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B TRP 404 CH2 2873 1 Y 1 B THR 403 ? OG1 ? B THR 405 OG1 2874 1 Y 1 B THR 403 ? CG2 ? B THR 405 CG2 2875 1 Y 1 B GLU 404 ? CG ? B GLU 406 CG 2876 1 Y 1 B GLU 404 ? CD ? B GLU 406 CD 2877 1 Y 1 B GLU 404 ? OE1 ? B GLU 406 OE1 2878 1 Y 1 B GLU 404 ? OE2 ? B GLU 406 OE2 2879 1 Y 1 B TYR 405 ? CG ? B TYR 407 CG 2880 1 Y 1 B TYR 405 ? CD1 ? B TYR 407 CD1 2881 1 Y 1 B TYR 405 ? CD2 ? B TYR 407 CD2 2882 1 Y 1 B TYR 405 ? CE1 ? B TYR 407 CE1 2883 1 Y 1 B TYR 405 ? CE2 ? B TYR 407 CE2 2884 1 Y 1 B TYR 405 ? CZ ? B TYR 407 CZ 2885 1 Y 1 B TYR 405 ? OH ? B TYR 407 OH 2886 1 Y 1 B TRP 406 ? CG ? B TRP 408 CG 2887 1 Y 1 B TRP 406 ? CD1 ? B TRP 408 CD1 2888 1 Y 1 B TRP 406 ? CD2 ? B TRP 408 CD2 2889 1 Y 1 B TRP 406 ? NE1 ? B TRP 408 NE1 2890 1 Y 1 B TRP 406 ? CE2 ? B TRP 408 CE2 2891 1 Y 1 B TRP 406 ? CE3 ? B TRP 408 CE3 2892 1 Y 1 B TRP 406 ? CZ2 ? B TRP 408 CZ2 2893 1 Y 1 B TRP 406 ? CZ3 ? B TRP 408 CZ3 2894 1 Y 1 B TRP 406 ? CH2 ? B TRP 408 CH2 2895 1 Y 1 B GLN 407 ? CG ? B GLN 409 CG 2896 1 Y 1 B GLN 407 ? CD ? B GLN 409 CD 2897 1 Y 1 B GLN 407 ? OE1 ? B GLN 409 OE1 2898 1 Y 1 B GLN 407 ? NE2 ? B GLN 409 NE2 2899 1 Y 1 B PRO 412 ? CG ? B PRO 414 CG 2900 1 Y 1 B PRO 412 ? CD ? B PRO 414 CD 2901 1 Y 1 B GLU 413 ? CG ? B GLU 415 CG 2902 1 Y 1 B GLU 413 ? CD ? B GLU 415 CD 2903 1 Y 1 B GLU 413 ? OE1 ? B GLU 415 OE1 2904 1 Y 1 B GLU 413 ? OE2 ? B GLU 415 OE2 2905 1 Y 1 B TRP 414 ? CG ? B TRP 416 CG 2906 1 Y 1 B TRP 414 ? CD1 ? B TRP 416 CD1 2907 1 Y 1 B TRP 414 ? CD2 ? B TRP 416 CD2 2908 1 Y 1 B TRP 414 ? NE1 ? B TRP 416 NE1 2909 1 Y 1 B TRP 414 ? CE2 ? B TRP 416 CE2 2910 1 Y 1 B TRP 414 ? CE3 ? B TRP 416 CE3 2911 1 Y 1 B TRP 414 ? CZ2 ? B TRP 416 CZ2 2912 1 Y 1 B TRP 414 ? CZ3 ? B TRP 416 CZ3 2913 1 Y 1 B TRP 414 ? CH2 ? B TRP 416 CH2 2914 1 Y 1 B GLU 415 ? CG ? B GLU 417 CG 2915 1 Y 1 B GLU 415 ? CD ? B GLU 417 CD 2916 1 Y 1 B GLU 415 ? OE1 ? B GLU 417 OE1 2917 1 Y 1 B GLU 415 ? OE2 ? B GLU 417 OE2 2918 1 Y 1 B PHE 416 ? CG ? B PHE 418 CG 2919 1 Y 1 B PHE 416 ? CD1 ? B PHE 418 CD1 2920 1 Y 1 B PHE 416 ? CD2 ? B PHE 418 CD2 2921 1 Y 1 B PHE 416 ? CE1 ? B PHE 418 CE1 2922 1 Y 1 B PHE 416 ? CE2 ? B PHE 418 CE2 2923 1 Y 1 B PHE 416 ? CZ ? B PHE 418 CZ 2924 1 Y 1 B VAL 417 ? CG1 ? B VAL 419 CG1 2925 1 Y 1 B VAL 417 ? CG2 ? B VAL 419 CG2 2926 1 Y 1 B ASN 418 ? CG ? B ASN 420 CG 2927 1 Y 1 B ASN 418 ? OD1 ? B ASN 420 OD1 2928 1 Y 1 B ASN 418 ? ND2 ? B ASN 420 ND2 2929 1 Y 1 B THR 419 ? OG1 ? B THR 421 OG1 2930 1 Y 1 B THR 419 ? CG2 ? B THR 421 CG2 2931 1 Y 1 B PRO 420 ? CG ? B PRO 422 CG 2932 1 Y 1 B PRO 420 ? CD ? B PRO 422 CD 2933 1 Y 1 B PRO 421 ? CG ? B PRO 423 CG 2934 1 Y 1 B PRO 421 ? CD ? B PRO 423 CD 2935 1 Y 1 B LEU 422 ? CG ? B LEU 424 CG 2936 1 Y 1 B LEU 422 ? CD1 ? B LEU 424 CD1 2937 1 Y 1 B LEU 422 ? CD2 ? B LEU 424 CD2 2938 1 Y 1 B VAL 423 ? CG1 ? B VAL 425 CG1 2939 1 Y 1 B VAL 423 ? CG2 ? B VAL 425 CG2 2940 1 Y 1 B LYS 424 ? CG ? B LYS 426 CG 2941 1 Y 1 B LYS 424 ? CD ? B LYS 426 CD 2942 1 Y 1 B LYS 424 ? CE ? B LYS 426 CE 2943 1 Y 1 B LYS 424 ? NZ ? B LYS 426 NZ 2944 1 Y 1 B LEU 425 ? CG ? B LEU 427 CG 2945 1 Y 1 B LEU 425 ? CD1 ? B LEU 427 CD1 2946 1 Y 1 B LEU 425 ? CD2 ? B LEU 427 CD2 2947 1 Y 1 B TRP 426 ? CG ? B TRP 428 CG 2948 1 Y 1 B TRP 426 ? CD1 ? B TRP 428 CD1 2949 1 Y 1 B TRP 426 ? CD2 ? B TRP 428 CD2 2950 1 Y 1 B TRP 426 ? NE1 ? B TRP 428 NE1 2951 1 Y 1 B TRP 426 ? CE2 ? B TRP 428 CE2 2952 1 Y 1 B TRP 426 ? CE3 ? B TRP 428 CE3 2953 1 Y 1 B TRP 426 ? CZ2 ? B TRP 428 CZ2 2954 1 Y 1 B TRP 426 ? CZ3 ? B TRP 428 CZ3 2955 1 Y 1 B TRP 426 ? CH2 ? B TRP 428 CH2 2956 1 Y 1 B TYR 427 ? CG ? B TYR 429 CG 2957 1 Y 1 B TYR 427 ? CD1 ? B TYR 429 CD1 2958 1 Y 1 B TYR 427 ? CD2 ? B TYR 429 CD2 2959 1 Y 1 B TYR 427 ? CE1 ? B TYR 429 CE1 2960 1 Y 1 B TYR 427 ? CE2 ? B TYR 429 CE2 2961 1 Y 1 B TYR 427 ? CZ ? B TYR 429 CZ 2962 1 Y 1 B TYR 427 ? OH ? B TYR 429 OH 2963 1 Y 1 B GLN 428 ? CG ? B GLN 430 CG 2964 1 Y 1 B GLN 428 ? CD ? B GLN 430 CD 2965 1 Y 1 B GLN 428 ? OE1 ? B GLN 430 OE1 2966 1 Y 1 B GLN 428 ? NE2 ? B GLN 430 NE2 2967 1 Y 1 C G 181 ? P ? C G 59 P 2968 1 Y 1 C G 181 ? OP1 ? C G 59 OP1 2969 1 Y 1 C G 181 ? OP2 ? C G 59 OP2 2970 1 Y 1 C G 181 ? "O5'" ? C G 59 "O5'" 2971 1 Y 1 C G 181 ? "C5'" ? C G 59 "C5'" 2972 1 Y 1 D DC 77 ? "O3'" ? D DC 77 "O3'" # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 6B19 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6B19 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6B19 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 6B19 _struct.title 'Architecture of HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6B19 _struct_keywords.text ;Reverse Transcriptase, tRNA, HIV-1, Reverse Transcription, RNA, Transcription, Complex, RNA-binding protein, backbone model, VIRAL PROTEIN-RNA complex ; _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN/RNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP POL_HV1B1 P03366 ? 1 ;PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALVEICTEMEKEGKISKIGPENPYNTPVFAIKKKDSTKWRKLVDFREL NKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKKKSVTVLDVGDAYFSVPLDEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIF QSSMTKILEPFKKQNPDIVIYQYMDDLYVGSDLEIGQHRTKIEELRQHLLRWGLTTPDKKHQKEPPFLWMGYELHPDKWT VQPIVLPEKDSWTVNDIQKLVGKLNWASQIYPGIKVRQLCKLLRGTKALTEVIPLTEEAELELAENREILKEPVHGVYYD PSKDLIAEIQKQGQGQWTYQIYQEPFKNLKTGKYARMRGAHTNDVKQLTEAVQKITTESIVIWGKTPKFKLPIQKETWET WWTEYWQATWIPEWEFVNTPPLVKLWYQLEKEPIVGAETFYVDGAANRETKLGKAGYVTNKGRQKVVPLTNTTNQKTELQ AIYLALQDSGLEVNIVTDSQYALGIIQAQPDKSESELVNQIIEQLIKKEKVYLAWVPAHKGIGGNEQVDKLVSAGIRKIL ; 600 2 UNP POL_HV1B1 P03366 ? 2 ;PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALVEICTEMEKEGKISKIGPENPYNTPVFAIKKKDSTKWRKLVDFREL NKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKKKSVTVLDVGDAYFSVPLDEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIF QSSMTKILEPFKKQNPDIVIYQYMDDLYVGSDLEIGQHRTKIEELRQHLLRWGLTTPDKKHQKEPPFLWMGYELHPDKWT VQPIVLPEKDSWTVNDIQKLVGKLNWASQIYPGIKVRQLCKLLRGTKALTEVIPLTEEAELELAENREILKEPVHGVYYD PSKDLIAEIQKQGQGQWTYQIYQEPFKNLKTGKYARMRGAHTNDVKQLTEAVQKITTESIVIWGKTPKFKLPIQKETWET WWTEYWQATWIPEWEFVNTPPLVKLWYQLEKEPIVGAETF ; 600 3 GB AY835748.1 60651827 ? 3 ;GACUCUGGUAACUAGAGAUCCCUCAGACCCUUUUAGUCAGUGUGGAAAAUCUCUAGCAGUGGCGCCCGAACAGGGACUUG AAAGCGAAAGUAAAGCCAGAG ; 577 4 PDB 6B19 6B19 ? 4 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6B19 A 3 ? 562 ? 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'expression tag' 561 6 1 6B19 LEU A 564 ? UNP P03366 ? ? 'expression tag' 562 7 1 6B19 GLY A 565 ? UNP P03366 ? ? 'expression tag' 563 8 1 6B19 THR A 566 ? UNP P03366 ? ? 'expression tag' 564 9 1 6B19 LEU A 567 ? UNP P03366 ? ? 'expression tag' 565 10 1 6B19 VAL A 568 ? UNP P03366 ? ? 'expression tag' 566 11 1 6B19 PRO A 569 ? UNP P03366 ? ? 'expression tag' 567 12 1 6B19 ARG A 570 ? UNP P03366 ? ? 'expression tag' 568 13 2 6B19 MET B 1 ? UNP P03366 ? ? 'expression tag' -1 14 2 6B19 VAL B 2 ? UNP P03366 ? ? 'expression tag' 0 15 2 6B19 SER B 282 ? UNP P03366 CYS 879 'engineered mutation' 280 16 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D # loop_ _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 1 1 homology ;Fitting of other HIV reverse transcriptase crystal structures validated our identification of the reverse transcriptase subunits, tRNA primer strand, and viral RNA template strand. ; 2 1 cross-linking ;tRNA has been crosslinked from position G71 to 258C on the p66 subunit of HIV reverse transcriptase. This helped validate the position of the viral RNA/tRNA duplex in the cleft. ; # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ALA A 35 ? GLU A 46 ? ALA A 33 GLU A 44 1 ? 12 HELX_P HELX_P2 AA2 PHE A 79 ? ARG A 85 ? PHE A 77 ARG A 83 1 ? 7 HELX_P HELX_P3 AA3 GLY A 157 ? ASN A 177 ? GLY A 155 ASN A 175 1 ? 21 HELX_P HELX_P4 AA4 GLY A 198 ? ARG A 213 ? GLY A 196 ARG A 211 1 ? 16 HELX_P HELX_P5 AA5 ASN A 257 ? SER A 270 ? ASN A 255 SER A 268 1 ? 14 HELX_P HELX_P6 AA6 GLN A 271 ? TYR A 273 ? GLN A 269 TYR A 271 5 ? 3 HELX_P HELX_P7 AA7 VAL A 278 ? LEU A 285 ? VAL A 276 LEU A 283 1 ? 8 HELX_P HELX_P8 AA8 THR A 298 ? GLU A 314 ? THR A 296 GLU A 312 1 ? 17 HELX_P HELX_P9 AA9 ASN A 365 ? TRP A 385 ? ASN A 363 TRP A 383 1 ? 21 HELX_P HELX_P10 AB1 GLN A 396 ? THR A 405 ? GLN A 394 THR A 403 1 ? 10 HELX_P HELX_P11 AB2 THR A 475 ? SER A 491 ? THR A 473 SER A 489 1 ? 17 HELX_P HELX_P12 AB3 SER A 501 ? ALA A 510 ? SER A 499 ALA A 508 1 ? 10 HELX_P HELX_P13 AB4 SER A 517 ? LYS A 530 ? SER A 515 LYS A 528 1 ? 14 HELX_P HELX_P14 AB5 ASN A 547 ? LYS A 552 ? ASN A 545 LYS A 550 1 ? 6 HELX_P HELX_P15 AB6 GLU B 30 ? GLY B 47 ? GLU B 28 GLY B 45 1 ? 18 HELX_P HELX_P16 AB7 PHE B 79 ? THR B 86 ? PHE B 77 THR B 84 1 ? 8 HELX_P HELX_P17 AB8 THR B 86 ? LEU B 94 ? THR B 84 LEU B 92 1 ? 9 HELX_P HELX_P18 AB9 ALA B 116 ? VAL B 120 ? ALA B 114 VAL B 118 5 ? 5 HELX_P HELX_P19 AC1 GLU B 124 ? LYS B 128 ? GLU B 122 LYS B 126 5 ? 5 HELX_P HELX_P20 AC2 SER B 136 ? GLU B 140 ? SER B 134 GLU B 138 5 ? 5 HELX_P HELX_P21 AC3 LYS B 156 ? PHE B 162 ? LYS B 154 PHE B 160 1 ? 7 HELX_P HELX_P22 AC4 PHE B 162 ? ASN B 177 ? PHE B 160 ASN B 175 1 ? 16 HELX_P HELX_P23 AC5 GLU B 196 ? TRP B 214 ? GLU B 194 TRP B 212 1 ? 19 HELX_P HELX_P24 AC6 THR B 255 ? SER B 270 ? THR B 253 SER B 268 1 ? 16 HELX_P HELX_P25 AC7 GLN B 280 ? LEU B 285 ? GLN B 278 LEU B 283 1 ? 6 HELX_P HELX_P26 AC8 THR B 298 ? GLU B 314 ? THR B 296 GLU B 312 1 ? 17 HELX_P HELX_P27 AC9 ASN B 365 ? GLY B 386 ? ASN B 363 GLY B 384 1 ? 22 HELX_P HELX_P28 AD1 GLN B 396 ? TRP B 404 ? GLN B 394 TRP B 402 1 ? 9 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role hydrog1 hydrog ? ? C G 59 N1 ? ? ? 1_555 D DC 77 N3 ? ? C G 181 D DC 77 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? C G 59 N2 ? ? ? 1_555 D DC 77 O2 ? ? C G 181 D DC 77 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? C G 59 O6 ? ? ? 1_555 D DC 77 N4 ? ? C G 181 D DC 77 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? C U 60 N3 ? ? ? 1_555 D A 76 N1 ? ? C U 182 D A 76 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? C U 60 O4 ? ? ? 1_555 D A 76 N6 ? ? C U 182 D A 76 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? C G 61 N1 ? ? ? 1_555 D C 75 N3 ? ? C G 183 D C 75 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? C G 61 N2 ? ? ? 1_555 D C 75 O2 ? ? C G 183 D C 75 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? C G 61 O6 ? ? ? 1_555 D C 75 N4 ? ? C G 183 D C 75 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? C G 62 N1 ? ? ? 1_555 D C 74 N3 ? ? C G 184 D C 74 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? C G 62 N2 ? ? ? 1_555 D C 74 O2 ? ? C G 184 D C 74 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? C G 62 O6 ? ? ? 1_555 D C 74 N4 ? ? C G 184 D C 74 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? C C 63 N3 ? ? ? 1_555 D G 73 N1 ? ? C C 185 D G 73 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? C C 63 N4 ? ? ? 1_555 D G 73 O6 ? ? C C 185 D G 73 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? C C 63 O2 ? ? ? 1_555 D G 73 N2 ? ? C C 185 D G 73 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? C G 64 N1 ? ? ? 1_555 D C 72 N3 ? ? C G 186 D C 72 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? C G 64 N2 ? ? ? 1_555 D C 72 O2 ? ? C G 186 D C 72 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? C G 64 O6 ? ? ? 1_555 D C 72 N4 ? ? C G 186 D C 72 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? C C 65 N3 ? ? ? 1_555 D DG 71 N1 ? ? C C 187 D DG 71 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? C C 65 N4 ? ? ? 1_555 D DG 71 O6 ? ? C C 187 D DG 71 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? C C 65 O2 ? ? ? 1_555 D DG 71 N2 ? ? C C 187 D DG 71 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? C C 66 N3 ? ? ? 1_555 D G 70 N1 ? ? C C 188 D G 70 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? C C 66 N4 ? ? ? 1_555 D G 70 O6 ? ? C C 188 D G 70 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? C C 66 O2 ? ? ? 1_555 D G 70 N2 ? ? C C 188 D G 70 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? C C 67 N3 ? ? ? 1_555 D G 69 N1 ? ? C C 189 D G 69 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? C C 67 N4 ? ? ? 1_555 D G 69 O6 ? ? C C 189 D G 69 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? C C 67 O2 ? ? ? 1_555 D G 69 N2 ? ? C C 189 D G 69 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? C G 68 N1 ? ? ? 1_555 D C 68 N3 ? ? C G 190 D C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? C G 68 N2 ? ? ? 1_555 D C 68 O2 ? ? C G 190 D C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? C G 68 O6 ? ? ? 1_555 D C 68 N4 ? ? C G 190 D C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? C A 69 N1 ? ? ? 1_555 D U 67 N3 ? ? C A 191 D U 67 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? C A 69 N6 ? ? ? 1_555 D U 67 O4 ? ? C A 191 D U 67 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? C A 70 N1 ? ? ? 1_555 D U 66 N3 ? ? C A 192 D U 66 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? C A 70 N6 ? ? ? 1_555 D U 66 O4 ? ? C A 192 D U 66 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? C C 71 N3 ? ? ? 1_555 D G 65 N1 ? ? C C 193 D G 65 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog35 hydrog ? ? C C 71 N4 ? ? ? 1_555 D G 65 O6 ? ? C C 193 D G 65 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog36 hydrog ? ? C C 71 O2 ? ? ? 1_555 D G 65 N2 ? ? C C 193 D G 65 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog37 hydrog ? ? C A 72 N1 ? ? ? 1_555 D U 64 N3 ? ? C A 194 D U 64 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog38 hydrog ? ? C A 72 N6 ? ? ? 1_555 D U 64 O4 ? ? C A 194 D U 64 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? C G 73 N1 ? ? ? 1_555 D C 63 N3 ? ? C G 195 D C 63 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? C G 73 N2 ? ? ? 1_555 D C 63 O2 ? ? C G 195 D C 63 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog41 hydrog ? ? C G 73 O6 ? ? ? 1_555 D C 63 N4 ? ? C G 195 D C 63 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? C G 74 N1 ? ? ? 1_555 D C 62 N3 ? ? C G 196 D C 62 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? C G 74 N2 ? ? ? 1_555 D C 62 O2 ? ? C G 196 D C 62 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? C G 74 O6 ? ? ? 1_555 D C 62 N4 ? ? C G 196 D C 62 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? C G 75 N1 ? ? ? 1_555 D C 61 N3 ? ? C G 197 D C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? C G 75 N2 ? ? ? 1_555 D C 61 O2 ? ? C G 197 D C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? C G 75 O6 ? ? ? 1_555 D C 61 N4 ? ? C G 197 D C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? C A 76 N1 ? ? ? 1_555 D U 60 N3 ? ? C A 198 D U 60 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? C A 76 N6 ? ? ? 1_555 D U 60 O4 ? ? C A 198 D U 60 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog50 hydrog ? ? C C 77 N3 ? ? ? 1_555 D G 59 N1 ? ? C C 199 D G 59 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog51 hydrog ? ? C C 77 N4 ? ? ? 1_555 D G 59 O6 ? ? C C 199 D G 59 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog52 hydrog ? ? C C 77 O2 ? ? ? 1_555 D G 59 N2 ? ? C C 199 D G 59 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 5 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? parallel AA3 4 5 ? parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ILE A 49 ? SER A 50 ? ILE A 47 SER A 48 AA1 2 GLN A 147 ? TYR A 148 ? GLN A 145 TYR A 146 AA2 1 VAL A 181 ? ILE A 182 ? VAL A 179 ILE A 180 AA2 2 VAL A 191 ? GLY A 192 ? VAL A 189 GLY A 190 AA3 1 LYS A 352 ? LYS A 355 ? LYS A 350 LYS A 353 AA3 2 GLN A 338 ? TYR A 344 ? GLN A 336 TYR A 342 AA3 3 ILE A 328 ? GLY A 335 ? ILE A 326 GLY A 333 AA3 4 LYS A 390 ? LYS A 392 ? LYS A 388 LYS A 390 AA3 5 TRP A 416 ? GLU A 417 ? TRP A 414 GLU A 415 AA4 1 TYR A 443 ? ASP A 445 ? TYR A 441 ASP A 443 AA4 2 ALA A 457 ? VAL A 460 ? ALA A 455 VAL A 458 AA4 3 LYS A 467 ? VAL A 469 ? LYS A 465 VAL A 467 AA5 1 GLU A 494 ? VAL A 495 ? GLU A 492 VAL A 493 AA5 2 LYS A 532 ? VAL A 533 ? LYS A 530 VAL A 531 AA6 1 PHE B 63 ? ILE B 65 ? PHE B 61 ILE B 63 AA6 2 ARG B 74 ? LEU B 76 ? ARG B 72 LEU B 74 AA7 1 TYR B 183 ? TYR B 185 ? TYR B 181 TYR B 183 AA7 2 ASP B 188 ? TYR B 190 ? ASP B 186 TYR B 188 AA8 1 ALA B 329 ? GLN B 332 ? ALA B 327 GLN B 330 AA8 2 THR B 340 ? TYR B 344 ? THR B 338 TYR B 342 AA8 3 ASN B 350 ? LYS B 352 ? ASN B 348 LYS B 350 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N SER A 50 ? N SER A 48 O GLN A 147 ? O GLN A 145 AA2 1 2 N VAL A 181 ? N VAL A 179 O GLY A 192 ? O GLY A 190 AA3 1 2 O GLY A 354 ? O GLY A 352 N TYR A 341 ? N TYR A 339 AA3 2 3 O TYR A 344 ? O TYR A 342 N ILE A 328 ? N ILE A 326 AA3 3 4 N ALA A 329 ? N ALA A 327 O LYS A 390 ? O LYS A 388 AA3 4 5 N PHE A 391 ? N PHE A 389 O GLU A 417 ? O GLU A 415 AA4 1 2 N TYR A 443 ? N TYR A 441 O VAL A 460 ? O VAL A 458 AA4 2 3 N TYR A 459 ? N TYR A 457 O LYS A 467 ? O LYS A 465 AA5 1 2 N VAL A 495 ? N VAL A 493 O LYS A 532 ? O LYS A 530 AA6 1 2 N ILE B 65 ? N ILE B 63 O ARG B 74 ? O ARG B 72 AA7 1 2 N TYR B 183 ? N TYR B 181 O TYR B 190 ? O TYR B 188 AA8 1 2 N GLN B 332 ? N GLN B 330 O THR B 340 ? O THR B 338 AA8 2 3 N ILE B 343 ? N ILE B 341 O LEU B 351 ? O LEU B 349 # _pdbx_validate_rmsd_angle.id 1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num 1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 C _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 B _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 ASN _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 54 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 ? _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 ? _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 N _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 B _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 PRO _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 55 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 ? _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 ? _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 CA _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 B _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 PRO _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 55 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 ? _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 ? _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value 131.52 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value 119.30 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation 12.22 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation 1.50 _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag Y # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 PRO A 25 ? ? -38.02 136.78 2 1 SER A 48 ? ? -118.59 -169.20 3 1 PRO A 55 ? ? -65.16 92.19 4 1 ASN A 57 ? ? -175.29 146.01 5 1 ALA A 62 ? ? 178.00 162.92 6 1 ALA A 98 ? ? -95.52 50.31 7 1 SER A 105 ? ? -174.25 137.41 8 1 THR A 131 ? ? -177.90 147.75 9 1 ILE A 132 ? ? -159.13 65.40 10 1 ASN A 175 ? ? -155.47 73.80 11 1 PRO A 176 ? ? -56.72 -8.23 12 1 ASP A 177 ? ? -58.90 -7.60 13 1 GLN A 182 ? ? -90.32 53.86 14 1 MET A 184 ? ? -125.49 -166.62 15 1 LYS A 219 ? ? -141.60 28.73 16 1 PHE A 227 ? ? -66.94 91.21 17 1 PRO A 247 ? ? -79.24 44.31 18 1 GLU A 248 ? ? -68.78 82.47 19 1 LYS A 249 ? ? -121.18 -56.35 20 1 THR A 253 ? ? -150.57 86.22 21 1 VAL A 254 ? ? -134.23 -66.23 22 1 ASN A 255 ? ? -133.21 -32.73 23 1 SER A 268 ? ? -69.80 11.14 24 1 PRO A 313 ? ? -46.42 157.76 25 1 ASP A 324 ? ? -77.17 -169.41 26 1 PHE A 346 ? ? 74.63 -8.88 27 1 ALA A 355 ? ? -140.86 20.89 28 1 GLU A 413 ? ? -69.01 94.71 29 1 GLU A 438 ? ? -96.41 34.02 30 1 ASP A 443 ? ? 177.52 -179.99 31 1 LYS A 451 ? ? 75.02 -10.65 32 1 LEU A 452 ? 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_em_3d_fitting.ref_protocol 'BACKBONE TRACE' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 6B19 _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm 'BACK PROJECTION' _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages 2 _em_3d_reconstruction.num_particles 128153 _em_3d_reconstruction.resolution 4.5 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details 'Beta-OG was added just prior to freezing.' _em_buffer.pH 8.0 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.source _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.entity_id_list _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.oligomeric_details 1 0 ;Peripheral dynamic RNA elements belonging to tRNA primer and viral RNA template have been masked out for higher resolution structure determination. ; 'HIV-1 reverse transcription initiation complex core' 'MULTIPLE SOURCES' COMPLEX '1, 2, 3, 4' ? ? 2 1 ;The COOH-terminus of p66 contains an unstructured linker and a six-histidine tag that was cleaved before full complex formation. A cysteine mutation for crosslinking was introduced into helix H of p66 (Q258C). The protein used in this study also had the C280S mutation, introduced in prior structural work and the E478Q mutation, introduced to eliminate RNase H activity. ; 'HIV-1 reverse transcriptase' RECOMBINANT COMPLEX '1, 2' ? ? 3 1 ;HIV-1 RNA genome fragment. 101 bases in length before masking. Contains the primer binding site (PBS), primer activation signal (PAS), A-rich loop, and C-rich region. ; 'HIV-1 RNA genome fragment' NATURAL COMPLEX 3 ? ? 4 1 ;Chemically synthesized and extended tRNA lysine3 primer. A modified nucleotide containing a N2-cystamine was placed at position 71. The tRNA primer has been extended by one ddCTP, bringing its total length in the full complex to 77 nucleotides before masking. ; 'tRNA lysine3 primer' NATURAL COMPLEX 4 ? ? # _em_image_scans.entry_id 6B19 _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.dimension_height ? _em_image_scans.dimension_width ? _em_image_scans.frames_per_image 40 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.used_frames_per_image 1-40 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 6B19 _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification 50000 _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_max 2500 _em_imaging.nominal_defocus_min 1300 _em_imaging.nominal_magnification 29000 _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details ? _em_sample_support.grid_material COPPER _em_sample_support.grid_mesh_size 200 _em_sample_support.grid_type 'Quantifoil R2/2' _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature 292 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details 'Blotted for 3.5 sec before plunging into liquid ethane.' _em_vitrification.humidity 85 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.entry_id 6B19 _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 6B19 _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 2 # _em_single_particle_entity.entry_id 6B19 _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET -1 ? A MET 1 2 1 Y 1 A VAL 0 ? A VAL 2 3 1 Y 1 A PRO 1 ? A PRO 3 4 1 Y 1 A ILE 2 ? A ILE 4 5 1 Y 1 A SER 3 ? A SER 5 6 1 Y 1 A PRO 4 ? A PRO 6 7 1 Y 1 A PRO 9 ? A PRO 11 8 1 Y 1 A VAL 10 ? A VAL 12 9 1 Y 1 A GLY 15 ? A GLY 17 10 1 Y 1 A MET 16 ? A MET 18 11 1 Y 1 A ASP 17 ? A ASP 19 12 1 Y 1 A GLY 51 ? A GLY 53 13 1 Y 1 A PRO 52 ? A PRO 54 14 1 Y 1 A GLU 53 ? A GLU 55 15 1 Y 1 A LYS 64 ? A LYS 66 16 1 Y 1 A LYS 65 ? A LYS 67 17 1 Y 1 A LYS 66 ? A LYS 68 18 1 Y 1 A ASP 67 ? A ASP 69 19 1 Y 1 A SER 68 ? A SER 70 20 1 Y 1 A THR 69 ? A THR 71 21 1 Y 1 A LYS 70 ? A LYS 72 22 1 Y 1 A THR 84 ? A THR 86 23 1 Y 1 A GLN 85 ? A GLN 87 24 1 Y 1 A ASP 86 ? A ASP 88 25 1 Y 1 A PHE 87 ? A PHE 89 26 1 Y 1 A TRP 88 ? A TRP 90 27 1 Y 1 A GLU 89 ? A GLU 91 28 1 Y 1 A VAL 90 ? A VAL 92 29 1 Y 1 A GLN 91 ? A GLN 93 30 1 Y 1 A LEU 92 ? A LEU 94 31 1 Y 1 A GLY 93 ? A GLY 95 32 1 Y 1 A GLY 112 ? A GLY 114 33 1 Y 1 A PRO 119 ? A PRO 121 34 1 Y 1 A LEU 120 ? A LEU 122 35 1 Y 1 A ILE 135 ? 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"C3'" "O3'" sing N N 15 A "C3'" "C2'" sing N N 16 A "C3'" "H3'" sing N N 17 A "O3'" "HO3'" sing N N 18 A "C2'" "O2'" sing N N 19 A "C2'" "C1'" sing N N 20 A "C2'" "H2'" sing N N 21 A "O2'" "HO2'" sing N N 22 A "C1'" N9 sing N N 23 A "C1'" "H1'" sing N N 24 A N9 C8 sing Y N 25 A N9 C4 sing Y N 26 A C8 N7 doub Y N 27 A C8 H8 sing N N 28 A N7 C5 sing Y N 29 A C5 C6 sing Y N 30 A C5 C4 doub Y N 31 A C6 N6 sing N N 32 A C6 N1 doub Y N 33 A N6 H61 sing N N 34 A N6 H62 sing N N 35 A N1 C2 sing Y N 36 A C2 N3 doub Y N 37 A C2 H2 sing N N 38 A N3 C4 sing Y N 39 ALA N CA sing N N 40 ALA N H sing N N 41 ALA N H2 sing N N 42 ALA CA C sing N N 43 ALA CA CB sing N N 44 ALA CA HA sing N N 45 ALA C O doub N N 46 ALA C OXT sing N N 47 ALA CB HB1 sing N N 48 ALA CB HB2 sing N N 49 ALA CB HB3 sing N N 50 ALA OXT HXT sing N N 51 ARG N CA sing N N 52 ARG N H sing N N 53 ARG N H2 sing N N 54 ARG CA C sing N N 55 ARG CA CB sing N N 56 ARG CA HA sing N N 57 ARG C O doub N N 58 ARG C OXT sing N N 59 ARG CB CG 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