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'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP GRIA2_RAT P19491 ? 1 ;MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSEFRLTPHIDNLEVANSFAVTNAFCSQ FSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFPTDGTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLST LQAVLDSAAEKKWQVTAINVGNINNDKKDETYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIANL GFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTATIKYTSALTYDAVQVMTEAFRNLRKQRIE ISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVEGLSGNIKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLT ELPSGNDTSGLENKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKI WNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVV LFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTAN LAAFLTVERMVSPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGK YAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSGGGD SKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCYKSRAEAKRMKVAKNPQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIES VKI ; 1 2 UNP CCG2_RAT Q71RJ2 ? 2 ;MGLFDRGVQMLLTTVGAFAAFSLMTIAVGTDYWLYSRGVCKTKSVSENETSKKNEEVMTHSGLWRTCCLEGNFKGLCKQI DHFPEDADYEADTAEYFLRAVRASSIFPILSVILLFMGGLCIAASEFYKTRHNIILSAGIFFVSAGLSNIIGIIVYISAN AGDPSKSDSKKNSYSYGWSFYFGALSFIIAEMVGVLAVHMFIDRHKQLRATARATDYLQASAITRIPSYRYRYQRRSRSS SRSTEPSHSRDASPVGVKGFNTLPSTEISMYTLSRDPLKAATTPTATYNSDRDNSFLQVHNCIQKDSKDSLHANTANRRT TPV ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 5VOV A 1 ? 889 ? 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'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 5VOV _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 5VOV _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 15268 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.716 ? 20763 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 7.601 ? 8931 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.043 ? 2483 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 ? 2688 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 5VOV _struct.title 'Structure of AMPA receptor-TARP complex' _struct.pdbx_descriptor 'GluA2 AMPA receptor, Transmembrane AMPA receptor regulatory protein gamma-2' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 5VOV _struct_keywords.text ;AMPA receptor-TARP complex, TARP modulation mechanism, full agonist bound, desensitized ensemble., membrane protein, metal transport ; _struct_keywords.pdbx_keywords 'membrane protein, metal transport' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? 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GLY C 757 TYR C 768 1 ? 12 HELX_P HELX_P48 AF3 SER C 809 ? LYS C 847 ? SER C 788 LYS C 826 1 ? 39 HELX_P HELX_P49 AF4 ASN D 432 ? LEU D 436 ? ASN D 411 LEU D 415 5 ? 5 HELX_P HELX_P50 AF5 GLU D 437 ? GLU D 440 ? GLU D 416 GLU D 419 5 ? 4 HELX_P HELX_P51 AF6 GLY D 444 ? GLY D 458 ? GLY D 423 GLY D 437 1 ? 15 HELX_P HELX_P52 AF7 ASN D 482 ? TYR D 490 ? ASN D 461 TYR D 469 1 ? 9 HELX_P HELX_P53 AF8 THR D 503 ? GLU D 508 ? THR D 482 GLU D 487 1 ? 6 HELX_P HELX_P54 AF9 PHE D 536 ? ASP D 540 ? PHE D 515 ASP D 519 5 ? 5 HELX_P HELX_P55 AG1 ALA D 543 ? ARG D 566 ? ALA D 522 ARG D 545 1 ? 24 HELX_P HELX_P56 AG2 GLY D 593 ? MET D 606 ? GLY D 572 MET D 585 1 ? 14 HELX_P HELX_P57 AG3 LEU D 617 ? VAL D 647 ? LEU D 596 VAL D 626 1 ? 31 HELX_P HELX_P58 AG4 SER D 656 ? LYS D 662 ? SER D 635 LYS D 641 1 ? 7 HELX_P HELX_P59 AG5 GLY D 674 ? SER D 683 ? GLY D 653 SER D 662 1 ? 10 HELX_P HELX_P60 AG6 ILE D 685 ? ARG D 696 ? ILE D 664 ARG D 675 1 ? 12 HELX_P HELX_P61 AG7 THR D 706 ? SER D 717 ? THR D 685 SER D 696 1 ? 12 HELX_P HELX_P62 AG8 SER D 727 ? GLN D 735 ? SER D 706 GLN D 714 1 ? 9 HELX_P HELX_P63 AG9 SER D 762 ? GLN D 777 ? SER D 741 GLN D 756 1 ? 16 HELX_P HELX_P64 AH1 GLY D 778 ? TYR D 789 ? GLY D 757 TYR D 768 1 ? 12 HELX_P HELX_P65 AH2 LEU D 810 ? LYS D 847 ? LEU D 789 LYS D 826 1 ? 38 HELX_P HELX_P66 AH3 GLY E 7 ? THR E 30 ? GLY E 7 THR E 30 1 ? 24 HELX_P HELX_P67 AH4 THR E 93 ? ALA E 103 ? THR E 93 ALA E 103 1 ? 11 HELX_P HELX_P68 AH5 SER E 105 ? PHE E 127 ? SER E 105 PHE E 127 1 ? 23 HELX_P HELX_P69 AH6 ASN E 133 ? ASN E 160 ? ASN E 133 ASN E 160 1 ? 28 HELX_P HELX_P70 AH7 GLY E 177 ? THR E 211 ? GLY E 177 THR E 211 1 ? 35 HELX_P HELX_P71 AH8 GLY F 7 ? THR F 30 ? GLY F 7 THR F 30 1 ? 24 HELX_P HELX_P72 AH9 ALA F 94 ? ALA F 103 ? ALA F 94 ALA F 103 1 ? 10 HELX_P HELX_P73 AI1 SER F 105 ? GLU F 126 ? SER F 105 GLU F 126 1 ? 22 HELX_P HELX_P74 AI2 HIS F 132 ? ASN F 160 ? HIS F 132 ASN F 160 1 ? 29 HELX_P HELX_P75 AI3 GLY F 177 ? ARG F 213 ? GLY F 177 ARG F 213 1 ? 37 HELX_P HELX_P76 AI4 GLY G 7 ? THR G 30 ? GLY G 7 THR G 30 1 ? 24 HELX_P HELX_P77 AI5 THR G 93 ? ALA G 103 ? THR G 93 ALA G 103 1 ? 11 HELX_P HELX_P78 AI6 SER G 105 ? PHE G 127 ? SER G 105 PHE G 127 1 ? 23 HELX_P HELX_P79 AI7 ASN G 133 ? ASN G 160 ? ASN G 133 ASN G 160 1 ? 28 HELX_P HELX_P80 AI8 GLY G 177 ? THR G 211 ? GLY G 177 THR G 211 1 ? 35 HELX_P HELX_P81 AI9 GLY H 7 ? THR H 30 ? GLY H 7 THR H 30 1 ? 24 HELX_P HELX_P82 AJ1 ALA H 94 ? ALA H 103 ? ALA H 94 ALA H 103 1 ? 10 HELX_P HELX_P83 AJ2 SER H 105 ? GLU H 126 ? SER H 105 GLU H 126 1 ? 22 HELX_P HELX_P84 AJ3 HIS H 132 ? ASN H 160 ? HIS H 132 ASN H 160 1 ? 29 HELX_P HELX_P85 AJ4 GLY H 177 ? ARG H 213 ? GLY H 177 ARG H 213 1 ? 37 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf1 disulf ? ? 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H CYS 67 H CYS 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 424 A . ? SER 403 A PRO 425 A ? PRO 404 A 1 11.88 2 GLU 699 A . ? GLU 678 A PRO 700 A ? PRO 679 A 1 -15.37 3 LYS 737 A . ? LYS 716 A PRO 738 A ? 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