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'DICER1, DICER, HERNA, KIAA0928' ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 'Biological sequence' 1 366 Human ? 'TARBP2, TRBP' ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 'Biological sequence' 1 73 Human ? ? ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? 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'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 5ZAM _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.B_iso_max ? _refine.B_iso_mean ? _refine.B_iso_min ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.details ? _refine.diff_density_max ? _refine.diff_density_max_esd ? _refine.diff_density_min ? _refine.diff_density_min_esd ? _refine.diff_density_rms ? _refine.diff_density_rms_esd ? _refine.entry_id 5ZAM _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.ls_abs_structure_details ? _refine.ls_abs_structure_Flack ? _refine.ls_abs_structure_Flack_esd ? _refine.ls_abs_structure_Rogers ? _refine.ls_abs_structure_Rogers_esd ? 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_struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 5ZAM _struct_keywords.text 'Dicer, TRBP, Cryo-EM, RNA interference, PROTEIN BINDING, HYDROLASE-PROTEIN BINDING-RNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'HYDROLASE/PROTEIN BINDING/RNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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SER A 1762 GLN A 1776 1 ? 15 HELX_P HELX_P47 AF2 ALA A 1807 ? SER A 1823 ? ALA A 1807 SER A 1823 1 ? 17 HELX_P HELX_P48 AF3 SER A 1826 ? ASN A 1848 ? SER A 1826 ASN A 1848 1 ? 23 HELX_P HELX_P49 AF4 SER A 1852 ? GLU A 1861 ? SER A 1852 GLU A 1861 1 ? 10 HELX_P HELX_P50 AF5 SER A 1896 ? SER A 1911 ? SER A 1896 SER A 1911 1 ? 16 HELX_P HELX_P51 AF6 PRO B 292 ? GLN B 305 ? PRO B 292 GLN B 305 1 ? 14 HELX_P HELX_P52 AF7 THR B 343 ? ALA B 363 ? THR B 343 ALA B 363 1 ? 21 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 443 SG ? ? ? 1_555 A CYS 531 SG ? ? A CYS 443 A CYS 531 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? ? hydrog1 hydrog ? ? C U 1 N3 ? ? ? 1_555 C A 71 N1 ? ? C U 1 C A 71 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? C U 1 O4 ? ? ? 1_555 C A 71 N6 ? ? C U 1 C A 71 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? C A 3 N1 ? ? ? 1_555 C U 69 N3 ? ? C A 3 C U 69 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? C A 3 N6 ? ? ? 1_555 C U 69 O4 ? ? C A 3 C U 69 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? C A 3 N1 ? ? ? 1_555 C U 70 N3 ? ? C A 3 C U 70 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? C A 3 N6 ? ? ? 1_555 C U 70 O4 ? ? C A 3 C U 70 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? C G 4 N1 ? ? ? 1_555 C C 68 N3 ? ? C G 4 C C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? C G 4 N2 ? ? ? 1_555 C C 68 O2 ? ? C G 4 C C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? C G 4 O6 ? ? ? 1_555 C C 68 N4 ? ? C G 4 C C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? C G 5 N1 ? ? ? 1_555 C U 67 O2 ? ? C G 5 C U 67 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? C G 5 O6 ? ? ? 1_555 C U 67 N3 ? ? C G 5 C U 67 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? C G 5 N1 ? ? ? 1_555 C C 68 N3 ? ? C G 5 C C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? C G 5 N2 ? ? ? 1_555 C C 68 O2 ? ? C G 5 C C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? C G 5 O6 ? ? ? 1_555 C C 68 N4 ? ? C G 5 C C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? C U 6 N3 ? ? ? 1_555 C U 67 O4 ? ? C U 6 C U 67 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? C U 6 O2 ? ? ? 1_555 C U 67 N3 ? ? C U 6 C U 67 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? C A 7 N1 ? ? ? 1_555 C U 65 N3 ? ? C A 7 C U 65 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? C A 7 N6 ? ? ? 1_555 C U 65 O4 ? ? C A 7 C U 65 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? C G 8 N1 ? ? ? 1_555 C C 64 N3 ? ? C G 8 C C 64 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? C G 8 N2 ? ? ? 1_555 C C 64 O2 ? ? C G 8 C C 64 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? C G 8 O6 ? ? ? 1_555 C C 64 N4 ? ? C G 8 C C 64 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? C U 9 N3 ? ? ? 1_555 C A 63 N1 ? ? C U 9 C A 63 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? C U 9 O4 ? ? ? 1_555 C A 63 N6 ? ? C U 9 C A 63 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? C A 10 N1 ? ? ? 1_555 C U 62 N3 ? ? C A 10 C U 62 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? C A 10 N6 ? ? ? 1_555 C U 62 O4 ? ? C A 10 C U 62 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? C G 11 N1 ? ? ? 1_555 C C 61 N3 ? ? C G 11 C C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? C G 11 N2 ? ? ? 1_555 C C 61 O2 ? ? C G 11 C C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? C G 11 O6 ? ? ? 1_555 C C 61 N4 ? ? C G 11 C C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? C G 12 N1 ? ? ? 1_555 C U 60 O4 ? ? C G 12 C U 60 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_27_PAIR ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? C G 12 O6 ? ? ? 1_555 C U 60 N3 ? ? C G 12 C U 60 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_27_PAIR ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? C U 13 N3 ? ? ? 1_555 C A 59 N1 ? ? C U 13 C A 59 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? C U 13 O4 ? ? ? 1_555 C A 59 N6 ? ? C U 13 C A 59 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? C U 14 N3 ? ? ? 1_555 C A 58 N1 ? ? C U 14 C A 58 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? C U 14 O4 ? ? ? 1_555 C A 58 N6 ? ? C U 14 C A 58 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ARG 137 A . ? ARG 137 A TRP 138 A ? TRP 138 A 1 24.48 2 GLY 162 A . ? GLY 162 A TYR 163 A ? TYR 163 A 1 7.42 3 GLU 194 A . ? GLU 194 A ASN 195 A ? ASN 195 A 1 28.58 4 PRO 259 A . ? PRO 259 A PHE 260 A ? PHE 260 A 1 -13.98 5 PHE 260 A . ? PHE 260 A THR 261 A ? THR 261 A 1 -16.42 6 SER 364 A . ? SER 364 A PRO 365 A ? PRO 365 A 1 -3.13 7 ASP 369 A . ? ASP 369 A LEU 370 A ? LEU 370 A 1 4.62 8 PHE 372 A . ? PHE 372 A VAL 373 A ? VAL 373 A 1 -19.90 9 THR 374 A . ? THR 374 A PRO 375 A ? PRO 375 A 1 -11.38 10 ARG 554 A . ? ARG 554 A ALA 555 A ? ALA 555 A 1 22.59 11 ALA 555 A . ? ALA 555 A PRO 556 A ? PRO 556 A 1 -11.96 12 LEU 641 A . ? LEU 641 A PRO 642 A ? PRO 642 A 1 0.18 13 HIS 648 A . ? HIS 648 A LEU 649 A ? LEU 649 A 1 23.08 14 LEU 649 A . ? LEU 649 A ALA 650 A ? ALA 650 A 1 16.15 15 ASP 873 A . ? ASP 873 A SER 874 A ? SER 874 A 1 4.74 16 ASP 1308 A . ? ASP 1308 A GLY 1309 A ? GLY 1309 A 1 -2.56 17 PHE 1374 A . ? PHE 1374 A ASP 1375 A ? ASP 1375 A 1 22.84 18 GLU 1551 A . ? GLU 1551 A GLN 1552 A ? GLN 1552 A 1 13.01 19 GLU 1600 A . ? GLU 1600 A LYS 1601 A ? LYS 1601 A 1 -3.75 20 GLN 1783 A . ? GLN 1783 A GLY 1784 A ? GLY 1784 A 1 -3.23 21 GLY 291 B . ? GLY 291 B PRO 292 B ? PRO 292 B 1 1.95 22 GLN 332 B . ? GLN 332 B PRO 333 B ? PRO 333 B 1 -0.88 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 6 ? AA5 ? 5 ? 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LEU A 99 ? VAL A 97 LEU A 99 AA1 2 LEU A 148 ? MET A 150 ? LEU A 148 MET A 150 AA2 1 LEU A 171 ? VAL A 173 ? LEU A 171 VAL A 173 AA2 2 ARG A 201 ? LEU A 203 ? ARG A 201 LEU A 203 AA3 1 ILE A 253 ? VAL A 255 ? ILE A 253 VAL A 255 AA3 2 TYR A 560 ? LEU A 563 ? TYR A 560 LEU A 563 AA3 3 VAL A 534 ? PHE A 537 ? VAL A 534 PHE A 537 AA3 4 ILE A 446 ? PHE A 447 ? ILE A 446 PHE A 447 AA4 1 PHE A 816 ? TYR A 819 ? PHE A 816 TYR A 819 AA4 2 GLU A 824 ? SER A 828 ? GLU A 824 SER A 828 AA4 3 TYR A 769 ? LEU A 777 ? TYR A 769 LEU A 777 AA4 4 CYS A 801 ? THR A 806 ? CYS A 801 THR A 806 AA4 5 LEU A 879 ? VAL A 884 ? LEU A 879 VAL A 884 AA4 6 THR A 889 ? ASP A 891 ? THR A 889 ASP A 891 AA5 1 ILE A 1032 ? LEU A 1033 ? ILE A 1032 LEU A 1033 AA5 2 LEU A 987 ? HIS A 992 ? LEU A 987 HIS A 992 AA5 3 PHE A 945 ? TYR A 951 ? PHE A 945 TYR A 951 AA5 4 VAL A 931 ? PRO A 934 ? VAL A 931 PRO A 934 AA5 5 CYS A 1038 ? HIS A 1041 ? CYS A 1038 HIS A 1041 AA6 1 VAL B 309 ? LEU B 312 ? 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THR B 335 GLY B 339 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N PHE A 98 ? N PHE A 98 O LEU A 148 ? O LEU A 148 AA2 1 2 N LEU A 172 ? N LEU A 172 O LEU A 203 ? O LEU A 203 AA3 1 2 N ILE A 253 ? N ILE A 253 O MET A 562 ? O MET A 562 AA3 2 3 O LEU A 563 ? O LEU A 563 N ARG A 536 ? N ARG A 536 AA3 3 4 O VAL A 535 ? O VAL A 535 N PHE A 447 ? N PHE A 447 AA4 1 2 N VAL A 818 ? N VAL A 818 O VAL A 825 ? O VAL A 825 AA4 2 3 O SER A 828 ? O SER A 828 N GLY A 774 ? N GLY A 774 AA4 3 4 N TYR A 771 ? N TYR A 771 O ILE A 804 ? O ILE A 804 AA4 4 5 N CYS A 801 ? N CYS A 801 O LEU A 881 ? O LEU A 881 AA4 5 6 N VAL A 884 ? N VAL A 884 O THR A 889 ? O THR A 889 AA5 1 2 O LEU A 1033 ? O LEU A 1033 N LEU A 988 ? N LEU A 988 AA5 2 3 O LEU A 987 ? O LEU A 987 N TYR A 951 ? N TYR A 951 AA5 3 4 O PHE A 945 ? O PHE A 945 N ILE A 932 ? N ILE A 932 AA5 4 5 N VAL A 931 ? N VAL A 931 O HIS A 1041 ? O HIS A 1041 AA6 1 2 N SER B 310 ? N SER B 310 O GLU B 328 ? O GLU B 328 AA6 2 3 N CYS B 325 ? N CYS B 325 O GLY B 339 ? O GLY B 339 # _atom_sites.entry_id 5ZAM _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C H N O P S # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 MET 1 1 ? ? ? 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