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ARG n 1 84 PHE n 1 85 GLN n 1 86 SER n 1 87 SER n 1 88 ALA n 1 89 VAL n 1 90 MET n 1 91 ALA n 1 92 LEU n 1 93 GLN n 1 94 GLU n 1 95 ALA n 1 96 SER n 1 97 GLU n 1 98 ALA n 1 99 TYR n 1 100 LEU n 1 101 VAL n 1 102 ALA n 1 103 LEU n 1 104 PHE n 1 105 GLU n 1 106 ASP n 1 107 THR n 1 108 ASN n 1 109 LEU n 1 110 CYS n 1 111 ALA n 1 112 ILE n 1 113 HIS n 1 114 ALA n 1 115 LYS n 1 116 ARG n 1 117 VAL n 1 118 THR n 1 119 ILE n 1 120 MET n 1 121 PRO n 1 122 LYS n 1 123 ASP n 1 124 ILE n 1 125 GLN n 1 126 LEU n 1 127 ALA n 1 128 ARG n 1 129 ARG n 1 130 ILE n 1 131 ARG n 1 132 GLY n 1 133 GLU n 1 134 ARG n 1 135 ALA n 2 1 SER n 2 2 GLY n 2 3 ARG n 2 4 GLY n 2 5 LYS n 2 6 GLY n 2 7 GLY n 2 8 LYS n 2 9 GLY n 2 10 LEU n 2 11 GLY n 2 12 LYS n 2 13 GLY n 2 14 GLY n 2 15 ALA n 2 16 LYS n 2 17 ARG n 2 18 HIS n 2 19 ARG n 2 20 LYS n 2 21 VAL n 2 22 LEU n 2 23 ARG n 2 24 ASP n 2 25 ASN n 2 26 ILE n 2 27 GLN n 2 28 GLY n 2 29 ILE n 2 30 THR n 2 31 LYS n 2 32 PRO n 2 33 ALA n 2 34 ILE n 2 35 ARG n 2 36 ARG n 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.620 ? 25128 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 21.658 ? 9691 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.038 ? 2863 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 2297 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 5Z3O _struct.title 'Structure of Snf2-nucleosome complex in ADP state' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 5Z3O _struct_keywords.text 'complex, nucleosome, chromatin remodeling, gene regulation, STRUCTURAL PROTEIN-HYDROLASE-DNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'STRUCTURAL PROTEIN/HYDROLASE/DNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? K N N 7 ? L N N 8 ? M N N 9 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP H32_XENLA P84233 ? 1 ;ARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKT DLRFQSSAVMALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; 2 2 UNP H4_XENLA P62799 ? 2 ;SGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKT VTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; 2 3 UNP Q6AZJ8_XENLA Q6AZJ8 ? 3 ;SGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIP RHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK ; 2 4 UNP H2B11_XENLA P02281 ? 4 ;AKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKSRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHY NKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; 5 5 PDB 5Z3O 5Z3O ? 5 ? 1 6 PDB 5Z3O 5Z3O ? 6 ? 1 7 UNP SNF2_YEAST P22082 ? 7 ;AYIKLLDQTKDTRITHLLRQTNAFLDSLTRAVKDQQKYTKEMIDSHIKEASEEVDDLSMVPKMKDEEYDDDDDNSNVDYY NVAHRIKEDIKKQPSILVGGTLKDYQIKGLQWMVSLFNNHLNGILADEMGLGKTIQTISLLTYLYEMKNIRGPYLVIVPL STLSNWSSEFAKWAPTLRTISFKGSPNERKAKQAKIRAGEFDVVLTTFEYIIKERALLSKVKWVHMIIDEGHRMKNAQSK LSLTLNTHYHADYRLILTGTPLQNNLPELWALLNFVLPKIFNSVKSFDEWFNTPFANTGGQDKIELSEEETLLVIRRLHK VLRPFLLRRLKKDVEKELPDKVEKVVKCKMSALQQIMYQQMLKYRRLFIGDQNNKKMVGLRGFNNQIMQLKKICNHPFVF EEVEDQINPTRETNDDIWRVAGKFELLDRILPKLKATGHRVLIFFQMTQIMDIMEDFLRYINIKYLRLDGHTKSDERSEL LRLFNAPDSEYLCFILSTRAGGLGLNLQTADTVIIFDTDWNPHQDLQAQDRAHRIGQKNEVRILRLITTNSVEEVILERA YKKLDIDGKVIQAGKFDNKSTSEEQEALLRSLLDAEEERRKKRESGVEEEEELKDSEINEILARNDEEMAVLTRMDEDRS KKEEELGVKSRLLEKSELPDIYSRDIGAELKREESESAAVYNGRGARERKTATYNDNMSEEQWLRQFEVSDDEKNDKQAR KQRTKKEDKSEAIDG ; 666 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 5Z3O A 1 ? 135 ? P84233 2 ? 136 ? 1 135 2 2 5Z3O B 1 ? 102 ? P62799 2 ? 103 ? 1 102 3 3 5Z3O C 1 ? 129 ? Q6AZJ8 2 ? 130 ? 1 129 4 4 5Z3O D 1 ? 122 ? P02281 5 ? 126 ? 1 122 5 1 5Z3O E 1 ? 135 ? P84233 2 ? 136 ? 1 135 6 2 5Z3O F 1 ? 102 ? P62799 2 ? 103 ? 1 102 7 3 5Z3O G 1 ? 129 ? Q6AZJ8 2 ? 130 ? 1 129 8 4 5Z3O H 1 ? 122 ? P02281 5 ? 126 ? 1 122 9 5 5Z3O I 1 ? 167 ? 5Z3O 1 ? 167 ? 1 167 10 6 5Z3O J 1 ? 167 ? 5Z3O -19 ? 147 ? -19 147 11 7 5Z3O O 1 ? 735 ? P22082 666 ? 1400 ? 666 1400 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 5Z3O ALA A 102 ? UNP P84233 GLY 103 'see sequence details' 102 1 4 5Z3O THR D 29 ? UNP P02281 SER 33 'see sequence details' 29 2 5 5Z3O ALA E 102 ? UNP P84233 GLY 103 'see sequence details' 102 3 8 5Z3O THR H 29 ? UNP P02281 SER 33 'see sequence details' 29 4 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details undecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 11 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 58970 ? 1 MORE -425 ? 1 'SSA (A^2)' 104070 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support microscopy _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 44 ? SER A 57 ? GLY A 44 SER A 57 1 ? 14 HELX_P HELX_P2 AA2 ARG A 63 ? LYS A 79 ? ARG A 63 LYS A 79 1 ? 17 HELX_P HELX_P3 AA3 GLN A 85 ? ALA A 114 ? GLN A 85 ALA A 114 1 ? 30 HELX_P HELX_P4 AA4 MET A 120 ? ARG A 131 ? MET A 120 ARG A 131 1 ? 12 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP B 24 ? ILE B 29 ? ASP B 24 ILE B 29 5 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 THR B 30 ? GLY B 41 ? THR B 30 GLY B 41 1 ? 12 HELX_P HELX_P7 AA7 LEU B 49 ? ALA B 76 ? LEU B 49 ALA B 76 1 ? 28 HELX_P HELX_P8 AA8 THR B 82 ? GLY B 94 ? THR B 82 GLY B 94 1 ? 13 HELX_P HELX_P9 AA9 THR C 16 ? ALA C 21 ? THR C 16 ALA C 21 1 ? 6 HELX_P HELX_P10 AB1 PRO C 26 ? GLY C 37 ? PRO C 26 GLY C 37 1 ? 12 HELX_P HELX_P11 AB2 GLY C 46 ? ASN C 73 ? GLY C 46 ASN C 73 1 ? 28 HELX_P HELX_P12 AB3 ILE C 79 ? ASP C 90 ? ILE C 79 ASP C 90 1 ? 12 HELX_P HELX_P13 AB4 ASP C 90 ? GLY C 98 ? ASP C 90 GLY C 98 1 ? 9 HELX_P HELX_P14 AB5 ALA D 35 ? HIS D 46 ? ALA D 35 HIS D 46 1 ? 12 HELX_P HELX_P15 AB6 SER D 52 ? ASN D 81 ? SER D 52 ASN D 81 1 ? 30 HELX_P HELX_P16 AB7 THR D 87 ? LEU D 99 ? THR D 87 LEU D 99 1 ? 13 HELX_P HELX_P17 AB8 GLU D 102 ? SER D 120 ? GLU D 102 SER D 120 1 ? 19 HELX_P HELX_P18 AB9 GLY E 44 ? SER E 57 ? GLY E 44 SER E 57 1 ? 14 HELX_P HELX_P19 AC1 ARG E 63 ? LYS E 79 ? ARG E 63 LYS E 79 1 ? 17 HELX_P HELX_P20 AC2 GLN E 85 ? ALA E 114 ? GLN E 85 ALA E 114 1 ? 30 HELX_P HELX_P21 AC3 MET E 120 ? ARG E 131 ? MET E 120 ARG E 131 1 ? 12 HELX_P HELX_P22 AC4 THR F 30 ? GLY F 41 ? THR F 30 GLY F 41 1 ? 12 HELX_P HELX_P23 AC5 LEU F 49 ? ALA F 76 ? LEU F 49 ALA F 76 1 ? 28 HELX_P HELX_P24 AC6 THR F 82 ? GLY F 94 ? THR F 82 GLY F 94 1 ? 13 HELX_P HELX_P25 AC7 THR G 16 ? ALA G 21 ? THR G 16 ALA G 21 1 ? 6 HELX_P HELX_P26 AC8 PRO G 26 ? GLY G 37 ? PRO G 26 GLY G 37 1 ? 12 HELX_P HELX_P27 AC9 GLY G 46 ? ASN G 73 ? GLY G 46 ASN G 73 1 ? 28 HELX_P HELX_P28 AD1 ILE G 79 ? ASP G 90 ? ILE G 79 ASP G 90 1 ? 12 HELX_P HELX_P29 AD2 ASP G 90 ? GLY G 98 ? ASP G 90 GLY G 98 1 ? 9 HELX_P HELX_P30 AD3 ALA H 35 ? HIS H 46 ? ALA H 35 HIS H 46 1 ? 12 HELX_P HELX_P31 AD4 SER H 52 ? ASN H 81 ? SER H 52 ASN H 81 1 ? 30 HELX_P HELX_P32 AD5 THR H 87 ? LEU H 99 ? THR H 87 LEU H 99 1 ? 13 HELX_P HELX_P33 AD6 GLU H 102 ? SER H 120 ? GLU H 102 SER H 120 1 ? 19 HELX_P HELX_P34 AD7 LEU K 6 ? LEU K 18 ? LEU O 671 LEU O 683 1 ? 13 HELX_P HELX_P35 AD8 LEU K 18 ? LEU K 25 ? LEU O 683 LEU O 690 1 ? 8 HELX_P HELX_P36 AD9 TYR K 80 ? ARG K 85 ? TYR O 745 ARG O 750 1 ? 6 HELX_P HELX_P37 AE1 LYS K 103 ? ASN K 119 ? LYS O 768 ASN O 784 1 ? 17 HELX_P HELX_P38 AE2 GLY K 132 ? MET K 147 ? GLY O 797 MET O 812 1 ? 16 HELX_P HELX_P39 AE3 PRO K 159 ? TRP K 173 ? PRO O 824 TRP O 838 1 ? 15 HELX_P HELX_P40 AE4 GLY K 184 ? ALA K 198 ? GLY O 849 ALA O 863 1 ? 15 HELX_P HELX_P41 AE5 PHE K 208 ? GLU K 214 ? PHE O 873 GLU O 879 1 ? 7 HELX_P HELX_P42 AE6 GLU K 214 ? VAL K 221 ? GLU O 879 VAL O 886 1 ? 8 HELX_P HELX_P43 AE7 GLU K 230 ? LYS K 235 ? GLU O 895 LYS O 900 1 ? 6 HELX_P HELX_P44 AE8 SER K 239 ? THR K 247 ? SER O 904 THR O 912 1 ? 9 HELX_P HELX_P45 AE9 LEU K 277 ? THR K 293 ? LEU O 942 THR O 958 1 ? 17 HELX_P HELX_P46 AF1 LYS K 303 ? GLU K 308 ? LYS O 968 GLU O 973 1 ? 6 HELX_P HELX_P47 AF2 THR K 311 ? LEU K 322 ? THR O 976 LEU O 987 1 ? 12 HELX_P HELX_P48 AF3 LEU K 330 ? VAL K 334 ? LEU O 995 VAL O 999 5 ? 5 HELX_P HELX_P49 AF4 GLN K 355 ? ARG K 366 ? GLN O 1020 ARG O 1031 1 ? 12 HELX_P HELX_P50 AF5 ASN K 384 ? CYS K 394 ? ASN O 1049 CYS O 1059 1 ? 11 HELX_P HELX_P51 AF6 VAL K 403 ? ASN K 408 ? VAL O 1068 ASN O 1073 1 ? 6 HELX_P HELX_P52 AF7 ILE K 417 ? VAL K 420 ? ILE O 1082 VAL O 1085 5 ? 4 HELX_P HELX_P53 AF8 ALA K 421 ? GLY K 438 ? ALA O 1086 GLY O 1103 1 ? 18 HELX_P HELX_P54 AF9 THR K 448 ? ILE K 461 ? THR O 1113 ILE O 1126 1 ? 14 HELX_P HELX_P55 AG1 SER K 474 ? ASN K 485 ? SER O 1139 ASN O 1150 1 ? 12 HELX_P HELX_P56 AG2 PRO K 522 ? ARG K 534 ? PRO O 1187 ARG O 1199 1 ? 13 HELX_P HELX_P57 AG3 SER K 551 ? TYR K 561 ? SER O 1216 TYR O 1226 1 ? 11 HELX_P HELX_P58 AG4 LYS K 562 ? ILE K 566 ? LYS O 1227 ILE O 1231 5 ? 5 HELX_P HELX_P59 AG5 ASP K 567 ? PHE K 576 ? ASP O 1232 PHE O 1241 1 ? 10 HELX_P HELX_P60 AG6 THR K 581 ? GLN K 585 ? THR O 1246 GLN O 1250 5 ? 5 HELX_P HELX_P61 AG7 GLU K 586 ? GLU K 598 ? GLU O 1251 GLU O 1263 1 ? 13 HELX_P HELX_P62 AG8 ARG K 599 ? ARG K 603 ? ARG O 1264 ARG O 1268 5 ? 5 HELX_P HELX_P63 AG9 LYS K 614 ? ILE K 621 ? LYS O 1279 ILE O 1286 1 ? 8 HELX_P HELX_P64 AH1 ASN K 625 ? LYS K 642 ? ASN O 1290 LYS O 1307 1 ? 18 HELX_P HELX_P65 AH2 ARG K 672 ? GLU K 676 ? ARG O 1337 GLU O 1341 1 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? L ADP . O1B ? ? ? 1_555 M MG . MG ? ? O ADP 1501 O MG 1502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? ? metalc2 metalc ? ? L ADP . O1A ? ? ? 1_555 M MG . MG ? ? O ADP 1501 O MG 1502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? ? hydrog1 hydrog ? ? I DT 2 O4 ? ? ? 1_555 J DA 166 N6 ? ? I DT 2 J DA 146 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DA PAIR' ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? I DC 3 N3 ? ? ? 1_555 J DG 165 N1 ? ? I DC 3 J DG 145 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? I DC 3 N4 ? ? ? 1_555 J DG 165 O6 ? ? I DC 3 J DG 145 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? I DC 3 O2 ? ? ? 1_555 J DG 165 N2 ? ? I DC 3 J DG 145 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? I DG 4 N1 ? ? ? 1_555 J DC 164 N3 ? ? I DG 4 J DC 144 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? I DG 4 N2 ? ? ? 1_555 J DC 164 O2 ? ? I DG 4 J DC 144 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? I DG 4 O6 ? ? ? 1_555 J DC 164 N4 ? ? I DG 4 J DC 144 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? 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I DC 18 N4 ? ? ? 1_555 J DG 150 O6 ? ? I DC 18 J DG 130 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? I DC 18 O2 ? ? ? 1_555 J DG 150 N2 ? ? I DC 18 J DG 130 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? I DG 19 N1 ? ? ? 1_555 J DC 149 N3 ? ? I DG 19 J DC 129 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? I DG 19 N2 ? ? ? 1_555 J DC 149 O2 ? ? I DG 19 J DC 129 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? I DG 19 O6 ? ? ? 1_555 J DC 149 N4 ? ? I DG 19 J DC 129 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? I DA 20 N1 ? ? ? 1_555 J DT 148 N3 ? ? I DA 20 J DT 128 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? I DA 20 N6 ? ? ? 1_555 J DT 148 O4 ? ? I DA 20 J DT 128 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog50 hydrog ? ? I DG 21 N1 ? ? ? 1_555 J DC 147 N3 ? ? I DG 21 J DC 127 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog51 hydrog ? ? I DG 21 N2 ? ? ? 1_555 J DC 147 O2 ? ? I DG 21 J DC 127 1_555 ? ? ? ? ? ? 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I DT 142 J DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DA PAIR' ? ? ? hydrog321 hydrog ? ? I DC 143 N3 ? ? ? 1_555 J DG 25 N2 ? ? I DC 143 J DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? ? hydrog322 hydrog ? ? I DC 144 N3 ? ? ? 1_555 J DG 24 N2 ? ? I DC 144 J DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? ? hydrog323 hydrog ? ? I DG 146 N2 ? ? ? 1_555 J DT 21 O2 ? ? I DG 146 J DT 1 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DT MISPAIR' ? ? ? hydrog324 hydrog ? ? I DG 146 N2 ? ? ? 1_555 J DC 22 N3 ? ? I DG 146 J DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog325 hydrog ? ? I DA 147 N3 ? ? ? 1_555 J DT 21 N3 ? ? I DA 147 J DT 1 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DA-DT PAIR' ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # _pdbx_struct_conn_angle.id 1 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id O1B _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id L _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id ADP _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id . _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id O _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id ADP _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id 1501 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry 1_555 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id MG _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id M _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id MG _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id . _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id O _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id MG _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id 1502 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry 1_555 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id O1A _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id L _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id ADP _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id . _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id O _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id ADP _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id 1501 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry 1_555 _pdbx_struct_conn_angle.value 87.7 _pdbx_struct_conn_angle.value_esd ? # _struct_mon_prot_cis.pdbx_id 1 _struct_mon_prot_cis.label_comp_id GLY _struct_mon_prot_cis.label_seq_id 152 _struct_mon_prot_cis.label_asym_id K _struct_mon_prot_cis.label_alt_id . _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code ? _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id GLY _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id 817 _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id O _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 153 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 K _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 ? _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 818 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 O _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num 1 _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle -6.98 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 6 ? 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_pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? # _em_3d_fitting.entry_id 5Z3O _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_protocol 'RIGID BODY FIT' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 5Z3O _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 146723 _em_3d_reconstruction.resolution 3.62 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details ? 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J 1 ? ? 5 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 I DT 2 1_555 J DA 166 1_555 I DC 3 1_555 J DG 165 1_555 0.871 -2.024 3.619 -1.583 1.818 28.402 -4.559 -2.160 3.433 3.696 3.219 28.502 1 II_DT2DC3:DG145DA146_JJ I 2 ? 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