data_5FIL # _entry.id 5FIL # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.391 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 5FIL pdb_00005fil 10.2210/pdb5fil/pdb PDBE EBI-65168 ? ? 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IDTAAKFIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYARNPSLKQQLFSYAILGFALSEAMGLFCLMVAFLILF J,K,L,M,N,O,P,Q ? 7 'polypeptide(L)' no no ;FAKLVRPPVQIYGIEGRYATALYSAASKQNKLEQVEKELLRVGQILKEPKMAASLLNPYVKRSVKVKSLSDMTAKEKFSP LTSNLINLLAENGRLTNTPAVISAFSTMMSVHRGEVPCTVTTASALDETTLTELKTVLKSFLSKGQVLKLEVKIDPSIMG GMIVRIGEKYVDMSAKTKIQKLSRAMREIL ; ;FAKLVRPPVQIYGIEGRYATALYSAASKQNKLEQVEKELLRVGQILKEPKMAASLLNPYVKRSVKVKSLSDMTAKEKFSP LTSNLINLLAENGRLTNTPAVISAFSTMMSVHRGEVPCTVTTASALDETTLTELKTVLKSFLSKGQVLKLEVKIDPSIMG GMIVRIGEKYVDMSAKTKIQKLSRAMREIL ; S ? 8 'polypeptide(L)' no no ;PYVLGTGLILYLLSKEIYVITPETFSAISTIGFLVYIVKKYGASVGEFADKLNEQKIAQLEEVKQASIKQIQDAIDMEKS QQALVQKRHYLFDVQRNNIAMALEVTYRERLHRVYREVKNRLDYHISVQNMMRQKEQEHMINWVEKRVVQSISAQQEKET IAKCIADLKLLSKK ; ;PYVLGTGLILYLLSKEIYVITPETFSAISTIGFLVYIVKKYGASVGEFADKLNEQKIAQLEEVKQASIKQIQDAIDMEKS QQALVQKRHYLFDVQRNNIAMALEVTYRERLHRVYREVKNRLDYHISVQNMMRQKEQEHMINWVEKRVVQSISAQQEKET IAKCIADLKLLSKK ; T ? 9 'polypeptide(L)' no no ;AGRKLALKTIDWVAFGEIIPRNQKAVANSLKSWNETLTSRLATLPEKPPAIDWAYYKANVAKAGLVDDFEKKFNALKVPI PEDKYTAQVDAEEKEDVKSCAEFLTQSKTRIQEYEKELEKMRNI ; ;AGRKLALKTIDWVAFGEIIPRNQKAVANSLKSWNETLTSRLATLPEKPPAIDWAYYKANVAKAGLVDDFEKKFNALKVPI PEDKYTAQVDAEEKEDVKSCAEFLTQSKTRIQEYEKELEKMRNI ; U ? 10 'polypeptide(L)' no no FNKELDPVQKLFVDKIREYRTKRQTSGGPVDAGPEYQQDLDRELFKLKQMYGKADMNTFPNFTFEDPKFEVVEKPQS FNKELDPVQKLFVDKIREYRTKRQTSGGPVDAGPEYQQDLDRELFKLKQMYGKADMNTFPNFTFEDPKFEVVEKPQS V ? 11 'polypeptide(L)' no no ;ITPVILGLPLVTLIVLFPSLLFPTSNRLVSNRFVTLQQWMLQLVSKQMMSIHNSKGQTWTLMLMSLILFIGSTNLLGLLP HSFTPTTQLSMNLGMAIPLWAGAVITGFRNKTKASLAHFLPQGTPTPLIPMLVIIETISLFIQPMALAVRLTANITAGHL LIHLIGGATLALMSISTTTALITFTILILLTILEFAVAMIQAYVFTLLVSLYLHDNT ; ;ITPVILGLPLVTLIVLFPSLLFPTSNRLVSNRFVTLQQWMLQLVSKQMMSIHNSKGQTWTLMLMSLILFIGSTNLLGLLP HSFTPTTQLSMNLGMAIPLWAGAVITGFRNKTKASLAHFLPQGTPTPLIPMLVIIETISLFIQPMALAVRLTANITAGHL LIHLIGGATLALMSISTTTALITFTILILLTILEFAVAMIQAYVFTLLVSLYLHDNT ; W ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 GLN n 1 2 LYS n 1 3 THR n 1 4 GLY n 1 5 THR n 1 6 ALA n 1 7 GLU n 1 8 VAL n 1 9 SER n 1 10 SER n 1 11 ILE n 1 12 LEU n 1 13 GLU n 1 14 GLU n 1 15 ARG n 1 16 ILE n 1 17 LEU n 1 18 GLY n 1 19 ALA n 1 20 ASP n 1 21 THR n 1 22 SER n 1 23 VAL n 1 24 ASP n 1 25 LEU n 1 26 GLU n 1 27 GLU n 1 28 THR n 1 29 GLY n 1 30 ARG n 1 31 VAL n 1 32 LEU n 1 33 SER n 1 34 ILE n 1 35 GLY n 1 36 ASP n 1 37 GLY n 1 38 ILE n 1 39 ALA n 1 40 ARG n 1 41 VAL n 1 42 HIS n 1 43 GLY n 1 44 LEU n 1 45 ARG n 1 46 ASN n 1 47 VAL n 1 48 GLN n 1 49 ALA n 1 50 GLU n 1 51 GLU n 1 52 MET n 1 53 VAL n 1 54 GLU n 1 55 PHE n 1 56 SER n 1 57 SER n 1 58 GLY n 1 59 LEU n 1 60 LYS n 1 61 GLY n 1 62 MET n 1 63 SER n 1 64 LEU n 1 65 ASN n 1 66 LEU n 1 67 GLU n 1 68 PRO n 1 69 ASP n 1 70 ASN n 1 71 VAL n 1 72 GLY n 1 73 VAL n 1 74 VAL n 1 75 VAL n 1 76 PHE n 1 77 GLY n 1 78 ASN n 1 79 ASP n 1 80 LYS n 1 81 LEU n 1 82 ILE n 1 83 LYS n 1 84 GLU n 1 85 GLY n 1 86 ASP n 1 87 ILE n 1 88 VAL n 1 89 LYS n 1 90 ARG n 1 91 THR n 1 92 GLY n 1 93 ALA n 1 94 ILE n 1 95 VAL n 1 96 ASP n 1 97 VAL n 1 98 PRO n 1 99 VAL n 1 100 GLY n 1 101 GLU n 1 102 GLU n 1 103 LEU n 1 104 LEU n 1 105 GLY n 1 106 ARG n 1 107 VAL n 1 108 VAL n 1 109 ASP n 1 110 ALA n 1 111 LEU n 1 112 GLY n 1 113 ASN n 1 114 ALA n 1 115 ILE n 1 116 ASP n 1 117 GLY n 1 118 LYS n 1 119 GLY n 1 120 PRO n 1 121 ILE n 1 122 GLY n 1 123 SER n 1 124 LYS n 1 125 ALA n 1 126 ARG n 1 127 ARG n 1 128 ARG n 1 129 VAL n 1 130 GLY n 1 131 LEU n 1 132 LYS n 1 133 ALA n 1 134 PRO n 1 135 GLY n 1 136 ILE n 1 137 ILE n 1 138 PRO n 1 139 ARG n 1 140 ILE n 1 141 SER n 1 142 VAL n 1 143 ARG n 1 144 GLU n 1 145 PRO n 1 146 MET n 1 147 GLN n 1 148 THR n 1 149 GLY n 1 150 ILE n 1 151 LYS n 1 152 ALA n 1 153 VAL n 1 154 ASP n 1 155 SER n 1 156 LEU n 1 157 VAL n 1 158 PRO n 1 159 ILE n 1 160 GLY n 1 161 ARG n 1 162 GLY n 1 163 GLN n 1 164 ARG n 1 165 GLU n 1 166 LEU n 1 167 ILE n 1 168 ILE n 1 169 GLY n 1 170 ASP n 1 171 ARG n 1 172 GLN 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P00847 10 ? 226 ? 10 226 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 5FIL GLY A 481 ? UNP P19483 SER 524 conflict 481 1 2 5FIL GLY B 481 ? UNP P19483 SER 524 conflict 481 2 3 5FIL GLY C 481 ? UNP P19483 SER 524 conflict 481 3 18 5FIL THR S 129 ? UNP P13621 ALA 152 conflict 129 4 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 22-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 22 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ILE A 11 ? ILE A 16 ? ILE A 11 ILE A 16 1 ? 6 HELX_P HELX_P2 2 ASN A 78 ? ILE A 82 ? ASN A 78 ILE A 82 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 3 ILE A 150 ? VAL A 157 ? ILE A 150 VAL A 157 1 ? 8 HELX_P HELX_P4 4 GLY A 174 ? ASP A 191 ? GLY A 174 ASP A 191 1 ? 18 HELX_P HELX_P5 5 LYS A 209 ? ALA A 223 ? LYS A 209 ALA A 223 1 ? 15 HELX_P HELX_P6 6 ASP A 224 ? LYS A 227 ? ASP A 224 LYS A 227 5 ? 4 HELX_P HELX_P7 7 ALA A 239 ? ASN A 260 ? ALA A 239 ASN A 260 1 ? 22 HELX_P HELX_P8 8 ASP A 270 ? LEU A 285 ? ASP A 270 LEU A 285 1 ? 16 HELX_P HELX_P9 9 GLY A 290 ? TYR A 294 ? GLY A 290 TYR A 294 5 ? 5 HELX_P HELX_P10 10 ASP A 297 ? ARG A 308 ? ASP A 297 ARG A 308 1 ? 12 HELX_P HELX_P11 11 ASN A 313 ? GLY A 317 ? ASN A 313 GLY A 317 5 ? 5 HELX_P HELX_P12 12 ALA A 336 ? THR A 346 ? ALA A 336 THR A 346 1 ? 11 HELX_P HELX_P13 13 GLU A 353 ? GLY A 360 ? GLU A 353 GLY A 360 1 ? 8 HELX_P HELX_P14 14 VAL A 374 ? GLN A 379 ? VAL A 374 GLN A 379 5 ? 6 HELX_P HELX_P15 15 THR A 380 ? ALA A 402 ? THR A 380 ALA A 402 1 ? 23 HELX_P HELX_P16 16 ASP A 411 ? LYS A 429 ? ASP A 411 LYS A 429 1 ? 19 HELX_P HELX_P17 17 ALA A 437 ? ARG A 450 ? ALA A 437 ARG A 450 1 ? 14 HELX_P HELX_P18 18 TYR A 452 ? LEU A 456 ? TYR A 452 LEU A 456 5 ? 5 HELX_P HELX_P19 19 GLU A 457 ? GLN A 475 ? GLU A 457 GLN A 475 1 ? 19 HELX_P HELX_P20 20 HIS A 476 ? GLY A 487 ? HIS A 476 GLY A 487 1 ? 12 HELX_P HELX_P21 21 SER A 490 ? GLU A 509 ? SER A 490 GLU A 509 1 ? 20 HELX_P HELX_P22 22 ILE B 150 ? VAL B 157 ? ILE B 150 VAL B 157 1 ? 8 HELX_P HELX_P23 23 GLY B 174 ? ASP B 191 ? GLY B 174 ASP B 191 1 ? 18 HELX_P HELX_P24 24 LYS B 209 ? ALA B 223 ? LYS B 209 ALA B 223 1 ? 15 HELX_P HELX_P25 25 ALA B 225 ? LYS B 227 ? ALA B 225 LYS B 227 5 ? 3 HELX_P HELX_P26 26 ALA B 239 ? ASP B 259 ? ALA B 239 ASP B 259 1 ? 21 HELX_P HELX_P27 27 ASP B 270 ? LEU B 285 ? ASP B 270 LEU B 285 1 ? 16 HELX_P HELX_P28 28 GLY B 290 ? TYR B 294 ? GLY B 290 TYR B 294 5 ? 5 HELX_P HELX_P29 29 ASP B 297 ? ARG B 308 ? ASP B 297 ARG B 308 1 ? 12 HELX_P HELX_P30 30 ASN B 313 ? GLY B 317 ? ASN B 313 GLY B 317 5 ? 5 HELX_P HELX_P31 31 ALA B 336 ? THR B 346 ? ALA B 336 THR B 346 1 ? 11 HELX_P HELX_P32 32 GLU B 353 ? GLY B 360 ? GLU B 353 GLY B 360 1 ? 8 HELX_P HELX_P33 33 THR B 380 ? GLU B 399 ? THR B 380 GLU B 399 1 ? 20 HELX_P HELX_P34 34 ASP B 411 ? LYS B 429 ? ASP B 411 LYS B 429 1 ? 19 HELX_P HELX_P35 35 ALA B 437 ? ARG B 450 ? ALA B 437 ARG B 450 1 ? 14 HELX_P HELX_P36 36 TYR B 452 ? LEU B 456 ? TYR B 452 LEU B 456 5 ? 5 HELX_P HELX_P37 37 GLU B 457 ? GLN B 475 ? GLU B 457 GLN B 475 1 ? 19 HELX_P HELX_P38 38 HIS B 476 ? GLY B 487 ? HIS B 476 GLY B 487 1 ? 12 HELX_P HELX_P39 39 SER B 490 ? GLY B 507 ? SER B 490 GLY B 507 1 ? 18 HELX_P HELX_P40 40 ILE C 150 ? VAL C 157 ? ILE C 150 VAL C 157 1 ? 8 HELX_P HELX_P41 41 GLY C 174 ? GLN C 186 ? GLY C 174 GLN C 186 1 ? 13 HELX_P HELX_P42 42 GLN C 186 ? ASP C 191 ? GLN C 186 ASP C 191 1 ? 6 HELX_P HELX_P43 43 LYS C 209 ? ALA C 223 ? 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SER C 490 ALA C 510 1 ? 21 HELX_P HELX_P58 58 GLY D 91 ? LEU D 95 ? GLY D 87 LEU D 91 5 ? 5 HELX_P HELX_P59 59 GLU D 126 ? MET D 130 ? GLU D 122 MET D 126 5 ? 5 HELX_P HELX_P60 60 ILE D 141 ? ALA D 148 ? ILE D 137 ALA D 144 1 ? 8 HELX_P HELX_P61 61 GLY D 165 ? VAL D 177 ? GLY D 161 VAL D 173 1 ? 13 HELX_P HELX_P62 62 ARG D 193 ? GLY D 208 ? ARG D 189 GLY D 204 1 ? 16 HELX_P HELX_P63 63 PRO D 229 ? GLN D 250 ? PRO D 225 GLN D 246 1 ? 22 HELX_P HELX_P64 64 ASN D 261 ? LEU D 276 ? ASN D 257 LEU D 272 1 ? 16 HELX_P HELX_P65 65 SER D 281 ? TYR D 285 ? SER D 277 TYR D 281 5 ? 5 HELX_P HELX_P66 66 THR D 288 ? GLU D 298 ? THR D 284 GLU D 294 1 ? 11 HELX_P HELX_P67 67 VAL D 316 ? ASP D 320 ? VAL D 312 ASP D 316 5 ? 5 HELX_P HELX_P68 68 ASP D 323 ? HIS D 332 ? ASP D 319 HIS D 328 1 ? 10 HELX_P HELX_P69 69 SER D 340 ? LEU D 346 ? SER D 336 LEU D 342 1 ? 7 HELX_P HELX_P70 70 VAL D 367 ? GLY D 396 ? VAL D 363 GLY D 392 1 ? 30 HELX_P HELX_P71 71 GLU D 403 ? SER D 419 ? 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? -65.04 -73.43 235 1 THR G 247 ? ? -63.66 2.53 236 1 PHE G 250 ? ? -47.98 -86.34 237 1 ASN G 251 ? ? -37.72 -38.09 238 1 VAL G 257 ? ? -56.26 -83.14 239 1 ILE G 258 ? ? -26.68 -53.11 240 1 SER G 267 ? ? 38.56 40.29 241 1 ALA G 269 ? ? -166.85 -9.55 242 1 ALA G 270 ? ? -91.86 -113.26 243 1 ALA H 44 ? ? -143.38 -132.76 244 1 PHE H 45 ? ? 147.68 156.24 245 1 ALA H 49 ? ? -46.63 72.81 246 1 ALA H 50 ? ? 130.36 -2.58 247 1 HIS H 51 ? ? -19.08 145.63 248 1 VAL H 52 ? ? -38.81 159.41 249 1 LEU H 58 ? ? -73.17 -121.66 250 1 ARG H 59 ? ? 138.47 148.32 251 1 ASP H 69 ? ? -34.06 -18.69 252 1 ASP H 87 ? ? -67.37 -177.35 253 1 SER H 88 ? ? -53.40 -8.10 254 1 ASP H 101 ? ? -32.12 -27.87 255 1 ASP H 124 ? ? 63.57 161.42 256 1 ALA I 2 ? ? -159.02 -27.40 257 1 TRP I 4 ? ? -165.40 -52.93 258 1 GLN I 6 ? ? 4.86 -94.40 259 1 LEU I 9 ? ? 80.06 112.18 260 1 ALA I 25 ? ? -76.83 -151.12 261 1 LEU I 26 ? ? 92.44 150.08 262 1 SER I 40 ? ? -139.04 -58.62 263 1 LYS I 43 ? ? -166.91 99.26 264 1 LYS I 46 ? ? -147.83 20.51 265 1 ASN J 39 ? ? 69.47 161.87 266 1 GLN J 44 ? ? 71.85 157.57 267 1 GLN J 45 ? ? 91.65 -52.10 268 1 ASN K 39 ? ? 66.24 165.08 269 1 GLN K 44 ? ? 66.67 169.17 270 1 GLN K 45 ? ? 64.98 -73.35 271 1 THR L 4 ? ? -91.22 34.54 272 1 ALA L 5 ? ? -138.70 -58.97 273 1 PHE L 29 ? ? -80.88 38.46 274 1 ASN L 39 ? ? 64.48 166.78 275 1 SER L 41 ? ? -102.98 60.79 276 1 GLN L 44 ? ? 69.57 -28.07 277 1 GLN L 45 ? ? -115.92 -74.66 278 1 LEU L 72 ? ? -148.85 -54.53 279 1 ASN M 39 ? ? 63.79 164.36 280 1 GLN M 44 ? ? -148.15 -77.15 281 1 ILE M 71 ? ? -92.15 37.31 282 1 LEU M 72 ? ? -147.96 -14.22 283 1 ILE N 9 ? ? -101.72 48.53 284 1 ASN N 39 ? ? 66.18 166.35 285 1 GLN N 44 ? ? 61.90 179.21 286 1 GLN N 45 ? ? 65.75 -59.88 287 1 LEU N 72 ? ? -93.55 -66.11 288 1 ASN O 39 ? ? 62.74 -177.72 289 1 SER O 41 ? ? -69.36 78.94 290 1 LEU O 42 ? ? -72.53 -77.08 291 1 GLN O 44 ? ? 80.49 154.85 292 1 GLN O 45 ? ? 68.43 -68.17 293 1 ASN P 39 ? ? 63.58 163.43 294 1 LEU P 42 ? ? -65.56 -78.29 295 1 GLN P 44 ? ? 70.21 154.48 296 1 GLN P 45 ? 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? -22.82 -66.60 358 1 CYS U 100 ? ? -59.63 -119.55 359 1 ALA U 101 ? ? -12.30 -72.08 360 1 PHE U 103 ? ? -142.53 -20.72 361 1 LEU U 104 ? ? -37.34 -72.82 362 1 ASN U 123 ? ? -111.83 -104.88 363 1 THR V 25 ? ? -103.19 -82.62 364 1 SER V 26 ? ? -148.95 -74.28 365 1 PRO V 29 ? ? -93.00 31.92 366 1 ALA V 32 ? ? -172.31 -25.83 367 1 MET V 56 ? ? -65.42 20.02 368 1 GLU V 70 ? ? -127.94 -117.55 369 1 ASN W 35 ? ? -92.31 43.58 370 1 ARG W 36 ? ? -164.65 -37.96 371 1 ASN W 40 ? ? 47.27 -161.11 372 1 SER W 63 ? ? 48.95 -124.69 373 1 PHE W 92 ? ? -163.74 -42.22 374 1 THR W 95 ? ? -121.30 -59.72 375 1 ALA W 123 ? ? -156.30 60.23 376 1 LEU W 129 ? ? -160.52 91.71 377 1 PHE W 150 ? ? -135.65 -68.12 378 1 MET W 182 ? ? -111.23 70.26 379 1 SER W 183 ? ? -73.76 48.53 380 1 SER W 185 ? ? 65.85 75.72 381 1 GLU W 203 ? ? -92.02 -79.01 # loop_ _pdbx_validate_peptide_omega.id _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_model_num _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.omega 1 1 PHE A 406 ? ? GLY A 407 ? ? -147.84 2 1 SER B 123 ? ? LYS B 124 ? ? -149.66 3 1 GLN B 379 ? ? THR B 380 ? ? -147.50 4 1 GLU B 399 ? ? VAL B 400 ? ? -143.18 5 1 GLY C 174 ? ? LYS C 175 ? ? -148.86 6 1 HIS C 476 ? ? GLN C 477 ? ? 146.95 7 1 PHE E 25 ? ? ASP E 26 ? ? -147.69 8 1 ALA F 158 ? ? GLY F 159 ? ? 148.40 9 1 ASP G 195 ? ? ILE G 196 ? ? -146.53 10 1 ALA H 144 ? ? LEU H 145 ? ? -139.05 11 1 ALA S 52 ? ? ALA S 53 ? ? -135.48 12 1 GLU S 151 ? ? VAL S 152 ? ? -146.97 13 1 VAL S 152 ? ? LYS S 153 ? ? 127.70 14 1 PRO S 156 ? ? SER S 157 ? ? -123.36 15 1 PRO T 22 ? ? GLU T 23 ? ? -149.62 16 1 ASP T 50 ? ? LYS T 51 ? ? -133.77 17 1 VAL T 149 ? ? GLN T 150 ? ? -145.89 18 1 ALA T 154 ? ? GLN T 155 ? ? 137.59 19 1 LYS T 173 ? ? LYS T 174 ? ? 146.23 20 1 ARG U 3 ? ? LYS U 4 ? ? 140.09 21 1 LYS U 8 ? ? THR U 9 ? ? 119.67 22 1 ASP U 11 ? ? TRP U 12 ? ? -137.92 23 1 GLY U 16 ? ? GLU U 17 ? ? -148.17 24 1 GLU U 17 ? ? ILE U 18 ? ? -139.95 25 1 PRO U 20 ? ? ARG U 21 ? ? -126.55 26 1 LEU U 44 ? ? PRO U 45 ? ? 148.53 27 1 ASN U 59 ? ? VAL U 60 ? ? 136.69 28 1 ALA U 61 ? ? LYS U 62 ? ? 143.68 29 1 ASP U 83 ? ? LYS U 84 ? ? -140.59 30 1 GLU U 95 ? ? ASP U 96 ? ? 103.14 31 1 ASP U 96 ? ? VAL U 97 ? ? 134.36 32 1 VAL U 97 ? ? LYS U 98 ? ? 149.54 33 1 LYS U 98 ? ? SER U 99 ? ? 139.37 34 1 PHE U 103 ? ? LEU U 104 ? ? 144.39 35 1 GLU U 115 ? ? LYS U 116 ? ? 148.45 36 1 ASP V 6 ? ? PRO V 7 ? ? 145.12 37 1 GLN V 9 ? ? LYS V 10 ? ? 145.38 38 1 GLU V 18 ? ? TYR V 19 ? ? 147.40 39 1 THR V 25 ? ? SER V 26 ? ? 139.82 40 1 ASP V 31 ? ? ALA V 32 ? ? -143.79 41 1 ASN V 61 ? ? PHE V 62 ? ? -145.28 42 1 PHE V 64 ? ? GLU V 65 ? ? -137.73 43 1 ASN W 35 ? ? ARG W 36 ? ? 119.08 # loop_ _pdbx_validate_main_chain_plane.id _pdbx_validate_main_chain_plane.PDB_model_num _pdbx_validate_main_chain_plane.auth_comp_id _pdbx_validate_main_chain_plane.auth_asym_id _pdbx_validate_main_chain_plane.auth_seq_id _pdbx_validate_main_chain_plane.PDB_ins_code _pdbx_validate_main_chain_plane.label_alt_id _pdbx_validate_main_chain_plane.improper_torsion_angle 1 1 ASP A 238 ? ? -10.43 2 1 ASP A 333 ? ? 10.58 3 1 SER B 123 ? ? 12.73 4 1 ARG B 398 ? ? 10.50 5 1 GLU B 399 ? ? 12.19 6 1 LEU B 505 ? ? -12.26 7 1 THR C 173 ? ? 10.08 8 1 GLY C 174 ? ? 12.04 9 1 ASP D 319 ? ? 11.81 10 1 MET D 393 ? ? 11.59 11 1 SER D 397 ? ? 14.28 12 1 PHE E 25 ? ? 13.32 13 1 TYR E 311 ? ? 11.65 14 1 SER E 397 ? ? 10.63 15 1 THR F 318 ? ? -10.17 16 1 SER F 397 ? ? 11.45 17 1 PHE G 155 ? ? -11.34 18 1 ASP G 182 ? ? 13.54 19 1 ASP G 195 ? ? 12.57 20 1 ASN S 57 ? ? -10.13 21 1 LEU S 89 ? ? 10.00 22 1 SER S 157 ? ? -10.36 23 1 MET S 159 ? ? 10.00 24 1 GLY S 161 ? ? 11.65 25 1 GLY T 46 ? ? -10.16 26 1 LYS T 51 ? ? 10.53 27 1 HIS T 89 ? ? -16.56 28 1 ARG T 96 ? ? 19.74 29 1 ASN T 97 ? ? -12.08 30 1 GLN T 137 ? ? -13.95 31 1 LYS T 163 ? ? -10.80 32 1 LYS T 169 ? ? 10.53 33 1 ARG U 3 ? ? -12.20 34 1 LYS U 8 ? ? -10.82 35 1 THR U 9 ? ? 13.95 36 1 ILE U 19 ? ? -12.90 37 1 PRO U 20 ? ? 14.83 38 1 THR U 43 ? ? 10.24 39 1 ASN U 59 ? ? -12.93 40 1 GLY U 64 ? ? -13.11 41 1 PRO U 81 ? ? -12.28 42 1 GLU U 92 ? ? -13.70 43 1 GLU U 95 ? ? -12.63 44 1 ASP U 96 ? ? -16.92 45 1 THR U 109 ? ? -13.86 46 1 GLU U 113 ? ? -11.03 47 1 GLU U 115 ? ? -16.66 48 1 GLU U 117 ? ? -10.52 49 1 PHE V 12 ? ? -11.85 50 1 ARG V 17 ? ? -10.05 51 1 GLU V 18 ? ? -12.55 52 1 ALA V 32 ? ? -15.12 53 1 GLU V 35 ? ? -13.20 54 1 LYS V 46 ? ? -11.38 55 1 PHE V 64 ? ? 13.98 56 1 GLU V 70 ? ? 10.20 57 1 SER W 63 ? ? -11.56 58 1 GLY W 132 ? ? -11.02 59 1 THR W 133 ? ? 11.67 60 1 ARG W 159 ? ? -12.11 # _pdbx_database_remark.id 700 _pdbx_database_remark.text ; SHEET DETERMINATION METHOD: DSSP THE SHEETS PRESENTED AS "AA" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN 10-STRANDED BARREL THIS IS REPRESENTED BY A 11-STRANDED SHEET IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL. SHEET DETERMINATION METHOD: DSSP THE SHEETS PRESENTED AS "BA" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN 6-STRANDED BARREL THIS IS REPRESENTED BY A 7-STRANDED SHEET IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL. SHEET DETERMINATION METHOD: DSSP THE SHEETS PRESENTED AS "CA" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN 10-STRANDED BARREL THIS IS REPRESENTED BY A 11-STRANDED SHEET IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL. SHEET DETERMINATION METHOD: DSSP THE SHEETS PRESENTED AS "FA" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN 6-STRANDED BARREL THIS IS REPRESENTED BY A 7-STRANDED SHEET IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL. ; # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 5FIL _em_3d_fitting.ref_protocol 'FLEXIBLE FIT' _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details 'METHOD--FLEXIBLE FITTING' _em_3d_fitting.method ? # loop_ _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id _em_3d_fitting_list.id _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id _em_3d_fitting_list.details _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id _em_3d_fitting_list.chain_id _em_3d_fitting_list.chain_residue_range _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range _em_3d_fitting_list.source_name _em_3d_fitting_list.type _em_3d_fitting_list.accession_code 1 1 2WSS ? ? 1 ? ? ? PDB 'experimental model' 2WSS 1 2 2XND ? ? 2 ? ? ? PDB 'experimental model' 2XND 1 3 2CLY ? ? 3 ? ? ? PDB 'experimental model' 2CLY # _em_3d_reconstruction.entry_id 5FIL _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.num_particles 22117 _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.method 'PROJECTION MATCHING AND MAXIMUM LIKELIHOOD CLASSIFICATION' _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.resolution 7.1 _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.details 'SUBMISSION BASED ON EXPERIMENTAL DATA FROM EMDB EMD-3170. (DEPOSITION ID: 13802).' _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.resolution_method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name '20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) GLYCEROL, 0.05% (WT/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3' _em_buffer.pH 7.2 _em_buffer.details '20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) GLYCEROL, 0.05% (WT/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3' # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.name 'BOVINE MITOCHONDRIAL ATP SYNTHASE' _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_imaging.entry_id 5FIL _em_imaging.id 1 _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.date 2015-03-15 _em_imaging.temperature 80 _em_imaging.nominal_defocus_min 1200 _em_imaging.nominal_defocus_max 4100 _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.nominal_magnification 18000 _em_imaging.calibrated_magnification 30487 _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.details ;K2 SUMMIT DIRECT DETECTOR DEVICE (GATAN INC.) OPERATED IN SUPER-RESOLUTION MODE WITH A 1.64 ANGSTROM PHYSICAL PIXEL AND 0. 82 ANGSTROM SUPER- RESOLUTION PIXEL. WITH NO SPECIMEN PRESENT, THE RATE OF EXPOSURE OF THE DETECTOR WAS 8 ELECTRONS PER PIXEL PER SECOND. EXPOSURE- FRACTIONATED MOVIES OF 20.1 S WERE RECORDED AS STACKS OF 67 FRAMES, SO THAT SELECTED SPECIMEN AREAS WERE EXPOSED WITH A TOTAL OF 60.3 ELECTRONS PER SQUARE ANGSTROM. ; _em_imaging.specimen_holder_type . _em_imaging.specimen_holder_model . _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details 'HOLEY CARBON' _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type ? # _em_vitrification.entry_id 5FIL _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK III' _em_vitrification.cryogen_name ETHANE-PROPANE _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.details ;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING, ; _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 5FIL _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' # _em_single_particle_entity.entry_id 5FIL _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A GLN 1 ? 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C THR 5 37 1 Y 1 C ALA 6 ? C ALA 6 38 1 Y 1 C GLU 7 ? C GLU 7 39 1 Y 1 C VAL 8 ? C VAL 8 40 1 Y 1 C SER 9 ? C SER 9 41 1 Y 1 C SER 10 ? C SER 10 42 1 Y 1 C ILE 11 ? C ILE 11 43 1 Y 1 C LEU 12 ? C LEU 12 44 1 Y 1 C GLU 13 ? C GLU 13 45 1 Y 1 C GLU 14 ? C GLU 14 46 1 Y 1 C ARG 15 ? C ARG 15 47 1 Y 1 C ILE 16 ? C ILE 16 48 1 Y 1 C LEU 17 ? C LEU 17 49 1 Y 1 C GLY 18 ? C GLY 18 50 1 Y 1 C ALA 19 ? C ALA 19 51 1 Y 1 C ASP 20 ? C ASP 20 52 1 Y 1 C THR 21 ? C THR 21 53 1 Y 1 C SER 22 ? C SER 22 54 1 Y 1 C VAL 23 ? C VAL 23 55 1 Y 1 D ALA -3 ? D ALA 1 56 1 Y 1 D ALA -2 ? D ALA 2 57 1 Y 1 D GLN -1 ? D GLN 3 58 1 Y 1 D ALA 0 ? D ALA 4 59 1 Y 1 D SER 1 ? D SER 5 60 1 Y 1 D PRO 2 ? D PRO 6 61 1 Y 1 D SER 3 ? D SER 7 62 1 Y 1 D PRO 4 ? D PRO 8 63 1 Y 1 D LYS 5 ? D LYS 9 64 1 Y 1 D ALA 6 ? D ALA 10 65 1 Y 1 D GLY 7 ? D GLY 11 66 1 Y 1 D ALA 8 ? D ALA 12 67 1 Y 1 D GLU 476 ? D GLU 480 68 1 Y 1 D HIS 477 ? D HIS 481 69 1 Y 1 D SER 478 ? D SER 482 70 1 Y 1 E ALA -3 ? E ALA 1 71 1 Y 1 E ALA -2 ? 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