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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP TOLC_ECOLI P02930 ? 1 ;ENLMQVYQQARLSNPELRKSAADRDAAFEKINEARSPLLPQLGLGADYTYSNGYRDANGINSNATSASLQLTQSIFDMSK WRALTLQEKAAGIQDVTYQTDQQTLILNTATAYFNVLNAIDVLSYTQAQKEAIYRQLDQTTQRFNVGLVAITDVQNARAQ YDTVLANEVTARNNLDNAVEQLRQITGNYYPELAALNVENFKTDKPQPVNALLKEAEKRNLSLLQARLSQDLAREQIRQA QDGHLPTLDLTASTGISDTSYSGSKTRGAAGTQYDDSNMGQNKVGLSFSLPIYQGGMVNSQVKQAQYNFVGASEQLESAH RSVVQTVRSSFNNINASISSINAYKQAVVSAQSSLDAMEAGYSVGTRTIVDVLDATTTLYNAKQELANARYNYLINQLNI KSALGTLNEQDLLALNNALSKPVSTNPENVAPQTPEQNAIAD ; 23 2 UNP ACRA_ECO57 P0AE07 ? 2 ;MNKNRGFTPLAVVLMLSGSLALTGCDDKQAQQGGQQMPAVGVVTVKTEPLQITTELPGRTSAYRIAEVRPQVSGIILKRN FKEGSDIEAGVSLYQIDPATYQATYDSAKGDLAKAQAAANIAQLTVNRYQKLLGTQYISKQEYDQALADAQQANAAVTAA KAAVETARINLAYTKVTSPISGRIGKSNVTEGALVQNGQATALATVQQLDPIYVDVTQSSNDFLRLKQELANGTLKQENG KAKVSLITSDGIKFPQDGTLEFSDVTVDQTTGSITLRAIFPNPDHTLLPGMFVRARLEEGLNPNAILVPQQGVTRTPRGD ATVLVVGADDKVETRPIVASQAIGDKWLVTEGLKAGDRVVISGLQKVRPGVQVKAQEVTADNNQQAASGAQPEQSKS ; 1 3 UNP ACRB_ECOLI P31224 ? 3 ;MPNFFIDRPIFAWVIAIIIMLAGGLAILKLPVAQYPTIAPPAVTISASYPGADAKTVQDTVTQVIEQNMNGIDNLMYMSS NSDSTGTVQITLTFESGTDADIAQVQVQNKLQLAMPLLPQEVQQQGVSVEKSSSSFLMVVGVINTDGTMTQEDISDYVAA NMKDAISRTSGVGDVQLFGSQYAMRIWMNPNELNKFQLTPVDVITAIKAQNAQVAAGQLGGTPPVKGQQLNASIIAQTRL TSTEEFGKILLKVNQDGSRVLLRDVAKIELGGENYDIIAEFNGQPASGLGIKLATGANALDTAAAIRAELAKMEPFFPSG LKIVYPYDTTPFVKISIHEVVKTLVEAIILVFLVMYLFLQNFRATLIPTIAVPVVLLGTFAVLAAFGFSINTLTMFGMVL AIGLLVDDAIVVVENVERVMAEEGLPPKEATRKSMGQIQGALVGIAMVLSAVFVPMAFFGGSTGAIYRQFSITIVSAMAL SVLVALILTPALCATMLKPIAKGDHGEGKKGFFGWFNRMFEKSTHHYTDSVGGILRSTGRYLVLYLIIVVGMAYLFVRLP SSFLPDEDQGVFMTMVQLPAGATQERTQKVLNEVTHYYLTKEKNNVESVFAVNGFGFAGRGQNTGIAFVSLKDWADRPGE ENKVEAITMRATRAFSQIKDAMVFAFNLPAIVELGTATGFDFELIDQAGLGHEKLTQARNQLLAEAAKHPDMLTSVRPNG LEDTPQFKIDIDQEKAQALGVSINDINTTLGAAWGGSYVNDFIDRGRVKKVYVMSEAKYRMLPDDIGDWYVRAADGQMVP FSAFSSSRWEYGSPRLERYNGLPSMEILGQAAPGKSTGEAMELMEQLASKLPTGVGYDWTGMSYQERLSGNQAPSLYAIS LIVVFLCLAALYESWSIPFSVMLVVPLGVIGALLAATFRGLTNDVYFQVGLLTTIGLSAKNAILIVEFAKDLMDKEGKGL IEATLDAVRMRLRPILMTSLAFILGVMPLVISTGAGSGAQNAVGTGVMGGMVTATVLAIFFVPVFFVVVRRRFSRKNEDI EHSHTVDHH ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 5V5S A 1 ? 442 ? P02930 23 ? 464 ? 1 442 2 1 5V5S B 1 ? 442 ? P02930 23 ? 464 ? 1 442 3 1 5V5S C 1 ? 442 ? P02930 23 ? 464 ? 1 442 4 2 5V5S D 1 ? 397 ? P0AE07 1 ? 397 ? 1 397 5 2 5V5S E 1 ? 397 ? P0AE07 1 ? 397 ? 1 397 6 2 5V5S F 1 ? 397 ? P0AE07 1 ? 397 ? 1 397 7 2 5V5S G 1 ? 397 ? P0AE07 1 ? 397 ? 1 397 8 2 5V5S H 1 ? 397 ? P0AE07 1 ? 397 ? 1 397 9 2 5V5S I 1 ? 397 ? P0AE07 1 ? 397 ? 1 397 10 3 5V5S J 1 ? 1049 ? P31224 1 ? 1049 ? 1 1049 11 3 5V5S K 1 ? 1049 ? P31224 1 ? 1049 ? 1 1049 12 3 5V5S L 1 ? 1049 ? P31224 1 ? 1049 ? 1 1049 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 4 5V5S CYS D 273 ? UNP P0AE07 SER 273 conflict 273 1 5 5V5S CYS E 273 ? UNP P0AE07 SER 273 conflict 273 2 6 5V5S CYS F 273 ? UNP P0AE07 SER 273 conflict 273 3 7 5V5S CYS G 273 ? UNP P0AE07 SER 273 conflict 273 4 8 5V5S CYS H 273 ? UNP P0AE07 SER 273 conflict 273 5 9 5V5S CYS I 273 ? UNP P0AE07 SER 273 conflict 273 6 10 5V5S CYS J 258 ? UNP P31224 SER 258 conflict 258 7 11 5V5S CYS K 258 ? UNP P31224 SER 258 conflict 258 8 12 5V5S CYS L 258 ? UNP P31224 SER 258 conflict 258 9 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MSE 'L-peptide linking' n SELENOMETHIONINE ? 'C5 H11 N O2 Se' 196.106 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 5V5S _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 5V5S _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.018 ? 49461 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.252 ? 67203 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 9.169 ? 30015 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.064 ? 7959 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.007 ? 8754 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 5V5S _struct.title 'multi-drug efflux; membrane transport; RND superfamily; Drug resistance' _struct.pdbx_descriptor 'Outer membrane protein TolC, Multidrug efflux pump subunit AcrA, Multidrug efflux pump subunit AcrB' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 5V5S _struct_keywords.text 'multi-drug efflux, membrane transport, RND superfamily, Drug resistance, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 2 ? F N N 2 ? G N N 2 ? H N N 2 ? I N N 2 ? J N N 3 ? K N N 3 ? L N N 3 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASN A 2 ? ASN A 14 ? ASN A 2 ASN A 14 1 ? 13 HELX_P HELX_P2 AA2 ASN A 14 ? SER A 36 ? ASN A 14 SER A 36 1 ? 23 HELX_P HELX_P3 AA3 PRO A 37 ? LEU A 39 ? PRO A 37 LEU A 39 5 ? 3 HELX_P HELX_P4 AA4 MSE A 78 ? ASN A 145 ? MSE A 78 ASN A 145 1 ? 68 HELX_P HELX_P5 AA5 ALA A 150 ? ARG A 183 ? ALA A 150 ARG A 183 1 ? 34 HELX_P HELX_P6 AA6 VAL A 198 ? PHE A 201 ? VAL A 198 PHE A 201 5 ? 4 HELX_P HELX_P7 AA7 ASN A 210 ? GLU A 217 ? ASN A 210 GLU A 217 1 ? 8 HELX_P HELX_P8 AA8 LEU A 221 ? HIS A 244 ? LEU A 221 HIS A 244 1 ? 24 HELX_P HELX_P9 AA9 ASN A 299 ? ALA A 305 ? ASN A 299 ALA A 305 1 ? 7 HELX_P HELX_P10 AB1 ASN A 308 ? GLU A 314 ? ASN A 308 GLU A 314 1 ? 7 HELX_P HELX_P11 AB2 GLU A 314 ? VAL A 364 ? GLU A 314 VAL A 364 1 ? 51 HELX_P HELX_P12 AB3 THR A 368 ? GLY A 405 ? THR A 368 GLY A 405 1 ? 38 HELX_P HELX_P13 AB4 ASN A 408 ? ALA A 418 ? ASN A 408 ALA A 418 1 ? 11 HELX_P HELX_P14 AB5 ASN B 2 ? LEU B 12 ? ASN B 2 LEU B 12 1 ? 11 HELX_P HELX_P15 AB6 ASN B 14 ? SER B 36 ? ASN B 14 SER B 36 1 ? 23 HELX_P HELX_P16 AB7 MSE B 78 ? LEU B 86 ? MSE B 78 LEU B 86 1 ? 9 HELX_P HELX_P17 AB8 LYS B 89 ? GLY B 147 ? LYS B 89 GLY B 147 1 ? 59 HELX_P HELX_P18 AB9 ILE B 151 ? ARG B 183 ? ILE B 151 ARG B 183 1 ? 33 HELX_P HELX_P19 AC1 ASN B 210 ? ASN B 220 ? ASN B 210 ASN B 220 1 ? 11 HELX_P HELX_P20 AC2 LEU B 221 ? HIS B 244 ? LEU B 221 HIS B 244 1 ? 24 HELX_P HELX_P21 AC3 SER B 300 ? TYR B 307 ? SER B 300 TYR B 307 1 ? 8 HELX_P HELX_P22 AC4 ASN B 308 ? VAL B 364 ? ASN B 308 VAL B 364 1 ? 57 HELX_P HELX_P23 AC5 THR B 368 ? LEU B 404 ? THR B 368 LEU B 404 1 ? 37 HELX_P HELX_P24 AC6 ASN B 408 ? ALA B 418 ? ASN B 408 ALA B 418 1 ? 11 HELX_P HELX_P25 AC7 ASN C 2 ? LEU C 12 ? ASN C 2 LEU C 12 1 ? 11 HELX_P HELX_P26 AC8 ASN C 14 ? SER C 36 ? ASN C 14 SER C 36 1 ? 23 HELX_P HELX_P27 AC9 PRO C 37 ? LEU C 39 ? PRO C 37 LEU C 39 5 ? 3 HELX_P HELX_P28 AD1 MSE C 78 ? GLY C 147 ? MSE C 78 GLY C 147 1 ? 70 HELX_P HELX_P29 AD2 ALA C 150 ? ARG C 183 ? ALA C 150 ARG C 183 1 ? 34 HELX_P HELX_P30 AD3 ASN C 210 ? ASN C 220 ? ASN C 210 ASN C 220 1 ? 11 HELX_P HELX_P31 AD4 LEU C 221 ? HIS C 244 ? LEU C 221 HIS C 244 1 ? 24 HELX_P HELX_P32 AD5 SER C 300 ? VAL C 364 ? SER C 300 VAL C 364 1 ? 65 HELX_P HELX_P33 AD6 THR C 368 ? GLY C 405 ? 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A MSE 358 C ? ? ? 1_555 A GLU 359 N ? ? A MSE 358 A GLU 359 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale11 covale both ? B LEU 3 C ? ? ? 1_555 B MSE 4 N ? ? B LEU 3 B MSE 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale12 covale both ? B MSE 4 C ? ? ? 1_555 B GLN 5 N ? ? B MSE 4 B GLN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale13 covale both ? B ASP 77 C ? ? ? 1_555 B MSE 78 N ? ? B ASP 77 B MSE 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale14 covale both ? B MSE 78 C ? ? ? 1_555 B SER 79 N ? ? B MSE 78 B SER 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale15 covale both ? B ASN 278 C ? ? ? 1_555 B MSE 279 N ? ? B ASN 278 B MSE 279 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale16 covale both ? B MSE 279 C ? ? ? 1_555 B GLY 280 N ? ? B MSE 279 B GLY 280 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale17 covale both ? B GLY 296 C ? ? ? 1_555 B MSE 297 N ? ? B GLY 296 B MSE 297 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale18 covale both ? B MSE 297 C ? ? ? 1_555 B VAL 298 N ? ? B MSE 297 B VAL 298 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale19 covale both ? B ALA 357 C ? ? ? 1_555 B MSE 358 N ? ? B ALA 357 B MSE 358 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? covale20 covale both ? B MSE 358 C ? ? ? 1_555 B GLU 359 N ? ? B MSE 358 B GLU 359 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale21 covale both ? C LEU 3 C ? ? ? 1_555 C MSE 4 N ? ? C LEU 3 C MSE 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale22 covale both ? C MSE 4 C ? ? ? 1_555 C GLN 5 N ? ? C MSE 4 C GLN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? covale23 covale both ? C ASP 77 C ? ? ? 1_555 C MSE 78 N ? ? C ASP 77 C MSE 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale24 covale both ? C MSE 78 C ? ? ? 1_555 C SER 79 N ? ? C MSE 78 C SER 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale25 covale both ? C ASN 278 C ? ? ? 1_555 C MSE 279 N ? ? C ASN 278 C MSE 279 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? covale26 covale both ? C MSE 279 C ? ? ? 1_555 C GLY 280 N ? ? C MSE 279 C GLY 280 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale27 covale both ? C GLY 296 C ? ? ? 1_555 C MSE 297 N ? ? C GLY 296 C MSE 297 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale28 covale both ? C MSE 297 C ? ? ? 1_555 C VAL 298 N ? ? C MSE 297 C VAL 298 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.314 ? covale29 covale both ? C ALA 357 C ? ? ? 1_555 C MSE 358 N ? ? C ALA 357 C MSE 358 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? covale30 covale both ? C MSE 358 C ? ? ? 1_555 C GLU 359 N ? ? C MSE 358 C GLU 359 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? # _struct_conn_type.id covale _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 THR 316 D . ? THR 316 D PRO 317 D ? PRO 317 D 1 -8.77 2 MET 291 E . ? MET 291 E PHE 292 E ? PHE 292 E 1 -5.06 3 GLU 299 E . ? GLU 299 E GLY 300 E ? GLY 300 E 1 -2.50 4 THR 316 E . ? THR 316 E PRO 317 E ? PRO 317 E 1 -17.84 5 THR 316 F . ? THR 316 F PRO 317 F ? PRO 317 F 1 -8.57 6 MET 291 G . ? MET 291 G PHE 292 G ? PHE 292 G 1 -5.48 7 GLU 299 G . ? GLU 299 G GLY 300 G ? GLY 300 G 1 -3.13 8 THR 316 G . ? THR 316 G PRO 317 G ? PRO 317 G 1 -13.49 9 THR 316 H . ? THR 316 H PRO 317 H ? PRO 317 H 1 -7.10 10 MET 291 I . ? MET 291 I PHE 292 I ? PHE 292 I 1 -4.47 11 GLU 299 I . ? GLU 299 I GLY 300 I ? GLY 300 I 1 -1.83 12 THR 316 I . ? THR 316 I PRO 317 I ? PRO 317 I 1 -16.92 13 THR 222 J . ? THR 222 J PRO 223 J ? PRO 223 J 1 -2.61 14 THR 222 K . ? THR 222 K PRO 223 K ? PRO 223 K 1 -4.70 15 THR 222 L . ? THR 222 L PRO 223 L ? PRO 223 L 1 -3.75 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 3 ? B ? 3 ? C ? 2 ? D ? 2 ? E ? 4 ? F ? 2 ? G ? 2 ? H ? 3 ? I ? 2 ? J ? 3 ? K ? 2 ? L ? 2 ? M ? 3 ? N ? 2 ? O ? 2 ? P ? 2 ? Q ? 2 ? R ? 2 ? S ? 3 ? T ? 2 ? U ? 2 ? V ? 2 ? W ? 2 ? X ? 2 ? Y ? 2 ? Z ? 2 ? AA ? 3 ? AB ? 2 ? AC ? 2 ? AD ? 2 ? AE ? 2 ? AF ? 2 ? AG ? 3 ? AH ? 2 ? AI ? 2 ? AJ ? 2 ? AK ? 2 ? AL ? 3 ? AM ? 2 ? AN ? 2 ? AO ? 2 ? AP ? 2 ? AQ ? 2 ? AR ? 2 ? AS ? 2 ? AT ? 3 ? AU ? 3 ? AV ? 2 ? AW ? 2 ? AX ? 2 ? AY ? 2 ? AZ ? 2 ? BA ? 5 ? BB ? 3 ? BC ? 4 ? BD ? 2 ? BE ? 3 ? BF ? 3 ? BG ? 2 ? BH ? 5 ? BI ? 2 ? BJ ? 2 ? BK ? 5 ? BL ? 2 ? BM ? 2 ? BN ? 2 ? BO ? 3 ? BP ? 2 ? BQ ? 2 ? BR ? 4 ? BS ? 5 ? BT ? 2 ? BU ? 2 ? BV ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel B 2 3 ? anti-parallel C 1 2 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel E 1 2 ? anti-parallel E 2 3 ? anti-parallel E 3 4 ? anti-parallel F 1 2 ? anti-parallel G 1 2 ? anti-parallel H 1 2 ? anti-parallel H 2 3 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel J 1 2 ? anti-parallel J 2 3 ? anti-parallel K 1 2 ? anti-parallel L 1 2 ? anti-parallel M 1 2 ? anti-parallel M 2 3 ? anti-parallel N 1 2 ? anti-parallel O 1 2 ? anti-parallel P 1 2 ? anti-parallel Q 1 2 ? anti-parallel R 1 2 ? anti-parallel S 1 2 ? anti-parallel S 2 3 ? anti-parallel T 1 2 ? anti-parallel U 1 2 ? anti-parallel V 1 2 ? anti-parallel W 1 2 ? anti-parallel X 1 2 ? anti-parallel Y 1 2 ? anti-parallel Z 1 2 ? anti-parallel AA 1 2 ? anti-parallel AA 2 3 ? anti-parallel AB 1 2 ? anti-parallel AC 1 2 ? anti-parallel AD 1 2 ? anti-parallel AE 1 2 ? anti-parallel AF 1 2 ? anti-parallel AG 1 2 ? anti-parallel AG 2 3 ? anti-parallel AH 1 2 ? anti-parallel AI 1 2 ? anti-parallel AJ 1 2 ? anti-parallel AK 1 2 ? anti-parallel AL 1 2 ? anti-parallel AL 2 3 ? anti-parallel AM 1 2 ? anti-parallel AN 1 2 ? anti-parallel AO 1 2 ? anti-parallel AP 1 2 ? anti-parallel AQ 1 2 ? anti-parallel AR 1 2 ? anti-parallel AS 1 2 ? parallel AT 1 2 ? anti-parallel AT 2 3 ? anti-parallel AU 1 2 ? anti-parallel AU 2 3 ? anti-parallel AV 1 2 ? anti-parallel AW 1 2 ? anti-parallel AX 1 2 ? anti-parallel AY 1 2 ? anti-parallel AZ 1 2 ? anti-parallel BA 1 2 ? anti-parallel BA 2 3 ? anti-parallel BA 3 4 ? anti-parallel BA 4 5 ? anti-parallel BB 1 2 ? anti-parallel BB 2 3 ? anti-parallel BC 1 2 ? anti-parallel BC 2 3 ? parallel BC 3 4 ? anti-parallel BD 1 2 ? anti-parallel BE 1 2 ? anti-parallel BE 2 3 ? anti-parallel BF 1 2 ? anti-parallel BF 2 3 ? anti-parallel BG 1 2 ? anti-parallel BH 1 2 ? anti-parallel BH 2 3 ? anti-parallel BH 3 4 ? anti-parallel BH 4 5 ? anti-parallel BI 1 2 ? anti-parallel BJ 1 2 ? anti-parallel BK 1 2 ? anti-parallel BK 2 3 ? anti-parallel BK 3 4 ? anti-parallel BK 4 5 ? anti-parallel BL 1 2 ? anti-parallel BM 1 2 ? anti-parallel BN 1 2 ? anti-parallel BO 1 2 ? anti-parallel BO 2 3 ? anti-parallel BP 1 2 ? anti-parallel BQ 1 2 ? anti-parallel BR 1 2 ? anti-parallel BR 2 3 ? parallel BR 3 4 ? anti-parallel BS 1 2 ? anti-parallel BS 2 3 ? anti-parallel BS 3 4 ? anti-parallel BS 4 5 ? anti-parallel BT 1 2 ? anti-parallel BU 1 2 ? anti-parallel BV 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 GLN A 41 ? SER A 51 ? GLN A 41 SER A 51 A 2 ILE A 60 ? THR A 72 ? ILE A 60 THR A 72 A 3 TYR A 261 ? GLY A 263 ? TYR A 261 GLY A 263 B 1 SER A 66 ? GLN A 70 ? SER A 66 GLN A 70 B 2 LEU A 250 ? SER A 257 ? LEU A 250 SER A 257 B 3 GLN A 281 ? LEU A 286 ? GLN A 281 LEU A 286 C 1 GLN A 73 ? ILE A 75 ? GLN A 73 ILE A 75 C 2 LEU A 248 ? LEU A 250 ? LEU A 248 LEU A 250 D 1 GLU A 192 ? ALA A 194 ? GLU A 192 ALA A 194 D 2 PRO A 422 ? SER A 424 ? PRO A 422 SER A 424 E 1 GLN B 41 ? ASP B 47 ? GLN B 41 ASP B 47 E 2 SER B 66 ? ILE B 75 ? SER B 66 ILE B 75 E 3 LEU B 248 ? ILE B 256 ? LEU B 248 ILE B 256 E 4 GLN B 281 ? LEU B 286 ? GLN B 281 LEU B 286 F 1 ASN B 61 ? ASN B 63 ? ASN B 61 ASN B 63 F 2 SER B 260 ? SER B 262 ? SER B 260 SER B 262 G 1 GLU B 192 ? ALA B 194 ? GLU B 192 ALA B 194 G 2 PRO B 422 ? SER B 424 ? PRO B 422 SER B 424 H 1 GLN C 41 ? ASN C 52 ? GLN C 41 ASN C 52 H 2 ILE C 60 ? THR C 72 ? ILE C 60 THR C 72 H 3 TYR C 261 ? GLY C 263 ? TYR C 261 GLY C 263 I 1 SER C 66 ? GLN C 70 ? SER C 66 GLN C 70 I 2 SER C 253 ? SER C 257 ? SER C 253 SER C 257 J 1 GLN C 73 ? ILE C 75 ? GLN C 73 ILE C 75 J 2 LEU C 248 ? ALA C 252 ? LEU C 248 ALA C 252 J 3 VAL C 284 ? LEU C 286 ? VAL C 284 LEU C 286 K 1 GLU C 192 ? ALA C 194 ? GLU C 192 ALA C 194 K 2 PRO C 422 ? SER C 424 ? PRO C 422 SER C 424 L 1 VAL D 42 ? VAL D 45 ? VAL D 42 VAL D 45 L 2 ASP D 357 ? VAL D 360 ? ASP D 357 VAL D 360 M 1 GLU D 55 ? PRO D 57 ? GLU D 55 PRO D 57 M 2 ARG D 294 ? ARG D 296 ? ARG D 294 ARG D 296 M 3 SER D 245 ? ILE D 247 ? SER D 245 ILE D 247 N 1 ARG D 59 ? ALA D 62 ? ARG D 59 ALA D 62 N 2 ILE D 212 ? ASP D 215 ? ILE D 212 ASP D 215 O 1 LYS D 241 ? VAL D 244 ? LYS D 241 VAL D 244 O 2 GLY D 258 ? GLU D 261 ? GLY D 258 GLU D 261 P 1 ILE D 306 ? PRO D 309 ? ILE D 306 PRO D 309 P 2 LYS D 346 ? VAL D 349 ? LYS D 346 VAL D 349 Q 1 THR D 322 ? VAL D 325 ? THR D 322 VAL D 325 Q 2 GLU D 333 ? PRO D 336 ? GLU D 333 PRO D 336 R 1 SER D 92 ? GLN D 95 ? SER D 92 GLN D 95 R 2 LYS D 175 ? THR D 177 ? LYS D 175 THR D 177 S 1 GLU E 55 ? PRO E 57 ? GLU E 55 PRO E 57 S 2 ARG E 294 ? ARG E 296 ? ARG E 294 ARG E 296 S 3 SER E 245 ? ILE E 247 ? SER E 245 ILE E 247 T 1 ARG E 59 ? ALA E 62 ? ARG E 59 ALA E 62 T 2 ILE E 212 ? ASP E 215 ? ILE E 212 ASP E 215 U 1 VAL E 216 ? GLN E 218 ? VAL E 216 GLN E 218 U 2 ILE E 274 ? LEU E 276 ? ILE E 274 LEU E 276 V 1 LYS E 241 ? VAL E 244 ? LYS E 241 VAL E 244 V 2 GLY E 258 ? GLU E 261 ? GLY E 258 GLU E 261 W 1 ILE E 306 ? PRO E 309 ? ILE E 306 PRO E 309 W 2 LYS E 346 ? VAL E 349 ? LYS E 346 VAL E 349 X 1 THR E 322 ? VAL E 325 ? THR E 322 VAL E 325 X 2 GLU E 333 ? PRO E 336 ? GLU E 333 PRO E 336 Y 1 ILE E 65 ? ARG E 69 ? ILE E 65 ARG E 69 Y 2 ALA E 202 ? GLN E 207 ? ALA E 202 GLN E 207 Z 1 VAL F 43 ? VAL F 45 ? VAL F 43 VAL F 45 Z 2 ASP F 357 ? VAL F 359 ? ASP F 357 VAL F 359 AA 1 GLU F 55 ? PRO F 57 ? GLU F 55 PRO F 57 AA 2 ARG F 294 ? ARG F 296 ? ARG F 294 ARG F 296 AA 3 SER F 245 ? ILE F 247 ? SER F 245 ILE F 247 AB 1 PRO F 211 ? GLN F 218 ? 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1010 GLY GLY L . n L 3 1011 MET 1011 1011 1011 MET MET L . n L 3 1012 VAL 1012 1012 1012 VAL VAL L . n L 3 1013 THR 1013 1013 1013 THR THR L . n L 3 1014 ALA 1014 1014 1014 ALA ALA L . n L 3 1015 THR 1015 1015 1015 THR THR L . n L 3 1016 VAL 1016 1016 1016 VAL VAL L . n L 3 1017 LEU 1017 1017 1017 LEU LEU L . n L 3 1018 ALA 1018 1018 1018 ALA ALA L . n L 3 1019 ILE 1019 1019 1019 ILE ILE L . n L 3 1020 PHE 1020 1020 1020 PHE PHE L . n L 3 1021 PHE 1021 1021 1021 PHE PHE L . n L 3 1022 VAL 1022 1022 1022 VAL VAL L . n L 3 1023 PRO 1023 1023 1023 PRO PRO L . n L 3 1024 VAL 1024 1024 1024 VAL VAL L . n L 3 1025 PHE 1025 1025 1025 PHE PHE L . n L 3 1026 PHE 1026 1026 1026 PHE PHE L . n L 3 1027 VAL 1027 1027 1027 VAL VAL L . n L 3 1028 VAL 1028 1028 1028 VAL VAL L . n L 3 1029 VAL 1029 1029 1029 VAL VAL L . n L 3 1030 ARG 1030 1030 1030 ARG ARG L . n L 3 1031 ARG 1031 1031 1031 ARG ARG L . n L 3 1032 ARG 1032 1032 1032 ARG ARG L . n L 3 1033 PHE 1033 1033 1033 PHE PHE L . n L 3 1034 SER 1034 1034 1034 SER SER L . n L 3 1035 ARG 1035 1035 1035 ARG ARG L . n L 3 1036 LYS 1036 1036 1036 LYS LYS L . n L 3 1037 ASN 1037 1037 1037 ASN ASN L . n L 3 1038 GLU 1038 1038 ? ? ? L . n L 3 1039 ASP 1039 1039 ? ? ? L . n L 3 1040 ILE 1040 1040 ? ? ? L . n L 3 1041 GLU 1041 1041 ? ? ? L . n L 3 1042 HIS 1042 1042 ? ? ? L . n L 3 1043 SER 1043 1043 ? ? ? L . n L 3 1044 HIS 1044 1044 ? ? ? L . n L 3 1045 THR 1045 1045 ? ? ? L . n L 3 1046 VAL 1046 1046 ? ? ? L . n L 3 1047 ASP 1047 1047 ? ? ? L . n L 3 1048 HIS 1048 1048 ? ? ? L . n L 3 1049 HIS 1049 1049 ? ? ? L . n # loop_ _pdbx_struct_mod_residue.id _pdbx_struct_mod_residue.label_asym_id _pdbx_struct_mod_residue.label_comp_id _pdbx_struct_mod_residue.label_seq_id _pdbx_struct_mod_residue.auth_asym_id _pdbx_struct_mod_residue.auth_comp_id _pdbx_struct_mod_residue.auth_seq_id _pdbx_struct_mod_residue.PDB_ins_code _pdbx_struct_mod_residue.parent_comp_id _pdbx_struct_mod_residue.details 1 A MSE 4 A MSE 4 ? MET 'modified residue' 2 A MSE 78 A MSE 78 ? MET 'modified residue' 3 A MSE 279 A MSE 279 ? MET 'modified residue' 4 A MSE 297 A MSE 297 ? MET 'modified residue' 5 A MSE 358 A MSE 358 ? MET 'modified residue' 6 B MSE 4 B MSE 4 ? MET 'modified residue' 7 B MSE 78 B MSE 78 ? MET 'modified residue' 8 B MSE 279 B MSE 279 ? MET 'modified residue' 9 B MSE 297 B MSE 297 ? MET 'modified residue' 10 B MSE 358 B MSE 358 ? MET 'modified residue' 11 C MSE 4 C MSE 4 ? MET 'modified residue' 12 C MSE 78 C MSE 78 ? MET 'modified residue' 13 C MSE 279 C MSE 279 ? MET 'modified residue' 14 C MSE 297 C MSE 297 ? MET 'modified residue' 15 C MSE 358 C MSE 358 ? MET 'modified residue' # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 52030 ? 1 MORE -193 ? 1 'SSA (A^2)' 290930 ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2017-04-19 2 'Structure model' 1 1 2017-08-02 3 'Structure model' 1 2 2019-02-20 4 'Structure model' 1 3 2019-10-23 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Data collection' 2 2 'Structure model' 'Refinement description' 3 3 'Structure model' Advisory 4 3 'Structure model' 'Data collection' 5 3 'Structure model' 'Derived calculations' 6 4 'Structure model' 'Data collection' 7 4 'Structure model' Other # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' em_3d_fitting 2 2 'Structure model' em_software 3 3 'Structure model' em_admin 4 3 'Structure model' pdbx_data_processing_status 5 3 'Structure model' pdbx_database_proc 6 3 'Structure model' pdbx_validate_close_contact 7 3 'Structure model' struct_conn 8 4 'Structure model' atom_sites 9 4 'Structure model' cell # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_em_3d_fitting.target_criteria' 2 2 'Structure model' '_em_software.name' 3 3 'Structure model' '_em_admin.last_update' 4 4 'Structure model' '_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]' 5 4 'Structure model' '_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]' 6 4 'Structure model' '_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]' 7 4 'Structure model' '_cell.Z_PDB' # _software.citation_id ? _software.classification refinement _software.compiler_name ? _software.compiler_version ? _software.contact_author ? _software.contact_author_email ? _software.date ? _software.description ? _software.dependencies ? _software.hardware ? _software.language ? _software.location ? _software.mods ? _software.name PHENIX _software.os ? _software.os_version ? _software.type ? _software.version dev_2415: _software.pdbx_ordinal 1 # _em_3d_fitting.entry_id 5V5S _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details ;Crystal structures were rigid-body fit into the density map and model optimization was then carried out with Phenix real-space refine. Due to the weaker resolution, stronger stereochemical and secondary structure restraints were used to ensure that alpha-helices and beta-sheets did not deviate far from their expected geometry. Manual adjustments were kept to a minimum to reduce human bias in the modeling procedure, with Coot only being used to fix obvious errors such as C-beta deviations. A final check of MolProbity and cross correlation was done to ensure model quality. ; _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_protocol 'FLEXIBLE FIT' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.target_criteria 'Cross-correlation coefficient' _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 5V5S _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm 'BACK PROJECTION' _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages 1 _em_3d_reconstruction.num_particles 13544 _em_3d_reconstruction.resolution 6.5 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 8 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.name 'AcrABTolC in apo state' _em_entity_assembly.source RECOMBINANT _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.entity_id_list '1, 2, 3' _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 5V5S _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.dimension_height ? _em_image_scans.dimension_width ? _em_image_scans.frames_per_image 45 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.used_frames_per_image ? _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 5V5S _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.cryogen ? _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_max ? _em_imaging.nominal_defocus_min ? _em_imaging.nominal_magnification ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details ? _em_sample_support.grid_material GOLD _em_sample_support.grid_mesh_size 300 _em_sample_support.grid_type Quantifoil _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature 20 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details ;a 3ul aliquot at a concentration of 2 mg per ml was applied onto glow-discharged holey carbon grid (Quantifoil Au R1.21.3, 300 mesh) ; _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.entry_id 5V5S _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 5V5S _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 5V5S _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C3 # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 CZ H PHE 223 ? ? 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