data_5FUU # _entry.id 5FUU # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.397 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 5FUU pdb_00005fuu 10.2210/pdb5fuu/pdb PDBE EBI-66152 ? ? WWPDB D_1290066152 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2016-03-09 2 'Structure model' 1 1 2016-03-16 3 'Structure model' 1 2 2017-08-02 4 'Structure model' 2 0 2020-07-29 5 'Structure model' 2 1 2024-10-23 # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 4 'Structure model' repository Remediation 'Carbohydrate remediation' ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Database references' 2 3 'Structure model' 'Data collection' 3 4 'Structure model' Advisory 4 4 'Structure model' 'Atomic model' 5 4 'Structure model' 'Data collection' 6 4 'Structure model' 'Derived calculations' 7 4 'Structure model' Other 8 4 'Structure model' 'Structure summary' 9 5 'Structure model' 'Data collection' 10 5 'Structure model' 'Database references' 11 5 'Structure model' 'Refinement description' 12 5 'Structure model' 'Structure summary' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 3 'Structure model' em_image_scans 2 3 'Structure model' em_software 3 4 'Structure model' atom_site 4 4 'Structure model' chem_comp 5 4 'Structure model' entity 6 4 'Structure model' pdbx_branch_scheme 7 4 'Structure model' pdbx_chem_comp_identifier 8 4 'Structure model' pdbx_database_status 9 4 'Structure model' pdbx_entity_branch 10 4 'Structure model' pdbx_entity_branch_descriptor 11 4 'Structure model' pdbx_entity_branch_link 12 4 'Structure model' pdbx_entity_branch_list 13 4 'Structure model' pdbx_entity_nonpoly 14 4 'Structure model' pdbx_nonpoly_scheme 15 4 'Structure model' pdbx_struct_assembly_gen 16 4 'Structure model' pdbx_validate_close_contact 17 4 'Structure model' struct_asym 18 4 'Structure model' struct_conn 19 4 'Structure model' struct_site 20 4 'Structure model' struct_site_gen 21 5 'Structure model' chem_comp 22 5 'Structure model' chem_comp_atom 23 5 'Structure model' chem_comp_bond 24 5 'Structure model' database_2 25 5 'Structure model' pdbx_entry_details 26 5 'Structure model' pdbx_modification_feature 27 5 'Structure model' refine # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 3 'Structure model' '_em_software.fitting_id' 2 3 'Structure model' '_em_software.image_processing_id' 3 3 'Structure model' '_em_software.name' 4 4 'Structure model' '_atom_site.Cartn_x' 5 4 'Structure model' '_atom_site.Cartn_y' 6 4 'Structure model' '_atom_site.Cartn_z' 7 4 'Structure model' '_atom_site.auth_asym_id' 8 4 'Structure model' '_atom_site.auth_atom_id' 9 4 'Structure model' '_atom_site.auth_comp_id' 10 4 'Structure model' '_atom_site.auth_seq_id' 11 4 'Structure model' '_atom_site.label_asym_id' 12 4 'Structure model' '_atom_site.label_atom_id' 13 4 'Structure model' '_atom_site.label_comp_id' 14 4 'Structure model' '_atom_site.label_entity_id' 15 4 'Structure model' '_atom_site.type_symbol' 16 4 'Structure model' '_chem_comp.name' 17 4 'Structure model' '_chem_comp.type' 18 4 'Structure model' '_pdbx_database_status.pdb_format_compatible' 19 4 'Structure model' '_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list' 20 4 'Structure model' '_pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1' 21 4 'Structure model' '_pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2' 22 4 'Structure model' '_pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1' 23 4 'Structure model' '_pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2' 24 4 'Structure model' '_struct_conn.pdbx_dist_value' 25 4 'Structure model' '_struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag' 26 4 'Structure model' '_struct_conn.pdbx_role' 27 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id' 28 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id' 29 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id' 30 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_asym_id' 31 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_atom_id' 32 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_comp_id' 33 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_seq_id' 34 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id' 35 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id' 36 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id' 37 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_asym_id' 38 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_comp_id' 39 5 'Structure model' '_chem_comp.pdbx_synonyms' 40 5 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 41 5 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' 42 5 'Structure model' '_pdbx_entry_details.has_protein_modification' 43 5 'Structure model' '_refine.ls_d_res_high' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.entry_id 5FUU _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.SG_entry . _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2016-01-29 _pdbx_database_status.pdb_format_compatible N _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.db_id EMD-3308 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' _pdbx_database_related.details . # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Lee, J.H.' 1 'Ward, A.B.' 2 # _citation.id primary _citation.title 'Cryo-Em Structure of a Native, Fully Glycosylated and Cleaved HIV-1 Envelope Trimer' _citation.journal_abbrev Science _citation.journal_volume 351 _citation.page_first 1043 _citation.page_last ? _citation.year 2016 _citation.journal_id_ASTM SCIEAS _citation.country US _citation.journal_id_ISSN 0036-8075 _citation.journal_id_CSD 0038 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 26941313 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1126/SCIENCE.AAD2450 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Lee, J.H.' 1 ? primary 'Ozorowski, G.' 2 ? primary 'Ward, A.B.' 3 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'HIV-1 ENVELOPE GLYCOPROTEIN GP160' 53342.355 3 ? YES 'GP120, RESIDUES 30-502' 'GP120 OF JR-FL ENV' 2 polymer man 'HIV-1 ENVELOPE GLYCOPROTEIN GP160' 17243.592 3 ? ? 'GP41, RESIDUES 503-655' 'GP41 ECTODOMAIN OF JR-FL ENV' 3 polymer man 'IMMUNOGLOBULIN G PGT151' 26087.438 2 ? ? 'FAB HEAVY CHAIN VARIABLE REGION, RESIDUES 1-218' 'PGT151 CLEAVED INTO FAB' 4 polymer man 'IMMUNOGLOBULIN G PGT151' 24057.809 2 ? ? 'FAB LIGHT CHAIN VARIABLE REGION, RESIDUES 1-214' 'PGT151 CLEAVED INTO FAB' 5 branched man '2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose' 424.401 22 ? ? ? ? 6 branched man 'beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose' 586.542 19 ? ? ? ? 7 branched man ;alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-3)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; 1235.105 3 ? ? ? ? 8 branched man ;beta-D-galactopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-2)-[beta-D-galactopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-6)]alpha-D-mannopyranose-(1-6)-[2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; 1990.824 2 ? ? ? ? 9 branched man ;beta-D-galactopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-2)-[beta-D-galactopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)]alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[beta-D-galactopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-2)-[2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-6)]alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; 2356.157 1 ? ? ? ? 10 branched man ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; 910.823 1 ? ? ? ? 11 branched man ;alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; 1397.245 2 ? ? ? ? 12 branched man '2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose' 570.542 1 ? ? ? ? 13 branched man ;alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; 1072.964 1 ? ? ? ? 14 branched man ;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; 748.682 1 ? ? ? ? 15 branched man ;beta-D-galactopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-2)-[beta-D-galactopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)]alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-2)-[2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-6)]alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; 2194.017 1 ? ? ? ? 16 non-polymer man 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose 221.208 10 ? ? ? ? # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;TEKLWVTVYYGVPVWKEATTTLFCASDAKAYDTEVHNVWATHACVPTDPNPQEVVLENVTEHFNMWKNNMVEQMQEDIIS LWDQSLKPCVKLTPLCVTLNCKDVNATNTTNDSEGTMERGEIKNCSFNITTSIRDEVQKEYALFYKLDVVPIDNNNTSYR LISCDTSVITQACPKISFEPIPIHYCAPAGFAILKCNDKTFNGKGPCKNVSTVQCTHGIRPVVSTQLLLNGSLAEEEVVI RSDNFTNNAKTIIVQLKESVEINCTRPNNNTRKSIHIGPGRAFYTTGEIIGDIRQAHCNISRAKWNDTLKQIVIKLREQF ENKTIVFNHSSGGDPEIVMHSFNCGGEFFYCNSTQLFNSTWNNNTEGSNNTEGNTITLPCRIKQIINMWQEVGKAMYAPP IRGQIRCSSNITGLLLTRDGGINENGTEIFRPGGGDMRDNWRSELYKYKVVKIEPLGVAPTKAKRRVVQREKR ; ;TEKLWVTVYYGVPVWKEATTTLFCASDAKAYDTEVHNVWATHACVPTDPNPQEVVLENVTEHFNMWKNNMVEQMQEDIIS LWDQSLKPCVKLTPLCVTLNCKDVNATNTTNDSEGTMERGEIKNCSFNITTSIRDEVQKEYALFYKLDVVPIDNNNTSYR LISCDTSVITQACPKISFEPIPIHYCAPAGFAILKCNDKTFNGKGPCKNVSTVQCTHGIRPVVSTQLLLNGSLAEEEVVI RSDNFTNNAKTIIVQLKESVEINCTRPNNNTRKSIHIGPGRAFYTTGEIIGDIRQAHCNISRAKWNDTLKQIVIKLREQF ENKTIVFNHSSGGDPEIVMHSFNCGGEFFYCNSTQLFNSTWNNNTEGSNNTEGNTITLPCRIKQIINMWQEVGKAMYAPP IRGQIRCSSNITGLLLTRDGGINENGTEIFRPGGGDMRDNWRSELYKYKVVKIEPLGVAPTKAKRRVVQREKR ; A,C,E ? 2 'polypeptide(L)' no no ;AVGIGAVFLGFLGAAGSTMGAASMTLTVQARLLLSGIVQQQNNLLRAIEAQQRMLQLTVWGIKQLQARVLAVERYLGDQQ LLGIWGCSGKLICTTAVPWNASWSNKSLDRIWNNMTWMEWEREIDNYTSEIYTLIEESQNQQEKNEQELLELD ; ;AVGIGAVFLGFLGAAGSTMGAASMTLTVQARLLLSGIVQQQNNLLRAIEAQQRMLQLTVWGIKQLQARVLAVERYLGDQQ LLGIWGCSGKLICTTAVPWNASWSNKSLDRIWNNMTWMEWEREIDNYTSEIYTLIEESQNQQEKNEQELLELD ; B,D,F ? 3 'polypeptide(L)' no no ;RVQLVESGGGVVQPGKSVRLSCVVSDFPFSKYPMYWVRQAPGKGLEWVAAISGDAWHVVYSNSVQGRFLVSRDNVKNTLY LEMNSLKIEDTAVYRCARMFQESGPPRLDRWSGRNYYYYSGMDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAAL GCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDK ; ;RVQLVESGGGVVQPGKSVRLSCVVSDFPFSKYPMYWVRQAPGKGLEWVAAISGDAWHVVYSNSVQGRFLVSRDNVKNTLY LEMNSLKIEDTAVYRCARMFQESGPPRLDRWSGRNYYYYSGMDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAAL GCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDK ; H,M ? 4 'polypeptide(L)' no no ;DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISCKSSESLRQSNGKTSLYWYRQKPGQSPQLLVFEVSNRFSGVSDRFVGSGSGTDFTLRI SRVEAEDVGFYYCMQSKDFPLTFGGGTKVDLKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQ SGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC ; ;DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISCKSSESLRQSNGKTSLYWYRQKPGQSPQLLVFEVSNRFSGVSDRFVGSGSGTDFTLRI SRVEAEDVGFYYCMQSKDFPLTFGGGTKVDLKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQ SGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC ; L,N ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 16 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 THR n 1 2 GLU n 1 3 LYS n 1 4 LEU n 1 5 TRP n 1 6 VAL n 1 7 THR n 1 8 VAL n 1 9 TYR n 1 10 TYR n 1 11 GLY n 1 12 VAL n 1 13 PRO n 1 14 VAL n 1 15 TRP n 1 16 LYS n 1 17 GLU n 1 18 ALA n 1 19 THR n 1 20 THR n 1 21 THR n 1 22 LEU n 1 23 PHE n 1 24 CYS n 1 25 ALA n 1 26 SER n 1 27 ASP n 1 28 ALA n 1 29 LYS n 1 30 ALA n 1 31 TYR n 1 32 ASP n 1 33 THR n 1 34 GLU n 1 35 VAL n 1 36 HIS n 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MAN 6 C MAN 1453 n PA 11 MAN 7 p MAN 7 C MAN 1454 n PA 11 MAN 8 p MAN 8 C MAN 1455 n QA 12 NAG 1 q NAG 1 D NAG 1611 n QA 12 NAG 2 q NAG 2 D NAG 1612 n QA 12 FUC 3 q FUC 3 D FUC 1613 n RA 5 NAG 1 r NAG 1 D NAG 1625 n RA 5 NAG 2 r NAG 2 D NAG 1626 n SA 5 NAG 1 s NAG 1 D NAG 1637 n SA 5 NAG 2 s NAG 2 D NAG 1638 n TA 6 NAG 1 t NAG 1 E NAG 1088 n TA 6 NAG 2 t NAG 2 E NAG 1089 n TA 6 BMA 3 t BMA 3 E BMA 1090 n UA 5 NAG 1 u NAG 1 E NAG 1135 n UA 5 NAG 2 u NAG 2 E NAG 1136 n VA 6 NAG 1 v NAG 1 E NAG 1156 n VA 6 NAG 2 v NAG 2 E NAG 1157 n VA 6 BMA 3 v BMA 3 E BMA 1158 n WA 5 NAG 1 w NAG 1 E NAG 1160 n WA 5 NAG 2 w NAG 2 E NAG 1161 n XA 13 NAG 1 x NAG 1 E NAG 1241 n XA 13 NAG 2 x NAG 2 E NAG 1242 n XA 13 BMA 3 x BMA 3 E BMA 1243 n XA 13 MAN 4 x MAN 4 E MAN 1244 n XA 13 MAN 5 x MAN 5 E MAN 1245 n XA 13 MAN 6 x MAN 6 E MAN 1246 n YA 7 NAG 1 y NAG 1 E NAG 1262 n YA 7 NAG 2 y NAG 2 E NAG 1263 n YA 7 BMA 3 y BMA 3 E BMA 1264 n YA 7 MAN 4 y MAN 4 E MAN 1267 n YA 7 MAN 5 y MAN 5 E MAN 1268 n YA 7 MAN 6 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_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code MB 16 NAG 1 1135 1135 NAG NAG A . 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VB N N 16 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP Q75760_9HIV1 1 ? ? Q75760 ? 2 UNP Q6BC19_9HIV1 2 ? ? Q6BC19 ? 3 PDB 5FUU 3 ? ? 5FUU ? 4 PDB 5FUU 4 ? ? 5FUU ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 5FUU A 1 ? 473 ? Q75760 30 ? 502 ? 31 511 2 2 5FUU B 1 ? 153 ? Q6BC19 503 ? 655 ? 512 664 3 1 5FUU C 1 ? 473 ? 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UNP Q75760 VAL 30 'engineered mutation' 31 3 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details decameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 10 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list ;A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB ; # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ALA A 40 ? 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N-Glycosylation covale11 covale one ? A ASN 306 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? A ASN 339 T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.399 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? A ASN 322 ND2 ? ? ? 1_555 NB NAG . C1 ? ? A ASN 355 A NAG 1355 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.393 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? A ASN 328 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? A ASN 362 U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.386 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? A ASN 352 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? A ASN 386 V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.419 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? A ASN 358 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? A ASN 392 W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? A ASN 363 ND2 ? ? ? 1_555 OB NAG . C1 ? ? A ASN 397 A NAG 1397 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? A ASN 410 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? A ASN 448 X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? B ASN 100 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? B ASN 611 Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? B ASN 105 ND2 ? ? ? 1_555 PB NAG . C1 ? ? B ASN 616 B NAG 1600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.465 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? B ASN 114 ND2 ? ? ? 1_555 QB NAG . C1 ? ? B ASN 625 B NAG 1625 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.420 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? B ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? B ASN 637 Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? C ASN 58 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? C ASN 88 a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.510 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? C ASN 105 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? C ASN 135 b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? C ASN 124 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? C ASN 156 c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.552 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? C ASN 128 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? C ASN 160 d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.423 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? C ASN 209 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? C ASN 241 e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? C ASN 230 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? C ASN 262 f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? C ASN 244 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? C ASN 276 g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? C ASN 263 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? C ASN 295 h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.405 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? C ASN 269 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? C ASN 301 i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? N-Glycosylation covale31 covale one ? C ASN 299 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? C ASN 332 j NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? N-Glycosylation covale32 covale one ? C ASN 306 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? C ASN 339 k NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale33 covale one ? C ASN 322 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? C ASN 355 l NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? N-Glycosylation covale34 covale one ? C ASN 328 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? C ASN 362 m NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale35 covale one ? C ASN 352 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? C ASN 386 n NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.384 ? N-Glycosylation covale36 covale one ? C ASN 358 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? C ASN 392 o NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale37 covale one ? C ASN 363 ND2 ? ? ? 1_555 RB NAG . C1 ? ? C ASN 397 C NAG 1397 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.410 ? N-Glycosylation covale38 covale one ? C ASN 410 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? C ASN 448 p NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale39 covale one ? D ASN 100 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? D ASN 611 q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? N-Glycosylation covale40 covale one ? D ASN 105 ND2 ? ? ? 1_555 SB NAG . C1 ? ? D ASN 616 D NAG 1600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? N-Glycosylation covale41 covale one ? D ASN 114 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? D ASN 625 r NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? N-Glycosylation covale42 covale one ? D ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? D ASN 637 s NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale43 covale one ? E ASN 58 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? E ASN 88 t NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.481 ? N-Glycosylation covale44 covale one ? E ASN 105 ND2 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? E ASN 135 u NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? N-Glycosylation covale45 covale one ? E ASN 124 ND2 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? E ASN 156 v NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.395 ? N-Glycosylation covale46 covale one ? E ASN 128 ND2 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? E ASN 160 w NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.384 ? N-Glycosylation covale47 covale one ? E ASN 155 ND2 ? ? ? 1_555 TB NAG . C1 ? ? E ASN 187 E NAG 1187 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale48 covale one ? E ASN 209 ND2 ? ? ? 1_555 XA NAG . C1 ? ? E ASN 241 x NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.347 ? N-Glycosylation covale49 covale one ? E ASN 230 ND2 ? ? ? 1_555 YA NAG . C1 ? ? E ASN 262 y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.413 ? N-Glycosylation covale50 covale one ? E ASN 244 ND2 ? ? ? 1_555 ZA NAG . C1 ? ? E ASN 276 z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.319 ? N-Glycosylation covale51 covale one ? E ASN 263 ND2 ? ? ? 1_555 AB NAG . C1 ? ? E ASN 295 0 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? N-Glycosylation covale52 covale one ? E ASN 269 ND2 ? ? ? 1_555 BB NAG . C1 ? ? E ASN 301 1 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? N-Glycosylation covale53 covale one ? E ASN 299 ND2 ? ? ? 1_555 CB NAG . C1 ? ? E ASN 332 2 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale54 covale one ? E ASN 306 ND2 ? ? ? 1_555 DB NAG . C1 ? ? E ASN 339 3 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.391 ? N-Glycosylation covale55 covale one ? E ASN 322 ND2 ? ? ? 1_555 EB NAG . C1 ? ? E ASN 355 4 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? N-Glycosylation covale56 covale one ? E ASN 328 ND2 ? ? ? 1_555 FB NAG . C1 ? ? E ASN 362 5 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? N-Glycosylation covale57 covale one ? E ASN 352 ND2 ? ? ? 1_555 GB NAG . C1 ? ? E ASN 386 6 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? N-Glycosylation covale58 covale one ? E ASN 358 ND2 ? ? ? 1_555 HB NAG . C1 ? ? E ASN 392 7 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale59 covale one ? E ASN 363 ND2 ? ? ? 1_555 UB NAG . C1 ? ? E ASN 397 E NAG 1397 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.421 ? N-Glycosylation covale60 covale one ? E ASN 410 ND2 ? ? ? 1_555 IB NAG . C1 ? ? E ASN 448 8 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? N-Glycosylation covale61 covale one ? F ASN 100 ND2 ? ? ? 1_555 JB NAG . C1 ? ? F ASN 611 9 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale62 covale one ? F ASN 105 ND2 ? ? ? 1_555 VB NAG . C1 ? ? F ASN 616 F NAG 1600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.410 ? N-Glycosylation covale63 covale one ? F ASN 114 ND2 ? ? ? 1_555 KB NAG . C1 ? ? F ASN 625 AA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale64 covale one ? F ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 LB NAG . C1 ? ? F ASN 637 BA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.366 ? N-Glycosylation covale65 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.388 ? ? covale66 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? I NAG 1 I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.387 ? ? covale67 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L BMA . C1 ? ? I NAG 2 I BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? ? covale68 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? J NAG 1 J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.385 ? ? covale69 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M BMA . C1 ? ? J NAG 2 J BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? ? covale70 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? K NAG 1 K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.386 ? ? covale71 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N BMA . C1 ? ? K NAG 2 K BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.403 ? ? covale72 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale73 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O BMA . C1 ? ? O NAG 2 O BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale74 covale both ? O BMA . O3 ? ? ? 1_555 O MAN . C1 ? ? O BMA 3 O MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale75 covale both ? O BMA . O6 ? ? ? 1_555 O MAN . C1 ? ? O BMA 3 O MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale76 covale both ? O MAN . O2 ? ? ? 1_555 O MAN . C1 ? ? O MAN 4 O MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale77 covale both ? O MAN . O3 ? ? ? 1_555 O MAN . C1 ? ? O MAN 6 O MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.385 ? ? covale78 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? P NAG 1 P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.388 ? ? covale79 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P BMA . C1 ? ? P NAG 2 P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale80 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? Q NAG 1 Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.388 ? ? covale81 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? R NAG 1 R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.387 ? ? covale82 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? S NAG 1 S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.387 ? ? covale83 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S BMA . C1 ? ? S NAG 2 S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale84 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? T NAG 1 T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.387 ? ? covale85 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? U NAG 1 U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.387 ? ? covale86 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U BMA . C1 ? ? U NAG 2 U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale87 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? V NAG 1 V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.388 ? ? covale88 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V BMA . C1 ? ? V NAG 2 V BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale89 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? W NAG 1 W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.386 ? ? covale90 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W BMA . C1 ? ? W NAG 2 W BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? ? covale91 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? X NAG 1 X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.387 ? ? covale92 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? Y NAG 1 Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.470 ? ? covale93 covale both ? Y NAG . O6 ? ? ? 1_555 Y FUC . C1 ? ? Y NAG 1 Y FUC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? ? covale94 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y BMA . C1 ? ? Y NAG 2 Y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? ? covale95 covale both ? Y BMA . O6 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y BMA 3 Y MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? ? covale96 covale both ? Y BMA . O3 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y BMA 3 Y MAN 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.465 ? ? covale97 covale both ? Y MAN . O2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? Y MAN 4 Y NAG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.473 ? ? covale98 covale both ? Y MAN . O6 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? Y MAN 4 Y NAG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.471 ? ? covale99 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y GAL . C1 ? ? Y NAG 5 Y GAL 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? ? covale100 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y GAL . C1 ? ? Y NAG 7 Y GAL 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.471 ? ? covale101 covale both ? Y MAN . O2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? Y MAN 9 Y NAG 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? ? covale102 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? Z NAG 1 Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? ? covale103 covale both ? Z NAG . O6 ? ? ? 1_555 Z FUC . C1 ? ? Z NAG 1 Z FUC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? ? covale104 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z BMA . C1 ? ? Z NAG 2 Z BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.465 ? ? covale105 covale both ? Z BMA . O3 ? ? ? 1_555 Z MAN . C1 ? ? Z BMA 3 Z MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.465 ? ? covale106 covale both ? Z BMA . O6 ? ? ? 1_555 Z MAN . C1 ? ? Z BMA 3 Z MAN 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? ? covale107 covale both ? Z MAN . O2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? Z MAN 4 Z NAG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.471 ? ? covale108 covale both ? Z MAN . O4 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? Z MAN 4 Z NAG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.473 ? ? covale109 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z GAL . C1 ? ? Z NAG 5 Z GAL 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.470 ? ? covale110 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z GAL . C1 ? ? Z NAG 7 Z GAL 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.471 ? ? covale111 covale both ? Z MAN . O2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? Z MAN 9 Z NAG 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.473 ? ? covale112 covale both ? Z MAN . O6 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? Z MAN 9 Z NAG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? ? covale113 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z GAL . C1 ? ? Z NAG 10 Z GAL 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? ? covale114 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? a NAG 1 a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.390 ? ? covale115 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA BMA . C1 ? ? a NAG 2 a BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale116 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? b NAG 1 b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.387 ? ? covale117 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? c NAG 1 c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.387 ? ? covale118 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? d NAG 1 d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.387 ? ? covale119 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA BMA . C1 ? ? d NAG 2 d BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale120 covale both ? EA NAG . O4 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? e NAG 1 e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.387 ? ? covale121 covale both ? EA NAG . O4 ? ? ? 1_555 EA BMA . C1 ? ? e NAG 2 e BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.403 ? ? covale122 covale both ? EA BMA . O3 ? ? ? 1_555 EA MAN . C1 ? ? e BMA 3 e MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.404 ? ? covale123 covale both ? EA BMA . O6 ? ? ? 1_555 EA MAN . C1 ? ? e BMA 3 e MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.403 ? ? covale124 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? f NAG 1 f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale125 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA BMA . C1 ? ? f NAG 2 f BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale126 covale both ? FA BMA . O3 ? ? ? 1_555 FA MAN . C1 ? ? f BMA 3 f MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale127 covale both ? FA BMA . O6 ? ? ? 1_555 FA MAN . C1 ? ? f BMA 3 f MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale128 covale both ? FA MAN . O2 ? ? ? 1_555 FA MAN . C1 ? ? f MAN 4 f MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale129 covale both ? FA MAN . O3 ? ? ? 1_555 FA MAN . C1 ? ? f MAN 6 f MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.386 ? ? covale130 covale both ? GA NAG . O4 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? g NAG 1 g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.388 ? ? covale131 covale both ? GA NAG . O4 ? ? ? 1_555 GA BMA . C1 ? ? g NAG 2 g BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale132 covale both ? HA NAG . O4 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? h NAG 1 h NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.387 ? ? covale133 covale both ? IA NAG . O4 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? i NAG 1 i NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.388 ? ? covale134 covale both ? IA NAG . O4 ? ? ? 1_555 IA BMA . C1 ? ? i NAG 2 i BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? ? covale135 covale both ? JA NAG . O4 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? j NAG 1 j NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.390 ? ? covale136 covale both ? JA NAG . O4 ? ? ? 1_555 JA BMA . C1 ? ? j NAG 2 j BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale137 covale both ? KA NAG . O4 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? k NAG 1 k NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.388 ? ? covale138 covale both ? LA NAG . O4 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? l NAG 1 l NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.387 ? ? covale139 covale both ? MA NAG . O4 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? m NAG 1 m NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.387 ? ? covale140 covale both ? MA NAG . O4 ? ? ? 1_555 MA BMA . C1 ? ? m NAG 2 m BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? ? covale141 covale both ? NA NAG . O4 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? n NAG 1 n NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.387 ? ? covale142 covale both ? NA NAG . O4 ? ? ? 1_555 NA BMA . C1 ? ? n NAG 2 n BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale143 covale both ? OA NAG . O4 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? o NAG 1 o NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.387 ? ? covale144 covale both ? PA NAG . O4 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? p NAG 1 p NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.386 ? ? covale145 covale both ? PA NAG . O4 ? ? ? 1_555 PA BMA . C1 ? ? p NAG 2 p BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? ? covale146 covale both ? PA BMA . O3 ? ? ? 1_555 PA MAN . C1 ? ? p BMA 3 p MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.404 ? ? covale147 covale both ? PA BMA . O6 ? ? ? 1_555 PA MAN . C1 ? ? p BMA 3 p MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.405 ? ? covale148 covale both ? PA MAN . O2 ? ? ? 1_555 PA MAN . C1 ? ? p MAN 4 p MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale149 covale both ? PA MAN . O3 ? ? ? 1_555 PA MAN . C1 ? ? p MAN 6 p MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.405 ? ? covale150 covale both ? PA MAN . O6 ? ? ? 1_555 PA MAN . C1 ? ? p MAN 6 p MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.404 ? ? covale151 covale both ? QA NAG . O4 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? q NAG 1 q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.470 ? ? covale152 covale both ? QA NAG . O6 ? ? ? 1_555 QA FUC . C1 ? ? q NAG 1 q FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.476 ? ? covale153 covale both ? RA NAG . O4 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? r NAG 1 r NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.386 ? ? covale154 covale both ? SA NAG . O4 ? ? ? 1_555 SA NAG . 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(DEPOSITION ID: 14201).' _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.resolution_method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name '50 MM TRIS, 150 MM NACL, 0.1% DDM, 0.03 MG/ML SODIUM DEOXYCHOLATE' _em_buffer.pH 7.4 _em_buffer.details '50 MM TRIS, 150 MM NACL, 0.1% DDM, 0.03 MG/ML SODIUM DEOXYCHOLATE' # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.name 'JR-FL ENVDCT IN COMPLEX WITH PGT151 FAB' _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_imaging.entry_id 5FUU _em_imaging.id 1 _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.date 2015-02-27 _em_imaging.temperature ? _em_imaging.nominal_defocus_min 1200 _em_imaging.nominal_defocus_max 3000 _em_imaging.tilt_angle_min 0 _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_magnification 22500 _em_imaging.calibrated_magnification 22500 _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.details ? _em_imaging.specimen_holder_type . _em_imaging.specimen_holder_model . _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details 'HOLEY CARBON' _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type ? # _em_vitrification.entry_id 5FUU _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.instrument 'HOMEMADE PLUNGER' _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.details 'SAMPLES WERE PLUNGED INTO LIQUID ETHANE USING A MANUAL PLUNGER AT RT.' _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 5FUU _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' # _em_single_particle_entity.entry_id 5FUU _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A ALA 58 ? 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