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'X-RAY DIFFRACTION' . 2.8723 2.9061 3217 0.2996 100.00 0.3390 . . 165 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.9061 2.9415 3206 0.2885 100.00 0.3103 . . 175 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.9415 2.9787 3178 0.2901 100.00 0.3283 . . 166 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.9787 3.0179 3283 0.2764 100.00 0.3244 . . 153 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.0179 3.0593 3130 0.2829 100.00 0.3352 . . 186 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.0593 3.1030 3268 0.2871 100.00 0.3094 . . 170 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.1030 3.1493 3169 0.2873 100.00 0.3411 . . 166 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.1493 3.1985 3189 0.2613 100.00 0.3020 . . 173 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.1985 3.2509 3236 0.2525 100.00 0.3141 . . 172 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.2509 3.3070 3180 0.2421 100.00 0.2851 . . 171 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.3070 3.3671 3255 0.2387 100.00 0.2776 . . 181 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.3671 3.4319 3165 0.2414 100.00 0.2689 . . 170 . . . . 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'X-RAY DIFFRACTION' . 5.1599 5.5581 3247 0.2219 100.00 0.2589 . . 164 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 5.5581 6.1170 3234 0.2333 100.00 0.2171 . . 149 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 6.1170 7.0012 3225 0.2273 100.00 0.2946 . . 171 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 7.0012 8.8171 3235 0.2138 100.00 0.2507 . . 178 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 8.8171 63.9472 3206 0.2349 98.00 0.2291 . . 163 . . . . # _struct.entry_id 5FFJ _struct.title 'Structure of a nuclease-deletion mutant of the Type ISP restriction-modification enzyme LlaGI in complex with a DNA substrate mimic' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? # _struct_keywords.entry_id 5FFJ _struct_keywords.text 'Helicase-like ATPase, methyltransferase, DNA-binding protein, restriction-modification enzyme, DNA BINDING PROTEIN-DNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN/DNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 1 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 4 ? H N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP Q93R01_9LACT Q93R01 ? 1 ;RPENVVVKKPKKLRDYQQTAKENALAHFKENDRGQLIMAPGTGKTFTSLKISEALSKDKNGPFKVLYLVPSIQLLTQTLR GWNNDTELTITSMAVTSDRDASRGTDGTEDIKASDIGYPATTSSKKILQNWHDFESLPKQTDMLVVFSTYQSIEVIGEAQ KEGFPEFDFIISDEAHRTTGAHEAAKEASAFSKVHSNNNVKGLKRMYQTATPKIYGESAKKNAKDKSILLSSMDDESKYG EVFFRMGFGQAVSRDILTDYKVMVLAVDEAAIQKDMQRTLADPENGLNIDDVGRIVGIWNGMMRRNGYKNPIKNSPYDGA PLERAIAFTRTIEESKKVSSQFEEVVNEYISEAIEDESIHLSMRHADGKMNALQKGEILDWLADPNKPADEARIVSNVRF LTEGIDIPTLDAVIFLSPKKSQVDIVQAVGRIMRKAEGKDYGYIILPIVIPTGEKPETILDNNKNYETVWQVINALRSVD ERFEAMIDKLNMAKPKQLKVIGVGSAPEQVNDQDKTIENTPVQTELELEWNKFEGAIFGKIVQKVGDRKYLENWSKDVAK IAERQINWIKNKLSDKKDPISLEFKKFVSSLQHNINDSIDEKQAAEMLSQHLITKPIFEALFSEYSFVNQNPVSQAMESI VSELEKAGFAKEQENLEPLYESVRMRAEGIEKAEDKQKIIVTLYDKFFKTAFKATTERLGIVFTPIEVVDFIVHSVDDVL KKHFGKSLASKDVHILDPFTGTGTFIVRTLTYLKEQMDAGEISLSDITRKFMKELHANEIVLLSYYIAAINIEATFDEIN GEEEGYVPFEGIVLTDTFESTETEETLDDDYFGTNDERLKRQQEVPITAIIGNPPYSKGQSNENDNNKNIEYPRLFKSIA DSYVKNSKTTSVLGMYDSYVLSIRWASNRLNDKGVIGFVSNGSYIDSQSADGLRKSLFKEFNHLYIFNLRGDQRTQGETS RKEGGKIFGSGSRTSIAISILVKDDSDNHEVHYHDIGDYLTRDDKLDILRDKESILNIDWENISPDENNDWINQRDQNYL NYRPLADENGSIFSVKDIGIVTNRDAWVSNFSKINVSDNVQIMIKNYNLEVDRLENIDVKLNDKTVVDYVTNDERKISWS RSLKQRAARREKTQFSHSDIMLAMYRPFTKKYLYRNRFLNENVRKTYQTFPDKNSKNLLINISGQGDKADFATLISEYLS DMHVIGGQARNLPRFTYETDGMFAGRTDNIVSDDEFYYVYGVLHSSAYRKRYANDLKKDLPRIPLLKNKDKYVEIGRKLS DLHLNYENQPIWDGIEVEISQPDYRVKKMKHPKKGVLDTIIYNESITIKNIPERAYEYVVNGRPAIEWIIDQYQVKTDKK SGITDDPNEFSDNPKYILNLLLSVITVSMRTLELIEELPEFEIQE ; 166 2 PDB 5FFJ 5FFJ ? 2 ? 1 3 PDB 5FFJ 5FFJ ? 3 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 5FFJ A 2 ? 1406 ? 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'expression tag' 165 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 2 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 7210 ? 1 MORE -24 ? 1 'SSA (A^2)' 50060 ? 2 'ABSA (A^2)' 7270 ? 2 MORE -22 ? 2 'SSA (A^2)' 58120 ? # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,C,G 2 1 D,E,F,H # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ARG A 15 ? 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LEU A 821 ALA A 832 1 ? 12 HELX_P HELX_P16 AB7 ASP A 676 ? PHE A 693 ? ASP A 840 PHE A 857 1 ? 18 HELX_P HELX_P17 AB8 PRO A 706 ? HIS A 724 ? PRO A 870 HIS A 888 1 ? 19 HELX_P HELX_P18 AB9 GLY A 744 ? ALA A 760 ? GLY A 908 ALA A 924 1 ? 17 HELX_P HELX_P19 AC1 SER A 764 ? LYS A 774 ? SER A 928 LYS A 938 1 ? 11 HELX_P HELX_P20 AC2 VAL A 782 ? ASP A 798 ? VAL A 946 ASP A 962 1 ? 17 HELX_P HELX_P21 AC3 ASP A 817 ? THR A 822 ? ASP A 981 THR A 986 1 ? 6 HELX_P HELX_P22 AC4 PHE A 833 ? ARG A 842 ? PHE A 997 ARG A 1006 1 ? 10 HELX_P HELX_P23 AC5 TYR A 873 ? SER A 883 ? TYR A 1037 SER A 1047 1 ? 11 HELX_P HELX_P24 AC6 VAL A 893 ? TYR A 897 ? VAL A 1057 TYR A 1061 5 ? 5 HELX_P HELX_P25 AC7 ASP A 898 ? LEU A 911 ? ASP A 1062 LEU A 1075 1 ? 14 HELX_P HELX_P26 AC8 SER A 924 ? ASP A 927 ? SER A 1088 ASP A 1091 5 ? 4 HELX_P HELX_P27 AC9 SER A 928 ? SER A 930 ? SER A 1092 SER A 1094 5 ? 3 HELX_P HELX_P28 AD1 ALA A 931 ? PHE A 942 ? ALA A 1095 PHE A 1106 1 ? 12 HELX_P HELX_P29 AD2 GLY A 958 ? 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'DA-DT PAIR' ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # _struct_mon_prot_cis.pdbx_id 1 _struct_mon_prot_cis.label_comp_id GLY _struct_mon_prot_cis.label_seq_id 62 _struct_mon_prot_cis.label_asym_id D _struct_mon_prot_cis.label_alt_id . _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code ? _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id GLY _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id 226 _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id B _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 63 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 D _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 ? _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 227 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 B _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num 1 _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 0.08 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 7 ? AA2 ? 9 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 2 ? 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