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'ATCC 204508 / S288c' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 1 747 ;Baker's yeast ; 'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' 559292 ? ? 'ATCC 204508 / S288c' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP ATR_YEAST P38111 ? 1 ;MESHVKYLDELILAIKDLNSGVDSKVQIKKVPTDPSSSQEYAKSLKILNTLIRNLKDQRRNNIMKNDTIFSKTVSALALL LEYNPFLLVMKDSNGNFEIQRLIDDFLNISVLNYDNYHRIWFMRRKLGSWCKACVEFYGKPAKFQLTAHFENTMNLYEQA LTEVLLGKTELLKFYDTLKGLYILLYWFTSEYSTFGNSIAFLDSSLGFTKFDFNFQRLIRIVLYVFDSCELAALEYAEIQ LKYISLVVDYVCNRTISTALDAPALVCCEQLKFVLTTMHHFLDNKYGLLDNDPTMAKGILRLYSLCISNDFSKCFVDHFP IDQWADFSQSEHFPFTQLTNKALSIVYFDLKRRSLPVEALKYDNKFNIWVYQSEPDSSLKNVTSPFDDRYKQLEKLRLLV LKKFNKTERGTLLKYRVNQLSPGFFQRAGNDFKLILNEASVSIQTCFKTNNITRLTSWTVILGRLACLESEKFSGTLPNS TKDMDNWYVCHLCDIEKTGNPFVRINPNRPEAAGKSEIFRILHSNFLSHPNIDEFSESLLSGILFSLHRIFSHFQPPKLT DGNGQINKSFKLVQKCFMNSNRYLRLLSTRIIPLFNISDSHNSEDEHTATLIKFLQSQKLPVVKENLVIAWTQLTLTTSN DVFDTLLLKLIDIFNSDDYSLRIMMTLQIKNMAKILKKTPYQLLSPILPVLLRQLGKNLVERKVGFQNLIELLGYSSKTI LDIFQRYIIPYAIIQYKSDVLSEIAKIMCDGDTSLINQMKVNLLKKNSRQIFAVALVKHGLFSLDILETLFLNRAPTFDK GYITAYLPDYKTLAEITKLYKNSVTKDASDSENANMILCSLRFLITNFEKDKRHGSKYKNINNWTDDQEQAFQKKLQDNI LGIFQVFSSDIHDVEGRTTYYEKLRVINGISFLIIYAPKKSIISALAQISICLQTGLGLKEVRYEAFRCWHLLVRHLNDE ELSTVIDSLIAFILQKWSEFNGKLRNIVYSILDTLIKEKSDLILKLKPYTTLALVGKPELGILARDGQFARMVNKIRSTT DLIPIFANNLKSSNKYVINQNLDDIEVYLRRKQTERSIDFTPKKVGQTSDITLVLGALLDTSHKFRNLDKDLCEKCAKCI SMIGVLDVTKHEFKRTTYSENEVYDLNDSVQTIKFLIWVINDILVPAFWQSENPSKQLFVALVIQESLKYCGLSSESWDM NHKELYPNEAKLWEKFNSVSKTTIYPLLSSLYLAQSWKEYVPLKYPSNNFKEGYKIWVKRFTLDLLKTGTTENHPLHVFS SLIREDDGSLSNFLLPYISLDIIIKAEKGTPYADILNGIIIEFDSIFTCNLEGMNNLQVDSLRMCYESIFRVFEYCKKWA TEFKQNYSKLHGTFIIKDTKTTNMLLRIDEFLRTTPSDLLAQRSLETDSFERSALYLEQCYRQNPHDKNQNGQLLKNLQI TYEEIGDIDSLDGVLRTFATGNLVSKIEELQYSENWKLAQDCFNVLGKFSDDPKTTTRMLKSMYDHQLYSQIISNSSFHS SDGKISLSPDVKEWYSIGLEAANLEGNVQTLKNWVEQIESLRNIDDREVLLQYNIAKALIAISNEDPLRTQKYIHNSFRL IGTNFITSSKETTLLKKQNLLMKLHSLYDLSFLSSAKDKFEYKSNTTILDYRMERIGADFVPNHYILSMRKSFDQLKMNE QADADLGKTFFTLAQLARNNARLDIASESLMHCLERRLPQAELEFAEILWKQGENDRALKIVQEIHEKYQENSSVNARDR AAVLLKFTEWLDLSNNSASEQIIKQYQDIFQIDSKWDKPYYSIGLYYSRLLERKKAEGYITNGRFEYRAISYFLLAFEKN TAKVRENLPKVITFWLDIAAASISEAPGNRKEMLSKATEDICSHVEEALQHCPTYIWYFVLTQLLSRLLHSHQSSAQIIM HILLSLAVEYPSHILWYITALVNSNSSKRVLRGKHILEKYRQHSQNPHDLVSSALDLTKALTRVCLQDVKSITSRSGKSL EKDFKFDMNVAPSAMVVPVRKNLDIISPLESNSMRGYQPFRPVVSIIRFGSSYKVFSSLKKPKQLNIIGSDGNIYGIMCK KEDVRQDNQYMQFATTMDFLLSKDIASRKRSLGINIYSVLSLREDCGILEMVPNVVTLRSILSTKYESLKIKYSLKSLHD RWQHTAVDGKLEFYMEQVDKFPPILYQWFLENFPDPINWFNARNTYARSYAVMAMVGHILGLGDRHCENILLDIQTGKVL HVDFDCLFEKGKRLPVPEIVPFRLTPNLLDALGIIGTEGTFKKSSEVTLALMRKNEVALMNVIETIMYDRNMDHSIQKAL KVLRNKIRGIDPQDGLVLSVAGQTETLIQEATSEDNLSKMYIGWLPFW ; 1 2 UNP LCD1_YEAST Q04377 ? 2 ;MRRETVGEFSSDDDDDILLELGTRPPRFTQIPPSSAALQTQIPTTLEVTTTTLNNKQSKNDNQLVNQLNKAQGEASMLRD KINFLNIEREKEKNIQAVKVNELQVKHLQELAKLKQELQKLEDEKKFLQMEARGKSKREVITNVKPPSTTLSTNTNTITP DSSSVAIEAKPQSPQSKKRKISDNLLKKNMVPLNPNRIIPDETSLFLESILLHQIIGADLSTIEILNRLKLDYITEFKFK NFVIAKGAPIGKSIVSLLLRCKKTLTLDRFIDTLLEDIAVLIKEISVHPNESKLAVPFLVALMYQIVQFRPSATHNLALK DCFLFICDLIRIYHHVLKVPIHESNMNLHVEPQIFQYELIDYLIISYSFDLLEGILRVLQSHPKQTYMEFFDENILKSFE FVYKLALTISYKPMVNVIFSAVEVVNIITSIILNMDNSSDLKSLISGSWWRDCITRLYALLEKEIKSGDVYNENVDTTTL HMSKYHDFFGLIRNIGDNELGGLISKLIYTDRLQSVPRVISKEDIGMDSDKFTAPIIGYKMEKWLLKLKDEVLNIFENLL MIYGDDATIVNGEMLIHSSKFLSREQALMIERYVGQDSPNLDLRCHLIEHTLTIIYRLWKDHFKQLREEQIKQVESQLIM SLWRFLVCQTETVTANEREMRDHRHLVDSLHDLTIKDQASYYEDAFEDLPEYIEEELKMQLNKRTGRIMQVKYDEKFQEM ARTILESKSFDLTTLEEADSLYISMGL ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 5X6O C 1 ? 2368 ? P38111 1 ? 2368 ? 1 2368 2 2 5X6O G 1 ? 747 ? Q04377 1 ? 747 ? 1 747 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 5X6O _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.B_iso_max ? _refine.B_iso_mean ? _refine.B_iso_min ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.details ? _refine.diff_density_max ? _refine.diff_density_max_esd ? _refine.diff_density_min ? _refine.diff_density_min_esd ? _refine.diff_density_rms ? _refine.diff_density_rms_esd ? _refine.entry_id 5X6O _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.ls_abs_structure_details ? _refine.ls_abs_structure_Flack ? _refine.ls_abs_structure_Flack_esd ? _refine.ls_abs_structure_Rogers ? _refine.ls_abs_structure_Rogers_esd ? _refine.ls_d_res_high 3.90 _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_extinction_coef ? _refine.ls_extinction_coef_esd ? _refine.ls_extinction_expression ? _refine.ls_extinction_method ? _refine.ls_goodness_of_fit_all ? _refine.ls_goodness_of_fit_all_esd ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs_esd ? _refine.ls_hydrogen_treatment ? _refine.ls_matrix_type ? _refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_work ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? 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_struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 5X6O _struct_keywords.text 'ATR/Mec1, Kinase, Dimeric, TRANSFERASE, TRANSFERASE-DNA BINDING PROTEIN complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'TRANSFERASE/DNA BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ALA A 237 ? ARG A 254 ? ALA C 237 ARG C 254 1 ? 18 HELX_P HELX_P2 AA2 CYS A 267 ? LYS A 285 ? CYS C 267 LYS C 285 1 ? 19 HELX_P HELX_P3 AA3 THR A 294 ? ILE A 307 ? THR C 294 ILE C 307 1 ? 14 HELX_P HELX_P4 AA4 PHE A 311 ? PHE A 319 ? PHE C 311 PHE C 319 1 ? 9 HELX_P HELX_P5 AA5 PRO A 320 ? TRP A 324 ? PRO C 320 TRP C 324 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 AA6 ALA A 342 ? 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