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'Hurley, J.H.' 4 0000-0001-5054-5445 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country ? _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Cell _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 1097-4172 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 174 _citation.language ? _citation.page_first 659 _citation.page_last 671.e14 _citation.title 'HIV-1 Nefs Are Cargo-Sensitive AP-1 Trimerization Switches in Tetherin Downregulation.' _citation.year 2018 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.cell.2018.07.004 _citation.pdbx_database_id_PubMed 30053425 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Morris, K.L.' 1 ? primary 'Buffalo, C.Z.' 2 ? primary 'Sturzel, C.M.' 3 ? primary 'Heusinger, E.' 4 ? primary 'Kirchhoff, F.' 5 ? primary 'Ren, X.' 6 ? primary 'Hurley, J.H.' 7 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Bone marrow stromal antigen 2, Protein Nef chimera' 29964.326 3 ? ? 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mu-1,Clathrin assembly protein complex 1 mu-1 medium chain 1,Clathrin coat assembly protein AP47,Clathrin coat-associated protein AP47,Golgi adaptor HA1/AP1 adaptin mu-1 subunit,Mu-adaptin 1,Mu1A-adaptin ; 6 ;Adaptor protein complex AP-1 subunit sigma-1C,Adaptor-related protein complex 1 subunit sigma-1C,Clathrin assembly protein complex 1 sigma-1C small chain,Golgi adaptor HA1/AP1 adaptin sigma-1C subunit,Sigma 1C subunit of AP-1 clathrin,Sigma-adaptin 1C,Sigma1C-adaptin ; # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MSYYHHHHHHDYDIPTTENLYFQGAMGSASTSYDYCRVPMEDGDKRCKGSDEASEGSGMGGKWSKSSVIGWPAVRERMRR AEPAADGVGAVSRDLEKHGAITSSNTAANNAACAWLEAQEEEEVGFPVTPQVPLRPMTYKAAVDLSHFLKEKGGLEGLIH SQRRQDILDLWIYHTQGYFPDWQNYTPGPGVRYPLTFGWCYKLVPVEPDKVEEANKGENTSLLHPVSLHGMDDPEREVLE 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;GSMTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQTDNLELKKLVYLYLMNYAK SQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITEYLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVED QGFLDTLKDLISDSNPMVVANAVAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYMPKDDREAQ SICERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQYVALRNINLIVQKRPEILK HEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELREYATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDL IQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRKYPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDKST QVQLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEVVLAEKPLISEETDLIEPT LLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEG ; B ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MSYYHHHHHHDYDIPTTENLYFQGAMGSEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWDV GGLDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAVLLVFANKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSL RHRNWYIQATCATSGDGLYEGLDWLSNQLRNQK ; ;MSYYHHHHHHDYDIPTTENLYFQGAMGSEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWDV GGLDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAVLLVFANKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSL RHRNWYIQATCATSGDGLYEGLDWLSNQLRNQK ; C,H ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MPAPIRLRELIRTIRTARTQAEEREMIQKECAAIRSSFREEDNTYRCRNVAKLLYMHMLGYPAHFGQLECLKLIASQKFT DKRIGYLGAMLLLDERQDVHLLMTNCIKNDLNHSTQFVQGLALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSYLRKKAALC AVHVIRKVPELMEMFLPATKNLLNEKNHGVLHTSVVLLTEMCERSPDMLAHFRKLVPQLVRILKNLIMSGYSPEHDVSGI SDPFLQVRILRLLRILGRNDDDSSEAMNDILAQVATNTETSKNVGNAILYETVLTIMDIKSESGLRVLAINILGRFLLNN DKNIRYVALTSLLKTVQTDHNAVQRHRSTIVDCLKDLDVSIKRRAMELSFALVNGNNIRGMMKELLYFLDSCEPEFKADC ASGIFLAAEKYAPSKRWHIDTIMRVLTTAGSYVRDDAVPNLIQLITNSVEMHAYTVQRLYKAILGDYSQQPLVQVAAWCI GEYGDLLVSGQCEEEEPIQVTEDEVLDILESVLISNMSTSVTRGYALTAIMKLSTRFTCTVNRIKKVVSIYGSSIDVELQ QRAVEYNALFKKYDHMRSALLERMPVMEKVTTNGPENLYFQ ; ;MPAPIRLRELIRTIRTARTQAEEREMIQKECAAIRSSFREEDNTYRCRNVAKLLYMHMLGYPAHFGQLECLKLIASQKFT DKRIGYLGAMLLLDERQDVHLLMTNCIKNDLNHSTQFVQGLALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSYLRKKAALC AVHVIRKVPELMEMFLPATKNLLNEKNHGVLHTSVVLLTEMCERSPDMLAHFRKLVPQLVRILKNLIMSGYSPEHDVSGI 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SEGIKYRKNEVFLDVIEAVNLLVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKSKSVELEDVKFHQ CVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSHSRIEYMVKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDA DSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSVKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEK SGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ ; M ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MIHFILLFSRQGKLRLQKWYITLPDKERKKITREIVQIILSRGHRTSSFVDWKELKLVYKRYASLYFCCAIENQDNELLT LEIVHRYVELLDKYFGNVCELDIIFNFEKAYFILDEFIIGGEIQETSKKIAVKAIEDSDMLQEVSTVCQTMGER ; ;MIHFILLFSRQGKLRLQKWYITLPDKERKKITREIVQIILSRGHRTSSFVDWKELKLVYKRYASLYFCCAIENQDNELLT LEIVHRYVELLDKYFGNVCELDIIFNFEKAYFILDEFIIGGEIQETSKKIAVKAIEDSDMLQEVSTVCQTMGER ; S ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 7 "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" GTP 8 'MAGNESIUM ION' MG # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 SER n 1 3 TYR n 1 4 TYR n 1 5 HIS n 1 6 HIS n 1 7 HIS n 1 8 HIS n 1 9 HIS n 1 10 HIS n 1 11 ASP n 1 12 TYR n 1 13 ASP n 1 14 ILE n 1 15 PRO n 1 16 THR n 1 17 THR n 1 18 GLU n 1 19 ASN n 1 20 LEU n 1 21 TYR n 1 22 PHE n 1 23 GLN n 1 24 GLY n 1 25 ALA n 1 26 MET n 1 27 GLY n 1 28 SER n 1 29 ALA n 1 30 SER n 1 31 THR n 1 32 SER n 1 33 TYR n 1 34 ASP n 1 35 TYR n 1 36 CYS n 1 37 ARG n 1 38 VAL n 1 39 PRO n 1 40 MET n 1 41 GLU n 1 42 ASP n 1 43 GLY n 1 44 ASP n 1 45 LYS n 1 46 ARG n 1 47 CYS n 1 48 LYS n 1 49 GLY n 1 50 SER n 1 51 ASP n 1 52 GLU n 1 53 ALA n 1 54 SER n 1 55 GLU n 1 56 GLY n 1 57 SER n 1 58 GLY n 1 59 MET n 1 60 GLY n 1 61 GLY n 1 62 LYS n 1 63 TRP n 1 64 SER n 1 65 LYS n 1 66 SER n 1 67 SER n 1 68 VAL n 1 69 ILE n 1 70 GLY n 1 71 TRP n 1 72 PRO n 1 73 ALA n 1 74 VAL n 1 75 ARG n 1 76 GLU n 1 77 ARG n 1 78 MET n 1 79 ARG n 1 80 ARG n 1 81 ALA n 1 82 GLU n 1 83 PRO n 1 84 ALA n 1 85 ALA n 1 86 ASP n 1 87 GLY n 1 88 VAL n 1 89 GLY n 1 90 ALA n 1 91 VAL n 1 92 SER n 1 93 ARG n 1 94 ASP n 1 95 LEU n 1 96 GLU n 1 97 LYS n 1 98 HIS n 1 99 GLY n 1 100 ALA n 1 101 ILE n 1 102 THR n 1 103 SER n 1 104 SER n 1 105 ASN n 1 106 THR n 1 107 ALA n 1 108 ALA n 1 109 ASN n 1 110 ASN n 1 111 ALA n 1 112 ALA n 1 113 CYS n 1 114 ALA n 1 115 TRP n 1 116 LEU n 1 117 GLU n 1 118 ALA n 1 119 GLN n 1 120 GLU n 1 121 GLU n 1 122 GLU n 1 123 GLU n 1 124 VAL n 1 125 GLY n 1 126 PHE n 1 127 PRO n 1 128 VAL n 1 129 THR n 1 130 PRO n 1 131 GLN n 1 132 VAL n 1 133 PRO n 1 134 LEU n 1 135 ARG n 1 136 PRO n 1 137 MET n 1 138 THR n 1 139 TYR n 1 140 LYS n 1 141 ALA n 1 142 ALA n 1 143 VAL n 1 144 ASP n 1 145 LEU n 1 146 SER n 1 147 HIS n 1 148 PHE n 1 149 LEU n 1 150 LYS n 1 151 GLU n 1 152 LYS n 1 153 GLY n 1 154 GLY n 1 155 LEU n 1 156 GLU n 1 157 GLY n 1 158 LEU n 1 159 ILE n 1 160 HIS n 1 161 SER n 1 162 GLN n 1 163 ARG n 1 164 ARG n 1 165 GLN n 1 166 ASP n 1 167 ILE n 1 168 LEU n 1 169 ASP n 1 170 LEU n 1 171 TRP n 1 172 ILE n 1 173 TYR n 1 174 HIS n 1 175 THR n 1 176 GLN n 1 177 GLY n 1 178 TYR n 1 179 PHE n 1 180 PRO n 1 181 ASP n 1 182 TRP n 1 183 GLN n 1 184 ASN n 1 185 TYR n 1 186 THR n 1 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AB9 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? parallel AA8 5 6 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AA9 4 5 ? parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ARG D 31 ? 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