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JAZF1 protein,Suppressor of zeste 12 protein homolog' 2 'Jumonji/ARID domain-containing protein 2' 3 'ENX-1,Enhancer of zeste homolog 2,Lysine N-methyltransferase 6' 4 'hEED,Embryonic ectoderm development protein,WD protein associating with integrin cytoplasmic tails 1,WAIT-1' 5 ;Chromatin assembly factor 1 subunit C,CAF-1 subunit C,Chromatin assembly factor I p48 subunit,CAF-I p48,Nucleosome-remodeling factor subunit RBAP48,Retinoblastoma-binding protein 4,RBBP-4,Retinoblastoma-binding protein p48 ; 7 'Adipocyte enhancer-binding protein 2,AE-binding protein 2' 9 'Jumonji/ARID domain-containing protein 2' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MAPQKHGGGGGGGSGPSAGSGGGGFGGSAAVAAATASGGKSGGGSCGGGGSYSASSSSSAAAAAGAAVLPVKKPKMEHVQ 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EQASANHPAAAPSTGSSAKGLAATHHHPPLHRSAQDLRKQVSKVNGVTRMSSLGAGVTSAKKMREVRPSPSKTVKYTATV TKGAVTYTKAKRELVKDTKPNHHKPSSAVNHTISGKTESSNAKTRKQVLSLGGASKSTGPAVNGLKVSGRLNPKSCTKEV GGRQLREGLQLREGLRNSKRRLEEAHQA ; E ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MGQTGKKSEKGPVCWRKRVKSEYMRLRQLKRFRRADEVKSMFSSNRQKILERTEILNQEWKQRRIQPVHILTSVSSLRGT RECSVTSDLDFPTQVIPLKTLNAVASVPIMYSWSPLQQNFMVEDETVLHNIPYMGDEVLDQDGTFIEELIKNYDGKVHGD RECGFINDEIFVELVNALGQYNDDDDDDDGDDPEEREEKQKDLEDHRDDKESRPPRKFPSDKIFEAISSMFPDKGTAEEL KEKYKELTEQQLPGALPPECTPNIDGPNAKSVQREQSLHSFHTLFCRRCFKYDCFLHPFHATPNTYKRKNTETALDNKPC GPQCYQHLEGAKEFAAALTAERIKTPPKRPGGRRRGRLPNNSSRPSTPTINVLESKDTDSDREAGTETGGENNDKEEEEK KDETSSSSEANSRCQTPIKMKPNIEPPENVEWSGAEASMFRVLIGTYYDNFCAIARLIGTKTCRQVYEFRVKESSIIAPA PAEDVDTPPRKKKRKHRLWAAHCRKIQLKKDGSSNHVYNYQPCDHPRQPCDSSCPCVIAQNFCEKFCQCSSECQNRFPGC RCKAQCNTKQCPCYLAVRECDPDLCLTCGAADHWDSKNVSCKNCSIQRGSKKHLLLAPSDVAGWGIFIKDPVQKNEFISE YCGEIISQDEADRRGKVYDKYMCSFLFNLNNDFVVDATRKGNKIRFANHSVNPNCYAKVMMVNGDHRIGIFAKRAIQTGE ELFFDYRYSQADALKYVGIEREMEIP ; ;MGQTGKKSEKGPVCWRKRVKSEYMRLRQLKRFRRADEVKSMFSSNRQKILERTEILNQEWKQRRIQPVHILTSVSSLRGT RECSVTSDLDFPTQVIPLKTLNAVASVPIMYSWSPLQQNFMVEDETVLHNIPYMGDEVLDQDGTFIEELIKNYDGKVHGD RECGFINDEIFVELVNALGQYNDDDDDDDGDDPEEREEKQKDLEDHRDDKESRPPRKFPSDKIFEAISSMFPDKGTAEEL KEKYKELTEQQLPGALPPECTPNIDGPNAKSVQREQSLHSFHTLFCRRCFKYDCFLHPFHATPNTYKRKNTETALDNKPC GPQCYQHLEGAKEFAAALTAERIKTPPKRPGGRRRGRLPNNSSRPSTPTINVLESKDTDSDREAGTETGGENNDKEEEEK KDETSSSSEANSRCQTPIKMKPNIEPPENVEWSGAEASMFRVLIGTYYDNFCAIARLIGTKTCRQVYEFRVKESSIIAPA PAEDVDTPPRKKKRKHRLWAAHCRKIQLKKDGSSNHVYNYQPCDHPRQPCDSSCPCVIAQNFCEKFCQCSSECQNRFPGC RCKAQCNTKQCPCYLAVRECDPDLCLTCGAADHWDSKNVSCKNCSIQRGSKKHLLLAPSDVAGWGIFIKDPVQKNEFISE YCGEIISQDEADRRGKVYDKYMCSFLFNLNNDFVVDATRKGNKIRFANHSVNPNCYAKVMMVNGDHRIGIFAKRAIQTGE ELFFDYRYSQADALKYVGIEREMEIP ; K,C ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSEREVSTAPAGTDMPAAKKQKLSSDENSNPDLSGDENDDAVSIESGTNTERPDTPTNTPNAPGRKSWGKGKWKSKKCKY SFKCVNSLKEDHNQPLFGVQFNWHSKEGDPLVFATVGSNRVTLYECHSQGEIRLLQSYVDADADENFYTCAWTYDSNTSH 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EESPSKAGMNKRRKLKNKRRRSLPRPHDFFDAQTLDAIRHRAICFNLSAHIESLGKGHSVVFHSTVIAKRKEDSGKIKLL LHWMPEDILPDVWVNESERHQLKTKVVHLSKLPKDTALLLDPNIYRTMPQKRLKR ; ;MSSDGEPLSRMDSEDSISSTIMDVDSTISSGRSTPAMMNGQGSTTSSSKNIAYNCCWDQCQACFNSSPDLADHIRSIHVD GQRGGVFVCLWKGCKVYNTPSTSQSWLQRHMLTHSGDKPFKCVVGGCNASFASQGGLARHVPTHFSQQNSSKVSSQPKAK EESPSKAGMNKRRKLKNKRRRSLPRPHDFFDAQTLDAIRHRAICFNLSAHIESLGKGHSVVFHSTVIAKRKEDSGKIKLL LHWMPEDILPDVWVNESERHQLKTKVVHLSKLPKDTALLLDPNIYRTMPQKRLKR ; P ? 8 'polypeptide(L)' no no ;(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ; ;XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX ; Z ? 9 'polypeptide(L)' no yes ;RKRPRLQAQR(M3L)FAQSQPNSPSTTPVKIVEPLLPPPATQISDLSKRKPKTEDFLTFLCLRGSPALPNSMVYFGSSQD EEEVEEEDDETEDVKTATNNASSSCQSTPRKGKTHKHVHNGHVFNGSSRSTREKEPVQKHKSKEATPAKEKHSDHRADSR REQASANHPAAAPSTGSSAKGLAATHHHPPLHRSAQDLRKQVSKVNGVTRMSSLGAGVTSAKKMREVRPSPSKTVKYTAT VTKGAVTYTKAKRELVKDTKPNHHKPSSAVNHTISGKTESSNAKTRKQVLSLGGASKSTGPAVNGLKVSGRLNPKSCTKE VGGRQLREGLQLREGLRNSKRRLEEAHQA ; ;RKRPRLQAQRKFAQSQPNSPSTTPVKIVEPLLPPPATQISDLSKRKPKTEDFLTFLCLRGSPALPNSMVYFGSSQDEEEV EEEDDETEDVKTATNNASSSCQSTPRKGKTHKHVHNGHVFNGSSRSTREKEPVQKHKSKEATPAKEKHSDHRADSRREQA SANHPAAAPSTGSSAKGLAATHHHPPLHRSAQDLRKQVSKVNGVTRMSSLGAGVTSAKKMREVRPSPSKTVKYTATVTKG AVTYTKAKRELVKDTKPNHHKPSSAVNHTISGKTESSNAKTRKQVLSLGGASKSTGPAVNGLKVSGRLNPKSCTKEVGGR QLREGLQLREGLRNSKRRLEEAHQA ; B ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ALA n 1 3 PRO n 1 4 GLN n 1 5 LYS n 1 6 HIS n 1 7 GLY n 1 8 GLY n 1 9 GLY n 1 10 GLY n 1 11 GLY n 1 12 GLY n 1 13 GLY n 1 14 SER n 1 15 GLY n 1 16 PRO n 1 17 SER n 1 18 ALA n 1 19 GLY n 1 20 SER n 1 21 GLY n 1 22 GLY n 1 23 GLY n 1 24 GLY n 1 25 PHE n 1 26 GLY n 1 27 GLY n 1 28 SER n 1 29 ALA n 1 30 ALA n 1 31 VAL n 1 32 ALA n 1 33 ALA n 1 34 ALA n 1 35 THR n 1 36 ALA n 1 37 SER n 1 38 GLY n 1 39 GLY n 1 40 LYS n 1 41 SER n 1 42 GLY n 1 43 GLY n 1 44 GLY n 1 45 SER n 1 46 CYS n 1 47 GLY n 1 48 GLY n 1 49 GLY n 1 50 GLY n 1 51 SER n 1 52 TYR n 1 53 SER n 1 54 ALA n 1 55 SER n 1 56 SER n 1 57 SER n 1 58 SER n 1 59 SER n 1 60 ALA n 1 61 ALA n 1 62 ALA n 1 63 ALA n 1 64 ALA n 1 65 GLY n 1 66 ALA n 1 67 ALA n 1 68 VAL n 1 69 LEU n 1 70 PRO n 1 71 VAL n 1 72 LYS n 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_entity_src_gen.host_org_common_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.host_org_genus _entity_src_gen.pdbx_host_org_gene _entity_src_gen.pdbx_host_org_organ _entity_src_gen.host_org_species _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 739 Human ? 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'Trichoplusia ni' 7111 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP SUZ12_HUMAN Q15022 ? 1 ;MAPQKHGGGGGGGSGPSAGSGGGGFGGSAAVAAATASGGKSGGGSCGGGGSYSASSSSSAAAAAGAAVLPVKKPKMEHVQ ADHELFLQAFEKPTQIYRFLRTRNLIAPIFLHRTLTYMSHRNSRTNIKRKTFKVDDMLSKVEKMKGEQESHSLSAHLQLT FTGFFHKNDKPSPNSENEQNSVTLEVLLVKVCHKKRKDVSCPIRQVPTGKKQVPLNPDLNQTKPGNFPSLAVSSNEFEPS NSHMVKSYSLLFRVTRPGRREFNGMINGETNENIDVNEELPARRKRNREDGEKTFVAQMTVFDKNRRLQLLDGEYEVAMQ EMEECPISKKRATWETILDGKRLPPFETFSQGPTLQFTLRWTGETNDKSTAPIAKPLATRNSESLHQENKPGSVKPTQTI AVKESLTTDLQTRKEKDTPNENRQKLRIFYQFLYNNNTRQQTEARDDLHCPWCTLNCRKLYSLLKHLKLCHSRFIFNYVY HPKGARIDVSINECYDGSYAGNPQDIHRQPGFAFSRNGPVKRTPITHILVCRPKRTKASMSEFLESEDGEVEQQRTYSSG HNRLYFHSDTCLPLRPQEMEVDSEDEKDPEWLREKTITQIEEFSDVNEGEKEVMKLWNLHVMKHGFIADNQMNHACMLFV ENYGQKIIKKNLCRNFMLHLVSMHDFNLISIMSIDKAVTKLREMQQKLEKGESASPANEEITEEQNGTANGFSEINSKEK ALETDSVSGVSKQSKKQKL ; 1 2 UNP JARD2_HUMAN Q92833 Q92833-2 2 ;RKRPRLQAQRKFAQSQPNSPSTTPVKIVEPLLPPPATQISDLSKRKPKTEDFLTFLCLRGSPALPNSMVYFGSSQDEEEV EEEDDETEDVKTATNNASSSCQSTPRKGKTHKHVHNGHVFNGSSRSTREKEPVQKHKSKEATPAKEKHSDHRADSRREQA SANHPAAAPSTGSSAKGLAATHHHPPLHRSAQDLRKQVSKVNGVTRMSSLGAGVTSAKKMREVRPSPSKTVKYTATVTKG AVTYTKAKRELVKDTKPNHHKPSSAVNHTISGKTESSNAKTRKQVLSLGGASKSTGPAVNGLKVSGRLNPKSCTKEVGGR QLREGLQLREGLRNSKRRLEEAHQA ; 68 3 UNP EZH2_HUMAN Q15910 ? 3 ;MGQTGKKSEKGPVCWRKRVKSEYMRLRQLKRFRRADEVKSMFSSNRQKILERTEILNQEWKQRRIQPVHILTSVSSLRGT RECSVTSDLDFPTQVIPLKTLNAVASVPIMYSWSPLQQNFMVEDETVLHNIPYMGDEVLDQDGTFIEELIKNYDGKVHGD RECGFINDEIFVELVNALGQYNDDDDDDDGDDPEEREEKQKDLEDHRDDKESRPPRKFPSDKIFEAISSMFPDKGTAEEL KEKYKELTEQQLPGALPPECTPNIDGPNAKSVQREQSLHSFHTLFCRRCFKYDCFLHPFHATPNTYKRKNTETALDNKPC GPQCYQHLEGAKEFAAALTAERIKTPPKRPGGRRRGRLPNNSSRPSTPTINVLESKDTDSDREAGTETGGENNDKEEEEK KDETSSSSEANSRCQTPIKMKPNIEPPENVEWSGAEASMFRVLIGTYYDNFCAIARLIGTKTCRQVYEFRVKESSIIAPA PAEDVDTPPRKKKRKHRLWAAHCRKIQLKKDGSSNHVYNYQPCDHPRQPCDSSCPCVIAQNFCEKFCQCSSECQNRFPGC RCKAQCNTKQCPCYLAVRECDPDLCLTCGAADHWDSKNVSCKNCSIQRGSKKHLLLAPSDVAGWGIFIKDPVQKNEFISE YCGEIISQDEADRRGKVYDKYMCSFLFNLNNDFVVDATRKGNKIRFANHSVNPNCYAKVMMVNGDHRIGIFAKRAIQTGE ELFFDYRYSQADALKYVGIEREMEIP ; 1 4 UNP EED_HUMAN O75530 ? 4 ;MSEREVSTAPAGTDMPAAKKQKLSSDENSNPDLSGDENDDAVSIESGTNTERPDTPTNTPNAPGRKSWGKGKWKSKKCKY SFKCVNSLKEDHNQPLFGVQFNWHSKEGDPLVFATVGSNRVTLYECHSQGEIRLLQSYVDADADENFYTCAWTYDSNTSH PLLAVAGSRGIIRIINPITMQCIKHYVGHGNAINELKFHPRDPNLLLSVSKDHALRLWNIQTDTLVAIFGGVEGHRDEVL SADYDLLGEKIMSCGMDHSLKLWRINSKRMMNAIKESYDYNPNKTNRPFISQKIHFPDFSTRDIHRNYVDCVRWLGDLIL SKSCENAIVCWKPGKMEDDIDKIKPSESNVTILGRFDYSQCDIWYMRFSMDFWQKMLALGNQVGKLYVWDLEVEDPHKAK CTTLTHHKCGAAIRQTSFSRDSSILIAVCDDASIWRWDRLR ; 1 5 UNP RBBP4_HUMAN Q09028 ? 5 ;MADKEAAFDDAVEERVINEEYKIWKKNTPFLYDLVMTHALEWPSLTAQWLPDVTRPEGKDFSIHRLVLGTHTSDEQNHLV IASVQLPNDDAQFDASHYDSEKGEFGGFGSVSGKIEIEIKINHEGEVNRARYMPQNPCIIATKTPSSDVLVFDYTKHPSK PDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNPNLSGHLLSASDDHTICLWDISAVPKEGKVVDAKTIFTGHTAVVEDVSWHLLHE SLFGSVADDQKLMIWDTRSNNTSKPSHSVDAHTAEVNCLSFNPYSEFILATGSADKTVALWDLRNLKLKLHSFESHKDEI FQVQWSPHNETILASSGTDRRLNVWDLSKIGEEQSPEDAEDGPPELLFIHGGHTAKISDFSWNPNEPWVICSVSEDNIMQ VWQMAENIYNDEDPEGSVDPEGQGS ; 1 6 PDB 6C23 6C23 ? 6 ? 1 7 UNP AEBP2_HUMAN Q6ZN18 ? 7 ;MSSDGEPLSRMDSEDSISSTIMDVDSTISSGRSTPAMMNGQGSTTSSSKNIAYNCCWDQCQACFNSSPDLADHIRSIHVD GQRGGVFVCLWKGCKVYNTPSTSQSWLQRHMLTHSGDKPFKCVVGGCNASFASQGGLARHVPTHFSQQNSSKVSSQPKAK EESPSKAGMNKRRKLKNKRRRSLPRPHDFFDAQTLDAIRHRAICFNLSAHIESLGKGHSVVFHSTVIAKRKEDSGKIKLL LHWMPEDILPDVWVNESERHQLKTKVVHLSKLPKDTALLLDPNIYRTMPQKRLKR ; 209 8 PDB 6C23 6C23 ? 8 ? 1 9 UNP JARD2_HUMAN Q92833 Q92833-2 9 ;RKRPRLQAQRKFAQSQPNSPSTTPVKIVEPLLPPPATQISDLSKRKPKTEDFLTFLCLRGSPALPNSMVYFGSSQDEEEV EEEDDETEDVKTATNNASSSCQSTPRKGKTHKHVHNGHVFNGSSRSTREKEPVQKHKSKEATPAKEKHSDHRADSRREQA SANHPAAAPSTGSSAKGLAATHHHPPLHRSAQDLRKQVSKVNGVTRMSSLGAGVTSAKKMREVRPSPSKTVKYTATVTKG AVTYTKAKRELVKDTKPNHHKPSSAVNHTISGKTESSNAKTRKQVLSLGGASKSTGPAVNGLKVSGRLNPKSCTKEVGGR QLREGLQLREGLRNSKRRLEEAHQA ; 68 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6C23 A 1 ? 739 ? 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'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 M3L 'L-peptide linking' n N-TRIMETHYLLYSINE ? 'C9 H21 N2 O2 1' 189.275 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 UNK 'L-peptide linking' . UNKNOWN ? 'C4 H9 N O2' 103.120 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? # _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.d_res_high 3.900 _refine_ls_shell.d_res_low 4.001 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 4779 _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.463 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 100.00 _refine_ls_shell.R_factor_R_free ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 0 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? # _struct.entry_id 6C23 _struct.title 'Cryo-EM structure of PRC2 bound to cofactors AEBP2 and JARID2 in the Compact Active State' _struct.pdbx_descriptor ;Polycomb protein SUZ12, Protein Jumonji, Histone-lysine N-methyltransferase EZH2 (E.C.2.1.1.43), Polycomb protein EED, Histone-binding protein RBBP4, JARID2-substrate, Zinc finger protein AEBP2, SUZ12 ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6C23 _struct_keywords.text 'polycomb repressive complex, AEBP2, JARID2, histone modification, GENE REGULATION' _struct_keywords.pdbx_keywords 'GENE REGULATION' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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PRO 282 P 1 2.02 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 5 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 5 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 3 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 4 ? AC5 ? 4 ? AC6 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? parallel AC5 3 4 ? parallel AC6 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 PHE A 432 ? LEU A 433 ? PHE A 432 LEU A 433 AA1 2 ARG A 486 ? ILE A 491 ? ARG A 486 ILE A 491 AA1 3 PHE A 474 ? TYR A 480 ? PHE A 474 TYR A 480 AA2 1 LEU A 529 ? VAL A 530 ? LEU A 529 VAL A 530 AA2 2 TYR F 32 ? ALA F 39 ? TYR N 32 ALA N 39 AA2 3 ILE F 398 ? MET F 404 ? ILE N 398 MET N 404 AA2 4 VAL F 389 ? SER F 394 ? VAL N 389 SER N 394 AA2 5 ILE F 377 ? TRP F 382 ? ILE N 377 TRP N 382 AA3 1 PHE C 285 ? CYS C 286 ? PHE K 285 CYS K 286 AA3 2 LYS C 291 ? TYR C 292 ? LYS K 291 TYR K 292 AA4 1 LEU C 614 ? PRO C 618 ? LEU K 614 PRO K 618 AA4 2 TRP C 624 ? ILE C 628 ? TRP K 624 ILE K 628 AA5 1 PHE C 637 ? GLU C 640 ? PHE K 637 GLU K 640 AA5 2 HIS C 706 ? PHE C 711 ? HIS K 706 PHE K 711 AA5 3 TYR C 696 ? MET C 701 ? TYR K 696 MET K 701 AA6 1 LEU C 666 ? ASN C 668 ? LEU K 666 ASN K 668 AA6 2 VAL C 674 ? ASP C 676 ? VAL K 674 ASP K 676 AA6 3 GLU C 644 ? ILE C 646 ? GLU K 644 ILE K 646 AA6 4 PHE K 120 ? MET K 121 ? PHE C 120 MET C 121 AA7 1 PHE D 82 ? CYS D 84 ? PHE L 82 CYS L 84 AA7 2 ARG D 436 ? ARG D 439 ? ARG L 436 ARG L 439 AA7 3 ILE D 424 ? CYS D 429 ? ILE L 424 CYS L 429 AA7 4 ILE D 413 ? PHE D 418 ? ILE L 413 PHE L 418 AA8 1 LEU D 88 ? GLU D 90 ? LEU L 88 GLU L 90 AA8 2 VAL K 85 ? SER K 87 ? VAL C 85 SER C 87 AA9 1 GLY D 98 ? PHE D 101 ? GLY L 98 PHE L 101 AA9 2 LEU D 111 ? VAL D 116 ? LEU L 111 VAL L 116 AA9 3 ARG D 120 ? CYS D 126 ? ARG L 120 CYS L 126 AA9 4 SER D 137 ? VAL D 139 ? SER L 137 VAL L 139 AB1 1 ALA D 151 ? TYR D 154 ? ALA L 151 TYR L 154 AB1 2 PRO D 161 ? GLY D 167 ? PRO L 161 GLY L 167 AB1 3 ILE D 171 ? ILE D 175 ? ILE L 171 ILE L 175 AB1 4 HIS D 185 ? TYR D 186 ? HIS L 185 TYR L 186 AB2 1 GLU D 195 ? LEU D 196 ? GLU L 195 LEU L 196 AB2 2 LEU D 205 ? VAL D 209 ? LEU L 205 VAL L 209 AB2 3 LEU D 215 ? ASN D 219 ? LEU L 215 ASN L 219 AB2 4 THR D 224 ? PHE D 229 ? THR L 224 PHE L 229 AB2 5 GLN D 292 ? ILE D 294 ? GLN L 292 ILE L 294 AB3 1 VAL D 239 ? TYR D 244 ? VAL L 239 TYR L 244 AB3 2 LYS D 250 ? GLY D 255 ? LYS L 250 GLY L 255 AB3 3 LEU D 260 ? ARG D 264 ? LEU L 260 ARG L 264 AB3 4 SER D 300 ? THR D 301 ? SER L 300 THR L 301 AB4 1 VAL D 312 ? LEU D 315 ? VAL L 312 LEU L 315 AB4 2 LEU D 318 ? SER D 321 ? LEU L 318 SER L 321 AB4 3 ALA D 327 ? PRO D 333 ? ALA L 327 PRO L 333 AB4 4 VAL D 350 ? ASP D 357 ? VAL L 350 ASP L 357 AB5 1 MET D 376 ? LEU D 377 ? MET L 376 LEU L 377 AB5 2 TRP D 389 ? ASP D 390 ? TRP L 389 ASP L 390 AB6 1 TYR E 565 ? PHE E 566 ? TYR M 565 PHE M 566 AB6 2 PRO E 573 ? LEU E 574 ? PRO M 573 LEU M 574 AB7 1 GLN F 48 ? TRP F 49 ? GLN N 48 TRP N 49 AB7 2 ARG F 65 ? VAL F 67 ? ARG N 65 VAL N 67 AB7 3 HIS F 78 ? SER F 83 ? HIS N 78 SER N 83 AB7 4 LYS F 120 ? ASN F 122 ? LYS N 120 ASN N 122 AB8 1 PHE F 61 ? SER F 62 ? PHE N 61 SER N 62 AB8 2 LEU F 86 ? PRO F 87 ? LEU N 86 PRO N 87 AB9 1 ILE F 139 ? THR F 142 ? ILE N 139 THR N 142 AB9 2 LEU F 150 ? ASP F 153 ? LEU N 150 ASP N 153 AC1 1 SER F 184 ? TRP F 185 ? SER N 184 TRP N 185 AC1 2 LEU F 193 ? LEU F 194 ? LEU N 193 LEU N 194 AC1 3 LEU F 204 ? TRP F 205 ? LEU N 204 TRP N 205 AC2 1 VAL F 230 ? TRP F 235 ? VAL N 230 TRP N 235 AC2 2 LEU F 242 ? ALA F 247 ? LEU N 242 ALA N 247 AC2 3 LEU F 252 ? ASP F 256 ? LEU N 252 ASP N 256 AC2 4 HIS F 267 ? VAL F 269 ? HIS N 267 VAL N 269 AC3 1 SER F 280 ? PHE F 281 ? SER N 280 PHE N 281 AC3 2 ILE F 288 ? GLY F 292 ? ILE N 288 GLY N 292 AC3 3 VAL F 298 ? ASP F 302 ? VAL N 298 ASP N 302 AC3 4 LYS F 309 ? PHE F 313 ? LYS N 309 PHE N 313 AC4 1 ILE F 320 ? VAL F 323 ? ILE N 320 VAL N 323 AC4 2 ILE F 332 ? GLY F 337 ? ILE N 332 GLY N 337 AC4 3 LEU F 342 ? ASP F 346 ? LEU N 342 ASP N 346 AC4 4 LEU F 366 ? HIS F 370 ? LEU N 366 HIS N 370 AC5 1 UNK J 5 ? UNK J 6 ? UNK Z 19 UNK Z 20 AC5 2 UNK J 13 ? UNK J 18 ? UNK Z 31 UNK Z 36 AC5 3 UNK J 31 ? UNK J 36 ? UNK Z 58 UNK Z 63 AC5 4 UNK J 50 ? UNK J 53 ? UNK Z 86 UNK Z 89 AC6 1 GLU K 82 ? CYS K 83 ? GLU C 82 CYS C 83 AC6 2 ILE K 96 ? PRO K 97 ? ILE C 96 PRO C 97 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N LEU A 433 ? N LEU A 433 O VAL A 489 ? O VAL A 489 AA1 2 3 O ASP A 488 ? O ASP A 488 N ASN A 477 ? N ASN A 477 AA2 1 2 N VAL A 530 ? N VAL A 530 O THR F 37 ? O THR N 37 AA2 2 3 N ASP F 33 ? N ASP N 33 O GLN F 403 ? O GLN N 403 AA2 3 4 O GLN F 400 ? O GLN N 400 N SER F 392 ? N SER N 392 AA2 4 5 O VAL F 393 ? O VAL N 393 N ASP F 379 ? N ASP N 379 AA3 1 2 N CYS C 286 ? N CYS K 286 O LYS C 291 ? O LYS K 291 AA4 1 2 N LEU C 615 ? N LEU K 615 O PHE C 627 ? O PHE K 627 AA5 1 2 N ILE C 638 ? N ILE K 638 O ILE C 710 ? O ILE K 710 AA5 2 3 O PHE C 711 ? O PHE K 711 N TYR C 696 ? N TYR K 696 AA6 1 2 N PHE C 667 ? N PHE K 667 O VAL C 675 ? O VAL K 675 AA6 2 3 O ASP C 676 ? O ASP K 676 N GLU C 644 ? N GLU K 644 AA6 3 4 N ILE C 645 ? N ILE K 645 O PHE K 120 ? O PHE C 120 AA7 1 2 N LYS D 83 ? N LYS L 83 O ASP D 438 ? O ASP L 438 AA7 2 3 O TRP D 437 ? O TRP L 437 N LEU D 425 ? N LEU L 425 AA7 3 4 O ILE D 426 ? O ILE L 426 N SER D 417 ? N SER L 417 AA8 1 2 N LYS D 89 ? N LYS L 89 O THR K 86 ? O THR C 86 AA9 1 2 N GLN D 100 ? N GLN L 100 O ALA D 114 ? O ALA L 114 AA9 2 3 N LEU D 111 ? N LEU L 111 O CYS D 126 ? O CYS L 126 AA9 3 4 N VAL D 121 ? N VAL L 121 O TYR D 138 ? O TYR L 138 AB1 1 2 N THR D 153 ? N THR L 153 O LEU D 162 ? O LEU L 162 AB1 2 3 N LEU D 163 ? N LEU L 163 O ILE D 175 ? O ILE L 175 AB1 3 4 N ILE D 172 ? N ILE L 172 O TYR D 186 ? O TYR L 186 AB2 1 2 N GLU D 195 ? N GLU L 195 O VAL D 209 ? O VAL L 209 AB2 2 3 N LEU D 206 ? N LEU L 206 O TRP D 218 ? O TRP L 218 AB2 3 4 N ASN D 219 ? N ASN L 219 O THR D 224 ? O THR L 224 AB2 4 5 N VAL D 226 ? N VAL L 226 O GLN D 292 ? O GLN L 292 AB3 1 2 N LEU D 240 ? N LEU L 240 O CYS D 254 ? O CYS L 254 AB3 2 3 N SER D 253 ? N SER L 253 O LYS D 261 ? O LYS L 261 AB3 3 4 N LEU D 260 ? N LEU L 260 O THR D 301 ? O THR L 301 AB4 1 2 N ARG D 313 ? N ARG L 313 O LEU D 320 ? O LEU L 320 AB4 2 3 N ILE D 319 ? N ILE L 319 O TRP D 331 ? O TRP L 331 AB4 3 4 N ILE D 328 ? N ILE L 328 O PHE D 356 ? O PHE L 356 AB5 1 2 N LEU D 377 ? N LEU L 377 O TRP D 389 ? O TRP L 389 AB6 1 2 N TYR E 565 ? N TYR M 565 O LEU E 574 ? O LEU M 574 AB7 1 2 N GLN F 48 ? N GLN N 48 O VAL F 67 ? O VAL N 67 AB7 2 3 N LEU F 66 ? N LEU N 66 O ALA F 82 ? O ALA N 82 AB7 3 4 N LEU F 79 ? N LEU N 79 O ILE F 121 ? O ILE N 121 AB8 1 2 N SER F 62 ? N SER N 62 O LEU F 86 ? O LEU N 86 AB9 1 2 N ILE F 140 ? N ILE N 140 O PHE F 152 ? O PHE N 152 AC1 1 2 N SER F 184 ? N SER N 184 O LEU F 194 ? O LEU N 194 AC1 2 3 N LEU F 193 ? N LEU N 193 O TRP F 205 ? O TRP N 205 AC2 1 2 N ASP F 232 ? N ASP N 232 O VAL F 246 ? O VAL N 246 AC2 2 3 N SER F 245 ? N SER N 245 O MET F 253 ? O MET N 253 AC2 3 4 N ILE F 254 ? N ILE N 254 O HIS F 267 ? O HIS N 267 AC3 1 2 N SER F 280 ? N SER N 280 O ALA F 290 ? O ALA N 290 AC3 2 3 N LEU F 289 ? N LEU N 289 O TRP F 301 ? O TRP N 301 AC3 3 4 N LEU F 300 ? N LEU N 300 O HIS F 311 ? O HIS N 311 AC4 1 2 N PHE F 321 ? N PHE N 321 O SER F 336 ? O SER N 336 AC4 2 3 N LEU F 333 ? N LEU N 333 O TRP F 345 ? O TRP N 345 AC4 3 4 N VAL F 344 ? N VAL N 344 O PHE F 368 ? O PHE N 368 AC5 1 2 N UNK J 5 ? N UNK Z 19 O UNK J 17 ? O UNK Z 35 AC5 2 3 N UNK J 18 ? N UNK Z 36 O UNK J 35 ? O UNK Z 62 AC5 3 4 N UNK J 34 ? N UNK Z 61 O UNK J 50 ? O UNK Z 86 AC6 1 2 N CYS K 83 ? N CYS C 83 O ILE K 96 ? 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The expected sequence for this portion is: SUZ12 aa 150 - 356 SHSLSAHLQLTFTGFFHKNDKPSPNSENEQNSVTLEVLLVKVCHKKRKDVSCPIRQVPTGKKQVPLNPDLNQTKPGNFPSLAVSSNEFEPSNSHMVKSYSLLFRVTRPGRREFNGMINGETNENIDVNEELPARRKRNREDGEKTFVAQMTVFDKNRRLQLLDGEYEVAMQEMEECPISKKRATWETILDGKRLPPFETFSQGPTLQ ; _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 6C23 _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 145592 _em_3d_reconstruction.resolution 3.9 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.9 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.name 'Ternary complex of PRC2 with cofactors AEBP2 and JARID2' _em_entity_assembly.source RECOMBINANT _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.entity_id_list 1,2,3,4,5,6,7,8,9 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 6C23 _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.cryogen ? _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'SPOT SCAN' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_max ? _em_imaging.nominal_defocus_min ? _em_imaging.nominal_magnification ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature ? _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details ? _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.instrument ? _em_vitrification.entry_id 6C23 _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 6C23 _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 6C23 _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 O N VAL 151 ? ? 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