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_entity_src_gen.gene_src_species _entity_src_gen.gene_src_strain _entity_src_gen.gene_src_tissue _entity_src_gen.gene_src_tissue_fraction _entity_src_gen.gene_src_details _entity_src_gen.pdbx_gene_src_fragment _entity_src_gen.pdbx_gene_src_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_gene_src_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.pdbx_gene_src_variant _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell_line _entity_src_gen.pdbx_gene_src_atcc _entity_src_gen.pdbx_gene_src_organ _entity_src_gen.pdbx_gene_src_organelle _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cellular_location _entity_src_gen.host_org_common_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.host_org_genus _entity_src_gen.pdbx_host_org_gene _entity_src_gen.pdbx_host_org_organ _entity_src_gen.host_org_species _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant 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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _entity_src_nat.entity_id _entity_src_nat.pdbx_src_id _entity_src_nat.pdbx_alt_source_flag _entity_src_nat.pdbx_beg_seq_num _entity_src_nat.pdbx_end_seq_num _entity_src_nat.common_name _entity_src_nat.pdbx_organism_scientific _entity_src_nat.pdbx_ncbi_taxonomy_id _entity_src_nat.genus _entity_src_nat.species _entity_src_nat.strain _entity_src_nat.tissue _entity_src_nat.tissue_fraction _entity_src_nat.pdbx_secretion _entity_src_nat.pdbx_fragment _entity_src_nat.pdbx_variant _entity_src_nat.pdbx_cell_line _entity_src_nat.pdbx_atcc _entity_src_nat.pdbx_cellular_location _entity_src_nat.pdbx_organ _entity_src_nat.pdbx_organelle _entity_src_nat.pdbx_cell _entity_src_nat.pdbx_plasmid_name _entity_src_nat.pdbx_plasmid_details _entity_src_nat.details 2 1 sample 1 350 ? 'Mycobacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155)' 246196 ? ? 'ATCC 700084 / mc(2)155' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 1 1169 ? 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'ATCC 700084 / mc(2)155' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _pdbx_entity_src_syn.entity_id 7 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag sample _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num 57 _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific 'synthetic construct' _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name ? _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id 32630 _pdbx_entity_src_syn.details ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP RBPA_MYCS2 A0QZ11 ? 1 ;MADRVLRGSRLGAVSYETDRNHDLAPRQVARYRTDNGEEFDVPFADDAEIPGTWLCRNGLEGTLIEGDVPEPKKVKPPRT HWDMLLERRSVEELEELLKERLDLIKAKRRGTGS ; 1 2 UNP RPOA_MYCS2 A0QSL8 ? 2 ;MLISQRPTLSEETVAENRSRFVIEPLEPGFGYTLGNSLRRTLLSSIPGAAVTSIRIDGVLHEFTTVPGVKEDVTDIILNL KGLVVSSDDDEPVTMYLRKQGPGVVTAGDIVPPAGVTVHNPDMHIATLNDKGKLEVELVVERGRGYVPAVQNKASGAEIG RIPVDSIYSPVLKVTYKVEATRVEQRTDFDKLIIDVETKNSISPRDALASAGGTLVELFGLARELNADSEHIEIGPSPAE ADHIASFALPIDDLDLTVRSYNCLKREGVHTVGELVARTESDLLDIRNFGQKSIDEVKIKLHQLGLSLKDSPATFDPSEV AGYDAATGTWTSDAGYDLDDNQDYAETEQL ; 1 3 UNP RPOB_MYCS2 P60281 ? 3 ;MLEGCILAVSSQSKSNAITNNSVPGAPNRVSFAKLREPLEVPGLLDVQTDSFEWLVGSDRWRQAAIDRGEENPVGGLEEV LAELSPIEDFSGSMSLSFSDPRFDEVKASVDECKDKDMTYAAPLFVTAEFINNNTGEIKSQTVFMGDFPMMTEKGTFIIN GTERVVVSQLVRSPGVYFDETIDKSTEKTLHSVKVIPGRGAWLEFDVDKRDTVGVRIDRKRRQPVTVLLKALGWTNEQIV ERFGFSEIMMGTLEKDTTSGTDEALLDIYRKLRPGEPPTKESAQTLLENLFFKEKRYDLARVGRYKVNKKLGLNAGKPIT SSTLTEEDVVATIEYLVRLHEGQTSMTVPGGVEVPVEVDDIDHFGNRRLRTVGELIQNQIRVGLSRMERVVRERMTTQDV EAITPQTLINIRPVVAAIKEFFGTSQLSQFMDQNNPLSGLTHKRRLSALGPGGLSRERAGLEVRDVHPSHYGRMCPIETP EGPNIGLIGSLSVYARVNPFGFIETPYRKVENGVVTDQIDYLTADEEDRHVVAQANSPTDENGRFTEDRVMVRKKGGEVE FVSADQVDYMDVSPRQMVSVATAMIPFLEHDDANRALMGANMQRQAVPLVRSEAPLVGTGMELRAAIDAGDVVVADKTGV IEEVSADYITVMADDGTRQSYRLRKFARSNHGTCANQRPIVDAGQRVEAGQVIADGPCTQNGEMALGKNLLVAIMPWEGH NYEDAIILSNRLVEEDVLTSIHIEEHEIDARDTKLGAEEITRDIPNVSDEVLADLDERGIVRIGAEVRDGDILVGKVTPK GETELTPEERLLRAIFGEKAREVRDTSLKVPHGESGKVIGIRVFSREDDDELPAGVNELVRVYVAQKRKISDGDKLAGRH GNKGVIGKILPVEDMPFLPDGTPVDIILNTHGVPRRMNIGQILETHLGWVAKAGWNIDVAAGVPDWASKLPEELYSAPAD STVATPVFDGAQEGELAGLLGSTLPNRDGEVMVDADGKSTLFDGRSGEPFPYPVTVGYMYILKLHHLVDDKIHARSTGPY SMITQQPLGGKAQFGGQRFGEMECWAMQAYGAAYTLQELLTIKSDDTVGRVKVYEAIVKGENIPEPGIPESFKVLLKELQ SLCLNVEVLSSDGAAIEMRDGDDEDLERAAANLGINLSRNESASVEDLA ; 1 4 UNP RPOC_MYCS2 A0QS66 ? 4 ;MLDVNFFDELRIGLATADDIRNWSYGEVKKPETINYRTLKPEKDGLFCEKIFGPTRDWECYCGKYKRVRFKGIICERCGV EVTRAKVRRERMGHIELAAPVTHIWYFKGVPSRLGYLLDLAPKDLEKIIYFAAYVITSVDDEMRHNELSTLEAEMAVEKK AVEDQRDADLEARAQKLEADLAELEAEGAKSDVRRKVRDSGEREMRQLRDRAQRELDRLDEIWNTFTKLAPKQLIVDEVL YRELQDRYGEYFTGAMGAESIKKLIENFDIDAEAESLREVIRSGKGQKKLRALKRLKVVAAFQQSGNSPMGMVLDAVPVI PPELRPMVQLDGGRFATSDLNDLYRRVINRNNRLKRLIDLGAPEIIVNNEKRMLQESVDALFDNGRRGRPVTGPGNRPLK SLSDLLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPQLKLHQCGLPKLMALELFKPFVMKRLVDLNHAQNIKSAKRMVERQR PQVWDVLEEVIAEHPVLLNRAPTLHRLGIQAFEPQLVEGKAIQLHPLVCEAFNADFDGDQMAVHLPLSAEAQAEARILML SSNNILSPASGKPLAMPRLDMVTGLYYLTTLVEGATGEYQAATKDAPEQGVYSSPAEAIMAMDRGALSVRAKIKVRLTEL RPPTDLEAQLFENGWKPGDAWTAETTLGRVMFNELLPKSYPFVNEQMHKKVQARIINDLAERFPMIVVAQTVDKLKDAGF YWATRSGVTVSMADVLVPPQKQEILERHEAEADAIERKYQRGALNHTERNESLVKIWQDATEEVGKALEEFYPADNPIIT IVKSGATGNLTQTRTLAGMKGLVTNPKGEFIPRPIKSSFREGLTVLEYFINTHGARKGLADTALRTADSGYLTRRLVDVS QDVIVREHDCETERGINVTLAERGPDGTLIRDAHVETSAFARTLATDAVDANGNVIIERGHDLGDPAIDALLAAGITTVK VRSVLTCTSATGVCAMCYGRSMATGKLVDIGEAVGIVAAQSIGEPGTQLTMRTFHQGGVTGGADIVGGLPRVQELFEARV PRNKAPIADVAGRVRLEESDKFFKITIVPDDGGEEVVYDKLSKRQRLRVITHEDGTEGVLSDGDHVEVGDQLMEGAADPH EVLRVQGPREVQIHLVKEVQEVYRAQGVSIHDKHIEVIVRQMLRRVTIIDSGSTEFLPGSLTERAEFEAENRRVVAEGGE PAAGRPVLMGITKASLATDSWLSAASFQETTRVLTDAAINCRSDKLNGLKENVIIGKLIPAGTGISRYRNIQVQPTEEAR AAAYTIPSYEDQYYSPDFGQATGAAVPLDDYGYSDYR ; 1 5 UNP RPOZ_MYCS2 A0QWT1 ? 5 ;MSTPHADAQLNAADDLGIDSSAASAYDTPLGITNPPIDELLSRASSKYALVIYAAKRARQINDYYNQLGDGILEYVGPLV EPGLQEKPLSIALREIHGDLLEHTEGE ; 1 6 UNP A0QW02_MYCS2 A0QW02 ? 6 ;MAATKASPATEEPVKRTATKTPAKKAPAKRAAKSAAAKAGGKAPAKKAPAKRAAKGTAAKPEDGVTDDLEVTDDLEAEPG EDLDVEDTDLELDDLDSDDDTAVEDEEEEADAATPAVATAKAADDDIDEPSEKDKASGDFVWDEEESEALRQARKDAELT ASADSVRAYLKQIGKVALLNAEEEVELAKRIEAGLYATQKLAELAEKGEKLPVQQRRDMQWICRDGDRAKNHLLEANLRL VVSLAKRYTGRGMAFLDLIQEGNLGLIRAVEKFDYTKGYKFSTYATWWIRQAITRAMADQARTIRIPVHMVEVINKLGRI QRELLQDLGREPTPEELAKEMDITPEKVLEIQQYAREPISLDQTIGDEGDSQLGDFIEDSEAVVAVDAVSFTLLQDQLQS VLETLSEREAGVVRLRFGLTDGQPRTLDEIGQVYGVTRERIRQIESKTMSKLRHPSRSQVLRDYLD ; 1 7 PDB 6CCE 6CCE ? 7 ? 1 8 PDB 6CCE 6CCE ? 8 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6CCE J 1 ? 114 ? 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'X-RAY DIFFRACTION' . 7.1649 49.5558 7637 0.1837 100.00 0.2071 . . 144 . . # _struct.entry_id 6CCE _struct.title 'Crystal structure of a Mycobacterium smegmatis RNA polymerase transcription initiation complex with inhibitor Kanglemycin A' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6CCE _struct_keywords.text ;RNA polymerase antibiotic complex inhibitor tuberculosis, TRANSCRIPTION, transcription-antibiotic complex, transcription-dna-antibiotic complex ; _struct_keywords.pdbx_keywords transcription/dna/antibiotic # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 4 ? F N N 5 ? G N N 6 ? H N N 7 ? I N N 8 ? J N N 9 ? K N N 10 ? L N N 10 ? M N N 11 ? N N N 12 ? O N N 13 ? P N N 10 ? Q N N 10 ? R N N 10 ? S N N 10 ? 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H DA 8 N6 ? ? ? 1_555 H DT 50 O4 ? ? O DA 8 O DT 50 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? H DA 9 N1 ? ? ? 1_555 H DT 49 N3 ? ? O DA 9 O DT 49 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? H DA 9 N6 ? ? ? 1_555 H DT 49 O4 ? ? O DA 9 O DT 49 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? H DA 10 N1 ? ? ? 1_555 H DT 48 N3 ? ? O DA 10 O DT 48 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? H DA 10 N6 ? ? ? 1_555 H DT 48 O4 ? ? O DA 10 O DT 48 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? H DA 11 N1 ? ? ? 1_555 H DT 47 N3 ? ? O DA 11 O DT 47 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? H DA 11 N6 ? ? ? 1_555 H DT 47 O4 ? ? O DA 11 O DT 47 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? H DG 12 N1 ? ? ? 1_555 H DC 46 N3 ? ? O DG 12 O DC 46 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? H DG 12 N2 ? ? ? 1_555 H DC 46 O2 ? ? O DG 12 O DC 46 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLU 24 B . ? GLU 24 A PRO 25 B ? PRO 25 A 1 -3.00 2 GLU 24 C . ? GLU 24 B PRO 25 C ? PRO 25 B 1 -14.71 3 PRO 28 C . ? PRO 28 B GLY 29 C ? GLY 29 B 1 -0.59 4 SER 85 D . ? SER 85 C PRO 86 D ? 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CD ? C GLU 71 CD 113 1 Y 1 B GLU 71 ? OE1 ? C GLU 71 OE1 114 1 Y 1 B GLU 71 ? OE2 ? C GLU 71 OE2 115 1 Y 1 B LEU 83 ? CG ? C LEU 83 CG 116 1 Y 1 B LEU 83 ? CD1 ? C LEU 83 CD1 117 1 Y 1 B LEU 83 ? CD2 ? C LEU 83 CD2 118 1 Y 1 B LEU 97 ? CG ? C LEU 97 CG 119 1 Y 1 B LEU 97 ? CD1 ? C LEU 97 CD1 120 1 Y 1 B LEU 97 ? CD2 ? C LEU 97 CD2 121 1 Y 1 B GLN 100 ? CG ? C GLN 100 CG 122 1 Y 1 B GLN 100 ? CD ? C GLN 100 CD 123 1 Y 1 B GLN 100 ? OE1 ? C GLN 100 OE1 124 1 Y 1 B GLN 100 ? NE2 ? C GLN 100 NE2 125 1 Y 1 B ILE 110 ? CG1 ? C ILE 110 CG1 126 1 Y 1 B ILE 110 ? CG2 ? C ILE 110 CG2 127 1 Y 1 B ILE 110 ? CD1 ? C ILE 110 CD1 128 1 Y 1 B LEU 128 ? CG ? C LEU 128 CG 129 1 Y 1 B LEU 128 ? CD1 ? C LEU 128 CD1 130 1 Y 1 B LEU 128 ? CD2 ? C LEU 128 CD2 131 1 Y 1 B LYS 131 ? CG ? C LYS 131 CG 132 1 Y 1 B LYS 131 ? CD ? C LYS 131 CD 133 1 Y 1 B LYS 131 ? CE ? C LYS 131 CE 134 1 Y 1 B LYS 131 ? NZ ? C LYS 131 NZ 135 1 Y 1 B LEU 134 ? CG ? C LEU 134 CG 136 1 Y 1 B LEU 134 ? CD1 ? 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