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25 'polypeptide(L)' no no AKTIKITQTRSAIGRLPKHKATLLGLGLRRIGHTVEREDTPAIRGMINAVSFMVKVEE AKTIKITQTRSAIGRLPKHKATLLGLGLRRIGHTVEREDTPAIRGMINAVSFMVKVEE 28 ? 26 'polypeptide(L)' no no MKKDIHPKYEEITASCSCGNVMKIRSTVGHDLNLDVCSKCHPFFTGKQRDVATGGRVDRFNKRFNI MKKDIHPKYEEITASCSCGNVMKIRSTVGHDLNLDVCSKCHPFFTGKQRDVATGGRVDRFNKRFNI 29 ? 27 'polypeptide(L)' no no AVQQNKPTRSKRGMRRSHDALTAVTSLSVDKTSGEKHLRHHITADGYYRGRKVIAK AVQQNKPTRSKRGMRRSHDALTAVTSLSVDKTSGEKHLRHHITADGYYRGRKVIAK 30 ? 28 'polypeptide(L)' no no GIREKIKLVSSAGTGHFYTTTKNKRTKPEKLELKKFDPVVRQHVIYKEAK GIREKIKLVSSAGTGHFYTTTKNKRTKPEKLELKKFDPVVRQHVIYKEAK 31 ? 29 'polypeptide(L)' no no MKRTFQPSVLKRNRSHGFRARMATKNGRQVLARRRAKGRARLTVSK MKRTFQPSVLKRNRSHGFRARMATKNGRQVLARRRAKGRARLTVSK 32 ? 30 'polypeptide(L)' no no PKIKTVRGAAKRFKKTGKGGFKHKHANLRHILTKKATKRKRHLRPKAMVSKGDLGLVIACLPYA PKIKTVRGAAKRFKKTGKGGFKHKHANLRHILTKKATKRKRHLRPKAMVSKGDLGLVIACLPYA 33 ? 31 'polypeptide(L)' no no MKVRASVKKLCRNCKIVKRDGVIRVICSAEPKHKQRQG MKVRASVKKLCRNCKIVKRDGVIRVICSAEPKHKQRQG 34 ? 32 'polypeptide(L)' no no ;ATVSMRDMLKAGVHFGHQTRYWNPKMKPFIFGARNKVHIINLEKTVPMFNEALAELNKIASRKGKILFVGTKRAASEAVK DAALSCDQFFVNHRWLGGMLTNWKTVRQSIKRLKDLETQSQDGTFDKLTKKEALMRTRELEKLENSLGGIKDMGGLPDAL FVIDADHEHIAIKEANNLGIPVFAIVDTNSDPDGVDFVIPGNDDAIRAVTLYLGAVAATVREGRS ; ;ATVSMRDMLKAGVHFGHQTRYWNPKMKPFIFGARNKVHIINLEKTVPMFNEALAELNKIASRKGKILFVGTKRAASEAVK DAALSCDQFFVNHRWLGGMLTNWKTVRQSIKRLKDLETQSQDGTFDKLTKKEALMRTRELEKLENSLGGIKDMGGLPDAL FVIDADHEHIAIKEANNLGIPVFAIVDTNSDPDGVDFVIPGNDDAIRAVTLYLGAVAATVREGRS ; B ? 33 'polypeptide(L)' no no ;GQKVHPNGIRLGIVKPWNSTWFANTKEFADNLDSDFKVRQYLTKELAKASVSRIVIERPAKSIRVTIHTARPGIVIGKKG EDVEKLRKVVADIAGVPAQINIAEVRKPELDAKLVADSITSQLERRVMFRRAMKRAVQNAMRLGAKGIKVEVSGRLGGAE IARTEWYREGRVPLHTLRADIDYNTSEAHTTYGVIGVKVWIFKGEI ; ;GQKVHPNGIRLGIVKPWNSTWFANTKEFADNLDSDFKVRQYLTKELAKASVSRIVIERPAKSIRVTIHTARPGIVIGKKG EDVEKLRKVVADIAGVPAQINIAEVRKPELDAKLVADSITSQLERRVMFRRAMKRAVQNAMRLGAKGIKVEVSGRLGGAE IARTEWYREGRVPLHTLRADIDYNTSEAHTTYGVIGVKVWIFKGEI ; C ? 34 'polypeptide(L)' no no ;ARYLGPKLKLSRREGTDLFLKSGVRAIDTKCKIEQAPGQHGARKPRLSDYGVQLREKQKVRRIYGVLERQFRNYYKEAAR LKGNTGENLLALLEGRLDNVVYRMGFGATRAEARQLVSHKAIMVNGRVVNIASYQVSPNDVVSIREKAKKQSRVKAALEL AEQREKPTWLEVDAGKMEGTFKRKPERSDLSADINEHLIVELYSK ; ;ARYLGPKLKLSRREGTDLFLKSGVRAIDTKCKIEQAPGQHGARKPRLSDYGVQLREKQKVRRIYGVLERQFRNYYKEAAR LKGNTGENLLALLEGRLDNVVYRMGFGATRAEARQLVSHKAIMVNGRVVNIASYQVSPNDVVSIREKAKKQSRVKAALEL AEQREKPTWLEVDAGKMEGTFKRKPERSDLSADINEHLIVELYSK ; D ? 35 'polypeptide(L)' no no ;ELQEKLIAVNRVSKTVKGGRIFSFTALTVVGDGNGRVGFGYGKAREVPAAIQKAMEKARRNMINVALNNGTLQHPVKGVH TGSRVFMQPASEGTGIIAGGAMRAVLEVAGVHNVLAKAYGSTNPINVVRATIDGLENMNSPEMVAAKRGKSVEEILG ; ;ELQEKLIAVNRVSKTVKGGRIFSFTALTVVGDGNGRVGFGYGKAREVPAAIQKAMEKARRNMINVALNNGTLQHPVKGVH TGSRVFMQPASEGTGIIAGGAMRAVLEVAGVHNVLAKAYGSTNPINVVRATIDGLENMNSPEMVAAKRGKSVEEILG ; E ? 36 'polypeptide(L)' no no ;MRHYEIVFMVHPDQSEQVPGMIERYTAAITGAEGKIHRLEDWGRRQLAYPINKLHKAHYVLMNVEAPQEVIDELETTFRF NDAVIRSMVMRTKHAVTEASPMVKAKDERRERRDDFANETADDAEA ; 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;ARIAGINIPDHKHAVIALTSIYGVGKTRSKAILAAAGIAEDVKISELSEGQIDTLRDEVAKFVVEGDLRREISMSIKRLM DLGCYRGLRHRRGLPVRGQRTKTNARTRKGPRKP ; ;ARIAGINIPDHKHAVIALTSIYGVGKTRSKAILAAAGIAEDVKISELSEGQIDTLRDEVAKFVVEGDLRREISMSIKRLM DLGCYRGLRHRRGLPVRGQRTKTNARTRKGPRKP ; M ? 44 'polypeptide(L)' no no ;AKQSMKAREVKRVALADKYFAKRAELKAIISDVNASDEDRWNAVLKLQTLPRDSSPSRQRNRCRQTGRPHGFLRKFGLSR IKVREAAMRGEIPGLKKASW ; ;AKQSMKAREVKRVALADKYFAKRAELKAIISDVNASDEDRWNAVLKLQTLPRDSSPSRQRNRCRQTGRPHGFLRKFGLSR IKVREAAMRGEIPGLKKASW ; N ? 45 'polypeptide(L)' no no ;SLSTEATAKIVSEFGRDANDTGSTEVQVALLTAQINHLQGHFAEHKKDHHSRRGLLRMVSQRRKLLDYLKRKDVARYTQL IERLGLRR ; ;SLSTEATAKIVSEFGRDANDTGSTEVQVALLTAQINHLQGHFAEHKKDHHSRRGLLRMVSQRRKLLDYLKRKDVARYTQL IERLGLRR ; O ? 46 'polypeptide(L)' no no ;MVTIRLARHGAKKRPFYQVVVADSRNARNGRFIERVGFFNPIASEKEEGTRLDLDRIAHWVGQGATISDRVAALIKEVNK AA ; ;MVTIRLARHGAKKRPFYQVVVADSRNARNGRFIERVGFFNPIASEKEEGTRLDLDRIAHWVGQGATISDRVAALIKEVNK AA ; P ? 47 'polypeptide(L)' no no 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NAEAAKAAGAELVGMEDLADQIKKGEMNFDVVIASPDAMRVVGQLGQVLGPRGLMPNPKVGTVTPNVAEAVKNAKAGQVR YRNDKNGIIHTTIGKVDFDADKLKENLEALLVALKKAKPTQAKGVYIKKVSISTTMGAGVAVD ; ;KLTKRMRVIREKVDATKQYDINEAIALLKELATAKFVESVDVAVNLGIDARKSDQNVRGATVLPHGTGRSVRVAVFTQGA NAEAAKAAGAELVGMEDLADQIKKGEMNFDVVIASPDAMRVVGQLGQVLGPRGLMPNPKVGTVTPNVAEAVKNAKAGQVR YRNDKNGIIHTTIGKVDFDADKLKENLEALLVALKKAKPTQAKGVYIKKVSISTTMGAGVAVD ; 03 ? 53 polyribonucleotide no no ;AAUUGAAGAGUUUGAUCAUGGCUCAGAUUGAACGCUGGCGGCAGGCCUAACACAUGCAAGUCGAACGGUAACAGGAAGAA GCUUGCUUCUUUGCUGACGAGUGGCGGACGGGUGAGUAAUGUCUGGGAAACUGCCUGAUGGAGGGGGAUAACUACUGGAA ACGGUAGCUAAUACCGCAUAACGUCGCAAGACCAAAGAGGGGGACCUUCGGGCCUCUUGCCAUCGGAUGUGCCCAGAUGG GAUUAGCUAGUAGGUGGGGUAACGGCUCACCUAGGCGACGAUCCCUAGCUGGUCUGAGAGGAUGACCAGCCACACUGGAA CUGAGACACGGUCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUAUUGCACAAUGGGCGCAAGCCUGAUGCAGCCAUGCC GCGUGUAUGAAGAAGGCCUUCGGGUUGUAAAGUACUUUCAGCGGGGAGGAAGGGAGUAAAGUUAAUACCUUUGCUCAUUG ACGUUACCCGCAGAAGAAGCACCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGUGCAAGCGUUAAUCGGAAU 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CGCGGGGUGGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGGUCGUCGGUUCAAAUCCGGCCCCCGCAACCA CGCGGGGUGGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGGUCGUCGGUUCAAAUCCGGCCCCCGCAACCA X,W ? 57 polyribonucleotide no no GGCAAGGAGGUAAAAAUGUUCAAAAAA GGCAAGGAGGUAAAAAUGUUCAAAAAA V ? 58 polyribonucleotide no no GCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAGGGGAUUGAAAAUCCCCGUGUCCUUGGUUCGAUUCCGAGUCCGGGCACCA GCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAGGGGAUUGAAAAUCCCCGUGUCCUUGGUUCGAUUCCGAGUCCGGGCACCA Y ? 59 'polypeptide(L)' no no ;SFAQLFEESLKEIETRPGSIVRGVVVAIDKDVVLVDAGLKSESAIPAEQFKNAQGELEIQVGDEVDVALDAVEDGFGETL LSREKAKRHEAWITLEKAYEDAETVTGVINGKVKGGFTVELNGIRAFLPGSLVDVRPVRDTLHLEGKELEFKVIKLDQKR NNVVVSRRAVIESENSAERDQLLENLQEGMEVKGIVKNLTDYGAFVDLGGVDGLLHITDMAWKRVKHPSEIVNVGDEITV KVLKFDRERTRVSLGLKQLGEDPWVAIAKRYPEGTKLTGRVTNLTDYGCFVEIEEGVEGLVHVSEMDWTNKNIHPSKVVN VGDVVEVMVLDIDEERRRISLGLKQCKANPWQQFAETHNKGDRVEGKIKSITDFGIFIGLDGGIDGLVHLSDISWNVAGE EAVREYKKGDEIAAVVLQVDAERERISLGVKQLAEDPFNNWVALNKKGAIVTGKVTAVDAKGATVELADGVEGYLRASEA 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'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6BU8 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 6BU8 _struct.title '70S ribosome with S1 domains 1 and 2 (Class 1)' _struct.pdbx_descriptor ;50S ribosomal protein L2, 50S ribosomal protein L3, 50S ribosomal protein L4, 50S ribosomal protein L5, 50S ribosomal protein L6, 50S ribosomal protein L9, 50S ribosomal protein L10, 50S ribosomal protein L11, 50S ribosomal protein L13, 50S ribosomal protein L14, 50S ribosomal protein L15, 50S ribosomal protein L16, 50S ribosomal protein L17, 50S ribosomal protein L18, 50S ribosomal protein L19, 50S ribosomal protein L20, 50S ribosomal protein L21, 50S ribosomal protein L22, 50S ribosomal protein L23, 50S ribosomal protein L24, 50S ribosomal protein L25, 50S ribosomal protein L27, 50S ribosomal protein L28, 50S ribosomal protein L29, 50S ribosomal protein L30, 50S ribosomal protein L31, 50S ribosomal protein L32, 50S ribosomal protein L33, 50S ribosomal protein L34, 50S ribosomal protein L35, 50S ribosomal protein L36, 30S ribosomal protein S2, 30S ribosomal protein S3, 30S ribosomal protein S4, 30S ribosomal protein S5, 30S ribosomal protein S6, 30S ribosomal protein S7, 30S ribosomal protein S8, 30S ribosomal protein S9, 30S ribosomal protein S10, 30S ribosomal protein S11, 30S ribosomal protein S12, 30S ribosomal protein S13, 30S ribosomal protein S14, 30S ribosomal protein S15, 30S ribosomal protein S16, 30S ribosomal protein S17, 30S ribosomal protein S18, 30S ribosomal protein S19, 30S ribosomal protein S20, 30S ribosomal protein S21, 50S ribosomal protein L1, Elongation factor Tu 2/RNA Complex ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6BU8 _struct_keywords.text 'Ribosome, tRNA, S1, ribosomal protein S1' _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? hydrog3021 hydrog ? ? AB U 36 O2 ? ? ? 1_555 AB A 396 N6 ? ? A U 37 A A 397 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? hydrog3022 hydrog ? ? AB G 38 N1 ? ? ? 1_555 AB C 402 N3 ? ? A G 39 A C 403 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3023 hydrog ? ? AB G 38 N2 ? ? ? 1_555 AB C 402 O2 ? ? A G 39 A C 403 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3024 hydrog ? ? AB G 38 O6 ? ? ? 1_555 AB C 402 N4 ? ? A G 39 A C 403 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3025 hydrog ? ? AB C 39 N3 ? ? ? 1_555 AB G 401 N1 ? ? A C 40 A G 402 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3026 hydrog ? ? AB C 39 N4 ? ? ? 1_555 AB G 401 O6 ? ? A C 40 A G 402 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3027 hydrog ? ? AB C 39 O2 ? ? ? 1_555 AB G 401 N2 ? ? A C 40 A G 402 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3028 hydrog ? ? AB G 40 N1 ? ? ? 1_555 AB C 400 N3 ? ? A G 41 A C 401 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3029 hydrog ? ? AB G 40 N2 ? ? ? 1_555 AB C 400 O2 ? ? 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AB G 183 N2 ? ? ? 1_555 AB C 192 O2 ? ? A G 184 A C 193 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3224 hydrog ? ? AB G 183 O6 ? ? ? 1_555 AB C 192 N4 ? ? A G 184 A C 193 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3225 hydrog ? ? AB U 184 N3 ? ? ? 1_555 AB A 191 N1 ? ? A U 185 A A 192 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3226 hydrog ? ? AB U 184 O4 ? ? ? 1_555 AB A 191 N6 ? ? A U 185 A A 192 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3227 hydrog ? ? AB C 185 N3 ? ? ? 1_555 AB G 190 N1 ? ? A C 186 A G 191 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3228 hydrog ? ? AB C 185 N4 ? ? ? 1_555 AB G 190 O6 ? ? A C 186 A G 191 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3229 hydrog ? ? AB C 185 O2 ? ? ? 1_555 AB G 190 N2 ? ? A C 186 A G 191 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3230 hydrog ? ? AB G 186 N2 ? ? ? 1_555 AB A 189 N7 ? ? A G 187 A A 190 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? hydrog3231 hydrog ? ? AB G 197 N1 ? ? ? 1_555 AB U 218 O2 ? ? A G 198 A U 219 1_555 ? ? ? ? ? ? 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? -120.41 -76.62 154 1 GLU 13 106 ? ? -39.34 -19.03 155 1 GLU 13 110 ? ? 84.29 -33.09 156 1 ALA 14 15 ? ? 67.12 -131.30 157 1 ILE 14 23 ? ? -99.11 -61.00 158 1 LYS 14 29 ? ? 52.24 87.39 159 1 HIS 14 35 ? ? -72.65 -70.20 160 1 MET 14 55 ? ? -53.01 106.23 161 1 PRO 14 56 ? ? -36.50 142.81 162 1 VAL 14 85 ? ? -56.17 -90.64 163 1 GLU 14 86 ? ? -174.90 118.78 164 1 THR 14 94 ? ? 73.99 -24.28 165 1 ILE 14 101 ? ? -121.86 -81.51 166 1 GLU 14 106 ? ? -133.76 -71.78 167 1 THR 14 117 ? ? -127.52 -71.69 168 1 PRO 14 119 ? ? -62.29 71.74 169 1 GLN 15 3 ? ? -176.47 132.67 170 1 ARG 15 6 ? ? 34.87 71.99 171 1 ARG 15 10 ? ? -46.99 -70.07 172 1 GLN 15 22 ? ? -97.91 -72.94 173 1 SER 15 27 ? ? -142.73 -56.38 174 1 SER 15 30 ? ? -120.33 -54.72 175 1 VAL 15 36 ? ? -114.24 -76.35 176 1 GLN 15 45 ? ? -51.14 -78.94 177 1 LYS 15 58 ? ? 56.83 -110.64 178 1 GLN 15 60 ? ? -56.32 -179.88 179 1 PRO 15 69 ? ? -42.81 -75.48 180 1 ASP 15 70 ? ? 47.69 17.23 181 1 LEU 15 78 ? ? -33.96 130.73 182 1 ALA 15 79 ? ? 64.47 63.47 183 1 MET 15 82 ? ? -65.06 -162.42 184 1 GLU 15 90 ? ? -109.88 -62.42 185 1 ALA 15 120 ? ? -39.52 -39.94 186 1 PRO 15 125 ? ? -84.91 42.65 187 1 ARG 16 2 ? ? 33.38 34.60 188 1 SER 16 14 ? ? -7.54 -69.01 189 1 ALA 16 25 ? ? -55.75 -72.55 190 1 GLU 16 32 ? ? 59.54 -1.38 191 1 ARG 16 46 ? ? -61.20 8.94 192 1 VAL 16 47 ? ? -127.87 -63.88 193 1 SER 16 59 ? ? -133.40 -94.08 194 1 VAL 16 60 ? ? -145.83 -73.47 195 1 THR 16 70 ? ? 72.04 -28.46 196 1 ARG 16 71 ? ? 48.81 24.13 197 1 PHE 16 80 ? ? 67.14 -4.71 198 1 ASN 16 81 ? ? -130.41 -54.50 199 1 GLU 16 82 ? ? -99.53 -65.98 200 1 ALA 16 104 ? ? -29.20 -48.42 201 1 PRO 16 109 ? ? -60.67 73.32 202 1 ASP 16 117 ? ? -90.39 -83.88 203 1 ILE 17 8 ? ? -43.91 -75.30 204 1 ARG 17 15 ? ? -48.22 -80.83 205 1 HIS 17 34 ? ? 65.23 94.31 206 1 LEU 17 48 ? ? -134.38 -66.61 207 1 LYS 17 63 ? ? -102.16 -62.15 208 1 LYS 17 68 ? ? -53.83 -73.60 209 1 ASP 17 69 ? ? -38.79 -28.17 210 1 LYS 17 88 ? ? -135.58 -60.00 211 1 SER 17 95 ? ? 39.51 42.29 212 1 HIS 17 100 ? ? -145.51 -63.99 213 1 ARG 17 102 ? ? -25.91 -46.34 214 1 GLU 18 10 ? ? -67.53 3.21 215 1 GLN 18 14 ? ? -122.90 -57.22 216 1 PRO 18 17 ? ? -59.56 69.33 217 1 SER 18 18 ? ? -15.38 119.02 218 1 ASP 18 81 ? ? -124.68 -68.58 219 1 SER 18 84 ? ? -35.57 132.75 220 1 LYS 18 86 ? ? -101.18 -60.39 221 1 LYS 18 93 ? ? 159.04 150.37 222 1 TYR 18 97 ? ? -31.02 -32.15 223 1 TYR 18 98 ? ? -59.92 -6.44 224 1 ARG 18 112 ? ? -110.65 -83.90 225 1 ARG 19 2 ? ? -35.99 142.66 226 1 ARG 19 27 ? ? -39.19 -28.39 227 1 ARG 19 29 ? ? -134.50 -63.16 228 1 ARG 19 32 ? ? -51.88 -7.46 229 1 GLN 19 55 ? ? -54.45 -74.94 230 1 SER 19 76 ? ? -44.94 -73.24 231 1 PHE 19 78 ? ? -48.99 -74.02 232 1 SER 19 86 ? ? 60.17 73.29 233 1 SER 20 7 ? ? -141.20 -76.92 234 1 VAL 20 38 ? ? -16.27 114.94 235 1 ASN 20 43 ? ? -136.11 -88.13 236 1 PRO 20 52 ? ? -38.42 144.85 237 1 PHE 20 53 ? ? 69.20 75.77 238 1 VAL 20 54 ? ? -17.51 -92.66 239 1 ASP 20 55 ? ? -159.78 -85.84 240 1 VAL 20 64 ? ? -93.91 -74.51 241 1 GLN 20 87 ? ? -170.90 130.51 242 1 HIS 20 89 ? ? 175.23 149.25 243 1 GLU 21 2 ? ? -119.47 -76.07 244 1 THR 21 3 ? ? 56.60 85.08 245 1 HIS 21 9 ? ? 54.71 16.11 246 1 SER 21 12 ? ? 160.50 150.36 247 1 ILE 21 24 ? ? -69.61 3.39 248 1 ILE 21 55 ? ? -48.09 -70.74 249 1 ASN 21 61 ? ? -93.06 -73.01 250 1 ALA 21 64 ? ? -167.27 -152.45 251 1 ASP 21 65 ? ? 59.24 99.87 252 1 ASP 21 67 ? ? -59.79 -73.77 253 1 LYS 21 90 ? ? 58.11 -10.81 254 1 ARG 22 12 ? ? -130.86 -57.64 255 1 ALA 22 13 ? ? 173.50 159.01 256 1 LYS 22 26 ? ? -124.81 -63.14 257 1 ASN 22 28 ? ? 57.93 80.20 258 1 LYS 22 49 ? ? -100.58 -71.40 259 1 GLU 22 52 ? ? 26.97 55.75 260 1 VAL 22 53 ? ? -128.97 -165.77 261 1 GLU 22 56 ? ? -108.37 -71.48 262 1 ASN 22 92 ? ? -148.22 -74.37 263 1 LYS 23 3 ? ? -72.07 -71.39 264 1 ARG 23 6 ? ? 28.30 -135.66 265 1 ILE 23 38 ? ? -109.54 -80.15 266 1 PRO 23 47 ? ? -60.30 74.35 267 1 PRO 23 49 ? ? -65.63 50.16 268 1 LEU 23 51 ? ? 59.07 -27.33 269 1 GLN 23 53 ? ? -148.13 56.41 270 1 ALA 23 74 ? ? 73.92 -26.24 271 1 GLU 23 87 ? ? -28.65 -58.84 272 1 SER 23 97 ? ? 63.03 -13.85 273 1 ASN 23 98 ? ? -164.51 96.50 274 1 SER 23 99 ? ? -60.41 95.90 275 1 LYS 24 10 ? ? -100.34 -61.69 276 1 SER 24 58 ? ? -103.45 -72.67 277 1 GLN 24 75 ? ? -128.64 -65.97 278 1 PRO 24 81 ? ? -28.28 -61.49 279 1 PRO 24 84 ? ? -59.89 62.90 280 1 GLN 24 87 ? ? -138.81 -54.81 281 1 ASN 25 8 ? ? -135.07 -155.20 282 1 ARG 25 16 ? ? 46.59 75.12 283 1 LEU 25 17 ? ? -97.61 -152.74 284 1 LYS 25 20 ? ? -78.32 -71.09 285 1 VAL 26 6 ? ? -117.84 -83.38 286 1 ASN 26 31 ? ? -52.90 98.39 287 1 HIS 26 33 ? ? -177.55 143.26 288 1 LYS 27 2 ? ? -44.86 -80.26 289 1 ARG 27 23 ? ? -84.68 -155.37 290 1 GLU 27 24 ? ? -13.59 -60.29 291 1 GLN 27 25 ? ? -30.30 -81.17 292 1 ASN 27 27 ? ? -37.21 -33.40 293 1 LYS 27 44 ? ? -48.92 -72.45 294 1 THR 28 3 ? ? -71.68 -161.81 295 1 ILE 28 13 ? ? -140.13 -70.34 296 1 LEU 28 16 ? ? -47.22 159.15 297 1 ARG 28 29 ? ? -109.01 -78.99 298 1 GLU 28 57 ? ? -166.40 106.45 299 1 ILE 29 5 ? ? -147.25 -45.10 300 1 VAL 29 28 ? ? -42.03 -71.16 301 1 ASP 29 35 ? ? -96.41 -79.65 302 1 PRO 29 42 ? ? -80.77 47.56 303 1 ASP 29 50 ? ? -129.48 -66.01 304 1 VAL 29 51 ? ? -40.35 -82.42 305 1 THR 29 53 ? ? -139.97 -79.71 306 1 PRO 30 7 ? ? -67.11 -176.84 307 1 SER 30 17 ? ? -42.02 -74.69 308 1 THR 30 32 ? ? -95.12 -73.58 309 1 ARG 30 51 ? ? -170.37 141.05 310 1 VAL 30 53 ? ? -27.06 -43.04 311 1 THR 31 16 ? ? -54.75 173.94 312 1 THR 31 28 ? ? -136.37 -56.96 313 1 VAL 31 41 ? ? -71.84 -73.28 314 1 PHE 32 5 ? ? 162.87 103.98 315 1 PRO 32 7 ? ? -33.96 124.04 316 1 SER 32 15 ? ? -72.07 -71.02 317 1 LYS 32 25 ? ? -38.50 -74.68 318 1 ALA 32 40 ? ? -56.97 -80.41 319 1 THR 32 43 ? ? -132.30 -100.41 320 1 SER 32 45 ? ? 169.30 174.93 321 1 ARG 33 7 ? ? -38.50 -25.44 322 1 ASN 33 27 ? ? 44.91 21.26 323 1 ARG 33 29 ? ? -159.69 -93.94 324 1 ILE 33 31 ? ? 60.50 77.40 325 1 LEU 33 61 ? ? -148.20 58.71 326 1 PRO 33 62 ? ? -42.00 -78.36 327 1 LEU 34 10 ? ? -93.61 -73.39 328 1 ARG 34 12 ? ? -48.12 -16.05 329 1 ALA 34 29 ? ? -97.40 -85.87 330 1 ARG 34 36 ? ? -121.87 -162.34 331 1 GLN 34 37 ? ? 59.76 -150.73 332 1 HIS B 14 ? ? -56.98 -7.85 333 1 THR B 19 ? ? -44.70 -17.11 334 1 THR B 45 ? ? -52.18 -72.00 335 1 SER B 76 ? ? -47.84 -72.45 336 1 HIS B 93 ? ? -126.81 -85.84 337 1 LEU B 100 ? ? -122.38 -55.30 338 1 GLN B 119 ? ? -59.57 -8.51 339 1 LYS B 131 ? ? -54.15 -79.30 340 1 SER B 146 ? ? -122.21 -63.06 341 1 ASP B 164 ? ? 60.15 85.35 342 1 ALA B 165 ? ? -48.54 -75.97 343 1 HIS B 169 ? ? -35.88 -39.11 344 1 ASP B 193 ? ? -27.35 -50.83 345 1 GLN C 2 ? ? -141.86 -69.17 346 1 HIS C 5 ? ? -52.12 103.69 347 1 ASN C 7 ? ? -73.44 -75.18 348 1 ILE C 13 ? ? -137.62 -86.15 349 1 TRP C 17 ? ? -36.74 131.60 350 1 TRP C 21 ? ? -179.83 143.72 351 1 LYS C 26 ? ? -66.16 -72.57 352 1 PHE C 28 ? ? -40.55 -75.27 353 1 SER C 50 ? ? 61.54 79.33 354 1 SER C 52 ? ? -86.65 -73.67 355 1 ALA C 60 ? ? 40.37 97.59 356 1 ARG C 71 ? ? -114.41 76.13 357 1 LYS C 88 ? ? -68.79 -70.18 358 1 ALA C 112 ? ? -41.55 -84.93 359 1 THR C 120 ? ? -39.45 -77.33 360 1 ALA C 145 ? ? 178.16 154.07 361 1 LEU C 156 ? ? 24.81 78.62 362 1 ARG C 178 ? ? -56.52 -9.32 363 1 LYS C 203 ? ? -130.47 -60.78 364 1 LEU D 4 ? ? 42.31 25.25 365 1 PRO D 6 ? ? -61.43 79.59 366 1 PHE D 19 ? ? 72.57 -4.91 367 1 LEU D 20 ? ? -44.95 -74.88 368 1 SER D 22 ? ? -24.66 -76.50 369 1 ALA D 26 ? ? -38.43 -80.26 370 1 THR D 29 ? ? 66.55 -39.02 371 1 GLU D 34 ? ? 74.78 -33.04 372 1 GLN D 35 ? ? -158.70 80.62 373 1 ALA D 36 ? ? -176.90 39.31 374 1 LEU D 47 ? ? 46.89 87.11 375 1 GLU D 68 ? ? -29.46 -80.69 376 1 LEU D 81 ? ? -59.33 174.86 377 1 LYS D 150 ? ? 37.73 72.47 378 1 SER D 152 ? ? 57.31 -114.77 379 1 ARG D 153 ? ? -21.93 -53.27 380 1 GLU D 165 ? ? -43.86 -79.05 381 1 LYS D 166 ? ? 67.53 69.01 382 1 PRO D 167 ? ? -65.64 -163.22 383 1 TRP D 169 ? ? -22.29 -40.93 384 1 ALA D 174 ? ? 64.28 -16.87 385 1 LYS D 182 ? ? -83.19 -147.99 386 1 SER D 191 ? ? 25.65 -100.19 387 1 ALA D 192 ? ? 82.66 14.87 388 1 GLN E 11 ? ? 43.17 92.96 389 1 ILE E 15 ? ? -117.83 -80.17 390 1 LYS E 22 ? ? -127.11 -54.07 391 1 THR E 23 ? ? 63.20 91.13 392 1 LYS E 25 ? ? -37.26 -86.70 393 1 VAL E 45 ? ? -122.15 -169.64 394 1 TYR E 49 ? ? -109.94 -82.98 395 1 ASN E 77 ? ? 48.08 26.28 396 1 THR E 89 ? ? 53.89 -113.98 397 1 VAL E 93 ? ? 48.28 93.89 398 1 ALA E 98 ? ? 48.81 89.61 399 1 THR E 102 ? ? 53.22 76.09 400 1 ALA E 109 ? ? 76.34 -43.67 401 1 ALA E 112 ? ? -51.00 -75.42 402 1 ASN E 121 ? ? -133.69 -89.59 403 1 VAL E 122 ? ? 29.49 101.50 404 1 PRO E 132 ? ? -38.87 -73.43 405 1 GLU F 5 ? ? -161.69 100.17 406 1 ASP F 13 ? ? -55.53 -74.71 407 1 HIS F 37 ? ? -136.03 -70.80 408 1 GLU F 40 ? ? -35.93 131.70 409 1 PRO F 50 ? ? -49.08 84.10 410 1 LYS F 53 ? ? 59.91 -112.92 411 1 LEU F 54 ? ? -21.60 138.75 412 1 HIS F 55 ? ? -104.50 -159.40 413 1 LYS F 56 ? ? 41.40 88.29 414 1 MET F 62 ? ? -121.31 -60.06 415 1 ASN F 63 ? ? 52.51 83.51 416 1 ASP F 82 ? ? -58.40 -1.55 417 1 ARG F 86 ? ? 57.81 75.84 418 1 THR F 92 ? ? -106.26 -100.42 419 1 HIS F 94 ? ? 51.85 86.68 420 1 GLU F 98 ? ? 75.91 -178.98 421 1 GLU F 125 ? ? -124.05 -64.44 422 1 ARG G 3 ? ? -135.66 -57.91 423 1 ARG G 4 ? ? -24.07 126.67 424 1 PRO G 15 ? ? -81.69 37.83 425 1 LYS G 16 ? ? -146.75 -66.15 426 1 SER G 19 ? 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HB GLY 366 309 1 Y 1 Z LYS 370 ? HB LYS 367 310 1 Y 1 Z ILE 371 ? HB ILE 368 311 1 Y 1 Z LYS 372 ? HB LYS 369 312 1 Y 1 Z SER 373 ? HB SER 370 313 1 Y 1 Z ILE 374 ? HB ILE 371 314 1 Y 1 Z THR 375 ? HB THR 372 315 1 Y 1 Z ASP 376 ? HB ASP 373 316 1 Y 1 Z PHE 377 ? HB PHE 374 317 1 Y 1 Z GLY 378 ? HB GLY 375 318 1 Y 1 Z ILE 379 ? HB ILE 376 319 1 Y 1 Z PHE 380 ? HB PHE 377 320 1 Y 1 Z ILE 381 ? HB ILE 378 321 1 Y 1 Z GLY 382 ? HB GLY 379 322 1 Y 1 Z LEU 383 ? HB LEU 380 323 1 Y 1 Z ASP 384 ? HB ASP 381 324 1 Y 1 Z GLY 385 ? HB GLY 382 325 1 Y 1 Z GLY 386 ? HB GLY 383 326 1 Y 1 Z ILE 387 ? HB ILE 384 327 1 Y 1 Z ASP 388 ? HB ASP 385 328 1 Y 1 Z GLY 389 ? HB GLY 386 329 1 Y 1 Z LEU 390 ? HB LEU 387 330 1 Y 1 Z VAL 391 ? HB VAL 388 331 1 Y 1 Z HIS 392 ? HB HIS 389 332 1 Y 1 Z LEU 393 ? HB LEU 390 333 1 Y 1 Z SER 394 ? HB SER 391 334 1 Y 1 Z ASP 395 ? HB ASP 392 335 1 Y 1 Z ILE 396 ? HB ILE 393 336 1 Y 1 Z SER 397 ? HB SER 394 337 1 Y 1 Z TRP 398 ? HB TRP 395 338 1 Y 1 Z ASN 399 ? HB ASN 396 339 1 Y 1 Z VAL 400 ? HB VAL 397 340 1 Y 1 Z ALA 401 ? HB ALA 398 341 1 Y 1 Z GLY 402 ? HB GLY 399 342 1 Y 1 Z GLU 403 ? HB GLU 400 343 1 Y 1 Z GLU 404 ? HB GLU 401 344 1 Y 1 Z ALA 405 ? HB ALA 402 345 1 Y 1 Z VAL 406 ? HB VAL 403 346 1 Y 1 Z ARG 407 ? HB ARG 404 347 1 Y 1 Z GLU 408 ? HB GLU 405 348 1 Y 1 Z TYR 409 ? HB TYR 406 349 1 Y 1 Z LYS 410 ? HB LYS 407 350 1 Y 1 Z LYS 411 ? HB LYS 408 351 1 Y 1 Z GLY 412 ? HB GLY 409 352 1 Y 1 Z ASP 413 ? HB ASP 410 353 1 Y 1 Z GLU 414 ? HB GLU 411 354 1 Y 1 Z ILE 415 ? HB ILE 412 355 1 Y 1 Z ALA 416 ? HB ALA 413 356 1 Y 1 Z ALA 417 ? HB ALA 414 357 1 Y 1 Z VAL 418 ? HB VAL 415 358 1 Y 1 Z VAL 419 ? HB VAL 416 359 1 Y 1 Z LEU 420 ? HB LEU 417 360 1 Y 1 Z GLN 421 ? HB GLN 418 361 1 Y 1 Z VAL 422 ? HB VAL 419 362 1 Y 1 Z ASP 423 ? HB ASP 420 363 1 Y 1 Z ALA 424 ? HB ALA 421 364 1 Y 1 Z GLU 425 ? HB GLU 422 365 1 Y 1 Z ARG 426 ? HB ARG 423 366 1 Y 1 Z GLU 427 ? HB GLU 424 367 1 Y 1 Z ARG 428 ? HB ARG 425 368 1 Y 1 Z ILE 429 ? HB ILE 426 369 1 Y 1 Z SER 430 ? HB SER 427 370 1 Y 1 Z LEU 431 ? HB LEU 428 371 1 Y 1 Z GLY 432 ? HB GLY 429 372 1 Y 1 Z VAL 433 ? HB VAL 430 373 1 Y 1 Z LYS 434 ? HB LYS 431 374 1 Y 1 Z GLN 435 ? HB GLN 432 375 1 Y 1 Z LEU 436 ? HB LEU 433 376 1 Y 1 Z ALA 437 ? HB ALA 434 377 1 Y 1 Z GLU 438 ? HB GLU 435 378 1 Y 1 Z ASP 439 ? HB ASP 436 379 1 Y 1 Z PRO 440 ? HB PRO 437 380 1 Y 1 Z PHE 441 ? HB PHE 438 381 1 Y 1 Z ASN 442 ? HB ASN 439 382 1 Y 1 Z ASN 443 ? HB ASN 440 383 1 Y 1 Z TRP 444 ? HB TRP 441 384 1 Y 1 Z VAL 445 ? HB VAL 442 385 1 Y 1 Z ALA 446 ? HB ALA 443 386 1 Y 1 Z LEU 447 ? HB LEU 444 387 1 Y 1 Z ASN 448 ? HB ASN 445 388 1 Y 1 Z LYS 449 ? HB LYS 446 389 1 Y 1 Z LYS 450 ? HB LYS 447 390 1 Y 1 Z GLY 451 ? HB GLY 448 391 1 Y 1 Z ALA 452 ? HB ALA 449 392 1 Y 1 Z ILE 453 ? HB ILE 450 393 1 Y 1 Z VAL 454 ? HB VAL 451 394 1 Y 1 Z THR 455 ? HB THR 452 395 1 Y 1 Z GLY 456 ? HB GLY 453 396 1 Y 1 Z LYS 457 ? HB LYS 454 397 1 Y 1 Z VAL 458 ? HB VAL 455 398 1 Y 1 Z THR 459 ? HB THR 456 399 1 Y 1 Z ALA 460 ? HB ALA 457 400 1 Y 1 Z VAL 461 ? HB VAL 458 401 1 Y 1 Z ASP 462 ? HB ASP 459 402 1 Y 1 Z ALA 463 ? HB ALA 460 403 1 Y 1 Z LYS 464 ? HB LYS 461 404 1 Y 1 Z GLY 465 ? HB GLY 462 405 1 Y 1 Z ALA 466 ? HB ALA 463 406 1 Y 1 Z THR 467 ? HB THR 464 407 1 Y 1 Z VAL 468 ? HB VAL 465 408 1 Y 1 Z GLU 469 ? HB GLU 466 409 1 Y 1 Z LEU 470 ? HB LEU 467 410 1 Y 1 Z ALA 471 ? HB ALA 468 411 1 Y 1 Z ASP 472 ? HB ASP 469 412 1 Y 1 Z GLY 473 ? HB GLY 470 413 1 Y 1 Z VAL 474 ? HB VAL 471 414 1 Y 1 Z GLU 475 ? HB GLU 472 415 1 Y 1 Z GLY 476 ? HB GLY 473 416 1 Y 1 Z TYR 477 ? HB TYR 474 417 1 Y 1 Z LEU 478 ? HB LEU 475 418 1 Y 1 Z ARG 479 ? HB ARG 476 419 1 Y 1 Z ALA 480 ? HB ALA 477 420 1 Y 1 Z SER 481 ? HB SER 478 421 1 Y 1 Z GLU 482 ? HB GLU 479 422 1 Y 1 Z ALA 483 ? HB ALA 480 423 1 Y 1 Z SER 484 ? HB SER 481 424 1 Y 1 Z ARG 485 ? HB ARG 482 425 1 Y 1 Z ASP 486 ? HB ASP 483 426 1 Y 1 Z ARG 487 ? HB ARG 484 427 1 Y 1 Z VAL 488 ? HB VAL 485 428 1 Y 1 Z GLU 489 ? HB GLU 486 429 1 Y 1 Z ASP 490 ? HB ASP 487 430 1 Y 1 Z ALA 491 ? HB ALA 488 431 1 Y 1 Z THR 492 ? HB THR 489 432 1 Y 1 Z LEU 493 ? HB LEU 490 433 1 Y 1 Z VAL 494 ? HB VAL 491 434 1 Y 1 Z LEU 495 ? HB LEU 492 435 1 Y 1 Z SER 496 ? HB SER 493 436 1 Y 1 Z VAL 497 ? HB VAL 494 437 1 Y 1 Z GLY 498 ? HB GLY 495 438 1 Y 1 Z ASP 499 ? HB ASP 496 439 1 Y 1 Z GLU 500 ? HB GLU 497 440 1 Y 1 Z VAL 501 ? HB VAL 498 441 1 Y 1 Z GLU 502 ? HB GLU 499 442 1 Y 1 Z ALA 503 ? HB ALA 500 443 1 Y 1 Z LYS 504 ? HB LYS 501 444 1 Y 1 Z PHE 505 ? HB PHE 502 445 1 Y 1 Z THR 506 ? HB THR 503 446 1 Y 1 Z GLY 507 ? HB GLY 504 447 1 Y 1 Z VAL 508 ? HB VAL 505 448 1 Y 1 Z ASP 509 ? HB ASP 506 449 1 Y 1 Z ARG 510 ? HB ARG 507 450 1 Y 1 Z LYS 511 ? HB LYS 508 451 1 Y 1 Z ASN 512 ? HB ASN 509 452 1 Y 1 Z ARG 513 ? HB ARG 510 453 1 Y 1 Z ALA 514 ? HB ALA 511 454 1 Y 1 Z ILE 515 ? HB ILE 512 455 1 Y 1 Z SER 516 ? HB SER 513 456 1 Y 1 Z LEU 517 ? HB LEU 514 457 1 Y 1 Z SER 518 ? HB SER 515 458 1 Y 1 Z VAL 519 ? HB VAL 516 459 1 Y 1 Z ARG 520 ? HB ARG 517 460 1 Y 1 Z ALA 521 ? HB ALA 518 461 1 Y 1 Z LYS 522 ? HB LYS 519 462 1 Y 1 Z ASP 523 ? HB ASP 520 463 1 Y 1 Z GLU 524 ? HB GLU 521 464 1 Y 1 Z ALA 525 ? HB ALA 522 465 1 Y 1 Z ASP 526 ? HB ASP 523 466 1 Y 1 Z GLU 527 ? HB GLU 524 467 1 Y 1 Z LYS 528 ? HB LYS 525 468 1 Y 1 Z ASP 529 ? HB ASP 526 469 1 Y 1 Z ALA 530 ? HB ALA 527 470 1 Y 1 Z ILE 531 ? HB ILE 528 471 1 Y 1 Z ALA 532 ? HB ALA 529 472 1 Y 1 Z THR 533 ? HB THR 530 473 1 Y 1 Z VAL 534 ? HB VAL 531 474 1 Y 1 Z ASN 535 ? HB ASN 532 475 1 Y 1 Z LYS 536 ? HB LYS 533 476 1 Y 1 Z GLN 537 ? HB GLN 534 477 1 Y 1 Z GLU 538 ? HB GLU 535 478 1 Y 1 Z ASP 539 ? HB ASP 536 479 1 Y 1 Z ALA 540 ? HB ALA 537 480 1 Y 1 Z ASN 541 ? HB ASN 538 481 1 Y 1 Z PHE 542 ? HB PHE 539 482 1 Y 1 Z SER 543 ? HB SER 540 483 1 Y 1 Z ASN 544 ? HB ASN 541 484 1 Y 1 Z ASN 545 ? HB ASN 542 485 1 Y 1 Z ALA 546 ? HB ALA 543 486 1 Y 1 Z MET 547 ? HB MET 544 487 1 Y 1 Z ALA 548 ? HB ALA 545 488 1 Y 1 Z GLU 549 ? HB GLU 546 489 1 Y 1 Z ALA 550 ? HB ALA 547 490 1 Y 1 Z PHE 551 ? HB PHE 548 491 1 Y 1 Z LYS 552 ? HB LYS 549 492 1 Y 1 Z ALA 553 ? HB ALA 550 493 1 Y 1 Z ALA 554 ? HB ALA 551 494 1 Y 1 Z LYS 555 ? HB LYS 552 495 1 Y 1 Z GLY 556 ? HB GLY 553 496 1 Y 1 Z GLU 557 ? HB GLU 554 # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ;CTFFIND3 was used to determine CTF values. FREALIGN applied CTF correction. ; # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.units MEGADALTONS _em_entity_assembly_molwt.value 2.5 # _em_entity_assembly_naturalsource.id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 83333 _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Escherichia coli (strain K12)' _em_entity_assembly_naturalsource.strain K12 _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details 'Gain reference was applied, movies were aligned, and the summed imaged were corrected for magnification anisotropy.' # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 1.0 _em_image_recording.average_exposure_time 0.4 _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode SUPER-RESOLUTION _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 2 _em_image_recording.num_real_images 3928 # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details 'Particles were picked from micrographs using Signature reference-based particle picker.' _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 800367 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? Signature 2.02a 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' ? SerialEM 3 ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? CTFFIND 3 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? 'UCSF Chimera' 1.7 ? 1 ? 8 OTHER ? ? ? ? ? ? 9 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? FREALIGN 9.11 1 ? ? 10 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? FREALIGN 9.11 1 ? ? 11 CLASSIFICATION ? FREALIGN 9.11 1 ? ? 12 RECONSTRUCTION ? FREALIGN 9.11 1 ? ? 13 'MODEL REFINEMENT' ? RSRef 1.1 ? 1 ? 14 'MODEL REFINEMENT' ? CNS 1.3 ? 1 ? 15 'MODEL REFINEMENT' ? PHENIX 1.11 ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ;250 nM 50S, 250 nM 30S, 1.25 micromolar mRNA, 500 nM fMet-tRNAfMet, 1 micromolar EF-T, 500 micromolar GDPCP, 1 micromolar Phe-tRNAPhe ; _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 6BU8 'double helix' 6BU8 'a-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 AB A 396 1_555 AB U 36 1_555 -0.573 1.764 0.708 -4.564 7.945 148.550 1 A_A397:U37_A A 397 ? A 37 ? 21 2 1 AB G 547 1_555 AB C 35 1_555 -0.753 0.149 0.073 -1.880 3.987 -0.962 2 A_G548:C36_A A 548 ? A 36 ? 19 1 1 AB C 548 1_555 AB G 34 1_555 0.034 0.007 -0.125 0.498 -7.373 -6.792 3 A_C549:G35_A A 549 ? A 35 ? 19 1 1 AB G 549 1_555 AB C 33 1_555 -0.202 -0.056 0.092 0.078 -5.113 -7.431 4 A_G550:C34_A A 550 ? A 34 ? 19 1 1 AB U 550 1_555 AB A 32 1_555 -0.274 0.194 0.039 1.582 -2.114 -5.629 5 A_U551:A33_A A 551 ? A 33 ? 20 1 1 AB U 551 1_555 AB A 31 1_555 -0.259 0.232 -0.423 4.271 -2.541 -6.694 6 A_U552:A32_A A 552 ? A 32 ? 20 1 1 AB A 552 1_555 AB U 29 1_555 -0.590 0.020 0.658 3.006 -5.205 3.612 7 A_A553:U30_A A 553 ? A 30 ? 20 1 1 AB A 553 1_555 AB U 28 1_555 -0.691 0.154 -0.169 -0.974 -15.231 16.390 8 A_A554:U29_A A 554 ? A 29 ? 20 1 1 AB U 554 1_555 AB A 27 1_555 -0.060 0.192 0.009 0.044 4.271 1.746 9 A_U555:A28_A A 555 ? A 28 ? 20 1 1 AB C 555 1_555 AB G 26 1_555 0.659 -0.070 -0.129 5.330 -6.398 0.573 10 A_C556:G27_A A 556 ? A 27 ? 19 1 1 AB G 557 1_555 AB A 25 1_555 6.705 -4.410 -0.270 -8.853 0.813 3.486 11 A_G558:A26_A A 558 ? A 26 ? 11 9 1 AB G 8 1_555 AB C 24 1_555 -0.133 0.073 -0.512 -6.113 -0.768 0.929 12 A_G9:C25_A A 9 ? A 25 ? 19 1 1 AB A 9 1_555 AB U 23 1_555 -0.396 0.110 -0.635 -7.561 -4.146 7.343 13 A_A10:U24_A A 10 ? A 24 ? 20 1 1 AB G 10 1_555 AB C 22 1_555 0.208 0.075 -0.626 -14.093 -0.649 -4.191 14 A_G11:C23_A A 11 ? A 23 ? 19 1 1 AB U 11 1_555 AB G 21 1_555 2.224 -0.328 -0.551 7.772 -0.268 -9.888 15 A_U12:G22_A A 12 ? A 22 ? 28 1 1 AB A 913 1_555 AB G 20 1_555 -7.281 -3.629 -0.124 -4.007 0.520 1.806 16 A_A914:G21_A A 914 ? A 21 ? 11 9 1 AB A 914 1_555 AB U 12 1_555 -0.377 -2.848 -0.062 -8.089 4.993 70.988 17 A_A915:U13_A A 915 ? A 13 ? 23 3 1 AB U 915 1_555 AB A 18 1_555 -0.119 0.284 -0.629 11.189 -9.320 -4.339 18 A_U916:A19_A A 916 ? A 19 ? 20 1 1 AB G 916 1_555 AB C 17 1_555 0.033 0.251 -0.096 -8.310 -0.032 4.017 19 A_G917:C18_A A 917 ? A 18 ? 19 1 1 AB A 917 1_555 AB U 16 1_555 0.525 0.119 -0.278 6.004 -5.243 -6.066 20 A_A918:U17_A A 918 ? A 17 ? 20 1 1 AB A 918 1_555 AB A 15 1_555 2.574 1.487 -0.683 3.049 -8.071 12.699 21 A_A919:A16_A A 919 ? A 16 ? ? 1 1 AB U 919 1_555 AB G 14 1_555 2.784 -0.395 -0.123 -2.944 3.228 -8.661 22 A_U920:G15_A A 920 ? A 15 ? 28 1 1 AB U 920 1_555 AB A 1395 1_555 0.241 0.113 -0.347 7.906 -8.375 -8.281 23 A_U921:A1396_A A 921 ? A 1396 ? 20 1 1 AB G 921 1_555 AB C 1394 1_555 0.047 0.218 0.004 -1.640 -10.544 -3.475 24 A_G922:C1395_A A 922 ? A 1395 ? 19 1 1 AB A 922 1_555 AB U 1392 1_555 -0.606 -0.046 -0.055 -6.915 -7.487 -7.908 25 A_A923:U1393_A A 923 ? A 1393 ? 20 1 1 AB C 923 1_555 AB G 1391 1_555 0.843 -0.058 -0.161 4.836 -5.943 0.443 26 A_C924:G1392_A A 924 ? A 1392 ? 19 1 1 AB G 924 1_555 AB U 1390 1_555 -1.184 0.049 -0.182 -1.389 -10.342 -8.426 27 A_G925:U1391_A A 925 ? A 1391 ? 28 1 1 AB G 926 1_555 AB U 1389 1_555 -2.143 -0.100 -0.352 -6.483 0.133 0.474 28 A_G927:U1390_A A 927 ? A 1390 ? 28 1 1 AB G 927 1_555 AB C 1388 1_555 0.095 0.142 -0.471 -9.420 1.522 0.549 29 A_G928:C1389_A A 928 ? A 1389 ? 19 1 1 AB G 928 1_555 AB C 1387 1_555 0.340 0.099 -0.321 -4.229 -0.831 3.532 30 A_G929:C1388_A A 929 ? A 1388 ? 19 1 1 AB C 929 1_555 AB G 1386 1_555 0.531 0.235 -0.333 3.074 2.803 6.149 31 A_C930:G1387_A A 930 ? A 1387 ? 19 1 1 AB C 930 1_555 AB G 1385 1_555 0.713 0.178 -0.673 6.006 -1.273 7.206 32 A_C931:G1386_A A 931 ? A 1386 ? 19 1 1 AB C 931 1_555 AB G 1384 1_555 0.511 0.262 -0.409 9.058 -1.379 4.926 33 A_C932:G1385_A A 932 ? A 1385 ? 19 1 1 AB G 932 1_555 AB C 1383 1_555 -0.393 0.236 -0.242 3.301 -8.399 -1.856 34 A_G933:C1384_A A 933 ? A 1384 ? 19 1 1 AB A 934 1_555 AB U 1379 1_555 0.187 0.319 -0.613 -4.803 17.373 -10.449 35 A_A935:U1380_A A 935 ? A 1380 ? 20 1 1 AB C 935 1_555 AB G 1378 1_555 0.190 0.531 -0.473 11.382 5.482 3.419 36 A_C936:G1379_A A 936 ? 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