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'Gria2, Glur2' ? ? ? ? ? ? 'Rattus norvegicus' 10116 ? ? ? ? ? ? ? Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 'Biological sequence' 1 323 Rat ? Cacng2 ? ? ? ? ? ? 'Rattus norvegicus' 10116 ? ? ? ? ? ? ? Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP GRIA2_RAT P19491 ? 1 ;MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSEFRLTPHIDNLEVANSFAVTNAFCSQ FSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFPTDGTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLST LQAVLDSAAEKKWQVTAINVGNINNDKKDETYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIANL GFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTATIKYTSALTYDAVQVMTEAFRNLRKQRIE ISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVEGLSGNIKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLT ELPSGNDTSGLENKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKI WNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVV LFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTAN LAAFLTVERMVSPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGK YAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSGGGD SKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCYKSRAEAKRMKVAKNPQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIES VKI ; 1 2 UNP CCG2_RAT Q71RJ2 ? 2 ;MGLFDRGVQMLLTTVGAFAAFSLMTIAVGTDYWLYSRGVCKTKSVSENETSKKNEEVMTHSGLWRTCCLEGNFKGLCKQI DHFPEDADYEADTAEYFLRAVRASSIFPILSVILLFMGGLCIAASEFYKTRHNIILSAGIFFVSAGLSNIIGIIVYISAN AGDPSKSDSKKNSYSYGWSFYFGALSFIIAEMVGVLAVHMFIDRHKQLRATARATDYLQASAITRIPSYRYRYQRRSRSS SRSTEPSHSRDASPVGVKGFNTLPSTEISMYTLSRDPLKAATTPTATYNSDRDNSFLQVHNCIQKDSKDSLHANTANRRT TPV ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 5KK2 A 1 ? 889 ? P19491 1 ? 883 ? -20 868 2 1 5KK2 B 1 ? 889 ? P19491 1 ? 883 ? -20 868 3 1 5KK2 C 1 ? 889 ? P19491 1 ? 883 ? -20 868 4 1 5KK2 D 1 ? 889 ? P19491 1 ? 883 ? -20 868 5 2 5KK2 E 1 ? 323 ? Q71RJ2 1 ? 323 ? 1 323 6 2 5KK2 F 1 ? 323 ? Q71RJ2 1 ? 323 ? 1 323 7 2 5KK2 G 1 ? 323 ? Q71RJ2 1 ? 323 ? 1 323 8 2 5KK2 H 1 ? 323 ? Q71RJ2 1 ? 323 ? 1 323 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 5KK2 ARG A 607 ? UNP P19491 GLN 607 variant 586 1 1 5KK2 ASP A 869 ? UNP P19491 ? ? insertion 848 2 1 5KK2 TYR A 870 ? UNP P19491 ? ? insertion 849 3 1 5KK2 LYS A 871 ? UNP P19491 ? ? insertion 850 4 1 5KK2 ASP A 872 ? UNP P19491 ? ? insertion 851 5 1 5KK2 ASP A 873 ? UNP P19491 ? ? insertion 852 6 1 5KK2 ASP A 874 ? UNP P19491 ? ? insertion 853 7 1 5KK2 ASP A 875 ? UNP P19491 TYR 869 conflict 854 8 2 5KK2 ARG B 607 ? UNP P19491 GLN 607 variant 586 9 2 5KK2 ASP B 869 ? UNP P19491 ? ? insertion 848 10 2 5KK2 TYR B 870 ? UNP P19491 ? ? insertion 849 11 2 5KK2 LYS B 871 ? UNP P19491 ? ? insertion 850 12 2 5KK2 ASP B 872 ? UNP P19491 ? ? insertion 851 13 2 5KK2 ASP B 873 ? UNP P19491 ? ? insertion 852 14 2 5KK2 ASP B 874 ? UNP P19491 ? ? insertion 853 15 2 5KK2 ASP B 875 ? UNP P19491 TYR 869 conflict 854 16 3 5KK2 ARG C 607 ? UNP P19491 GLN 607 variant 586 17 3 5KK2 ASP C 869 ? UNP P19491 ? ? insertion 848 18 3 5KK2 TYR C 870 ? UNP P19491 ? ? insertion 849 19 3 5KK2 LYS C 871 ? UNP P19491 ? ? insertion 850 20 3 5KK2 ASP C 872 ? UNP P19491 ? ? insertion 851 21 3 5KK2 ASP C 873 ? UNP P19491 ? ? insertion 852 22 3 5KK2 ASP C 874 ? UNP P19491 ? ? insertion 853 23 3 5KK2 ASP C 875 ? UNP P19491 TYR 869 conflict 854 24 4 5KK2 ARG D 607 ? UNP P19491 GLN 607 variant 586 25 4 5KK2 ASP D 869 ? UNP P19491 ? ? insertion 848 26 4 5KK2 TYR D 870 ? UNP P19491 ? ? insertion 849 27 4 5KK2 LYS D 871 ? UNP P19491 ? ? insertion 850 28 4 5KK2 ASP D 872 ? UNP P19491 ? ? insertion 851 29 4 5KK2 ASP D 873 ? UNP P19491 ? ? insertion 852 30 4 5KK2 ASP D 874 ? UNP P19491 ? ? insertion 853 31 4 5KK2 ASP D 875 ? UNP P19491 TYR 869 conflict 854 32 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 5KK2 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 5KK2 _struct.title 'Architecture of fully occupied GluA2 AMPA receptor - TARP complex elucidated by single particle cryo-electron microscopy' _struct.pdbx_descriptor 'Glutamate receptor 2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 5KK2 _struct_keywords.text ;Tetrameric, ionotropic, glutamate receptors, GluA2 - TARP gamma2 complex, fully occupied, antagonist-bound state, MEMBRANE PROTEIN, TRANSPORT PROTEIN, SIGNALING PROTEIN ; _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN, TRANSPORT PROTEIN, SIGNALING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 2 ? F N N 2 ? G N N 2 ? H N N 2 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASN A 432 ? LEU A 436 ? ASN A 411 LEU A 415 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 AA2 GLU A 437 ? GLU A 440 ? GLU A 416 GLU A 419 5 ? 4 HELX_P HELX_P3 AA3 GLY A 444 ? GLY A 458 ? GLY A 423 GLY A 437 1 ? 15 HELX_P HELX_P4 AA4 GLY A 483 ? TYR A 490 ? GLY A 462 TYR A 469 1 ? 8 HELX_P HELX_P5 AA5 THR A 503 ? GLU A 508 ? THR A 482 GLU A 487 1 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 ALA A 543 ? ARG A 566 ? ALA A 522 ARG A 545 1 ? 24 HELX_P HELX_P7 AA7 GLU A 587 ? GLY A 603 ? GLU A 566 GLY A 582 1 ? 17 HELX_P HELX_P8 AA8 LEU A 617 ? VAL A 651 ? LEU A 596 VAL A 630 1 ? 35 HELX_P HELX_P9 AA9 SER A 656 ? GLN A 663 ? SER A 635 GLN A 642 1 ? 8 HELX_P HELX_P10 AB1 GLY A 674 ? SER A 683 ? GLY A 653 SER A 662 1 ? 10 HELX_P HELX_P11 AB2 ILE A 685 ? ALA A 698 ? ILE A 664 ALA A 677 1 ? 14 HELX_P HELX_P12 AB3 THR A 706 ? LYS A 716 ? THR A 685 LYS A 695 1 ? 11 HELX_P HELX_P13 AB4 SER A 727 ? GLN A 735 ? SER A 706 GLN A 714 1 ? 9 HELX_P HELX_P14 AB5 SER A 762 ? GLN A 777 ? SER A 741 GLN A 756 1 ? 16 HELX_P HELX_P15 AB6 GLY A 778 ? TYR A 789 ? GLY A 757 TYR A 768 1 ? 12 HELX_P HELX_P16 AB7 SER A 809 ? LYS A 847 ? SER A 788 LYS A 826 1 ? 39 HELX_P HELX_P17 AB8 ASN B 432 ? LEU B 436 ? ASN B 411 LEU B 415 5 ? 5 HELX_P HELX_P18 AB9 GLU B 437 ? GLU B 440 ? GLU B 416 GLU B 419 5 ? 4 HELX_P HELX_P19 AC1 GLY B 444 ? GLY B 458 ? GLY B 423 GLY B 437 1 ? 15 HELX_P HELX_P20 AC2 GLY B 483 ? TYR B 490 ? GLY B 462 TYR B 469 1 ? 8 HELX_P HELX_P21 AC3 THR B 503 ? GLU B 508 ? THR B 482 GLU B 487 1 ? 6 HELX_P HELX_P22 AC4 PHE B 536 ? ASP B 540 ? PHE B 515 ASP B 519 5 ? 5 HELX_P HELX_P23 AC5 ALA B 543 ? ARG B 566 ? ALA B 522 ARG B 545 1 ? 24 HELX_P HELX_P24 AC6 SER B 586 ? GLY B 603 ? SER B 565 GLY B 582 1 ? 18 HELX_P HELX_P25 AC7 LEU B 617 ? VAL B 647 ? LEU B 596 VAL B 626 1 ? 31 HELX_P HELX_P26 AC8 ALA B 657 ? GLN B 663 ? ALA B 636 GLN B 642 1 ? 7 HELX_P HELX_P27 AC9 GLY B 674 ? SER B 683 ? GLY B 653 SER B 662 1 ? 10 HELX_P HELX_P28 AD1 ILE B 685 ? ALA B 698 ? ILE B 664 ALA B 677 1 ? 14 HELX_P HELX_P29 AD2 THR B 706 ? LYS B 716 ? THR B 685 LYS B 695 1 ? 11 HELX_P HELX_P30 AD3 SER B 727 ? GLN B 735 ? SER B 706 GLN B 714 1 ? 9 HELX_P HELX_P31 AD4 SER B 762 ? GLN B 777 ? SER B 741 GLN B 756 1 ? 16 HELX_P HELX_P32 AD5 GLY B 778 ? TYR B 789 ? GLY B 757 TYR B 768 1 ? 12 HELX_P HELX_P33 AD6 LEU B 810 ? LYS B 847 ? 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ASN F 133 GLY F 162 1 ? 30 HELX_P HELX_P76 AI4 GLY F 177 ? ARG F 213 ? GLY F 177 ARG F 213 1 ? 37 HELX_P HELX_P77 AI5 GLY G 7 ? GLY G 29 ? GLY G 7 GLY G 29 1 ? 23 HELX_P HELX_P78 AI6 ALA G 91 ? ALA G 123 ? ALA G 91 ALA G 123 1 ? 33 HELX_P HELX_P79 AI7 HIS G 132 ? ALA G 159 ? HIS G 132 ALA G 159 1 ? 28 HELX_P HELX_P80 AI8 ASN G 160 ? GLY G 162 ? ASN G 160 GLY G 162 5 ? 3 HELX_P HELX_P81 AI9 GLY G 177 ? ARG G 213 ? GLY G 177 ARG G 213 1 ? 37 HELX_P HELX_P82 AJ1 GLY H 7 ? GLY H 29 ? GLY H 7 GLY H 29 1 ? 23 HELX_P HELX_P83 AJ2 ASP H 92 ? ALA H 123 ? ASP H 92 ALA H 123 1 ? 32 HELX_P HELX_P84 AJ3 HIS H 132 ? GLY H 162 ? HIS H 132 GLY H 162 1 ? 31 HELX_P HELX_P85 AJ4 GLY H 177 ? ARG H 213 ? GLY H 177 ARG H 213 1 ? 37 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf1 disulf ? ? 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D CYS 718 D CYS 773 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 424 A . ? SER 403 A PRO 425 A ? PRO 404 A 1 -0.73 2 GLU 699 A . ? GLU 678 A PRO 700 A ? PRO 679 A 1 -1.02 3 LYS 737 A . ? LYS 716 A PRO 738 A ? 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