6O _struct_keywords.text 'pacemaker ion channel, TRANSPORT PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'TRANSPORT PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP HCN1_HUMAN O60741 ? 1 ;MEGGGKPNSSSNSRDDGNSVFPAKASATGAGPAAAEKRLGTPPGGGGAGAKEHGNSVCFKVDGGGGGGGGGGGGEEPAGG FEDAEGPRRQYGFMQRQFTSMLQPGVNKFSLRMFGSQKAVEKEQERVKTAGFWIIHPYSDFRFYWDLIMLIMMVGNLVII PVGITFFTEQTTTPWIIFNVASDTVFLLDLIMNFRTGTVNEDSSEIILDPKVIKMNYLKSWFVVDFISSIPVDYIFLIVE KGMDSEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVP LLQDFPPDCWVSLNEMVNDSWGKQYSYALFKAMSHMLCIGYGAQAPVSMSDLWITMLSMIVGATCYAMFVGHATALIQSL DSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADMRQKIHDYYEHRYQGKIFDEENILNELNDPLREEIVNFNCRKLVATMPLFANAD PNFVTAMLSKLRFEVFQPGDYIIREGAVGKKMYFIQHGVAGVITKSSKEMKLTDGSYFGEICLLTKGRRTASVRADTYCR LYSLSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVAIDRLDRIGKKNSILLQKFQKDLNTGVFNNQENEILKQIVKHDREMVQA ; 1 2 UNP HCN1_HUMAN O60741 ? 1 ALPRESSSVLNTDPDAEKPRFASNL 866 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 5U6O A 1 ? 635 ? O60741 1 ? 635 ? 1 635 2 2 5U6O A 636 ? 660 ? O60741 866 ? 890 ? 636 660 3 1 5U6O B 1 ? 635 ? O60741 1 ? 635 ? 1 635 4 2 5U6O B 636 ? 660 ? O60741 866 ? 890 ? 636 660 5 1 5U6O C 1 ? 635 ? O60741 1 ? 635 ? 1 635 6 2 5U6O C 636 ? 660 ? O60741 866 ? 890 ? 636 660 7 1 5U6O D 1 ? 635 ? O60741 1 ? 635 ? 1 635 8 2 5U6O D 636 ? 660 ? O60741 866 ? 890 ? 636 660 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 MET A 94 ? GLN A 103 ? MET A 94 GLN A 103 1 ? 10 HELX_P HELX_P2 AA2 ASN A 107 ? GLY A 115 ? ASN A 107 GLY A 115 1 ? 9 HELX_P HELX_P3 AA3 SER A 116 ? LYS A 128 ? SER A 116 LYS A 128 1 ? 13 HELX_P HELX_P4 AA4 SER A 139 ? PHE A 167 ? SER A 139 PHE A 167 1 ? 29 HELX_P HELX_P5 AA5 THR A 172 ? THR A 196 ? THR A 172 THR A 196 1 ? 25 HELX_P HELX_P6 AA6 LYS A 211 ? LYS A 219 ? LYS A 211 LYS A 219 1 ? 9 HELX_P HELX_P7 AA7 TRP A 221 ? ILE A 230 ? TRP A 221 ILE A 230 1 ? 10 HELX_P HELX_P8 AA8 PRO A 231 ? GLY A 242 ? PRO A 231 GLY A 242 1 ? 12 HELX_P HELX_P9 AA9 ALA A 253 ? LEU A 265 ? ALA A 253 LEU A 265 1 ? 13 HELX_P HELX_P10 AB1 LEU A 266 ? LEU A 268 ? LEU A 266 LEU A 268 5 ? 3 HELX_P HELX_P11 AB2 LEU A 269 ? ASP A 290 ? LEU A 269 ASP A 290 1 ? 22 HELX_P HELX_P12 AB3 ALA A 292 ? GLN A 323 ? ALA A 292 GLN A 323 1 ? 32 HELX_P HELX_P13 AB4 CYS A 329 ? ASN A 334 ? CYS A 329 ASN A 334 1 ? 6 HELX_P HELX_P14 AB5 SER A 340 ? CYS A 358 ? SER A 340 CYS A 358 1 ? 19 HELX_P HELX_P15 AB6 SER A 368 ? ASP A 401 ? SER A 368 ASP A 401 1 ? 34 HELX_P HELX_P16 AB7 ASP A 401 ? LYS A 422 ? ASP A 401 LYS A 422 1 ? 22 HELX_P HELX_P17 AB8 PRO A 424 ? GLN A 440 ? PRO A 424 GLN A 440 1 ? 17 HELX_P HELX_P18 AB9 ASP A 445 ? LEU A 453 ? ASP A 445 LEU A 453 1 ? 9 HELX_P HELX_P19 AC1 ASN A 454 ? MET A 473 ? ASN A 454 MET A 473 1 ? 20 HELX_P HELX_P20 AC2 ASP A 480 ? LEU A 491 ? ASP A 480 LEU A 491 1 ? 12 HELX_P HELX_P21 AC3 VAL A 566 ? TYR A 576 ? VAL A 566 TYR A 576 1 ? 11 HELX_P HELX_P22 AC4 TYR A 576 ? THR A 585 ? TYR A 576 THR A 585 1 ? 10 HELX_P HELX_P23 AC5 GLN B 95 ? GLN B 103 ? GLN B 95 GLN B 103 1 ? 9 HELX_P HELX_P24 AC6 ASN B 107 ? GLY B 115 ? ASN B 107 GLY B 115 1 ? 9 HELX_P HELX_P25 AC7 SER B 116 ? LYS B 128 ? SER B 116 LYS B 128 1 ? 13 HELX_P HELX_P26 AC8 SER B 139 ? PHE B 167 ? SER B 139 PHE B 167 1 ? 29 HELX_P HELX_P27 AC9 THR B 172 ? THR B 196 ? THR B 172 THR B 196 1 ? 25 HELX_P HELX_P28 AD1 LYS B 211 ? LYS B 219 ? LYS B 211 LYS B 219 1 ? 9 HELX_P HELX_P29 AD2 TRP B 221 ? ILE B 230 ? 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