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EMD-4655 'other EM volume' EMDB . EMD-4677 'other EM volume' EMDB . EMD-4679 'other EM volume' EMDB 'The cryo-EM structure of the head of the genome empited bacteriophage phi29' EMD-4681 'associated EM volume' # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Xu, J.' 1 ? 'Wang, D.' 2 ? 'Gui, M.' 3 ? 'Xiang, Y.' 4 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Nat Commun' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2041-1723 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 10 _citation.language ? _citation.page_first 2366 _citation.page_last 2366 _citation.title 'Structural assembly of the tailed bacteriophage φ29.' _citation.year 2019 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41467-019-10272-3 _citation.pdbx_database_id_PubMed 31147544 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Xu, J.' 1 0000-0003-1833-1513 primary 'Wang, D.' 2 ? primary 'Gui, M.' 3 ? primary 'Xiang, Y.' 4 0000-0003-0230-9522 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Major capsid protein' 49894.906 235 ? ? ? ? 2 polymer nat 'Capsid fiber protein' 29642.361 165 ? ? ? 'the residues from 117 to 281 is derived from crystal structure of head fiber protein (PDB entry: 3QC7)' # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'Gene product 8,gp8,Major head protein,Protein p8' 2 'Gene product 8.5,gp8.5,Head fiber protein,Protein p8.5' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MRITFNDVKTSLGITESYDIVNAIRNSQGDNFKSYVPLATANNVAEVGAGILINQTVQNDFITSLVDRIGLVVIRQVSLN NPLKKFKKGQIPLGRTIEEIYTDITKEKQYDAEEAEQKVFEREMPNVKTLFHERNRQGFYHQTIQDDSLKTAFVSWGNFE SFVSSIINAIYNSAEVDEYEYMKLLVDNYYSKGLFTTVKIDEPTSSTGALTEFVKKMRATARKLTLPQGSRDWNSMAVRT RSYMEDLHLIIDADLEAELDVDVLAKAFNMNRTDFLGNVTVIDGFASTGLEAVLVDKDWFMVYDNLHKMETVRNPRGLYW NYYYHVWQTLSVSRFANAVAFVSGDVPAVTQVIVSPNIAAVKQGGQQQFTAYVRATNAKDHKVVWSVEGGSTGTAITGDG LLSVSGNEDNQLTVKATVDIGTEDKPKLVVGEAVVSIRPNNASGGAQA ; ;MRITFNDVKTSLGITESYDIVNAIRNSQGDNFKSYVPLATANNVAEVGAGILINQTVQNDFITSLVDRIGLVVIRQVSLN NPLKKFKKGQIPLGRTIEEIYTDITKEKQYDAEEAEQKVFEREMPNVKTLFHERNRQGFYHQTIQDDSLKTAFVSWGNFE SFVSSIINAIYNSAEVDEYEYMKLLVDNYYSKGLFTTVKIDEPTSSTGALTEFVKKMRATARKLTLPQGSRDWNSMAVRT RSYMEDLHLIIDADLEAELDVDVLAKAFNMNRTDFLGNVTVIDGFASTGLEAVLVDKDWFMVYDNLHKMETVRNPRGLYW NYYYHVWQTLSVSRFANAVAFVSGDVPAVTQVIVSPNIAAVKQGGQQQFTAYVRATNAKDHKVVWSVEGGSTGTAITGDG LLSVSGNEDNQLTVKATVDIGTEDKPKLVVGEAVVSIRPNNASGGAQA ; ;1A,1B,1C,1D,1E,1F,2A,2B,2C,2D,2E,3A,3B,3C,3D,3E,3F,4A,4B,4C,4D,4E,4F,5A,5B,5C,5D,5E,5F,6A,6B,6C,6D,6E,6F,7A,7B,7C,7D,7E,8A,8B,8C,8D,8E,8F,9A,1G,1H,1I,1J,1K,1L,2F,2G,2H,2I,2J,3G,3H,3I,3J,3K,3L,4G,4H,4I,4J,4K,4L,5G,5H,5I,5J,5K,5L,6G,6H,6I,6J,6K,6L,7F,7G,7H,7I,7J,8G,8H,8I,8J,8K,8L,9B,1M,1N,1O,1P,1Q,1R,2K,2L,2M,2N,2O,3M,3N,3O,3P,3Q,3R,4M,4N,4O,4P,4Q,4R,5M,5N,5O,5P,5Q,5R,6M,6N,6O,6P,6Q,6R,7K,7L,7M,7N,7O,8M,8N,8O,8P,8Q,8R,9C,1S,1T,1U,1V,1W,1X,2P,2Q,2R,2S,2T,3S,3T,3U,3V,3W,3X,4S,4T,4U,4V,4W,4X,5S,5T,5U,5V,5W,5X,6S,6T,6U,6V,6W,6X,7P,7Q,7R,7S,7T,8S,8T,8U,8V,8W,8X,9D,1Y,1Z,1a,1b,1c,1d,2U,2V,2W,2X,2Y,3Y,3Z,3a,3b,3c,3d,4Y,4Z,4a,4b,4c,4d,5Y,5Z,5a,5b,5c,5d,6Y,6Z,6a,6b,6c,6d,7U,7V,7W,7X,7Y,8Y,8Z,8a,8b,8c,8d,9E ; ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MMVSFTARAKSNVMAYRLLAYSQGDDIIEISHAAENTIPDYVAVKDVDKGDLTQVNMYPLAAWQVIAGSDIKVGDNLTTG KDGTAVPTDDPSTVFGYAVEEAQEGQLVTLVISRSKEISIEVEDIKDAGDTGKRLLKINTPSGARNIIIENEDAKALING ETTNTNKKNLQDLLFSDGNVKAFLQATTTDENKTALQQLLVSNADVLGLLSGNPTSDNKINLRTMIGAGVPYSLPAATTT 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