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;MATPSMMPQWSYMHISGQDASEYLSPGLVQFARATETYFSLNNKFRNPTVAPTHDVTTDRSQRLTLRFIPVDREDTAYSY KARFTLAVGDNRVLDMASTYFDIRGVLDRGPTFKPYSGTAYNALAPKGAPNPCEWDEAATALEINLEEEDDDNEDEVDEQ AEQQKTHVFGQAPYSGINITKEGIQIGVEGQTPKYADKTFQPEPQIGESQWYETEINHAAGRVLKKTTPMKPCYGSYAKP TNENGGQGILVKQQNGKLESQVEMQFFSTTEATAGNGDNLTPKVVLYSEDVDIETPDTHISYMPTIKEGNSRELMGQQSM PNRPNYIAFRDNFIGLMYYNSTGNMGVLAGQASQLNAVVDLQDRNTELSYQLLLDSIGDRTRYFSMWNQAVDSYDPDVRI IENHGTEDELPNYCFPLGGVINTETLTKVKPKTGQENGWEKDATEFSDKNEIRVGNNFAMEINLNANLWRNFLYSNIALY LPDKLKYSPSNVKISDNPNTYDYMNKRVVAPGLVDCYINLGARWSLDYMDNVNPFNHHRNAGLRYRSMLLGNGRYVPFHI QVPQKFFAIKNLLLLPGSYTYEWNFRKDVNMVLQSSLGNDLRVDGASIKFDSICLYATFFPMAHNTASTLEAMLRNDTND QSFNDYLSAANMLYPIPANATNVPISIPSRNWAAFRGWAFTRLKTKETPSLGSGYDPYYTYSGSIPYLDGTFYLNHTFKK VAITFDSSVSWPGNDRLLTPNEFEIKRSVDGEGYNVAQCNMTKDWFLVQMLANYNIGYQGFYIPESYKDRMYSFFRNFQP MSRQVVDDTKYKDYQQVGILHQHNNSGFVGYLAPTMREGQAYPANFPYPLIGKTAVDSITQKKFLCDRTLWRIPFSSNFM SMGALTDLGQNLLYANSAHALDMTFEVDPMDEPTLLYVLFEVFDVVRVHRPHRGVIETVYLRTPFSAGNATT ; A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MRRAAMYEEGPPPSYESVVSAAPVAAALGSPFDAPLDPPFVPPRYLRPTGGRNSIRYSELAPLFDTTRVYLVDNKSTDVA SLNYQNDHSNFLTTVIQNNDYSPGEASTQTINLDDRSHWGGDLKTILHTNMPNVNEFMFTNKFKARVMVSRLPTKDNQVE LKYEWVEFTLPEGNYSETMTIDLMNNAIVEHYLKVGRQNGVLESDIGVKFDTRNFRLGFDPVTGLVMPGVYTNEAFHPDI ILLPGCGVDFTHSRLSNLLGIRKRQPFQEGFRITYDDLEGGNIPALLDVDAYQASLKDDTEQGGGGAGGSNSSGSGAEEN SNAAAAAMQPVEDMNDHAIRGDTFATRAEEKRAEAEAAAEAAAPAAQPEVEKPQKKPVIKPLTEDSKKRSYNLISNDSTF TQYRSWYLAYNYGDPQTGIRSWTLLCTPDVTCGSEQVYWSLPDMMQDPVTFRSTRQISNFPVVGAELLPVHSKSFYNDQA VYSQLIRQFTSLTHVFNRFPENQILARPPAPTITTVSENVPALTDHGTLPLRNSIGGVQRVTITDARRRTCPYVYKALGI VSPRVLSSRTF ; ;MRRAAMYEEGPPPSYESVVSAAPVAAALGSPFDAPLDPPFVPPRYLRPTGGRNSIRYSELAPLFDTTRVYLVDNKSTDVA SLNYQNDHSNFLTTVIQNNDYSPGEASTQTINLDDRSHWGGDLKTILHTNMPNVNEFMFTNKFKARVMVSRLPTKDNQVE LKYEWVEFTLPEGNYSETMTIDLMNNAIVEHYLKVGRQNGVLESDIGVKFDTRNFRLGFDPVTGLVMPGVYTNEAFHPDI ILLPGCGVDFTHSRLSNLLGIRKRQPFQEGFRITYDDLEGGNIPALLDVDAYQASLKDDTEQGGGGAGGSNSSGSGAEEN 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AENRAIRPDEAGLVYDALLQRVARYNSGNVQTNLDRLVGDVREAVAQRERAQQQGNLGSMVALNAFLSTQPANVPRGQED YTNFVSALRLMVTETPQSEVYQSGPDYFFQTSRQGLQTVNLSQAFKNLQGLWGVRAPTGDRATVSSLLTPNSRLLLLLIA PFTDSGSVSRDTYLGHLLTLYREAIGQAHVDEHTFQEITSVSRALGQEDTGSLEATLNYLLTNRRQKIPSLHSLNSEEER ILRYVQQSVSLNLMRDGVTPSVALDMTARNMEPGMYASNRPFINRLMDYLHRAAAVNPEYFTNAILNPHWLPPPGFYTGG FEVPEGNDGFLWDDIDDSVFSPQPQTLLELQQREQAEAALRKESFRRPSSLSDLGAAAPRSDASSPFPSLIGSLTSTRTT RPRLLGEEEYLNNSLLQPQREKNLPPAFPNNGIESLVDKMSRWKTYAQEHRDVPGPRPPTRRQRHDRQRGLVWEDDDSAD DSSVLDLGGSGNPFAHLRPRLGRMF ; N ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSKEIPTPYMWSYQPQMGLAAGAAQDYSTRINYMSAGPHMISRVNGIRAHRNRILLEQAAITTTPRNNLNPRSWPAALVY QESPAPTTVVLPRDAQAEVQMTNSGAQLAGGFRHRVRSPGQGITHLTIRGRGIQLNDESVSSSLGLRPDGTFQIGGAGRP SFTPRQAILTLQTSSSEPRSGGIGTLQFIEEFVPSVYFNPFSGPPGHYPDQFIPNFDAVKDSADGYD ; ;MSKEIPTPYMWSYQPQMGLAAGAAQDYSTRINYMSAGPHMISRVNGIRAHRNRILLEQAAITTTPRNNLNPRSWPAALVY QESPAPTTVVLPRDAQAEVQMTNSGAQLAGGFRHRVRSPGQGITHLTIRGRGIQLNDESVSSSLGLRPDGTFQIGGAGRP SFTPRQAILTLQTSSSEPRSGGIGTLQFIEEFVPSVYFNPFSGPPGHYPDQFIPNFDAVKDSADGYD ; O,P ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MSTNSFDGSIVSSYLTTRMPPWAGVRQNVMGSSIDGRPVLPANSTTLTYETVSGTPLETAASAAASAAAATARGIVTDFA FLSPLASSAASRSSARDDKLTALLAQLDSLTRELNVVSQQLLDLRQQVSALKASSPPNAV ; ;MSTNSFDGSIVSSYLTTRMPPWAGVRQNVMGSSIDGRPVLPANSTTLTYETVSGTPLETAASAAASAAAATARGIVTDFA FLSPLASSAASRSSARDDKLTALLAQLDSLTRELNVVSQQLLDLRQQVSALKASSPPNAV ; Q,R,S,T ? 6 'polypeptide(L)' no no MEDINFASLAPRHGSRPFMGNWQDIGTSNMSGG MEDINFASLAPRHGSRPFMGNWQDIGTSNMSGG U,V,Y ? 7 'polypeptide(L)' no no GLRFPSKMFGG GLRFPSKMFGG W ? 8 'polypeptide(L)' no no ;AFSWGSLWSGIKNFGSTVKNYGSKAWNSSTGQMLRDKLKEQNFQQKVVDGLASGISGVVDLANQAVQNKINSKLDPRPPV EEPPPAVETVSPEGRGEKRPRPDREETLVTQIDEPPSYEEALKQGLPTTRPIAPMATGVLGQHTPVTLDLPPPADTQQKP VLPGPTAVVVTRPSRASLRRAASGPRSLRPVASGNWQSTLNSIVGLGVQSLKRRRCF ; ;AFSWGSLWSGIKNFGSTVKNYGSKAWNSSTGQMLRDKLKEQNFQQKVVDGLASGISGVVDLANQAVQNKINSKLDPRPPV EEPPPAVETVSPEGRGEKRPRPDREETLVTQIDEPPSYEEALKQGLPTTRPIAPMATGVLGQHTPVTLDLPPPADTQQKP VLPGPTAVVVTRPSRASLRRAASGPRSLRPVASGNWQSTLNSIVGLGVQSLKRRRCF ; X ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ALA n 1 3 THR n 1 4 PRO n 1 5 SER n 1 6 MET n 1 7 MET n 1 8 PRO n 1 9 GLN n 1 10 TRP n 1 11 SER n 1 12 TYR n 1 13 MET n 1 14 HIS n 1 15 ILE n 1 16 SER n 1 17 GLY n 1 18 GLN n 1 19 ASP n 1 20 ALA n 1 21 SER n 1 22 GLU n 1 23 TYR n 1 24 LEU n 1 25 SER n 1 26 PRO n 1 27 GLY n 1 28 LEU n 1 29 VAL n 1 30 GLN n 1 31 PHE n 1 32 ALA n 1 33 ARG n 1 34 ALA n 1 35 THR n 1 36 GLU n 1 37 THR n 1 38 TYR n 1 39 PHE n 1 40 SER n 1 41 LEU n 1 42 ASN n 1 43 ASN n 1 44 LYS n 1 45 PHE n 1 46 ARG n 1 47 ASN n 1 48 PRO n 1 49 THR n 1 50 VAL n 1 51 ALA n 1 52 PRO n 1 53 THR n 1 54 HIS n 1 55 ASP n 1 56 VAL n 1 57 THR n 1 58 THR n 1 59 ASP n 1 60 ARG n 1 61 SER n 1 62 GLN n 1 63 ARG n 1 64 LEU n 1 65 THR n 1 66 LEU n 1 67 ARG n 1 68 PHE n 1 69 ILE n 1 70 PRO n 1 71 VAL n 1 72 ASP n 1 73 ARG n 1 74 GLU n 1 75 ASP n 1 76 THR n 1 77 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.007 ? 18313 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 6B1T _struct.title 'Improved cryoEM structure of human adenovirus type 5 with atomic details of minor proteins VI and VII' _struct.pdbx_descriptor ;Hexon protein, Penton protein, Pre-hexon-linking protein IIIa, Pre-hexon-linking protein VIII, Hexon-interlacing protein, Pre-protein VI, Pre-histone-like nucleoprotein ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6B1T _struct_keywords.text 'human adenovirus, cement protein, dsDNA genome packaging, genome-capsid co-assembly, VIRUS' _struct_keywords.pdbx_keywords VIRUS # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 1 ? K N N 1 ? L N N 1 ? 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Y . n Y 6 6 PHE 6 6 6 PHE PHE Y . n Y 6 7 ALA 7 7 7 ALA ALA Y . n Y 6 8 SER 8 8 8 SER SER Y . n Y 6 9 LEU 9 9 9 LEU LEU Y . n Y 6 10 ALA 10 10 10 ALA ALA Y . n Y 6 11 PRO 11 11 11 PRO PRO Y . n Y 6 12 ARG 12 12 12 ARG ARG Y . n Y 6 13 HIS 13 13 13 HIS HIS Y . n Y 6 14 GLY 14 14 14 GLY GLY Y . n Y 6 15 SER 15 15 15 SER SER Y . n Y 6 16 ARG 16 16 16 ARG ARG Y . n Y 6 17 PRO 17 17 17 PRO PRO Y . n Y 6 18 PHE 18 18 18 PHE PHE Y . n Y 6 19 MET 19 19 19 MET MET Y . n Y 6 20 GLY 20 20 20 GLY GLY Y . n Y 6 21 ASN 21 21 21 ASN ASN Y . n Y 6 22 TRP 22 22 22 TRP TRP Y . n Y 6 23 GLN 23 23 23 GLN GLN Y . n Y 6 24 ASP 24 24 24 ASP ASP Y . n Y 6 25 ILE 25 25 25 ILE ILE Y . n Y 6 26 GLY 26 26 26 GLY GLY Y . n Y 6 27 THR 27 27 27 THR THR Y . n Y 6 28 SER 28 28 28 SER SER Y . n Y 6 29 ASN 29 29 29 ASN ASN Y . n Y 6 30 MET 30 30 30 MET MET Y . n Y 6 31 SER 31 31 31 SER SER Y . n Y 6 32 GLY 32 32 32 GLY GLY Y . n Y 6 33 GLY 33 33 33 GLY GLY Y . n # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 'complete icosahedral assembly' ? 1500-meric 1500 2 'icosahedral asymmetric unit' ? 25-meric 25 3 'icosahedral pentamer' ? 125-meric 125 4 'icosahedral 23 hexamer' ? 150-meric 150 5 'icosahedral asymmetric unit, std point frame' ? 25-meric 25 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 '(1-60)' A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y 2 1 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y 3 '(1-5)' A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y 4 '(1,2,6,10,23,24)' A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y 5 P A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] P 'transform to point frame' ? ? 0.80901699 0.46708621 -0.35682206 0.00000 -0.50000000 0.86602540 0.00000006 0.00000 0.30901699 0.17841098 0.93417237 0.00000 1 'point symmetry operation' ? ? 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 2 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 -0.75576136 0.57735022 0.00000 0.75576135 0.56366096 0.33333332 0.00000 -0.57735021 0.33333331 0.74535604 0.00000 3 'point symmetry operation' ? ? -0.80901700 -0.46708621 0.35682206 0.00000 0.46708620 -0.14235045 0.87267796 0.00000 -0.35682206 0.87267796 0.33333346 0.00000 4 'point symmetry operation' ? ? -0.80901699 0.46708620 -0.35682206 0.00000 -0.46708621 -0.14235045 0.87267796 0.00000 0.35682205 0.87267797 0.33333345 0.00000 5 'point symmetry operation' ? ? 0.30901700 0.75576136 -0.57735022 0.00000 -0.75576135 0.56366095 0.33333332 0.00000 0.57735021 0.33333333 0.74535604 0.00000 6 'point symmetry operation' ? ? -0.80901700 0.11026405 0.57735028 0.00000 0.11026405 -0.93633904 0.33333322 0.00000 0.57735027 0.33333322 0.74535604 0.00000 7 'point symmetry operation' ? ? -0.50000000 0.86602541 0.00000006 0.00000 -0.86602540 -0.50000000 -0.00000010 0.00000 -0.00000007 -0.00000011 1.00000000 0.00000 8 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 0.86602541 0.00000006 0.00000 -0.64549718 0.37267802 -0.66666669 0.00000 -0.57735031 0.33333331 0.74535597 0.00000 9 'point symmetry operation' ? ? 0.80901699 0.11026405 0.57735028 0.00000 0.46708620 0.47568366 -0.74535598 0.00000 -0.35682206 0.87267800 0.33333334 0.00000 10 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 -0.35682215 0.93417234 0.00000 0.93417233 -0.33333338 -0.12732205 0.00000 0.35682215 0.87267795 0.33333338 0.00000 11 'point symmetry operation' ? ? -0.49999999 -0.86602541 -0.00000006 0.00000 -0.86602540 0.49999999 0.00000010 0.00000 -0.00000006 0.00000011 -1.00000000 0.00000 12 'point symmetry operation' ? ? -0.80901699 -0.11026406 -0.57735028 0.00000 0.11026405 0.93633904 -0.33333322 0.00000 0.57735028 -0.33333321 -0.74535604 0.00000 13 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 0.35682215 -0.93417234 0.00000 0.93417233 0.33333339 0.12732204 0.00000 0.35682216 -0.87267795 -0.33333339 0.00000 14 'point symmetry operation' ? ? 0.80901699 -0.11026404 -0.57735029 0.00000 0.46708620 -0.47568365 0.74535598 0.00000 -0.35682205 -0.87267801 -0.33333334 0.00000 15 'point symmetry operation' ? ? 0.50000001 -0.86602540 -0.00000007 0.00000 -0.64549718 -0.37267803 0.66666669 0.00000 -0.57735031 -0.33333331 -0.74535597 0.00000 16 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 0.75576136 -0.57735022 0.00000 0.75576135 -0.56366095 -0.33333332 0.00000 -0.57735021 -0.33333332 -0.74535604 0.00000 17 'point symmetry operation' ? ? 1.00000000 0.00000001 0.00000000 0.00000 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 -1.00000000 0.00000 18 'point symmetry operation' ? ? 0.30901700 -0.75576135 0.57735022 0.00000 -0.75576135 -0.56366096 -0.33333332 0.00000 0.57735022 -0.33333332 -0.74535604 0.00000 19 'point symmetry operation' ? ? -0.80901699 -0.46708622 0.35682207 0.00000 -0.46708620 0.14235044 -0.87267796 0.00000 0.35682206 -0.87267796 -0.33333345 0.00000 20 'point symmetry operation' ? ? -0.80901700 0.46708620 -0.35682205 0.00000 0.46708620 0.14235045 -0.87267797 0.00000 -0.35682205 -0.87267796 -0.33333345 0.00000 21 'point symmetry operation' ? ? -0.30901700 0.17841097 0.93417237 0.00000 0.75576135 0.64235027 0.12732207 0.00000 -0.57735021 0.74535606 -0.33333327 0.00000 22 'point symmetry operation' ? ? -0.50000001 0.64549719 0.57735031 0.00000 0.64549718 -0.16666676 0.74535600 0.00000 0.57735031 0.74535601 -0.33333323 0.00000 23 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 0.93417234 0.35682215 0.00000 -0.35682215 -0.33333339 0.87267795 0.00000 0.93417233 -0.12732204 0.33333339 0.00000 24 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 0.64549719 0.57735031 0.00000 -0.86602540 0.37267801 0.33333331 0.00000 -0.00000006 -0.66666669 0.74535597 0.00000 25 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 0.17841097 0.93417238 0.00000 -0.17841098 0.97568368 -0.12732196 0.00000 -0.93417237 -0.12732196 0.33333332 0.00000 26 'point symmetry operation' ? ? 0.80901700 0.11026406 0.57735027 0.00000 -0.46708620 -0.47568366 0.74535599 0.00000 0.35682206 -0.87267800 -0.33333334 0.00000 27 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 -0.35682216 0.93417234 0.00000 -0.93417233 0.33333338 0.12732205 0.00000 -0.35682215 -0.87267795 -0.33333338 0.00000 28 'point symmetry operation' ? ? -0.80901700 0.11026404 0.57735028 0.00000 -0.11026405 0.93633904 -0.33333322 0.00000 -0.57735027 -0.33333322 -0.74535604 0.00000 29 'point symmetry operation' ? ? -0.50000001 0.86602540 0.00000006 0.00000 0.86602540 0.50000001 0.00000010 0.00000 0.00000006 0.00000011 -1.00000000 0.00000 30 'point symmetry operation' ? ? 0.49999999 0.86602541 0.00000005 0.00000 0.64549718 -0.37267801 0.66666669 0.00000 0.57735032 -0.33333330 -0.74535597 0.00000 31 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 0.35682216 -0.93417234 0.00000 -0.93417233 -0.33333339 -0.12732205 0.00000 -0.35682216 0.87267795 0.33333338 0.00000 32 'point symmetry operation' ? ? 0.80901700 -0.11026404 -0.57735028 0.00000 -0.46708620 0.47568365 -0.74535598 0.00000 0.35682205 0.87267801 0.33333334 0.00000 33 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 -0.86602541 -0.00000005 0.00000 0.64549718 0.37267802 -0.66666669 0.00000 0.57735031 0.33333331 0.74535597 0.00000 34 'point symmetry operation' ? ? -0.50000000 -0.86602541 -0.00000005 0.00000 0.86602540 -0.50000000 -0.00000010 0.00000 0.00000006 -0.00000011 1.00000000 0.00000 35 'point symmetry operation' ? 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