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EMDB EMD-6699 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2017-04-19 2 'Structure model' 1 1 2017-06-07 3 'Structure model' 1 2 2019-10-09 4 'Structure model' 1 3 2024-03-27 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Database references' 2 3 'Structure model' 'Data collection' 3 3 'Structure model' Other 4 4 'Structure model' 'Data collection' 5 4 'Structure model' 'Database references' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 3 'Structure model' atom_sites 2 3 'Structure model' cell 3 3 'Structure model' em_software 4 4 'Structure model' chem_comp_atom 5 4 'Structure model' chem_comp_bond 6 4 'Structure model' database_2 # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 3 'Structure model' '_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]' 2 3 'Structure model' '_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]' 3 3 'Structure model' '_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]' 4 3 'Structure model' '_cell.Z_PDB' 5 3 'Structure model' '_cell.length_a' 6 3 'Structure model' '_cell.length_b' 7 3 'Structure model' '_cell.length_c' 8 3 'Structure model' '_em_software.name' 9 4 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 10 4 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 5X0X _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2017-01-23 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBJ _pdbx_database_status.process_site PDBJ _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type EMDB 'Complex of Snf2-Nucleosome complex with Snf2 bound to position +6 of the nucleosome' EMD-6699 'associated EM volume' PDB . 5X0Y unspecified EMDB . EMD-6700 'other EM volume' # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Li, M.' 1 ? 'Liu, X.' 2 ? 'Xia, X.' 3 ? 'Chen, Z.' 4 ? 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;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; B,F ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MSGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK ; ;MSGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK ; C,G ? 4 'polypeptide(L)' no no ;PEPAKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRL AHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; ;PEPAKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRL AHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; D,H ? 5 polydeoxyribonucleotide no no ;(DA)(DT)(DC)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DG)(DA) (DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DG)(DT)(DC)(DG)(DT)(DA)(DG) (DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DT)(DA)(DA) 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(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DA) (DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DT)(DA) (DG)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DA)(DC)(DG)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG) (DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT) (DT)(DC)(DT)(DC)(DG)(DA)(DT) ; ;ATCGTACTTCTCGACAAGCTATCGGATGTATATATCTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAA AACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGAT TCTCGAT ; J ? 7 'polypeptide(L)' no no ;AYIKLLDQTKDTRITHLLRQTNAFLDSLTRAVKDQQKYTKEMIDSHIKEASEEVDDLSMVPKMKDEEYDDDDDNSNVDYY NVAHRIKEDIKKQPSILVGGTLKDYQIKGLQWMVSLFNNHLNGILADEMGLGKTIQTISLLTYLYEMKNIRGPYLVIVPL STLSNWSSEFAKWAPTLRTISFKGSPNERKAKQAKIRAGEFDVVLTTFEYIIKERALLSKVKWVHMIIDEGHRMKNAQSK LSLTLNTHYHADYRLILTGTPLQNNLPELWALLNFVLPKIFNSVKSFDEWFNTPFANTGGQDKIELSEEETLLVIRRLHK VLRPFLLRRLKKDVEKELPDKVEKVVKCKMSALQQIMYQQMLKYRRLFIGDQNNKKMVGLRGFNNQIMQLKKICNHPFVF 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KKEEELGVKSRLLEKSELPDIYSRDIGAELKREESESAAVYNGRGARERKTATYNDNMSEEQWLRQFEVSDDEKNDKQAR KQRTKKEDKSEAIDG ; O ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ALA n 1 3 ARG n 1 4 THR n 1 5 LYS n 1 6 GLN n 1 7 THR n 1 8 ALA n 1 9 ARG n 1 10 LYS n 1 11 SER n 1 12 THR n 1 13 GLY n 1 14 GLY n 1 15 LYS n 1 16 ALA n 1 17 PRO n 1 18 ARG n 1 19 LYS n 1 20 GLN n 1 21 LEU n 1 22 ALA n 1 23 THR n 1 24 LYS n 1 25 ALA n 1 26 ALA n 1 27 ARG n 1 28 LYS n 1 29 SER n 1 30 ALA n 1 31 PRO n 1 32 ALA n 1 33 THR n 1 34 GLY n 1 35 GLY n 1 36 VAL n 1 37 LYS n 1 38 LYS n 1 39 PRO n 1 40 HIS n 1 41 ARG n 1 42 TYR n 1 43 ARG n 1 44 PRO n 1 45 GLY n 1 46 THR n 1 47 VAL n 1 48 ALA n 1 49 LEU n 1 50 ARG n 1 51 GLU n 1 52 ILE n 1 53 ARG n 1 54 ARG n 1 55 TYR n 1 56 GLN n 1 57 LYS n 1 58 SER n 1 59 THR n 1 60 GLU n 1 61 LEU n 1 62 LEU n 1 63 ILE n 1 64 ARG n 1 65 LYS n 1 66 LEU n 1 67 PRO n 1 68 PHE n 1 69 GLN n 1 70 ARG n 1 71 LEU n 1 72 VAL n 1 73 ARG n 1 74 GLU n 1 75 ILE n 1 76 ALA n 1 77 GLN n 1 78 ASP n 1 79 PHE n 1 80 LYS n 1 81 THR n 1 82 ASP n 1 83 LEU n 1 84 ARG n 1 85 PHE n 1 86 GLN n 1 87 SER n 1 88 SER n 1 89 ALA n 1 90 VAL n 1 91 MET n 1 92 ALA n 1 93 LEU n 1 94 GLN n 1 95 GLU n 1 96 ALA n 1 97 SER n 1 98 GLU n 1 99 ALA n 1 100 TYR n 1 101 LEU n 1 102 VAL n 1 103 GLY n 1 104 LEU n 1 105 PHE n 1 106 GLU n 1 107 ASP n 1 108 THR n 1 109 ASN n 1 110 LEU n 1 111 CYS n 1 112 ALA n 1 113 ILE n 1 114 HIS n 1 115 ALA n 1 116 LYS n 1 117 ARG n 1 118 VAL n 1 119 THR n 1 120 ILE n 1 121 MET n 1 122 PRO n 1 123 LYS n 1 124 ASP n 1 125 ILE n 1 126 GLN n 1 127 LEU n 1 128 ALA n 1 129 ARG n 1 130 ARG n 1 131 ILE n 1 132 ARG n 1 133 GLY n 1 134 GLU n 1 135 ARG n 1 136 ALA n 2 1 MET n 2 2 SER n 2 3 GLY n 2 4 ARG n 2 5 GLY n 2 6 LYS n 2 7 GLY n 2 8 GLY n 2 9 LYS n 2 10 GLY n 2 11 LEU n 2 12 GLY n 2 13 LYS n 2 14 GLY n 2 15 GLY n 2 16 ALA n 2 17 LYS n 2 18 ARG n 2 19 HIS n 2 20 ARG n 2 21 LYS n 2 22 VAL n 2 23 LEU n 2 24 ARG n 2 25 ASP n 2 26 ASN n 2 27 ILE n 2 28 GLN n 2 29 GLY n 2 30 ILE n 2 31 THR n 2 32 LYS n 2 33 PRO n 2 34 ALA n 2 35 ILE n 2 36 ARG n 2 37 ARG n 2 38 LEU n 2 39 ALA n 2 40 ARG n 2 41 ARG n 2 42 GLY n 2 43 GLY n 2 44 VAL n 2 45 LYS n 2 46 ARG n 2 47 ILE n 2 48 SER n 2 49 GLY n 2 50 LEU n 2 51 ILE n 2 52 TYR n 2 53 GLU n 2 54 GLU n 2 55 THR n 2 56 ARG n 2 57 GLY n 2 58 VAL n 2 59 LEU n 2 60 LYS n 2 61 VAL n 2 62 PHE n 2 63 LEU n 2 64 GLU n 2 65 ASN n 2 66 VAL n 2 67 ILE n 2 68 ARG n 2 69 ASP n 2 70 ALA n 2 71 VAL n 2 72 THR n 2 73 TYR n 2 74 THR n 2 75 GLU n 2 76 HIS n 2 77 ALA n 2 78 LYS n 2 79 ARG n 2 80 LYS n 2 81 THR n 2 82 VAL n 2 83 THR n 2 84 ALA n 2 85 MET n 2 86 ASP n 2 87 VAL n 2 88 VAL n 2 89 TYR n 2 90 ALA n 2 91 LEU n 2 92 LYS n 2 93 ARG n 2 94 GLN n 2 95 GLY n 2 96 ARG n 2 97 THR n 2 98 LEU n 2 99 TYR n 2 100 GLY n 2 101 PHE n 2 102 GLY n 2 103 GLY n 3 1 MET n 3 2 SER n 3 3 GLY n 3 4 ARG n 3 5 GLY n 3 6 LYS n 3 7 GLN n 3 8 GLY n 3 9 GLY n 3 10 LYS n 3 11 THR n 3 12 ARG n 3 13 ALA n 3 14 LYS 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_refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.011 ? 17632 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.926 ? 25051 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 19.078 ? 12287 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.049 ? 2856 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 2163 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 5X0X _struct.title 'Complex of Snf2-Nucleosome complex with Snf2 bound to position +6 of the nucleosome' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 5X0X _struct_keywords.text 'Snf2, nucleosome, chromatin remodeling, STRUCTURAL PROTEIN-HYDROLASE-DNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'STRUCTURAL PROTEIN/HYDROLASE/DNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? K N N 7 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP H32_XENLA P84233 ? 1 ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; 1 2 UNP H4_XENLA P62799 ? 2 ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; 1 3 UNP Q6AZJ8_XENLA Q6AZJ8 ? 3 ;MSGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK ; 1 4 UNP H2B11_XENLA P02281 ? 4 ;PEPAKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKSRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRL AHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; 2 5 PDB 5X0X 5X0X ? 5 ? 1 6 PDB 5X0X 5X0X ? 6 ? 1 7 UNP SNF2_YEAST P22082 ? 7 ;AYIKLLDQTKDTRITHLLRQTNAFLDSLTRAVKDQQKYTKEMIDSHIKEASEEVDDLSMVPKMKDEEYDDDDDNSNVDYY NVAHRIKEDIKKQPSILVGGTLKDYQIKGLQWMVSLFNNHLNGILADEMGLGKTIQTISLLTYLYEMKNIRGPYLVIVPL STLSNWSSEFAKWAPTLRTISFKGSPNERKAKQAKIRAGEFDVVLTTFEYIIKERALLSKVKWVHMIIDEGHRMKNAQSK LSLTLNTHYHADYRLILTGTPLQNNLPELWALLNFVLPKIFNSVKSFDEWFNTPFANTGGQDKIELSEEETLLVIRRLHK VLRPFLLRRLKKDVEKELPDKVEKVVKCKMSALQQIMYQQMLKYRRLFIGDQNNKKMVGLRGFNNQIMQLKKICNHPFVF EEVEDQINPTRETNDDIWRVAGKFELLDRILPKLKATGHRVLIFFQMTQIMDIMEDFLRYINIKYLRLDGHTKSDERSEL LRLFNAPDSEYLCFILSTRAGGLGLNLQTADTVIIFDTDWNPHQDLQAQDRAHRIGQKNEVRILRLITTNSVEEVILERA YKKLDIDGKVIQAGKFDNKSTSEEQEALLRSLLDAEEERRKKRESGVEEEEELKDSEINEILARNDEEMAVLTRMDEDRS KKEEELGVKSRLLEKSELPDIYSRDIGAELKREESESAAVYNGRGARERKTATYNDNMSEEQWLRQFEVSDDEKNDKQAR KQRTKKEDKSEAIDG ; 666 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 5X0X A 1 ? 136 ? P84233 1 ? 136 ? 0 135 2 2 5X0X B 1 ? 103 ? P62799 1 ? 103 ? 0 102 3 3 5X0X C 1 ? 130 ? Q6AZJ8 1 ? 130 ? 0 129 4 4 5X0X D 1 ? 125 ? P02281 2 ? 126 ? -2 122 5 1 5X0X E 1 ? 136 ? P84233 1 ? 136 ? 0 135 6 2 5X0X F 1 ? 103 ? P62799 1 ? 103 ? 0 102 7 3 5X0X G 1 ? 130 ? Q6AZJ8 1 ? 130 ? 0 129 8 4 5X0X H 1 ? 125 ? P02281 2 ? 126 ? -2 122 9 5 5X0X I 1 ? 167 ? 5X0X 1 ? 167 ? 1 167 10 6 5X0X J 1 ? 167 ? 5X0X -19 ? 147 ? -19 147 11 7 5X0X O 1 ? 735 ? P22082 666 ? 1400 ? 666 1400 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 4 5X0X THR D 32 ? UNP P02281 SER 33 'see sequence details' 29 1 8 5X0X THR H 32 ? UNP P02281 SER 33 'see sequence details' 29 2 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details undecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 11 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 45 ? GLN A 56 ? GLY A 44 GLN A 55 1 ? 12 HELX_P HELX_P2 AA2 ARG A 64 ? LYS A 80 ? ARG A 63 LYS A 79 1 ? 17 HELX_P HELX_P3 AA3 GLN A 86 ? ALA A 115 ? GLN A 85 ALA A 114 1 ? 30 HELX_P HELX_P4 AA4 MET A 121 ? ARG A 132 ? MET A 120 ARG A 131 1 ? 12 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP B 25 ? ILE B 30 ? ASP B 24 ILE B 29 5 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 THR B 31 ? GLY B 43 ? THR B 30 GLY B 42 1 ? 13 HELX_P HELX_P7 AA7 LEU B 50 ? LYS B 78 ? LEU B 49 LYS B 77 1 ? 29 HELX_P HELX_P8 AA8 THR B 83 ? GLY B 95 ? THR B 82 GLY B 94 1 ? 13 HELX_P HELX_P9 AA9 THR C 17 ? ALA C 22 ? THR C 16 ALA C 21 1 ? 6 HELX_P HELX_P10 AB1 PRO C 27 ? GLY C 38 ? PRO C 26 GLY C 37 1 ? 12 HELX_P HELX_P11 AB2 ALA C 46 ? ASN C 74 ? ALA C 45 ASN C 73 1 ? 29 HELX_P HELX_P12 AB3 ILE C 80 ? ASP C 91 ? ILE C 79 ASP C 90 1 ? 12 HELX_P HELX_P13 AB4 GLU C 92 ? GLY C 99 ? GLU C 91 GLY C 98 1 ? 8 HELX_P HELX_P14 AB5 GLN C 113 ? LEU C 117 ? GLN C 112 LEU C 116 5 ? 5 HELX_P HELX_P15 AB6 TYR D 37 ? HIS D 49 ? TYR D 34 HIS D 46 1 ? 13 HELX_P HELX_P16 AB7 SER D 55 ? ASN D 84 ? SER D 52 ASN D 81 1 ? 30 HELX_P HELX_P17 AB8 THR D 90 ? LEU D 102 ? THR D 87 LEU D 99 1 ? 13 HELX_P HELX_P18 AB9 PRO D 103 ? ALA D 124 ? PRO D 100 ALA D 121 1 ? 22 HELX_P HELX_P19 AC1 GLY E 45 ? GLN E 56 ? GLY E 44 GLN E 55 1 ? 12 HELX_P HELX_P20 AC2 ARG E 64 ? LYS E 80 ? ARG E 63 LYS E 79 1 ? 17 HELX_P HELX_P21 AC3 GLN E 86 ? ALA E 115 ? GLN E 85 ALA E 114 1 ? 30 HELX_P HELX_P22 AC4 MET E 121 ? ARG E 132 ? MET E 120 ARG E 131 1 ? 12 HELX_P HELX_P23 AC5 ASP F 25 ? ILE F 30 ? ASP F 24 ILE F 29 5 ? 6 HELX_P HELX_P24 AC6 THR F 31 ? GLY F 43 ? THR F 30 GLY F 42 1 ? 13 HELX_P HELX_P25 AC7 LEU F 50 ? LYS F 78 ? LEU F 49 LYS F 77 1 ? 29 HELX_P HELX_P26 AC8 THR F 83 ? GLY F 95 ? THR F 82 GLY F 94 1 ? 13 HELX_P HELX_P27 AC9 THR G 17 ? ALA G 22 ? THR G 16 ALA G 21 1 ? 6 HELX_P HELX_P28 AD1 PRO G 27 ? GLY G 38 ? PRO G 26 GLY G 37 1 ? 12 HELX_P HELX_P29 AD2 ALA G 46 ? ASN G 74 ? ALA G 45 ASN G 73 1 ? 29 HELX_P HELX_P30 AD3 ILE G 80 ? ASP G 91 ? ILE G 79 ASP G 90 1 ? 12 HELX_P HELX_P31 AD4 GLU G 92 ? GLY G 99 ? GLU G 91 GLY G 98 1 ? 8 HELX_P HELX_P32 AD5 GLN G 113 ? LEU G 117 ? GLN G 112 LEU G 116 5 ? 5 HELX_P HELX_P33 AD6 TYR H 37 ? HIS H 49 ? TYR H 34 HIS H 46 1 ? 13 HELX_P HELX_P34 AD7 SER H 55 ? ASN H 84 ? SER H 52 ASN H 81 1 ? 30 HELX_P HELX_P35 AD8 THR H 90 ? LEU H 102 ? THR H 87 LEU H 99 1 ? 13 HELX_P HELX_P36 AD9 PRO H 103 ? ALA H 124 ? PRO H 100 ALA H 121 1 ? 22 HELX_P HELX_P37 AE1 LEU K 6 ? PHE K 24 ? LEU O 671 PHE O 689 1 ? 19 HELX_P HELX_P38 AE2 TYR K 79 ? HIS K 84 ? TYR O 744 HIS O 749 1 ? 6 HELX_P HELX_P39 AE3 LYS K 103 ? ASN K 119 ? LYS O 768 ASN O 784 1 ? 17 HELX_P HELX_P40 AE4 GLY K 132 ? GLU K 146 ? GLY O 797 GLU O 811 1 ? 15 HELX_P HELX_P41 AE5 PRO K 159 ? TRP K 173 ? PRO O 824 TRP O 838 1 ? 15 HELX_P HELX_P42 AE6 GLY K 184 ? ALA K 198 ? GLY O 849 ALA O 863 1 ? 15 HELX_P HELX_P43 AE7 PHE K 208 ? GLU K 214 ? PHE O 873 GLU O 879 1 ? 7 HELX_P HELX_P44 AE8 GLU K 214 ? VAL K 221 ? GLU O 879 VAL O 886 1 ? 8 HELX_P HELX_P45 AE9 GLU K 230 ? ASN K 236 ? GLU O 895 ASN O 901 5 ? 7 HELX_P HELX_P46 AF1 SER K 239 ? HIS K 248 ? SER O 904 HIS O 913 1 ? 10 HELX_P HELX_P47 AF2 PRO K 267 ? LEU K 277 ? PRO O 932 LEU O 942 1 ? 11 HELX_P HELX_P48 AF3 LEU K 277 ? SER K 283 ? LEU O 942 SER O 948 1 ? 7 HELX_P HELX_P49 AF4 SER K 283 ? THR K 293 ? SER O 948 THR O 958 1 ? 11 HELX_P HELX_P50 AF5 LYS K 303 ? GLU K 308 ? LYS O 968 GLU O 973 1 ? 6 HELX_P HELX_P51 AF6 GLU K 310 ? ARG K 323 ? GLU O 975 ARG O 988 1 ? 14 HELX_P HELX_P52 AF7 SER K 351 ? MET K 357 ? SER O 1016 MET O 1022 1 ? 7 HELX_P HELX_P53 AF8 GLN K 360 ? ARG K 365 ? GLN O 1025 ARG O 1030 1 ? 6 HELX_P HELX_P54 AF9 MET K 388 ? ILE K 393 ? MET O 1053 ILE O 1058 1 ? 6 HELX_P HELX_P55 AG1 GLU K 401 ? ASN K 408 ? GLU O 1066 ASN O 1073 1 ? 8 HELX_P HELX_P56 AG2 ALA K 421 ? GLY K 438 ? ALA O 1086 GLY O 1103 1 ? 18 HELX_P HELX_P57 AG3 GLN K 449 ? ASN K 462 ? GLN O 1114 ASN O 1127 1 ? 14 HELX_P HELX_P58 AG4 LYS K 473 ? ALA K 486 ? LYS O 1138 ALA O 1151 1 ? 14 HELX_P HELX_P59 AG5 SER K 497 ? GLY K 502 ? SER O 1162 GLY O 1167 1 ? 6 HELX_P HELX_P60 AG6 PRO K 522 ? ARG K 534 ? PRO O 1187 ARG O 1199 1 ? 13 HELX_P HELX_P61 AG7 SER K 551 ? SER K 580 ? SER O 1216 SER O 1245 1 ? 30 HELX_P HELX_P62 AG8 SER K 582 ? GLU K 604 ? SER O 1247 GLU O 1269 1 ? 23 HELX_P HELX_P63 AG9 LYS K 614 ? LEU K 622 ? LYS O 1279 LEU O 1287 1 ? 9 HELX_P HELX_P64 AH1 GLU K 627 ? LYS K 642 ? GLU O 1292 LYS O 1307 1 ? 16 HELX_P HELX_P65 AH2 ARG K 672 ? ARG K 684 ? ARG O 1337 ARG O 1349 1 ? 13 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role hydrog1 hydrog ? ? 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J 2 ? 20 1 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 I DC 3 1_555 J DG 165 1_555 I DG 4 1_555 J DC 164 1_555 0.608 0.361 3.528 9.978 19.481 37.124 -1.714 0.299 3.365 27.836 -14.258 42.899 1 II_DC3DG4:DC144DG145_JJ I 3 ? J 145 ? I 4 ? J 144 ? 1 I DG 4 1_555 J DC 164 1_555 I DA 5 1_555 J DT 163 1_555 -0.712 0.897 3.243 -2.532 7.604 34.555 0.325 0.787 3.401 12.593 4.193 35.445 2 II_DG4DA5:DT143DC144_JJ I 4 ? J 144 ? I 5 ? J 143 ? 1 I DA 5 1_555 J DT 163 1_555 I DG 6 1_555 J DC 162 1_555 0.360 0.900 3.103 -2.818 5.048 33.058 0.759 -1.070 3.161 8.787 4.906 33.545 3 II_DA5DG6:DC142DT143_JJ I 5 ? J 143 ? I 6 ? J 142 ? 1 I DG 6 1_555 J DC 162 1_555 I DA 7 1_555 J DT 161 1_555 -0.409 0.632 3.082 -1.283 3.116 39.736 0.585 0.459 3.132 4.574 1.884 39.873 4 II_DG6DA7:DT141DC142_JJ I 6 ? J 142 ? I 7 ? J 141 ? 1 I DA 7 1_555 J DT 161 1_555 I DA 8 1_555 J DT 160 1_555 0.309 -0.327 3.227 -3.663 1.401 35.769 -0.725 -1.011 3.167 2.272 5.942 35.976 5 II_DA7DA8:DT140DT141_JJ I 7 ? J 141 ? I 8 ? J 140 ? 1 I DA 8 1_555 J DT 160 1_555 I DT 9 1_555 J DA 159 1_555 0.294 -0.694 3.317 -3.146 -1.549 26.292 -1.098 -1.485 3.295 -3.387 6.877 26.521 6 II_DA8DT9:DA139DT140_JJ I 8 ? J 140 ? I 9 ? J 139 ? 1 I DT 9 1_555 J DA 159 1_555 I DC 10 1_555 J DG 158 1_555 0.077 -0.220 3.257 -1.966 -2.339 44.231 -0.075 -0.284 3.258 -3.101 2.607 44.331 7 II_DT9DC10:DG138DA139_JJ I 9 ? J 139 ? I 10 ? J 138 ? 1 I DC 10 1_555 J DG 158 1_555 I DC 11 1_555 J DG 157 1_555 -0.044 -0.112 3.366 -1.105 -1.131 37.182 -0.021 -0.081 3.367 -1.772 1.732 37.214 8 II_DC10DC11:DG137DG138_JJ I 10 ? J 138 ? I 11 ? J 137 ? 1 I DC 11 1_555 J DG 157 1_555 I DC 12 1_555 J DG 156 1_555 0.055 -0.300 3.224 -0.941 1.379 31.972 -0.789 -0.267 3.206 2.502 1.706 32.015 9 II_DC11DC12:DG136DG137_JJ I 11 ? J 137 ? I 12 ? J 136 ? 1 I DC 12 1_555 J DG 156 1_555 I DG 13 1_555 J DC 155 1_555 0.220 0.046 3.031 -0.462 4.288 30.684 -0.681 -0.495 3.006 8.053 0.868 30.978 10 II_DC12DG13:DC135DG136_JJ I 12 ? J 136 ? I 13 ? J 135 ? 1 I DG 13 1_555 J DC 155 1_555 I DG 14 1_555 J DC 154 1_555 0.432 -0.566 3.180 0.701 -0.549 34.389 -0.873 -0.624 3.197 -0.928 -1.185 34.400 11 II_DG13DG14:DC134DC135_JJ I 13 ? J 135 ? I 14 ? J 134 ? 1 I DG 14 1_555 J DC 154 1_555 I DT 15 1_555 J DA 153 1_555 -0.162 -1.096 3.219 6.028 -0.030 31.495 -1.979 1.356 3.136 -0.055 -10.980 32.053 12 II_DG14DT15:DA133DC134_JJ I 14 ? J 134 ? I 15 ? J 133 ? 1 I DT 15 1_555 J DA 153 1_555 I DG 16 1_555 J DC 152 1_555 0.605 0.466 4.422 15.973 12.687 39.404 -1.067 1.319 4.302 17.469 -21.994 44.184 13 II_DT15DG16:DC132DA133_JJ I 15 ? J 133 ? I 16 ? J 132 ? 1 I DG 16 1_555 J DC 152 1_555 I DC 17 1_555 J DG 151 1_555 -0.255 0.310 2.814 -4.328 -0.808 29.399 0.752 -0.288 2.813 -1.580 8.467 29.720 14 II_DG16DC17:DG131DC132_JJ I 16 ? J 132 ? I 17 ? J 131 ? 1 I DC 17 1_555 J DG 151 1_555 I DC 18 1_555 J DG 150 1_555 0.064 1.927 3.946 -5.670 0.875 44.349 2.437 -0.711 3.945 1.154 7.475 44.700 15 II_DC17DC18:DG130DG131_JJ I 17 ? J 131 ? I 18 ? J 130 ? 1 I DC 18 1_555 J DG 150 1_555 I DG 19 1_555 J DC 149 1_555 -0.248 1.567 3.251 3.834 -10.237 37.591 3.488 0.799 2.711 -15.490 -5.801 39.093 16 II_DC18DG19:DC129DG130_JJ I 18 ? J 130 ? I 19 ? 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