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'X-RAY DIFFRACTION' . 7.9828 46.1622 3314 0.2434 100.00 0.2953 . . 164 . . . . # _struct.entry_id 5IZM _struct.title 'The crystal structure of human eEFSec in complex with GDPNP' _struct.pdbx_descriptor 'Selenocysteine-specific elongation factor' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? # _struct_keywords.entry_id 5IZM _struct_keywords.text 'elongation factor, selenocysteine, selenocysteine tRNA, translation, GTPase, GDPNP, GTP' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSLATION # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 2 ? 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A ARG 611 C ? ? ? 1_555 A MSE 612 N ? ? A ARG 591 A MSE 592 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? covale27 covale both ? A MSE 612 C ? ? ? 1_555 A VAL 613 N ? ? A MSE 592 A VAL 593 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? metalc3 metalc ? ? B THR 41 OG1 ? ? ? 1_555 E MN . MN ? ? B THR 21 B MN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? metalc4 metalc ? ? B THR 68 OG1 ? ? ? 1_555 E MN . MN ? ? B THR 48 B MN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? covale28 covale both ? B LEU 132 C ? ? ? 1_555 B MSE 133 N ? ? B LEU 112 B MSE 113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale29 covale both ? B MSE 133 C ? ? ? 1_555 B MSE 134 N ? ? B MSE 113 B MSE 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale30 covale both ? B MSE 134 C ? ? ? 1_555 B LEU 135 N ? ? B MSE 114 B LEU 115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale31 covale both ? B GLY 142 C ? ? ? 1_555 B MSE 143 N ? ? B GLY 122 B MSE 123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale32 covale both ? B MSE 143 C ? ? ? 1_555 B GLN 144 N ? ? B MSE 123 B GLN 124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale33 covale both ? B LYS 182 C ? ? ? 1_555 B MSE 183 N ? ? B LYS 162 B MSE 163 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? covale34 covale both ? B MSE 183 C ? ? ? 1_555 B THR 184 N ? ? B MSE 163 B THR 164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale35 covale both ? B LYS 186 C ? ? ? 1_555 B MSE 187 N ? ? B LYS 166 B MSE 167 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale36 covale both ? B MSE 187 C ? ? ? 1_555 B GLN 188 N ? ? B MSE 167 B GLN 168 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale37 covale both ? B LEU 245 C ? ? ? 1_555 B MSE 246 N ? ? B LEU 225 B MSE 226 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? covale38 covale both ? B MSE 246 C ? ? ? 1_555 B SER 247 N ? ? B MSE 226 B SER 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? covale39 covale both ? B VAL 260 C ? ? ? 1_555 B MSE 261 N ? ? B VAL 240 B MSE 241 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale40 covale both ? B MSE 261 C ? ? ? 1_555 B THR 262 N ? ? B MSE 241 B THR 242 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale41 covale both ? B SER 289 C ? ? ? 1_555 B MSE 290 N ? ? B SER 269 B MSE 270 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale42 covale both ? B MSE 290 C ? ? ? 1_555 B GLN 291 N ? ? B MSE 270 B GLN 271 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale43 covale both ? B GLN 291 C ? ? ? 1_555 B MSE 292 N ? ? B GLN 271 B MSE 272 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? covale44 covale both ? B MSE 292 C ? ? ? 1_555 B PHE 293 N ? ? B MSE 272 B PHE 273 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? covale45 covale both ? B HIS 294 C ? ? ? 1_555 B MSE 295 N ? ? B HIS 274 B MSE 275 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale46 covale both ? B MSE 295 C ? ? ? 1_555 B PRO 296 N ? ? B MSE 275 B PRO 276 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.349 ? covale47 covale both ? B ALA 300 C ? ? ? 1_555 B MSE 301 N ? ? B ALA 280 B MSE 281 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale48 covale both ? B MSE 301 C ? ? ? 1_555 B GLN 302 N ? ? B MSE 281 B GLN 282 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale49 covale both ? B VAL 364 C ? ? ? 1_555 B MSE 365 N ? ? B VAL 344 B MSE 345 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? covale50 covale both ? B MSE 365 C ? ? ? 1_555 B GLY 366 N ? ? B MSE 345 B GLY 346 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale51 covale both ? B LEU 368 C ? ? ? 1_555 B MSE 369 N ? ? B LEU 348 B MSE 349 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale52 covale both ? B MSE 369 C ? ? ? 1_555 B PHE 370 N ? ? B MSE 349 B PHE 350 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale53 covale both ? B ALA 502 C ? ? ? 1_555 B MSE 503 N ? ? B ALA 482 B MSE 483 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale54 covale both ? B MSE 503 C ? ? ? 1_555 B ASP 504 N ? ? B MSE 483 B ASP 484 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale55 covale both ? B ARG 611 C ? ? ? 1_555 B MSE 612 N ? ? B ARG 591 B MSE 592 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale56 covale both ? B MSE 612 C ? ? ? 1_555 B VAL 613 N ? ? B MSE 592 B VAL 593 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? metalc5 metalc ? ? C MN . MN ? ? ? 1_555 D GNP . O3G ? ? A MN 1001 A GNP 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.192 ? metalc6 metalc ? ? E MN . MN ? ? ? 1_555 F GNP . O3G ? ? B MN 1001 B GNP 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.642 ? metalc7 metalc ? ? E MN . MN ? ? ? 1_555 F GNP . O1B ? ? B MN 1001 B GNP 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.744 ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? covale ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 6 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 8 ? AA6 ? 9 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 6 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 10 ? AB4 ? 5 ? 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B . n # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 MN 1 1001 1001 MN MN A . D 3 GNP 1 1002 801 GNP GNP A . E 2 MN 1 1001 1001 MN MN B . F 3 GNP 1 1002 801 GNP GNP B . # loop_ _pdbx_struct_mod_residue.id _pdbx_struct_mod_residue.label_asym_id _pdbx_struct_mod_residue.label_comp_id _pdbx_struct_mod_residue.label_seq_id _pdbx_struct_mod_residue.auth_asym_id _pdbx_struct_mod_residue.auth_comp_id _pdbx_struct_mod_residue.auth_seq_id _pdbx_struct_mod_residue.PDB_ins_code _pdbx_struct_mod_residue.parent_comp_id _pdbx_struct_mod_residue.details 1 A MSE 133 A MSE 113 ? MET 'modified residue' 2 A MSE 134 A MSE 114 ? MET 'modified residue' 3 A MSE 143 A MSE 123 ? MET 'modified residue' 4 A MSE 183 A MSE 163 ? 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