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'X-RAY DIFFRACTION' 5.8312 48.7684 . . 137 13804 98.00 . . . 0.2455 . 0.2112 . . . . . . . . . . # _struct.entry_id 6ABH _struct.title 'Structure of a natural red emitting luciferase from Phrixothrix hirtus (P1 crystal form)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6ABH _struct_keywords.text 'bioluminescence, Luciferase, Red emission, LUMINESCENT PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'LUMINESCENT PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? 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ASN H 402 LEU H 410 1 ? 9 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PHE 265 A . ? PHE 265 A GLU 266 A ? GLU 266 A 1 5.13 2 LEU 201 C . ? LEU 201 C PRO 202 C ? PRO 202 C 1 -11.63 3 ALA 293 C . ? ALA 293 C LYS 294 C ? LYS 294 C 1 -25.11 4 ILE 360 C . ? ILE 360 C GLY 361 C ? GLY 361 C 1 -1.95 5 PHE 429 D . ? PHE 429 D ILE 430 D ? ILE 430 D 1 -6.65 6 ASP 434 D . ? ASP 434 D ARG 435 D ? ARG 435 D 1 -0.82 7 ARG 353 E . ? ARG 353 E GLU 354 E ? GLU 354 E 1 -14.54 8 LYS 356 F . ? LYS 356 F LYS 357 F ? LYS 357 F 1 -7.12 9 ALA 359 F . ? ALA 359 F ILE 360 F ? ILE 360 F 1 3.91 10 GLY 422 G . ? GLY 422 G TYR 423 G ? TYR 423 G 1 -14.12 11 LYS 412 H . ? LYS 412 H ASP 413 H ? ASP 413 H 1 -6.32 12 GLU 426 H . ? GLU 426 H ASP 427 H ? ASP 427 H 1 -8.02 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 6 ? AA2 ? 5 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 6 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 6 ? AA9 ? 7 ? AB1 ? 3 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 6 ? AB4 ? 7 ? AB5 ? 6 ? AB6 ? 5 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 3 ? AC1 ? 6 ? AC2 ? 5 ? AC3 ? 3 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 6 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 2 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 6 ? AD1 ? 5 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? parallel AA1 5 6 ? parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? parallel AA2 3 4 ? parallel AA2 4 5 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? parallel AA4 3 4 ? parallel AA4 4 5 ? parallel AA4 5 6 ? parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? parallel AA5 3 4 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? parallel AA8 3 4 ? parallel AA8 4 5 ? parallel AA8 5 6 ? parallel AA9 1 2 ? parallel AA9 2 3 ? parallel AA9 3 4 ? parallel AA9 4 5 ? parallel AA9 5 6 ? parallel AA9 6 7 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? parallel AB3 3 4 ? parallel AB3 4 5 ? parallel AB3 5 6 ? parallel AB4 1 2 ? parallel AB4 2 3 ? parallel AB4 3 4 ? parallel AB4 4 5 ? parallel AB4 5 6 ? parallel AB4 6 7 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? parallel AB5 3 4 ? parallel AB5 4 5 ? parallel AB5 5 6 ? parallel AB6 1 2 ? parallel AB6 2 3 ? parallel AB6 3 4 ? parallel AB6 4 5 ? parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? parallel AC1 3 4 ? parallel AC1 4 5 ? parallel AC1 5 6 ? parallel AC2 1 2 ? parallel AC2 2 3 ? parallel AC2 3 4 ? parallel AC2 4 5 ? parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? parallel AC5 3 4 ? parallel AC5 4 5 ? parallel AC5 5 6 ? parallel AC6 1 2 ? parallel AC6 2 3 ? parallel AC6 3 4 ? parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? parallel AC9 3 4 ? parallel AC9 4 5 ? parallel AC9 5 6 ? parallel AD1 1 2 ? parallel AD1 2 3 ? parallel AD1 3 4 ? parallel AD1 4 5 ? parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 VAL A 47 ? ILE A 48 ? VAL A 47 ILE A 48 AA1 2 ILE A 39 ? ASP A 41 ? ILE A 39 ASP A 41 AA1 3 LYS A 258 ? MET A 261 ? LYS A 258 MET A 261 AA1 4 SER A 233 ? ALA A 236 ? SER A 233 ALA A 236 AA1 5 SER A 281 ? VAL A 283 ? SER A 281 VAL A 283 AA1 6 GLU A 308 ? ALA A 310 ? GLU A 308 ALA A 310 AA2 1 MET A 99 ? SER A 102 ? MET A 99 SER A 102 AA2 2 VAL A 75 ? CYS A 78 ? VAL A 75 CYS A 78 AA2 3 LEU A 122 ? CYS A 125 ? LEU A 122 CYS A 125 AA2 4 LYS A 145 ? VAL A 148 ? LYS A 145 VAL A 148 AA2 5 GLU A 159 ? CYS A 160 ? GLU A 159 CYS A 160 AA3 1 THR A 189 ? SER A 195 ? THR A 189 SER A 195 AA3 2 LYS A 203 ? SER A 208 ? LYS A 203 SER A 208 AA4 1 VAL B 47 ? ILE B 48 ? VAL B 47 ILE B 48 AA4 2 ILE B 39 ? ASP B 41 ? ILE B 39 ASP B 41 AA4 3 LYS B 258 ? MET B 261 ? LYS B 258 MET B 261 AA4 4 SER B 233 ? ALA B 236 ? SER B 233 ALA B 236 AA4 5 SER B 281 ? VAL B 284 ? SER B 281 VAL B 284 AA4 6 GLU B 308 ? CYS B 311 ? GLU B 308 CYS B 311 AA5 1 MET B 99 ? THR B 101 ? MET B 99 THR B 101 AA5 2 VAL B 75 ? CYS B 78 ? VAL B 75 CYS B 78 AA5 3 LEU B 122 ? CYS B 125 ? LEU B 122 CYS B 125 AA5 4 LYS B 145 ? VAL B 148 ? LYS B 145 VAL B 148 AA6 1 THR B 189 ? MET B 193 ? THR B 189 MET B 193 AA6 2 VAL B 205 ? SER B 208 ? VAL B 205 SER B 208 AA7 1 VAL B 367 ? LYS B 370 ? VAL B 367 LYS B 370 AA7 2 CYS B 389 ? SER B 392 ? CYS B 389 SER B 392 AA7 3 LEU B 416 ? HIS B 417 ? LEU B 416 HIS B 417 AA8 1 VAL C 47 ? ILE C 48 ? VAL C 47 ILE C 48 AA8 2 ILE C 39 ? ASP C 41 ? ILE C 39 ASP C 41 AA8 3 LYS C 258 ? MET C 261 ? LYS C 258 MET C 261 AA8 4 SER C 233 ? ALA C 236 ? SER C 233 ALA C 236 AA8 5 SER C 281 ? VAL C 283 ? SER C 281 VAL C 283 AA8 6 GLU C 308 ? ALA C 310 ? GLU C 308 ALA C 310 AA9 1 GLU C 159 ? CYS C 160 ? GLU C 159 CYS C 160 AA9 2 LYS C 145 ? VAL C 148 ? LYS C 145 VAL C 148 AA9 3 LEU C 122 ? CYS C 125 ? LEU C 122 CYS C 125 AA9 4 VAL C 75 ? CYS C 78 ? VAL C 75 CYS C 78 AA9 5 MET C 99 ? THR C 101 ? MET C 99 THR C 101 AA9 6 THR C 189 ? MET C 193 ? THR C 189 MET C 193 AA9 7 VAL C 205 ? SER C 208 ? VAL C 205 SER C 208 AB1 1 VAL C 367 ? VAL C 371 ? VAL C 367 VAL C 371 AB1 2 ILE C 388 ? SER C 392 ? ILE C 388 SER C 392 AB1 3 LEU C 416 ? HIS C 417 ? LEU C 416 HIS C 417 AB2 1 VAL D 7 ? ASN D 8 ? VAL D 7 ASN D 8 AB2 2 VAL D 367 ? ILE D 372 ? VAL D 367 ILE D 372 AB2 3 GLU D 387 ? SER D 392 ? GLU D 387 SER D 392 AB2 4 LEU D 416 ? LEU D 421 ? LEU D 416 LEU D 421 AB3 1 VAL D 47 ? ILE D 48 ? VAL D 47 ILE D 48 AB3 2 ILE D 39 ? ASP D 41 ? ILE D 39 ASP D 41 AB3 3 LYS D 258 ? MET D 261 ? LYS D 258 MET D 261 AB3 4 SER D 233 ? ALA D 236 ? SER D 233 ALA D 236 AB3 5 SER D 281 ? VAL D 283 ? SER D 281 VAL D 283 AB3 6 GLU D 308 ? ALA D 310 ? GLU D 308 ALA D 310 AB4 1 GLU D 159 ? CYS D 160 ? GLU D 159 CYS D 160 AB4 2 LYS D 145 ? VAL D 148 ? LYS D 145 VAL D 148 AB4 3 LEU D 122 ? CYS D 125 ? LEU D 122 CYS D 125 AB4 4 VAL D 75 ? CYS D 78 ? VAL D 75 CYS D 78 AB4 5 MET D 99 ? THR D 101 ? MET D 99 THR D 101 AB4 6 THR D 189 ? SER D 195 ? THR D 189 SER D 195 AB4 7 LYS D 203 ? SER D 208 ? LYS D 203 SER D 208 AB5 1 VAL E 47 ? ILE E 48 ? VAL E 47 ILE E 48 AB5 2 ILE E 39 ? ASP E 41 ? ILE E 39 ASP E 41 AB5 3 LYS E 258 ? MET E 261 ? LYS E 258 MET E 261 AB5 4 SER E 233 ? ALA E 236 ? SER E 233 ALA E 236 AB5 5 SER E 281 ? VAL E 283 ? SER E 281 VAL E 283 AB5 6 GLU E 308 ? ALA E 310 ? GLU E 308 ALA E 310 AB6 1 MET E 99 ? THR E 101 ? MET E 99 THR E 101 AB6 2 VAL E 75 ? CYS E 78 ? VAL E 75 CYS E 78 AB6 3 LEU E 122 ? CYS E 125 ? LEU E 122 CYS E 125 AB6 4 LYS E 145 ? VAL E 148 ? LYS E 145 VAL E 148 AB6 5 GLU E 159 ? CYS E 160 ? GLU E 159 CYS E 160 AB7 1 THR E 189 ? MET E 193 ? THR E 189 MET E 193 AB7 2 VAL E 205 ? SER E 208 ? VAL E 205 SER E 208 AB8 1 VAL E 367 ? GLN E 368 ? VAL E 367 GLN E 368 AB8 2 CYS E 389 ? SER E 392 ? CYS E 389 SER E 392 AB8 3 LEU E 416 ? HIS E 417 ? LEU E 416 HIS E 417 AB9 1 VAL F 7 ? ASN F 8 ? VAL F 7 ASN F 8 AB9 2 VAL F 367 ? VAL F 369 ? VAL F 367 VAL F 369 AB9 3 PHE F 390 ? SER F 392 ? PHE F 390 SER F 392 AC1 1 VAL F 47 ? ILE F 48 ? VAL F 47 ILE F 48 AC1 2 ILE F 39 ? ASP F 41 ? ILE F 39 ASP F 41 AC1 3 LYS F 258 ? MET F 261 ? LYS F 258 MET F 261 AC1 4 SER F 233 ? ALA F 236 ? SER F 233 ALA F 236 AC1 5 SER F 281 ? VAL F 284 ? SER F 281 VAL F 284 AC1 6 GLU F 308 ? CYS F 311 ? GLU F 308 CYS F 311 AC2 1 MET F 99 ? THR F 101 ? MET F 99 THR F 101 AC2 2 VAL F 75 ? CYS F 78 ? VAL F 75 CYS F 78 AC2 3 LEU F 122 ? CYS F 125 ? LEU F 122 CYS F 125 AC2 4 LYS F 145 ? VAL F 148 ? LYS F 145 VAL F 148 AC2 5 GLU F 159 ? CYS F 160 ? GLU F 159 CYS F 160 AC3 1 THR F 189 ? SER F 195 ? THR F 189 SER F 195 AC3 2 LYS F 203 ? SER F 208 ? LYS F 203 SER F 208 AC3 3 GLY F 398 ? TYR F 399 ? GLY F 398 TYR F 399 AC4 1 ILE F 347 ? LEU F 348 ? ILE F 347 LEU F 348 AC4 2 THR F 362 ? PRO F 363 ? THR F 362 PRO F 363 AC5 1 VAL G 47 ? ILE G 48 ? VAL G 47 ILE G 48 AC5 2 ILE G 39 ? ASP G 41 ? ILE G 39 ASP G 41 AC5 3 LYS G 258 ? MET G 261 ? LYS G 258 MET G 261 AC5 4 SER G 233 ? ALA G 236 ? SER G 233 ALA G 236 AC5 5 SER G 281 ? VAL G 284 ? SER G 281 VAL G 284 AC5 6 GLU G 308 ? CYS G 311 ? GLU G 308 CYS G 311 AC6 1 MET G 99 ? THR G 101 ? MET G 99 THR G 101 AC6 2 VAL G 75 ? CYS G 78 ? VAL G 75 CYS G 78 AC6 3 LEU G 122 ? CYS G 125 ? LEU G 122 CYS G 125 AC6 4 LYS G 145 ? VAL G 148 ? LYS G 145 VAL G 148 AC7 1 THR G 189 ? SER G 195 ? THR G 189 SER G 195 AC7 2 LYS G 203 ? SER G 208 ? LYS G 203 SER G 208 AC8 1 VAL G 367 ? GLN G 368 ? VAL G 367 GLN G 368 AC8 2 LYS G 391 ? SER G 392 ? LYS G 391 SER G 392 AC9 1 VAL H 47 ? ILE H 48 ? VAL H 47 ILE H 48 AC9 2 ILE H 39 ? ASP H 41 ? ILE H 39 ASP H 41 AC9 3 LYS H 258 ? MET H 261 ? LYS H 258 MET H 261 AC9 4 SER H 233 ? ALA H 236 ? SER H 233 ALA H 236 AC9 5 SER H 281 ? VAL H 284 ? SER H 281 VAL H 284 AC9 6 GLU H 308 ? CYS H 311 ? GLU H 308 CYS H 311 AD1 1 MET H 99 ? THR H 101 ? MET H 99 THR H 101 AD1 2 VAL H 75 ? CYS H 78 ? VAL H 75 CYS H 78 AD1 3 LEU H 122 ? CYS H 125 ? LEU H 122 CYS H 125 AD1 4 LYS H 145 ? VAL H 148 ? LYS H 145 VAL H 148 AD1 5 GLU H 159 ? CYS H 160 ? GLU H 159 CYS H 160 AD2 1 THR H 189 ? THR H 194 ? THR H 189 THR H 194 AD2 2 GLY H 204 ? SER H 208 ? GLY H 204 SER H 208 AD3 1 ILE H 347 ? LEU H 348 ? ILE H 347 LEU H 348 AD3 2 THR H 362 ? PRO H 363 ? THR H 362 PRO H 363 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 O ILE A 48 ? 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