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'ATCC 204508 / S288c' ? ? ? ? ? ? 204508 ? ? ? ? ? ? ? 8 1 sample 1 753 ;Baker's yeast ; 'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' 559292 ? ? 'ATCC 204508 / S288c' ? ? ? ? ? ? 204508 ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 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P33332 1 ? 1336 ? 1 1336 2 2 5YFP B 1 ? 971 ? P89102 1 ? 971 ? 1 971 3 3 5YFP C 1 ? 805 ? P32844 1 ? 805 ? 1 805 4 4 5YFP D 1 ? 1065 ? P32855 1 ? 1065 ? 1 1065 5 5 5YFP E 1 ? 871 ? Q06245 1 ? 871 ? 1 871 6 6 5YFP F 1 ? 910 ? P22224 1 ? 910 ? 1 910 7 7 5YFP G 1 ? 623 ? P19658 1 ? 623 ? 1 623 8 8 5YFP H 1 ? 753 ? P38261 1 ? 753 ? 1 753 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H # loop_ _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 1 1 'gel filtration' ;The elution position of the exocyst complex is around 1MD, and SDS-PAGE of the gel filtration fractions shows that all subunits are present in a similar ratio. ; 2 1 microscopy 'Both negative staining and Cryo microscope analysis show that the exocyst complex is well folded and properly assembled.' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLU A 625 ? LEU A 631 ? GLU A 625 LEU A 631 1 ? 7 HELX_P HELX_P2 AA2 GLU A 639 ? LEU A 664 ? GLU A 639 LEU A 664 1 ? 26 HELX_P HELX_P3 AA3 SER A 666 ? ARG A 675 ? SER A 666 ARG A 675 1 ? 10 HELX_P HELX_P4 AA4 ARG A 675 ? SER A 711 ? ARG A 675 SER A 711 1 ? 37 HELX_P HELX_P5 AA5 GLU A 741 ? GLN A 746 ? GLU A 741 GLN A 746 1 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 ASN A 762 ? ALA A 773 ? ASN A 762 ALA A 773 1 ? 12 HELX_P HELX_P7 AA7 ILE A 788 ? LEU A 791 ? ILE A 788 LEU A 791 5 ? 4 HELX_P HELX_P8 AA8 LYS A 792 ? GLY A 822 ? LYS A 792 GLY A 822 1 ? 31 HELX_P HELX_P9 AA9 MET A 830 ? LEU A 838 ? MET A 830 LEU A 838 1 ? 9 HELX_P HELX_P10 AB1 ILE A 839 ? LEU A 845 ? ILE A 839 LEU A 845 1 ? 7 HELX_P HELX_P11 AB2 SER A 854 ? GLU A 860 ? SER A 854 GLU A 860 1 ? 7 HELX_P HELX_P12 AB3 ASN A 861 ? ILE A 866 ? ASN A 861 ILE A 866 1 ? 6 HELX_P HELX_P13 AB4 GLN A 867 ? SER A 879 ? GLN A 867 SER A 879 1 ? 13 HELX_P HELX_P14 AB5 PHE A 923 ? GLU A 928 ? PHE A 923 GLU A 928 1 ? 6 HELX_P HELX_P15 AB6 GLN A 931 ? GLU A 936 ? 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VAL A 1300 TYR A 1307 1 ? 8 HELX_P HELX_P29 AD2 THR A 1308 ? ILE A 1310 ? THR A 1308 ILE A 1310 5 ? 3 HELX_P HELX_P30 AD3 LEU B 11 ? TYR B 15 ? LEU B 11 TYR B 15 5 ? 5 HELX_P HELX_P31 AD4 LEU B 71 ? GLU B 87 ? LEU B 71 GLU B 87 1 ? 17 HELX_P HELX_P32 AD5 ASN B 131 ? VAL B 151 ? ASN B 131 VAL B 151 1 ? 21 HELX_P HELX_P33 AD6 PHE B 155 ? GLU B 171 ? PHE B 155 GLU B 171 1 ? 17 HELX_P HELX_P34 AD7 VAL B 192 ? LYS B 197 ? VAL B 192 LYS B 197 1 ? 6 HELX_P HELX_P35 AD8 ASP B 200 ? LYS B 211 ? ASP B 200 LYS B 211 1 ? 12 HELX_P HELX_P36 AD9 LYS B 211 ? GLU B 231 ? LYS B 211 GLU B 231 1 ? 21 HELX_P HELX_P37 AE1 ASN B 238 ? LEU B 247 ? ASN B 238 LEU B 247 1 ? 10 HELX_P HELX_P38 AE2 GLU B 258 ? ARG B 267 ? GLU B 258 ARG B 267 1 ? 10 HELX_P HELX_P39 AE3 ARG B 268 ? SER B 273 ? ARG B 268 SER B 273 1 ? 6 HELX_P HELX_P40 AE4 GLN B 277 ? ASN B 305 ? GLN B 277 ASN B 305 1 ? 29 HELX_P HELX_P41 AE5 ILE B 310 ? ILE B 331 ? ILE B 310 ILE B 331 1 ? 22 HELX_P HELX_P42 AE6 ILE B 354 ? ARG B 385 ? ILE B 354 ARG B 385 1 ? 32 HELX_P HELX_P43 AE7 GLU B 402 ? LEU B 407 ? GLU B 402 LEU B 407 1 ? 6 HELX_P HELX_P44 AE8 GLN B 411 ? THR B 419 ? GLN B 411 THR B 419 5 ? 9 HELX_P HELX_P45 AE9 SER B 458 ? ASP B 494 ? SER B 458 ASP B 494 1 ? 37 HELX_P HELX_P46 AF1 GLN B 498 ? LYS B 505 ? GLN B 498 LYS B 505 1 ? 8 HELX_P HELX_P47 AF2 LYS B 528 ? LEU B 550 ? LYS B 528 LEU B 550 1 ? 23 HELX_P HELX_P48 AF3 LEU B 595 ? LEU B 618 ? LEU B 595 LEU B 618 1 ? 24 HELX_P HELX_P49 AF4 GLY B 624 ? SER B 652 ? GLY B 624 SER B 652 1 ? 29 HELX_P HELX_P50 AF5 THR B 686 ? THR B 693 ? THR B 686 THR B 693 1 ? 8 HELX_P HELX_P51 AF6 SER B 694 ? LEU B 706 ? SER B 694 LEU B 706 1 ? 13 HELX_P HELX_P52 AF7 LEU B 707 ? ALA B 709 ? LEU B 707 ALA B 709 5 ? 3 HELX_P HELX_P53 AF8 PRO B 725 ? LYS B 754 ? PRO B 725 LYS B 754 1 ? 30 HELX_P HELX_P54 AF9 THR B 764 ? ARG B 775 ? THR B 764 ARG B 775 1 ? 12 HELX_P HELX_P55 AG1 CYS B 777 ? GLN B 784 ? CYS B 777 GLN B 784 1 ? 8 HELX_P HELX_P56 AG2 TYR B 785 ? ASP B 787 ? TYR B 785 ASP B 787 5 ? 3 HELX_P HELX_P57 AG3 LEU B 799 ? ASP B 826 ? LEU B 799 ASP B 826 1 ? 28 HELX_P HELX_P58 AG4 THR B 827 ? PHE B 832 ? THR B 827 PHE B 832 1 ? 6 HELX_P HELX_P59 AG5 GLY B 848 ? CYS B 865 ? GLY B 848 CYS B 865 1 ? 18 HELX_P HELX_P60 AG6 HIS B 874 ? ALA B 891 ? HIS B 874 ALA B 891 1 ? 18 HELX_P HELX_P61 AG7 GLN B 906 ? MET B 918 ? GLN B 906 MET B 918 1 ? 13 HELX_P HELX_P62 AG8 LYS B 924 ? GLN B 935 ? LYS B 924 GLN B 935 1 ? 12 HELX_P HELX_P63 AG9 THR B 942 ? ILE B 952 ? THR B 942 ILE B 952 1 ? 11 HELX_P HELX_P64 AH1 ILE B 952 ? LEU B 960 ? ILE B 952 LEU B 960 1 ? 9 HELX_P HELX_P65 AH2 GLN B 966 ? SER B 971 ? GLN B 966 SER B 971 5 ? 6 HELX_P HELX_P66 AH3 SER C 3 ? ASP C 11 ? SER C 3 ASP C 11 1 ? 9 HELX_P HELX_P67 AH4 SER C 18 ? SER C 67 ? SER C 18 SER C 67 1 ? 50 HELX_P HELX_P68 AH5 GLN C 70 ? LEU C 78 ? GLN C 70 LEU C 78 1 ? 9 HELX_P HELX_P69 AH6 ILE C 91 ? THR C 96 ? ILE C 91 THR C 96 1 ? 6 HELX_P HELX_P70 AH7 GLU C 100 ? THR C 104 ? GLU C 100 THR C 104 5 ? 5 HELX_P HELX_P71 AH8 THR C 105 ? GLU C 123 ? THR C 105 GLU C 123 1 ? 19 HELX_P HELX_P72 AH9 LEU C 142 ? ARG C 153 ? LEU C 142 ARG C 153 1 ? 12 HELX_P HELX_P73 AI1 LEU C 177 ? SER C 182 ? LEU C 177 SER C 182 1 ? 6 HELX_P HELX_P74 AI2 ASP C 189 ? VAL C 200 ? ASP C 189 VAL C 200 1 ? 12 HELX_P HELX_P75 AI3 GLU C 201 ? ARG C 204 ? GLU C 201 ARG C 204 5 ? 4 HELX_P HELX_P76 AI4 LEU C 210 ? ILE C 235 ? LEU C 210 ILE C 235 1 ? 26 HELX_P HELX_P77 AI5 ASN C 299 ? SER C 304 ? ASN C 299 SER C 304 1 ? 6 HELX_P HELX_P78 AI6 MET C 308 ? ARG C 313 ? MET C 308 ARG C 313 1 ? 6 HELX_P HELX_P79 AI7 ASP C 323 ? CYS C 346 ? ASP C 323 CYS C 346 1 ? 24 HELX_P HELX_P80 AI8 PHE C 353 ? ILE C 368 ? PHE C 353 ILE C 368 1 ? 16 HELX_P HELX_P81 AI9 GLU C 377 ? ILE C 379 ? GLU C 377 ILE C 379 5 ? 3 HELX_P HELX_P82 AJ1 ILE C 380 ? LEU C 395 ? ILE C 380 LEU C 395 1 ? 16 HELX_P HELX_P83 AJ2 GLU C 414 ? LEU C 446 ? GLU C 414 LEU C 446 1 ? 33 HELX_P HELX_P84 AJ3 ASP C 463 ? VAL C 476 ? ASP C 463 VAL C 476 1 ? 14 HELX_P HELX_P85 AJ4 VAL C 478 ? ASN C 483 ? VAL C 478 ASN C 483 1 ? 6 HELX_P HELX_P86 AJ5 VAL C 489 ? ILE C 526 ? VAL C 489 ILE C 526 1 ? 38 HELX_P HELX_P87 AJ6 GLY C 540 ? GLY C 567 ? GLY C 540 GLY C 567 1 ? 28 HELX_P HELX_P88 AJ7 SER C 571 ? ASN C 580 ? SER C 571 ASN C 580 1 ? 10 HELX_P HELX_P89 AJ8 HIS C 581 ? GLU C 583 ? HIS C 581 GLU C 583 5 ? 3 HELX_P HELX_P90 AJ9 GLY C 584 ? PHE C 589 ? GLY C 584 PHE C 589 1 ? 6 HELX_P HELX_P91 AK1 ALA C 590 ? ASP C 606 ? ALA C 590 ASP C 606 1 ? 17 HELX_P HELX_P92 AK2 LYS C 610 ? ILE C 615 ? LYS C 610 ILE C 615 1 ? 6 HELX_P HELX_P93 AK3 SER C 617 ? GLY C 623 ? SER C 617 GLY C 623 1 ? 7 HELX_P HELX_P94 AK4 SER C 624 ? LEU C 637 ? SER C 624 LEU C 637 1 ? 14 HELX_P HELX_P95 AK5 ILE C 640 ? MET C 644 ? ILE C 640 MET C 644 5 ? 5 HELX_P HELX_P96 AK6 ASN C 645 ? LYS C 663 ? ASN C 645 LYS C 663 1 ? 19 HELX_P HELX_P97 AK7 ASN C 676 ? ASN C 678 ? ASN C 676 ASN C 678 5 ? 3 HELX_P HELX_P98 AK8 ASN C 679 ? PHE C 692 ? 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PRO 1081 A 1 15.20 22 ILE 1106 A . ? ILE 1106 A LYS 1107 A ? LYS 1107 A 1 -2.31 23 THR 1109 A . ? THR 1109 A ASP 1110 A ? ASP 1110 A 1 -5.99 24 GLU 1111 A . ? GLU 1111 A GLY 1112 A ? GLY 1112 A 1 -10.11 25 ILE 1116 A . ? ILE 1116 A GLU 1117 A ? GLU 1117 A 1 12.22 26 ASP 1210 A . ? ASP 1210 A THR 1211 A ? THR 1211 A 1 -0.54 27 THR 1211 A . ? THR 1211 A MET 1212 A ? MET 1212 A 1 -28.81 28 THR 1256 A . ? THR 1256 A SER 1257 A ? SER 1257 A 1 0.26 29 HIS 1278 A . ? HIS 1278 A GLN 1279 A ? GLN 1279 A 1 18.80 30 ARG 3 B . ? ARG 3 B PHE 4 B ? PHE 4 B 1 6.48 31 GLN 5 B . ? GLN 5 B ILE 6 B ? ILE 6 B 1 6.86 32 THR 19 B . ? THR 19 B ILE 20 B ? ILE 20 B 1 1.84 33 ASN 21 B . ? ASN 21 B PRO 22 B ? PRO 22 B 1 -7.80 34 TRP 26 B . ? TRP 26 B ALA 27 B ? ALA 27 B 1 -13.08 35 SER 67 B . ? SER 67 B ARG 68 B ? ARG 68 B 1 -3.93 36 GLN 93 B . ? GLN 93 B HIS 94 B ? HIS 94 B 1 11.44 37 VAL 106 B . ? VAL 106 B ASN 107 B ? ASN 107 B 1 -3.49 38 LYS 122 B . ? LYS 122 B GLN 123 B ? GLN 123 B 1 -3.82 39 ASN 177 B . ? ASN 177 B GLU 178 B ? GLU 178 B 1 -4.21 40 GLU 178 B . ? GLU 178 B LYS 179 B ? LYS 179 B 1 -13.44 41 CYS 182 B . ? CYS 182 B ASP 183 B ? ASP 183 B 1 -18.77 42 ASN 188 B . ? ASN 188 B GLN 189 B ? GLN 189 B 1 7.68 43 ASN 250 B . ? ASN 250 B ASP 251 B ? ASP 251 B 1 2.89 44 PHE 252 B . ? PHE 252 B ASN 253 B ? ASN 253 B 1 9.27 45 ALA 275 B . ? ALA 275 B SER 276 B ? SER 276 B 1 -2.23 46 LYS 343 B . ? LYS 343 B ASN 344 B ? ASN 344 B 1 7.71 47 ASN 344 B . ? ASN 344 B THR 345 B ? THR 345 B 1 -9.38 48 THR 345 B . ? THR 345 B THR 346 B ? THR 346 B 1 7.44 49 THR 346 B . ? THR 346 B SER 347 B ? SER 347 B 1 -7.76 50 ASN 390 B . ? ASN 390 B ASN 391 B ? ASN 391 B 1 6.89 51 LYS 396 B . ? LYS 396 B SER 397 B ? SER 397 B 1 21.97 52 SER 397 B . ? SER 397 B GLN 398 B ? GLN 398 B 1 -8.41 53 LYS 421 B . ? LYS 421 B ASP 422 B ? ASP 422 B 1 15.10 54 TYR 443 B . ? TYR 443 B LEU 444 B ? LEU 444 B 1 10.56 55 ASN 447 B . ? ASN 447 B CYS 448 B ? CYS 448 B 1 -24.53 56 THR 496 B . ? THR 496 B TYR 497 B ? TYR 497 B 1 16.06 57 ASN 509 B . ? ASN 509 B ILE 510 B ? ILE 510 B 1 4.39 58 ILE 510 B . ? ILE 510 B LEU 511 B ? LEU 511 B 1 18.55 59 GLY 513 B . ? GLY 513 B ASP 514 B ? ASP 514 B 1 6.28 60 SER 520 B . ? SER 520 B TYR 521 B ? TYR 521 B 1 -8.79 61 TYR 521 B . ? TYR 521 B GLN 522 B ? GLN 522 B 1 -24.66 62 LYS 523 B . ? LYS 523 B SER 524 B ? SER 524 B 1 -2.99 63 PHE 554 B . ? PHE 554 B THR 555 B ? THR 555 B 1 -12.28 64 LEU 565 B . ? LEU 565 B LYS 566 B ? LYS 566 B 1 -3.43 65 SER 575 B . ? SER 575 B ASN 576 B ? ASN 576 B 1 17.85 66 ASP 578 B . ? ASP 578 B SER 579 B ? SER 579 B 1 -11.07 67 PRO 582 B . ? PRO 582 B LEU 583 B ? LEU 583 B 1 -14.38 68 TYR 585 B . ? TYR 585 B GLY 586 B ? GLY 586 B 1 27.54 69 ILE 620 B . ? ILE 620 B THR 621 B ? THR 621 B 1 -7.18 70 LEU 679 B . ? LEU 679 B THR 680 B ? THR 680 B 1 -23.64 71 GLU 682 B . ? GLU 682 B TYR 683 B ? TYR 683 B 1 -22.04 72 PRO 714 B . ? PRO 714 B ILE 715 B ? ILE 715 B 1 22.84 73 ILE 715 B . ? ILE 715 B ILE 716 B ? ILE 716 B 1 9.00 74 LYS 754 B . ? LYS 754 B ASP 755 B ? ASP 755 B 1 -19.07 75 ASN 758 B . ? ASN 758 B PRO 759 B ? PRO 759 B 1 13.46 76 LEU 794 B . ? LEU 794 B ALA 795 B ? ALA 795 B 1 -3.51 77 PHE 845 B . ? PHE 845 B ARG 846 B ? ARG 846 B 1 -5.79 78 ASN 901 B . ? ASN 901 B ASP 902 B ? ASP 902 B 1 -8.02 79 ARG 962 B . ? ARG 962 B THR 963 B ? THR 963 B 1 13.32 80 ALA 131 C . ? ALA 131 C GLU 132 C ? GLU 132 C 1 6.59 81 THR 137 C . ? THR 137 C GLY 138 C ? GLY 138 C 1 -0.18 82 GLU 206 C . ? GLU 206 C GLN 207 C ? GLN 207 C 1 -15.41 83 GLN 207 C . ? GLN 207 C ILE 208 C ? ILE 208 C 1 8.89 84 LEU 250 C . ? LEU 250 C PRO 251 C ? PRO 251 C 1 -6.64 85 SER 253 C . ? SER 253 C LYS 254 C ? LYS 254 C 1 -3.28 86 ASN 255 C . ? ASN 255 C THR 256 C ? THR 256 C 1 11.28 87 ARG 258 C . ? ARG 258 C LEU 259 C ? LEU 259 C 1 1.04 88 GLU 262 C . ? GLU 262 C THR 263 C ? THR 263 C 1 -0.82 89 THR 263 C . ? THR 263 C PRO 264 C ? PRO 264 C 1 1.25 90 LYS 265 C . ? LYS 265 C VAL 266 C ? VAL 266 C 1 3.89 91 ILE 267 C . ? 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? -142.56 43.15 175 1 TRP C 350 ? ? 60.58 66.29 176 1 ASN C 351 ? ? 60.32 65.81 177 1 LYS C 413 ? ? 66.37 -3.96 178 1 PRO C 452 ? ? -71.88 -165.33 179 1 HIS C 453 ? ? -39.62 123.61 180 1 LEU C 459 ? ? -103.57 43.39 181 1 PHE C 469 ? ? -58.79 -70.87 182 1 ASP C 525 ? ? -144.79 17.10 183 1 ASP C 527 ? ? 69.95 81.51 184 1 PRO C 528 ? ? -61.95 10.06 185 1 PHE C 616 ? ? 71.42 -3.24 186 1 LEU C 637 ? ? -103.82 57.21 187 1 ALA C 667 ? ? -96.00 39.28 188 1 LYS C 675 ? ? -91.72 50.63 189 1 ASN C 678 ? ? 58.32 19.09 190 1 ASN C 679 ? ? 59.36 13.98 191 1 PRO C 727 ? ? -74.33 -164.47 192 1 SER C 730 ? ? -140.69 17.24 193 1 VAL C 741 ? ? -120.89 -53.16 194 1 THR C 793 ? ? -144.95 -151.70 195 1 MET C 795 ? ? -97.44 35.45 196 1 PHE C 798 ? ? -95.70 58.39 197 1 SER D 31 ? ? 67.99 -4.90 198 1 ASN D 55 ? ? 59.13 75.12 199 1 LEU D 64 ? ? -101.15 -61.11 200 1 ASP D 65 ? ? -123.57 -50.01 201 1 LEU D 89 ? ? -88.76 30.03 202 1 HIS D 96 ? ? -67.23 -78.37 203 1 SER D 97 ? ? 21.23 34.49 204 1 THR D 136 ? ? -127.16 -163.49 205 1 ASP D 138 ? ? 85.59 -6.75 206 1 ASN D 175 ? ? -94.45 32.06 207 1 LEU D 200 ? ? -149.36 -156.52 208 1 THR D 202 ? ? -55.69 170.64 209 1 VAL D 203 ? ? -31.07 -28.83 210 1 LEU D 206 ? ? 83.38 5.70 211 1 ILE D 228 ? ? -78.90 -72.50 212 1 HIS D 229 ? ? -96.75 47.20 213 1 LYS D 235 ? ? -162.86 -162.81 214 1 ASN D 237 ? ? -85.80 -156.80 215 1 ARG D 243 ? ? 57.58 73.02 216 1 THR D 245 ? ? -62.48 80.30 217 1 ASN D 247 ? ? 55.29 73.86 218 1 ILE D 253 ? ? -122.75 -69.18 219 1 SER D 254 ? ? -164.36 114.60 220 1 HIS D 257 ? ? -94.12 -63.59 221 1 ASN D 258 ? ? 36.39 49.35 222 1 PHE D 260 ? ? -89.26 -159.75 223 1 THR D 261 ? ? 77.50 -28.24 224 1 SER D 262 ? ? -147.39 -44.22 225 1 ASN D 320 ? ? 58.89 70.51 226 1 ALA D 350 ? ? -61.72 -71.10 227 1 LEU D 373 ? ? -39.07 134.21 228 1 LYS D 374 ? ? 76.62 30.94 229 1 ALA D 376 ? ? -40.47 109.26 230 1 THR D 377 ? ? 65.32 -6.73 231 1 ASN D 383 ? ? 57.41 14.31 232 1 HIS D 384 ? ? -93.07 56.52 233 1 ILE D 392 ? ? -123.92 -65.40 234 1 PRO D 427 ? ? -101.26 76.57 235 1 SER D 429 ? ? -162.79 115.35 236 1 ALA D 431 ? ? -95.03 36.26 237 1 ASN D 457 ? ? -93.71 38.72 238 1 GLU D 460 ? ? -143.38 -11.49 239 1 SER D 463 ? ? 66.23 -6.94 240 1 SER D 464 ? ? 33.13 47.19 241 1 PHE D 518 ? ? -76.49 -71.60 242 1 SER D 549 ? ? -64.59 -74.94 243 1 ASN D 552 ? ? -121.46 -69.16 244 1 MET D 553 ? ? 175.81 -162.71 245 1 LYS D 554 ? ? -87.33 48.51 246 1 VAL D 571 ? ? -38.41 108.04 247 1 THR D 579 ? ? -160.33 -166.74 248 1 SER D 582 ? ? 60.99 73.69 249 1 PHE D 585 ? ? 57.87 81.40 250 1 PHE D 586 ? ? 65.71 77.70 251 1 ASP D 587 ? ? -97.90 -80.26 252 1 ASP D 588 ? ? 56.64 -15.68 253 1 TYR D 589 ? ? -132.66 -40.85 254 1 GLU D 609 ? ? -140.51 36.90 255 1 GLU D 611 ? ? 63.43 -3.85 256 1 TYR D 616 ? ? -172.11 147.51 257 1 GLU D 619 ? ? 59.49 81.06 258 1 LEU D 620 ? ? -39.97 -32.83 259 1 ASP D 622 ? ? -161.22 -162.98 260 1 HIS D 625 ? ? 25.11 58.72 261 1 THR D 647 ? ? 71.65 -13.87 262 1 ALA D 648 ? ? 59.11 -27.09 263 1 PHE D 651 ? ? -175.20 138.03 264 1 ARG D 683 ? ? 31.62 60.37 265 1 THR D 712 ? ? -96.67 47.85 266 1 LYS D 737 ? ? -137.17 -157.95 267 1 SER D 738 ? ? -74.11 -152.78 268 1 ASP D 739 ? ? 65.83 76.98 269 1 LEU D 740 ? ? 82.55 -0.16 270 1 ALA D 769 ? ? -78.63 23.31 271 1 MET D 780 ? ? -143.63 -14.90 272 1 ALA D 783 ? ? -34.38 147.36 273 1 ASP D 784 ? ? -121.65 -60.68 274 1 ARG D 787 ? ? 72.19 -13.07 275 1 SER D 788 ? ? -140.76 -41.82 276 1 SER D 789 ? ? 67.22 -7.17 277 1 THR D 791 ? ? 38.41 35.41 278 1 MET D 796 ? ? 56.91 -31.27 279 1 ASP D 797 ? ? -165.44 93.34 280 1 TYR D 800 ? ? -36.42 103.86 281 1 SER D 805 ? ? 37.42 44.12 282 1 SER D 806 ? ? -153.65 64.16 283 1 SER D 809 ? ? 71.67 -11.42 284 1 LEU D 810 ? ? 65.05 -8.51 285 1 LEU D 813 ? ? -126.54 -58.34 286 1 ASP D 819 ? ? 65.50 -1.18 287 1 THR D 862 ? ? 59.57 70.35 288 1 ASN D 866 ? ? 69.82 -21.04 289 1 MET D 867 ? ? 176.52 167.11 290 1 ASP D 868 ? ? -143.25 38.75 291 1 SER D 871 ? ? 61.00 71.62 292 1 LEU D 874 ? ? -140.34 17.08 293 1 ASP D 875 ? ? 58.84 71.92 294 1 GLN D 876 ? ? -38.39 -36.62 295 1 ILE D 923 ? ? -124.05 -70.90 296 1 LYS D 924 ? ? -173.09 -171.11 297 1 LYS D 979 ? ? 71.45 -2.62 298 1 LEU D 983 ? ? 62.81 78.97 299 1 PRO D 984 ? ? -66.02 77.58 300 1 HIS D 985 ? ? -116.69 53.81 301 1 LEU D 1007 ? ? -103.02 -168.52 302 1 ASN D 1057 ? ? -94.67 31.10 303 1 ALA D 1058 ? ? -103.41 56.33 304 1 THR D 1061 ? ? 67.45 -5.43 305 1 ASP E 8 ? ? -141.93 52.83 306 1 LEU E 24 ? ? -144.55 12.41 307 1 ASN E 27 ? ? 76.35 -6.21 308 1 HIS E 37 ? ? 58.46 73.00 309 1 ASN E 39 ? ? 73.60 -3.54 310 1 THR E 52 ? ? -85.34 -157.62 311 1 ASN E 53 ? ? -39.18 145.55 312 1 GLU E 54 ? ? -55.99 -7.89 313 1 GLN E 57 ? ? -124.33 -52.59 314 1 ASP E 58 ? ? 66.00 -5.58 315 1 PHE E 98 ? ? -78.82 -157.89 316 1 SER E 99 ? ? -59.88 2.10 317 1 LYS E 153 ? ? -87.96 49.93 318 1 LEU E 185 ? ? 71.24 -8.18 319 1 LYS E 190 ? ? -162.65 -152.36 320 1 LEU E 191 ? ? -66.27 93.80 321 1 LEU E 209 ? ? -66.17 -70.66 322 1 GLU E 210 ? ? -125.75 -53.24 323 1 SER E 213 ? ? 56.42 71.95 324 1 ILE E 214 ? ? -62.75 -179.99 325 1 PRO E 215 ? ? -59.99 -1.73 326 1 ARG E 244 ? ? 64.75 -7.19 327 1 GLU E 245 ? ? -141.25 -14.41 328 1 SER E 270 ? ? -89.91 45.74 329 1 ASN E 309 ? ? -78.60 -163.64 330 1 SER E 311 ? ? -148.84 -155.03 331 1 ILE E 313 ? ? -38.11 137.42 332 1 SER E 317 ? ? 63.28 -7.48 333 1 SER E 375 ? ? -161.16 -168.29 334 1 GLN E 411 ? ? -80.00 -157.64 335 1 PHE E 436 ? ? -122.46 -50.18 336 1 ASN E 463 ? ? -162.01 -166.06 337 1 LEU E 468 ? ? 67.90 -3.45 338 1 ASN E 560 ? ? -123.66 -68.45 339 1 SER E 561 ? ? -171.87 -179.81 340 1 SER E 564 ? ? 62.46 80.99 341 1 ALA E 566 ? ? 59.22 72.84 342 1 ASN E 567 ? ? -144.03 35.04 343 1 LEU E 570 ? ? 73.71 -3.81 344 1 ASP E 612 ? ? -130.88 -36.71 345 1 ILE E 617 ? ? -128.34 -57.08 346 1 LYS E 628 ? ? -92.84 46.24 347 1 ASN E 669 ? ? -83.05 -71.24 348 1 LYS E 754 ? ? -34.96 117.84 349 1 ASP E 811 ? ? -130.18 -31.92 350 1 GLU E 831 ? ? -93.48 -60.13 351 1 SER E 849 ? ? -98.15 39.08 352 1 ARG E 854 ? ? -173.48 -175.62 353 1 PHE E 857 ? ? -81.26 -71.28 354 1 ASN E 858 ? ? -148.43 32.74 355 1 HIS E 859 ? ? 60.30 77.14 356 1 ASP E 860 ? ? 68.15 88.22 357 1 ASN E 861 ? ? 75.44 64.99 358 1 ASN E 864 ? ? -96.73 36.39 359 1 ASP F 52 ? ? 55.71 73.90 360 1 PHE F 54 ? ? 29.79 62.69 361 1 ASP F 55 ? ? -59.24 -0.53 362 1 LEU F 56 ? ? 75.15 -11.20 363 1 ASP F 102 ? ? -97.64 34.39 364 1 LYS F 190 ? ? -122.42 -52.42 365 1 ASN F 211 ? ? -91.56 49.21 366 1 ASN F 213 ? ? -91.52 30.72 367 1 ASN F 241 ? ? 72.04 -11.00 368 1 LYS F 276 ? ? 58.74 -0.28 369 1 MET F 277 ? ? -141.35 -23.02 370 1 LEU F 279 ? ? -79.34 -71.03 371 1 PHE F 284 ? ? -146.97 -157.72 372 1 GLN F 308 ? ? -140.14 13.80 373 1 LEU F 343 ? ? -121.92 -69.39 374 1 MET F 344 ? ? 55.67 -9.68 375 1 TYR F 345 ? ? -171.74 74.27 376 1 PRO F 346 ? ? -38.58 131.23 377 1 LYS F 350 ? ? -82.43 49.95 378 1 LEU F 387 ? ? -92.03 51.68 379 1 LYS F 411 ? ? -69.15 99.08 380 1 GLU F 414 ? ? -92.26 50.22 381 1 PHE F 415 ? ? -130.89 -38.89 382 1 ASP F 419 ? ? -65.60 92.71 383 1 ASN F 421 ? ? -152.01 85.67 384 1 TYR F 422 ? ? -130.45 -39.41 385 1 ASP F 445 ? ? 64.75 -0.27 386 1 LEU F 448 ? ? -86.31 36.47 387 1 LYS F 449 ? ? -141.32 46.12 388 1 GLU F 451 ? ? -62.33 1.60 389 1 GLU F 452 ? ? -74.70 -145.18 390 1 ASP F 453 ? ? -55.46 11.03 391 1 ILE F 475 ? ? -123.25 -67.16 392 1 ASP F 498 ? ? -49.16 -14.92 393 1 PHE F 510 ? ? -69.74 92.24 394 1 ASP F 517 ? ? 61.29 73.08 395 1 HIS F 581 ? ? -101.46 51.98 396 1 GLU F 582 ? ? -95.71 -62.77 397 1 ASN F 588 ? ? -79.02 -152.35 398 1 ILE F 589 ? ? -42.42 -17.74 399 1 ASN F 599 ? ? -64.99 99.69 400 1 ASP F 600 ? ? -33.96 119.45 401 1 VAL F 602 ? ? -53.26 -9.48 402 1 SER F 612 ? ? -69.15 96.07 403 1 ALA F 619 ? ? 67.80 -6.17 404 1 ARG F 641 ? ? -97.56 -69.60 405 1 GLU F 642 ? ? -171.65 -174.39 406 1 ASN F 643 ? ? 56.25 75.87 407 1 ILE F 644 ? ? -28.13 -55.31 408 1 MET F 650 ? ? -172.19 144.52 409 1 GLU F 651 ? ? -146.63 32.50 410 1 SER F 724 ? ? -75.91 -146.91 411 1 VAL F 725 ? ? -38.47 -16.72 412 1 HIS F 747 ? ? -67.69 -72.37 413 1 ASP F 748 ? ? -161.84 107.44 414 1 THR F 754 ? ? -166.80 -168.58 415 1 GLU F 824 ? ? -140.10 16.52 416 1 LEU F 825 ? ? -98.98 36.85 417 1 LYS F 826 ? ? -96.51 36.13 418 1 GLN F 827 ? ? -90.68 -60.59 419 1 LEU F 832 ? ? -140.92 -12.57 420 1 LYS F 837 ? ? -141.91 18.70 421 1 ASP F 856 ? ? -94.95 31.47 422 1 SER F 862 ? ? -95.32 -60.80 423 1 ASP F 877 ? ? -94.56 57.86 424 1 ILE F 887 ? ? -120.55 -50.07 425 1 ASP G 6 ? ? -92.55 32.60 426 1 ASN G 69 ? ? -98.90 37.24 427 1 ALA G 72 ? ? -42.39 150.30 428 1 PHE G 189 ? ? -93.71 30.27 429 1 LYS G 228 ? ? -143.80 35.47 430 1 ASN G 229 ? ? -62.33 -70.91 431 1 ALA G 230 ? ? -78.18 -83.95 432 1 SER G 296 ? ? 65.84 -2.78 433 1 PHE G 301 ? ? 58.03 70.32 434 1 TYR G 385 ? ? -98.27 37.70 435 1 ASN G 395 ? ? 60.28 62.60 436 1 ASP G 422 ? ? -129.11 -169.51 437 1 LEU H 257 ? ? -130.37 -40.84 438 1 ARG H 309 ? ? -89.94 46.68 439 1 LEU H 315 ? ? 94.18 9.93 440 1 GLN H 336 ? ? 56.17 87.22 441 1 LYS H 337 ? ? -30.81 152.85 442 1 PHE H 338 ? ? 63.19 66.28 443 1 ASN H 340 ? ? -68.91 65.72 444 1 LEU H 365 ? ? -100.32 -168.78 445 1 LYS H 382 ? ? -94.58 52.60 446 1 ARG H 384 ? ? -97.97 34.11 447 1 ASN H 388 ? ? 48.15 25.02 448 1 ASP H 389 ? ? -125.86 -53.07 449 1 PHE H 390 ? ? -140.40 47.02 450 1 GLN H 405 ? ? -93.44 34.49 451 1 VAL H 453 ? ? -130.72 -74.16 452 1 GLU H 454 ? ? 64.95 -25.03 453 1 GLU H 455 ? ? -148.58 -6.44 454 1 LEU H 468 ? ? -101.41 -65.68 455 1 SER H 470 ? ? -154.90 81.77 456 1 THR H 471 ? ? -175.41 126.49 457 1 GLN H 472 ? ? -137.91 -42.24 458 1 GLN H 473 ? ? 60.04 65.82 459 1 ARG H 481 ? ? -141.14 43.10 460 1 SER H 482 ? ? -72.40 -73.55 461 1 PRO H 483 ? ? -94.84 52.53 462 1 LEU H 645 ? ? -65.38 5.48 463 1 PHE H 679 ? ? -98.31 43.87 464 1 LEU H 682 ? ? -98.35 55.99 # loop_ _pdbx_validate_peptide_omega.id _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_model_num _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.omega 1 1 GLU A 749 ? ? CYS A 750 ? ? 140.36 2 1 GLU A 780 ? ? VAL A 781 ? ? -149.56 3 1 VAL A 946 ? ? PHE A 947 ? ? 143.83 4 1 PHE A 947 ? ? PHE A 948 ? ? 127.62 5 1 PHE A 948 ? ? HIS A 949 ? ? -31.11 6 1 ASN A 955 ? ? PHE A 956 ? ? -35.62 7 1 ASP A 967 ? ? ALA A 968 ? ? -36.11 8 1 GLU A 1034 ? ? SER A 1035 ? ? 149.20 9 1 GLU A 1039 ? ? PHE A 1040 ? ? -149.32 10 1 VAL A 1064 ? ? LEU A 1065 ? ? -141.26 11 1 GLU A 1117 ? ? LEU A 1118 ? ? 147.89 12 1 SER B 184 ? ? PRO B 185 ? ? 147.89 13 1 GLU B 187 ? ? ASN B 188 ? ? 38.93 14 1 TYR B 236 ? ? PHE B 237 ? ? 147.60 15 1 ASP B 251 ? ? PHE B 252 ? ? 146.71 16 1 ARG B 268 ? ? PHE B 269 ? ? 149.76 17 1 SER B 347 ? ? SER B 348 ? ? 109.64 18 1 SER B 348 ? ? SER B 349 ? ? -123.11 19 1 SER B 349 ? ? ASN B 350 ? ? 136.87 20 1 ASN B 350 ? ? GLU B 351 ? ? 144.71 21 1 ILE B 354 ? ? LEU B 355 ? ? 143.59 22 1 LEU B 407 ? ? LYS B 408 ? ? -145.78 23 1 GLN B 411 ? ? LEU B 412 ? ? 142.08 24 1 ASP B 418 ? ? THR B 419 ? ? 146.40 25 1 VAL B 430 ? ? GLU B 431 ? ? 146.46 26 1 VAL B 435 ? ? ASN B 436 ? ? -147.04 27 1 SER B 442 ? ? TYR B 443 ? ? 135.88 28 1 CYS B 448 ? ? GLN B 449 ? ? -143.14 29 1 GLN B 453 ? ? GLY B 454 ? ? 138.75 30 1 GLY B 454 ? ? LEU B 455 ? ? -136.43 31 1 LYS B 507 ? ? GLU B 508 ? ? -145.88 32 1 GLU B 519 ? ? SER B 520 ? ? -148.03 33 1 SER B 524 ? ? LEU B 525 ? ? 146.76 34 1 SER B 557 ? ? GLN B 558 ? ? -144.95 35 1 SER B 559 ? ? SER B 560 ? ? 136.43 36 1 LYS B 577 ? ? ASP B 578 ? ? -147.63 37 1 GLY B 580 ? ? SER B 581 ? ? -149.88 38 1 SER B 581 ? ? PRO B 582 ? ? -126.59 39 1 PRO B 589 ? ? PRO B 590 ? ? -142.23 40 1 ASN B 591 ? ? CYS B 592 ? ? -134.94 41 1 CYS B 592 ? ? ASN B 593 ? ? 141.39 42 1 VAL B 666 ? ? THR B 667 ? ? -141.69 43 1 THR B 703 ? ? ARG B 704 ? ? 149.03 44 1 GLU B 711 ? ? LYS B 712 ? ? -32.28 45 1 ALA B 753 ? ? LYS B 754 ? ? 135.63 46 1 ASN B 761 ? ? SER B 762 ? ? 114.80 47 1 HIS B 763 ? ? THR B 764 ? ? 140.47 48 1 ASP B 788 ? ? ALA B 789 ? ? 119.95 49 1 GLU B 791 ? ? TRP B 792 ? ? 133.31 50 1 TRP B 792 ? ? ASN B 793 ? ? 135.16 51 1 ILE B 873 ? ? HIS B 874 ? ? 143.53 52 1 GLN B 939 ? ? ASN B 940 ? ? -39.61 53 1 LEU C 12 ? ? ILE C 13 ? ? 147.44 54 1 ILE C 13 ? ? LYS C 14 ? ? 148.31 55 1 ILE C 284 ? ? SER C 285 ? ? -34.00 56 1 LYS C 294 ? ? HIS C 295 ? ? 149.68 57 1 ASP C 319 ? ? GLN C 320 ? ? 140.07 58 1 HIS C 453 ? ? SER C 454 ? ? -147.06 59 1 SER C 454 ? ? ASP C 455 ? ? 144.56 60 1 LEU C 603 ? ? MET C 604 ? ? 146.85 61 1 HIS D 96 ? ? SER D 97 ? ? 123.33 62 1 THR D 137 ? ? ASP D 138 ? ? -133.06 63 1 ASP D 138 ? ? LYS D 139 ? ? 141.17 64 1 GLY D 140 ? ? SER D 141 ? ? 143.36 65 1 LEU D 142 ? ? GLN D 143 ? ? 149.42 66 1 THR D 202 ? ? VAL D 203 ? ? -137.86 67 1 LYS D 235 ? ? SER D 236 ? ? 148.43 68 1 VAL D 244 ? ? THR D 245 ? ? -131.90 69 1 ASP D 248 ? ? ILE D 249 ? ? -139.20 70 1 PHE D 250 ? ? LYS D 251 ? ? 33.86 71 1 THR D 261 ? ? SER D 262 ? ? 103.63 72 1 SER D 262 ? ? LEU D 263 ? ? 147.52 73 1 VAL D 271 ? ? ASN D 272 ? ? 30.54 74 1 ILE D 273 ? ? ASP D 274 ? ? 38.88 75 1 LEU D 373 ? ? LYS D 374 ? ? -136.28 76 1 MET D 375 ? ? ALA D 376 ? ? -127.32 77 1 THR D 377 ? ? SER D 378 ? ? -146.62 78 1 ASN D 383 ? ? HIS D 384 ? ? 147.08 79 1 VAL D 389 ? ? GLN D 390 ? ? -43.54 80 1 GLU D 420 ? ? MET D 421 ? ? -146.87 81 1 ASN D 438 ? ? LYS D 439 ? ? 148.87 82 1 GLU D 460 ? ? LEU D 461 ? ? -143.32 83 1 SER D 549 ? ? VAL D 550 ? ? 138.65 84 1 PHE D 551 ? ? ASN D 552 ? ? 148.17 85 1 MET D 553 ? ? LYS D 554 ? ? 144.74 86 1 ILE D 570 ? ? VAL D 571 ? ? -137.77 87 1 VAL D 571 ? ? PRO D 572 ? ? -143.05 88 1 PHE D 585 ? ? PHE D 586 ? ? -147.98 89 1 ASN D 624 ? ? HIS D 625 ? ? 130.54 90 1 HIS D 625 ? ? ASN D 626 ? ? 35.48 91 1 PHE D 651 ? ? ARG D 652 ? ? 148.09 92 1 ASP D 682 ? ? ARG D 683 ? ? 137.07 93 1 LEU D 707 ? ? ASN D 708 ? ? 115.35 94 1 ALA D 731 ? ? GLY D 732 ? ? -36.23 95 1 LEU D 781 ? ? ASP D 782 ? ? -34.68 96 1 ARG D 787 ? ? SER D 788 ? ? 149.23 97 1 PHE D 792 ? ? SER D 793 ? ? -31.22 98 1 ASN D 799 ? ? TYR D 800 ? ? -108.51 99 1 ASN D 802 ? ? PRO D 803 ? ? 148.39 100 1 ASN D 812 ? ? LEU D 813 ? ? -36.38 101 1 LEU D 817 ? ? ASP D 818 ? ? 148.62 102 1 LYS D 863 ? ? ILE D 864 ? ? -145.71 103 1 ASN D 1057 ? ? ALA D 1058 ? ? 148.63 104 1 LEU E 24 ? ? THR E 25 ? ? -147.79 105 1 ASP E 36 ? ? HIS E 37 ? ? 141.82 106 1 ILE E 179 ? ? VAL E 180 ? ? -149.05 107 1 GLU E 315 ? ? THR E 316 ? ? 35.64 108 1 SER E 564 ? ? PRO E 565 ? ? 31.05 109 1 LEU E 753 ? ? LYS E 754 ? ? -131.44 110 1 VAL F 53 ? ? PHE F 54 ? ? 133.21 111 1 ASN F 75 ? ? GLN F 76 ? ? 37.76 112 1 THR F 280 ? ? ASN F 281 ? ? -36.27 113 1 GLU F 295 ? ? SER F 296 ? ? 144.96 114 1 TYR F 345 ? ? PRO F 346 ? ? -129.58 115 1 ASN F 410 ? ? LYS F 411 ? ? 149.43 116 1 PHE F 415 ? ? ILE F 416 ? ? -33.21 117 1 ILE F 444 ? ? ASP F 445 ? ? 30.02 118 1 ASP F 445 ? ? GLU F 446 ? ? 147.99 119 1 ASN F 599 ? ? ASP F 600 ? ? -128.56 120 1 ASP F 600 ? ? ILE F 601 ? ? -132.96 121 1 ILE F 601 ? ? VAL F 602 ? ? -129.19 122 1 ASN F 643 ? ? ILE F 644 ? ? -105.66 123 1 LEU G 153 ? ? ASN G 154 ? ? 149.19 124 1 GLU G 175 ? ? ASP G 176 ? ? -143.92 125 1 HIS G 190 ? ? GLY G 191 ? ? 149.65 126 1 ALA G 230 ? ? PRO G 231 ? ? 139.62 127 1 ASP G 259 ? ? LEU G 260 ? ? -146.61 128 1 TYR G 261 ? ? SER G 262 ? ? 137.43 129 1 SER G 262 ? ? GLN G 263 ? ? -145.89 130 1 ASN G 300 ? ? PHE G 301 ? ? -33.51 131 1 LYS G 317 ? ? SER G 318 ? ? -143.36 132 1 VAL H 314 ? ? LEU H 315 ? ? -121.09 133 1 LEU H 315 ? ? ILE H 316 ? ? 136.57 134 1 GLN H 336 ? ? LYS H 337 ? ? -142.19 135 1 LYS H 337 ? ? PHE H 338 ? ? -126.56 136 1 PHE H 338 ? ? ILE H 339 ? ? 30.30 137 1 ILE H 339 ? ? ASN H 340 ? ? -144.05 138 1 LEU H 348 ? ? MET H 349 ? ? -140.23 139 1 GLN H 387 ? ? ASN H 388 ? ? 35.42 140 1 GLU H 454 ? ? GLU H 455 ? ? 148.85 141 1 SER H 470 ? ? THR H 471 ? ? 145.84 142 1 ASN H 652 ? ? PRO H 653 ? ? -136.97 143 1 GLN H 708 ? ? LEU H 709 ? ? 146.91 # loop_ _em_3d_fitting.entry_id _em_3d_fitting.id _em_3d_fitting.details _em_3d_fitting.overall_b_value _em_3d_fitting.ref_protocol _em_3d_fitting.ref_space _em_3d_fitting.target_criteria _em_3d_fitting.method 5YFP 1 ;Exo70 (a.a.67-623) was first fit into the map with Situs as a rigid body. Then it was split as Exo70 (a.a.67-344) and Exo70 (a.a.345-623), and fit into the same position with Chimera. ; ? 'RIGID BODY FIT' REAL ? ? 5YFP 2 'Well fit by one step Situs fitting.' ? 'RIGID BODY FIT' REAL ? ? 5YFP 3 'The fitting position of this chain was determined by cross-link mass spectrum.' ? 'RIGID BODY FIT' REAL ? ? 5YFP 4 ;The yeast Sec10 (a.a.234-867) model was first obtained with Swiss-Model prediction based on this zebrafish originated initial model, and then fit into the map. Local adjustment was made with Coot. Final refinement was proceeded with Phenix real-space refinement. ; ? 'RIGID BODY FIT' REAL ? ? 5YFP 5 ;The yeast Exo84 (a.a.346-470) model was first obtained with PHYRE2 prediction based on this rat originated initial model, and then fit into the map. Final refinement was proceeded with Phenix real-space refinement. ; ? 'RIGID BODY FIT' REAL ? ? 5YFP 6 ;The yeast Sec15 (a.a.482-896) model was first obtained with PHYRE2 prediction based on this Drosophila originated initial model, and then fit into the map. Local adjustment was made with Coot. Final refinement was proceeded with Phenix real-space refinement. ; ? 'RIGID BODY FIT' REAL ? ? 5YFP 7 ;All remaining models were manually built as backbone tracing Poly-Alanine, yet the present residues are shown as original. The backbone trace was guided by the EM map connectivity, secondary structure prediction and cross-link mass spectrum. The model was validated with different sets of cross-link mass spectrum data to confirmed the correctness. ; ? 'BACKBONE TRACE' REAL ? ? # loop_ _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id _em_3d_fitting_list.id _em_3d_fitting_list.details _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id _em_3d_fitting_list.chain_id _em_3d_fitting_list.chain_residue_range _em_3d_fitting_list.source_name _em_3d_fitting_list.type _em_3d_fitting_list.accession_code 1 1 ? A 67-623 2B1E 1 ? ? PDB 'experimental model' 2B1E 2 2 ? A 525-753 2D2S 2 ? ? PDB 'experimental model' 2D2S 3 3 ? A 411-805 2FJI 3 ? ? PDB 'experimental model' 2FJI 4 4 ? A 195-708 5H11 4 ? ? PDB 'experimental model' 5H11 5 5 ? B 171-283 1ZC4 5 ? ? PDB 'experimental model' 1ZC4 6 6 ? X 383-699 2A2F 6 ? ? PDB 'experimental model' 2A2F 7 7 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 5YFP _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm 'FOURIER SPACE' _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages 1 _em_3d_reconstruction.num_particles 343342 _em_3d_reconstruction.resolution 4.4 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details 'Solutions were freshly prepared from stock and filtered with 0.22um membrane to avoid microbial contamination.' _em_buffer.pH 7.4 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.source _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.entity_id_list _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.oligomeric_details 1 0 'overall map of Yeast Exocyst complex' 'Cryo-EM map of the Yeast Exocyst complex overall structure at 5.5A resolution' NATURAL COMPLEX '1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8' ? ? 2 1 'Map acquired from mask refinement against the head-part of the overall Yeast Exocyst complex map' 'Cryo-EM map of the yeast Exocyst complex head-part structure at 6.7A resolution' NATURAL COMPLEX '1, 2, 3, 4' ? ? 3 1 'Map acquired from mask refinement against the top part of the Yeast Exocyst complex head-part map' 'Cryo-EM map of the yeast Exocyst complex top head-part structure at 6.2A resolution' NATURAL COMPLEX '1, 2, 3, 4' ? ? 4 1 'Map acquired from mask refinement against the bottom leg-part of the overall Yeast Exocyst complex map' 'Cryo-EM map of the yeast Exocyst complex bottom leg-part structure at 4.6A resolution' NATURAL COMPLEX '5, 6, 7, 8' ? ? 5 1 'Map acquired from mask refinement against the body-part of the overall Yeast Exocyst complex map' 'Cryo-EM map of the yeast Exocyst complex body-part structure at 4.4A resolution' NATURAL COMPLEX '1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8' ? ? 6 1 ;The mask was generated by relion_image_handler against the overall final half map. The threshold was set to 0.0046, extending binary map with 6 pixels and a soft-edge of 6 pixels was added. ; 'Cryo-EM map mask for the Yeast Exocyst complex overall structure at 5.5A resolution' NATURAL COMPLEX '1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8' ? ? 7 1 ;The mask was made by relion_image_handler against the head part of overall final half map. Map threshold was set to 0.0046, extending binary map with 6 pixels and a soft-edge of 6 pixels was applied. ; 'Cryo-EM map mask for the Yeast Exocyst complex head structure at 6.7A resolution' NATURAL COMPLEX '1, 2, 3, 4' ? ? 8 1 ;The mask was made by relion_image_handler against the top head part of the head masked final half map. Map threshold was set to 0.0046, extending binary map with 6 pixels and a soft-edge of 6 pixels was applied. ; 'Cryo-EM map mask for the yeast Exocyst complex top head-part structure at 6.2A resolution' NATURAL COMPLEX '1, 2, 3, 4' ? ? 9 1 ;The mask was made by relion_image_handler against the bottom leg part of overall final half map. Map threshold was set to 0.0046, extending binary map with 6 pixels and a soft-edge of 6 pixels was applied. ; 'Cryo-EM map mask for the yeast Exocyst complex bottom leg-part structure at 4.6A resolution' NATURAL COMPLEX '5, 6, 7, 8' ? ? 10 1 ;The mask was made by relion_image_handler against the body part of the overall final half map. Map threshold was set to 0.0046, extending binary map with 6 pixels and a soft-edge of 6 pixels was applied. ; 'Cryo-EM map mask for the yeast Exocyst complex body-part structure at 4.4A resolution' NATURAL COMPLEX '1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8' ? ? # _em_image_scans.entry_id 5YFP _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.dimension_height 3710 _em_image_scans.dimension_width 3838 _em_image_scans.frames_per_image 32 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.sampling_size 5 _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.used_frames_per_image 0-31 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 5YFP _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure 'COMA FREE' _em_imaging.c2_aperture_diameter 70 _em_imaging.calibrated_defocus_max 3200 _em_imaging.calibrated_defocus_min 1800 _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_max 3000 _em_imaging.nominal_defocus_min 2000 _em_imaging.nominal_magnification 22500 _em_imaging.recording_temperature_maximum 123 _em_imaging.recording_temperature_minimum 113 _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details ;Purchased Quantifoil R1.2/1.3 gold grid was directly glow discharged 60 seconds before use. Before glow discharge, the sample chamber was vacuumed by an air bump for 2 minutes. ; _em_sample_support.grid_material GOLD _em_sample_support.grid_mesh_size 300 _em_sample_support.grid_type 'Quantifoil R1.2/1.3' _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature 301 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details ;Protein sample was applied onto a Quantifoil R1.2/1.3 golden grid and hold for 60 seconds, then blot for 2.5 seconds before plunging. ; _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.entry_id 5YFP _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 5YFP _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 5YFP _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET 1 ? A MET 1 2 1 Y 1 A ARG 2 ? A ARG 2 3 1 Y 1 A SER 3 ? A SER 3 4 1 Y 1 A SER 4 ? A SER 4 5 1 Y 1 A LYS 5 ? A LYS 5 6 1 Y 1 A SER 6 ? A SER 6 7 1 Y 1 A PRO 7 ? A PRO 7 8 1 Y 1 A PHE 8 ? A PHE 8 9 1 Y 1 A LYS 9 ? A LYS 9 10 1 Y 1 A ARG 10 ? A ARG 10 11 1 Y 1 A LYS 11 ? A LYS 11 12 1 Y 1 A SER 12 ? A SER 12 13 1 Y 1 A HIS 13 ? A HIS 13 14 1 Y 1 A SER 14 ? A SER 14 15 1 Y 1 A ARG 15 ? A ARG 15 16 1 Y 1 A GLU 16 ? A GLU 16 17 1 Y 1 A THR 17 ? A THR 17 18 1 Y 1 A SER 18 ? A SER 18 19 1 Y 1 A HIS 19 ? A HIS 19 20 1 Y 1 A ASP 20 ? A ASP 20 21 1 Y 1 A GLU 21 ? A GLU 21 22 1 Y 1 A ASN 22 ? A ASN 22 23 1 Y 1 A THR 23 ? A THR 23 24 1 Y 1 A SER 24 ? A SER 24 25 1 Y 1 A PHE 25 ? A PHE 25 26 1 Y 1 A PHE 26 ? A PHE 26 27 1 Y 1 A HIS 27 ? A HIS 27 28 1 Y 1 A LYS 28 ? A LYS 28 29 1 Y 1 A ARG 29 ? A ARG 29 30 1 Y 1 A THR 30 ? A THR 30 31 1 Y 1 A ILE 31 ? A ILE 31 32 1 Y 1 A SER 32 ? A SER 32 33 1 Y 1 A GLY 33 ? A GLY 33 34 1 Y 1 A SER 34 ? A SER 34 35 1 Y 1 A SER 35 ? A SER 35 36 1 Y 1 A ALA 36 ? A ALA 36 37 1 Y 1 A HIS 37 ? A HIS 37 38 1 Y 1 A HIS 38 ? A HIS 38 39 1 Y 1 A SER 39 ? A SER 39 40 1 Y 1 A ARG 40 ? A ARG 40 41 1 Y 1 A ASN 41 ? A ASN 41 42 1 Y 1 A VAL 42 ? A VAL 42 43 1 Y 1 A SER 43 ? A SER 43 44 1 Y 1 A GLN 44 ? A GLN 44 45 1 Y 1 A GLY 45 ? A GLY 45 46 1 Y 1 A ALA 46 ? A ALA 46 47 1 Y 1 A VAL 47 ? A VAL 47 48 1 Y 1 A PRO 48 ? A PRO 48 49 1 Y 1 A SER 49 ? A SER 49 50 1 Y 1 A SER 50 ? A SER 50 51 1 Y 1 A ALA 51 ? A ALA 51 52 1 Y 1 A PRO 52 ? A PRO 52 53 1 Y 1 A PRO 53 ? A PRO 53 54 1 Y 1 A VAL 54 ? A VAL 54 55 1 Y 1 A SER 55 ? A SER 55 56 1 Y 1 A GLY 56 ? A GLY 56 57 1 Y 1 A GLY 57 ? A GLY 57 58 1 Y 1 A ASN 58 ? A ASN 58 59 1 Y 1 A TYR 59 ? A TYR 59 60 1 Y 1 A SER 60 ? A SER 60 61 1 Y 1 A HIS 61 ? A HIS 61 62 1 Y 1 A LYS 62 ? A LYS 62 63 1 Y 1 A ARG 63 ? A ARG 63 64 1 Y 1 A ASN 64 ? A ASN 64 65 1 Y 1 A VAL 65 ? A VAL 65 66 1 Y 1 A SER 66 ? A SER 66 67 1 Y 1 A ARG 67 ? A ARG 67 68 1 Y 1 A ALA 68 ? A ALA 68 69 1 Y 1 A SER 69 ? A SER 69 70 1 Y 1 A ASN 70 ? A ASN 70 71 1 Y 1 A SER 71 ? A SER 71 72 1 Y 1 A SER 72 ? A SER 72 73 1 Y 1 A GLN 73 ? A GLN 73 74 1 Y 1 A THR 74 ? A THR 74 75 1 Y 1 A SER 75 ? A SER 75 76 1 Y 1 A ASN 76 ? A ASN 76 77 1 Y 1 A PHE 77 ? A PHE 77 78 1 Y 1 A LEU 78 ? A LEU 78 79 1 Y 1 A ALA 79 ? A ALA 79 80 1 Y 1 A GLU 80 ? A GLU 80 81 1 Y 1 A GLN 81 ? A GLN 81 82 1 Y 1 A TYR 82 ? A TYR 82 83 1 Y 1 A GLU 83 ? A GLU 83 84 1 Y 1 A ARG 84 ? A ARG 84 85 1 Y 1 A ASP 85 ? A ASP 85 86 1 Y 1 A ARG 86 ? A ARG 86 87 1 Y 1 A LYS 87 ? A LYS 87 88 1 Y 1 A ALA 88 ? A ALA 88 89 1 Y 1 A ILE 89 ? A ILE 89 90 1 Y 1 A ILE 90 ? A ILE 90 91 1 Y 1 A ASN 91 ? A ASN 91 92 1 Y 1 A CYS 92 ? A CYS 92 93 1 Y 1 A CYS 93 ? A CYS 93 94 1 Y 1 A PHE 94 ? A PHE 94 95 1 Y 1 A SER 95 ? A SER 95 96 1 Y 1 A ARG 96 ? A ARG 96 97 1 Y 1 A PRO 97 ? A PRO 97 98 1 Y 1 A ASP 98 ? A ASP 98 99 1 Y 1 A HIS 99 ? A HIS 99 100 1 Y 1 A LYS 100 ? A LYS 100 101 1 Y 1 A THR 101 ? A THR 101 102 1 Y 1 A GLY 102 ? A GLY 102 103 1 Y 1 A GLU 103 ? A GLU 103 104 1 Y 1 A PRO 104 ? A PRO 104 105 1 Y 1 A PRO 105 ? A PRO 105 106 1 Y 1 A ASN 106 ? A ASN 106 107 1 Y 1 A ASN 107 ? A ASN 107 108 1 Y 1 A TYR 108 ? A TYR 108 109 1 Y 1 A ILE 109 ? A ILE 109 110 1 Y 1 A THR 110 ? A THR 110 111 1 Y 1 A HIS 111 ? A HIS 111 112 1 Y 1 A VAL 112 ? A VAL 112 113 1 Y 1 A ARG 113 ? A ARG 113 114 1 Y 1 A ILE 114 ? A ILE 114 115 1 Y 1 A ILE 115 ? A ILE 115 116 1 Y 1 A GLU 116 ? A GLU 116 117 1 Y 1 A ASP 117 ? A ASP 117 118 1 Y 1 A SER 118 ? A SER 118 119 1 Y 1 A LYS 119 ? A LYS 119 120 1 Y 1 A PHE 120 ? A PHE 120 121 1 Y 1 A PRO 121 ? A PRO 121 122 1 Y 1 A SER 122 ? A SER 122 123 1 Y 1 A SER 123 ? A SER 123 124 1 Y 1 A ARG 124 ? A ARG 124 125 1 Y 1 A PRO 125 ? A PRO 125 126 1 Y 1 A PRO 126 ? A PRO 126 127 1 Y 1 A PRO 127 ? A PRO 127 128 1 Y 1 A ASP 128 ? A ASP 128 129 1 Y 1 A SER 129 ? A SER 129 130 1 Y 1 A LYS 130 ? A LYS 130 131 1 Y 1 A LEU 131 ? A LEU 131 132 1 Y 1 A GLU 132 ? A GLU 132 133 1 Y 1 A ASN 133 ? A ASN 133 134 1 Y 1 A LYS 134 ? A LYS 134 135 1 Y 1 A LYS 135 ? A LYS 135 136 1 Y 1 A LYS 136 ? A LYS 136 137 1 Y 1 A ARG 137 ? A ARG 137 138 1 Y 1 A LEU 138 ? A LEU 138 139 1 Y 1 A LEU 139 ? A LEU 139 140 1 Y 1 A ILE 140 ? A ILE 140 141 1 Y 1 A LEU 141 ? A LEU 141 142 1 Y 1 A SER 142 ? A SER 142 143 1 Y 1 A ALA 143 ? A ALA 143 144 1 Y 1 A LYS 144 ? A LYS 144 145 1 Y 1 A PRO 145 ? A PRO 145 146 1 Y 1 A ASN 146 ? A ASN 146 147 1 Y 1 A ASN 147 ? A ASN 147 148 1 Y 1 A ALA 148 ? A ALA 148 149 1 Y 1 A LYS 149 ? A LYS 149 150 1 Y 1 A LEU 150 ? A LEU 150 151 1 Y 1 A ILE 151 ? A ILE 151 152 1 Y 1 A GLN 152 ? A GLN 152 153 1 Y 1 A ILE 153 ? A ILE 153 154 1 Y 1 A HIS 154 ? A HIS 154 155 1 Y 1 A LYS 155 ? A LYS 155 156 1 Y 1 A ALA 156 ? A ALA 156 157 1 Y 1 A ARG 157 ? A ARG 157 158 1 Y 1 A GLU 158 ? A GLU 158 159 1 Y 1 A ASN 159 ? A ASN 159 160 1 Y 1 A SER 160 ? A SER 160 161 1 Y 1 A ASP 161 ? A ASP 161 162 1 Y 1 A GLY 162 ? A GLY 162 163 1 Y 1 A SER 163 ? A SER 163 164 1 Y 1 A PHE 164 ? A PHE 164 165 1 Y 1 A GLN 165 ? A GLN 165 166 1 Y 1 A ILE 166 ? 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